Sobre el origen de genmica adaptacin a alta temperatura para organismos procariticos

Biologa evolutiva durante mucho tiempo se ha intentado encontrar el mecanismo adaptativo de molculas de cidos
nucleicos bajo temperaturas de alto crecimiento. Existe considerable variacin en la guanina (G) y citosina (C)
contenido entre los microorganismos. Las causas de la variacin en las composiciones de base se han mantenido la
cuestin fundamental entre selectionists y neutralists. Hiptesis de adaptacin trmica propuesto por Bernardi da una
relacin entre temperatura y contenido de GC si existe una variacin considerable de guanina (G) y citosina (C)
contenido entre especies. G:C pares son trmicamente ms estables que los pares A:T, G:C pares estn conectadas por
tres enlaces de hidrgeno y A:T pares por dos. Sin embargo, algunos autores han podido hacer ninguna correlacin
entre la composicin de GC (o GC3) y la temperatura. Recientemente, Musto et al afirm que existe una correlacin
positiva entre la temperatura de crecimiento ptima y contenido GC genmica en la mayora de las familias
bacterianas estudiaban; Pero algunas anomalas ya se han sealado con respecto a la perfeccin del conjunto de datos
considerado por Musto et en sus anlisis.
En el transcriptoma de nivel, curiosamente, Galtier y Lobry demostraron que existe una correlacin significativa
entre G + C contenido de RNAs estructurales (tales como ribosomal y RNAs de transferencia) y la temperatura de
crecimiento. Lobry y Chessel observ una preferencia para salas C y G-final de codones para aminocidos do en
thermophiles. Sin embargo, ellos no proporcionaron ninguna razn para la preferencia de C y G final codones en do
aminocidos. Efecto del codn puro purnica
Se ha observado un comportamiento idiosincrsico en la variacin de grupos WSC y WSG de codones. Mientras que el
grupo WSC de codones negativamente se correlaciona significativamente con la temperatura de crecimiento (r = 0.619,
p < 0.05), grupo WSG de codones positivamente se correlaciona significativamente con la temperatura de crecimiento (r
= 0.847, p < 0,01). La cin inesperado DaNello positiva observada para el grupo WSG de codones nos impuls a
analizar las frecuencias de los codones que conforman grupo WSG con respecto a la temperatura ptima del
crecimiento. Sorprendentemente, la correlacin positiva significativa para el grupo WSG de codones es enteramente
debido al aumento significativo del codn AGG (r = 0.868, p < 0,01), que es el codn slo puro purnica presente en
este grupo. Los coeficientes de correlacin para otros codones que integran este grupo son: TGG (r = 0.369), TCG (r =
0352) y ACG

(r = 0.205).


Soluciones de algunos hechos hasta ahora sin resolver
En este contexto, debemos hablar de los resultados obtenidos anteriormente por Galtier y Lobry. RNAs
estructurales (rRNAs y tRNAs) son los genes no codificante de la protena, interaccin codonanticodon de
ninguna manera en est relacionado con estos genes. Como resultado, riqueza de GC de estos RNAs
estructurales a temperatura superior slo tendra un efecto estabilizador y la riqueza de GC de estos genes
no tendra una respuesta correlacionada hacia otros niveles moleculares. Por otro lado, para genes de la
protena-codificacin, desde la evitacin de la formacin de side-by-side GC pares de base en la interaccin
codonanticodon tiene un efecto dominante; presumiblemente, es difcil conseguir siempre una correlacin
positiva entre composicin GC (o GC3) y la temperatura ptima del crecimiento.

Una estrategia de los organismos para sobrevivir en la temperatura alta est vinculada a su capacidad de
producir suficientes cantidades de productos gnicos funcionales bajo la condicin trmica extrema. Esto
podra lograrse mediante una combinacin de cambios adaptativos en varios niveles, y estabilidad en un
nivel no puede ser lograda por desestabilizar a otros niveles.
En resumen, la conclusin ms importante del presente estudio es el hecho de que independientemente de
los cambios que tienen lugar en uno o varios otros niveles, siempre sera un resultado positivo maximizar la
funcin biolgica a temperatura de alto crecimiento.