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AMINOACIDOS Y PROTEINAS

DR. GEAN CARLOS ARTEAGA ARROYO

1
COMPETENCIA DESARROLLAR
Diferencia los aminoácidos por las características de sus cadenas
laterales y conoce las interacciones covalentes y no covalentes que
pueden establecer con otros grupos funcionales.

Comprender la importancia biomédica de los péptidos.

Reconocer los niveles estructurales de las proteínas y la


importancia biomédica como moléculas importantes para los seres
vivos.

2
AMINOACIDOS
Los aminoácidos son un grupo heterogéneo de moléculas que poseen unas características
estructurales y funcionales comunes.

Existen veinte aminoácidos diferentes especificados en el código genético, aunque hay


otros aminoácidos menos frecuentes que se forman por modificaciones enzimáticas
posteriores al proceso de traducción.

En las células, estos veinte aminoácidos se unen mediante enlaces covalentes formando
largas cadenas de combinaciones específicas que producen un gran número de proteínas
diferentes.

El tamaño puede ser muy variado, desde péptidos formados por un número pequeño de
aminoácidos hasta polímeros de una elevadísima masa molecular.

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Características estructurales comunes
Los aminoácidos tienen en común la existencia de un átomo de carbono (llamado
carbono a) al que se unen los siguientes grupos funcionales: un grupo carboxilo (—
COOH), un grupo amino (— NH2) y un átomo de hidrógeno.

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Fórmula general

• Carbono α, es un carbono quiral por lo tanto hay


enantiomeros (isomeros ópticos).
5
Aminoácidos
Un poco de historia

El primer aminoácido descubierto en las proteínas fue la asparragina en 1806 y el


último de los 20 aminoácidos en identificarse fue la treonina en 1938.
Casi todos los nombres comunes de los aminoácidos provienen de la fuente a
partir del cual se aislaron inicialmente: la asparragina se encontró por primera vez
en el espárrago, el ácido glutámico en el gluten del trigo o la tirosina en el queso
(tyros en griego significa queso). Además del nombre común todos los
aminoácidos tienen un código de 3 letras (leu, tyr, asn, glu…) y otro de una sóla
letra (G, N, E…)

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Configuración:
• Hay dos tipos:
• d: dextrarotatorio
• L:levorotatorio

• Rotan la luz polarizada a la


derecha y a la izquierda
respectivamente.

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• La mayoria de los aminoacidos con actividad biológica son los
del tipo “l” (forman parte de las proteínas).

• Existen algunos casos de aa del tipo “d” con actividad


biológica, los cuela se han encontrado en vertebrados
superiores, invertebrados y bacterias.

Figura: Imágenes especulares de la alanina

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La configuración (L) de los aminoácidos.

Casi todos los aminoácidos naturales tienen configuración (S), con estereoquímica
parecida a la del L-(-)-gliceraldehído, por lo que se denominan L-aminoácidos.
Excepto la glicina, todos los α aminoácidos son quirales. El centro quiral es el
átomo de carbono asimétrico α.

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Clasificación de aminoácidos
Hidrófobos

Hidrófilos
Según la polaridad
del radical
Ácidos

Básicos

Aminoácidos
Ácidos

Alifáticos Básicos

Según la estructura
Aromáticos Neutros
del radical

Heterocíclicos

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Clasificación de aminoácidos

1. Aminoácidos alifáticos. Son los aminoácidos en los que el radical R


es una cadena hidrocarbonada abierta, que puede tener, además,
grupos —COOH y —NH2. Los aminoácidos alifáticos se clasifican en
neutros, ácidos y básicos.
1. Neutros. Si el radical R no posee grupos carboxilo ni amino.
2. Ácidos. Si el radical R presenta grupos carboxilo, pero no
amino.
3. Básicos. Si el radical R tiene grupos amino, pero no grupos
carboxilo
2. Aminoácidos aromáticos. Son aquellos cuyo radical R es una cadena
cerrada, generalmente relacionada con el benceno.
3. Aminoácidos heterocíclicos. Aquellos cuyo radical R es una cadena
cerrada, generalmente compleja y con algunos átomos distintos del
carbono y del hidrógeno.

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13
Clasificación de los aminoácidos

14
Clasificación de los aminoácidos

15
Clasificación de los aminoácidos

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No polares

Polares

Ácidos Básico

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2. Clasificación de los aminoácidos
Nombre Abreviación Estructura Nombre Abreviación Estructura
Aminoácidos con extremos de cadenas non polares Prolina Pro(P) O

O
Glicina Gly(G) N
H2N H OH
OH fenilalanina Phe (F) O

O
Alanina Ala (A)
NH OH
2

NH OH
2
O Triptófano Trp(w) H2N
OH
Valina Val(V) HN

OH O

NH2 O
Leucina Leu(L)
OH Aminoácidos con extremos de cadenas polares pero no
ionizados
NH2
O O
Isoleucina Ile(I) Asparagina Asn(N)
H2N
OH OH

