Adn

Bioqumica
CIDOS NUCLEICOS

Los cidos nucleicos, as como las protenas e hidratos de carbono constituyen gran
parte de la materia viva (biomolculas). En particular, los cidos nucleicos son los
componentes ms fundamentales e importantes de la clula viva.

Parece probable que la vida en si empezara su evolucin con los cidos nucleicos puesto
que son las nicas sustancias biolgicas que poseen la notable propiedad de
autoduplicacin.

Los cidos nucleicos actan como depositarios y transmisores de la informacin
gentica de cada clula. Gran parte del desarrollo fsico de un organismo a lo largo de
su vida est programado en estas molculas. Las protenas que elaborarn sus clulas y
las funciones que realizarn estn todas registradas en esta cinta molecular.

A continuacin se tratar de describir los cidos nucleicos, se aportar una breve
introduccin respecto a la forma en la que stos mantienen y transmiten la informacin
gentica y el papel que desempean en la formacin de protenas.

DNA

El DNA es una macromolcula muy larga, de aspecto filamentoso y formada por un
gran nmero de desoxirribonucletidos, cada uno de ellos compuesto por una base
nitrogenada, un azcar (desoxirribosa) y un grupo fosfato. Las bases de las molculas de
DNA son las responsables de portar la informacin gentica, en tanto que los grupos
azcar y fosfato tienen un papel estructural.

La unidad estructural bsica del DNA es el nucletido. Un nucletido est formado por
una base nitrogenada, un azcar y uno o ms grupos fosfato.

La desoxirribosa es el azcar de los desoxirribonucletidos. Desoxi pues este azcar
carece de un tomo de oxgeno en la posicin 2 del anillo mientras que la ribosa si lo
tiene. La base nitrogenada deriva de la purina o la pirimidina.

N
N
N
N
1
2
3
4
5
6 7
8
9
N
N
1
2
3
4
5
6
O
OH CH
2
OH
OH
1'
2' 3'
4'
5'
H

Purina

Pirimidina

-D-2-Desoxirribosa

El DNA contiene dos bases derivadas de la purina, la adenina (A) y la guanina (G), y
dos de la pirimidina, timina (T) y citosina (C).

N
N
N
N
NH
2

H
N
N
N
N
O
2
N

N
N O
O
CH
3

O
N
N
NH
2

Adenina (A) Guanina (G) Timina (T) Citosina (C)

Escuela de Vitivinicultura Pte. Toms Berreta Pg. 1
Bioqumica
Un nuclesido est formado por una base prica o pirimidnica enlazada a un azcar.
Los cuatro nuclesidos del DNA se llaman desoxiadenosina, desoxiguanosina,
desoxitimidina y desoxicitidina. El ster fosfrico de un nuclesido es lo que se
denomina nucletido.

O
CH
2
OH
Base
O P
O
O
O
P
O
O
O P
O
O
O

Nucletido genrico o
nuclesido trifosfato
H

El esqueleto de DNA, que es constante a lo largo de la molcula, est formado por
desoxirribosas ligadas por puentes fosfodister. Concretamente, el hidroxilo 3 (3-OH)
del azcar de un desoxirribonucletido est unido al hidroxilo 5 (5-OH) del azcar
adyacente por un enlace fosfodister. La parte variable del DNA es la secuencia de los
cuatro tipos de bases (A, G, C o T) as es que se utilizan esas iniciales para hacer
referencia a una secuencia concreta de un polinucletido.

Las cadenas de DNA tienen polaridad.
Uno de los extremos de la cadena tiene
un grupo 5-OH y el otro un grupo 3-OH
que no estn unidos a otro nucletido.

Por convencin el smbolo ACG indica
l DNA por Watson y Crick revolucion a la

as caractersticas ms sobresalientes del modelo de DNA son (ver fig.1):
1) Hay dos cadenas helicoidales de polinucletidos enrolladas a lo largo de un eje
2) e la hlice mientras que las
3) tes estn separadas por
3,4 a lo largo del eje de la hlice y desplazadas por una rotacin de 36.
que el grupo 5-OH de la
desoxiadenosina est libre y que tambin
lo est el grupo 3-OH de la
desoxiguanosina. As pues, la secuencia
de bases est escrita en la direccin
53.

