by dr.

Novi Khila Firani

LAB. BIOKIMIA FK UB

TUJUAN PEMBELAJARAN
1.Menjelaskan sifat-sifat umum enzim 2.Menyebutkan klasifikasi dan tata nama enzim menurut IUB 3.Menjelaskan mekanisme kerja enzim 4.Menjelaskan sifat-sifat kinetik enzim 5.Menjelaskan peranan enzim dalam aspek klinis

REFERENSI
1. Harpers Biochemistry 2. Basic Medical Biochemistry : A Clinical Approach 3. Review of Biochemistry 4. Buku-buku lain yg relevan

WHAT ? HOW ?
ENZIM

WHERE ?

WHY ?

WHEN ?

Lho, buanyaak sekali manfaatnya enzim itu lho nak !!

Bu,buat apa sih belajar Enzim ???

MANFAAT ENZIM

Medis

Industri/Pangan

Diagnosa/Prognosa : GOT-GPT Terapi : Enzymplex

Papain : Pelunak daging Renin : koagulasi susu

ENZIM
SENYAWA ORGANIK-PROTEIN
BIOKATALISATOR

BERSIFAT SPESIFIK
DISINTESA DAN BERFUNGSI DIDALAM TUBUH

HAMPIR SEMUA REAKSI DALAM TUBUH

MAKHLUK HIDUP BERLANGSUNG : PADA SUHU 370 C PADA pH 7,2 - 7,4

SUPER CEPAT
KARENA DIKATALIS OLEH E N Z I M

Biokatalisator :
E + S ES E + P

Spesifik :

* Terhadap satu substrat. mis. Glukokinase a-D-glukosa * Terhadap sekelompok substrat mis. D-asam aminooksidase * Stereospesifik contoh : maltase Ik. Glikosida a

TATA NAMA & KLASIFIKASI

* SINGKAT
* JELAS * TEGAS * INFORMATIF

PTYALIN AMIGDALIN AMILASE

Nama Enzim :
Substrat + ase : urease, lipase Jenis reaksi + ase : dehidrogenase, transferase Substrat dan jenis reaksi + ase : amino-oksidase, malat-dehidrogenase

KLASIFIKASI & TATANAMA ( I.U.B. )

a) DASAR : JENIS REAKSI YG DIKATALIS :
Kelas 1. OKSIDOREDUKTASE Kelas 2. TRANSFERASE Kelas 3. HIDROLASE Kelas 4. LIASE Kelas 5. ISOMERASE Kelas 6. LIGASE

b) NAMA POKOK ENZIM : SUBSTRAT(S) : KELAS-ASE * Malat : NAD oksidoreduktase c) INFORMASI TAMBAHAN : DIBELAKANG NAMA
POKOK DALAM KURUNG

Malat : NAD oksidoreduktase (dekarboksilasi)

Nama Pokok kelas info tambahan

d) UNTUK MENYINGKAT : NOMOR KODE

NOMOR KODE ENZIM

NAMA ENZIM TERDIRI ATAS 4 DIGID > DIGID PERTAMA = KELAS ENZIM

> DIGID KEDUA = SUBKELAS

> DIGID KETIGA = SUB-SUBKELAS > DIGID KEEMPAT = NAMA SPESIFIK

CONTOH : E.C.2.7.1.1
ENZYME CODE

HEKSOKINASE

SUB-SUBKELAS 1 = ALKOHOL (AKSEPTOR)

SUBKELAS 7 = GUGUS FOSFAT (YG DITRANSFER) KELAS 2 = TRANSFERASE

NAMA LENGKAPNYA :
ATP:D-HEKSOSA-6 FOSFOTRANSFERASE (HEKSOKINASE)

REAKSINYA :

ATP + D-HEKSOSA

ADP + D-HEKSOSA-6P

CATATAN : UNTUK MENGETAHUI NAMA KELAS/SUBKELAS/SUB-SUBKELAS LIHAT TABEL IUB

BEBERAPA CONTOH DARI KE 6 KELAS ENZIM : KELAS 1 : OKSIDOREDUKTASE

REAKSI UMUM :
Sred eSoks Sred

Soks

E.C.1.1.1.1=ALKOHOL:NAD OKSIDOREDUKTASE (ALKOHOL DEHIDROGENASE)

ALKOHOL
e-

ALDEHID/KETON NADH + H+

NAD+

KELAS 2 : TRANSFERASE REAKSI UMUM : S1-G S1

G
S2 S2-G

E.C.2.3.1.6 = KOLIN:ASETIL TRANSFERASE ASETIL-KoA ASETIL KOLIN KoA-SH

ASETIL-KOLIN

Macamnya : Kelompok enzim yang memindahkan gugus : 2.1. karbon 2.2. aldehid, keton 2.3. asil (COOH) 2.4. glikosil (R-CHO) 2.5. fosfat 2.6. sulfat

