Unas breves cuestiones sobre protenas y enzimas.

1. Sabiendo que el pH isoelctrico (pI) de la Alanina es 6, indica la carga y la estructura qumica que posee dicho aminocido a pH 6, 2 e 9.

2. A 1L de disolucin que posee 1 mol de HCl, se engaden unos g de Alanina (puedes usar tambin el nombre ingls, Alanine, para hacer bsquedas en la web). Indica la frmula molecular de ese aminocido tal y como se encuentra en la disolucin indicada. El cido clorhdrico es un cido muy fuerte y monoprtico que se disocia totalmente, entonces el pH de la disolucin estar referido totalmente a la concentracin del protn disociado: HCl(aq) H+ + ClpH = -log(H+)en este caso la concentracin del HCl es 10-6M, por lo que el pH de la disolucin ser: pH = -log(10-6) = 6, tambin se podra sumar la concentracin del agua en el punto de equilibrio que es 10-14 pero tendramos el mismo resultado. Por lo tanto a este pH, encontramos el punto isoelctrico de la alanina, por lo que se encontrar en forma neutra. 2. Cierto polipptido est formado por 6 restos de Lys, 8 de Ala e 2 de Val. Calcula la masa molecular del peptido en cuestin. (Lysine, Alanine e Valine para las bsquedas en la web). Masa molecular Lys 146,188 x 6 = 877,128 Masa molecular Ala 89,0932 x 8 = 712,7456

Masa molecular Val 117,146 x 2 = 234,292 Tenemos que descontar la masa molecular de las molculas de agua desprendidas en el establecimiento de cada enlace peptdico, como son 16 restos de aminocidos, el nmero de cadenas peptdicas es de n-1=15. Masa molecular agua 18,0153 x 15 = 270,2295 La masa molecular del pptido problema es 1553,9361. 4. La tripsina es una enzima proteoltica que solo cataliza la hidrlisis de determinadas cadenas peptdicas. Cual es el resultado de la accin de la tripsina sobre los siguientes pptidos? H2N-Lys-Met-Cys-Met-Lys-Ala-Cys-Arg-COOH H2N-Asp-Lys-Gly-Ala-Ala-COOH H2N-Arg-Lys-Phe-Gly-Ala-Lys-Asp

En la direccin web que ofrece el enunciado podemos encontrar que "Es una enzima especfica ya que liga al pptido en las posiciones del carboxilo de residuos Arginina (Arg) o Lisina (Lys) en la cadena". Pues esta enzima rompe las cadenas en las uniones peptdicas en las que la funcin carbonilo es aportada por la Arg o la Lys. Los fragmentos obtenidos seran (ya no se indican los extremos H2N y COOH, se entiende que se sigue la orden convencional): Lys / Met-Cys-Met-Lys / Ala-Cys-Arg Asp-Lys / Gly-Ala-AlaArg / Lys / Phe-Gly-Ala-Lys / Asp

5. Un pptido de 14 aminocidos aislado del cerebro de perro se somete a anlisis con el fin de determinar su secuencia. Datos obtenidos: deduce la secuencia colocando los fragmentos peptdicos en el orden adecuado:

N-terminal: Val C-terminal: Thr Digestin con tripsina:

Asp-Thr Val-Ser-Lys Phe-Gly-Tyr-Arg Ala-His-Trp-Glu-Lys Digestin con quimiotripsina: Gly-Tyr Arg-Ala-His-Trp Val-Ser-Lys-Phe Glu-Lys-Asp-Thr Secuencia: Val-Ser-Lys-Phe-Gly-Tyr-Arg-Ala-His-Trp-Glu-Lys-Asp-Thr 6. Una forma de separar aminocidos es usar tcnicas cromatografcas. Se coloca una mezcla de los aminocidos Ala, Leu y Cys sobre un papel para cromatografa y este se introduce en una cubeta cerdada con agua y un benceno (disolvente non polar). El papel se humedece con el vapor de agua y el benceno se hace resbalar sobre el papel para desplazar los aminocidos a una distancia proporcional a la relacin que existe entre el tempo que permanece en el disolvente apolar y el que pasan en el agau. De acuerdo con eso, coma se desplaza la mezcla? El benceno (fase mvil segundo lo indicado en el enunciado) desplazar aquellos aminocidos con cadenas laterales de caractersticas semejantes (esto es apolares) de forma que cubrirn una distancia mayor los que tengan mayor masa molecular. Dos aminocidos de la mezcla la Cys es polar ionizable (grupo tiol, -SH, en el extremo de la cadena lateral) mientras que Ala y Leu son apolares (cadenas laterales alifticas), se desplazaron ms lejos, la Leucina debido a su mayor masa molecular (131,173 frente a los 89,0932 de la Ala). As , la separacin cromatogrfica de la mezcla indicada, por orden de menor a mayor desplazamiento desde el punto de aplicacin, ser: Cys < Ala < Leu. 7. Determinadas resinas de intercambio inico de tipo Dowex contienen anillos aromticos que, por afinidad, retienen los aminocidos con radicales del mismo tipo. Tenemos una mestura de Ala, Cys, Gly, Ser y Glu que se hace pasar por una resina tipo Dowex, que aminocidos quedan retenidos en la misma?

Ningn aminocido quedara retenido, ya que para que quedar retenidos deberan de tener anillos aromticos y todos carecen de ellos.