Los protozoos tienen importancia en las cadenas alimentarias como
componentes del plancton. Son considerados como bioindicadores en el proceso de tratamiento de aguas residuales. Se utilizan para detectar vetas petrolferas. Contribuyen a degradar la celulosa en el rumen. Debido a su fcil y rpida reproduccin en el laboratorio son utilizados en investigaciones sobre nutricin y crecimiento, por ejemplo, El protozoo ciliado Tetrahymena thermophila fue el primer microorganismo eucariota en el que se desarroll la induccin de cultivos sincrnicos, facilitando el anlisis de las diferentes fases del ciclo celular eucariota. Este protozoo tambin particip en el descubrimiento de los lisosomas y peroxisomas. Un equipo de investigadores argentinos logr convertir el colesterol presente en la leche y el huevo en pro vitamina D., a travs de la aplicacin directa del protozoo ciliado denominado Tetrahymena. Tambin se ha provocado parasitismo artificial con protozoos de vida libre con el fin de llegar a conocer los cambios que ocurren en la adaptacin a la vida parastica. Algunos de tienen la habilidad de concentrar sustancias radioactivas disueltas en el agua. Estas sustancias pueden pasar a travs de la cadena alimenticia hasta el hombre, producindole un incremento en las mutaciones, cncer y otras enfermedades. La mayor importancia de los protozoos para el hombre lo constityelas numerosas enfermedades que provocan los protozoos parsitos como se mencion anteriormente. IMPORTANCIA EN EL ECOSISTEMA Juegan un papel muy importante. Aunque su tamao sea mnimo, sus poblaciones son muy numerosas, y por tanto su accin s que es apreciable (poblaciones de orden de millones...).Con respecto a la Ecologa, han colonizado todos los ambientes. Existen 30.000 de las cuales 10.000 son parsitas (habr esporozoos, cnidosporarios, algunos flagelados y muy pocos ciliados). Las otras 20.000son de vida libre: +/- 13.000 marinas (flagelados y ciliados (sobre todo)) y 7.000 terrestres o dulceacucolas. Los que no son parsitos, son depredadores (de otros protozoos, de pequeos invertebrados...) y otros sern herbvoros, consumen algas y bacterias. Por esto, los protozoos juegan un papel importante en la depuracin de aguas residuales y son capaces de reciclar la materia (degradan materia orgnica)