Base
O
P O O
O
O
CH
2
O H
O
CH
2
H
P O O
O
Base
Puente fosfodister

El descubrimiento de la doble hlice de
biologa (1953)
L

comn. Las cadenas corren en direcciones opuestas.
Las bases de purina y pirimidina estn en el interior d
unidades de fosfato y desoxirribosa estn en el exterior.
El dimetro de la hlice es de 20, las bases adyacen

Bioqumica

. La

5)
o est
restringida en modo

a replicacin del DNA es semiconservativa
omo suele ocurrir con una buena teora o modelo, la
structura de Watson y Crick explicaba tambin otros
dan. El
ioqumico Erwin Chargaff, que haba determinado las
ebras son
omplementarias. Si las hebras pudieran separarse y se
4) Las dos cadenas
permanecen unidas
por puentes de
hidrgeno entre los
pares de bases

Fig. 1. Estructura del DNA
adenina siempre est
emparejada con la
timina y la guanina
con la citosina.
La secuencia de las
bases posibles a lo
largo de la cadena del
polinucetido n
alguno. La secuencia
de bases precisa
transporta la
informacin gentica.
L

C
e
datos que hasta entonces no se compren
b
cantidades relativas de A, T, G y C en los DNA de
muchos organismos encuentra que A y T estaban
presentes casi siempre en cantidades aproximadamente
iguales y lo mismo suceda con G y C. Si la mayor parte
del DNA de las clulas era de doble hebra, con el
apareamiento entre bases de Watson y Crick, la regla de
Chargaff era una consecuencia natural de ello.

El modelo de Watson y Crick no solo explicaba la
estructura del DNA y la regla de Chargaff; como A se
aparea con T y C con G, las dos h
Fig. 2. Autorreplicacin del
DNA.
c
pudiera sintetizar un nuevo DNA a lo largo de cada una
de ellas siguiendo el apareamiento de bases, podran
obtenerse dos molculas de DNA de doble hebra, cada
una de las cuales sera una copia exacta del original. Esta
autorreplicacin es precisamente la propiedad que el
material gentico debe poseer (fig. 2)

Bioqumica
La primera enzima descubierta que est dirigida por un molde: La DNA
Polimerasa I
a DNA polimerasa I no es la enzima que replica la mayor li.
parte es la DNA polimerasa ms sencilla y la mejor conocida. Su estudio
rve de ejemplo para muchos principios clave de la accin de las DNA polimerasas,
n es catalizada por un nico centro activo que
uede enlazarse a cualquiera de los cuatro desoxirribonuclesidos trifosfato (dNTPs) El
ibre
un molde de DNA

parte del DNA de E. co
bin
L
Sin embargo, juega un papel crtico en la replicacin y tam en la reparacin del
DNA. Por otra
si
tanto procariticas como eucariticas.

La DNA polimerasa I es una enzima con una procesividad o progresividad moderada:
antes de disociarse del DNA molde cataliza la formacin de aproximadamente 20
puentes fosfodister. La polimerizaci
p
que se enlace uno u otro depende de la base correspondiente de la hebra molde. La
probabilidad de que se forme un enlace y de que se establezca un puente fosfodister es
muy pequea, a menos que el nucletido que llegue forme un par de bases de Watson y
Crick con el nucletido opuesto del molde.

La DNA polimerasa exige como requerimientos mnimos:
a) los cuatro dNTPs (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) y Mg
2+

b) una cadena cebadora con grupo 3-OH l
c)

La reaccin que cataliza esta enzima es:

) DNA (
residuos n
dNTP +
i residuos 1 n
PP ) DNA ( +
+

una pirofosfatasa inorgnica permite que la
accin pueda proseguir.
a DNA Polimerasa I tambin es una exonucleasa 35 que corrige sus errores
de catalizar la hidrlisis de cadenas de DNA as como su
olimerizacin. La enzima cataliza la hidrlisis de uno en uno de los nucletidos que no
o
e actividad exonucleasa es distinto del centro de actividad polimerasa.
ad exonucleasa
ejora notablemente la exactitud de la replicacin del DNA, ya que constituye un
letido. En efecto, la DNA
olimerasa I comprueba el resultado de cada polimerizacin que cataliza antes de

La hidrlisis del pirofosfato (PP
i
) por
re
L

La DNA polimerasa I pue
p
estn apareados en el extremo 3 de las cadenas de DNA (exonucleasa 35) El centr
d

La actividad nucleasa 35 tiene una funcin correctora en la polimerizacin. En
general, la DNA polimerasa I elimina los residuos incorrectamente apareados del
extremo del cebador antes de iniciar la polimerizacin. Esta activid
m
control adicional para el correcto apareamiento de las bases.

