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Red de Revistas Cientficas de Amrica Latina, el Caribe, Espaa y Portugal
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Anglica Gutirrez-Nava, Lino Mayorga-Reyes
La Era Post-genmica en Biomedicina
Revista Mexicana de Ciencias Farmacuticas, vol. 42, nm. 2, abril-junio, 2011, pp. 7-13,
Asociacin Farmacutica Mexicana, A.C.
Mxico
Cmo citar? Fascculo completo Ms informacin del artculo Pgina de la revista
Revista Mexicana de Ciencias Farmacuticas,
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7
La Era Post-genmica en Biomedicina
Post-genomics Age in Biomedicine
Anglica Gutirrez-Nava, Lino Mayorga-Reyes
Universidad Autnoma Metropolitana. Depto. Sistemas Biolgicos
Resumen
regulacin. A partir de su publicacin, los estudios sobre la expresin de genes bajo circunstancias normales y condiciones
patolgicas dieron pie al surgimiento de la era post-genmica cuyo objetivo fundamental es conocer la funcin de cada
convirtindose en un reto para mejorar la salud mundial. La aplicacin de la genmica en biomedicina est impulsando
la evolucin de otras ramas que avanzan a pasos agigantados para tratar de elucidar los mecanismos que controlan los
procesos celulares bsicos. La presente revisin muestra la retrospectiva y la perspectiva de la genmica y la protemica como
protagonistas de la historia.
Abstract
The human genome was completely sequenced, its contents not only determines the expression of genes but other elements
Since its publication, studies of the gene expression under normal and pathological conditions gave way to the post-genomic
age, which its fundamental aim is to know the function of each gene and their respective protein to monitor the susceptibility
and progression of disease development becoming a big challenge to improve global health. The application of genomics in
biomedicine, boost the evolution of other disciplines trying to elucidate the mechanisms that control the basic cellular processes.
This review shows the retrospective and perspective of genomics and proteomics as protagonist of the story.
Palabras clave: genmica, protemica, biomedicina. Keywords: genomics, proteomics, biomedicine.
Correspondencia
Dra. Mara Anglica Gutirrez Nava
Laboratorio de Biotecnologa
Departamento de Sistemas Biolgicos, UAM Xochimilco.
Calz. del Hueso 1100, Col. Villa Quietud.
Coyoacn C.P. 04960, Mxico D.F.
Tel. 5483 7003
e-mail: agutz@correo.xoc.uam.mx
Fecha de recepcin: 14 de enero de 2011
Fecha de aceptacin: 23 de mayo de 2011
Volumcn 42 Nmero 2 Abril - Junio 2011
8
Introduccin
La funcin del DNA es muy simple: contiene codifcada
la informacin para sintetizar nuevas protenas que son los
caballitos de batalla que utiliza la clula para llevar a cabo
la mayora de reacciones qumicas, formando nuevos tejidos,
mandando seales a otros rganos del cuerpo, regulando y
equilibrando las funciones del organismo entre otras muchas.
La enorme complejidad de la regulacin de genes y expresin de
protenas ha hecho difcil conocer los mecanismos que regulan
y controlan los procesos celulares bsicos.
Todo comienza en 1953, cuando James Watson y Francis Crick
descubrieron la estructura de doble hlice que tiene la molcula
de DNA. Cincuenta aos ms tarde y gracias a los avances de la
informtica y al desarrollo de las tcnicas de secuenciacin, en
2001 dos grupos de Investigacin: Celera Genomics (iniciativa
privada) e International Human Genome Sequencing Consortium
(sector pblico) lograron esbozar el primer borrador de los 3
mil millones de componentes del genoma humano.
1,2
Aunque
la secuencia reportada cubra solamente el 90% del genoma, su
anlisis arroj interesantes resultados observando que slo el 2%
se public un avance de la secuenciacin del genoma humano
completando ~99.7% de la secuencia con una mejora ya que
contena un error por cada 100,000 bases
3
Hoy en da se sabe
4

Ante la llegada de la secuencia del genoma humano se inicia
enfrentado a un reto formidable que es: darle sentido a toda
la informacin del genoma humano que tienen en sus manos.