NH2 O NH2
O
Metionina Met(M) O O
S
Glutamina Gln (Q)
OH
H2N OH
NH2
NH2
2-Clasificación de los aminoácidos
Nombre Abreviación Estructura Nombre Abreviación Estructura
O
Aminoácidos con extremos de cadena polares pero no Cisteína Cys(C)
ionizados
O HS OH

Serina Ser (S)


NH2

HO OH Aminoácidos con extremos de cadena básicos


O

OH
NH2
O
Lisina Lys(K)
Treonina Thr(T) H2N
OH

OH NH2

NH2
Arginina Arg (R) NH O

Aminoácidos con extremos de cadenas ácidos H2N N


H
OH
O
NH2
Ácido Asp(D) O

apártico
HO Histidina His (H
OH N
OH
O NH2
O O
Ácido Glu (E) HN
NH2

glutámico
HO OH

NH2
O
Tirosina Tyr(Y)
OH

NH2
HO
20
Aminoácidos Esenciales

• Son aquellos que los organismos


heterótrofos deben tomar de su • EN ADULTOS: 8
dieta ya que no pueden – Fenilalanina
sintetizarlos en su cuerpo (los – Isoleucina
autótrofos pueden sintetizarlos – Leucina
todos) – Lisina
– Metionina
• Las rutas metabólicas para su – Treonina
obtención suelen ser largas y – Triptófano
energéticamente costosas, por lo – Valina
que los vertebrados las han ido
perdiendo a lo largo de la evolución
(resulta menos costoso obtenerlos • EN NIÑOS los anteriores y:
en los alimentos). – Arginina
– Histidina

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Propiedades de los aminoácidos

1. Los aminoácidos son compuestos


sólidos.
2. compuestos cristalinos
3. Presentan un elevado punto de
fusión.
4. Son solubles en agua.
5. Tienen actividad óptica

6. Presentan un comportamiento químico anfótero. Esto se debe a que a


pH=7 presentan una ionización dipolar, llamada zwitterion, que
permanece en equilibrio con la forma no iónica. Este estado varía con
el pH. A pH alcalino, el grupo carboxilo está ionizado (-COO-) y el
grupo amino no. A pH ácido, el grupo amino está ionizado (NH3+) y el
grupo carboxilo no.

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Formación zwitterión.

 A pesar de que generalmente los


aminoácidos se escriben con un
grupo carboxílico (-COOH) y un
grupo amino (-NH2), su estructura
real es iónica y depende del pH.
 El grupo carboxílico pierde un
protón, dando lugar a un ión
carboxilato, y el grupo amino se
protona y da lugar a un ión
amonio. A esta estructura se le
denomina ión dipolar o zwitterión.

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4. Propiedades
- Los aminoácidos son sustancias mucho más polares de lo que uno esperaría de
acuerdo con su fórmula molecular.
- Las propiedades que presentan, sólidos cristalinos solubles en agua, se atribuyen al
hecho de que la forma estable es un zwitterión o sal interna.
O O

H2N CH C OH H3N CH C O

R R

Formas zwitteriónicas de un aminoácido

- Los aminoácidos son anfóteros, contienen un grupo ácido y uno básico.


O O O
-H+ -H+
H3N CH C OH H3N CH C O H2N CH C O
+H+ +H+
R R R

Zwitterión
Especie presente Especie presente Especie presente
en medio ácido en medio neutro en medio básico
O 4. Propiedades O O
-H+ -H+
H3N CH C OH H3N CH C O H2N CH C O
+H+ +H+
R R R
a b c

Curva de valoración de la glicina.


- Valores de pH menores que pKa1: la especie a es la mayoritaria.
- Valores entre pKa1 y pKa :la principal especie es el zwitterión (b). La concentración
del zwitterión es máxima en el punto isoeléctrico pI.
- Valores superiores a pKa2: la especie c es la presente en mayor concentración.
4. Propiedades
-La glicina se caracteriza por dos pKa: uno corresponde a la posición más ácida
(pKa1) y el otro a la menos ácida (pKa2). Otros aminoácidos con cadenas laterales
neutras presentan valores de pKa similares a los de la glicina.
- El punto isoeléctrico pI corresponde al valor de pH para el cual el aminoácido no
tiene carga neta, corresponde a un máximo en la concentración del zwitterión.
Aminoácido pKa1 pKa2 pI

Glicina 2.34 9.60 5.97


Alanina 2.34 9.69 6.00
Valina 2.32 9,62 5.96
Leucina 2.36 9,60 5.98
Isoleucina 2.36 9,60 6.02
Metionina 2.28 9,21 5.74
Prolina 1.99 10.60 6.30
fenilalanina 1.83 9,13 5.48
Triptofan 2.83 9,39 5.89
Asparagina 2.02 8,80 5.41
Glutamina 2.17 9,13 5.65
Serina 2.21 9,15 5.68
Treonina 2.09 9,10 5.60

pKa1:ionización del grupo carboxílico; pKa2: deprotonación del ión amonio


4. Propiedades
- Aquellos aminoácidos que poseen cadenas laterales que contienen grupos ácidos o
básicos se caracterizan mediante tres valores de pKa. El valor del pKa extra (puede
ser pKa2 o pKa3) refleja la naturaleza de la función presente en la cadena lateral.
- Los puntos isoeléctricos de estos aminoácidos se encuentran a medio camino entre
los valores de los pKa del monocatión y del monoanión.
Aminoácido pka1 pKa2 pKa3 pI