Por lo general, la polimerizacin no se produce a menos que los pares de bases se
adapten a una doble hlice. Sin embargo, un error cometido durante esta etapa, casi
siempre puede corregirse antes que se aada el siguiente nuc
p
incorporar el siguiente nucletido.

Bioqumica
La actividad 35 exonucleasa de la DNA polimerasa III elimina aproximadamente 1
de cada 10 nucletidos apareados correctamente. La frecuencia de esrror de la enzima es
e 10
-7
. Despus de la replicacin hay tres sistemas de reparacin que mejoran la
sta enzima puede tambin hidrolizar DNA a partir del extremo 5 de la cadena. El
tivos
e polimerizacin e hidrlisis 35.
or. Adems, la actividad exonucleasa 53 complementa la actividad
xonucleasa 35 ya que corrige errores de distinto tipo. La polimerizacin y la
as DNA plomerasas II y III se parecen a la I en varios aspectos:
molde a partir de dNTP.
2. Se requiere un cebador con 3-OH libres.

Un ue forma parte la DNA polimerasa III sintetiza la
may s que la DNA polimerasa I elimina el cebador y
llena los espacios vacos. La DNA polimerasa II participa en la reparacin del DNA
cen simultneamente el desenrollamiento y la
ntesis se llama horquilla de replicacin.
nuevo DNA. El sentido global de la sntesis de DNA debe ser 53 para
na hebra y 35 para la otra. Sin embargo, todas las DNA polimerasas conocidas
(1000 nucletidos) los cuales estn
mporalmente presentes en las proximidades de la horquilla de replicacin. A medida
d
fidelidad hasta obtener una tasa de mutacin global de 10
-10
por par de bases y por
generacin.

La DNA Polimerasa I es tambin una exonucleasa 53 que corrige errores

E
centro activo con actividad exonucleasa 53 difiere claramente de los centros ac
d

La DNA Polimerasa I contiene tres centros activos distintos en una nica cadena
polipeptdica

La actividad 53 juega un papel fundamental en la replicacin del DNA al eliminar
el RNA cebad
e
correccin (35) pueden tener lugar de forma casi simultnea, sin que la enzima deba
disociarse del DNA.

Descubrimiento de las DNA Polimerasas II y III

L
1. Catalizan la sntesis de DNA dirigida por un
3. Sntesis en direccin 53
4. Actividad exonucleasa 35
complejo multienzimtico del q
or parte del DNA nuevo, mientra
re
pero no es necesaria para la replicacin.

La sntesis de DNA nuevo est estrechamente relacionado con el desenrrollamiento del
DNA parental. El lugar donde se produ
s

Una hebra del DNA se sintetiza en fragmentos y la otra se sintetiza en forma
continua

En la horquilla de replicacin, las dos hebras del DNA parental sirven de molde para la
sntesis de
u
sintetizan DNA en sentido 53 y no 35.

Reiji Okazaki descubri que una proporcin importante del DNA recin sintetizado
existe en forma de fragmentos pequeos
te

Bioqumica
que avanza la replicacin estos fragmentos se unen covalentemente por medio de la
DNA ligasa para formar una de las hebras hijas, la hebra retrasada. La otra hebra
nueva se sintetiza en forma continua, sin interrupciones, y se denomina hebra gua.

La replicacin en E. coli comienza con el desenrrollamiento en el punto oriC
(origen)

Un cebador de RNA sintetizado por la primasa permite que comience la snte
DNA
sis de
ue no se construya un cebador. Las RNA polimerasas pueden iniciar cadenas de
ovo, as que RNA podra servir como cebador para iniciar la sntesis de DNA.
une al
omplejo carente de cebador formando un ensamblaje de mltiples subunidades llamado
dad.
ntetiza la mayor parte del DNA.
hebra gua utilizando un RNA cebador originado por la primasa. El
NA dplex, situado por delante de la polimerasa, se desenrolla por la accin de una

Luego del desenrrollamiento, el molde est expuesto pero no se puede sintetizar DNA
hasta q
n

En efecto, el RNA acta como cebador en la sntesis de DNA, y ese cebador est
sintetizado por una RNA polimerasa especfica llamada primasa la cual se
c
primosoma. La primasa sintetiza un pequeo fragmento de RNA (5 nucletidos) que es
complementario a una de las hebras del DNA molde. Este RNA cebador es eliminado al
final de la replicacin por la actividad exonucleasa 53 de la DNA polimerasa I.

