BIOQUIMICA

Es una ciencia derivada producto del avance de la qumica y de la biologa, que se encarga del estudio de las molculas, reacciones y procesos que caracterizan a la materia viva. Molcula: la partcula ms pequea de una sustancia, que mantiene las propiedades qumicas especficas de esa sustancia. Reaccin: proceso en el que una o ms sustancias se transforman en otras sustancias diferentes. la reaccin en materia inerte es aislada, es decir independiente una de otra. La reaccin en materia viva es encadenada, es decir una reaccin provoca otra lo que indica que son complementarias. Debido a esto la materia viva siempre esta transformndose rpidamente, debido a su dinamismo. PROPSITO Comprender los procesos que se desarrollan en la materia a nivel molecular.

OBJETIVO En si, es el metabolismo que se define como el conjunto de reacciones qumicas que se llevan a cabo dentro de la clula de los organismos vivos.

CAMPO DE ACCIN Toda la materia viva que existe en el universo.

HISTORIA DE LA BIOQUIMICA
La bioqumica tuvo sus primeros orgenes en las especulaciones acerca del papel del aire en la utilizacin de los alimentos y sobre la naturaleza de las fermentaciones. Leonardo Da Vinci (1452-1519) fue uno de los primeros en comparar el proceso de nutricin animal con la combustin de una buja, lnea de pensamiento que ms tarde fue desarrollada por Van Helmont (1648). Sin embargo la verdadera historia de la bioqumica no comenz hasta finales del siglo XVIII, en que la ciencia qumica comenz a adquirir forma. 1771-1774: Priestley descubre el oxgeno y demuestra que lo consumen los animales y lo producen las plantas. 1773: Rouvelle asla la urea a partir de la orina. 1779-1796: Ingenuos demuestra que la luz es indispensable para la produccin de oxgeno por las plantas verdes. Tambin observa que las plantas consumen dixido de carbono. 1780-1789: Lavoisier demuestra que los animales requieren oxigeno, reconoce que la respiracin es una oxidacin, mide por primera vez el consumo de oxgeno de un ser humano y reconoce que la fermentacin alcohlica es, fundamentalmente, un proceso qumico. 1783: Spallanzani deduce que la digestin proteica del estmago es un proceso ms qumico que mecnico. 1804: Dalton enuncia la teora atmica. 1804: De Saussure hace el primer balance de la estequiometra de los intercambios gaseosos de la fotosntesis. 1810: Gay-Lussac deduce la ecuacin de la fermentacin alcohlica. 1828: Whler sisntetiza la primera sustancia orgnica partiendo de sustancias inorgnicas: la urea a partir del cianato de plomo y del amoniaco. 1830-1840: Liebig desarrolla tcnicas de anlisis cuantitativo aplicadas a sistemas biolgicos. 1833: Payen y Persoz postulan la importancia capital de las enzimas en biologa. 1837: Berzelius postula la naturaleza cataltica de la fermentacin. 1838: Schleiden y Schwan enuncian la teora celular. 1838: Mulder realiza los primeros estudios sistemticos de las protenas. 1850-1855: Bernard aisla glucgeno del hgado, mostrando que se converta en la glucosa sangunea, y descubre tambin el proceso de la gluconeognesis. 1854-1864: Patear demuestra que la fermentacin es provocada por microorganismos, destruyendo as la hiptesis de la generacin espontnea. 1859: Darwin publica el origen de las especies. 1869: Miescher descubre el DNA. 1893: Ostwald demuestra que las enzimas son catalizadores. 1903: Neuberg utiliza por primera vez la denominacin de bioqumica. 1905: Knoop deduce la oxidacin de los cidos grasos. 1912: Neuberg propone una ruta metablica qumica para la fermentacin.

