Mdulo Tcnica de Haz

de Electrones: Qemscan
Instituto de Geologa
Econmica Aplicada

INTRODUCCIN AL ANALISIS DE
IMAGEN APLICADO A LA
CARACTERIZACIN DE MINERALES

prof: Marcos Pincheira N.

DEFINICIONES BSICAS
El Anlisis de Imgenes comprende tres niveles de manipulacin de la
informacin contenida en una imagen digital:
Captacin
Anlisis
Procesamiento
La captacin: Se utilizan una serie de soportes tales como cmaras
fotogrficas o de video, que permiten la obtencin de imgenes en el espectro
visible, instrumentos que generan imgenes de rayos X, o como en el Qemscan,
que entregan imgenes de la intensidad de los electrones retrodispersados (BSE).

Los medios de captacin utilizados por el

Anlisis de Imagen son cmaras o videos de
alta resolucin (sobre 5 megapixels),
microscopios electrnico (SEM), Qemscan,
EPMA, etc.

El segundo nivel es el de anlisis. Se trata de

un proceso interactivo mediante el cual se extrae
informacin cuantitativa de una imagen digital.
Mediante software especializado se detectan
objetos en la imagen y se cuantifican diversos
parmetros medibles, como por ejemplo intensidad
de la luz (brillo), rea, permetro, dimetro de los
objetos, etc. Para ello se utilizan algoritmos
matemticos y estadsticos aplicados sobre los
objetos de inters contenidos en la imagen.

El tercer nivel es el del procesamiento. Se trata

ahora de manipulacin matemtica de los valores
medidos en la imagen, generalmente para producir
otra imagen y tablas de datos con los resultados
de la cuantificacin de los parmetros.
Objeto de
inters

Captacin
de la imagen

Anlisis de la
Informacin
Nueva
Imagen
Procesamiento
de la Imagen

Tablas,
Grficos
Textos

INFORMACION CONTENIDA
EN LAS IMGENES DIGITALES
La informacin que percibimos en una imagen es
de dos tipos:
espacial, tal como la forma, el tamao o la distribucin
de los objetos.
espectral, relacionada con la intensidad de tonos de
grises en imgenes monocromticas de rayos X y de
electrones retrodispersados BSE o con la intensidad con la
que se reciben los tres colores bsicos del espectro visible
(rojo, verde y azul, RGB) de las imgenes cromticas.

INFORMACION CONTENIDA EN LAS IMGENES

DIGITALES

La informacin (espacial y espectral), se vincula a cada

punto de un sistema cartesiano de tres coordenadas para
las imgenes en tonos de grises (dos espaciales,
correspondientes a la proyeccin plana de los pixeles del
objetos y una para el brillo del tono de gris:
Coordenada espacial X
Coordenada espacial Y
Coordenada espectral brillo BSE
Para las coordenadas espaciales, cada punto de la imagen
es proyectado sobre una estructura de diminutos puntos
(pxeles) o elementos sensibles a la luz, ordenados
cartesianamente (pxel, es la abreviatura de picture
element).

Estos valores son llevados a una matriz de nmeros que constituyen el resultado
de la digitalizacin. Cada pxel, ocupa una coordenada espacial dentro de la
matriz XY, y presenta tres valores de intensidad de luz cromtica, o bien un valor
de intensidad monocromtica (escala de grises).

128

255

Imagen BSE: coordenadas X,Y y brillo del tono de gris

Origen de coordenadas
j

Coordenadas X - Y
de cada pxel e
intensidades en la
escala de grises

50

100

150

58
60

200

62

250

64

50

100

150

200

250

66
300
68

350

70
72

202

x(60,220)

201

x(61,220)

202

x(62,220)

202
x(63, 220)

152
x(64, 220)

201
221)
x(60,

202
221)
x(61,

202
221)
x(62,

163
221)
x(63,

124
221)
x(64,

201
222)
x(60,

190
222)
x(61,

148
222)
x(62,

127
222)
x(63,

113
222)
x(64,

118

x(60,224)

115
224)
x(61,

111
224)
x(62,

107
224)
x(63,

104
224)
x(64,

Tonos de gris

74
76

143

x(60,223)

129
223)
x(61,

120
223)
x(62,

111
223)
x(63,

108
223)
x(64,

220

225

230

235

Segmentacin y Binarizacin: Ejemplo en

imgenes RGB
La segmentacin es el proceso que lleva a la
deteccin y diferenciacin del objeto que nos interesa
medir y deja excluido a los objetos de diferentes
caractersticas espectrales.
En este procesos se analiza para cada pxel la
respuesta espectral y se agrupan pxeles con
similares caractersticas.
De una buena segmentacin depende la calidad de la
medicin.