Ácido Aspártico 1.88 3.65 9.60 2.77

Ácido Glutámico 2.19 4.25 9.67 3.22

Tirosina 2.20 9.11 10.07 5.66

Cisteína 1.96 8.18 10.28 5.07

Lisina 2.18 8.95 10.53 9.74

Arginina 2.17 9.04 12.48 10.76

Histidina 1.82 6.00 9.17 7.59

- Las propiedades ácido-base de la cadena lateral de los aminoácidos son


importantes tanto para las propiedades de las proteínas que los contienen como
para el análisis de mezclas de aminoácidos que pueden ser separados en base a su
capacidad para dar o aceptar protones.
Curva de valoración de la glicina

El pH controla la carga de la
glicina: catiónica por debajo
de pH = 2.3; aniónica por
encima de pH = 9.6 y
zwitteriónica entre pH = 2.3
y 9.6. El pH isoeléctrico es
6.0.

El punto isoeléctrico es el
pH al que el aminoácido se
encuentra en equilibrio
entre las dos formas, como
el zwitterión dipolar con
una carga neta de cero.

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EL ENLACE PEPTÍDICO
El enlace peptídico es la unidad primaria estructural de las cadenas polipeptídicas.
Los aminoácidos se unen en secuencias lineales durante la síntesis de proteínas
mediante una reacción de condensación entre el grupo carboxilo de un aminoácido
y el grupo amino del siguiente, que produce la formación de un enlace amida (Fig.
4-17). Los aminoácidos incorporados en la cadena polipeptídica se denominan
residuos por la pérdida de agua que se produce en la reacción.

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Unión Peptídica entre Aminoácidos

Unión Peptídica
H H
O
H O H O
= N N =

=
N C CC C C

H OH H OH
H
R R

+ H2O CONDENSACIÓN

Los aminoácidos se unen entre sí mediante uniones peptídicas para formar


cadenas lineales no ramificadas.
31
32
Péptidos

Los aminoácidos están unidos mediante "enlaces amida" denominados enlaces


peptídicos.

33
enlace peptídico
• el enlace peptídico es
esencialmente plano

• Carácter parcial de
doble enlace

• el enlace peptídico no tiene carga


• casi todos los enlaces en las proteínas son trans
cadena polipéptidica

por convenio: el extremo amino terminal se considera que es el


comienzo de la cadena polipeptídica
cadena polipeptídica
consta de una cadena principal o esqueleto (en negro) y una
parte variable constituida por las cadenas laterales
características

 esqueleto: capaz de formar puentes de hidrógeno

 pequeño número de aa  péptido


 más de 50 aa  proteína
mayor proteína conocida: la titina con 27000 aa
Péptidos importantes

Hay muchos péptidos que tienen actividades biológicas importantes:


• Hormonas (oxitocina, insulina, glucagón…)
• Antiinflamotorios (bradiquinina)

37
Hormona humana bradiquinina.

Hormona humana bradiquinina es un nonapéptido con un


grupo -NH3+ en el extremo N terminal y un -COO- libre en el
extremo C terminal.

Un péptido es un polímero de aminoácidos unidos por


enlaces amido entre el grupo amino de cada aminoácido y el
grupo carboxilo del aminoácido vecino.

38
Oxitocina humana.

La oxitocina es
un nonapéptido
con dos residuos
de cisteína (en las
posiciones 1 y 16)
que unen parte
de la molécula
formando un
gran anillo

39
40
Insulina

La insulina está formada por dos cadenas peptídicas separadas, la cadena A


contiene 21 residuos de aminoácidos y la cadena B que contiene 30.

41
Proteínas
Las proteínas se pueden definir como polímeros formados por la unión, mediante
enlaces peptídicos, de unidades de menor masa molecular
llamadas aminoácidos.
Son moléculas muy complejas. Su masa molecular es muy elevada,
normalmente está comprendida entre 6000 da y 106 da, son macromoléculas. 
Las proteínas son las  moléculas orgánicas más abundantes en las células, más
del 50% del peso seco de la célula son proteínas.  Están constituidas,
fundamentalmente, por C, H, O y N y casi todas tienen también azufre. Algunas
tienen, además, otros elementos químicos y en particular: P, Fe, Zn o Cu. El
elemento más característico de las proteínas es el nitrógeno. Son los
compuestos nitrogenados por excelencia de los seres vivos.
Las proteínas son moléculas específicas que marcan la individualidad de cada
ser vivo. Son además de una gran importancia porque a través de ellas se va a
expresar la información genética, de hecho el dogma central de la genética
molecular nos dice:
 
                                             DNA→ RNA → Proteína
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Uniones disulfuro.

