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De esta manera, este proceso metabólico, el cual es regulado por insulina, tiene una doble función, ya que la
glucosa se usa para formar NADPH, mientras que también se puede transformar en otros componentes del
metabolismo, especialmente pentosas, utilizadas para la síntesis de nucleótidos y de ácidos nucleicos. Así, se
forma un puente entre rutas anabólicas y catabólicas de la glucosa. a ruta de la pentosa fosfato tiene lugar en el
citosol, y puede dividirse en dos fases:
De este modo se acaba obteniendo dos moléculas de NADPH que, además de su uso en la biosíntesis reductiva, también
es responsable del mantenimiento de un medio reductor en la célula. Esto puede verse si hay un déficit de glucosa-6-
fosfato deshidrogenasa, producido por un defecto en un gen que se encuentra en el cromosoma X, pudiendo afectar con
mayor proporción a los varones
Los glóbulos rojos de la sangre necesitan grandes cantidades de NADPH para la reducción de la hemoglobina
oxidada y para poder regenerar el glutatión reducido, un antioxidante que presenta importantes funciones
como la eliminación de peróxidos y la reducción de ferrihemoglobina (Fe3+). Estas necesidades se ven
cubiertas gracias a la ruta de la pentosa fosfato con el intermediario de reducción NADPH. Sin embargo, si
existe este defecto genético, debido a la ingesta de algún determinado medicamento, como el antimalárico
primaquina, o algunos vegetales, como por ejemplo las habas, los eritrocitos se distribuyen en un lugar de
debilidad, pudiendo desenvolver en una grave anemia hemolítica. Esta mutación genética podría aumentar la
producción de peróxidos y con ello también habría la oxidación de los lípidos de membrana, junto a la
aceleración de la degradación de los eritrocitos. De este modo, se puede observar como la ruta de la pentosa
fosfato es la única vía metabólica por la cual estas células pueden producir NADPH.
A pesar de todo, los afectados por este problema congénito se ven altamente favorecidos en un aspecto. Estos
suelen vivir en zonas tropicales, ya que son mejores protectores contra infecciones de malaria. Esto puede
verse explicado por la necesidad inmediata de los plasmodios hacia un medio reducido para su metabolismo,
ya que los parásitos resisten mucho menos el estrés oxidativo respecto a sus células huésped.
Reactivos Productos Enzima Descripción
Esta fase conlleva toda una serie de reacciones reversibles, el sentido de las cuales depende de
la disponibilidad del sustrato. Asimismo, la isomerización de ribulosa-5-fosfato a ribosa-5-fosfato
es también reversible. Esto nos permite poder eliminar el excedente de ribosa-5-fosfato para
acabar transformándolo en productos intermediarios de la glucólisis
La primera reacción llevada a cabo es la epimerización, regulada mediante la enzima pentosa-5-fosfato epimerasa, que
convertirá la ribulosa-5-fosfato, producto de la fase oxidativa, en xilulosa-5-fosfato, generando así el sustrato necesario para la
siguiente reacción controlada por la transcetolasa, la cual actúa junto a la coenzima pirofosfato de tiamina (TPP). Ésta
convertirá la xilulosa-5-fosfato en ribosa-5-fosfato y, mediante la transferencia de una unidad de C2 de la cetosa a la aldosa, se
producirá gliceraldehído-3-fosfato y sedoheptulosa-7-fosfato.
Sucedido esto, la transaldolasa, con la ayuda de un resto lisina en su centro activo, transfiere una unidad C3 de la
sedoheptulosa-7-fosfato a gliceraldehído-3-fosfato, con lo que se formarán la tetrosa eritrosa-4-fosfato, además de uno de los
primeros productos finales: la hexosa fructosa-6-fosfato, la cual se dirigirá hacia la glucólisis.
Acto seguido, la enzima transcetolasa vuelve a transferir una unidad C2, desde la xilulosa-5-fosfato a eritrosa-4-fosfato,
consiguiendo así formar otra molécula de fructosa-6-fosfato y un gliceraldehído-3-fosfato, ambos intermediarios de la
glucólisis. De esta manera, se cierra la fase no oxidativa de esta ruta metabólica.2
Esta fase de la ruta conectará los procesos metabólicos que generan NADPH con los que originan NADH/ATP. Por otra
parte, el gliceraldehído-3-fosfato y la fructosa-6-fosfato pueden intervenir, en vez de en el glucólisis, en la gluconeogénesis
para formar una nueva síntesis de glucosa
Reactivos Productos Enzima
→ Gliceraldehído-3-fosfato +
Xilulosa-5-fosfato + Ribosa-5-fosfato Sedoheptulosa-7-fosfato Transcetolasa
→ Gliceraldehído-3-fosfato +
Xilulosa-5-fosfato + Eritrosa-4-fosfato Transcetolasa
Fructosa-6-fosfato
La célula y la ruta de la pentosa fosfato
La ruta de la pentosa fosfato tiene una gran flexibilidad, de hecho, es un módulo ideal del metabolismo, que se adapta
continuamente a las cantidades requeridas de ATP, NADPH, ribosa-5-fosfato, piruvato o acetil-CoA, según las
necesidades de la célula.