 1912: Warburg postula la existencia de una enzima respiratorio activador del oxigeno, descubriendo su inhibicin por el cianuro, demostrando la indispensabilidad del hierro en la respiracin. 1927: Muller y Stadler demuestran la mutacin artificial de los genes por los rayos X. 1935: Stanley cristaliza, por primera vez, un virus, el del mosaico del tabaco. 1935: Davson y Danielli postulan un modelo para la estructura de las membranas celulares. 1937: Krebs postula el ciclo del cido ctrico. 1939-1941: Lipmann postula el papel central del ATP en el ciclo de la transferencia energtica. 1948: Calvin y Benson descubren que el cido fosfoglicrico es uno de los primeros productos intermediarios de la fijacin fotosinttica del dioxido de carbono. 1951: Lenhinger demuestra que el transporte electrnico desde el NADH al oxgeno es la fuente de energa inmediata para la fosforilacin oxidativa. 1952-1954: Zamecnik y sus colegas descubren que las partculas de ribonucleoprotenas, ms tarde denominadas ribosomas, son los sitios de sntesis proteica. 1950-1965: Durante este perodo se elucionan las etapas principales de la sisntesis y degradacion de aminocidos, purinas, dirimidas, cidos grasos, glcidos complejos y lpidos, y compuestos terpenoides, alo que contribuyen multiples investigadores. 1961-1965: Los laboratorios de Nirenberg, Khorana y Ochoa identifican los vocablos del cdigo gentico de los aminocidos.

DESARROLLO DE LA BIOQUIMICA
Se ha logrado comprender la funcin de las biomoleculas: o Protenas. Fue la primer biomolecula en aparecer en la tierra antes de la vida, se les llam coacervados. Tienen funcin estructural. Forman a los seres vivos a excepcin de los vegetales que son formados por carbohidratos en mayor cantidad (celulosa). Nosotros obtenemos los carbohidratos de los vegetales y a partir de ellos generamos las dems biomoleculas (lpidos, protenas, y cidos nucleicos), a travs del metabolismo. Somos dependientes de los vegetales puesto que estos son los nicos que pueden producir su propio alimento a travs de la fotosntesis. Tienen funcin de transporte. La hemoglobina es la accionante del metabolismo en las clulas ya que esta es la que ayuda al oxigeno a llegar a todas las partes del cuerpo. No se pueden llevar a cabo las reacciones bioqumicas si no existiera el oxigeno. Las clulas liberan el CO2. o Carbohidratos. Proporcionan energa directa a las clulas de los animales para que se lleven a cabo las reacciones necesarias para su supervivencia y por lo tanto del individuo. En los vegetales tienen funcin estructural mayoritariamente aunque tambin les proporcionan energa. El que los vegetales los usen principalmente para funcin estructural y no para produccin de energa se debe a que las plantas son ms dependientes de la energa del sol para producir su energa. Algunas plantas no pueden sintetizar todas las protenas. o Lpidos. Funcin energtica y estructural.

o cidos nucleicos. Funcin de replicacin y reproduccin: Replicacin. Se da la mitosis. Cuando hay reposicin de clulas con estructura idntica a la original. Podemos decir que se da una recombinacin gentica.

Reproduccin. Se da la meiosis. Un ser da lugar a otro ser de estructura diferente (se combinan dos clulas y dan lugar a otra) mediante la unin sexual. Se han delineado las rutas metablicas de las biomoleculas. o En la materia viva, los procesos se dan de manera organizada. o En la materia inerte los procesos se dan de manera desorganizada. o Cada biomolecula sigue su propia ruta (proceso) metablica sin cruzarse entre ellas. o Cada uno de los procesos caractersticos de las biomoleculas son las llamadas rutas metablicas. Se han aislado los principales organelos celulares. o La clula es la unidad bsica de todos los seres vivos. o Ser vivo rganos tejido clulas organelos biomoleculas elementos o tomos. o La materia viva inicia en la clula. Se conoce la composicin qumica de la clula. o La clula esta formada por sustancias qumicas, por lo que se puede definir como un conjunto de molculas en interaccin. o Para que una clula se considere como tal, debe de haber interaccin entre sus molculas, es decir que se afecten unas a otras. Se conoce la funcin de las enzimas. o Las clulas estn compuestas por sustancias qumicas orgnicas. Naturalmente las sustancias qumicas orgnicas reaccionan muy lentamente es por ello que necesitan la presencia de catalizadores que les ayuden a acelerar esas reacciones, estos catalizadores son las llamadas protenas. o Las sustancias qumicas inorgnicas reaccionan rpidamente. o Toda reaccin qumica necesita catalizadores, pero solo las orgnicas son catalizadas por enzimas. o Las enzimas controlan la velocidad de las reacciones de sustancias orgnicas. o Las enzimas son protenas. Se conoce la estructura y funcin del DNA. o DNA responsable de la informacin gentica. Se conoce la estructura y funcin del genoma humano.