Segmentacin de los objetos medibles

Imgenes de
microscopa
ptica con luz
reflejada

Imagen original
captada por microscopa
Segmentacin
de la calcopirita

En la segmentacin se intenta que los pxeles

correspondientes al objeto de inters (calcopirita en la
imagen) queden agrupados en un rango estrecho de
valores de brillo en toda la imagen y que este sea
diferente del valor de los pxeles que corresponden a
otros minerales o al fondo de la imagen.
Para conseguirlo, debe buscarse un intervalo de
valores de intensidad de los pixeles que defina la
presencia de la especie mineral en la imagen. Esto se
logra mediante la funcin umbral o threshold que
permite englobar todos los pxeles que presentan
caractersticas semejantes de intensidad de brillo.

Segmentacin de la esfalerita : funcin umbral o threshold

157-183: rango que

define la esfalerita en la
escala de grises

Imagen de microscopa ptica con luz reflejada:

segmentacin de la esfalerita

0
Coal
Serpentine
Kaolinite
Topaz
Talc
Zeolites
Illite
Al2SiO5
SiO2 (e.g.Quartz)
Dolomite
Sericite
Tourmaline
Plagioclase Group
K-feldspar
Cordierite
Glauconite
Gypsum
Smectite Group
Calcite
Chlorite Group
Chamosite
Garnet Group
Amphibole Group
Biotite
Pyroxene Group
Epidote
Apatite
Staurolite
Olivine Group
Halite
Fluorite
Spinel-Chromite
Limonite
Jarosite
TiO2 (e.g.Rutile)
Siderite
Ilmenite
Goethite
Hematite
Magnetite
Pyrrhotite
Pyrite
Violarite
Carrollite
Cubanite
Pentlandite
Chalcopyrite
Millerite
Xenotime
Covellite
Sphalerite
Heazlewoodite
Zircon
Bornite
Chalcocite
Cuprite
Arsenopyrite
Cobaltite
Native Cu
Tennant-Tetrahedr
Nickeline (Niccolite)
Lollingite
Molybdenite
Laurite
Vysotskite
Barite
Cassiterite
Stibnite
Monazite
Columbite-Tantalite
Native Ag
Electrum
Wolframite
Kotulskite
Sperrylite
Cooperite
Galena
Ferroplatinum
Native Au
Uraninite

average atomic number (Z)

Segmentacin usando imgenes BSE en tonos de grises

El anlisis con imgenes RGB de microscopia tiene el problema de la

anisotropa de la mayora de los minerales, que hace variar la
intensidad del brillo y a veces el color dependiendo de la direccin de
los ejes cristalogrficos de la seccin analizada. La ventaja del anlisis
con imgenes de electrones retrodispersados (BSE) es que los tonos
de grises son generados por las caractersticas atmicas del Z promedio
de los minerales que emiten la seal, lo cual permite asociarlas a una
composicin particular.
90

80

70

60

50

40

30

20

10

molibdenita

Comparacin imgenes microscopia p0ca y BSE

Imagen de microscopia ptica

convencional. Colores de los
minerales dependen de la
absorcin y velocidad de los
rayos de luz (ndice de
refraccin) al interactuar con la
estructura cristalina de los
minerales

Imagen BSE (electrones

retrodispersados) forman una
gradacin de grises relacionada con
la composicin qumica de la
especie mineral

Segmentacin y Binarizacin

La binarizacin consiste en el paso siguiente a la

segmentacin donde las imgenes segmentadas
pasan a una imagen binaria de pxeles en blanco o
negro, lo que equivale a una matriz formada con
slo dos valores (0 1), o verdadero o falso,
indicando la presencia o ausencia del mineral en el
pixel, para ser procesadas por el programa de
anlisis.

