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Dise nos factoriales Tipos de efectos Aditividad Prueba de hip otesis Confusi on Factorial con tres niveles

Dise nos factoriales


Omar S. G omez G.
Facultad de Matem aticas Universidad Aut onoma de Yucat an

Noviembre de 2013

Omar S. G omez G.

Dise no de experimentos en IS

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Dise nos factoriales

El dise no factorial es usado cuando se desea investigar m as de un factor a la vez, es decir, investigar simult aneamente los efectos de varios factores. Este tipo de dise no tambi en es u til para identicar posibles interacciones entre los factores estudiados.

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Ejemplo

Se desea conocer si la experiencia de los sujetos (juniors o seniors) inuye en la efectividad de dos t ecnicas de detecci on de defectos (prueba funcional y estructural). La efectividad se ha medido de acuerdo al porcentaje de defectos observados por los sujetos tras aplicar las t ecnicas.

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Experiencia (A) Junior Senior Promedio

T ecnica (B) Funcional(%) Estructural(%) 50 40 75 65 62.5 52.5

Promedio(%) 45 70

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Tipos de efectos en los factores de un dise no factorial

El efecto de un factor es un cambio en la medici on recabada que es causado por un cambio en el nivel del factor Son tres los efectos que son de inter es en un dise no factorial:
Efectos simples Efectos principales Efectos de interacci on

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Experiencia Junior Senior Prom. T ec.

Funcional 11 21 .1 1 = 2 (11 + 21 )

T ecnica Estructural 12 22 .2 1 = 2 (12 + 22 )

Promedio Exp. 1. = 1 2 (11 + 12 ) 2. = 1 2 (21 + 22 )

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Efectos simples

Los efectos simples de un factor son contrastes entre los niveles de un factor en un s olo nivel de otro factor. Por ejemplo, el efecto simple de la experiencia sobre la t ecnica funcional es: Experienciatec .funcional = 21 11 = 75 50 = 25

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Efectos principales

Los efectos principales de un factor son contrastes entre los niveles de un factor promediados sobre todos los niveles de otro factor. Por ejemplo, el efecto principal del tipo de experiencia sobre ambas t ecnicas es: Experiencia = 2. 1. = 70 45 = 25

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Efectos de interacci on
El efecto de interacci on mide las diferencias entre los efectos simples de un factor en diferentes niveles del otro factor. Considerando los dos efectos simples de la experiencia sobre las t ecnicas, la diferencia entre los dos efectos simples (ldif = l2 l1 ) mide la interacci on entre la experiencia y los factores de la t ecnica respecto a la efectividad. T ecnica Efecto simple de la experiencia Funcional l1 = 75 50 = 25 Estructural l2 = 65 40 = 25 Diferencia ldif = 25 25 = 0

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Efectos de interacci on

La interacci on de un dise no factorial con dos niveles y dos factores 22 o 2 2 se deriva de la diferencia entre los dos factores simples del otro factor AB = (22 12 ) (21 11 ) = (22 21 12 + 11 )

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Ejemplo de no interacci on

75

factor(technique) funcional estructural

mean of effectiveness

40

45

50

55

60

65

70

junior factor(experience)

senior

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Ejemplo de interacci on

factor(technique) 55 estructural funcional

mean of effectiveness

40

45

50

junior factor(experience)

senior

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Ejemplo de interacci on

75

factor(technique) funcional estructural

mean of effectiveness

45

50

55

60

65

70

junior factor(experience)

senior

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Efectos de interacci on

Cuando se presenta una interacci on, las interpretaciones no deben basarse sobre los efectos principales, sino respecto a la interacci on observada

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Experiencia (A) Junior

Senior

Funcional(%) 50 51 49 52 75 76 74 77

T ecnica (B) Estructural(%) 40 41 39 42 65 66 64 67

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Modelo reducido para un dise no factorial con dos niveles y n n factores 2

