4.

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JUAN F. GUERRERO MARTNEZ
Curso 2010-2011


Tema 4
Procesado Digital de Bioseales



4.1. Introduccin


Una seal es un medio de transmisin de informacin. Para obtener informacin
sobre la fuente de la seal, o para modificar dicha seal, suele ser necesario aplicar algn
tipo de operaciones. Tambin en el caso de imgenes (seales 2D o 3D) puede ser
necesario aumentar el contraste, suavizar, eliminar ruido, detectar bordes, etc. Se necesita,
pues, aplicar un tratamiento especial para extraer la informacin deseada. Esta fase de
aplicacin suele denominarse preprocesado.

Una vez extrada la informacin, puede ser interesante compararla con las
obtenidas en otros casos, e intentar clasificarla dentro de alguno de estos tipos (patologas,
etc.). En este supuesto, el procesado digital realiza una tarea de ayuda al diagnstico. Otra
ocasin en que es necesario aplicar un tratamiento a la seal es cuando se desea transmitir
o almacenar eficientemente gran cantidad de informacin con vistas a un mejor
aprovechamiento del ancho de banda de transmisin disponible o a una optimizacin de
los dispositivos de memoria masiva, requirindose una compresin de los datos que
permita reducir el tiempo de transmisin, la cantidad de datos a transmitir y/o almacenar, y
su correcta reconstruccin.

La siguiente figura muestra un diagrama genrico de las distintas etapas de
aplicacin del procesado digital de seales biomdicas. Obviamente, dependiendo de la
aplicacin sern necesarios slo determinados bloques. A continuacin se describen
brevemente, y sern tratadas con mayor detalle en ste y sucesivos captulos.


Preprocesado: se intenta destacar la informacin deseada del resto de la seal,
que usualmente tiene ruido aditivo o multiplicativo asociado, y de la cual puede
interesar tan slo una parte (eliminacin del EMG superpuesto al ECG, por
ejemplo). Se aplican tcnicas de atenuacin y cancelacin de ruido (filtrado
digital y adaptativo, promediado), para lo cual se necesita un conocimiento
previo de las caractersticas de la seal y del ruido.




4. 2



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Segmentacin: las caractersticas de la seal suelen presentar variaciones con el
tiempo. Para poder aplicar algunas herramientas de procesado digital, que hacen
la suposicin de que la seal es estacionaria, es necesario acotar o segmentar la
ventana temporal sobre la que se aplican para asegurar que el tramo de seal
que contiene cumple dicha condicin.



























Fig. 4.1. Etapas de aplicacin del procesado digital de bioseales.


Transformacin: Las seales biomdicas generalmente se obtienen en el
dominio del tiempo. No obstante, en algunos casos, se puede estudiar mejor una
seal en otro dominio. Por ejemplo la seal del EEG no presenta una seal
generalmente identificable en el dominio del tiempo, pero si se pueden clasificar
intervalos en el dominio de la frecuencia. En estos casos, ser necesario aplicar
transformadas a la seal.

Seal
Seal procesada

Diagnstico
Seal reconstruida
PREPROCESADO SEGMENTACIN TRANFORMACIONES
DETECTOR DE
ONDAS
SELECCIN DE
CARACTERSTICAS
EXTRACCIN DE
CARACTERSTICAS
CLASIFICACIN
PATRONES
OTROS
PROCESADOS
ALMACENAMIENTO TRANSMISIN
RECONSTRUCCIN



4. 3



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Deteccin de formas de onda: Frecuentemente, la informacin relevante de la
seal posee una onda caracterstica que se conoce de forma general (por
ejemplo, el QRS en el ECG). Es necesario, en algunos casos, detectar estas
ondas caractersticas, generalmente como paso previo a algn procesado
posterior (la deteccin del QRS permite obtener la serie temporal RR, que a su
vez es estudiada para obtener informacin sobre determinadas patologas
cardacas).

Otros procesados: La seal, previamente tratada por los bloques comentados,
puede seguir siendo procesada. Dentro de este procesado posterior se incluira
desde medidas de relaciones entre seales tanto en el dominio del tiempo como
en el de la frecuencia (correlacin, espectro cruzado) hasta transformaciones
ms complejas, como puede ser la obtencin de imgenes, etc.

Extraccin de caractersticas: la seal generalmente presenta informacin
redundante, por lo que trabajar directamente con la misma no es la opcin
ptima. Esto es crucial cuando se requiere una transmisin o almacenamiento
optimizado. En este caso, el objetivo es extraer un conjunto de caractersticas
relevantes de la seal que permitan su representacin sin redundancias de
informacin. El tipo de caractersticas seleccionado y su nmero responden a un
equilibrio entre la necesidad de minimizacin, y de otro el error en la
representacin de la seal real. Por otra parte, la obtencin de un conjunto de
caractersticas que representen y determinen la seal permite la caracterizacin
(modelizacin) y prediccin del comportamiento del sistema.

Clasificacin: La clasificacin permite, a partir de una serie de patrones
previamente definidos que establecen las caractersticas propias de cada
patologa, y de las caractersticas extradas de la seal de entrada, determinar a
qu clase corresponde la seal (implementa de hecho un diagnstico
automtico).