La DNA polimerasa III, una asociacin de al menos 10 subunidades se caracteriza por
una elevadsima progresividad, potencia cataltica (1000 nucletidos/seg) y fideli
si

Las hebras gua y retrasada son sintetizadas de forma simultnea por la DNA
polimerasa III

La DNA polimerasa III se encuentra sobre la horquilla de replicacin, donde comienza
la sntesis de la
D
helicasa dependiente de ATP (fig. 3) La protena de unin a las hebras sencillas
mantiene el DNA desenrollado, extendido y accesible, de modo que ambas hebras
pueden servir de molde. La hebra gua es sintetizada de forma continua por la DNA
polimerasa III. La hebra retrasada se sintetiza en fragmentos, esto se consigue mediante
la formacin de un bucle en el molde de la hebra retrasada. De este modo, el molde de
la hebra retrasada atravesara el centro activo con actividad polimerasa de una
subunidad del dmero polimerasa III en el mismo sentido en que el molde de la hebra
gua lo hace en la otra subunidad. La DNA polimerasa III tendra que abandonar el
molde de la hebra retrasada despus de haber aadido unos 1000 nucletidos a esta
hebra. Entonces se formara un nuevo bucle y la primasa sintetizara de nuevo un
pequeo fragmento de RNA cebador para iniciar la sntesis de otro fragmento de
Okazaki.

Bioqumica

FLUJO de INFORMACIN GENTICA
Los genes establecen las clases de protenas que han de sintetizar las clulas, sin
embargo, el DNA no a que dichos moldes
n las molculas de RNA. El RNA mensajero (mRNA) es el intermediario en el
er figura 4.

Fig. 3. Replicacin del DNA en eucariotas.

es el molde directo para la sntesis proteica, y
so
transporte de informacin para la sntesis de protenas. El RNA de transferencia (tRNA)
y el RNA ribosmico (rRNA) forman parte de la maquinaria propia de esta sntesis.
Todas las formas de RNA celulares son sintetizadas por las RNA polimerasas que
toman las instrucciones del DNA molde. Este proceso de transcripcin se contina con
la traduccin, es decir, la sntesis de protenas de acuerdo con las instrucciones
transmitidas por el mRNA molde.

El flujo de informacin gentica (dogma central de la biologa molecular) en una clula
normal ser:

Protenas RNA DNA
Traduccin in Transcripc

V

Bioqumica

Esto nos lleva al cdigo
ecuencias de tres bases,
Fig. 4. Dogma central de la biologa molecular.

gentico (fig. 5), que es la
relacin entre la secuencia de
bases del DNA (o de su
transcrito de mRNA) y la
secuencia de aminocidos de la
protena.

Fig. 5. Arriba, tRNAs traduciendo el cdigo gentico de un
S
llamadas codones, especifican a
cada uno de los aminocidos.
Los codones del mRNA son
ledos secuencialmente por las
molculas de tRNA, que sirven
de adaptadores en la sntesis de
protenas (fig. 5) Esta sntesis
tiene lugar en los ribosomas,
que son asociaciones complejas
de rRNAs y ms de 50 clases de
protenas.
mRNA. Abajo, el cdigo gentico.

Bioqumica
Varios tipos de RNA desempean papeles
as molculas de RNA son de una sola cadena
as clulas contienen varios tipos de RNA:
l RNA mensajero (mRNA): es la plantilla o
E NA):
l RNA ribosmico (rRNA): es el principal componente de los ribosomas, juega un
is
uesto que las protenas son sintetizadas en el citoplasma y no en el interior del ncleo
as propiedades propuestas para el mensajero fueron:
1. El mensajero deba ser un polinucletido.
eba reflejar la composicin de bases
3. heterogneo en tamao, puesto que los genes (o
importantes en la expresin gentica

L
(fig. 6), excepto en algunos virus. En
consecuencia una molcula de RNA no tiene
necesidad de mantener determinadas
proporciones de bases complementarias. Las
molculas de RNA contienen regiones de
estructura de doble hlice producidas por la
formacin de lazos o bucles en forma de
horquillas. En estas regiones se empareja A-U y
G-C, aunque tambin se ve G-U pero con un
enlace menos fuerte que G-C. La proporcin de
regiones helicoidales en diferentes tipos de RNA
vara entre lmites muy amplios, un valor tpico
es 50%.

