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1
COMPETENCIA DESARROLLAR
Diferencia los aminoácidos por las características de sus cadenas
laterales y conoce las interacciones covalentes y no covalentes que
pueden establecer con otros grupos funcionales.
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AMINOACIDOS
Los aminoácidos son un grupo heterogéneo de moléculas que poseen unas características
estructurales y funcionales comunes.
En las células, estos veinte aminoácidos se unen mediante enlaces covalentes formando
largas cadenas de combinaciones específicas que producen un gran número de proteínas
diferentes.
El tamaño puede ser muy variado, desde péptidos formados por un número pequeño de
aminoácidos hasta polímeros de una elevadísima masa molecular.
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Características estructurales comunes
Los aminoácidos tienen en común la existencia de un átomo de carbono (llamado
carbono a) al que se unen los siguientes grupos funcionales: un grupo carboxilo (—
COOH), un grupo amino (— NH2) y un átomo de hidrógeno.
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Fórmula general
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Configuración:
• Hay dos tipos:
• d: dextrarotatorio
• L:levorotatorio
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• La mayoria de los aminoacidos con actividad biológica son los
del tipo “l” (forman parte de las proteínas).
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La configuración (L) de los aminoácidos.
Casi todos los aminoácidos naturales tienen configuración (S), con estereoquímica
parecida a la del L-(-)-gliceraldehído, por lo que se denominan L-aminoácidos.
Excepto la glicina, todos los α aminoácidos son quirales. El centro quiral es el
átomo de carbono asimétrico α.
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Clasificación de aminoácidos
Hidrófobos
Hidrófilos
Según la polaridad
del radical
Ácidos
Básicos
Aminoácidos
Ácidos
Alifáticos Básicos
Según la estructura
Aromáticos Neutros
del radical
Heterocíclicos
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Clasificación de aminoácidos
12
13
Clasificación de los aminoácidos
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Clasificación de los aminoácidos
15
Clasificación de los aminoácidos
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No polares
Polares
Ácidos Básico
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2. Clasificación de los aminoácidos
Nombre Abreviación Estructura Nombre Abreviación Estructura
Aminoácidos con extremos de cadenas non polares Prolina Pro(P) O
O
Glicina Gly(G) N
H2N H OH
OH fenilalanina Phe (F) O
O
Alanina Ala (A)
NH OH
2
NH OH
2
O Triptófano Trp(w) H2N
OH
Valina Val(V) HN
OH O
NH2 O
Leucina Leu(L)
OH Aminoácidos con extremos de cadenas polares pero no
ionizados
NH2
O O
Isoleucina Ile(I) Asparagina Asn(N)
H2N
OH OH
NH2 O NH2
O
Metionina Met(M) O O
S
Glutamina Gln (Q)
OH
H2N OH
NH2
NH2
2-Clasificación de los aminoácidos
Nombre Abreviación Estructura Nombre Abreviación Estructura
O
Aminoácidos con extremos de cadena polares pero no Cisteína Cys(C)
ionizados
O HS OH
OH
NH2
O
Lisina Lys(K)
Treonina Thr(T) H2N
OH
OH NH2
NH2
Arginina Arg (R) NH O
apártico
HO Histidina His (H
OH N
OH
O NH2
O O
Ácido Glu (E) HN
NH2
glutámico
HO OH
NH2
O
Tirosina Tyr(Y)
OH
NH2
HO
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Aminoácidos Esenciales
21
Propiedades de los aminoácidos
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Formación zwitterión.
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4. Propiedades
- Los aminoácidos son sustancias mucho más polares de lo que uno esperaría de
acuerdo con su fórmula molecular.
- Las propiedades que presentan, sólidos cristalinos solubles en agua, se atribuyen al
hecho de que la forma estable es un zwitterión o sal interna.
O O
H2N CH C OH H3N CH C O
R R
Zwitterión
Especie presente Especie presente Especie presente
en medio ácido en medio neutro en medio básico
O 4. Propiedades O O
-H+ -H+
H3N CH C OH H3N CH C O H2N CH C O
+H+ +H+
R R R
a b c
El pH controla la carga de la
glicina: catiónica por debajo
de pH = 2.3; aniónica por
encima de pH = 9.6 y
zwitteriónica entre pH = 2.3
y 9.6. El pH isoeléctrico es
6.0.
El punto isoeléctrico es el
pH al que el aminoácido se
encuentra en equilibrio
entre las dos formas, como
el zwitterión dipolar con
una carga neta de cero.
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EL ENLACE PEPTÍDICO
El enlace peptídico es la unidad primaria estructural de las cadenas polipeptídicas.
Los aminoácidos se unen en secuencias lineales durante la síntesis de proteínas
mediante una reacción de condensación entre el grupo carboxilo de un aminoácido
y el grupo amino del siguiente, que produce la formación de un enlace amida (Fig.