Almacenamiento-transmisin: En ambos casos, el objetivo es obtener una
representacin comprimida de la seal para optimizar las necesidades de
memoria y de ancho de canal. Posteriormente se puede invertir el proceso,
descomprimiendo la seal.





4. 4



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4.2. Seales aleatorias

Las seales se clasifican en dos grupos principales: deterministas y aleatorias. Las
primeras son las que se pueden describir con relaciones matemticas explcitas. Las
aleatorias no pueden expresarse exactamente, por lo que tienen que describirse en
trminos de probabilidades y promediados estadsticos. La clasificacin en cada grupo
depende los fines y restricciones del problema en estudio. Por ejemplo, al analizar el
ECG, podemos estar interesados en las caractersticas generales del complejo QRS y
considerarlo como determinista, o estar interesados en los cambios del intervalo R-R y
considerarlo como aleatorio.




















Figura 4.2. Clasificacin de las seales.


Las seales deterministas se dividen en dos grupos: peridicas y no peridicas. Las
primeras cumplen la relacin x(t) = x(t+T), siendo T el periodo, y estn completa-mente
descritas por su valor en un nico periodo. En el dominio de la frecuencia, estn descritas
por las series de Fourier, es decir, por la frecuencia fundamental y sus armnicos. Las no
peridicas son de dos clases: cuasi-peridicas y transitorias. Las cuasi-peridicas no son
peridicas en el sentido matemtico pero tienen una descripcin discreta en el dominio de
la frecuencia, que difiere de la anterior en que los trminos que aparecen no son armnicos
de alguna frecuencia fundamental. Una combinacin de seales peridicas no
SEAL
ESTACIONARIA PERIDICA
ALEATORIA DETERMINISTA
NO PERIDICA NO ESTACIONARIA
SINUSOIDAL
PERIDICA
COMPLEJA
CUASI
PERIDICA
TRANSITORIA
ERGDICA
NO ERGDICA



4. 5



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correlacionadas dan lugar a una cuasi-peridica. Las transitorias seran las que no cumplen
las condiciones anteriores.

Una seal aleatoria es una funcin muestreada de un proceso aleatorio. Dos
seales aleatorias del mismo proceso difieren entre s en la descripcin temporal, pero
poseen las mismas propiedades estadsticas. La descripcin de la seal aleatoria se realiza
mediante la funcin densidad de probabilidad.

Un proceso estacionario es un proceso cuyas propiedades estadsticas no son
funcin del tiempo. Una seal se dice que es ergdica si tiene igual promediado estadstico
que promediado temporal para cualquier funcin muestreada. Los procesos no
estacionarios (y, por tanto, no ergdicos) son ms difciles de procesar, por lo que en
ocasiones suelen suponerse ergdicos.

Cuando se procesa el EEG, por ejemplo, no disponemos del proceso completo, sino
que tenemos slo una funcin muestreada. Por tanto, estamos forzados a suponer la
ergodicidad y estimar las propiedades estadsticas requeridas a partir de promediados
temporales (en lugar de promediados estadsticos). Puesto que las herramientas para
procesar seales no estacionarias no son tan efectivas, se suele dividir la seal no
estacionaria en segmentos, cada uno de los cuales se supone estacionario. La longitud de
los segmentos depende de las propiedades de la no estacionariedad. En seales de voz, los
segmentos suelen ser de 10 msg, mientras que en EEG se toman del orden de algunos
segundos.


Determinacin de las propiedades de la seal

Dada una seal discreta consistente en N muestras equiespaciadas x(i), con i=1..N,
sus propiedades estadsticas se expresan en funcin del operador esperanza o valor
esperado E definido como:

[1]

donde p(x
i
) es la probabilidad asociada a la muestra x
i
.

El valor esperado se conoce tambin como el promediado estadstico o media -m-,
y se trata de un operador lineal. Si tenemos una funcin de la seal, z=x
n
, su valor esperado
vendr dado por:

[2]



4. 6



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y se denomina n-simo momento de x. As pues, la media sera el primer momento de x.
En un proceso aleatorio estacionario correspondera a la componente de continua.

El n-simo momento central se define como:

[3]
El momento central de orden 2 se denomina varianza, y viene definido por:

[4]

La raz cuadrada de la varianza se denomina desviacin estndar:

[5]

Para el caso de dos seales x
n
e y
n
, se definen anlogamente los momentos
centrales conjuntos:

[6]

El momento central conjunto de primer orden se denomina covarianza, y viene
dado por:

[7]

Si los dos procesos aleatorios dependen del tiempo, x(t) e y(t), el valor esperado
conjunto E{x,y} depende tambin del tiempo y se denomina funcin correlacin cruzada:

[8]

Cuando los dos procesos son el mismo, x(t)=y(t), el valor esperado conjunto se
denomina autocorrelacin:
[9]




4. 7



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Si las seales son ergdicas, los promedios estadsticos definidos son equivalentes
a los promedios temporales dados por:


MEDIA:
[10]


VARIANZA:

[11]

o equivalentemente:




DESVIACION ESTANDAR:
[12]

RMS:

[13]

COVARIANZA:

[14]





4. 8



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CORRELACION CRUZADA:


[15]


AUTOCORRELACION:



[16]
Estimadores

La seal discreta que estamos considerando consiste en N muestras equiespaciadas
que nosotros tomamos como representativas de algn proceso. Podemos realizar medidas
sobre las N muestras, simples (media, varianza, etc.) o ms complejas (clculo del
espectro), y deseamos que estas medidas sean representativas de la seal completa y no
slo de nuestro intervalo. Las medidas realizadas, pues, deben considerarse como
estimaciones de los valores reales, y a las operaciones matemticas utilizadas para
obtenerlas se les denomina estimadores. El comportamiento de un estimador se mide en
trminos de su diferencia respecto del valor medio real (bias) y su varianza:

error = bias
2
+ varianza

Otra caracterstica importante de un estimador es la forma en que su
comportamiento cambia con la longitud de la seal. Este factor se denomina consistencia
del estimador, y se dice que un estimador es consistente cuando el valor esperado que
estima tiende hacia el valor real cuando el nmero de muestras N tiende a infinito. Esto
implica que el bias y la varianza ( y por tanto el error) tienden a cero cuando N tiende a
infinito.



4. 9



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4.3. Adquisicin

Tras el preprocesado analgico, que incluye la transduccin, amplificacin y
filtrado analgicos, la seal suele convertirse al dominio digital, lo que implica pasar de
una representacin continua en el tiempo a otra discreta, permitiendo aprovechar las
ventajas de almacenamiento, procesado y transmisin que proporcionan los sistemas
digitales. El proceso de conversin analgico-digital implica dos etapas: el muestreo y la
cuantizacin. Ambos factores modifican las caractersticas de la seal.

El proceso de muestreo permite obtener una representacin digital que se obtiene
de la seal original, consistente en una serie de muestras discretas en el tiempo. Esta
representacin contiene toda la informacin de dicha seal, y por tanto sta puede
reconstruirse a partir de la seal muestreada. Para que esto sea cierto deben cumplirse
ciertas condiciones determinadas por el teorema de Shannon (o teorema del muestreo), el
cual establece que una seal continua puede reconstruirse sin prdida de informacin si y
solo si la frecuencia de muestreo (la razn con la que se toman muestras de la seal
analgica) es mayor que el doble de la mxima frecuencia del espectro de la seal original.

Esto se debe a que el espectro de una seal muestreada es el de la seal original
repetido cada mltiplo de la frecuencia de muestreo. En la siguiente figura se observa
cmo el espectro original (a), de frecuencia mxima f
b
, presenta solapes (b) cuando
f
m
<2f
b
, por lo que la seal original no puede recuperarse correctamente (efecto de
aliasing). En el caso c, cuando f
m
>2f
b
, es posible disear un filtro que permita extraer el
espectro original. Debido a esta relacin entre frecuencia de muestreo y frecuencia mxima
de la seal, sta debe tener una banda limitada y debe, por tanto, ser filtrada
analgicamente antes del proceso de muestreo (filtro antialiasing).














f
m
/2 f
m
f
f
m
/2 f
m
f
f
b
f
a)
b)
c)



4. 10



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Figura 4.3. Espectro de una seal muestreada. a) Espectro original con frecuencia
mxima f
b
. b) Caso f
m
<2f
b
. c) Caso f
m
>2f
b
.


Despus de haber muestreado la seal, se le asignan valores discretos a la amplitud
de cada muestra. El nmero de valores discretos posibles viene determinado por el nmero
de bits del conversor, y amplitudes localizadas entre dos de estos valores son asignadas a
uno de ellos segn el criterio utilizado. Las aproximaciones ms usuales son el redondeo y
la truncacin. En ambos casos, se genera un error (error de cuantizacin), que puede
considerarse como ruido blanco no correlacionado con la seal y que disminuye con el
nmero de bits del conversor.



4.4. Preprocesado digital de la seal


La fase de preprocesado intenta destacar la informacin deseada del resto de la
seal, que usualmente tiene ruido asociado, y de la cual puede interesar tan slo una parte
(eliminacin del EMG superpuesto al ECG, por ejemplo). En este caso se aplican tcnicas
de atenuacin y cancelacin de ruido (filtrado digital y adaptativo, promediado), para lo
cual se necesita un conocimiento previo de las caractersticas de la seal y del ruido.
Bsicamente podemos encontrar tres supuestos:

El ruido tiene unas caractersticas frecuenciales (espectro) que no interfieren, o
al menos no significativamente, con el espectro de la seal. Adems, estas
caractersticas no varan con el tiempo. En este caso, podemos utilizar un filtro
digital, que elimine las componentes frecuenciales del ruido preservando las de
la seal. La siguiente figura muestra el caso de una seal de ECG con
interferencia de ruido de red (50 Hz) y la misma seal despus de ser filtrada.

El ruido tiene un espectro coincidente significativamente con el de la seal (caso
de ruido aleatorio). No puede eliminarse, entonces, un intervalo de frecuencias
mediante filtrado, por lo que se utilizan otras tcnicas como el promediado
coherente. La siguiente figura muestra el caso de una seal de ECG con
interferencia de ruido aleatorio y la misma seal despus de ser promediada.




4. 11



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Figura 4.4. ECG con interferencia de red (A) y su espectro (B), ECG filtrado
elimina-banda (C) y el espectro correspondiente (D: puede observarse la
eliminacin de la frecuencia de red).





Figura 4.5. Espectros correspondientes al ECG original (A), al ruido aleatorio (B),
a la composicin de ambos (C) y al ECG promediado.