o Al conjunto de genes se le conoce como genoma humano. o Se conoce el nmero exacto de genes en el ser humano. o Un ejemplo de la aplicacin sobre el conocimiento de estructura genomica esta demostrado en la recombinacin gentica que hace posible la produccin de alimentos transgnicos.

RETOS DE LA BIOQUIMICA
No se conoce el mecanismo de diferenciacin celular o Es un enigma el como de una clula se puedan crear una gran variedad de clulas que lleguen a conformar los distintos tejidos. o No se sabe que pasa con las clulas para que de repente cambien su forma. No se conoce (molecularmente) el momento en el que empieza la vida. o En que momento se forma un ser vivo. No se conocen las funciones cerebrales (memoria, sueos, pensamiento). o No se sabe que sucede en las molculas para que podamos soar, pensar.

BIOQUIMICA: CIENCIA EXPERIMENTAL

Se dice que la bioqumica es una ciencia experimental debido a que la obtencin de conocimientos se lleva a cabo a travs del mtodo experimental. Cuando se hacen investigaciones biolgicas lo que se usa es el mtodo experimental, si no se usa este mtodo no se puede considerar investigacin biolgica. Para realizar una investigacin experimental los bioqumicos han basado sus descubrimientos haciendo uso de tres pasos: aislamiento de molculas, determinacin de su estructura, y determinacin de su funcin. Para poder saber la funcin de una molcula, primero hay que conocer su estructura. Aun cuando se habla del mtodo experimental, es necesario recordar que todos los mtodos dependen del mtodo cientfico. El paso de aislamiento de molculas se encuentra dentro de un proceso llamado fraccionamiento celular: FRACCIONAMIENTO CELULAR: Aislamiento de molculas: se siguen tres pasos: o Extraccin con solventes: los solventes se usan para disolver las molculas que se quieren estudiar. Consiste en exponer al tejido en solventes orgnicos (cloroformo, benceno, CCl4, etanol). Para ello se utilizan solventes que no sean muy agresivos o bien se pueden utilizar diluidos, todo esto se lleva a cabo a 4C para garantizar que el solvente se traiga solo a la molcula que vamos a estudiar. o Homogeneizacin: consiste en colocar el solvente con la molcula extrada en un tubo de ensaye para posteriormente depositarlo en un agitador magntico. La homogeneizacin se lleva a cabo usando movimientos suaves. Esto se hace para evitar que se precipiten todos los componentes. o Centrifugacin: se lleva a cabo tres veces, en donde el sobrenadante de una centrifugacin se centrifuga en la siguiente. De tal manera que se obtienen tres fracciones celulares: una fraccin nuclear, fraccin mitocondrial, y fraccin microsmica. ESTRUCTURA DE LA MOLECULAS: para la determinacin de la estructura molecular se utilizan los siguientes mtodos: o Espectroscopia ultravioleta o infrarroja.

o Espectrometra de masa. o Cristalografa de rayos X. DETERMINACIN DE LA FUNCIN: Se usan pruebas en los rganos, tejidos y clulas de animales.

CARBOHIDRATOS

Son sustancias orgnicas constituidas por C, H, O, y N, que ocupan importantes funciones estructurales y metablicas tanto en la clula animal como en la vegetal. Proporcionan energa directa para la realizacin de sus funciones, principalmente en los animales; mientras que en los vegetales son los principales constituyentes de su estructura. Qumicamente son derivados de los polialcoholes ya que resultan de la oxidacin de estos, de tal manera que para que una estructura sea considerada como carbohidrato debe poseer un grupo carboxilo y varios grupos oxidrilos o hidroxilos.