El primer paso para saber cmo prevenir o arreglar lo que est
funcionando de forma incorrecta, era conocer de lo que un ser
humano est hecho, la tendencia esperada era escuchar noticias
acerca del descubrimiento de un nuevo gen relacionado con
alguna enfermedad e inmediatamente despus, obtener una
cura. El estudio de la genmica ha surgido para entender el
genoma de un organismo determinado y esta disciplina est
impulsando la evolucin de otras ramas que estn avanzando a
pasos agigantados como son la genmica funcional, la genmica
comparativa, la protemica y la metabolmica.
Se pens que la secuenciacin del genoma humano llevara
inmediatamente a grandes avances en la comprensin del
funcionamiento de los organismos, la salud humana y las
enfermedades, este objetivo sigue estando en gran medida
sin realizar, no obstante los avances tecnolgicos que se han
realizado de manera coordinada con el uso de las herramientas
de muchas disciplinas, incluyendo la bioinformtica, qumica,
bioqumica de protenas y espectrometra de masas, as como el
desarrollo de sistemas de anlisis de las secuencias genmicas y
la prediccin de una gran variedad de procesos celulares.
El objetivo del presente trabajo es mostrar una visin amplia
del surgimiento de la genmica, sus retos y perspectivas, as
como el impacto que ha tenido a diez aos de la publicacin del
genoma humano.
Genmica funcional
La genmica funcional describe las funciones de los genes y
sus interacciones entre ellos y entre protenas, a diferencia de
del ADN y la estructura de los genes. El dogma un gen - una
protena ha sido desplazado por la evidencia de que estos 30,000
posible a travs de mecanismos de eliminacin de intrones para
la formacin de transcritos maduros como el splicing alternativo y
pero no la informacin gentica) como la metilacin.
5,6,7
El estudio de la genmica funcional no ha sido tan evidente
ya que muchos genes se expresan en diferentes formas, por lo
que en lugar de hablar de un gen nico, esta misma unidad
transcripcional puede dar lugar a 4 o 5 formas distintas, y
entonces se tendra que hablar de unos 100,000 o 150,000
genes funcionales. Esto nos da una idea de lo complejo que es
entender el funcionamiento de todos los genes humanos, sin
embargo, con el surgimiento de la genmica, la protemica y el
anlisis bioinformtico, es posible abordar el conocimiento de
cmo funciona una clula en su contexto individual y avanzar
hacia el funcionamiento de un tejido y eventualmente de un
organismo completo.
Microarreglos de DNA
Aunque no se conoce an la funcin de la mayora de los genes
contenidos en el genoma humano, los experimentos arrojan
datos importantes del conjunto de genes que se expresan en
forma anormal ya sea por exceso o por defecto en determinadas
condiciones patolgicas. Con este concepto es posible encontrar
grupos de expresin gnica que funcionen como biomarcadores,
o como indicadores de progresin o susceptibilidad a la
enfermedad y posteriormente dirigir la investigacin a esos genes
en particular. El estudio de la expresin de genes de un genoma
completo se conoce como: transcriptmica.
La tecnologa de microarreglos de DNA descrita por primera
vez en 1995 por Schena y colaboradores, marc un rpido
desarrollo de tecnologas para el anlisis de la expresin de genes
permitiendo usar la informacin de la secuencia de genomas
para medir en forma paralela y cuantitativa la expresin de
miles de genes simultneamente a travs del RNA mensajero,
los microarreglos de DNA tambin llamados DNA chips, se han
convertido en una de las herramientas ms poderosas y verstiles
de la investigacin genmica, as mismo fueron diseados y
utilizados microrreglos de oligonucletidos.
