ENZIMAS

Caractersticas Cofactores Tipos de enzimas Mecanismos de catlisis Efecto del pH y la temperatura Cintica Regulacin de la actividad enzimtica

ENZIMAS COMO CATALIZADORES BIOLGICOS

Las enzimas son protenas que: - Aumentan la velocidad de reaccin - No se transforman - Participan en casi todas las reacciones que ocurren en un organismo Son altamente especficas Algunas son estereoespecficas

A + B + E C +D + E
Sustratos Productos

Nomenclatura
1.- Se nombran por su sustrato ms la terminacin asa ejemplo: carboxipeptidasa A 2.- Se nombran por su accin y a continuacin se coloca el nmero de clasificacin ejemplo: peptidil -L-aminocido hidrolasa (EC 3.4.17.1
EC: enzyme commission Nmero es clase, sub clase, sub-sub clase y un nmero arbitrario

Porqu una enzima aumenta la velocidad de una reaccin qumica?

Diagrama del estado de transicin para una reaccin espontnea

Diagrama del estado de transicin para una reaccin espontnea Efecto de un catalizador

Reaccin catalizada por una enzima

Sitio activo

K = Lys D = Asp Q = Gln

Sitio activo de la S-adenosil metionina sintetasa con SAM, PPi, Pi y 2Mg2+.

Modelos de sitio activo

1.- Llave-cerradura

Modelos de sitio activo

2.- Encaje-inducido

Interacciones entre el sustrato y la enzima

No-covalentes

- Interacciones inicas - Dipolo - Puentes de hidrgeno - Apolares

Covalentes - Bases de Schiff

Porqu una enzima disminuye la energa de activacin?

Prdida de entropa en la formacin del complejo ES Desestabilizacin del complejo ES

Enzima

Sustratos

Enzima

Estado de transicin
Enzima

Producto

Cofactores
Son requeridos para convertir una enzima inactiva apoenzimas en la forma activa holoenzimas
Iones esenciales, principalmente iones metlicos Coenzimas, compuestos orgnicos, derivados de las vitaminas Co-enzima o co-factor: no se encuentra unida covalentemente a la enzima Grupos prostticos: se unen covalentemente a la enzima
Sitio activo de la anhidrasa carbnica

Coenzimas: NAD+

Nombre
Nicotidamida adenina dinucleotido

Rol metablico
Reacciones de xidoreduccin

Co-sustrato de
deshidrogenasas

Clasificacin de las enzimas

1.- Oxidoreductasas: Catalizan reacciones de oxido-reduccin

2.- Transferasas: Transfieren un grupo funcional de una molcula a otra

3.- Hidrolasas: Catalizan el rompimiento hidroltico de un enlace

Clasificacin de las enzimas, cont.

4.- Liasas: Catalizan la eliminacin de un grupo generando un doble enlace, la adicin de un grupo a un doble enlace o el rompimiento de un enlace que involucra rearreglo electrnico 5.- Isomerasas: Catalizan cambios geomtricos o estructurales en una molcula

6.- Ligasas: Catalizan la unin de dos molculas acopladas a la hidrlisis de ATP

Mecanismos de catlisis
Covalente Acido/base In metlico Proximidad y orientacin

Triosa fosfato isomerasa

Triosa fosfato isomerasa

Serin-proteasas

Serin-proteasas Quimiotripsina

Mecanismo cataltico de una serin proteasa

Catalytic propensity of residue types

Analysis of Catalytic Residues in Enzyme Active Sites (2002) Gail J. Bartlett, Craig T. Porter, Neera Borkakotiand Janet M. Thornton Journal of Molecular Biology, 324, 105-121

Efecto de la temperatura y el pH
a) Efecto de la temperatura

Efecto del pH en reacciones enzimticas