Esta ruta se ve regularizada mediante la enzima glucosa-6-fosfato deshidrogenasa. El regulador más importante es la
oferta de NADP+, el cual actúa como activador alostérico, mientras que el NADPH disminuye la actividad de la enzima
como inhibidor competitivo. En condiciones fisiológicas el NADPH se encuentra en mayor proporción (70:1) respecto
NADP+, si hubiese una utilización de equivalentes de reducción conduciría rápidamente a la estimulación de la
deshidrogenasa debido al aumento de la cantidad de NADP+.
Consecuentemente, esta ruta metabólica transcurre fuertemente en el tejido adiposo, donde hay una gran oferta de
glucosa y una alta necesidad de NADPH, requerido para la biosíntesis de ácidos grasos. Por el contrario, en el tejido
muscular, se encuentra una baja necesidad de NADPH, por lo que se realiza la inversión de la ruta.
En el caso del tejido adiposo, se dará lugar a NADPH para las células del tejido, pero, la formación de
ribosa-5-fosfato no dará suficiente síntesis de nucleótidos, hecho que provocará la conversión de las
pentosas en gliceraldehído-3-fosfato y fructosa-6-fosfato. Por lo general, estas biomoléculas se
incorporarán en la glucólisis, con la ayuda de la enzima piruvato deshidrogenasa, para formar, finalmente,
acetil-CoA necesario para la síntesis de ácidos grasos. Así pues, en la glucólisis simultáneamente se
forman equivalentes de reducción (NADPH, NADH) y también de energía (ATP). Este proceso se detiene
cuando ya hay suficiente y, además, se han cubierto las necesidades de ATP. En este momento, los
productos finales de la fase no oxidativa de esta ruta metabólica podrán incorporarse en la
gluconeogénesis, para formar nuevamente glucosa-6-fosfato y cerrar el ciclo.
Por último, hay otro tipo de células, las proliferantes que también se aprovechan de la gran flexibilidad de
este proceso metabólico. Estas necesitan una gran cantidad de ribosa-5-fosfato para poder sintetizar
ácidos nucleicos y, así, replicarse con facilidad y rapidez. De este modo, la ruta puede invertirse, gracias a
la reversibilidad de sus reacciones y, a partir de una molécula de gliceraldehído-3-fosfato y dos de
fructosa-6-fosfato, obtendremos como producto tres moléculas de ribosa-5-fosfato, sin formarse ningún
NADPH.3
Beta oxidación
La beta oxidación (β-oxidación) es un proceso catabólico de los ácidos grasos en el cual sufren remoción,
mediante la oxidación, de un par de átomos de carbono sucesivamente en cada ciclo del proceso, hasta que el
ácido graso se descompone por completo en forma de moléculas acetil-CoA, que serán posteriormente oxidados
en la mitocondria para generar energía química en forma de (ATP). La β-oxidación de ácidos grasos consta de
cuatro reacciones recurrentes.
El resultado de dichas reacciones son unidades de dos carbonos en forma de acetil-CoA, molécula que pueden
ingresar en el ciclo de Krebs, y coenzimas reducidos (NADH y FADH2) que pueden ingresar en la cadena
respiratoria.
No obstante, antes de que produzca la oxidación, los ácidos grasos deben activarse con coenzima A y atravesar
la membrana mitocondrial interna, que es impermeable a ellos.
Pasos previos
Activación de los ácidos grasos El paso previo a esas cuatro reacciones es la activación de los ácidos grasos a
acil coenzima A (acil CoA, R–CO–SCoA), la cual tiene lugar en el retículo endoplasmático (RE) o en la
membrana mitocondrial externa, donde se halla la acil-CoA sintetasa (o ácido graso tioquinasa), la enzima
que cataliza esta reacción:1
La carnitina se encarga de llevar los grupos acilo al interior de la matriz mitoncondrial por medio del siguiente mecanismo.
La carnitina es fuertemente inhibida por el malonil-CoA, uno de los pasos reguladores en el proceso de lipogénesis.
La enzima carnitina palmitoiltransferasa I (CPTI) de la membrana mitocondrial externa elimina el coenzima A de la molécula de
acil-CoA y, a la vez, la une a la carnitina situada en el espacio intermembrana, originado acilcarnitina; el CoA queda libre en el
citosol para poder activar otro ácido graso.