8,9,10
9
La tecnologa de microarreglos ha evolucionado con las
tecnologas desarrolladas conjuntamente y se han convertido
Inicialmente se analizaron de forma simultanea alrededor de 50
genes, actualmente se pueden tener microarreglos conteniendo
cerca de 50,000 genes en el estudio de genomas completos
de mamferos, para analizar la expresin de los transcritos en
alguna condicin dada, representando en algunos casos, ms
de 1 milln de caractersticas individuales.
11
La tecnologa de
microarreglos, requiere de instrumentos y sistemas complejos
de lectura que hacen el proceso caro y difcil de realizar, por lo
que al inicio estas pruebas slo se llevaban a cabo en laboratorios
de alta tecnologa. Sin embargo, el costo de esta tecnologa ha
disminuido ao con ao y cada da su uso invade reas diversas
de la genmica y de la clnica estando al alcance de ms sectores.
Gracias a lo anterior, ha surgido una avalancha de nueva
informacin gentica al analizar la expresin de genes de
las clulas de algn tipo de tejido bajo ciertas condiciones,
observando cambios de sobreexpresin o subexpresin de genes
o grupos de genes asociados con algunas enfermedades. Los
microarreglos de DNA son una herramienta muy til en la
investigacin biomdica, sus principales aplicaciones han sido
frmacos, diagnstico de cncer, interacciones DNA-protenas,
etc. Por ejemplo, con la informacin de la secuencia del genoma
de leucemia linfoblstica aguda con lo que se puede predecir
su curso y susceptibilidad al tratamiento;
12
otros investigadores
la sobrevida en pacientes con cncer de mama;
13
as mismo con
datos obtenidos de microarreglos se ha descrito la expresin gnica
de este padecimiento con diversas respuestas al tratamiento.
14,15
Genmica y Salud Pblica
Uno de los principales retos de la genmica en biomedicina es
fortalecer el sentido de compromiso con la salud pblica y darle
seguimiento a la medicina clnica, as mismo plantear estrategias
para aplicar las nuevas tecnologas y los nuevos conocimientos
en las enfermedades infecciosas y enfermedades crnicas. Es
sumamente importante reconocer que existe heterogeneidad
entre los pacientes dentro de un mismo diagnstico para poder
medio de anlisis computacionales. Y en consecuencia, existe el
desafo de la integracin de los factores genticos, ambientales
y de comportamiento en la prevencin y el tratamiento de
enfermedades.
16
Medicina Genmica
A diferencia de la gentica, que estudia las funciones y los efectos
de un solo gen, la genmica explora no slo las acciones de los
genes individuales, sino tambin la interaccin de mltiples
genes entre s y con el medio ambiente. Como resultado de la
genmica humana, existe un gran potencial para mejorar la salud
de la poblacin mundial. No obstante, la genmica requiere de
una evaluacin sistemtica de sus contribuciones potenciales y la
comprensin de la informacin y otros factores necesarios para
facilitar la traduccin de los resultados de la investigacin en las
estrategias de salud pblica.
Hasta hace poco, la gentica se haba interesado principalmente
y la enfermedad de Huntington, que presentan prevalencia
relativamente baja en la poblacin. Sin embargo, qu pasara si
la genmica pudiese ayudar a explicar las causas y las respuestas
a las enfermedades crnicas comunes que afectan a gran parte
de la poblacin: como enfermedades cardiovasculares, diabetes,
cncer, esquizofrenia, etc.? Qu pasara si los conocimientos
genticos se utilizaran no slo para benefciar a pacientes
pasara si la genmica pudiese ayudar a dilucidar sobre las
interacciones que existen entre las propias clulas, los tejidos,
los rganos de un mismo organismo que la ciencia ha estado
tratando de comprender durante dcadas? Entender la dinmica
entre factores endgenos y exgenos como la dieta, el medio
ambiente y el propio comportamiento humano sera realmente
una revolucin en la salud pblica y quizs el mundo se encuentra
en la cspide o muy cerca de la cspide de esa revolucin.