L

E
molde para la sntesis de protenas. Existe una
molcula de mRNA correspondiente a cada gen o
grupo de genes que vaya a expresarse, en
consecuencia, las molculas de mRNA son muy
heterogneas.
Fig. 6. Comparacin RNA, DNA

l RNA de transferencia (tR transporta los aminocidos en forma activada al
ribosoma para la formacin del enlace peptdico, en una secuencia que viene
determinada por el mRNA molde. Hay al menos un tipo de tRNA para cada uno de los
veinte aminocidos. Es la ms pequea de las molculas de RNA.

E
papel cataltico y estructural en la sntesis de protenas. Es el ms abundante de los tres
tipos de RNA (80%), luego se encuentra el tRNA (15%) y por ltimo el mRNA (5%)
Descubrimiento del mRNA, el transportador de la informacin en la sntes
proteica

P
de las clulas eucariticas, era evidente que debera existir un intermediario qumico
especificado por los genes el cual deba ser de vida muy corta.

L

2. La composicin de bases del mensajero d
del DNA que lo especifica.
El mensajero deba ser muy
grupos de genes) varan en longitud.

Bioqumica
4. El mensajero deba estar asociado transitoriamente con los ribosomas, los sitios
de la sntesis de protenas.
5. El mensajero deba ser sintetizado y degradado rpidamente.

Luego de una serie de experimentos, se concluy que los ribosomas son estructuras no
especializadas que sintetizan, en un momento determinado, la protena dictada por el
mensajero que contienen en aquel momento. Con lo que el mRNA es el transportador de
la informacin entre el gen y la protena.

Todo el RNA celular se sintetiza por las RNA polimerasas

La RNA polimerasa es la enzima que se sintetiza el RNA segn las instrucciones dadas
por un DNA molde. La RNA polimerasa de E. coli requiere los siguientes componentes
para la sntesis de RNA:

1. Un molde, el cual es preferentemente un DNA de doble cadena, pero tambin
puede ser DNA de una sola cadena.
2. Precursores activados, que son los cuatro ribonuclesidos trifosfato: ATP, GTP,
CTP y UTP.
3. Un in metlico divalente. Son eficaces el Mg
2+
o el Mn
2+
.

La RNA polimerasa cataliza la iniciacin y la elongacin paso a paso de las cadenas de
RNA. La reaccin catalizada por esta enzima es:

riboNTP ) RNA (
residuos n
+
i residuos 1 n
PP ) RNA ( +
+

La sntesis de RNA se asemeja a la de DNA en varios aspectos:

a. La direccin de sntesis es 5 3
b. El mecanismo de elongacin es similar, ataque nucleoflico del grupo 3-OH del
extremo de la cadena en crecimiento sobre el fosfato ms interno del nuclesido
trifosfato recin llegado.
c. La sntesis viene favorecida por la hidrlisis de pirofosfato.

Al contrario de la DNA polimerasa, la RNA polimerasa no requiere un iniciador. Otra
diferencia es que el DNA molde se conserva ntegramente en la sntesis de RNA
mientras que en la sntesis de DNA slo se conserva la mitad.

Tambin, la RNA polimerasa carece de la capacidad nuclesica que utiliza la DNA
polimerasa para cortar los nucletidos mal emparejados.

La transcripcin comienza en los centros promotores y finaliza en los centros de
terminacin

Los DNA moldes contienen regiones llamadas centros promotores que se unen
especficamente a la RNA polimerasa y determinan donde comienza la transcripcin. En
bacterias son muy importantes las dos secuencias situadas cerca del primer nucletido
que va a ser transcrito y ubicadas hacia el extremo 5. Una de ellas, llamada secuencia
Pribnow, contiene la secuencia consenso TATAAT y est centrada a 10 (diez
nucletidos hacia el lado 5 a contar desde el primer transcrito +1) La otra, llamada

Bioqumica
regin 35, tiene la secuencia consenso TTGACA. El primer nucletido transcrito es
normalmente una purina.

Los genes eucariticos que codifican protenas poseen centros promotores con una
secuencia consenso TATA centrada alrededor de 25, esta secuencia TATA es anloga
a la secuencia Pribnow de procariotas, salvo que est situada ms lejos secuencia arriba.