A continuación, una proteína transportadora, llamada translocasa, situada en la membrana mitocondrial interna, transfiere la
acilcarnitina a la matriz mitoncondrial y, paralelamente, la carnitina palmitoiltransferasa II (CPTII) une una molécula de CoA de la
matriz al ácido graso, regenerando así el acil-CoA .
La carnitina se devuelve al espacio intermembrana por la proteína transportadora y reacciona con otro acil-CoA, repitiéndose el
ciclo.
La carnitina, también reconocida como vitamina B11, es un derivado aminoacídico que participa en el circuito vascular
reduciendo niveles de triglicéridos y colesterol en sangre. Se produce naturalmente en el hígado a partir de los aminoácidos L-
metionina y la L-lisina.
Activación de un ácido graso y
traslocación de acil-CoA resultante
por la carnitina
Rojo: acil-CoA, verde: carnitina,
Rojo+verde: acilcarnitina, CoASH:
coenzima A, CPTI: carnitina
palmitoiltransferasa I, CPTII:
carnitina palmitoiltransferasa II, 1:
acil-CoA sintetasa, 2: translocasa, A:
membrana mitocondrial externa, B:
espacio intermembrana, C:
membrana mitocondrial interna, D:
matriz mitocondria
Descripción Reacción Enzima Producto final
Oxidación por FAD
El primer paso es la oxidación del ácido
graso por la acil-CoA deshidrogenasa. La acil-CoA
enzima cataliza la formación de un deshidrogenasa trans-Δ2-enoil-CoA
doble enlace entre C-2 (carbono α) y C-3
(carbono β).
Hidratación
El siguiente paso es la hidratación del
enlace entre C-2 y C-3. Esta reacción es enoil CoA hidratasa L-3-hidroxiacil CoA
estereospecífica, formando solo el
isómero L.
Oxidación por NAD+
El tercer paso es la oxidación del L-3-
L-3-hidroxiacil CoA
hidroxiacil CoA por el NAD+, lo que deshidrogenasa 3-cetoacil CoA
convierte el grupo hidroxilo (–OH) en un
grupo cetona (=O).
Tiólisis
El paso final es la separación del 3- Una molécula de acetil
cetoacil CoA por el grupo tiol de otra β-cetotiolasa CoA y una de acil CoAcon
molécula de CoA. El tiol es insertado dos carbonos menos
entre C-2 y C-3.
Oxidación por FAD
El primer paso es la oxidación del ácido graso activado (acil-CoA graso) por FAD. La enzima acil-CoA-deshidrogenasa, una
flavoproteína que tiene el coenzima FAD unido covalentemente, cataliza la formación de un doble enlace entre C-2 y C-3. Los
productos finales son FADH2 y un acil-CoA-betainsaturado (trans-Δ2-enoil-CoA) ya que el carbono beta del ácido graso se une
con un doble enlace al perder dos hidrógenos (que son ganados por el FAD).
Hidratación
El siguiente paso es la hidratación (adición de una molécula de agua) del doble enlace trans entre C-2 y C-3. Esta reacción es
catalizada por enoil-CoA hidratasa y se obtiene un betahidroxiacil-CoA (L-3-hidroxiacil CoA); es una reacción estereospecífica,
formándose exclusivamente el isómero L.
Tiólisis
El paso final para la rotura del cetoacil-CoA entre C-2 y C-3 por el grupo tiol de otra molécula de CoA. Esta reacción es
catalizada por β-cetotiolasa y da lugar a una molécula de acetil CoA y un acil CoA con dos carbonos menos.
Estas cuatro reacciones continúan hasta que la escición completa de la molécula en
unidades de acetil CoA. Por cada ciclo, se forma una molécula de FADH 2, una de NADH y
una de acetil CoA.
Esto supone una visión de un ciclo en espiral ya que repite los mismos pasos pero con
diferentes sustancias procedentes del ciclo anterior. Por ello se le llama hélice de Lynen.
Los ácidos grasos de un número impar de carbonos siguen las mismas vías, esto es, ciclos
de deshidrogenación, hidratación, deshidrogenación y lisis. Sin embargo, en el último
paso del ciclo, se forma una molécula de propionil-CoA (3C), potencialmente
gluconeogénico, a diferencia de los acetil-CoA (el Acetil-CoA que ingrese en el ciclo de los
ácidos tricarboxílicos es completamente oxidado a 2 moléculas de anhídrido carbónico
Rendimiento energético
Equivalencia de
Molécula Número moléculas de ATP Ciclo metabólico Total ATP
[cita requerida]
Total 106
Teniendo en cuenta los dos enlaces de alta energía que se utilizan en la activación del ácido graso a acil-CoA, se obtiene
un rendimiento neto de 106 moléculas de ATP. Obviamente, cuanto más larga es la molécula de ácido graso, más
moléculas de ATP se generan.