16
La medicina genmica tiene sus pilares en la capacidad de
conocer las variaciones de un solo nucletido (SNPs, por sus
siglas en ingls). Los SNPs son pequeas variaciones en la
secuencia de ADN de cada individuo, son muy frecuentes y
ocurren una cada 1000 pb. La mayora de estos SNPs ocurre
lo tanto no contribuyen a la susceptibilidad de una enfermedad.
Cuando llega a ocurrir directamente en un exn esto nos
convierte a cada individuo en nico.
17,18,19
a desarrollar enfermedades comunes antes de que aparezcan
los sntomas, y as evitar o retrasar sus manifestaciones,
complicaciones y secuelas.
enfermedades comunes, dar lugar a una prctica mdica
ms individualizada, ms preventiva y ms predictiva, siendo
posible diagnosticar a cada individuo en forma presintomtica,
permitiendo llevar a cabo medidas de atencin a la salud que
retrasen o eviten las manifestaciones clnicas, complicaciones
y secuelas de las enfermedades comunes que tanto impacto
tienen en la sociedad.
20
As mismo, se podr intervenir
Volumcn 42 Nmero 2 Abril - Junio 2011
10
travs de las ramas de la medicina genmica: farmacogenmica,
nutrigenmica y toxigenmica.
Farmacogenmica
frmaco sobre el genoma de un individuo y sus efectos generales
en el organismo, as como al desarrollo y uso de medicamentos
personalizados basados en las particularidades genticas de
menos txicos. En los ltimos aos la farmacogenmica al igual
que las otras ramas de la medicina genmica, ha tenido un gran
desarrollo. Uno de los principales retos de la farmacogenmica
es la creacin de nuevos frmacos a la medida de cada paciente
y adaptados a sus condiciones genmicas que tengan mayor
21,22,23
Nutrigenmica
La dieta es un factor ambiental que afecta la salud y la incidencia
de enfermedades crnicas, entender el efecto de la dieta en
la salud requiere estudiar los mecanismos moleculares de los
nutrientes y constituyentes bioactivos de los alimentos sobre las
clulas. Estudios en pacientes, animales y cultivos celulares han
demostrado que estos compuestos pueden regular la expresin de
genes en diversas vas metablicas.
24
la nutricin y la salud humana combatiendo enfermedades
crnicas degenerativas como la obesidad, diabetes, hipertensin
y cncer que tienen un componente gentico y en las que la
dieta juega un papel importante, la nutrigenmica persigue
conocer con profundidad las interacciones genes-nutrientes, y
tener un buen conocimiento sobre los alimentos funcionales, as
mismo se pretende tener una legislacin que regule el campo
de la seguridad alimentaria y poder establecer una nutricin
personalizada considerando tanto las propiedades saludables
Toxigenmica
Aplicando los avances de la genmica a la toxicologa, ha
aparecido una nueva rea denominada toxigenmica, que estudia
la respuesta a nivel de expresin de genes de los organismos
expuestos a agentes qumicos, estos incluyen frmacos,
contaminantes ambientales, aditivos de alimentos y otros
productos qumicos de uso comn. Con esta disciplina podra
nuevos frmacos y as salvar animales, ahorrar tiempo y dinero en
estudios de toxicidad. Esta disciplina permite as mismo, conocer
el papel de las interacciones entre genes y medio ambiente en el
desarrollo de enfermedades.
25,26,27
Protemica
La protemica es el estudio y caracterizacin de todo el conjunto
de protenas expresadas de un genoma, permite identifcar,
a las interacciones que se establecen entre ellas. De este modo,
se pueden caracterizar las redes funcionales que establecen las
(metabolmica). La tecnologa que involucra el estudio de la
los patrones de expresin en geles de poliacrilamida en dos
espectrometra de masas, almacenar la informacin y elaborar
bases de datos que al ser relacionadas con estudios de genmica
dan una aproximacin global en el estudio del metabolismo
celular en condiciones normales o durante el desarrollo de
alguna enfermedad.
28
Esta nueva disciplina se est aplicando
de enfermedades, la identifcacin de nuevos frmacos, la
enfermedades y el anlisis de procesos de transduccin de seales.