-35 -10 +1
TTGACATATAATsitio inicio

El centro promotor se encuentra en la hebra codificadora, la hebra molde (hebra
antisentido) es complementaria del RNA.

La RNA polimerasa discurre a lo largo del molde de DNA y transcribe una de sus
hebras hasta alcanzar la secuencia de terminacin. Esta secuencia codifica una seal de
terminacin que en E. coli consiste en una horquilla de bases emparejadas en la
molcula de RNA recin sintetizada. Esta horquilla se forma por emparejamiento de
bases se secuencias autocomplementarias, ricas en G y C. El RNA naciente se disocia
espontneamente de la RNA polimerasa cuando a la horquilla le sigue una hilera de
residuos U. Se sabe mucho menos sobre la terminacin de la transcripcin en
eucariotas.

El RNA de transferencia es la molcula adaptadora en la sntesis de protenas

Hemos visto que el mRNA es el molde para la sntesis de protenas. Cmo dirige a los
aminocidos para unirlos en la secuencia correcta?
Los aminocidos son transportados hacia el molde
por una molcula adaptadora y este adaptador es la
parte que se ajusta realmente con el RNA. Se
requieren entonces al menos veinte adaptadores,
uno por cada aminocido, pues cada uno de ellos
es especfico. El adaptador en la sntesis de
protenas es el tRNA.

El tRNA contiene un centro de unin al
aminocido y un centro de reconocimiento del
molde. El aminocido se une al tRNA por el
carboxilo esterificado con el 3 o 2-OH y la
lectura de mensajero es 53 sintetizando la
cadena polipeptdica de NH
2
COOH.
Cada molcula de tRNA transporta un aminocido
especfico en forma activada hasta el lugar de la
sntesis de la protena. El lugar de reconocimiento
del molde en el tRNA es una secuencia de tres
bases llamada anticodn. El anticodn del tRNA
reconoce una secuencia de tres bases
complementarias del mRNA llamada codn (fig. 7)

Fig. 7. Ordenamiento e codones d

Bioqumica
Caractersticas principales del cdigo gentico
4 codones, 61 tripletes corresponden a aminocidos y 3 son clave para la terminacin
os codones que codifican para un mismo aminocido se llaman sinnimos. Por
Cul es el significado biolgico de la degeneracin generalizada del cdigo gentico?

a degeneracin del cdigo puede ser tambin significativa en cuanto que permite al
l RNA mensajero contiene seales de iniciacin y de parada para la sntesis de
a seal de iniciacin para la sntesis proteica es compleja, las cadenas polipeptdicas en
UG es solo parte de la seal de iniciacin. En bacterias el AUG (o GUG) de iniciacin
l cdigo gentico es prcticamente universal
os mRNA pueden ser traducidos correctamente por la maquinaria sintetizadora de

6
de la cadena. Como hay 20 aminocidos y 61 tripletes que lo codifican, es evidente que
el cdigo es muy degenerado. Muchos aminocidos estn codificados por ms de un
triplete. Slo el triptfano (Trp) y la metionina (Met) estn codificados por un solo
triplete, mientras que la leucina, arginina y serina son especificados por seis codones
cada uno (fig. 5) El nmero de codones para un aminocido est correlacionado con la
frecuencia de aparicin en las protenas.

L
ejemplo CAU y CAC son sinnimos para histidina.

Si el cdigo no fuera degenerado, 20 codones designaran aminocidos y los otros 44

conduciran a la terminacin de la cadena. La probabilidad de mutacin que originase la
terminacin de la cadena sera mucho mayor con un cdigo no degenerado que con el
cdigo actual. Las mutaciones de terminacin de la cadena conducen generalmente a
protena inactivas, mientras que las sustituciones de un aminocido por otro son
generalmente inocuas. As pues, la degeneracin reduce al mnimo los efectos
deletreos delas mutaciones.

L
DNA modificar ampliamente su composicin de bases sin alterar la secuencia de
aminocidos de las protenas codificadas por l.

E
protenas

L
las bacterias comienzan con un aminocido modificado, la formilmetionina (fMet) Hay
un tRNA especfico, el tRNA iniciador, que transporta la fMet. Este complejo fMet-
tRNA reconoce al codn AUG o menos frecuentemente al GUG. Sin embargo, AUG es
codn para una metionina interna y GUG lo es para una valina interna. Esto significa
que la seal para el primer aminocido de una cadena polipeptdica de procariotas debe
ser mucho ms complejo que para el resto.