BIOSINTESIS DE ACIDOS GRASOS
Los ácidos grasos son biomoléculas muy importantes para los seres vivos. Son los principales
constituyentes de los triglicéridos (aceites y grasas, que actúan como reserva energética) y de
los fosfolípidos (que forman el armazón de las membranas celulares). Su biosíntesis es, pues, de
crucial importancia para todos los organismos.1
El principal precursor de los ácidos grasos es el malonil-CoA, una molécula que aporta dos de
sus tres átomos de carbono al esqueleto carbonado del ácido graso en crecimiento. El malonil-
CoA proviene, a su vez, del acetil-CoA. Todas las reacciones de síntesis de ácidos grasos tienen
lugar en el citosol de las células
Síntesis de malonil-CoA
Como en la β-oxidación, la elongación ocurre a través de cuatro reacciones recurrentes. En el diagrama adjunto,
las unidades de acetil y malonil se muestran como sus tioésteres con su proteína transportadora de acilos (ACP);
así es como los microorganismos y las plantas sintetizan sus ácidos grasos. En cambio, en los animales, esas
mismas reacciones ocurren en una gran enzima dimérica, la ácido graso sintasa que tiene todas las actividades
enzimáticas necesarias para la síntesis y liberación de ácidos grasos libres
Paso Descripción Reacción Enzima
8 Acetil-CoA + 14 (NADPH + H+) + 7 ATP → Ácido palmítico (C16) + 8 CoA + 14 NADP+ + 7 (ADP + Pi) + 6 H2O
Dado que el Á.palmítico tiene 16 carbonos, se requieren 7 ciclos (de 4 carbonos el primero y 2 los siguientes)
para formarlo. Por ello se necesitan:
8 Acetil-CoA: uno por cada ciclo (para transformarse en 8 malonil-CoA) más uno extra en el primero, que se
condensa tal cual.
7 ATP: necesario uno en cada ciclo para transformar el Acetil-CoA en Malonil-CoA.
14 NADPH: Dos por ciclo.
CICLO DE
KREBS
El ciclo de Krebs (ciclo del ácido cítrico o ciclo de los ácidos tricarboxílicos)1 2 es una ruta metabólica, es decir,
una sucesión de reacciones químicas, que forma parte de la respiración celular en todas las células aeróbicas,
donde es liberada energía almacenada a través de la oxidación del acetil-CoA derivado de carbohidratos, grasas
y proteínas en dióxido de carbono y energía química en forma de trifosfato de adenosina (ATP). En células
eucariotas se realiza en la matriz mitocondrial. En las procariotas, el ciclo de Krebs se realiza en el citoplasma.
Además, el ciclo proporciona precursores de ciertos aminoácidos, así como el agente reductor NADH que se
utiliza en numerosas reacciones bioquímicas. Su importancia central para muchas vías bioquímicas sugiere que
fue uno de los primeros componentes establecidos del metabolismo celular y señala un origen abiogénico.3 4
En organismos aeróbicos, el ciclo de Krebs es parte de la vía catabólica que realiza la oxidación de glúcidos,
ácidos grasos y aminoácidos hasta producir CO2, liberando energía en forma utilizable: poder reductor y GTP
(en algunos microorganismos se producen ATP).
El metabolismo oxidativo de glúcidos, lípidos y proteínas frecuentemente se divide en tres etapas, de las cuales
el ciclo de Krebs supone la segunda. En la primera etapa, los carbonos de estas macromoléculas dan lugar a
acetil-CoA, e incluye las vías catabólicas de aminoácidos (p. ej. desaminación oxidativa), la beta oxidación de
ácidos grasos y la glucólisis. La tercera etapa es la fosforilación oxidativa, en la cual el poder reductor (NADH y
FADH2) generado se emplea para la síntesis de ATP según la teoría del acomplamiento quimiosmótico.
El ciclo de Krebs también proporciona precursores para muchas biomoléculas, como ciertos aminoácidos. Por
ello se considera una vía anfibólica, es decir, catabólica y anabólica al mismo tiempo.
El nombre de esta vía metabólica se deriva del ácido cítrico (un tipo de ácido tricarboxílico) que se consume y
luego se regenera por esta secuencia de reacciones para completar el ciclo, o también conocido como ciclo de
Krebs ya que fue descubierto por el alemán Hans Adolf Krebs, quien obtuvo el Premio Nobel de Fisiología o
Medicina en 1953, junto con Fritz Lipmann.
