Universitario de Deportes[editar]

Vargas comenz su carrera como futbolista en las divisiones menores del Club
Universitario de Deportes del Per.3 Por recomendaciones de Luis Salhuana (padre de otro
juvenil crema), lleg a las filas del Unin Minas de Cerro de Pasco, dirigido en ese
entonces por Roberto Mosquera Vera. En este equipo nunca viaj a provincias, jugaba con
los juveniles del conjunto cerreo y decidi retirarse del cuadro provinciano debido a la
mala situacin econmica y futbolstica del club minero. 4 En el ao 2002 regres a la U,
aunque no lleg a tener muchas oportunidades de jugar debido a la presencia de
experimentados futbolistas que tena el cuadro estudiantil, donde destacaban Jos
Guillermo del Solar, Jos Luis Carranza, scar Ibez, Jos Pereda, Martn Vilallonga,
entre otros.5 La situacin del club fue complicada tanto en lo futbolstico como en lo
econmico, hasta el punto que los futbolistas profesionales decidieron irse a la huelga y la
dirigencia decidi recurrir a los juveniles.5
De esta forma, Juan Vargas debut oficialmente con Universitario el 24 de noviembre de
ese mismo ao en un encuentro disputado contra Cienciano en el Estadio Monumental que
finaliz con marcador de 3:2 a favor de los cusqueos.6 Entre lo ms destacable se apreci
la actuacin de Vargas, quien anot un gol desde unos cuarenta metros de distancia a los
sesenta y dos minutos del encuentro para decretar el empate transitorio. Luego, tuvo la
oportunidad de ser titular bajo la direccin tcnica del uruguayo Ricardo Ortiz, en la Copa
Libertadores 2003, donde el cuadro crema luch hasta la ltima fecha pero fue eliminado
en la primera fase.7 En la temporada siguiente anot seis goles en cuarenta y un
encuentros, finalizando su equipo en la quinta posicin de la tabla acumulada con ochenta
y cuatro puntos.8

Coln y Calcio Catania[editar]

Despus de tres temporadas, el lateral dej a Universitario de Deportes y fue cedido
al Club Atltico Coln. En Argentina, pudo seguir desarrollando su habilidad para
ejecutar tiros libres, aduendose de los balones parados. En su primera temporada con el
club argentino disput dieciocho encuentros y anot tres goles en la liga. En el Torneo
Clausura 2006 anot un gol en treinta y nueve encuentros del campeonato nacional. Al
Atltico Coln no le fue nada bien en el torneo, finaliz en el 16. puesto con veinte puntos
producto de cinco victorias, cinco empates y nueve derrotas. Cuando empezaba la
segunda parte del ao 2006 y el club se preparaba para el Torneo Apertura de dicha
temporada, una oferta del Portsmouth F. C. de Inglaterra hizo que el peruano viajara
aEuropa.9 Tras no llegar a un acuerdo con el cuadro ingls,10 fue fichado por el Calcio
Catania de Italia.11 El monto de la venta fue de 3 millones 350 mil dlares.
Su debut con el cuadro catanesi se produjo en un encuentro amistoso ante el U. S.
Palermo que finaliz con marcador de 5:1 a favor del Catania. 12 Su debut oficial en la Serie
A se dio el 1 de octubre de 2006, en la quinta jornada de la temporada 2006-07 ante
laFiorentina, con derrota para su club por 3:0.13 Su primer gol lo anot el 31 de octubre de

2007 ante el A. C. Siena para decretar el empate final en la dcima jornada de la campaa
2007-08.14 En esa misma temporada, marc un gol de bolea en un encuentro por los
octavos de final de la Copa Italia ante el A. C. Milan que finaliz con marcador de
1:1,15 permitiendo al Catania avanzar hasta la siguiente fase, donde nuevamente fue
incluido en la plantilla titular para enfrentar al Udinese Calcio tanto en el encuentro de ida
como en el de vuelta.16 17 En la liga disput un total de treinta encuentros y anot seis goles
y fue incluido en el Equipo Ideal de la Jornada # 23 del Calcio.18