4-17). Los aminoácidos incorporados en la cadena polipeptídica se denominan
residuos por la pérdida de agua que se produce en la reacción.
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Unión Peptídica entre Aminoácidos
Unión Peptídica
H H
O
H O H O
= N N =
=
N C CC C C
H OH H OH
H
R R
+ H2O CONDENSACIÓN
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enlace peptídico
• el enlace peptídico es
esencialmente plano
• Carácter parcial de
doble enlace
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Hormona humana bradiquinina.
38
Oxitocina humana.
La oxitocina es
un nonapéptido
con dos residuos
de cisteína (en las
posiciones 1 y 16)
que unen parte
de la molécula
formando un
gran anillo
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40
Insulina
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Proteínas
Las proteínas se pueden definir como polímeros formados por la unión, mediante
enlaces peptídicos, de unidades de menor masa molecular
llamadas aminoácidos.
Son moléculas muy complejas. Su masa molecular es muy elevada,
normalmente está comprendida entre 6000 da y 106 da, son macromoléculas.
Las proteínas son las moléculas orgánicas más abundantes en las células, más
del 50% del peso seco de la célula son proteínas. Están constituidas,
fundamentalmente, por C, H, O y N y casi todas tienen también azufre. Algunas
tienen, además, otros elementos químicos y en particular: P, Fe, Zn o Cu. El
elemento más característico de las proteínas es el nitrógeno. Son los
compuestos nitrogenados por excelencia de los seres vivos.
Las proteínas son moléculas específicas que marcan la individualidad de cada
ser vivo. Son además de una gran importancia porque a través de ellas se va a
expresar la información genética, de hecho el dogma central de la genética
molecular nos dice:
DNA→ RNA → Proteína
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Uniones disulfuro.
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Enlace peptídico
4. El enlace peptídico tiene un comportamiento similar al de un enlace
doble, es decir, presenta una cierta rigidez que inmoviliza en un plano
los átomos que lo forman.
5. Además es un enlace más corto que otros enlaces C-N. Esto le impide
girar libremente, los únicos enlaces que pueden girar son los Cα-C y los
Cα-N que no corresponden al enlace peptídico.
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Péptidos y oligopéptidos de interés biológico
46
Estructura de una
Proteína?
47
Estructura de las proteínas
1. ESTRUCTURA PRIMARIA
2. ESTRUCTURA SECUNDARIA
3. ESTRUCTURA TERCIARIA
4. ESTRUCTURA CUATERNARIA
48
Estructura primaria
49
Estructura primaria: secuencia
53
Estructura primaria
54
Serina Glicina Tirosina Alanina Leucina
Estructura primaria
55
Estructura secundaria
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Estructura secundaria
• Las interacciones no covalentes entre los restos laterales de los aminoácidos dan origen a la estructura
secundaria.
• Si bien las conformaciones anteriores son las más usuales, existen otras menos frecuentes.
• Existen sectores de los polipéptidos cuya estructura no está bien definida: los enroscamientos aleatorios o
“ad-random”.
Conformación β
Conformación ɑ
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1.4. Estructura secundaria
¿Se puede plegar una cadena polipeptídica en una estructura regular repetitiva?
1951 Linus Pauling y Robert Corey propusieron la hélice y la hoja plegada .
Hélice
la -hélice es
“right-handed”
1.4. Estructura secundaria
vista esquemática de las hélices
esferas y
cintas cilindros
varillas
la prolina actúa como rompedora de hélices (el grupo amino está
integrado en un anillo de 5 átomos)
1.4. Estructura secundaria
Hoja (o lámina) plegada
• formada por dos o más cadenas polipeptídicas, llamadas hebras
• se estabilizan por puentes de H entre las hebras o cadenas
• interaccionan diferentes secciones que no necesariamente van seguidas
• los grupos NH y CO de cada aa están unidos a un grupo CO y NH situados en
la cadena adyacente
1.4. Estructura secundaria
hoja antiparalela: si interaccionan en sentidos opuestos
ANTIPARALELA
PARALELA
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1.4. Estructura secundaria
vista esquemática de las hojas
esferas y
varillas
cintas
cintas 90º
1.4. Estructura secundaria
superhélice (2 hélices dextrógiras enrolladas)
67
Hélice de colágeno
68
Hélice de colágeno
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Conformación-β
Características de la Hoja plegada (beta-lamina):
• Los grupos C=O y N-H de los enlaces peptídicos de cadenas
adyacentes (o de segmentos adyacentes de una misma cadena) están
en el mismo plano apuntando uno hacia el otro, de tal forma que se
hace posible el enlace de hidrogeno entre ellos.
• Todos los grupos R en cada una de las cadenas alternan, primero arriba
del eje de la lamina, después abajo del mismo, y así sucesivamente.