Visión general
El ciclo del ácido cítrico es una vía metabólica clave que unifica el metabolismo de los carbohidratos, las grasas y
las proteínas. Las reacciones del ciclo son llevadas a cabo por 8 enzimas que oxidan completamente el acetato,
en forma de acetil-CoA, y se liberan dos moléculas por cada una, de dióxido de carbono y agua. A través del
catabolismo de azúcares, grasas y proteínas, se produce un acetato de producto orgánico de dos carbonos en
forma de acetil-CoA que entra en el ciclo de ácido cítrico. Las reacciones del ciclo también convierten tres
equivalentes de nicotinamida adenina dinucleótido (NAD +) en tres de NAD + reducido (NADH), un equivalente
de flavina adenina dinucleótido (FAD) en una de FADH2 y un equivalente de guanosina difosfato ) Y fosfato
inorgánico (Pi) en una de trifosfato de guanosina (GTP). El NADH y el FADH2 generados por el ciclo del ácido
cítrico son a su vez utilizados por la vía de la fosforilación oxidativa para generar trifosfato de adenosina rico en
energía (ATP).
Una de las fuentes primarias de acetil-CoA es la descomposición de azúcares por glucolisis que producen
piruvato que a su vez es descarboxilado por la enzima piruvato deshidrogenasa que genera acetil-CoA.
El producto de esta reacción, acetil-CoA, es el punto de partida para el ciclo del ácido cítrico.
El ciclo del ácido cítrico comienza con la transferencia de un grupo acetilo de dos carbonos de acetil-CoA al
compuesto aceptor de cuatro carbonos (oxaloacetato) para formar un compuesto de seis carbonos (citrato).
El citrato pasa entonces por una serie de transformaciones químicas, perdiendo dos grupos carboxilo como CO2.
Los carbonos perdidos como CO2 se originan de lo que fue oxaloacetato, no directamente de acetil-CoA. Los
carbones donados por acetil-CoA se convierten en parte de la columna vertebral de oxaloacetato de carbono
después de la primera vuelta del ciclo de ácido cítrico. La pérdida de los carbonos donados con acetil-CoA como
CO2 requiere varias vueltas del ciclo del ácido cítrico. Sin embargo, debido al papel del ciclo del ácido cítrico en el
anabolismo, pueden no perderse, ya que muchos intermedios del ciclo TCA también se utilizan como precursores
de la biosíntesis de otras moléculas. 8
La mayor parte de la energía disponible por los pasos oxidativos del ciclo se transfiere como electrones ricos en
energía a NAD +, formando NADH. Para cada grupo acetilo que entra en el ciclo del ácido cítrico, se producen tres
moléculas de NADH.
Al final de cada ciclo, el oxaloacetato de cuatro carbonos ha sido regenerado, y el ciclo continúa.
Reacciones del ciclo de
Krebs
Acetil-CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2 H2O → CoA-SH + 3 (NADH + H+) + FADH2 + GTP + 2 CO2
Los dos carbonos del acetil-CoA son oxidados a CO2, y la energía que tenía acumulada es liberada en forma de energía química: GTP y
poder reductor (electrones de alto potencial): NADH y FADH2. NADH y FADH2 son coenzimas (moléculas que se unen a enzimas)
capaces de acumular la energía en forma de poder reductor para su conversión en energía química en la fosforilación oxidativa.
VII. Succinato 7. Succinato deshidrogenasa Oxidación FADH2 Utiliza FAD como un grupo prostético en la enzima y
sintetiza ATP.
Muchas de las enzimas del ciclo de Krebs son reguladas por retroalimentación negativa (feedback), por unión
alostérica del ATP, que es un producto de la vía y un indicador del nivel energético de la célula. Entre estas
enzimas, se incluye el complejo de la piruvato deshidrogenasa que sintetiza el acetil-CoA necesario para la
primera reacción del ciclo a partir de piruvato (mediante una reacción irreversible), procedente de la glucólisis o
del catabolismo de aminoácidos gluncogénicos (es decir, los 20 aminoácidos estándar exceptuando lisina y
leucina). También las enzimas citrato sintasa, isocitrato deshidrogenasa y α-cetoglutarato deshidrogenasa, que
catalizan las tres primeras reacciones del ciclo de Krebs, son inhibidas por altas concentraciones de ATP. Esta
regulación frena este ciclo degradativo cuando el nivel energético de la célula es bueno.
Algunas enzimas son también reguladas negativamente cuando el nivel de poder reductor de la célula es
elevado. El mecanismo que se realiza es una inhibición competitiva por producto (por NADH) de las enzimas que
emplean NAD+ como sustrato. Así se regulan, entre otros, los complejos piruvato deshidrogenasa y citrato
sintasa.
