En 1798, ingres en la Universidad Real y Pontificia de Caracas, donde curs de 1802 a 1806.

Se gradu de bachiller en filosofa el 11 de julio de 1803. Obtuvo sus grados de bachiller,

licenciado y doctor en medicina en el ao de 1808.
Apenas termin sus estudios mdicos se traslada a Cuman, donde vive hasta 1812; luego de
iniciado el movimiento de laIndependencia, Vargas es parte del Supremo Poder Legislativo de
Cuman en 1811. Se encontraba en La Guaira cuando elterremoto del 26 de marzo de 1812, y
all prest servicios como mdico y hombre pblico a la comunidad de su ciudad natal, los
cuales fueron reconocidos oficial y pblicamente por la municipalidad guairea. Despus del
terremoto regres a Cuman, y se reencarg de sus actividades profesionales.
Cuando lleg Francisco Javier Cervriz a Cuman, redujo a prisin a todos los que haban
tomado parte en la Legislatura, y Vargas fue enviado a las bvedas de La Guaira donde
permaneci hasta comienzos de 1813 cuando fue liberado. A fines de ese ao se embarc
hacia Europa, con el propsito de ir a Edimburgo a perfeccionar sus estudios mdicos y
quirrgicos. All estudi ciruga, qumica, botnica, anatoma, dentistera. En Londres obtuvo
su incorporacin al Real Colegio de Cirujanos. De regreso a Amrica en 1819, se estableci
en la isla de Puerto Rico, pues a este sitio, durante la guerra, haban ido a refugiarse sus
hermanos con su madre, y administraban una propiedad en el sitio de Aguas Prietas, cerca de
la ciudad de Ponce.
En Puerto Rico desarroll una ingente labor profesional y cientfica. All escribi numerosos
trabajos y colabor con la Junta de Sanidad de la isla. En 1825, decidi regresar
a Venezuela definitivamente. El 18 de octubre de 1825 ya est en Saint Thomas y poco
despus se encuentra en Venezuela. Desde su llegada se dedic al ejercicio de su profesin y
se incorpor a la Universidad de Caracas como profesor de Anatoma. Primero dictaba las
clases en su casa de habitacin y luego inici los estudios oficiales en la universidad,
habindose dedicado a componer un texto de estudio. En 1827, despus de la reorganizacin
de la Universidad por el Libertador, fue electo rector, el primer rector mdico, como lo
permitan ya los nuevos estatutos.
Es a partir de esa poca cuando Vargas comienza a dar en Caracas muestras de su
capacidad administrativa, de su sabidura y sentido comn. En todas partes se le admira y se
le respeta. Las rentas de la universidad, dispersas y atrasadas, son puestas al da bajo su
exacta laboriosidad. Se dedica a reorganizar las diversas facultades, a la creacin de nuevas
ctedras, a las reparaciones fsicas de los locales, a la organizacin de bibliotecas, a
relacionar la universidad con otros planteles, de modo que cuando termin el rectorado de
Vargas, la universidad se haba remodelado y puesto al da.

Fuera de su condicin de mdico y cirujano, como profesor de anatoma, inaugura las

disecciones sobre cadveres, procedimiento novedoso para la poca, lo que le confiri
extraordinaria reputacin como docente. Fund en 1827 laSociedad Mdica de Caracas, con
lo que se comenzaron a practicar reuniones cientficas en el pas. Es ampliamente conocida
su labor botnica en este perodo y sus relaciones con hombres notables de esta ciencia en el
mundo entero; De Candolle, uno de los ms grandes botnicos de la poca, bautiza algunas
plantas con el nombre de Vargasia en homenaje a los trabajos de Vargas sobre la materia.
Una vez terminado su rectorado, Vargas se dedic de lleno a la instruccin, y ya en 1832,
fund la ctedra de Ciruga.
Simultneamente con sus actividades cientficas y educativas, Vargas tom parte en las
actividades polticas, y as lo vemos asistir al Congreso Constituyente de 1830, donde
despleg una gran actividad en las comisiones de trabajo, en las sesiones plenarias y en
muchas oportunidades salv su voto cuando se atac al Libertador. Va a ser en 1830 albacea
testamentario de Bolvar, encargo que cumple junto con los otros 3 albaceas con religiosa
acuciosidad. En 1829, al ser fundada en Caracas la Sociedad Econmica de Amigos del Pas,
Vargas fue designado su primer director. Su obra cientfica es extraordinaria. Sus
conocimientos son slidos y precisos. Goza de una merecida fama de hombre de carcter
recio, firme, de una sabidura universal, humanstica y tcnica, de un espritu despierto y una
inteligencia viva.