Estructura ciclica de la glucosa, mayor representante de los carbohidratos

Estructura lineal de la glucosa, mayor representante de los carbohidratos

CLASIFICACIN DE CARBOHIDRATOS
MONOSACARIDOS: Son los carbohidratos ms simples, aquellos que no se pueden descomponer o hidrolizar. Si se descompusieran se obtendran sustancias que no son en s carbohidratos. Como ejemplos de monosacridos encontramos los siguientes: glucosa, fructosa, ribosa, galactosa, y manosa. Los monosacridos se clasifican por dos criterios: o No. De tomos de carbono. Triosas: tienen tres tomos de carbono. Tetrosas: cuatro tomos de carbono. Pentosas: cinco tomos de carbono. Hexosas: seis tomos de carbono. Heptosas: siete tomos de carbono.

- Las ms abundantes en la naturaleza son las triosas y las tetrosas. - Las ms importantes biolgicamente son las pentosas porque pertenecen a la ribosa que es un componente esencial de los cidos nucleicos, y las hexosas porque pertenecen a la glucosa la cual da energa tanto a la clula animal como vegetal. o De acuerdo a la posicin del grupo carboxilo. Aldosas. Cuando el grupo carboxilo se encuentra en un carbono o extremo Terminal. Las molculas tiene dos extremos.

Cetosas. Cuando el grupo carboxilo se encuentra en un carbono intermedio.

ESTRUCTURA DE LOS MONOSACARIDOS

La glucosa es el monosacrido original puesto que a partir de su sntesis se origina los dems. La primera estructura que se le asign a la glucosa fue la estructura lineal o tambin conocida como estructura de Fisher. Esta estructura le fue asignada debido a que no se contaba con el equipo necesario para poder observar otra estructura.

Despus de estudios por parte de los bioqumicos se determin que la estructura real de la glucosa es la estructura cclica o tambin llamada estructura de Hawarth.

 Los estudios continuaron y finalmente se lleg a la conclusin y determinacin de la estructura de silla. Fue descubierta utilizando tcnicas de cristalografa de rayos X. aun cuando esta es la forma real, casi no se utiliza por que es mucho ms compleja que las anteriores.

ISOMERIA DE LOS MONOSACARIDOS

ISOMEROS: Son compuestos que tienen la misma formula pero diferente arreglo espacial (forma de acomodar). El hecho de que un compuesto presente isomeros se debe a la presencia de carbonos asimtricos en su estructura. Un carbono asimtrico es aquel que esta unido a cuatro grupos distintos, esta capacidad de unin se debe a que el carbono presenta cuatro ligaduras. Los posibles isomeros que pueda formar un compuesto esta dado por la formula ; donde n es el numero tomos de carbonos asimtricos. La glucosa tiene 4 carbonos asimtricos, as que la glucosa puede tener 16 posibles isomeros.

ACTIVIDAD OPTICA: Se dice que una sustancia posee actividad ptica cuando tiene la capacidad de desviar la luz polarizada en un plano. Los carbonos asimtricos son los que dan la actividad ptica. o Si la luz polarizada se da en el sentido de las manecillas del reloj se dice que la sustancia es dextrorotatoria o dextrgira y se representa con un signo as: (+). o Si la desviacin ocurre en sentido contrario a las manecillas del reloj se dice que la sustancia es levorotatoria o levgira y se representa as: (-).

EJEMPLOS DE ISOMERIA DE LA GLUCOSA

ISOMERIA D Y L: Este tipo de isomera esta dado por la orientacin de los grupos H y OH alrededor del tomo de carbono adyacente al tomo de carbono con el alcohol primario Terminal. Si el OH de dicho tomo se encuentra a la derecha, corresponde a la serie D; pero, si el OH se encuentra a la izquierda corresponde a la serie L.

