La Aduana fue uno de los edificios de mayor importancia en esa poca.

Construido entre 1630 y 1634, su estructura responda al modelo renacentista,

trado por los espaoles a estas tierras. Este edificio fue utilizado como
almacn, oficina fiscal, depsito de las cajas reales, residencia del gobernador
y de los oficiales reales. Estas funciones se suprimieron en 1744, cuando la
ciudad de Portobelo fue bombardeada por el pirata William Drake. En 1809,
volvi a recobrar su esplendor, hasta poco antes de la independencia de
Panam de Espaa ocurrida en 1821. Este edificio pas al olvido y abandono
del Estado panameo hasta finales del siglo XX, cuando los gobiernos
panameo y espaol firmaron un convenio para reconstruir dichas
instalaciones. Las ruinas de la Aduana se encuentran actualmente en buen
estado, ya que fue reconstruida y reutilizada como museo, en el que se
muestran objetos de la poca espaola que han sido encontrados en las
ltimas investigaciones arqueolgicas. Este lugar se ha convertido finalmente
en un gran destino turstico.