Las mediciones de un experimento factorial completamente aleatorizado con dos factores, A con a niveles y B con b niveles con r replicaciones pueden estimarse con el modelo: yijk = ij + eijk donde i = 1, 2..., a; j = 1, 2, ..., b ; k = 1, 2, ..., r ; ij es el promedio de la combinaci on de los tratamientos Ai Bj y eijk son los residuos aleatorios (error) con media 0 y varianza 2

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El modelo anterior puede ser estimado usando el m etodo de m nimos cuadrados. La suma de cuadrados del error experiemental es entonces:

r 2 e ijk =

SSError =
i =1 j =1 k =1

(yijk ij )2
i =1 j =1 k =1

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Los estimadores m nimos cuadrados para ij son el promedio de las celdas de las combinaciones de los tratamientos (Factores AB) ij =
yij . r

=y ij .

Los promedios estimados observados son estimadores insesgados del promedio estimado del factor, por lo que i . = y i .. as como .j = y .j . El promedio estimado general .. es estimado con el promedio general y ...

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Experiencia (A) Junior Senior Prom. T ec. ( y .j . )

T ecnica (B) Funcional Estructural 50.5 40.5 75.5 65.5 63.0 53.0

Prom. Exp. ( yi .. ) 45.5 70.5 y ... = 58

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Aditividad

El promedio de la celda ij representa la medici on de la combinaci on del tratamiento del nivel i para A y nivel j para B . En ausencia de interacci on el promedio de la celda puede expresarse como la suma del promedio general, , m as un efecto contribuido por A, digamos i , y un efecto contribuido por B , digamos j , entonces ij = + i + j

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El efecto para el i -esimo nivel del factor A puede denirse como i = i . .. El efecto para el j -esimo nivel del factor B puede denirse como i = .j .. Los efectos ser an jos si los niveles de los factores son reproducibles.

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En ausencia de interacci on, el promedio de la celda es la suma del promedio general y los efectos de los factores de la celda ij = .. + ( i . .. ) + ( .j .. ) El efecto de la combinaci on del ij -esimo tratamiento, ij = (ij .. ), es la suma de los dos efectos de los factores: (ij .. ) = ( i . .. ) + ( .j .. ) entonces se dice que los efectos de los factores son aditivos en ausencia de interacci on

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En presencia de interacci on el efecto del tratamiento no ser a igual a la suma de los efectos individuales del factor (ver ecuaci on anterior). Un efecto de interacci on, denotado como ( )ij , se dene como la diferencia entre los dos lados de la anterior ecuaci on, o: ( )ij = (ij .. ) ( i . .. ) ( .j .. ) = ij i . .j + ..

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Modelo completo para un dise no factorial con dos factores

El modelo lineal para un dise no factorial con dos factores es entonces: yijk = + i + j + ( )ij + eijk donde es el promedio general .. , i es el efecto del i -esimo nivel de A, j es el efecto del j -esimo nivel de B , y ( )ij es el efecto de interacci on entre el i -esimo nivel de A y el j -esimo nivel de B .

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Dado el modelo anterior, la sumatoria de cuadrados total es: SSTotal = SSTratamiento + SSError o,
a b r a b a b r

(yijk y ... ) = r
i =1 j =1 k =1 i =1 j =1

( yij . y ... ) +
i =1 j =1 k =1

(yijk y ij . )2

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La sumatoria de cuadrados del tratamiento se descompone en tres componentes: SSTratamiento = SSA + SSB + SS (AB )

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Donde,
a

SSA = rb
i =1 b

( yi .. y ... )2

SSB = ra
j =1 a b

( y.j . y ... )2

SS (AB ) = r
i =1 j =1

( yij . y i .. y .j . + y ... )2

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Por tanto, se tienen rab mediciones por lo que SSTotal tiene (rab 1) grados de libertad. Para el tratamiento (SSTratamiento ) t = ab se tiene (ab 1) grados de libertad, para el error (SSError ) se tiene ab (r 1) grados de libertad. SSA y SSB tienen (a 1) y (b 1) grados de libertad. Para la interacci on SS (AB ) se tiene (a 1)(b 1)1 grados de libertad.