Y ANOMEROS: Este tipo de isomera esta dado por la variacin de la

orientacin de los grupos H y OH alrededor del tomo de carbono No. 1. si el OH esta orientado hacia abajo, el monosacrido corresponde a la serie alfa (); y si esta orientado hacia arriba, corresponde a la serie beta ().

EPIMERA DE LOS MONOSACARIDOS: Este tipo de isomera esta dada por la orientacin de los grupos H y OH alrededor de los tomos de carbono 2 y 4 de un monosacrido. Si la variacin se da en el carbono 2 el isomero resultante es la manosa; si la variacin se presenta en el carbono 4 es la galactosa.

 ALDOSA CETOSA: Este tipo de isomera esta dado por la ubicacin del grupo carbonilo en la estructura del monosacrido. Si el grupo carbonilo se encuentra en el carbono Terminal entonces tenemos una aldosa (glucosa); si el grupo carbonilo se encuentra en un carbono intermedio entonces se trata de una cetosa (fructosa).

ALDOSAS

CETOSAS

DISACARIDOS: Son carbohidratos constituidos por dos molculas de monosacridos unidos mediante un enlace tipo ter denominado glucosdico, el cual se forma esntre un grupo OH de un monosacrido con el grupo OH de otro monosacrido, dando lugar ala formacin del disacrido correspondiente y una molcula de agua. Puede ser descompuesto por hidrlisis para separarse en

monosacridos. Como ejemplo de disacridos tenemos: sacarosa (glucosa + fructosa), maltosa (glucosa + glucosa), y lactosa (glucosa + galactosa). Todos los carbohidratos tienen glucosa, siendo esta esencial para la materia viva.

ISOMERIA DE LOS DISACARIDOS

MALTOSA. Esta constituida por dos glucosas unidas por medio de un enlace glucosdico - 1 - 4

SACAROSA. Disacrido constituido por una molcula de glucosa y una de fructosa unidos por enlace glucosdico - 1 2; donde el tomo No. 2 va a ser aportado por la fructosa.

 LACTOSA. Disacrido constituido por una molcula de glucosa y una de galactosa, unidas por un enlace glucosdico 1 4.

POLISACARIDOS. Son los carbohidratos ms complejos, constituidos por ms de tres unidades de monosacridos. Como ejemplo de estos, tenemos: almidn, celulosa, quitina, glucgeno, etc.

Los humanos comemos almidn y celulosa de las plantas, solo que la celulosa no la podemos descomponer en glucosa, los nicos capaces de realizar esta funcin son los animales rumiantes como las vacas. Las plantas sintetizan almidn, los animales no. Las clulas animales sintetizan glucogeno a partir del almidn que consumimos en exceso. Las clulas vegetales no sintetizan glucogeno.

ALMIDON.

Constituye la fuente ms importanete de carbohidratos de los alimentos y se encuentra en los cereales, legumbres y otros vegetales. Su estructura contiene dos componentes: amilosa que es una estructura helicoidal no ramificada de glucosas unidas por enlace glucosdico - 1 4 y amilopectina que es una estructura muy ramificada con glucosas unidas por enlace glucosdico - 1 4 en las cadenas y - 1 2 en los puntos de ramificacin. O O O O O O O O O O AMILOSA O O O

AMILOPECTINA NOTA: El que las semillas sean ricas en almidn se debe a que estas tienen por dentro una plantita, la cual necesita de nutrientes para seguir con vida, y en este caso estos nutrientes se los da el almidn, es por ello que la planta produce almidn.

GLUCGENO.

Es el polisacrido que se almacena en los tejidos animales. Es una estructura mucho ms ramificada que la amilopectina, la glucosas estn unidas mediante un enlace glucosdico - 1 4 sobre las cadenas y - 1 6 sobre los puntos de ramificacin.

