Sistemtica

BiologadeOrganismos BIOL1300 Prof:JorgeMolina

Sistemtica
Objetivosdelasistemtica: 1)Descubrirtodaslasespeciesexistentes 2)Reconstruirsusrelacionesevolutivas (descendenciaancestrocomn=Darwin) 3)Clasificarlosorganismosacordeconsusrelacionesevolutivas Haeckel(1866)introdujolostrminosfilogenia,Phylum,monofilticoyclado

Sistemtica=Estudiodeladiversidaddelavidasobrelatierraysus relaciones atravsdeltiempo

Porqu clasificarlosorganismosvivos?
Paralograrunamejoraproximacinalosecosistemas

Paradefinirprioridadesdeconservacin

Paraevaluarelefectodelaactividadhumanasobreelplaneta

Paratomarmedidasensituacionesdealertaensaludpblica

Qu es una especie?
ThomasHenryHuxleydiscutiendoDarwin yelOrigendelasespecies en1859se hizolapregunta

Laespecieeslaunidadevolutivabsica

Hendry.2009.Nature.458:162164

Qu es una especie?
Ladefinicinuniversaldeespeciese habuscadoporlargotiempo

Masdedosdocenasdedefiniciones sehandesarrolladoperoningunaes aceptadauniversalmente

Lasdefinicionesdeespeciese dividenentericasyoperacionales

Concepto

Reconocimiento

Definiciones tericas de especie

Laprincipaldefinicindentrodelastericasesladefinicinevolutivadeespecie

Desafortunadamenteladefinicinevolutivadeespecienoestilparaidentificar especiesporquenotienecriteriosdereconocimiento

Tayloretal.2000.Fungalgeneticsandbiology.31:2132

Definicionesoperacionalesdeespecie
Lasdefinicionesoperacionalessonmasabundantesquelastericas Dentrodelasdefinicionesoperacionalesseincluyen: Definicinmorfolgicadeespecie Definicinbiolgicadeespecie Definicinfilogenticadeespecie

Tayloretal.2000.Fungalgeneticsandbiology.31:2132

Definicinbiolgicadeespecie

Unadelasmaspopularesesla definicinbiolgicadeespecie

Unaespecieesunacomunidad(reproductiva)de poblacionesaisladasreproductivamente deotrasyqueocupanunnicho especficoenlanaturaleza (Mayr,1982)

Nicho=hipervolumendendimensiones(Hutchinson.1961.Theparadoxoftheplankton)

Problemadeladefinicinbiolgica deespecie
1.Seestimaqueel25%detodaslasplantasyel10%detodaslasespecies animaleshibridizanexitosamenteconporlomenosotraespecie Algunosentoncessugierenunadefinicinunpocomaslaxadondealgode flujogenticoespermitidosiempreycuandonoselleguealahomogenizacin

2.Esdifcildeaplicaragruposqueestngeogrficamenteseparadosoaloptricas (nosesabesinoseentrecruzanalsersimptricas)

3.Nosepuedeaplicaratodoslosorganismos(quedanporfueran losquenose reproducensexualmenteolosqueestnextintos) Surgenentoncesdefinicionesdeespeciealternativas

Hendry.2009.Nature.458:162164

Otrasdefinicionesdeespecie
Especietipolgicaofenotpica=Especiesdefinidasporcaracteresfenotpicos

Ejemplaresalmacenadosenlosmuseosrepresentanlaformaidealomorfolgica delaespecie Pequeasvariacionesmorfolgicassonconsideradasimperfeccionesaccidentales mientrasquegrandesvariacionesproducenunanuevaespecie

Otrasdefinicionesdeespecie
Agamoespecie =Notienenregulary/oobligatoriareproduccinbiparental

Sagapedo Genoespecie =Enbacterias, ungrupodecepasconmasdel 70%dehomologaensus secuenciasdeADN Siblingspecies=Especiesgenticamenteaisladaspero idnticasmorfolgicamente

Magicicadaseptendecula CerthiabrachydactylaC.familiaris

Otras definiciones de especie

Elcasodelosvirus

Problemaconlosvirus:Altastasasdemutacionesloqueindicaquelosvirus evolucionanmasde1millndevecesmsrpidoque losmicroorganismoscelulares. Cmopuedenentoncesmantenerlosvirussusidentidadescomoespecies patognicasduranteunperodoevolutivo?