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Conformación-β
71
Estructura terciaria
• La conformación terciaria de una proteína
globular es la conformación tridimensional
del polipéptido plegado.
72
Estructura terciaria
Lámina β
Hélice α
73
Residuos Residuos
hidrofóbicos polares
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Enlaces de hidrógeno en estructura terciaria
H
CH2 HO CH2 Y
Aceptores
N H
HN HO CH S,T
R
Donadores
H
H N CH2 K
H
C,M CH2 S H
R H
N NH R
H C
NH2+
O H
E,G,N,Q C H O
R N C N,Q
H
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Enlaces salinos o iónicos en estructura terciaria
K
CH2 NH3
R D,E
CH2 NH NH2
C OOC CH2
NH2
H
CH2
NH
HN
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Enlaces covalentes en estructura terciaria: disulfuro
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Enlaces covalentes en estructura terciaria: amida
H H N
H N
C O
D,E N
K
C
O C
O N H
N H
O C
R
R
C O
H N
H N
C O
R
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Interacciones que intervienen
en el plegamiento de la
estructura terciaria
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1.5. Estructura terciaria y
• cuaternaria
la estructura cuaternaria corresponde a la asociación de cadenas
polipeptídicas o subunidades, cada una de ellas con su estructura
terciaria
• se mantiene por enlaces entre los radicales de cadenas diferentes
• la forma más simple es un dímero (2 subunidades idénticas)
hemoglobina humana
(tetrámero: )
• En los tramos rectos, la cadena polipeptídica posee estructura
secundaria de tipo α-hélice o β-lámina
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Estructura cuaternaria
83
Estructura cuaternaria
• Interacciones hidrofóbicas.
• Puentes de hidrógeno.
• Interacciones salinas.
• Fuerza de Van der Waals.
• En algunas ocasiones puede haber enlaces
fuertes tipo puentes disulfuro, en el caso
de las inmunoglobulinas.
84
85
El uso de subunidades menores para construir grandes estructuras
presenta varias ventajas:
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En resumen, la estructura de una proteína.
Puente de Hidrógeno,
Unión Puente de Interacciones hidrofóbicas, Fuerzas diversas no
Peptídica Hidrógeno salinas, electrostáticas. covalentes.
88
Propiedades de
las proteínas
Desnaturalización Capacidad
Solubilidad Especificidad
y renaturalización amortiguadora
De función De especie
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Solubilidad
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Desnaturalización y renaturalización
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Agentes desnaturalizantes
I. Físicos
2. Radiaciones
1. Detergentes
2. Urea y guanidina a altas concentraciones
3. Altas concentraciones de sal y extremos de pH
4. Reactivos de grupos -SH
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Agentes desnaturalizantes
NH2
HOCH2 CH2 SH
C O Urea
2-mercaptoetanol
NH2
CH2 SH
HOCH NH2
C NH Guanidina
HCOH
NH2
CH2 SH
Ditiotreitol (DTT)
O
O S O-
O
Dodecilsulfato sódico (SDS, laurilsulfato)
93
94
Especificidad
La especificidad es doble:
• de especie
• de función.
Especificidad de especie:
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Capacidad amortiguadora
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CLASIFICACIÓN DE PROTEÍNAS
Se clasifican en:
• Holoproteínas: Formadas solamente por aminoácidos.
Proteínas filamentosas
Holoproteínas
Proteínas globulares
Cromoproteínas
PROTEÍNAS Glucoproteínas
Heteroproteínas Lipoproteínas
Nucleoproteínas
Fosfoproteínas
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HOLOPROTEÍNAS
99
HOLOPROTEÍNAS
100
HETEROPROTEÍNAS
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FUNCIONES Y EJEMPLOS DE PROTEÍNAS:
1. Estructural
2. Enzimática
3. Hormonal
4. Defensiva
5. Transporte
6. Reserva
7. Función
homeostática
8. Anticongelante
9. Actividad contráctil
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Estructural
Es una de las funciones más características:
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Enzimática
• Es la función más importante.
• Las enzimas son las proteínas más numerosas y especializadas y actúan
como biocatalizadores de las reacciones que constituyen el metabolismo
celular.
• Se diferencian de los catalizadores no biológicos porque las enzimas son
específicas de la reacción que catalizan y de los sustratos que
intervienen en ellas.
Hormonal
Insulina y glucagón
Hormona del crecimiento segregada por la hipófisis
Calcitonina
Defensiva
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Transporte
105
Reserva
Función homeostática
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Función contráctil
El movimiento y la locomoción en los organismos unicelulares y pluricelulares
dependen de las proteínas contráctiles:
• la dineína, en cilios y flagelos,
• la actina y miosina, responsables de la contracción muscular.
Anticongelante
Presentes en el citoplasma de ciertos peces antárticos.
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Estructura de la HEMOGLOBINA
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GRACIAS POR SU ATENCIÓN
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