Los grados de libertad restantes asignados a la sumatoria de cuadrados para la interacci on son los grados de libertad para los tratamientos (ab 1) menos los grados de libertad de las sumatorias de cuadrados de cada factor (a 1) y (b 1), o (ab-1)-(a-1)-(b-1)=(a-1)(b-1).
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Tabla ANOVA

La partici on completa de la sumatoria de cuadrados para un dise no factorial es: Source DoF SS MS F0 Pr > F SSTotal rab 1 SSTotal MSA Factor A a1 SSA MSA MSE MSB Factor B b1 SSB MSB MSE (AB ) AB Inter. (a 1)(b 1) SS (AB ) MS (AB ) MS MSE Error ab (r 1) SSE MSE

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Prueba de hip otesis

En ausencia de interacci on la hip otesis nula es denida como: H0 : ( )ij = ij i . .j + .. = 0 para todos los i , j versus la hip otesis alternativa: Ha : ( )ij = ij i . .j + .. = 0 para alg un i , j y es probada con: (AB ) con el valor cr tico F,(a1)(b1),ab(r 1) F0 = MS MSE

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En el caso del factor A: H0 : 1. = 2. = = a. versus la hip otesis alternativa: Ha : i . = k . para alg un i , k es probada con: MSA F0 = MSE con el valor cr tico F,(a1),ab(r 1)

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En el caso del factor B : H0 : .1 = .2 = = .b versus la hip otesis alternativa: Ha : .j = .m para alg un j , m es probada con: F0 = MSB tico F,(b1),ab(r 1) MSE con el valor cr

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Resultado de la tabla ANOVA

La partici on completa de la sumatoria de cuadrados para un dise no factorial es: Source Total Exp. (A) T ec. (B ) (AB ) Inter. Error DoF 15 1 1 1 12 SS 2920 2500 400 0 20 MS 2500 400 0.0 1.7 F0 1500 240 0 Pr > F < 0.0001 < 0.0001

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En el entorno R

En R puedes usar la siguiente instrucci on para realizar el an alisis de varianza en un dise no factorial con dos factores: aov (eectiveness technique experience ) que es equivalente a: aov (eectiveness technique + experience +technique : experience )

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Ejercicio
Se desea conocer si la productividad (LOCxHr), la densidad de defectos y la tasa de inyecci on de defectos var a en programadores solos o trabajando en pares, as como usando o no entornos de desarrollo integrado. Usando el archivo pp13hist.csv disponible en la plataforma web realiza un an alisis de varianza, donde eval ues los supuestos del modelo y examines las interacciones as como los efectos principales de cada factor. Emplea una gr aca para visualizar las interacciones entre los efectos de los factores. Para gracar las interacciones, puedes usar como referencia la p agina web: http://www.statmethods.net/stats/anova.html
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Actividad
Eval ua la efectivad de las dos t ecnicas de pruebas de software: Programa programa1 Funcional(%) 85.71, 100, 100, 100, 100, 85.71, 100, 100, 100 57.14, 71.43, 71.43, 85.71 0, 71.43, 100, 100, 85.71, 0, 85.71
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programa2

T ecnica Lectura de C odigo(%) 28.57, 28.57, 28.57, 42.86, 57.14, 42.86, 28.57, 71.43, 57.14, 42.86, 42.86 42.86, 57.14, 71.43, 71.43, 42.86, 57.14, 71.43, 71.43
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Dise nos factoriales con 2 niveles y n factores, o 2n

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Dise nos factoriales con 2 niveles y n factores, o 2n


Continuando con el ejemplo donde se examina la efecectividad de las dos t ecnicas en sujetos expertos y novicios, deseamos investigar si la complejidad ciclom atica tambi en inuye en la efectividad de las t ecnicas. Este nuevo factor tiene los valores: baja (< 10) o alta (> 10). Exp. (A) T ecnica (B ) Comp. Cic. (C ) Efectividad (y ) Junior Func. Baja 50 Senior Func. Baja 75 Junior Est. Baja 42 Senior Est. Baja 65 Junior Func. Alta 40 Senior Func. Alta 71 Junior Est. Alta 35 Senior Est. Alta 60
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La estructura de la tabla anterior tambi en permite identicar los efectos principales e interacciones de un dise no 2n en este caso 23 , 2 tal como se muestra en la siguiente tabla : tratamientos (1) a b ab c ac bc abc
2

