ENZIMAS

Historia.
Luis Pasteur (XIX): "la fermentacin del alcohol es un acto relacionado con la vida y la organizacin de las clulas de las levaduras, y no con la muerte y la putrefaccin de las clulas. Wilhelm Khne (1878): acu el trmino enzima, que viene del griego "en levadura", para describir este proceso. Eduard Buchner (1897): encontr que el azcar era fermentado inclusive cuando no haba elementos vivos en los cultivos de clulas de levaduras.

Las enzimas son protenas??

James B. Sumner (1926): demostr que la enzima ureasa era una protena pura y la cristaliz. Summer hizo lo mismo con la enzima catalasa en 1937.

Caractersticas.
Protenas globulares 62 2500 aa. Estructura tridimensional determinada por aa. Se pueden desnaturalizar.

 Sustrato: molcula sobre la que acta la enzima. Especificidad. Su funcin es la de catalizar reacciones metablicas. Aumentan la velocidad de la reaccin porque disminuyen la energa de activacin.

Cofactores.
Cofactores

Molculas no proticas.

Inorgnicos

Orgnicos

Iones metlicos

Complejos ferrosulfurosos

Grupos prostticos

Coenzimas

Enzimas que requieren cofactor pero no lo tienen unido se llaman apoenzimas; cuando las apoenzimas se unen a uno o varios cofactores se denominan holoenzimas.

 La mayora de los minerales actan como cofactores inorgnicos en reacciones enzimticas. Las coenzimas transportan grupos qumicos de una enzima a otra. Algunos de estos compuestos, como la riboflavina, la tiamina y el cido flico son vitaminas. Los grupos qumicos intercambiados incluyen el ion hidruro (H-) transportado por NAD o NADP+, el grupo fosfato transportado por el ATP, el grupo acetilo transportado por la coenzima A, los grupos formil, metenil o metil transportados por el cido flico y el grupo metil transportado por la S-Adenosil metionina.

Accin enzimtica.
Casi todas las enzimas son mucho ms grandes que los sustratos sobre los que actan, y solo una pequea parte de la enzima (alrededor de 3 a 4 aminocidos) est directamente involucrada en la catlisis, centro activo. Las enzimas tambin pueden contener sitios con la capacidad de unir cofactores, o sustratos o productos (directos o indirectos) de la reaccin catalizada.

Emil Fisher en 1894. Con base a sus resultados dedujo que ambas molculas, enzima y sustrato, poseen complementariedad geomtrica, es decir, sus estructuras encajan exactamente una en la otra, por lo que ha sido denominado como modelo de la "llavecerradura", refirindose a la enzima como a una especie de cerradura y al sustrato como a una llave que encaja de forma perfecta en dicha cerradura.

En 1958 Daniel Koshland sugiere una modificacin al modelo de la llave-cerradura: las enzimas son estructuras bastante flexibles y as el sitio activo podra cambiar su conformacin estructural por la interaccin con el sustrato. Como resultado de ello, la cadena aminoacdica que compone el sitio activo es moldeada en posiciones precisas, lo que permite a la enzima llevar a cabo su funcin cataltica. En algunos casos, como en las glicosidasas, el sustrato cambia ligeramente de forma para entrar en el sitio activo.

Regulacin Enzimtica.
Regular es lograr que la enzima trabaje o que la enzima no trabaje, sin afectar la presencia de la enzima. Se puede regular la actividad de la enzima o la cantidad de la enzima. El mecanismo de regular la cantidad de enzima es ms lento que el mecanismo de regular la actividad de la enzima.

Tipos de Regulacin.
Regulacin alostrica (reversible) Modificacin covalente (reversible) Activacin de zimgenos por protelisis limitada (irreversible) Disponibilidad de sustrato Compartimentalizacin Disponibilidad de cofactor

Mecanismos para regular la actividad enzimtica.

Regulador alostrico.
El regulador alostrico encaja perfecto en el sitio alostrico; es un sitio distinto al sitio activo. El regulador alostrico puede ser un activador o un inhibidor. Es decir, puede ser regulador positivo o negativo. Al unirse el inhibidor y la enzima, se alteran las uniones dbiles de la protena (enzima). Esto provoca un cambio en la conformacin de la protena y altera su funcin.

Cambia la conformacin y por lo tanto baja su afinidad por el sustrato. As, baja la cantidad de producto. Si en lugar de inhibidor es un activador, entonces favorece la afinidad de la enzima porque mejora el sitio activo para el sustrato. Es la inversa del inhibidor.

Tipos de inhibicion.
Competitiva: el inhibidor compite con el sustrato por el mismo sitio activo en la enzima. No competitiva: el inhibidor se coloca cerca del centro activo de la enzima pero no lo utiliza.

Modificacin covalente.
Como ejemplo tenemos la fosforilacin y la desfosforilacin, es decir, la unin o eliminacin de fosfatos. Los mecanismos alostricos son mediante uniones dbiles. Pero en la modificacin covalente se trata de uniones fuertes. Reaccin de fosforilacin: requiere un catalizador. La enzima que cataliza se llama protena quinasa (enzima que fosforila a la otra enzima). Al fosforilarse la enzima cambia su estructura primaria, en el sentido de que uno de sus aminocidos queda unido covalentemente a un fosfato. Sin embargo el cambio no es grande en la estructura primaria, es despreciable. El fosfato tiene carga negativa, cambia la forma de la protena (enzima). Cambia su estructura tridimensional. Esto modifica la actividad de la protena (enzima). Puede activarla o desactivarla. Para revertirlo hace falta una reaccin qumica inversa, la hidrlisis, que se denomina desfosforilar. La enzima que cataliza la desfosforilacin es la enzima fosfatasa (enzima que desfosforila a otra enzima).

