Enzimas

Enzimas
Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular

Especficas para un substrato particular (Estereo especificidad)

COOC-H H-C COO+ N H3+ Fumarato (= ,trans)

COOC-H C-H COO-

Maleato (= ,cis)

Aspartasa
COOH3+N-C-H C-H2 COOL-Aspartato COOH-C- NH3+ C-H2 COOD-Aspartato

Enzimas
Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular

Especficas para un substrato particular (Estereo especificidad)

Aceleran reacciones especficas qumicas(103-10 20) Actan en disolucin acuosa, a pH y temp. ptimos

Enzima Pepsina Tripsina Catalasa Arginasa Fumarasa

pH ptimo 1.5 7.7 7.6 9.7 7.8 7.8

Ribonucleasa

Enzima

Temp. pt. (oC)

Mamferos
Bacterias y algas Bacterias rticas
aprox. aprox.

37
100 0

Bacterias en muestra de hielo antigua

Enzimas
Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular

Especficas para un substrato particular (Estreo especificidad)

Aceleran reacciones especficas qumicas(103-10 20) Actan en disolucin acuosa, a pH y temp. ptimos Son las unidades funcionales del metabolismo celular

Enzimas
Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular

Especficas para un substrato particular (Estreo especificidad)

Aceleran reacciones especficas qumicas(103-10 20) Actan en disolucin acuosa, a pH y temp. ptimos Son las unidades funcionales del metabolismo celular

Reacciones acopladas (catabolismo anabolismo)

Enzimas
Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular

Especficas para un substrato particular (Estreo especificidad)

Aceleran reacciones especficas qumicas(103-10 20) Actan en disolucin acuosa, a pH y temp. ptimos Son las unidades funcionales del metabolismo celular Reacciones acopladas (catabolismo anabolismo) Reguladoras de rutas metablicas (Oligomricas)

Enzima 1800s

(gr).

: fermento

fermentacin del azcar por levaduras

Vitalistas Mecanicistas 1926, James B. Summer 1930s Ureasa

Pepsina Tripsina Quimotripsina Carboxipeptidasa Enzima Amarillo viejo (flavoprotena NADPH)

Medicina

Transaminasas

Industria Qumica Transformacin de Alimentos

Penicilina Fermentaciones Quesos Vinos

Agricultura

Rhyzobium

Estructura globular Hervir con HCl Tripsina Temperatura elevada

pH extremo
Funcionalidad Inactiva

S: PM 250, 0.8 nm

Cofactor
E: PM 100000, 7 nm Inorgnico: Fe2+, Mn2+, Zn2+,etc.

Orgnico: Coenzimas NAD, FAD, CoASH. Grupo Prosttico

Apoenzima

Holoenzima

Enzimas que requieren elementos inorgnicos

Citocromo oxidasa Catalasa, peroxidasa
Citocromo oxidasa DNA polimerasa Anhdrasa carbnica Alcohol deshidrogensa Hexoquinasa Glucosa 6-fosfatasa

Fe2+, Fe+,
Cu2+ Zn2+ Mg2+

Arginasa
Piruvato quinasa Ureasa Nitrato reductasa

Mn2+
K+, Mg2+ Ni2+ Mo2+

Coenzimas: Actan como transportadores eventuales de tomos especficos o de grupos funcionales Coenzimas Entidad transferida Pirofosfato de tiamina . Aldehdos
Dinucletido de flavina y adenina. tomos de hidrgeno
Dinucletido de nicotinamida y de adenina

Ion hidruro (H-) Coenzima A . Grupos acilo

Fosfato de Piridoxal . Grupos amino

5-Desoxicobalamina (Coenzima B12) tomos de H y grupos

alquilo Biocitina . CO2 Tetrahidrofolato . Otros grupos monocarbonados

Coenzimas

Adenosine Triphosphate (ATP)

Coenzyme A (CoA)

Nicotinamide Adenine Dinucleotide (NAD+)

Nicotinamide Adenine Dinucleotide Phosphate (NADP+)

Flavin Adenine Dinucleotide (FAD)

VITAMINAS
C (cido ascrbico) B1 (tiamina) B2 (riboflavina) B3 (cido pantotnico)

FUNCIONES
Coenzima de algunas peptidasas. Interviene en la sntesis de colgeno Coenzima de las descarboxilasas y de las enzima que transfieren grupos aldehdos Constituyente de los coenzimas FAD y FMN Constituyente de la CoA

Enfermedades carenciales
Escorbuto

Beriberi Dermatitis y lesiones en las mucosas Fatiga y trastornos del sueo

B5 (niacina)
B6 (piridoxina) B12 (cobalamina) Biotina

Constituyente de las coenzimas NAD y NADP

Interviene en las reacciones de transferencia de grupos aminos. Coenzima en la transferencia de grupos metilo. Coenzima de las enzimas que transfieren grupos carboxilo, en metabolismo de aminocidos.