Otrasdefinicionesdeespecie

Unaespecieviralesenrealidaduncomplejodepoblacionesautoperpetuantes diversasperorelacionadasyqueactancomountodo=quasiespecies Cambiarelnombredeespecieporquasiespecienoessolounacuestinsemntica, enrealidadtieneencuentaelcomportamientodelosvirus

Otrasdefinicionesdeespecie
Labasedelaclasificacindelosviruses desarrollarunconceptodegeometradel espacioquerepresentediferenciasentre secuenciasgenticascomodistancias espacialesprecisas

Cmosenombraunaespecie?

1618

UlisseAldrovandi

Cmosenombraunaespecie?
Primeraedicin(1735) y11pginas

17071778

10 edicin(1758) 4400animalesy 7700plantas

Nomenclaturabinomialtomandocomobasela morfologa

Cmosenombraunaespecie?

ForeyP.L.,2005

17071778

Cmosenombraunaespecie?
Idiomasoficiales griegoo latn Gnero=Sustantivo(ensingular) Especie=adjetivo

Pyrocephalusrubinus

Gnero:Pyrocephalus Especie:Pyrocephalusrubinus

SIEMPREencursiva Nombreespecfico:rubinus Losnombresdebensercortosyfcilesdememorizarparapodercodificar ymanejarelmayornmerodeespecmenes

Cmosenombraunaespecie?

Apismellifera Linnaeus,1758

Aedesaegypti (Linnaeus,1762) Stegomyiaaegypti Linnaeus,1762

Cmosenombraunaespecie?
Nosedebemezclargriegoconlatn Elprefijosub sedebeusarconsustantivosoadjetivoslatinos peroNO connombres propios(ej:subviridis osubstriatus peroNO subwilsoni osubdarwinia) Lomismosucedeparaelprefijopseudo peroenestecasolossustantivosoadjetivos debensergriegos. Sisevaautilizarelnombredeunvarnquenotieneniraceslatinasnigriegasse agregalaterminacini alnombrecompleto(smithi deSmith,krupai deKrupa, bonarellii deBonarelli,marinkelleideMarinkelle). Sisevaautilizarelnombredeunvarnquetieneraceslatinasseagregala terminacini parareemplazarlaterminacinus (fabricii deFabricius). Sisevaautilizarelnombredeunamujerquenotieneniraceslatinasnigriegasse agregalaterminacinae alnombrecompleto(josephineae deJosephine,ferroae de Ferro).

http://www.iczn.org/Formation_of_names.pdf

Cmosenombraunaespecie?
Sielnombremodernoprovienedeunnombreclsicosedebeutilizarsurazclsica (ej:caroli deCarlos,annae deAna). ConlosprefijosMacoMcoM sedebeutilizarmacyfusionaralapellido(ej:maccooki deMcCook,maccoyi deMCoy). ElprefijoO seunealnombreysinapstrofe(ej:obrieni deOBrien) Artculoscomoprefijossedebenuniralnombre(ej:leclerci deLeClerc,dubuyssoni deDuBuysson,lafarinai deLaFarina). Prefijoscorrespondientesattulosnobilariososantidadseremueven(ej:remyi deSan Remy,clairi deSaintClair). Losnombresgeogrficossedejanigualesyselesagregaelsufijoensis oiensis (ej:cubensis deCuba,timorensis deTimor,panamensis dePanam). Nombresgeogrficosusadosporlosromanosoescritoresmedievalestienen preferenciasobrelosnombresmodernos(ej:vindobonensis seprefieresobre vienensis deViena)
http://www.iczn.org/Formation_of_names.pdf

Cuntasespecieshay?
10a50millonesdeespecies

Cuntasespecieshay?

Plantas,hongosyotroseucariotassumanotromillndeespecies Hay3700.000especiesdeartrpodos

Lasespeciesseorganizanas:

Taxa Taxon Lanicacategoraalaqueselehatratadodedarunadefinicinprecisaesaespecie, lasotrascategorassondefinidasporsurangojerrquico

Reinos
Lemery(1675)propuso 3reinos(vegetal, animalymineral)y luegofuepopularizada porLinneo(sigloXVIII)

Dosreinosdelosseresvivos

Whittaker.1969.Science.163:150160

Reinos
Copeland(1956) 4reinos: Monera Protoctista Plantae Animalia

Hogg(1860)RegnumPrimigenum o Protoctista

Whittaker.1969.Science.163:150160

Reinos
Necker(1783)propuso elreinoFungi

Owen(1858)propuso elreinoProtozoa

Enderlein(1925)propuso elreinoBacteria

Whittaker.1969.Science.163:150160

http://www.timetree.org/book.php

Phyla
60Phylaentotal

Margulis&Schwartz(1988)=92Phylaentotal Mhn(1984)=100Phylaentotal

Virus???????

