Poisson-Boltzmann y su aplicacin en los sistemas macromoleculares.

Es una ecuacin diferencial que describe interacciones electrostticas entre molculas en

soluciones inicas



Es el operador divergencia,
Representa la posicin dependencia dielctrica,
Representa el gradiente del potencial electrosttico,
Representa la densidad de carga del soluto,
Representa la concentracin del ion i a una distancia de infinito desde el soluto,
Es la carga del ion, q es la carga del protn,
Es la constante de Boltzmann, T es la temperatura, y : es un factor para la
accesibilidad de la posicin dependencia de la posicin r hasta los iones en la disolucin.

Aplicacin en Sistemas Macromoleculares
Sobre la superficie de la macromolcula existen residuos cargados que generan potenciales
elctricos que se extienden varios angstroms dentro de la solucin. Por ejemplo, en el DNA los
potenciales producen gran concentracin de asociacin de iones, que afecta significativamente en
un gran factor la conformacin y las propiedades de los enlaces. El potencial elctrico alrededor de
las macromolculas puede aumentar la razn de asociacin del sustrato, y el potencial elctrico
alrededor del DNA se ha credo responsable de la no secuencia especfica de enlaces de protenas
y otras molculas. El potencial elctrico alrededor de ciertas protenas puede ser el responsable
del doblamiento del DNA.
El mtodo FDPB es el camino disponible ms efectivo para el clculo de potenciales alrededor de
macromolculas. Simulaciones detalladas no son lo suficientemente amplias para ser significativo
el efecto de la superficie o no incluyen los efectos de la fuerza inica. El mtodo de PDLD no es
apropiado para el clculo de estos potenciales, en algunos casos no es razonable usar la ley de
Coulomb con una constante dielctrica de 80 o usar soluciones analticas basadas en modelos
simplificados de la macromolcula, adems los efectos en los potenciales elctricos producidos
por el solvente pueden ser muy bajos si se utilizan mtodos simplificados.
Hay estructuras que inducen gradientes de potencial grandes en sitios activos o potenciales
exagerados en el interior de la solucin. Los potenciales generados en el solvente muestran tener
grandes efectos en la razn de asociacin de molculas cargadas. Este fenmeno recientemente
ha sido estudiado de forma extensiva por el clculo de Dinmica Browniana, el cual hace posible
simulaciones de procesos de difusin. El mtodo que ha sido ms efectivo en el estudio de la
asociacin usa potenciales generados por clculos de FDPB como bases para el clculo de fuerzas
usados en los procesos de simulacin de la Dinmica Browniana.
Aplicaciones a protenas Cu, Zn-superoxido dan un resultado satisfactorio del valor de la magnitud
observada y la dependencia de la fuerza inica de la razn constante para la difusin de los sitios
activos, cuando se usaron modelos que utilizan potenciales simples de Coulomb los resultados
difieren de los resultados experimentales.
Para el clculo de potenciales alrededor de la macromolcula solo es necesario definir la superficie
de Van der Waals y la distribucin de carga y con solo una corrida del programa de FDPB se
encuentran potenciales sobre un enrejado cbico que pueden ser mostrados grficamente o
numricamente. Por ejemplo, en el tRNA tiene una ventana de potencial negativo alrededor de
la molcula, que fue encontrado en la regin anticodon, esto sirve para reducir la interaccin
repulsiva con otras molculas de cargada negativa y puede aumentar la interaccin con el mRNA.

La utilidad de la electrosttica para el estudio de sistemas biolgicos.
Los sistemas biolgicos y moleculares se estudian para realizar modelos que describen el
comportamiento y las interacciones entre las diferentes estructuras moleculares, la electrosttica
de todas las molculas que se encuentran en los sistemas biolgicos es aplicada a sistemas
complejos que se pueden asumir ciertas consideraciones en su organizacin y en los que se les
atribuye fenmenos para descubrir su comportamiento y si interacciones que presentan ente sus
bio molculas.

La aplicacin actual y sus posibles aplicaciones en la salud, el medio ambiente y los alimentos.
La electrosttica se aplica para generar energa elctrica y que esta sea consumida por aparatos
elctricos. Para alimentos se estudia ampliamente en la conservacin de harinas ya que una
pequea chispa de esta energa puede desencadenar una gran explosin. En medicina se usara
para estudiar las interacciones que pudiera presentarse en el ADN con otro tipo de compuestos
qumicos y en el medio ambiente se puede usar para que la electrosttica retenga contaminantes
y evitar que lleguen al ambiente.