Pelagra
Depresin, anemia Anemia perniciosa Fatiga, dermatitis

Substrato Urea Arginina

Enzima Ureasa

Arginasa
Pepsina

Lis, Arg

Tripsina Amilasa Rec A rec A gen

HSP70

Protena de choque trmico

Caract.

Comit de la Unin Internacional de Bioq. y Biol. Mol. (IUBMB)

http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/

http://www.enzyme-database.org/

http://us.expasy.org/enzyme/

EC 1.1.1.2 Accepted alcohol dehydrogenase (NADP ) name: Reaction: an alcohol + NADP = an aldehyde + NADPH + H
+ + + +

Other na aldehyde reductase (NADPH2); NADP-alcohol dehydrogenase; NADP + me(s): aldehyde reductase; NADP -dependent aldehyde reductase; NADPHaldehyde reductase; NADPH-dependent aldehyde reductase; nonspecific succinic semialdehyde reductase; ALR 1; low-Km aldehyde reductase; + high-Km aldehyde reductase; alcohol dehydrogenase (NADP )
+

Systematic name: alcohol:NADP oxidoreductase Comments: A zinc protein. Some members of this group oxidize only primary alcohols; others act also on secondary alcohols. May be identical with EC 1.1.1.19 (L-glucuronate reductase), EC 1.1.1.33 [mevaldate reductase (NADPH)] and EC 1.1.1.55 [lactaldehyde reductase (NADPH)]. A-specific with respect to NADPH. Links to other da BRENDA, ERGO, EXPASY, IUBMB, KEGG, PDB, CAS registry tabases: number: 9028-12-0

Clases de Enzimas:
1. Oxidorreductasas

2. Transferasas
3. Hidrolasas 4. Liasas 5. Isomerasas 6. Ligasas

EC 1.1 Acting on the CH-OH group of donors

EC 1.1.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor EC 1.1.1.1 alcohol dehydrogenase EC 1.1.1.2 alcohol dehydrogenase (NADP+) EC 1.1.1.3 homoserine dehydrogenase EC 1.1.1.4 (R,R)-butanediol dehydrogenase EC 1.1.1.5 acetoin dehydrogenase EC 1.1.1.6 glycerol dehydrogenase EC 1.1.2 With a cytochrome as acceptor EC 1.1.2.1 now EC 1.1.99.5 EC 1.1.2.2 mannitol dehydrogenase (cytochrome) EC 1.1.3 With oxygen as acceptor EC 1.1.3.1 deleted, included in EC 1.1.3.15 EC 1.1.3.2 now EC 1.13.12.4 EC 1.1.3.3 malate oxidase EC 1.1.3.4 glucose oxidase EC 1.1.4 With a disulfide as acceptor EC 1.1.4.1 vitamin-K-epoxide reductase (warfarin-sensitive)

EC 1.1.5 With a quinone or similar compound as acceptor EC 1.1.5.1 Deleted, see EC 1.1.99.18 cellobiose dehydrogenase (acceptor)
EC 1.1.99 With other acceptors EC 1.1.99.1 choline dehydrogenase EC 1.1.99.2 2-hydroxyglutarate dehydrogenase

EC 1.2 Acting on the aldehyde or oxo group of donors

EC 1.2.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor EC 1.2.1.1 deleted, replaced by EC 1.1.1.284 and EC 4.4.1.22 EC 1.2.1.2 formate dehydrogenase EC 1.2.2 With a cytochrome as acceptor EC 1.2.2.1 formate dehydrogenase (cytochrome) EC 1.2.2.2 pyruvate dehydrogenase (cytochrome) EC 1.2.3 With oxygen as acceptor EC 1.2.3.1 aldehyde oxidase

EC 1.3 Acting on the CH-CH group of donors

EC 1.3.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor EC 1.3.1.1 dihydrouracil dehydrogenase (NAD+) EC 1.3.2 With a cytochrome as acceptor EC 1.3.2.1 now EC 1.3.99.2 EC 1.3.2.2 now EC 1.3.99.3 EC 1.3.3 With oxygen as acceptor EC 1.3.3.1 dihydroorotate oxidase EC 1.3.3.2 now EC 1.14.21.6

Clases de Enzimas:
1. Oxidorreductasas

2. Transferasas
3. Hidrolasas 4. Liasas 5. Isomerasas 6. Ligasas

Enzimas:
No.