La cistina, dímero de la cisteína, se obtiene cuando dos residuos de cisteína se


oxidan y forman un puente disulfuro.

La oxidación suave enlaza dos moléculas de un tiol para formar un puente


disulfuro.
43
Enlace peptídico
1. En un enlace peptídico, los átomos del grupo carboxilo y del grupo
amino se sitúan en un mismo plano, con distancias y ángulos fijos.

2. Los grupos de aminoácidos unidos por este enlace se denominan


residuos para resaltar la pérdida de una molécula de agua en cada
enlace.

3. El amino libre de un extremo y el carboxilo libre del otro extremo de la


cadena reciben el nombre de N-terminal y C-terminal respectivamente.
Por convenio, los aminoácidos se numeran desde el N-terminal.

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Enlace peptídico
4. El enlace peptídico tiene un comportamiento similar al de un enlace
doble, es decir, presenta una cierta rigidez que inmoviliza en un plano
los átomos que lo forman.

5. Además es un enlace más corto que otros enlaces C-N. Esto le impide
girar libremente, los únicos enlaces que pueden girar son los Cα-C y los
Cα-N que no corresponden al enlace peptídico.

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Péptidos y oligopéptidos de interés biológico

Existen algunos péptidos cortos con función biológica.

Entre ellos podemos citar:

• El tripéptido glutatión (que actúa como


transportador de hidrógeno en algunas reacciones
metabólicas).

• Los nanopéptidos oxitocina y vasopresina (con


actividad hormonal), la insulina y el glucagón que
regulan la concentración de glucosa en sangre.

• Los decapéptidos tirocidina, gramicidina y


valinomicina (antibióticos).

46
Estructura de una
Proteína?

47
Estructura de las proteínas

La organización de una proteína viene definida por cuatro niveles


estructurales ( o cuatro niveles de organización) denominados:

1. ESTRUCTURA PRIMARIA
2. ESTRUCTURA SECUNDARIA
3. ESTRUCTURA TERCIARIA
4. ESTRUCTURA CUATERNARIA

Cada una de estas estructuras informa de la disposición de la anterior en


el espacio.

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Estructura primaria

La estructura primaria es la secuencia de aminoácidos de la proteína.

Nos indica qué aminoácidos componen la cadena polipeptídica y el orden


en que dichos aminoácidos se encuentran.

La secuencia de una proteína se escribe enumerando los aminoácidos


desde el extremo N-terminal hasta el C-terminal.

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Estructura primaria: secuencia

 Dalton: equivale a una unidad de masa


atómica (casi igual a la del H)
 kilodalton (kd o kDa) equivale a 1000 daltons
 Ej: proteína de 50000 g/mol = 50000 daltons =
50 kDa.

 Cada proteína tiene una secuencia de aa


única y definida con
Secuencia de aa deprecisión
la insulina bovina
Estructura primaria: secuencia
importante conocer la secuencia de aa (estructura primaria) por:

1.- esencial para averiguar su mecanismo de acción


2.- determinan sus estructuras tridimensionales
3.- factor importante de la patología molecular
4.- revela mucho sobre su historia evolutiva
Estructura primaria: secuencia
libertad de giro alrededor de los enlaces de un polipéptido

 permite a las proteínas plegarse de formas muy diversas


estos giros se concretan en los llamados ángulos de torsión
Estructura primaria

La función de una proteína depende de su secuencia de aminoácidos y


de la forma que ésta adopte. El cambio de un solo aa de la secuencia de
la proteína puede tener efectos muy importantes, como el cambio de un
solo aa en la hemoglobina humana que provoca la anemia falciforme.

53
Estructura primaria

54
Serina Glicina Tirosina Alanina Leucina
Estructura primaria

55
Estructura secundaria

La estructura secundaria es la disposición de la secuencia de


aminoácidos o estructura primaria en el espacio.

Los aminoácidos, a medida que van siendo enlazados durante la


síntesis de las proteínas, y gracias a la capacidad de giro de sus
enlaces, adquieren una disposición espacial estable, la estructura
secundaria.

Son conocidos tres tipos de estructura secundaria: la α-hélice, la hélice


de colágeno y la conformación β o lámina plegada β. La estructura
secundaria de la cadena polipeptídica depende de los aminoácidos que
la forman.

56
Estructura secundaria

• Las interacciones no covalentes entre los restos laterales de los aminoácidos dan origen a la estructura
secundaria.

• Esta conformación viene dada por puentes de hidrógeno intercatenarios.

• La estructura secundaria puede ser:


– Conformación ɑ (Hélice)
– Conformación β (Hoja plegada)

• Si bien las conformaciones anteriores son las más usuales, existen otras menos frecuentes.

• Existen sectores de los polipéptidos cuya estructura no está bien definida: los enroscamientos aleatorios o
“ad-random”.