Eficiencia
Glucólisis Succinil-CoA
Oxidación y biosíntesis de aminoácidos NADH y FADH Fosforilación oxidativa y cadena de transporte electrónico
Glucólisi
s
La glucólisis o glicólisis (del griego glycos, azúcar y lysis, ruptura), es la vía metabólica encargada
de oxidar la glucosa con la finalidad de obtener energía para la célula. Consiste en 10 reacciones
enzimáticas consecutivas que convierten a la glucosa en dos moléculas de piruvato, el cual es
capaz de seguir otras vías metabólicas y así continuar entregando energía al organismo.1
Durante la glucólisis se obtiene un rendimiento neto de dos moléculas de ATP ; el ATP puede ser
usado como fuente de energía para realizar trabajo metabólico, mientras que el NADH puede
tener diferentes destinos. Puede usarse como fuente de poder reductor en reacciones
anabólicas; si hay oxígeno, puede oxidarse en la cadena respiratoria, obteniéndose 5 ATP (2.5
por cada NADH); si no hay dioxígeno, se usa para reducir el piruvato a lactato (fermentación
láctica), o a CO2 y etanol (fermentación alcohólica), sin obtención adicional de energía.
La glucólisis es la forma más rápida de conseguir energía para una célula y, en el metabolismo de
carbohidratos, generalmente es la primera vía a la cual se recurre. Se encuentra estructurada en
10 reacciones enzimáticas que permiten la transformación de una molécula de glucosa a dos
moléculas de piruvato mediante un proceso catabólico.
La glucólisis es una de las vías más estudiadas, y generalmente se encuentra dividida en dos
fases: la primera, de gasto de energía y la segunda fase, de obtención de energía.
En organismos aeróbicos, el piruvato seguirá oxidándose por la enzima piruvato deshidrogenasa y el ciclo de Krebs, creando
intermediarios como NADH y FADH2. Estos intermediarios no pueden cruzar la membrana mitocondrial, y por lo tanto, utilizan
sistemas de intercambio con otros compuestos llamados lanzaderas (en inglés, shuttles). Los más conocidos son la lanzadera
malato-aspartato y la lanzadera glicerol-3-fosfato. Los intermediarios logran entregar sus equivalentes4 al interior de la
membrana mitocondrial, y que luego pasarán por la cadena de transporte de electrones, que los usará para sintetizar ATP.
De esta manera, se puede obtener hasta 30 moles de ATP a partir de 1 mol de glucosa como ganancia neta.
Sin embargo, cuando las células no posean mitocondrias (ej: eritrocito) o cuando requieran de grandes cantidades de ATP (ej.:
el músculo al ejercitarse), el piruvato sufre fermentación que permite obtener 2 moles de ATP por cada mol de glucosa, por lo
que esta vía es poco eficiente respecto a la fase aeróbica de la glucólisis.
El tipo de fermentación varía respecto al tipo de organismos: en levaduras, se produce fermentación alcohólica, produciendo
etanol y CO2 como productos finales, mientras que en músculo, eritrocitos y algunos microorganismos se produce
fermentación láctica, que da como resultado ácido láctico o lactato.
FUNCIONES
Las funciones de la glucólisis son:
La generación de moléculas de alta energía (ATP y NADH) como fuente de energía celular en
procesos de respiración aeróbica (presencia de oxígeno) y fermentación (ausencia de oxígeno).
La generación de piruvato que pasará al ciclo de Krebs, como parte de la respiración aeróbica.
La producción de intermediarios de 6 y 3 carbonos que pueden ser utilizados en otros procesos
celulares.
Etapas de la glucólisis
La glucólisis se divide en dos partes principales y diez reacciones enzimáticas, que se
describen a continuación.
Se isomeriza el 3-fosfoglicerato
procedente de la reacción
anterior dando 2-fosfoglicerato,
la enzima que cataliza esta
reacción es la fosfoglicerato
mutasa. Lo único que ocurre aquí
es el cambio de posición del
fosfato del C3 al C2. Son energías
similares y por tanto reversibles,
con una variación de energía
libre cercana a cero
9° paso: Enolasa
La enzima enolasa
propicia la formación de
un doble enlace en el 2-
fosfoglicerato,
eliminando una molécula
de agua formada por el
hidrógeno del C2 y el OH
del C3. El resultado es el
fosfoenolpiruvato.
10° paso: Piruvato quinasa
Desfosforilación del
fosfoenolpiruvato,
obteniéndose piruvato
y ATP. Reacción
irreversible mediada
por la piruvato
quinasa.
El enzima piruvato quinasa es dependiente de magnesio y potasio. La energía libre es de -31,4
kJ/mol, por lo tanto la reacción es favorable e irreversible.