Qu sonlosvirus?
Virussonelementosgenticosparasticostransmisibleslateralmenteynoson organismosvivos Virussonungrupodepartculasultramiscroscpicascompuestasdecidos nuclicosyprotenas(algunasvecestambinlpidos)querequierenclulas vivasparareproducirse.Losvirusevolucionaronprobablementedeclulas eucariotasysecundariamenteperdieronalgunosdesusatributoscelulares
Purvesetal.2008

Cuatro razones hacen imposible incluir a los virus en el rbol de la vida: 1) Incapaces de auto-mantenerse (metabolismo) y auto-replicarse 2) Son polifilticos (no tienen un ancestro comn) 3) Origen celular de sus genes tipo clula 4) Volatilidad de su genoma a travs del tiempo

Definicindevida
Anorganizedgeneticunitcapableofmetabolism,reproduction,andevolution
Purvesetal.2004

Aselfreplicatingchemicalsystemcapableofevolving
Plaxco&Gross.2006.Astrobiology:Abriefintroduction

RNA

Cmosonlosvirus?

Cmosereplicanlosvirus?

Virus

Sepuedeeliminarsencillamentedelrboldelavidaaagentesmuyabundantes enlabiosferaybasalesenelrboldelavida? Qu quedaradelrboldelavidasinosotroseliminamostodaslaspropiedades virales?

Unrbolenlanaturalezaesmasquesololasclulasquecomponensusraces, tallosyhojas. Unrbolsinlasinteraccionesentrelasraces,hongos(micorrizas)ybacterias tieneseriosproblemasparasobrevivir. Sitenemosencuentaquemuchodeloquecoordinalasinteraccionesentrelas raceshongosbacteriassongenesproductodeorigenviral Podemosentoncesestarsegurosquelametforadelrboldelavidaactual,para sertilafuturodebetenerencuentaquelosvirushansidoysonelementos esencialesenlasracesytallosdelosrboles(naturalesydelavida)

Viroides
ViroidessonARNcirculardecadenasencillaconuntamaode250a400nucletidos

Descubiertasen1971porTheodorDiener

Infectanadiferentesplantascultivables(monoydicotiledneas) produciendoefectosdesdepocovisibleshastanecrosis,deformaciones oprdidadetamaoporinteraccionesconARNsi ViroidesnosonARNquecodifiqueyporlotantonohayprotenasviroides Viroidesnotienencpside

www.biologie.unihamburg.de/bzf/mppg/agviro2.jpg

Viroides
Losviroidesinfectanlaepidermisdelaplantadespusdedaomecnico delaparedcelular.Noutilizanvectores Losviroidessepuedenlocalizarenelncleo(Pospiviroidae)oen elcloroplasto(Avsunviroidae)dondesereplican Sonconsideradosparsitosdelamaquinariatranscripcionaldelncleoy cloroplastos

Enestasprimerasclulassereplicayluegoinvadeclulasvecinas porlosplasmodesmatahastallegaralfloemapordondesedispersaahojas jvenesylaraces

Viroides
Chrysanthemumchloroticmottleviroid CChMVd

Protenascomoagentesinfecciososquecausanenfermedades.