Conformación β

Conformación ɑ
57
1.4. Estructura secundaria
¿Se puede plegar una cadena polipeptídica en una estructura regular repetitiva?
1951 Linus Pauling y Robert Corey propusieron la hélice  y la hoja plegada .

Hélice 

• estructura de forma helicoidal que se genera por la torsión uniforme de la


cadena polipeptídica
• está estabilizada por puentes de H entre los grupos NH y CO de la cadena
principal
http://www.youtube.com/watch?v=_YWpAI1LOKk
1.4. Estructura secundaria
• El sentido de giro de una hélice puede ser
dextrógiro (sentido de las agujas del reloj) o
levógiro (contrario)

más favorecidas las hélices


dextrógiras

la -hélice es
“right-handed”
1.4. Estructura secundaria
vista esquemática de las hélices 

esferas y
cintas cilindros
varillas
la prolina actúa como rompedora de hélices  (el grupo amino está
integrado en un anillo de 5 átomos)
1.4. Estructura secundaria
Hoja (o lámina) plegada 
• formada por dos o más cadenas polipeptídicas, llamadas hebras 
• se estabilizan por puentes de H entre las hebras o cadenas
• interaccionan diferentes secciones que no necesariamente van seguidas
• los grupos NH y CO de cada aa están unidos a un grupo CO y NH situados en
la cadena adyacente
1.4. Estructura secundaria
hoja  antiparalela: si interaccionan en sentidos opuestos

hoja  paralela: si interaccionan en el mismo sentido


Conformación-β

ANTIPARALELA

PARALELA

63
1.4. Estructura secundaria
vista esquemática de las hojas 

esferas y
varillas

cintas
cintas 90º
1.4. Estructura secundaria
superhélice (2 hélices  dextrógiras enrolladas)

uniones: interacciones débiles como Van der Waals y enlaces iónicos


héptada repetitiva
Ejemplo: -queratina (en el cabello y la lana)
1.4. Estructura secundaria
cable superhelicoidal o soga (3 hebras enrolladas)

uniones: puentes de H entre las hebras


se repite la triada: Glycina – Prolina -Hidroxiprolina

Ejemplo: colágeno (en la piel, huesos, tendones, cartílagos, dientes)


Hélice de colágeno

• El colágeno posee una disposición


en hélice especial, mas alargada
que la α-hélice, debido a la
abundancia de prolina e
hidroxiprolina.

• Estos aa poseen una estructura


que dificulta la formación de
enlaces de hidrógeno, por lo que
se forma una hélice más
extendida, con sólo tres
aminoácidos por vuelta.

67
Hélice de colágeno

• Su estabilidad viene dada por la asociación de tres


hélices empaquetadas, para formar la triple hélice o
superhélice que es la responsable de la gran fuerza de
tensión del colágeno.

• Las tres hélices se unen mediante enlaces covalentes y


enlaces débiles de tipo puente de hidrógeno. Las
maromas y cables se construyen de forma semejante a
esta triple hélice.

• Hay algunas alteraciones


del colágeno que provocan
síndromes como el de el
hombre de goma o el
síndrome de Marfán que
padecía Paganini y que
explicaba sus dedos largos
e hiperextensibles

68
Hélice de colágeno

69
Conformación-β
Características de la Hoja plegada (beta-lamina):
 
• Los grupos C=O y N-H de los enlaces peptídicos de cadenas
adyacentes (o de segmentos adyacentes de una misma cadena) están
en el mismo plano apuntando uno hacia el otro, de tal forma que se
hace posible el enlace de hidrogeno entre ellos.

• Los puentes de hidrogeno son mas o menos perpendiculares al eje


principal de la estructura en hoja plegada.

• Todos los grupos R en cada una de las cadenas alternan, primero arriba
del eje de la lamina, después abajo del mismo, y así sucesivamente.

70
Conformación-β

• Muchas proteínas globulares presentan segmentos con conformación β


alternados con segmentos de estructura en α-hélice.
• En general, las proteínas que se quedan en la estructura secundaria, dan lugar a
proteínas filamentosas alargadas.
• Son insolubles en agua y soluciones salinas y realizan funciones esqueléticas.
• Las más conocidas son la α-queratina del pelo, plumas, uñas, cuernos, etc, la
fibroína del hilo de seda y de las telarañas, y la elastina del tejido conjuntivo, que
forma una red deformable por la tensión.

71
Estructura terciaria
• La conformación terciaria de una proteína
globular es la conformación tridimensional
del polipéptido plegado.

• Las interacciones que intervienen en el


plegamiento de la estructura secundaria son:
• Interacciones hidrofóbicas entre
restos laterales no polares.
• Uniones de Van der Waals.
• Puentes de Hidrógeno.
• Interacciones salinas.
• Puentes Disulfuro.

• Las funciones de las proteínas dependen del


plegamiento particular que adopten.

• Esta estructura está altamente influenciada


por la estructura primaria.

72
Estructura terciaria

• Es disposición espacial de la estructura secundaria de un polipéptido al plegarse


sobre sí misma originando una conformación globular.