A
viene precedido por una secuencia rica en purinas (A, G) a varios nucletidos de
distancia. En eucariotas el AUG ms prximo al extremo 5 del mRNA es normalmente
la seal de iniciacin para la sntesis de la protena. Este AUG particular es ledo por un
tRNA iniciador cargado con metionina.

E

L
protenas pertenecientes a especies biolgicas muy alejadas. As, por ejemplo el mRNA
de la hemoglobina humana es traducido correctamente por un extracto celular de
germen de trigo. Las bacterias expresan eficazmente las molculas de DNA

Bioqumica
recombinante que codifican protenas humanas tal como la insulina. Estos resultados
sugieren firmemente que el cdigo gentico es universal.

Sin embargo existen excepciones a esto. Las mitocondrias humanas leen el triplete
UGA como codn para el triptfano en vez de seal STOP. Adems AGA y AGG
significan STOP en vez de arginina y AUA corresponde a metionina en vez de
isoleucina. Las mitocondrias pueden tener un cdigo gentico diferente al del resto de la
clula debido a que el DNA mitocondrial codifica unos tRNAs distintos.

El cdigo gentico es prcticamente, pero no absolutamente universal. Existen
variaciones en mitocondrias y en especies como los ciliados, que se separaron muy
pronto en la evolucin de los eucariotas. Es interesante advertir que dos de los codones
modificados en las mitocondrias humanas disminuyen la informacin asignada a la
tercera base del triplete (por ej. tanto AUA como AUG codifican metionina) La mayora
de las modificaciones observadas respecto al cdigo gentico estndar van en la
direccin simplificadora.

La gran mayora de los genes eucariticos son mosaicos de intrones y exones

En las bacterias las cadenas polipeptdicas estn codificadas por una disposicin
continua de codones del DNA. En genes de organismos superiores no es siempre as,
diversos genes son discontinuos.
Las cadenas de RNA recin
sintetizadas (transcrito primario)
son mucho mayores que las
molculas de mRNA derivadas
de ellas. Las regiones que se
eliminan de este transcrito
primario se llaman intrones
(secuencias intercaladas),
mientras que aquellas que se
mantienen en el mRNA maduro
se denominan exones (regiones
expresadas) Un aspecto comn
de la expresin de estos genes
discontinuos es que sus exones
estn ordenados en la misma
secuencia en el mRNA y en el
DNA. As pues, los genes
entrecortados, como los genes
continuos, son colineales con sus
productos polipeptdicos. El
entrecortado (splicing) es una
operacin compleja realizada por
los spliceosomas que son
asociaciones de protenas y
pequeas molculas de RNA.
Esta maquinaria enzimtica
reconoce las seales del RNA
naciente que especifican los
Fig. 7 . Intrones y exones

Bioqumica
puntos de corte. Los intrones casi siempre empiezan con GU y terminan con una pareja
AG, precedida de un tramo rico en pirimidinas (U, C) Esta secuencia consenso es parte
de la seal de empalme.

Muchos exones codifican dominios de protenas

La mayora de los genes de los eucariotas superiores (aves, mamferos) estn
entrecortados. Los eucariotas inferiores, como las levaduras, tienen una mayor
proporcin de genes continuos.

La comparacin entre secuencias de DNA de genes que codifican protenas muy
conservadas durante la evolucin sugiere firmemente que haba intrones en los genes
ancestrales y que se perdieron durante la evolucin en aquellos seres especializados en
un crecimiento muy rpido, tales como las eubacterias y las levaduras.

Un dominio completo de una protena puede estar codificado por un solo exn. Una
hiptesis muy atrayente es que las protenas nuevas aparecen durante la evolucin por
reordenamiento de los exones que codifican elementos estructurales discretos, centros
de enlace y centros catalticos.

Transcripcin en eucariotas

Las tres etapas de la transcripcin: (1) iniciacin, (2) elongacin y (3) terminacin

(1) La RNA polimerasa desenrolla casi dos vueltas del DNA molde antes de iniciar la
sntesis de RNA. El inicio de la transcripcin se origina en los centros promotores del
DNA molde. Existen dos tramos de secuencias comunes ms all del lado 5 del punto
de iniciacin (secuencia arriba) en procariotas, son la secuencia 10 (TATAAT) y 35
(TTGACA) Los nmeros corresponden a la hebra codificadora.