Conocidos coloquialmente con el nombre de grasas. A veces cuando la glucosa est en exceso y la clula ya no la puede recibir se desva al glucgeno, y si este tampoco la puede reci9bir entonces se van a formar a los lpidos. Son reservas de energa ya que no se usan por la clula directamente sino que son almacenados. Contienen vitaminas que ninguna otra biomolecula se la va a dar. En s, son sustancias reconocidas como grasas; su principal funcin es ser fuente de energa de reserva para las clulas. Son un grupo de compuestos heterogneos (qumicamente no se parecen uno con otro) relacionados con los cidos grasos que tienen la propiedad comn de ser insolubles en agua pero solubles en solventes orgnicos no polares (ter, cloroformo, benceno, etc.) Son reconocidos fcilmente por propiedades fsicas que por qumicas. La mayora tienen cidos grasos; sin embargo los hay que no los contienen, tales como: el colesterol, esteroides, etc. Qumicamente, son esteres de cidos grasos y alcoholes. Esta es la diferencia entre los lpidos y los carbohidratos (son teres). Son importantes constituyentes de los alimentos ya que proporcionan energa directa y potencial al sistema celular. Adems de que son las nicas sustancias que proporcionan vitaminas liposolubles y cidos grasos esenciales al sistema celular. FUNCIONES IMPORTANTES Actan como aislantes elctricos en el sistema nervioso y el cerebro los lpidos forran a los nervios para que cuando la corriente elctrica producida por el cerebro no se disemine o se pierda en el espacio. Actan como aislantes trmicos. El cuerpo humano trabaja o debe mantener cierta temperatura (36C) para que las clulas trabajen eficientemente y los lpidos que forran nuestro cuerpo tienen sta funcin (que los rganos mantengan la temperatura ideal). Son constituyentes importantes de las membranas celulares. La clula tiene tantas membranas como organelos celulares, esto es, cada organelo tiene una membrana. Todas las membranas celulares estn constituidas por lpidos y carbohidratos; formadas de la misma manera (lpidos-carbohidratos-lpidos).

CLASIFICACIN DE LPIDOS

Qumicamente los lpidos son esteres; intervienen Ac. Grasos + alcohol. CH3 - CH2 -COOH + CH3 - CH2 - OH H2O + CH3 - CH2 - COO - CH2 - CH3 No hay una sola clasificacin ya que son compuestos heterogneos. Harper clasifica a los lpidos en tres tipos: simples, complejos, y precursores y derivados de los lpidos. Los lpidos simples y complejos, ambos, contienen cidos grasos, mientras que en los precursores y derivados no se sabe si contienen cidos grasos. LIPIDOS SIMPLES: Son esteres grasos ms diversos alcoholes. o GRASAS: Son esteres de cidos grasos con glicerol. Pueden ser slidas (mantecas) y lquidas (aceites). CH2 - OH CH - OH CH2 - OH (Glicerol) + 3 R - COOH (c. Grasos) CH2 - OOC - R CH - OOC - R CH2 - OOC -R (Triglicridos)

La mayora de las grasas que se encuentran en la naturaleza son triglicridos (por eso son tan conocidos). Segn el nmero de c. Grasos pueden llamarse: monogliceridos, digliceridos y triglicridos. o CERAS: Esteres de cidos grasos con alcoholes monohdricos de alto peso molecular. Para que un alcohol monohdrico tenga alto peso molecular, su molcula debe tener ms de 20 tomos de carbono. El glicerol no puede formar ceras puesto que es un polialcohol. La cera ms conocida es la utilizada en los panales de abejas (producidas por las propias abejas). LIPIDOS COMPLEJOS: Esteres de cidos grasos que contienen grupos adicionales al alcohol y al cido graso. cido graso + alcohol + otra especie qumica distinta del alcohol

o FOSFOLPIDOS: Junto con los glucolpidos son los lpidos complejos de mayor importancia biolgica. o GLUCOLPIDOS: Junto con los fosfolpidos son los ms abundantes en la naturaleza y por lo tanto los de mayor importancia biolgica. PRECURSORES Y DERIVADOS: En este grupo se estudia a los cidos grasos, glicerol, esteroides, vitaminas liposolubles, terpenos (aceites esenciales, pigmentos vegetales, vitaminas; canela, clavo, etc.).