A 0 1 0 1 0 1 0 1

B 0 0 1 1 0 0 1 1

C 0 0 0 0 1 1 1 1

y 50 75 42 65 40 71 35 60

Donde las letras may usculas representan los factores y las min usculas los niveles del factor o tratamiento. El tratmiento est a presente si contiene alg un 1.
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Ejercicio

Para un dise no factorial de 2 niveles y 4 factores o 24 ,Cu ales ser an los efectos principales y sus interacciones? Construye el modelo resultante (10 minutos)

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Respuesta a ejercicio

Para un dise no factorial de 2 niveles y 4 factores o 24 , los componentes se especicar an de la siguiente manera: 1 + a + b + ab + c + ac + bc + abc + d + ad + bd + abd + cd + acd + bcd + abcd

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Usando la tabla para identicar efectos principales e intarecciones podemos ampliarla para construir los distintos contrastes entre los efectos principales e interacciones, como se muestra en esta tabla3 : Trat. (1) a b ab c ac bc abc
3

I + + + + + + + +

A + + + +

B + + + +

C + + + +

AB + + + +

AC + + + +

BC + + + +

ABC + + + +

y 50 75 42 65 40 71 35 60

Los valores 0 y 1 se cambian por y + para calcular los efectos.


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Trat. (1) a b ab c ac bc abc Divisor Efecto SS


4

I4 + + + + + + + + 8 54.75

A + + + + 4 26 1,352

B + + + + 4 -8.5 144.5

C + + + + 4 -6.5 84.5

AB + + + + 4 -2 8

AC + + + + 4 2 8

BC + + + + 4 0.5 0.5

ABC + + + + 4 -1 2

y 50 75 42 65 40 71 35 60

I denota los s mbolos + para el promedio general con divisor 2n , n = 3


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El contraste de un factor principala o interacci on es: A= 1 4 (50 + 75 42 + 65 40 + 71 35 + 60) = 26


a

Como vimos anteriormente, es el promedio de los efectos simples.

Para calcular la suma de cuadrados de cualquier factor o interacci on, SScontraste = 2rn (lcontraste ... )2 donde r son las replicas, lcontraste ... = i ki y i por u ltimo ki = 1 que indica los coecientes de contraste. Por ejemplo, lA... = (50 + 75 42 + 65 40 + 71 35 + 60) = 104
2 SSA = 1 8 (104) = 1, 352

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Confusi on completa y parcial

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Confusi on completa en dise nos factoriales 2n


Un inconveniente del dise no 2n es que conforme aumentan los factores es m as complicado realizar el experimento en una s ola sesi on ya que implica m as recursos llevarlo a cabo. Por ejemplo en un dise no 24 se requieren 16 combinaciones de tratamientos para realizar el experimento. Una manera de compensar esta situaci on es dividir el dise no 2n en bloques, donde cada bloque contenga un n umero menor de tratamientos. De esta forma los tratamientos de cada bloque se pueden aplicar en difentes sesiones.

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Confusi on completa en dise nos factoriales 2n


Los contrastes entre los bloques construidos a partir de un dise no 2n son id enticos a los contrastes de los tratamientos por lo que se dice que el efecto del tratamiento se confunde completamente con el efecto de los bloques. Cuando se desea usar bloques en este tipo de dise no, generalmente se eligen las interacciones de orden mayor para que se confundan con los bloques. Por ejemplo en un dise no 23 la interacci on de orden mayor es ABC , donde los coecientes de los contrastes son: lABC = ((1), +a, +b , ab , +c , ac , bc , +abc )