El ruido presenta unas caractersticas que varan con el tiempo. En este caso, no
puede utilizarse un filtrado de caractersticas fijas, por lo que se utiliza filtrado
adaptativo. La siguiente figura muestra el caso de monitorizacin del ECG
durante una intervencin quirrgica en que se utiliza electrobistur. La
interferencia de RF que genera slo puede eliminarse eficientemente mediante
C D
B A
C D
B A



4. 12



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un filtro que se adapte a las variaciones (encendido/apagado, variaciones de
potencia aplicada).


Figura 4.6. Filtrado adaptativo de interferencias ESU (Unidad Electroquirrgica).
A: ECG con interferencia. B: Salida del filtro adaptativo. (A. Cohen. "Biomedical
Signal Processing". CRC Press)




4.4.1. Filtrado digital

Los filtros digitales presentan algunas ventajas sobre los correspondientes
analgicos. En primer lugar, un filtro digital es ms inmune al ruido debido a la forma en
que se implementa (software o circuitos digitales). La precisin depende slo del error de
redondeo, que est determinado por el nmero de bits utilizado en el diseo para
representar las variables del filtro. Adems, las caractersticas del filtro (frecuencia de
corte, etc.) pueden cambiarse fcilmente, y su funcionamiento es independiente del entorno
(variaciones de temperatura, tensin de alimentacin, etc.). Esta caracterstica es
importante en aplicaciones mdicas donde las seales tienen frecuencias bajas que pueden
ser distorsionadas por las derivas del circuito analgico.

Podemos definir un filtro digital como un sistema discreto que transforma una
secuencia de entrada produciendo la correspondiente secuencia de salida. Si la
transformacin no es funcin del tiempo, ser un sistema invariante temporal, y si cumple
el principio de superposicin lineal, se denominar lineal. Aunque se han aplicado en
A
B
cambio potencia cambio potencia cambio potencia
encendido
apagado



4. 13



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ocasiones otros tipos en el campo del procesado de bioseales, nos centraremos en el tipo
de filtros ms usual, que corresponde al caso de invariantes temporales y lineales.

Dada una secuencia de muestras, {x(n)}, la respuesta del filtro a dicha entrada se
puede expresar como:

y(n) = ! h(k) x(n-k) [17]

donde h(k) es la respuesta del filtro al impulso, y el producto entre h(k) y las muestras de
entrada retardadas representa la convolucin entre dicha respuesta al impulso y la seal de
entrada. Se dice que el filtro es estable si la respuesta del mismo a una entrada finita es
tambin finita, y es causal si no produce salida hasta que se aplica seal de entrada (es
decir, y(n)=0 para n<0).

La relacin entre entrada y salida del filtro suele expresarse de forma ms eficiente
mediante la transformada Z. Su definicin para una secuencia de entrada x(k) viene dada
por:

X(z) = ! x(k) z
-k
[18]


siendo z una variable compleja. Una propiedad importante de la transformada Z es que la
transformada de la convolucin de dos secuencias es equivalente al producto de las
respectivas transformadas. Si se aplica a la expresin [17], se obtiene:

Y(z) = H(z) X(z) [19]

donde H(z), la transformada Z de la respuesta al impulso, es la funcin de transferencia del
filtro. Si evaluamos H(z) en el plano z para z=e
j"nT
en los puntos de la circunferencia de
radio unidad, obtenemos la funcin compleja H("), que representa la respuesta en
frecuencia del filtro. En funcin de dicha respuesta, los filtros pueden clasificarse como
pasa-bajos, pasa-altos, pasa-bandas o elimina-bandas. La figura 4.7 muestra la respuesta
ideal para cada tipo.

La expresin general de la funcin de transferencia es:

[20]




4. 14



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donde los ceros y polos de la funcin sern las races del numerador y denominador
respectivamente. A partir de esta expresin puede obtenerse la ecuacin en diferencias en
el dominio temporal:

y(n) = - ! a
k
y(n-k) + ! b
m
x(n-m) [21]

que corresponde a una forma recursiva puesto que la salida depende tanto de muestras de
entrada como de salidas anteriores. Cuando todos los coeficientes a
k
son cero, la salida del
filtro depende exclusivamente de las muestras de entrada, y corresponde a una forma no
recursiva.


















Figura 4.7. Mdulo de la respuesta en frecuencia para filtros ideales: a) pasa-bajo,
b) pasa-alto, c) pasa-banda, d) elimina-banda. "
I
y "
S
: frecuencias de corte
inferior y superior, respectivamente.


Una clasificacin usual de los filtros digitales se basa en su respuesta al impulso.
Cuando h(k) presenta un nmero finito de valores no nulos, se obtiene una respuesta finita
al impulso (filtros FIR: Finite Impulse Response), mientras que si h(k) presenta siempre
valores no nulos, se obtiene una respuesta infinita (filtros IIR: Infinite Impulse Response).
Este ltimo caso requiere algn tipo de realimentacin (forma recursiva), que puede influir
en la estabilidad del filtro. Los filtros FIR, que suelen implementarse usualmente de forma
no recursiva y son estables, pueden disearse para que tengan respuesta de fase lineal, lo
que evita distorsiones en la seal de salida.
|H(")|
"
S
"
a)
|H(")|
"
S
"
b)
|H(")|
"
I
"
S
"
c)
|H(")|
"
I
"
S
"
d)



4. 15



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Figura 4.8. Filtrado pasa-banda FIR aplicado a seal ECG: a) Seal de entrada. b)
Salida filtrada (15-25Hz). c) Mdulo de la respuesta en frecuencia del filtro. d)
Fase. Frecuencias normalizadas (frecuencia de muestreo: 200 Hz).