• La conformación globular en las proteínas facilita su solubilidad en agua y en


disoluciones salinas. Esto les permite realizar funciones de transporte, enzimáticas,
hormonales, etc

• Las conformaciones globulares se mantienen estables por la existencia de enlaces


entre los radicales R de los aminoácidos.

Lámina β

Hélice α

73
Residuos Residuos
hidrofóbicos polares

74
Enlaces de hidrógeno en estructura terciaria
H
CH2 HO CH2 Y
Aceptores
N H
HN HO CH S,T
R
Donadores
H
H N CH2 K
H
C,M CH2 S H
R H
N NH R
H C
NH2+
O H
E,G,N,Q C H O
R N C N,Q
H

75
Enlaces salinos o iónicos en estructura terciaria

K
CH2 NH3

R D,E
CH2 NH NH2
C OOC CH2
NH2
H
CH2
NH

HN

76
Enlaces covalentes en estructura terciaria: disulfuro

77
Enlaces covalentes en estructura terciaria: amida

H H N
H N
C O
D,E N
K
C
O C
O N H
N H
O C
R
R
C O
H N
H N
C O
R

78
Interacciones que intervienen
en el plegamiento de la
estructura terciaria

79
1.5. Estructura terciaria y
• cuaternaria
la estructura cuaternaria corresponde a la asociación de cadenas
polipeptídicas o subunidades, cada una de ellas con su estructura
terciaria
• se mantiene por enlaces entre los radicales de cadenas diferentes
• la forma más simple es un dímero (2 subunidades idénticas)

proteína de unión a DNA, Cro


(dímero)

hemoglobina humana
(tetrámero: )
• En los tramos rectos, la cadena polipeptídica posee estructura
secundaria de tipo α-hélice o β-lámina

• En los codos o giros presenta secuencias sin estructura precisa.

• Existen combinaciones estables, compactas y de aspecto globular de α-


hélice y conformación-β que aparecen repetidamente en proteínas
distintas.

• Reciben el nombre de dominios estructurales y cada dominio se pliega


y se desnaturaliza casi independientemente de los demás.

• Evolutivamente, se considera que los dominios estructurales han servido


como unidades modulares para constituir diferentes tipos de proteínas
globulares.

• Los distintos dominios suelen estar unidos por zonas estrechas o


«cuellos», lo que posibilita un cierto movimiento rotacional. Así, al
separarse dos dominios, permiten la introducción de la molécula de
sustrato y, al acercarse, la fijan para actuar sobre ella.
81
Funciones de los Dominios:

A menudo un dominio realiza una función especifica y separada para la proteína:

 - Enlaza a un pequeño ligando


 - “Atravesar” la membrana plasmática
 - Contiene el sitio catalítico (enzimas)
 - Enlazar al DNA (en factores de transcripción)
 - Provee una superficie para enlazarse
específicamente a otra proteína.

82
Estructura cuaternaria

1. La estructura cuaternaria es la unión mediante


enlaces débiles (no covalentes) de varias cadenas
polipeptídicas con estructura terciana, idénticas o
no, para formar un complejo proteico.
2. Cada una de estas cadenas polipeptídicas recibe
el nombre de protómero (subunidad o monómero)
3. Según el número de protómeros que se asocian.
las proteínas que tienen estructura cuaternaria se
denominan:
• Dímeros, como la hexoquinasa.
• tetrámero como la hemoglobina.
• Pentámeros, como la ARN-polimerasa.
• Polímeros, cuando en su composición
intervienen gran número de protómeros.
(cápsida del virus de la poliomielitis, que
consta de 60 subunidades proteicas, los
filamentos de actina y miosina de las células
musculares, etc).

83
Estructura cuaternaria

• Las interacciones que estabilizan esta


estructura son en general uniones débiles:

• Interacciones hidrofóbicas.
• Puentes de hidrógeno.
• Interacciones salinas.
• Fuerza de Van der Waals.
• En algunas ocasiones puede haber enlaces
fuertes tipo puentes disulfuro, en el caso
de las inmunoglobulinas.

84
85
El uso de subunidades menores para construir grandes estructuras
presenta varias ventajas:

• Reduce la cantidad de información genética necesaria.

• El ensamblaje y la disgregación se controlan fácilmente, ya que las


subunidades se asocian por enlaces débiles.

• Los mecanismos de corrección pueden excluir durante el ensamblaje las


subunidades defectuosas, con lo que disminuyen los errores en la
síntesis de la estructura.

Se pueden distinguir dentro de las estructuras cuaternarias dos tipos:

• Homotípicas: Las cadenas polipeptídicas son idénticas o casi idénticas.

• Heterotípicas: Las subunidades poseen estructuras muy diferentes.

86
En resumen, la estructura de una proteína.

Primaria Secundaria Terciaria Cuaternaria

Combinación Hélice Globular Subunidades iguales


ilimitada de
aminoácidos. Hoja Plegada Fibrosa Subunidades distintas

Puente de Hidrógeno,
Unión Puente de Interacciones hidrofóbicas, Fuerzas diversas no
Peptídica Hidrógeno salinas, electrostáticas. covalentes.