Con los estudios de protemica, se realiza de forma global, un
anlisis estructural y una caracterizacin de todas las protenas
que se expresan bajo una determinada condicin, as como la
caracterizacin de la variabilidad proteica (tipos de protenas,
cantidades, niveles de actividad) y las interacciones protena-
protena as como su localizacin celular.
29
As mismo, a partir de la secuencia del genoma humano se
puede predecir la secuencia de aminocidos de las protenas, lo
que ha permitido realizar comparaciones entre todo un conjunto
de protenas para tratar de elucidar la funcin de cada una de
ellas,
30,31
sin embargo, la informacin genmica y la comparacin
una comprensin completa de cmo funcionan en el organismo,
por lo que ha sido necesario y de suma importancia desarrollar
programas computacionales aplicados a la biologa, gentica,
genmica y protemica.
Con el desarrollo de la protemica y la genmica, se han creado
bases de datos de protenas que se expresan en un organismo
informacin de los niveles de expresin de RNAm por hibridacin
de microarreglos. La combinacin de tecnologas permite una
post-traduccin. Sin embargo, el desarrollo de ambas disciplinas
est en rpida expansin con nuevos enfoques experimentales.
32
Bioinformtica
La bioinformtica es una disciplina cientfca en rpido
crecimiento, que implica el desarrollo de algoritmos y su
aplicacin para la interpretacin de datos biolgicos obtenidos
por medio de todas las tcnicas moleculares existentes, as
mecanismos de regulacin gnica y posteriormente hacer un
escalamiento de molculas individuales a organelos, clulas,
11
organismos completos y poblaciones de organismos. El objetivo
general es conocer los mecanismos moleculares para predecir,
prevenir y curar enfermedades.
En el campo de las ciencias biolgicas, el desarrollo de la
informtica se ha enfocado al manejo, anlisis y entendimiento
de la enorme cantidad de informacin generados por estudios de
genmica y protemica, enfocndose bsicamente a la generacin
de bases de datos tiles para almacenar la informacin;
el desarrollo de herramientas especializadas para extraer
informacin de dichas bases de datos y el manejo, desarrollo y
comprender el funcionamiento global del organismo.
Uno de los mayores desafos de la bioinformtica ha sido
reconstruir transcriptomas de novo. Basados en la secuencia de
genoma de S. cereviaiae un grupo de investigacin desarroll
algoritmos para construir automticamente un catalogo de
transcritos de la levadura, con una alta precisin pudiendo
predecir la expresin del 86% de genes bajo ciertas condiciones.
33
Impacto de la Genmica
El principal impacto de la genmica a diez aos de la publicacin
del genoma humano, ha sido la capacidad y la habilidad para
estudiar e investigar los fenmenos biolgicos de una forma
comprensiva e imparcial. En medicina, gracias a la genmica
han surgido las primeras aproximaciones para describir rutas
celulares y genes que se encuentran involucrados en el desarrollo
de una enfermedad.
Los estudios con algunos genes candidatos haban permitido
un progreso lento, hoy en da con estas aproximaciones se
hereditarias, ~1,100 loci que afectan desordenes polignicos y
~150 zonas recurrentes de mutaciones somticas en cncer
34
.
Se han creado mapas epigenmicos que muestran la ubicacin
35
loci relacionados con al
enfermedad de Crohn, enfermedad crnica autoinmune
llevando a cabo numerosas investigaciones en el campo de la
de un individuo permite determinar su susceptibilidad a la
enfermedad o su respuesta al tratamiento.
36
La diabetes tipo 2 que afecta a aproximadamente 300 millones
de personas en el mundo ha tenido especial atencin dentro del
loci relacionados
con este trastorno, los genes que haban previamente sido
implicados en la regulacin de la glucosa con base en estudios
bioqumicos, no parecen estar asociados con la diabetes tipo 2,
se ha encontrado que muchos de los genes involucrados estn
relacionados con la secrecin de insulina ms que con la resistencia
a la insulina como la causa principal de esta enfermedad.