El diseo de filtros se realiza en base a ciertos requerimientos, generalmente
relacionados con su respuesta en frecuencia. Puesto que las respuestas ideales presentadas
en la figura 4.7 no son realizables, se implementan aproximaciones con un error aceptable.
En este caso, tanto la banda pasante como la eliminada (las bandas de frecuencias para las
cuales el filtro permite o no el paso de seal, respectivamente), presenta un cierto rizado en
a)
d)
c)
b)
Frecuencia normalizada
Frecuencia normalizada
M
a
g
n
i
t
u
d

(
d
B
)

F
a
s
e

(
g
r
a
d
o
s
)




4. 16



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vez de la respuesta plana ideal. Adems, el paso de una a otra banda no se realiza con
pendiente infinita, sino que aparece una banda de transicin con una cierta anchura #".
Existen diversas tcnicas de diseo, entre las que podemos destacar el mtodo de ventanas,
el muestreo en frecuencia y el diseo de rizado constante para el caso FIR, y el mtodo del
impulso invariante o la transformacin bilineal para filtros IIR.

Un ejemplo usual de aplicacin de filtrado digital para seal ECG es el caso de
deteccin de complejos QRS. El objetivo es destacar las las frecuencias asociadas a dichos
complejos atenuando los de las dems ondas (P,T). Se ha aplicado un filtro pasa-banda
FIR de fase lineal, y su mdulo y fase as como la seal de entrada y su correspondiente
salida filtrada se muestran en la figura 4.8. Como puede observarse, es posible establecer
un umbral de amplitud en la seal filtrada que slo corte en puntos de los QRS, lo que no
era factible en el caso de la seal de entrada ya que las ondas T presentan amplitudes
similares a los QRS.


4.4.2. Filtrado adaptativo

Cuando no se dispone de informacin a priori de la seal y el ruido, o cuando stos
no son estacionarios, no puede disearse un filtro ptimo a priori. Los filtros adaptativos
(FA) pueden automticamente modificar sus parmetros adaptndose a dichos cambios.
Los elementos bsicos de un FA son el propio filtro con coeficientes modificables, el
algoritmo de adaptacin y el criterio de correccin, que se basa en algn ndice de
rendimiento. Un ndice frecuentemente utilizado es la minimizacin del error cuadrtico
de salida. El algoritmo de adaptacin modifica los coeficientes del filtro optimizando el
criterio de correccin elegido. Existen dos clases principales: los algoritmos no recursivos,
que trabajan sobre bloques de datos, y los recursivos, que se actualizan muestra a muestra.

El FA requiere un periodo inicial de aprendizaje o adaptacin. Durante este
periodo, su comportamiento no es satisfactorio, por lo que el tiempo de adaptacin,
controlado por la constante de adaptacin, es una caracterstica importante. Seales con
cambios rpidos requieren filtros que se adapten rpidamente, pero esto puede tambin
hacer que el filtro se adapte tambin a artefactos rpidos. Despus de la adaptacin inicial,
se supone que el filtro acta ptimamente mientras sigue cambios no estacionarios de la
seal y el ruido. Debido, no obstante, a la capacidad limitada del filtro para estimar las
estadsticas de la seal de entrada, el comportamiento no es ptimo, aunque pueden
obtenerse diseos prcticos en que el error en las prestaciones sea muy pequeo.


Un tipo importante de FA aplicado frecuentemente en el campo del procesado de
bioseales es el cancelador de ruido adaptativo (figura 4.9). En este caso, la seal de
entrada, x(k), est compuesta por la seal de inters, s(k), y ruido superpuesto, n
1
(k). El



4. 17



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objetivo es recuperar la bioseal s(k) eliminando dicho ruido. Para ello, se utiliza una
segunda entrada de referencia en la que se dispone slo de muestras de ruido, sin
contribucin de la bioseal. El ruido n
2
(k) est correlacionado con n
1
(k) ya que ambos
estn generados por la misma fuente de interferencia, pero no son exactamente iguales
puesto que se adquieren en localizaciones diferentes y pueden considerarse, por tanto,
como las salidas de dos filtros H
1
y H
2
cuya entrada comn es la seal producida por la
fuente de interferencia. El filtro debe adaptarse, por tanto, para producir una estimacin
de n
1
(k), n
1est
(k), a partir de n
2
(k), de manera que la salida final ser una estimacin de
la bioseal:

y(k) = x(k) - n
1est
(k) = s(k) + n
1
(k) - n
1est
(k) = s
est
(k) [22]

El error mnimo de salida se dar para n
1est
=n
1
. Puesto que, segn [17]:

n
1est
(k) = ! h
j
n
2
(k-j) [23]

el algoritmo de adaptacin debe modificar los coeficientes h
j
para obtener mnimo error.
Existen diversos algoritmos de adaptacin. Uno de los ms usuales es el LMS (Least Mean
Square), para el cual la actualizacin de coeficientes viene dada por:

h
j
= h
j
+ 2 y(k) n
2
(k) [24]

siendo la constante de adaptacin del filtro.