3.Kelas hidrolase S1 S2 + S3

Macamnya : hidrolisa pada ikatan 3.1. ester 3.2. ik glikosidik 3.3. ik peptida 3.4. ik C-N 3.5. asam anhidrida
Contoh : E.C.3.1.1.8. Asil kolin asil hidrolase ( pseudokolin esterase ) Asil kolin + H2O Kolin + Asam

4. Kelas Liase X C Y C X Y + -C = C-

Contoh : E.C.4.2.1.2 L-Malat Hidroliase ( Fumarase ) Malat Fumarat + H 2O

OH
H2C HOOC CH COOH

COOH
C= C

HOOC

COOH

5. Kelas isomerase
E.C.5.1.1.1. Alanin Rasemase L-Alanin D-Alanin

E.C.5.2.1.3. Retinen isomerase Trans retinen 11 sis retinen

6. Kelas Ligase
Macamnya : membentuk ikatan antara : * C-O * C-S * C-N * C-C Contoh :
E.C.6.3.1.2. L-Glutamat : Amonia ligase (ADP) (Glutamin sintetase) ATP + L-Glutamat + NH4+ ADP + L-Glutamin + Ortofosfat

DISKUSI
Kelas enzim apakah yang mengkatalisis reaksi di bawah ini : 1. ATP + D-heksosa ADP + Dheksosa-6- fosfat 2. D-Galaktosida + H2O Alkohol + D-Galaktosa 3. Gliseraldehida-3P + NAD+ 1,3 -Difosfogliserat + NADH + H+ 4. Glukosa 6-fosfat Fruktosa 6fosfat

Bagian Aktif Enzim

Active site Catalytic site Binding site Allosteric site catalytic activity

Active site Active site

STRUKTUR ENZIM

PROTEIN asam-asam amino ikatan peptida labil thd panas

KOENZIM
Kofaktor logam seny. Organik non protein (=KOENZIM) KOENZIM + APOENZIM HOLOENZIM IK : kovalen gugus prostetik non kovalen lemah Koenzim : - senyawa pembawa antara - sebag. besar turunan vit.B

KOENZIM : CARIER
> Hydrogen carier : NAD, NADP, FMN, FAD, koenzim Q > Electron carier : Heme > Pembawa gugusan lain : ATP : fosfat TPP : aldehid Koenzim A : asil

KOENZIM : turunan Vit.B

TPP : Tiamin (B1) NAD : Niasin FAD : Riboflavin (B2) Piridoksal Fosfat : Piridoksin (B6) Koenzim A : asam pantotenat Koenzim folat : asam folat

MEKANISME KERJA ENZIM

1. Fischer : Lock and Key

Enzim + Substrat

Enz- Sub

Lock and key model

Substrat Key (S) Lock (E) Enzyme

2. Daniel Koshland : Induced Fit

Konformasi yg sesuai

Induced Fit

KINETIKA ENZIM
Teori kinetik :

* Antar molekul harus saling membentur. * Mempunyai tenaga untuk melawan enersi penghalang ( Enersi Barier )
me enersi barier

ENZIM

Peran Enzim

FAKTOR-FAKTOR YANG MEMPENGARUHI REAKSI ENZIMATIK

1.Suhu / Temperatur
Protein Protein
K E C SUHU OPTIMUM

Denaturasi Sifat fisik/kimia hilang inaktif

2. Derajat keasaman /pH Enzim Enz+

as /bs

Denaturasi Enz-SH
- + -- ++ - -+++ -- - - ++++ -- -- +++++ - -- +++++ - - +- ++ - ++ -- -- +++++ -- -- +++++
OPT

SH+
+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + ++ + + ++ + + - ++ + + - - ++ + + - - - ++ + +

K E C . R

--------+-++ +
pH ENZ

SH

3. Kadar Substrat dan Enzim :

E + S

K1 K2

E + P

v1 = K1 [E] [S] , v2 = k2 [E] [P] k1 = k2 v1 = v2

Persamaan Michaelis Menten :

V[S] v = ---------------km + [ S ]
v V [S] Km = = = = Kec reaksi enzimatik Kec maksimum Kadar substrat Konstante Michaelis Menten

V 1/2V

Km

[S]

Apabila [ S ] << Km , maka v = K [ S ] Apabila [ S ] >> Km , maka v = V Apabila [ S ] = Km , maka v = V