PrionesproducenenfermedadesdenominadasEncefalopatias EspongiformesTransmisibles(EEToTSEeningls)

Nopresentainmunogenicidadytienenlargosperodosde incubacin

LaenfermedadmejorconocidaentrelasEETesladelasvacaslocas

Desde1994tambinen Saccharomycescerevisiae

Talvezlaformamascomn enhumanos(12individuos/ millndepersonas/ao)y seconsideraespontnea Lasformasfamiliaresestn asociadasconaprox.20 mutacionesdelgenPrP (substitucindeaa, insercionesorepeticiones supernumerarias)

Existeungen(Prnp)quecodificaparaPrPC queeslaprotenaenunhuspednormal. EstaprotenaporrearregloscomformacionalessetransformaenPrPSc

PrP=Glicoprotenaresistentealaproteasa

Contrarioaloquesepiensa,lasPrPSc nosonmuyestablesytienenunavidamedia demenosde24horas Entoncesparaqueselleguealamuertecelulardelasneuronassenecesitaquela tasadegeneracindePrPSc seamasdedosvecesmasrpidaquelade degradacinparaquelaprotenatransformadaseacumule

Bajocondicionesnaturaleslosprionesseadquierenporvaoral

Sntomatpicodela enfermedaddelas vacaslocas

Unavezenelinteriorinvadenelsistemanerviosocentralluego deamplificarseenel bazo(expresindePrPC esrequeridaparatransportarelagenteinfeccioso alSNC)yconducenaunaneurodegeneracin(vacuolacinymuertecelularde neuronas)

Sistemtica:Estudiocientficodeladiversidaddelosorganismos Taxonoma:Teorayprcticadeclasificarorganismos(subdivisindela sistemtica) Filogenia? rbolFilogentico?

Campbelletal.2008

Lasespeciesseorganizanas:
ElsistemadeclasificacindeLinneoesjerrquico
Humanos Gorila Sapo leopardo Animalia Chordata Vertebrata Mammalia Eutheria Primates Anthropoidea Hominidae Ranidae Ranininae Homo H. sapiens Gorilla G. gorilla Rana R. sphenocephala Anura Anphibia Arthropoda Uniramia Insecta Pterygota Orthoptera Ensifera Tettigoniidae Phaneropterinae Scudderia S. furcata S. furcata furcata Katydid

Reino Phylum Subphylum

Clase
Subclase Orden
Suborden

Familia
Subfamilia

Gnero Especie
Subespecie

Existen7taxabsicosperoentotalsereconocenhasta30taxa

Subespecies
Variacionesgeogrficas (especiespolitpicas) Lassubespecie,orazageogrfica,es unasubdivisindeespeciegeogrficamente localizada,quedifieregenticamentey taxonmicamentedelasotrassubdivisiones delaespecie Siexistendiferenciasmenoresentrelas poblacionesalolargodelrangogeogrfico delaespecie,quenojustificanel reconocimientotaxonmico,selellama alaespeciecomomonotpica.Sinembargo, frecuentementeciertasrazasgeogrficas deunaespeciesonsuficientemente diferentesparaserreconocidascomo subespecies.Unaespeciecompuestade variassubespeciesesllamadapolitpica

Mayr.1999.Systematicsandtheoriginofthespeciesfromtheviewpointofazoologist.pp:106107 Mayr.2001.Whatevolutionis.pp:165

Subespecies
Variacionesgeogrficas (especiespolitpicas) Perootrosnocreenquesubespeciesyrazas sonlomismo Subespecieacollectionofpopulationsoccupying adistinctbreedingrangeanddiagnosably distinctfromothersuchpopulations

Comohayunadefinicinclarapara subespecieytantosproblemascon razasentoncesmejormirarlascomo doscosasseparadasynocomo sinnimos

Ensatinaeschscholtzii
Patten.2009.Nature.457:147

Cmoseorganizanlasespecies?
Lasistemticaoelestudiocientficodelasrelaciones entrelosorganismos proveelarespuesta Losorganismosqueconformanlasespeciesserelacionanfilogenticamente esdecir,

Lafilogenia esunahiptesis quedescribelahistoriadeladescendenciadeun grupodeorganismosapartirdesuancestrocomn Unrbolfilogenticoesundiagramadelareconstruccindeesahistoria

rbolesfilogenticos

Campbelletal.2008

rbolesfilogenticos

Sinescaladetiempolalongitud delasramasmuestratiemposde divergenciarelativos Conescaladetiempo

rbolfilogenticovscladograma

Arbolfilogentico Cadanodorepresentaelancestrocomn mascercanoylalongituddelarama correspondeatiempo

Cladograma Representagrficamenteunproceso evolutivohipottico

Importanciadelosrbolesfilogenticos
Todaslasformasdevidaestnconectadas evolutivamente

Determinados caracteressepuedenseguiralolargodelaevolucin porqueseheredan

(Procesodedescendenciaconmodificaciones)

Caracteres(=caractersticasdelorganismo)puedensermorfolgicas, cromosomales,comportamentales,ecolgicosy/omoleculares

Importanciadelosrbolesfilogenticos
Taxonomosencuentranloscaracteresobservandolospatronesdesimilaridad entreorganismos Culescaracteressirvenparaestudiarlaevolucindelosorganismos?