Figura 4.9. Estructura general del cancelador de ruido adaptativo.


El cancelador de ruido adaptativo se ha aplicado en diversas aplicaciones de
procesado de bioseales, tales como eliminacin de interferencia de red, de intererencia de
RF producida por la utilizacin de electrobisturs, cancelacin de ECG materno en
registros de ECG fetal, etc. En todos los casos, es importante seleccionar adecuadamente
los puntos de obtencin de las bioseales para que se cumplan las hiptesis que deben
+
x(k)=s(k)+n
1
(k) y(k)
n
2
(k) Filtro
n
1est
(k)



4. 18



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cumplir x(k) y n
2
(k), fundamentalmente en lo que se refiere a la no presencia (o mnima
presencia) de la bioseal en la entrada de referencia. Esto no es siempre posible, por lo
que los resultados obtenidos por el filtro sern peores en la medida en que no se cumplan
las hiptesis de aplicacin.

Por ejemplo, en el caso de la eliminacin de interferencia RF (figura 4.6), tanto el
ruido como la bioseal de inters (el ECG del paciente), estn presentes en cualquier
localizacin de su cuerpo. Por ello, la seal x(k) se obtiene mediante electrodos localizados
en el trax, (cerca de la fuente de la bioseal: el corazn), por lo que el ECG presentar
mayor amplitud que en puntos lejanos (extremidades), en donde se obtiene la seal de
referencia n
2
(k).

En el problema de obtencin del ECG fetal, el ECG materno es la interfencia a
eliminar. En este caso, la seal x(k) se obtiene mediante electrodos localizados en el
abdomen materno (cerca del corazn fetal y, por tanto, donde se obtiene mayor amplitud
del ECG fetal), y la referencia de ruido se toma en un punto alejado del mismo, para tener
en la medida de lo posible una seal compuesta slo de ECG materno (usualmente se
utilizan electrodos situados en el trax de la madre).





Figura 4.10. Cancelacin de interferencia ECG en registro EMG. a) Entrada EMG
con ECG superpuesto. b) Referencia ECG. c) Salida del filtro adaptativo.

c)
b)
a)
t(s)



4. 19



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La figura 4.10 muestra un ejemplo de eliminacin de interferencias de otros
biopotenciales en la seal de inters. Corresponde al caso de captacin de EMG (bioseal
de inters en este caso), con superposicin de ECG (interferencia). La seal de EMG se ha
obtenido mediante electrodos localizados en el mentn. La entrada de referencia se ha
tomado en el trax, cerca de la fuente de interferencia y alejada de los msculos que
producen la seal de inters). La salida del FA muestra la cancelacin de la interferencia.


4.4.3. Promediacin

El promediado permite mejorar la relacin seal-ruido en aquellos casos en que el
espectro de ambos se solapa, por lo que no puede aplicarse un filtrado convencional. El
promediado secuencial se utiliz inicialmente en el campo de la Ingeniera Biomdica para
obtener los potenciales cerebrales evocados por estmulos sensoriales, y fue introducido en
el campo de la electrocardiografa a principios de la dcada de 1960 para extraer el ECG
del feto del de la madre.

Esta tcnica promedia cierto nmero de ciclos de la onda de inters, obtenidos de
un mismo canal de adquisicin pero en distintos instantes temporales, con lo que el ruido
aleatorio, que no est sincronizado con la seal, se reduce mientras la seal permanece
invariante. Para ello, los pulsos cardacos deben ser alineados, obtenindose un ciclo
promedio.

Existen algunos requerimientos para que esta tcnica reduzca el ruido de forma
efectiva:

1. La forma de onda de inters debe ser repetitiva. Si un evento ocurre de forma
espordica, o la onda cambia con el tiempo, se producir una onda promediada con
un efecto no deseado de filtrado pasa-bajo, eliminando la informacin de alta
frecuencia.

2. La seal debe estar correctamente alineada. Debe utilizarse una caracterstica que
sirva como referencia temporal. En el caso del ECG, por ejemplo, se suele utilizar
la mxima amplitud o pendiente del QRS, y como parmetro de alineamiento se
utiliza frecuentemente el coeficiente de correlacin.

3. El ruido debe tener ciertas caractersticas para que el promediado lo reduzca de
forma efectiva. Debe ser aleatorio y blanco. Los ruidos con un patrn regular,
como la interferencia de red, no se minimizan tan eficientemente por promediado
como el puramente aleatorio.




4. 20



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4. Por ltimo, la seal de inters no debe estar correlacionada con el ruido. El
promediado no atenuar correctamente aquellas interferencias que guarden una
cierta sincronizacin temporal con la seal, como ocurre en el caso de movimiento
de los electrodos debido a la respiracin o estmulos de marcapasos.

Las figuras 4.11 y 4.12 ilustran estas hiptesis de aplicacin:



Figura 4.11. Promediado de pulsos invariantes y no coherentes: efecto de formas
no constantes en la seal o incorrecta alineacin de la misma.