Secuencia Conformación Asociación


87
PROPIEDADES DE LAS PROTEINAS

Las propiedades de las proteínas dependen sobre todo de los radicales R


libres y de que éstos sobresalgan de la molécula y, por tanto, tengan la
posibilidad de reaccionar con otras moléculas.

El conjunto de aminoácidos de una proteína cuyos radicales poseen la


capacidad de unirse a otras moléculas y de reaccionar con éstas se
denomina centro activo de la proteína.

88
Propiedades de
las proteínas

Desnaturalización Capacidad
Solubilidad Especificidad
y renaturalización amortiguadora

De función De especie

89
Solubilidad

 Las proteínas globulares poseen un elevado tamaño molecular, por lo


que al disolverse, dan lugar a disoluciones coloidales.
 La solubilidad de estas moléculas se debe a los radicales R que, al
ionizarse, establecen puentes de hidrógeno con las moléculas de agua.
Así, la proteína queda recubierta de una capa de moléculas de agua
que impide que se pueda unir a otras proteínas, lo que provocaría su
precipitación.

 La solubilidad depende del pH,


temperatura, concentración
iónica... A pesar de ser solubles, la
mayoría de las membranas
biológicas son impermeables al
paso de proteínas.

Capa de moléculas de agua

90
Desnaturalización y renaturalización

Consiste en la pérdida de todas las estructuras de orden superior


(secundaria, terciaria y cuaternaria) quedando la proteína reducida
a un polímero con estructura primaria.

Consecuencias inmediatas son:

- Disminución drástica de la solubilidad de la


proteína, acompañada frecuentemente de
precipitación

- Pérdida de todas sus funciones biológicas

- Alteración de sus propiedades hidrodinámicas

91
Agentes desnaturalizantes

I. Físicos

1. Calor. La mayor parte de las proteínas experimentan


desnaturalizaciones cuando se calientan entre 50 y 60 ºC; otras se
desnaturalizan también cuando se enfrían por debajo de los 10 a 15 ºC.

2. Radiaciones

II. Químicos: todos los agentes que rompen interacciones


o enlaces presentes en la estructura nativa de la proteína:

1. Detergentes
2. Urea y guanidina a altas concentraciones
3. Altas concentraciones de sal y extremos de pH
4. Reactivos de grupos -SH

92
Agentes desnaturalizantes
NH2
HOCH2 CH2 SH
C O Urea
2-mercaptoetanol
NH2
CH2 SH
HOCH NH2
C NH Guanidina
HCOH
NH2
CH2 SH
Ditiotreitol (DTT)
O
O S O-
O
Dodecilsulfato sódico (SDS, laurilsulfato)
93
94
Especificidad

La especificidad es doble:
• de especie
• de función.

Especificidad de especie:

En su secuencia de aminoácidos, las proteínas presentan dos tipos de


sectores:
• Sectores estables
• Sectores variables: Algunos aminoácidos pueden ser sustituidos por
otros distintos sin que se altere la funcionalidad de la molécula.

Ello ha dado lugar, durante la evolución, a una gran variabilidad de proteínas,


lo que permite que cada especie tenga sus proteínas específicas y que,
incluso, aparezcan diferencias entre individuos de la misma especie (rechazo
en trasplantes de tejidos).

Las diferencias entre proteínas homologas, es decir, con la misma función,


son grandes entre especies alejadas evolutivamente y escasas entre especies
emparentadas.
95
Especificidad de función.

La especificidad también se refiere a la función.


• Cada proteína realiza una determinada función exclusivamente, por ejemplo,
catalizar cierta reacción química sobre cierto substrato y no sobre otro.
• La especificidad se debe a que su actuación se realiza mediante interacciones
selectivas con otras moléculas, para lo que necesitan una determinada secuencia de
aa y una conformación concreta.
• Un cambio en la secuencia o conformación puede impedir la unión y por lo tanto
dificultar la función.

96
Capacidad amortiguadora

Las proteínas, al estar constituidas por aminoácidos, tienen un


comportamiento anfótero. Tienden a neutralizar las variaciones de pH
del medio, ya que pueden comportarse como un ácido o una base y,
por tanto, liberar o retirar protones (H+) del medio

97
CLASIFICACIÓN DE PROTEÍNAS

Se clasifican en:
• Holoproteínas: Formadas solamente por aminoácidos.

• Heteroproteínas: Formadas por una fracción proteínica y por


un grupo no proteínico, que se denomina "grupo prostético.
Se clasifican según la naturaleza del grupo prostético.