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En los contrastes de un dise no 23 se tienen 4 coecientes con signos positivos y cuatro con signos negativos es decir, son ortogonales. En este dise no es posible usar dos bloques donde en uno de los bloques se asignan los tratamientos con signo positivo y en el otro los tratamientos con signo negativo. Eligiendo el contraste lABC = ((1), +a, +b , ab , +c , ac , bc , +abc ) obtenemos los bloques: Bloque I a b c abc +
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Bloque II -(1) ab ac bc
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Como se observa, el contraste de la interacci on ABC se confunde completamente con el contraste de los bloques (BloqueI BloqueII ) Bloque I a b c abc + Bloque II -(1) ab ac bc

El resto de contrastes no se confunde ya que se mantiene la ortogonalidad, por ejemplo en lA , cada bloque contiene dos signos positivos y dos negativos, lA = (abc + a b c ) + (ab + ac bc (1))
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Para un dise no 23 con dos bloques b = 2 por replicaci on. Si tenemos dos replicaciones r = 2 y hemos elegido el contraste lABC para confundirlo con los bloques, la tabla ANOVA resultantes es: Fuente de variaci on Replicas Bloques dentro de la replica Tratamientos A B C AB AC BC Error
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Grados de libertad r 1=1 r (b 1) = 2 6 1 1 1 1 1 1 6


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Actividad
Usando el archivo complete23.csv (disponible en la plataforma web, carpeta ejercicios en clase) que contiene las mediciones de un experiento 23 que analiza la efectividad de dos t ecnicas de pruebas de software empleando sujetos con dos tipos de experiencia y programas con dos tipos de complejidad ciclom atica estructurado de tal manera que la interacci on de tercer orden est a completamente confundida. Realiza un an alisis de varianza donde eval ues los supuestos del modelo y examines las interacciones as como los efectos principales de cada factor. Emplea gr acas para visualizar las interacciones AB , AC y BC .
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Respuesta a ejercicio
aov (efectividad replica + bloque + experiencia tecnica comp ) Df SS MSS F Pr (> F ) replica 1 2.2 2.2 9.0 0.024008 * bloque 2 1.3 0.6 2.5 0.162284 exp. 1 2,304.0 2,304.0 9,216.0 8.61e-11 *** tec. 1 324.0 324.0 1,296.0 3.06e-08 *** comp. 1 9.0 9.0 36.0 0.000965 *** exp.:tec. 1 9.0 9.0 36.0 0.000965 *** exp.:comp. 1 0.0 0.0 0.0 1.0 tec.:comp. 1 0.0 0.0 0.0 1.0 error 6 1.5 0.2

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Actividad

En el ejercicio anterior, se ha confundido el contraste de la interacci on ABC . Empleando los mismos datos, ahora confunde el contraste de la interacci on AB y vuelve a realizar la ANOVA.

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Confusi on parcial en dise nos factoriales 2n

Como ya vimos, empleando la confusi on completa perdemos informaci on sobre el efecto del contraste que es confundido con los bloques. Para evitar esta perdida de informaci on respecto al efecto de alg un contraste, se usan m as replicaciones y se elije otro contraste que pueda ser confundido en los bloques de las replicaciones. De esta manera se dice que el efecto es parcialmente confundido dentro de los bloques.

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BC 5 + (1) 50 ab 65 bc 41 c 48 abc 64 ac 74 a 75 b 42 Bloque I Bloque II R eplica I

AC + abc 65 bc 42 b 43 a 76 (1) 51 ab 66 ac 75 c 49 Bloque III Bloque IV R eplica II

AB + (1) 49 a c 47 b ab 64 ac abc 63 bc Bloq. V Bloq. R eplica III

74 41 73 40 VI

Contraste que es confundido.