El rendimiento total de la glucólisis de una sola glucosa (6C) es de 2 ATP y no 4 (dos por cada
gliceraldehído-3-fosfato (3C)), ya que se consumen 2 ATP en la primera fase, y 2 NADH (que
dejarán los electrones Nc en la cadena de transporte de electrones para formar 3 ATP por
cada electrón). Con la molécula de piruvato, mediante un paso de oxidación intermedio
llamado descarboxilación oxidativa, mediante el cual el piruvato pasa al interior de la
mitocondria, perdiendo CO2 y un electrón que oxida el NAD+, que pasa a ser NADH más H+ y
ganando un CoA-SH (coenzima A), formándose en acetil-CoA gracias a la enzima piruvato
deshidrogenasa, se puede entrar al ciclo de Krebs (que, junto con la cadena de transporte de
electrones, se denomina respiración).
Regulación
El efecto Pasteur
es la visualización del poder que posee el O2 en la Regulación del sustrato
fermentación mediada por levadura, que fue descubierto
por Luis Pasteur al observar la relación entre la tasa de
fermentación y la existencia de aire. El determinó que
estas tenían una relación inversa, y además observó que La membrana plasmática de las células es
en condiciones aeróbicas, las células de levadura impermeable a la glucosa. Para llevarla dentro
aumentaban y la fermentación disminuía. de ella utiliza transportadores especiales
llamados GLUT, de los cuales hay diferentes
De esta manera, el efecto Pasteur fue una de las primeras
observaciones que alguien realizó al proceso de la
tipos y algunos especializados para cada célula
glucólisis de manera indirecta, pero observando que el
metabolismo primario de glucosa se podía realizar con
presencia o ausencia de oxígeno, y que en este último
ocurre la fermentación alcohólica.
Regulación de la actividad enzimática
• La glucólisis se regula enzimáticamente en los tres puntos irreversibles de esta ruta, esto es, en la primera reacción
(G → G-6P), por medio de la hexoquinasa; en la tercera reacción (F-6P → F-1,6-BP) por medio de la PFK1 y en el
último paso (PEP → Piruvato) por la piruvato quinasa.
• La hexoquinasa es un punto de regulación poco importante, ya que se inhibe cuando hay mucho G-6P en músculo.
Es un punto poco importante ya que el G-6P se utiliza para otras vías.
• La fosfofructoquinasa-1 es la enzima principal de la regulación de la glucólisis, actúa como una llave de agua, si está
activa cataliza muchas reacciones y se obtiene más fructosa-1,6-bisfosfato, lo que permitirá a las enzimas siguientes
transformar mucho piruvato. Si está inhibida, se obtienen bajas concentraciones de producto y por lo tanto se
obtiene poco piruvato.
• Esta enzima es controlada por regulación alostérica: por un lado se activa por concentraciones elevadas de ADP y
AMP, inhibiéndose en abundancia de ATP y citrato, y por otro se activa en presencia de un regulador generado por
la PFK2 que es la fructosa-2,6-bisfosfato (F-2,6-BP), que no es un metabolito ni de la glucólisis ni de la
gluconeogénesis, sino un regulador de ambas vías que refleja el nivel de glucagón en sangre
La lógica de la inhibición y activación son las siguientes:
• ATP: inhibe esta enzima pues si hay una alta concentración de ATP entonces la célula no
necesita generar más.
• Citrato: Si la concentración de citrato es alta el Ciclo de Krebs va más despacio de lo que
el sustrato (acetil-CoA) llega para degradarse, y la concentración de glucosa será más
alta. En el Ciclo de Krebs se produce mucho NADH y FADH2, para que funcionen se han
de reoxidar en la cadena de transporte electrónico creando gradiente de protones, si el
gradiente no se gasta los coenzimas no se reoxidan y el Ciclo de Krebs se para.
• AMP, ADP: la alta concentración de estas moléculas implica que hay una carencia de
ATP, por lo que es necesario realizar glucólisis, para generar piruvato y energía.
• La piruvatoquinasa se regula distintamente según el tejido en el que trabaje, pero en
hígado se inhibe en presencia de ATP y Acetil Coenzima-A (Acetil-CoA), y se activa
gracias de nuevo ante la F-1,6-BP y la concentración de fosfoenolpiruvato.
Regulación hormonal
Al aumentar la glucosa en la sangre, después de una comida, las células beta del
páncreas estimulan la producción de insulina, y esta a su vez aumenta la actividad
de la glucoquinasa en los hepatocitos.