?
Homologa

?
Homoplasia

Estructurashomlogas/igualfuente/
Cualquiercarcterheredadodeunancestrocomnyqueincluye secuenciasdeADN,estructurasdeprotenas,estructurasanatmicas yalgunospatronescomportamentales
existen

Estructurasancestralesheredadas deunancestrocomn

Estructurasderivadassonaquellasque difierendelaformaancestral

Estructurashomlogas/igualfuente/

Campbelletal.2008

Estructurashomoplsicas
Similaridadnosiemprereflejalapresenciadeunancestrocomn

Vs.
Lasleyesdelafsicaqueoperansobrelosorganismossonlasmismas entonces

Estructurasquecumplenlamismafuncinperotienendiferenteorigen porlotantonoseheredaron Presenciadeunmismocarcteradquiridoindependientemente porevolucinconvergente

Usandoestructurashomoplsicasyhomlogas
Elobjetivodelafilogenticaesencontrar lasestructuras homlogas(heredadasdeunancestroencomn)

Vs.
Ambosson:triploblsticos(trescapasdetejidoembrionario) bilaterales celomados Ambostuvieronunancestrocomntempranoenlaevolucinyluegosesepararon (aprox.650millonesdeaos)origendeprotostomadosydeuterostomados

Construccinderbolesfilogenticos
Pasos:Definirelingroup (grupodeintersquesevaatrabajar) Definireloutgroup (darleunarazalrbolcongrupocercanofilogenticamente) Definirloscaracteresaestudiar(entremasymasvariadosmejor) Definirculescaracteressonancestralesyculesderivados
Taxon Lampreas Peces Salamandras Lagartijas Cocodrilo Paloma Ratn Chimpanc Mandbulas + + + + + + + Pulmones + + + + + + Garras o uas + + + + + Molleja + + Plumas + Pelaje + + Glndulas mamarias + + Escamas queratinosas + + + -

Principiodeparsimonia

JeanSimonBerthlemy(17431811).

Alejandromagno(356323aC) yelnudogordiano

Cuandoconquist Frigiaenel333aC Principiodeparsimonia=Laexplicacinpreferidadelosdatos observadosessiemprelamassimple

Taxon Lampreas Peces Salamandras Lagartijas Cocodrilo Paloma Ratn Chimpanc

Mandbulas + + + + + + +

Pulmones + + + + + +

Garras o uas + + + + +

Molleja + + -

Plumas + -

Pel aje + +

Glndulas mamarias + +

Escamas queratinosas + + + -

Ausencia= estadoancestral (outgroup) Presencia= estadoderivado

Sinapomorfiaparaesteclado Gr.klados =rama Sinapomorfia=carcter derivadocompartidoportodoslos miembrosdeunclado Gr. Synapsis =unidos+morphe =forma

Construccinderbolesfilogenticos

Campbelletal.2008

Construccinderbolesfilogenticos

Construccinderbolesfilogenticos

Campbelletal.2008

Objetivodelafilogentica:
Encontrarlosnivelestaxonmicosapropiadosenloscualescualquiercarcter dadoesunasinapomorfia

Esecarctersinapomrficoidentificaentoncesatodos losmiembrosdeeseclado

Relacionesevolutivasentreorganismos
Parafiltico=grupomonofilticoque excluyealgunosdelosdescendientes Polifiltico=grupoformadopormiembros dedosgruposmonofilticos.Seguramente losindividuostienendosancestrosy lleganalosmismoscaracterespor convergencia Monofiltico=grupodeespecies relacionadasqueformanunclado

Sistemtica:Estudiocientficodeladiversidaddelosorganismos Taxonoma:Teorayprcticadeclasificarorganismos(subdivisindela sistemtica) Filogenia:HiptesispropuestaporunB.Sistemticoquedescribela historiadedescendenciadeungrupodeorganismosdesdesuancestro comn. rbolFilogentico:Esunaformaderetratarlahistoriadedescendencia deungrupodeorganismosdesdesuancestrocomn.