Clase

Tipo de reaccin que catalizan

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas

Oxidorreductasas De xido reduccin (transferencia de e-)

Reduccin: ganancia de electrones (hidrgeno o prdida de oxgeno) Oxidacin: prdida de electrones (hidrgeno o ganancia de oxgeno). La Oxidacin y la Reduccin son reacciones acopladas (REDOX)

1. Oxido-reductasas ( Reacciones de oxido-reduccin).

Si una molcula se reduce, tiene que haber otra que se oxide

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas

Oxidorreductasas

Transferasas

Transferencia de grupos

Kinasas Transaminasas

2. Transferasas
(Transferencia de grupos funcionales)

grupos aldehdos

gupos acilos
grupos glucosilos grupos fosfatos (kinasas)

Succinato Deshidrogenasa Citocromo c oxidasa.

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas

Oxidorreductasas

Transferasas

Transferencia de grupos

Hidrolasas

Hidrlisis, con transferencia Pirofosfatasa de grupos funcionales del Tripsina agua Aldolasa

3. Hidrolasas (Reacciones de hidrlisis)

Transforman polmeros en monmeros. Actan sobre: enlace ster enlace glucosdico enlace peptdico enlace C-N

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa

Oxidorreductasas

2 3

Transferasas Hidrolasas

Transferencia de grupos Hidrlisis, con transferencia de grupos funcionales del agua

Liasas

Lisis de un substrato, (Sintasas) generando un doble enlace, o Adicin de un substrato a un Descarboxilasa doble enlace de un 2o. pirvica substrato

4. Liasas (Adicin a los dobles enlaces)

Entre C y C
Entre C y O Entre C y N

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa (Sintasas) Descarboxilasa pirvica

Oxidorreductasas

2 3

Transferasas Hidrolasas

Transferencia de grupos Hidrlisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Lisis de un substrato, generando un doble enlace, o Adicin de un substrato a un doble enlace de un 2o. substrato (Sintasa)

Liasas

Isomerasas

Transferencia de grupos en el interior de las molculas para dar formas ismeras

Mutasas Epimerasas Racemasas

5. Isomerasas (Reacciones de isomerizacin)

Enzimas:
No.
1

Clase
Oxidorreductasas

Tipo de reaccin que catalizan

De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa (Sintasas) Descarboxilasa pirvica

2 3

Transferasas Hidrolasas

Transferencia de grupos Hidrlisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Lisis de un substrato, generando un doble enlace, o Adicin de un substrato a un doble enlace de un 2o. substrato (Sintasa)

Liasas

Isomerasas

Transferencia de grupos en el interior de las molculas para dar formas ismeras Formacin de enlaces C-C, C-S, C-O y C-N. Mediante reacciones de condensacin, acopladas a la ruptura del ATP

Mutasas Epimerasas Racemasas Sintetasas

Ligasas

6. Ligasas (Formacin de enlaces, con aporte de ATP)

Entre C y O Entre C y S

Entre C y N
Entre C y C

E + S

SE

E + P

Cmo detectar una enzima?

1. 2. Actuacin global de la reaccin catalizada. Utilizar un procedimiento analtico para la determinacin de S que desaparece o los productos de la reaccin que aparecen. Si la enzima requiere cofactores (ines metlicos o coenzimas). La dependencia de la actividad enzimtica con la [S] o sea KM del S. El pH ptimo.

3.

4.

5.

6.

Un intervalo de temperatura en la que la enzima es estable y muestra actividad elevada.

1.0 Unidad de Actividad Enzimtica

Es la cantidad que transforma 1.0 mM (10-6 M) de S /min a 25oC, en las condiciones de medida ptima.

La Actividad Especfica
Es el no. de U de enzima / mg de protena. Es una medida de la pureza de la enzima.
Catalasa de Aspergillius niger 4000-8000 U/mg de prot. 100 mg $ 209.80 USD. Catalasa de Hgado de bisonte 2000-5000 U/mg de prot. 1 g $ 768.50 USD.

El Nmero de Recambio de una Enzima

Es el no. de molculas de S transformadas / unidad de tiempo, por una molcula de enzima (o por un slo sitio cataltico, cuando la E, es el limitante).

Enzima.
Anhidrasa carbnica b-Amilasa b-Galactosidasa Fosfoglucomutasa

Moles de S, transf./ min. a 20-38 oC. 36 000 000 1 000 000 12 000 1 240