ES

4. Modifier :

Senyawa yang mampu mempengaruhi aktifitas reaksi enzimatik

4.1. Modifier Positip * = Aktivator * Ion logam : Mn, Mg, Ca * Substrat (glukosa glukokinase) 4.2. Modifier Negatip = inhibitor 4.2.1. Competitive inhibitor 4.2.2. Non Competitive inhibitor * Reversible * Irreversible ( Hg )

Contoh penghambat bersaing : 1. Sulfanilamide : PABA Asam folat Tetra hidrofolat Kerangka 1 atom C anti bakteri 2. Aminopterin dan Ametopterin : Asamfolat Kerangka 1 atom C anti kanker 3. Dicoumarol : Vitamin K Sintesa Protrombin Koagulasi darah anti koagulasi darah

Inhibitor kompetitif

Inhibitor non kompetitif

I
E E P

Inhibitor

Pengendalian reaksi enzimatik :

E + S E + P

1. Substrat :

* Hukum aksi masa * Semi permeable * Hukum aksi masa * Hambatan umpan balik

2. Produk :

3. Enzim : 3.1. Kadar enzim 3.1.1. Kecepatan degradasi : * Enzim proteolitik * Sulit dipengaruhi

3.1.2. Kecepatan Sintesa : Diatur oleh 3 gene : a. Gene Strukturil b. Gene Operator c. Gene Regulator 3.2. Aktivitas enzim 3.2.1. Mengaktivkan zimogen Contoh : pepsinogen pepsin 3.2.2. Melalui modifier Contoh : ion logam aktivator 3.2.3. Melalui modifikasi kovalen * Fosforilasi * Defosforilasi

PRINSIP PENGENDALIAN METABOLISME SAMA DG PENGENDALIAN REAKSI ENZIMATIK

BIASANYA PD REAKSI YG IRREVERSIBLE TUNDUK PD HUKUM AKSI MASSA

FASILITATOR

A A

E B C [E] D E

MEMBRAN SEL

INTRA SEL

Supardan, 2005

PRINSIP PENGENDALIAN METABOLISME SAMA DG PENGENDALIAN REAKSI ENZIMATIK

BIASANYA PD REAKSI YG IRREVERSIBLE TUNDUK PD HUKUM AKSI MASSA

FASILITATOR

E A B C [E] D E

MEMBRAN SEL

Supardan, 2005

PRINSIP PENGENDALIAN METABOLISME SAMA DG PENGENDALIAN REAKSI ENZIMATIK PENGENDALIAN KADAR E & AKTIFITAS E
HORMON
FASILITATOR cAMP/Ca++ PROTEIN KINASE MODIFIER KOENZIM/KOFAKTOR FEED FORWARD +

E B C [E]
TRANSLASI RNA TERKAIT DENGAN EKSPRESI GEN DNA

- FEED BACK

INHIBITION

MEMBRAN SEL

TRANSKRIPSSI

Supardan, 2005

Fungsional plasma enzim : * Normal ada dalam plasma dalam jumlah yang banyak. * Berfungsi dalam plasma. * Disintesa dalam hati. * Tidak dapat digunakan untuk membantu diagnosa.

Contoh :

* * * *

Lipoprotein lipase Pseudokolin esterase Enzim-enzim pembekuan darah Enzim penghancur bekuan darah

Non fungsional plasma enzim : * Tidak berfungsi dalam plasma * Normal ditemukan dalam jumlah yang sedikit dalam plasma. * Membantu menegakkan diagnosa Contoh : * Plasma lipase - Lipoprotein lipase - Lipase pankreas * Plasma amilase - Kel Pankreas dan saliva * Plasma Tripsin - Kel pankreas * Transaminase - GOT dan GPT

Principal serum enzymes used in clinical diagnosis

Serum Enzymes
1.

Major Diagnostic use

1.

2. 3.

Aminotransferase (AST/SGOT), (ALT/SGPT) Amylase Creatin Kinase Laktat Dehidrogenase Lipase Acid Phosphatase Alkali Fosfatase

2. 3.

4. 5. 6. 7.

4. 5. 6.

7.

Myocardiac infarct, Hepatitis viral Acute Pancreatitis Muscle disorder, myocard infarct Myocard infarct Acute pancreatitis Ca Prostat metastase Bone disorder

Isozim : Enzim yang mempunyai sifat fisik sifat kimia dan immunokimia berbeda tetapi mempunyai fungsi yang sama.

Contoh : LDH ( Laktat Dehidrogenase ) * 4 sub unit/protomer Tetramer * 2 tipe : H (Heart) dan M (Muscle) * I 1 : HHHH I 2 : HHHM I 3 : HHMM I 4 : HMMM I 5 : MMMM

Elektroforese LDH

HHHM HMMM MMMMHHMMHHHH

***THE END***