Proteínas filamentosas
Holoproteínas
Proteínas globulares

Cromoproteínas

PROTEÍNAS Glucoproteínas

Heteroproteínas Lipoproteínas

Nucleoproteínas

Fosfoproteínas

98
HOLOPROTEÍNAS

Más complejas que las fibrosas. Forman


Globulares: estructuras compactas, casi esféricas,
solubles en agua o disolventes polares.
Son responsables de la actividad celular

1. Prolaminas: Zeína (maíza),gliadina (trigo), hordeína (cebada)


2. Gluteninas: Glutenina (trigo), orizanina (arroz).
3. Albúminas: Seroalbúmina (sangre), ovoalbúmina (huevo),
lactoalbúmina (leche)
4. Hormonas: Insulina, hormona del crecimiento, prolactina,
tirotropina
5. Enzimas: Hidrolasas, Oxidasas, Ligasas, Liasas, Transferasas .

99
HOLOPROTEÍNAS

Más simples que las globulares. Forman


Fibrosas: estructuras alargadas, ordenadas en una
sola dimensión, formando haces
paralelos. Son responsables de funciones
estructurales y protectoras

1. Colágenos: en tejidos conjuntivos, cartilaginosos


2. Queratinas: En formaciones epidérmicas: pelos, uñas, plumas,
cuernos.
3. Elastinas: En tendones y vasos sanguíneos
4. Fibroínas: En hilos de seda, (arañas, insectos)

100
HETEROPROTEÍNAS

1. Glucoproteínas: ribonucleasa mucoproteínas, anticuerpos, hormona


luteinizante
2. Lipoproteínas: De alta, baja y muy baja densidad, que transportan lípidos en
la sangre.
3. Nucleoproteínas: Nucleosomas de la cromatina, ribosomas, histonas y
protaminas de eucariotas.
4. Cromoproteínas: Pueden ser de dos tipos:
a) Porfirínicas. Hemoglobina, mioglobina que transportan oxígeno,
citocromos, que transportan electrones
b) No profirínicas como la hemocianina (pigmento respiratorio de
crustáceos y moluscos, de color azul y que contiene cobre)
5. Fosfoproteínas: Tienen PO4H3 en el grupo prostético. La caseína de la leche.

101
FUNCIONES Y EJEMPLOS DE PROTEÍNAS:

1. Estructural
2. Enzimática
3. Hormonal
4. Defensiva
5. Transporte
6. Reserva
7. Función
homeostática
8. Anticongelante
9. Actividad contráctil

102
Estructural
Es una de las funciones más características:

1. Algunas glucoproteínas forman parte de las membranas celulares.


Intervienen en el transporte selectivo de iones (bomba de Na-K)
2. Otras proteínas forman el citoesqueleto de las células, las fibras del huso,
de los cilios y flagelos.
3. Otras, como las histonas forman parte de los cromosomas eucariotas.
4. El colágeno, que mantiene unidos los tejidos animales y forma los
tendones y la matriz de los huesos y cartílagos.
5. La elastina, en el tejido conjuntivo elástico (ligamentos paredes de vasos
sanguíneos).
6. La queratina, que se sintetiza en la epidermis y forma parte de pelos, uñas,
escamas de reptiles, plumas, etc.
7. La fibroína, que forma la seda y las telas de arañas. Es una disolución
viscosa que solidifica rápidamente al contacto con el aire.

103
Enzimática
• Es la función más importante.
• Las enzimas son las proteínas más numerosas y especializadas y actúan
como biocatalizadores de las reacciones que constituyen el metabolismo
celular.
• Se diferencian de los catalizadores no biológicos porque las enzimas son
específicas de la reacción que catalizan y de los sustratos que
intervienen en ellas.

Hormonal
Insulina y glucagón
Hormona del crecimiento segregada por la hipófisis
Calcitonina

Defensiva

Inmunoglobulina, trombina y fibrinógeno

104
Transporte

• Además de las proteínas transportadoras de las membranas, existen otras


extracelulares que transportan sustancias a lugares diferentes del
organismo.
• Hemoglobina, la hemocianina y la mioglobina del músculo estriado.
• Los citocromos transportan electrones en la cadena respiratoria
(mitocondrias) y en la fase luminosa de la fotosíntesis (cloroplastos).
• La seroalbúmina transporta ácidos grasos, fármacos y productos
tóxicos por la sangre.
• Las lipoproteínas transportan el colesterol y los triacilglicéridos por la
sangre.

105
Reserva

En general, las proteínas no se utilizan para la obtención de energía. No


obstante, algunas como la ovoalbúmina de la clara de huevo, la
caseína de la leche o la gliadina de la semilla de trigo, son utilizadas
por el embrión en desarrollo como nutrientes.

Función homeostática

Las proteínas intracelulares y del medio interno intervienen en el


mantenimiento del equilibrio osmótico en coordinación con los
tampones.

106
Función contráctil
El movimiento y la locomoción en los organismos unicelulares y pluricelulares
dependen de las proteínas contráctiles:
• la dineína, en cilios y flagelos,
• la actina y miosina, responsables de la contracción muscular.

Anticongelante
Presentes en el citoplasma de ciertos peces antárticos.

107
Estructura de la HEMOGLOBINA

108
GRACIAS POR SU ATENCIÓN

109
110

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