Binarizacin de los elementos segmentados

Imagen original
captada por microscopa
ptica

Segmentacin del objeto

en este caso una calcopirita
Imagen binaria (blancos y negros)
de la calcopirita

Ajustes de la Segmentacin
Los valores espectrales de cada pxel en los
tonos de gris de imgenes BSE, son procesados por
un conjunto de funciones matemticas, llamadas
filtros, que modifican sus valores originales, lo cual
permite una gran variedad de filtros que permite por
ejemplo erosionar, agrandar, restar o sumar, una
cantidad determinada de pxeles en todas direcciones,
hasta que se logra que lo segmentado
corresponda adecuadamente a los objetos que
deseamos medir.

Ajustes de la Segmentacin
El filtro es una matriz de nmeros que son los
coeficientes por los que deben multiplicarse los
valores de intensidad de cada pxel en la imagen.

a, b y c, coeficientes
del filtro

X
Filtro de 3x3
Valores originales de los pxeles

Filtros:
Open de erosin y dilatacin

Se pierde un pixel en la
periferia del objeto
segmentado

Se gana un pixel en la
periferia del objeto
segmentado

Aplicacin del filtro Open con un ciclo completo de erosin

seguido por un ciclo de dilatacin

Conversin a imagen binaria y aplicacin de filtro limite de objeto

Imagen de microscopa
ptica con luz reflejada

Medicin de Parmetros y Clasificacin

Que parmetros se pueden cuantificar ?
Numero de objetos
rea de los objetos
Permetro
Dimetro de Feret (horizontal y vertical)
Centroides X,Y de los objetos
Circularidad
Distancias
ngulos
Muchos otros dependiendo del programa que
se utilice

Por ejemplo el permetro de los objetos es un

parmetro de uso frecuente. En este caso se basa en el
conteo de contactos objeto-fondo considerando los pxeles
de borde.
Partcula mineral

Segmentacin y Clasificacin
Formacin de
la imagen
Fuente de
electrones

Sensor

Preprocesamiento

Area
Permetro

Largo
mx
Brillo BSE

Segmentacin

Extraccin de
Caractersticas

420 um2
310 um
180 um

24

Clasificacin

Tabla de
cuantificacin

Resultado del anlisis de imagen es una tabla de valores u otra imagen donde
aparecen clasificados los pixeles y medidos de acuerdo con algn parmetro
establecido.

Por ejemplo si tenemos el rea ocupada por los pixeles de calcopirita en la

imagen podemos calcular el porcentaje en volumen y luego el porcentaje
en peso del mineral en dicha imagen, conociendo su peso especfico y
suponiendo que para partculas minerales, el rea medida en un plano es
proporcional al volumen del mineral en tres dimensiones.
Mineral

Area del mineral Peso Especfico

(pixeles 2)
(gr/cm3)

Producto

% Peso

Bornita

622

5.09

3165.98

57.93

Calcosina

90

6.46

581.40

10.64

Calcopirita

80

4.20

336.00

6.15

Tetraedrita

12

4.95

59.40

1.09

Magnetita

130

5.20

676.00

12.37

Esfalerita

60

4.10

246.00

4.50

Silicatos

150

2.67

400.50

7.33

Total (concentrado)

1166

5465.28

100.00

Tarea Anlisis de Imagen

Descargar el programa: Image J (Version 1.32) desde

http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html
y la documentacin en
http://rsbweb.nih.gov/ij/docs/user-guide.pdf
Calcular el porcentaje de rea ocupado por la galena en la imagen:
Concentrado-1A

Trabajo con ImageJ

Concentrado-1A, imagen de
electrones retrodispersados (BSE)

Concentrado-1A, imagen
interpretada por el Qemscan
galena
esfalerita

Trabajo de anlisis de imgenes:

1- escalamiento de la imagen
menu Analyse set scale
2- duplicar imagen
3- transformacion en imagen monocroma?ca de 8 bit
menu Image type
4- marcar rea de trabajo y ver respuesta espectral de los objetos contenidos
menu Analyse surface plot
menu Analyse Histogram
5- tabla de segmentacin y caracters?cas espectrales de la galena
6- rea de trabajo y segmentacin de la galena:
menu Image Ajust Threshold
deteccin de la galena usando los valores de brillo de la imagen
aplicacin de ltros

menu Process Binary Open Fill Holes
7- Parmetros medibles
menu Analyse set measurements Area Perimeter Ferets Diameter
menu Analyse Analyse par?cles
menu Analyse Distribu?on area