Hebra codificadora es aquella del DNA que posee la misma secuencia que el RNA
transcrito cambiando U por T (hebra con sentido +); hebra molde es la hebra antisentido
y es la complementaria a la codificadora o al mRNA transcrito primario (hebra con
sentido -)

5Compart. CAATCompart. GCCompart. TATA3
-110 -40
Centro de iniciacin
del mRNA

En levaduras, una secuencia TATAAA centrada entre los nucletidos 30 y 90
desempea el mismo papel.
La mutacin de una nica base en la TATA box daa sensiblemente la actividad del
promotor. Asimismo los intercambios de bases A y T producen prdida de actividad,
demostrando con ello que es esencial la secuencia exacta y no solo un alto contenido de
pares AT.
El compartimiento TATA es necesario pero insuficiente para una alta actividad del
promotor. Se localizan elementos adicionales entre las posiciones 40 y 110 CAAT y
GC que pueden ser tambin eficaces estando en la hebra molde.

Bioqumica
Secuencias intensificadoras pueden estimular la transcripcin en centros de iniciacin
alejados a millares de bases. Las secuencias intensificadoras pueden encontrarse
secuencia arriba, secuencia abajo o incluso en medio de un gen transcrito. Son efectivos
tanto si estn situados sobre la hebra codificadora como sobre la hebra molde.

(2) La elongacin tiene lugar en las burbujas de transcripcin que se desplazan a lo
largo del molde de DNA. La RNA polimerasa es una enzima muy progresiva o
procesiva. Su velocidad de sntesis es de 50 nucletidos por segundo y posee una tasa
de error de un fallo cada 10
4
o 10
5
bases agregadas.

(3) Las regiones transcritas de los moldes de DNA contienen seales de terminacin. La
ms sencilla es una regin palindrmica rica en GC seguida de una regin rica en AT.
El transcrito de RNA de este DNA palindrmico es autocomplementario, por lo tanto,
sus bases se pueden emparejar para formar una estructura en horquilla con un tallo y un
bucle, estructura favorecida por su alto contenido en GC. Esta horquilla estable viene
seguida de una secuencia de 4 o ms residuos U. El transcrito de RNA finaliza en ellos
o justamente despus.

Los precursores de mRNA adquieren casquetes 5 durante la transcripcin

El extremo 5 trifosfato de la cadena de RNA naciente se modifica de inmediato. Se
libera un fosfato, luego el extremo 5 difosfato ataca al tomo P del GTP para formar
un enlace 5-5-trifosfato nada corriente se denomina casquete CAP.

Los casquetes contribuyen a la estabilidad de los mRNAs porque protegen sus extremos
5 frente a las fosfatasas y las nucleasas. Adems los casquetes facilitan la traduccin
del mRNA por los sistemas eucariticos de sntesis proteica.

Despus de la ruptura debida a una endonucleasa se aade una cola de 3-
poliadenilato a la mayora de los precursores de mRNAs

La endonucleasa que reconoce la secuencia AAUAAA rompe los transcritos primarios
eucariticos (el entorno tambin incide en el sitio de ruptura) Luego, la poli(A)
polimerasa aade unos 250 residuos A al extremo 3 y esa cola de A se enrolla
alrededor de varias copias de una protena de unin.

Funcin de la cola poli(A): un mRNA sin cola poli(A) es un molde menos efectivo para
sntesis proteica. La vida de una molcula de mRNA se determina en parte por la
velocidad de degradacin de su cola de poli(A)

En el ncleo de eucariotas el mRNA transcrito primario sufre de un procesamiento a
cargo de ribonucleoprotenas (RNA y enzimas de corte y empalme) encargadas de
eliminar intrones y empalmar exones.

Bioqumica


Fig. Diferencias desde transcripcin a traduccin entre eucariotas y procariotas.

Adn

Cargado por

Información del documento

Derechos de autor

Formatos disponibles

Compartir este documento

Compartir o incrustar documentos

Opciones para compartir

¿Le pareció útil este documento?

¿Este contenido es inapropiado?

Copyright:

Formatos disponibles

Adn

Cargado por

Copyright:

Formatos disponibles

Bioqumica

Si el cdigo no fuera degenerado, 20 codones designaran aminocidos y los otros 44

También podría gustarte