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Las sumas de cuadrados para los efectos no confundidos A, B , C y ABC se calculan con la siguiente ecuaci on: SScontraste = 2rn ( ki y i )2 n donde r = 3, 2 = 8, y ki = 1
Prom: A B C ABC (1) 50 a 75 + + b 42 + + ab 65 + + c 48 + + ac 74 + + bc 41 + + abc 64 + + + + y i 2n 8 8 8 8 SS 3,528.4 459.4 9.4 0.37

ki

97 -35 -5 -1

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La suma de cuadrados para el resto de interacciones que est an confundidas en cada replicaci on se calcula en base a las replicaciones donde la interacci on no est a confundida. Por ejemplo, la suma de cuadrados de la interacci on AB se calcula a partir de las r eplicas I y II, para AC a partir de las r eplicas I y III, para BC a partir de las r eplicas II y III

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Trat. Totales: AB AC BC

(1) 150 + + +

a 225 +

b 126 +

ab 195 +

c 144 +

ac 222 +

bc 123 +

abc 192 + + +

ki

y i -15 3 3

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Totales Dif.

R eplica I confusi on BC Bloque I Bloque II 230 229 1


ki

R eplica II confusi on AC Bloque III Bloque IV 234 233 1

R eplica III confusi on AB Bloque V Bloque VI 223 228 -5


2(5)2 8

lAB =

y i DifAB r

15(5) 2

= 5; SS (AB ) =
2(1)2 8 2(1)2 8

= 6.25

lAC = lBC =

31 2 31 2

= 1; SS (AC ) = = 1; SS (BC ) =

= 0.25 = 0.25

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Dise nos factoriales Tipos de efectos Aditividad Prueba de hip otesis Confusi on Factorial con tres niveles

Para un dise no 23 con tres replicaciones (r = 3) donde se confunden parcialmente las interacciones AB , AC y BC . Y donde cada replicaci on contiene dos bloques (b = 2), la tabla ANOVA se especica como:
Fuente de variaci on Replicas Bloques dentro de las replicas A B C ABC AB (Reps .I , II ) AC (Reps .I , III ) BC (Reps .II , III ) Error
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Grados de libertad r 1=2 r (b 1) = 3 1 1 1 1 1 1 1 11


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Actividad
Dadas las siguientes tres replicas, realiza una confusi on parcial confundiendo los coecientes AB , AC y BC .
Trat. (1) a b ab c ac bc abc Exp. (A) Junior() Senior(+) Junior() Senior(+) Junior() Senior(+) Junior() Senior(+) T ec. (B ) Func.() Func.() Est.(+) Est.(+) Func.() Func.() Est.(+) Est.(+) Comp. (C ) Baja() Baja() Baja() Baja() Alta(+) Alta(+) Alta(+) Alta(+) Rep. I (y ) 50 75 42 65 48 74 41 64 Rep. II (y ) 51 76 43 66 49 75 42 65 Rep. III (y ) 49 74 41 64 47 73 40 63

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Dise nos factoriales con tres niveles

Los dise nos factoriales de tres niveles son similares a los factoriales con dos niveles vistos anteriormente. En un dise no con tres niveles y tres factores o 33 se tienen tres interacciones de segundo orden y una de tercer orden. El modelo estad stico es: ijk = + i + j + k + ( )ij + ( )ik + ( )jk + ( )ijk

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An alisis en R

Para analizar un dise no 33 usamos la funci on: aov (respuesta factorA factorB factorC )

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Actividad
Un investigador recab o las siguientes mediciones referentes a un experimento que eval ua, en tres programas, la efectividad (% faltas detectadas) de tres t ecnicas de prueba de software. Genera una an alis de varianzas empleando un dise no factorial de tres niveles con dos factores.
Programa programa A programa B programa C Estructural 16.67, 66.67, 83.33, 83.33, 83.33, 83.33 100, 85.71, 71.43, 71.43, 100, 100 85.71, 85.71, 71.43, 85.71, 85.71, 28.57 Funcional 83.33, 83.33, 100, 66.67, 100, 66.67 100, 100, 57.14, 100, 57.14, 100 85.71, 85.71, 85.71, 57.14, 42.86, 71.43 Revisi on 83.33, 33.33, 0, 0, 50, 66.67 42.86, 14.29, 85.71, 71.43, 71.43, 42.86 42.86, 85.71, 85.71, 71.43, 71.43, 57.14

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