37
El estudio de los desordenes mentales ha tenido poco alcance,
estar basados en la presencia de sntomas en cuanto a fenmenos y
identifcado dos variantes comunes en desorden bipolar y
esquizofrenia,
38,39
as como algunas deleciones en autismo y
en esquizofrenia.
40
Estas pequeas variantes representan un
mnimo porcentaje de lo que se conoce acerca de la etiologa de
los trastornos psiquitricos por lo que aun que da mucho camino
por recorrer en esta rea de la investigacin. Algunos autores
han sugerido que la investigacin de los mecanismos moleculares
implicados en enfermedades neuropiquitricas pueden ser una
va de investigacin etiopatognica y de descubrimiento de
nuevas herramientas terapeuticas.
41
El anlisis de la expresin de genes en el estudio del cncer ha
moleculares ms que en los sitios donde stos se inicien.
42,43
Estos
estudios que se han vuelto rutinarios en investigacin clnica,
una quimioterapia despus de una ciruga.
44
Recientemente estudios con microarreglos para analizar ms
de 3,000 tumores de 26 diferentes tipos de cncer permitieron
45
As mismo se
que incluyen translocaciones funcionales involucradas solo en uno
de varios factores de transcripcin en ms del 50% de cnceres de
prstata, lo que desminti la creencia de que las translocaciones
jugaban un importante papel en el desarrollo de cncer.
46
Actualmente existen proyectos como
que representa un esfuerzo de lucha contra el cncer su objetivo
inicial fue obtener una caracterizacin genmica sistemtica y
completa de tres tipos de cncer, secuenciando los genomas de
cientos de tumores por cada tipo de cncer sin embargo con el
avance vertiginoso de la investigacin estos objetivos han sido
expandidos dramticamente, puesto que los pacientes con cncer
pueden optar por aportar sus datos genmicos y clnicos para
contribuir al progreso de la biomedicina.
Genmica en Mxico
en biomedicina slo sern posibles en el marco de programas
nuevos conocimientos genmicos y que estos deriven en
Volumcn 42 Nmero 2 Abril - Junio 2011
12
que en Mxico se cre en el ao 2004 el Instituto Nacional de
Medicina Genmica (INMEGEN) mediante una estrecha
colaboracin entre la Secretara de Salud, la Universidad
Nacional Autnoma de Mxico, el Consejo Nacional para la
Ciencia y Tecnologa y la Fundacin Mexicana para la Salud.
A partir de la creacin del INMEGEN, Mxico ha asumido
un compromiso para desarrollar la infraestructura humana y
tecnolgica en genmica con especial nfasis en el desarrollo de
una plataforma nacional en medicina genmica para mejorar la
salud de la poblacin mexicana, desarrollando y proponiendo
estrategias coordinadas en el contexto de una poblacin de
aproximadamente 112 millones de habitantes incluyendo a ms
de 60 grupos tnicos y una compleja historia de mezcla gentica.
Enfermedades como la diabetes, la obesidad, cardiovasculares y
cncer, entre otras muchas son las prioridades de investigacin
en el INMEGEN tomando como punto de partida, las bases
genticas que se han establecido desde hace muchos aos.
moleculares de la individualidad humana y fue el detonante para
tecnolgica, se creara un instituto con tal envergadura. En l se
han realizado anlisis genticos de la poblacin mexicana donde
susceptibilidad y resistencia a enfermedades multifactoriales
comunes, esta informacin ha servido para comenzar con una
serie de investigaciones que pueden ayudar a mejorar la salud
de la poblacin mexicana.
47
As mismo se han desarrollado
investigaciones en torno al estudio de la expresin de genes
involucrados en trastornos hepticos como cirrosis y cncer.
48,49,50

Esta informacin junto con el desarrollo de las nuevas tecnologas
que se han mencionado a lo largo de este texto, ha llevado a la
Medicina Genmica a tomar conciencia de la necesidad de tener
una medicina ms predictiva y preventiva con sus importantes
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