Los recursos hdricos de Aguacatn se encuentran distribuidos dentro de la extensin
territorial de las cuatro sub - cuencas existentes en el Municipio, las cuales se observan en el cuadro siguiente y figura 4.
Las subcuencas del Ro Salinas y Ro Blanco pertenecen a la cuenca del Ro Salinas, la subcuenca del Ro Naranjo pertenece a la cuenca del Ro Ixcn y finalmente, la subcuenca Xaclbal, que pertenece a la cuenca del mimo nombre. Todas ellas pertenecen a la vertiente del golfo de Mxico.
Dentro de los lmites municipales de estas subcuencas, existen varias fuentes de agua, siendo las principales: Ro San Juan y ro blanco; por su disponibilidad de agua y atractivo turstico. Otros ros de menor importancia local son: Nacimiento el Pericn, Nacimiento Las Pilas, Ro Chancol, el Rancho y el Potrerillo, estos recursos estn vistos tambin como puntos tursticos.
En el mapeo participativo, sealaron los comunitarios que en lo que respecta al avance de la frontera agrcola, esta se da con mayor nfasis en las comunidades de Aldea Pajuil, Pas, Pajul, Chex abajo, Cruz Chex, El Suj, La Barranca, Tucun, Agua Blanca, Llano del Coyote, Xixurac, Exchimal; las cuales coinciden en gran parte con las comunidades donde se realizan actividades de produccin forestal en el Municipio. Lo anterior es de consideracin y suma importancia en cuanto a que institucionalmente se planifiquen acciones ambientales que protejan y preserven las zonas de recarga hdrica; se implementen programas y proyectos institucionales que aumenten la cobertura forestal y/o impulsen definicin de reas protegidas, que permitan sosteniblemente el uso del vital lquido de las fuentes de agua identificadas en el Municipio.
En el cuadro se observa el potencial de nacimientos de agua que tiene el municipio, entre ellos existen a nivel comunal y municipal; beneficindose de ellos el casco urbano y varias comunidades circunvecinas a las fuentes de agua, lamentando que la parte alta del municipio presenta serios problemas del vital lquido.