Para estudiar la aplicacin del promediado, consideremos un biopotencial x(t)
captado en la superficie de la piel. Podemos caracterizarlo por:

x(t) = s(t) + n(t) [25]

donde s(t) es la seal generada por la fuente del biopotencial y n(t) es el ruido compuesto
por otros biopotenciales no deseados, ruido trmico e interferencia de la red. Si la seal
est muestreada, vendr expresada por:

x(k) = s(k) + n(k) [26]

Podemos representar n(k) como la composicin de las distintas fuentes de ruido:

n(k) = n
1
(k) + n
2
(k) + n
3
(k) + n
4
(k) [27]





4. 21



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Figura 4.12. Efecto del tipo de ruido sobre el promediado: aleatorio, red y ruido
relacionado con la seal.

n
1
: ruido biolgico, debido a otros biopotenciales. En el caso de ruido EMG se
puede considerar estadsticamente normal, no correlacionado y estacionario con el
paciente en reposo.

n
2
: Interferencia de red. Se suele considerar la frecuencia fundamental (50 Hz) y el
tercer armnico. Su amplitud vara dependiendo de la localizacin.

n
3
: representa el ruido trmico del sistema electrnico. Estadsticamente es normal
y blanco. Su amplitud depende del equipamiento en uso y de su temperatura
equivalente de ruido.

n
4
: es el ruido de discretizacin de amplitud. Este ruido suele suponerse
estadsticamente uniforme, no correlacionado con la seal y blanco.

De los cuatro tipos comentados, n
2
no puede considerarse como aleatorio, y suele
eliminarse mediante filtrado previo. Los otros tres requieren promediacin para su
eliminacin. Esta promediacin, como ya se ha comentado, necesita una referencia
temporal en seales repetitivas (pulso de estimulacin en el caso de PE u onda R en el caso
del ECG). El primer paso, pues, consiste en la determinacin de la referencia temporal, que
deber ser lo ms precisa posible, ya que indeterminaciones en la superposicin de las
seales s
i
(k) consecutivas implicar un filtrado por incoherencia.



4. 22



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Para centrar el estudio, vamos a considerar que la seal s(k) a promediar es un
ECG de superficie al que se quiere mejorar la relacin S/N. Nuestra referencia temporal
ser la onda R.


Determinacin de la referencia temporal.

En primer lugar, es necesario detectar una referencia temporal que nos permita
superponer correctamente los pulsos. En el caso del ECG, se suele utilizar la onda R
debido a su mayor amplitud. Existen distintos algoritmos de deteccin, pero en este caso, y
puesto que slo necesitamos una referencia temporal, utilizaremos un criterio de umbral
para obtener una posicin aproximada, que posteriormente corregiremos para obtener la
posicin exacta de superposicin. Por tanto, se considerar que se ha detectado una onda R
cuando la seal supere el umbral, establecido como el 90% del valor mximo de su
amplitud. Las posiciones obtenidas se denotarn por n
ref(i)
, donde i=0..N-1, siendo N el
nmero de ondas R detectadas, y tomando i=0 para el pulso de referencia sobre el que
superpondremos todos los dems para realizar el promediado.














Figura 4.13. Definicin de patrn e ndices.


Para obtener un alineamiento correcto, deben corregirse las posiciones obtenidas
por el criterio de umbral. Un mtodo frecuentemente utilizado para obtener esta referencia
corregida es el clculo de la autocorrelacin, que indica la semejanza entre el pulso de
referencia y los dems, en funcin de su posicin relativa (lag). Para ello, se fija un patrn
(el pulso de referencia, que denotaremos con el subndice 'ref') y se calcula el coeficiente
de autocorrelacin entre el patrn y los sucesivos pulsos para distintos valores de
desplazamiento (lags). El desplazamiento al que corresponde el valor mximo del
Umbral R
R
ref(0)

L
ref(i)

L



4. 23



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coeficiente de correlacin proporciona la referencia temporal corregida. La figura 4.13
muestra un esquema de la seal con la definicin de umbrales y patrones.

El coeficiente de autocorrelacin vendr dado por:



La autocorrelacin se realizar entre L/2 muestras anteriores y posteriores a la
referencia de la onda R, ref(i), y el valor del lag, d, vara dependiendo de la frecuencia de
muestreo y de los niveles de ruido. Una variacin de aproximadamente 10 msg. es
suficiente para encontrar el valor mximo de la autocorrelacin. Si suponemos una
frecuencia de muestreo de 1 kHz, esto corresponder a un valor de d=-5..+5.

La referencia corregida vendr dada por:

k
ref(i)
= n
ref(i)
+ d [28]

Para el caso del pulso patrn, ref(0), su posicin relativa a s mismo no es necesario
corregirla, por lo que:
k
ref(0)
= n
ref(0)
[29]


El proceso de alineamiento mediante la funcin autocorrelacin permite tambin
rechazar la presencia de pulsos anormales del proceso de promediacin. As pueden
eliminarse tambin artefactos debido a movimiento, etc. Para ello, debe fijarse un criterio
de umbral mnimo para el coeficiente de autocorrelacin que permita desechar pulsos
ectpicos (los cuales, por tener formas diferentes a la del patrn, proporcionan bajas
correlaciones). La figura 4.14 ilustra estos casos:


Promediacin

El objetivo del promediado coherente es la disminucin del ruido. Para cuantificar
esto, calcularemos la relacin seal/ruido (SNR) de la seal promediada, definida como:


[30]



4. 24



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donde $
n(i)
es la desviacin estndar del ruido de media cero, y para este ruido el valor
RMS coincide con la desviacin estndar.