Activacin de zimgenos por protelisis limitada.

Los zimgenos son enzimas que se fabrican en forma inactiva. Los zimgenos son precursores de enzimas. Recin trabajan en el momento y lugar en que se necesitan. Se activan por protelisis (rotura de protenas). Al zimgeno se le corta un pequeo fragmento. Protelisis completa brinda aminocidos. La protelisis es limitada, se le quita una pequea porcin de aminocidos. Se cambia la estructura primaria y, eso permite que el sustrato se pueda unir a la enzima.

Disponibilidad de sustrato o de cofactor.

Se trata de fabricar ms enzima o fabricar menos enzima. Hay enzimas constitutivas y enzimas adaptativas. Las enzimas constitutivas son las que estn presentes siempre. Las enzimas adaptativas son las que aparecen solamente cuando se las necesita, son las que estn genticamente reguladas. La mayora de las enzimas son constitutivas.

La cantidad de enzimas en el organismo tambin se puede regular por la velocidad de degradacin de la enzima. Es decir, la velocidad, a la que la enzima se degrada, su vida media.

Compartimentalizacin.
Imaginemos que dentro de la mitocondria hay una ruta metablica. El sustrato entonces deber entrar a la mitocondria para unirse a las enzimas. Es decir que el sustrato y la enzima estn en distintos compartimentos (de la clula). Este tipo de regulacin se denomina compartimentalizacin.

Clasificacin.
Nombre: Por el sustrato (lactasa lactosa) Por la reaccin qumica catalizada polimerasa polimeriza el ADN) Ambas con el sufijo asa. La Unin Internacional de Bioqumica y Biologa Molecular creo nomenclatura para identificar a las enzimas basada en Nmeros EC. (Enzime commission numbers). (ADN

Clasificacin EC depende del mecanismo de accin.

Grupo 1. Oxidoreductasas EC 1 Accion Catalizan reacciones de oxidorreduccin. Tras la accin catlica quedan modificados en su grado de oxidacin por lo que debe ser transformados antes de volver a actuar de nuevo. Transfieren grupos activos (obtenidos de la ruptura de ciertas molculas) a otras sustancias receptoras. Suelen actuar en procesos de interconversiones de azucares, de aminocidos, etc Verifican reacciones de hidrlisis con la consiguiente obtencin de monmeros a partir de polmeros. Suele ser de tipo digestivo, por lo que normalmente actan en primer lugar. Actan sobre determinadas molculas obteniendo de ellas sus ismeros de funcin o de posicin. Suelen actuar en procesos de interconversion Realizan la degradacin o sntesis (entonces se llaman sintetasas) de los enlaces denominados fuertes sin ir acoplados a sustancias de alto valor energtico. Realizan la degradacin o sntesis de los enlaces fuertes mediante el acoplamiento a sustancias ricas en energa como los nucleosidos del ATP ejemplos Dehidrogenasas Aminooxidasa Deaminasas Catalasas Transaldolasas Transcetolasas Transaminasas Glucosidasas Lipasas Peptidasas Esterasas Fosfatasas Isomerasas de azcar Epimerasas Mutasas Aldolasas Decarboxilasas Carboxilasas Peptidosintetasas

2. Transferasas EC 2 3. Hidrolasas EC 3

4. Isomerasas EC 4 5. Liasas EC 5 6. Ligasas EC 6

Factores que modifican la accin enzimtica.

Efecto de la temperatura : Un aumento en la temperatura provoca un aumento de la velocidad de reaccin hasta cierta temperatura ptima, ya que despus de aproximadamente 45 C se comienza a producir la desnaturalizacin trmica.

Cuando mayor es la temperatura, mayor es la velocidad de reaccin.

Factores que modifican la accin enzimtica.

Concentracin de sustrato: Al principio un aumento de la concentracin de sustrato produce un aumento rpido de la velocidad de reaccin, pero si se sigue aumentando la concentracin de sustrato, la velocidad de reaccin comienza a disminuir; vemos que a muy altas concentraciones de sustrato se observa que no cambia la velocidad de reaccin, se dice que los centros activos de la enzima se encuentran saturados.

Factores que modifican la accin enzimtica.

Efecto del pH: El pH no afecta la actividad enzimtica directamente sino que modifica la concentracin de protones. Los protones adems de alterar la estructura de la enzima y el substrato, pueden participar tambin en la reaccin como substrato o producto. En esos casos, la concentracin de protones afecta directamente la velocidad de la reaccin. Cualquier cambio brusco de pH, sabiendo que las enzimas son protenas, puede alterar el carcter inico de los grupos amino y carboxilo en la superficie proteica, afectando as las propiedades catalticas de una enzima. A pH alto o bajo se puede producir la desnaturalizacin de la enzima y en consecuencia su inactivacin.