Figura 4.14. Alineamiento de la seal por correlacin. Efecto de alineamiento con
ectpicos.


Para obtener el valor de la SNR, calcularemos el valor medio y la desviacin
estndar de la seal promediada. Supongamos i=0..N-1 el nmero de pulsos detectados a
promediar, y k=-(L/2 -1)...+L/2 el nmero de muestras promediadas por cada pulso.
Supondremos que la seal de inters es invariante:

s(i,k) = (s(i+1,k) ; % i,k [31]

Suponiendo ya eliminada la interferencia de red, el valor esperado de los M pulsos
vendr dado por:







4. 25



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[32]

ya que hemos supuesto todos los pulsos iguales y el valor medio del ruido es cero para
ruido aleatorio (en la medida en que el ruido no sea totalmente aleatorio, esto no se
cumplir y el promediado no lo cancelar eficientemente).
La varianza para N promedios vendr dada por:


y teniendo en cuenta que n
1
, n
3
y n
4
son estadsticamente independientes y, por tanto, no
correlacionados:

[33]

donde $
2
n'(i)
es la varianza del ruido antes de promediar. Por tanto, la mejora obtenida es:

SNR
promed
= N
1/2
SNR
original
[34]

La figura 4.15 muestra el efecto del nmero de pulsos promediados sobre el nivel
de ruido.

El promediado es equivalente a un proceso de filtrado digital. La transformada de
Fourier de la funcin de transferencia de un promediador est compuesta por una serie de
componentes con iguales caractersticas (comb filter). La seal deseada tiene un espectro
compuesto de componentes frecuenciales discretas, mientras que el ruido aleatorio tiene









4. 26



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una distribucin continua. Cuando el nmero de pulsos promediados se incrementa, la
anchura de cada componente decrece, y el filtro deja pasar ms selectivamente las
componentes de la seal, mientras rechaza las frecuencias de ruido aleatorio situadas entre
dichas componentes. Por tanto, el ruido no se elimina completamente, y aquellas
interferencias con un espectro discreto tampoco se atenan tanto como las puramente
aleatorias.




Figura 4.15. Efecto del nmero de pulsos promediados.



4.5. Segmentacin

Puesto que la condicin de que la seal sea estacionaria, necesaria para poder
utilizar algunas herramientas de procesado digital, no se cumple en muchos casos cuando
se trata con seales reales, es necesario aplicar algn mecanismo que limite la ventana
temporal de datos a procesar asegurando que, dentro de esta ventana, la seal es
aproximadamente estacionaria. Este mecanismo se conoce como segmentacin, y permite
reducir la no estacionariedad a un problema de estacionariedad a tramos. Existen diferentes
formas de implementarlo, en funcin de las caractersticas de la seal a tratar.




4. 27



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La forma ms simple desde el punto de vista del procesado consiste en utilizar
ventanas de duracin constante. La longitud de las ventanas depende de la seal y de la
aplicacin, y debe seleccionarse lo suficientemente corta como para asegurar la
estacionariedad de la seal dentro de la ventana y lo suficientemente larga como para
preservar las frecuencias ms bajas del espectro de la seal. Este esquema de segmentacin
se ha usado frecuentemente en procesado de voz, ECG, etc.

Una forma ms eficiente consiste en determinar adaptativamente la longitud de la
ventana, en funcin de las variaciones de la seal. Esto permite detectar cambios abruptos,
aunque en general las bioseales suelen presentar cambios en la estacionariedad con
variaciones ms lentas. La segmentacin adaptativa se ha aplicado, por ejemplo, en
procesado de EEG.
Un ejemplo de mtodo de segmentacin adaptativa el la medida de error espectral
(SEM: Spectral Error Measure). Se define una ventana de referencia, de longitud constante
y lo suficientemente corta como para asegurar que la seal es estacionaria en ella. Una
segunda ventana deslizante, de igual longitud que la primera, se va desplazando muestra a
muestra por la seal. Para cada desplazamiento, se calcula el espectro correspondiente y se
compara con el de la ventana de referencia. Si la diferencia entre espectros es inferior a
cierto valor umbral, se supone que no hay variaciones significativas en la seal. Si se
supera el umbral, se considera que ha habido un cambio en la estacionariedad, por lo que la
ltima ventana deslizante se convierte en la nueva ventana de referencia para el siguiente
segmento de seal. La definicin de la medida de distancia espectral relativa (D) se define
en este mtodo como:



donde S
R
y S
D
son los espectros correspondientes a las ventanas de referencia y deslizante,
respectivamente. La medida se da en trminos relativos para independizarla de las
variaciones de amplitud de la seal. La siguiente figura muestra un cambio en la seal
EEG localizado en 2,5s, y el valor proporcionado por SEM, pudiendo establecerse un
umbral que detecte dicho cambio.




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Figura 4.16. Segmentacin adaptativa de EEG mediante SEM. (J. Bronzino Ed.
"The Biomedical Engineering Handbook". CRC Press).

ventana deslizante
ventana referencia
ventana incremental
t(s)