Regulación de la glucogénesis
Por el mecanismo alostérico, La forma no fosforilada de la glucógeno fosforilasa, inactiva, adquiere actividad si
existe elevadas concentraciones de AMP (su efector positivo) y se inhibe por elevadas concentraciones de ATP y
glucosa-6-fosfato que actúan como efectores negativos.
Gluconeogénesis
La gluconeogénesis es el proceso mediante el cual se sintetiza glucosa a partir de compuestos no
glucídicos. Sus precursores son el ácido láctico, el glicerol y varios aminoácidos denominados
aminoácidos glucogenéticos. Este proceso ocurre principalmente en el hígado y con menor
intensidad en el riñón y se localiza intracelularmente en la mitocondria y el citosol.
La mayoría de las reacciones de esta vía ocurren por inversión de las reacciones de la vía
glucolítica con la excepción de las reacciones irreversibles de esta última vía. Estos pasos se
evaden por la participación de otras enzimas que forman rodeos metabólicos.
Primer rodeo metabólico
La regulación coordinada de la glucólisis y la gluconeogénesis depende de tales efectos inversos. Así el nivel elevado de AMP
o ADP activa la glucólisis y deprime la gluconeogénesis ,un efecto opuesto lo provocaría un nivel elevado de ATP.
Por otra parte, la liberación de glucagón, al activar el centro fosfatásico de la enzima bifuncional condiciona que
disminuyan los niveles de fructosa 2,6 bisfosfato, lo cual provoca que se deprima la glucólisis al faltar el principal efector
alostérico positivo de la enzima marcapaso, la fosfofructoquinasa 1; por el contrario la gluconeogénesis se activaría al
decrecer la concentración de un efector negativo de la principal reguladora de esta vía, la bisfosfofructofosfatasa 1. Un
efecto inverso se provocaría por la liberación de la hormona insulina.
Cetogenesis
es un proceso metabólico por el cual se producen los cuerpos cetónicos como resultado del catabolismo de los
ácidos grasos.
Los cuerpos cetónicos se producen principalmente en las mitocondrias de las células del hígado. Su síntesis ocurre
en respuesta a bajos niveles de glucosa y después del agotamiento de las reservas celulares de glucógeno. La
producción de cuerpos cetónicos comienza para hacer disponible la energía que es guardada como ácidos grasos.
Los ácidos grasos son enzimáticamente descompuestos en la β-oxidación para formar acetil-CoA. Bajo
condiciones normales, la oxidación del acetil-CoA se produce en el ciclo de Krebs y su energía se transfiere como
electrones a NADH, FADH2, y GTP. Sin embargo, si la cantidad de acetil-CoA generada en el proceso de oxidación
de los ácidos grasos es superior a la capacidad de procesamiento del ciclo de Krebs, o si la actividad en este
proceso es baja dada la poca cantidad de elementos intermedios como el oxaloacetato, el acetil-CoA se usa para
la biosíntesis de los cuerpos cetónicos vía acetil-CoA y β-hidroxi-β-metilglutaril-CoA (HMG-CoA).
Además de su papel en la síntesis de cuerpos cetónicos, el HMG-CoA es también un intermediario en la síntesis
del colesterol.
Tipos de cuerpos cetónicos
Los tres cuerpos cetónicos son:
Acetoacetato, el cual, si no es oxidado a una forma útil para obtener energía, es la fuente de los
otros dos cuerpos cetónicos siguientes.
Acetona, el cual no es usado como fuente de energía, es exhalado o excretado como desecho.
Betahidroxibutirato, el cual no es, en sentido técnico, una cetona de acuerdo a la nomenclatura
IUPAC.
Regulación
La cetogénesis podría o no ocurrir, dependiendo de los niveles disponibles de carbohidratos en las células o el cuerpo.
Esto está cercanamente relacionado con las vías del acetil-CoA:
Cuando el cuerpo tiene abundantes carbohidratos como fuente de energía, la glucosa es completamente oxidada a
CO2; el acetil-CoA se forma como un intermediario en este proceso, comenzando por entrar al ciclo de Krebs seguido
por la completa conversión de su energía química a ATP en el intercambio de la cadena de electrones mediante un
proceso de oxidación.
Cuando el cuerpo tiene exceso de carbohidratos disponibles, parte de la glucosa es totalmente metabolizada, y parte
de esta es almacenada para ser usada con acetil-CoA para crear ácidos grasos. (CoA es también reciclado aquí).
Cuando el cuerpo no tiene carbohidratos libres disponibles, la grasa debe ser descompuesta en acetil-CoA para poder
obtener energía. El acetil-CoA no se oxida a través del ciclo de Krebs porque los intermediarios (principalmente
oxaloacetato) se han agotado para suplir el proceso de la gluconeogénesis, y la resultante acumulación de acetil-CoA
activa la cetogénesis.
Patología
Los cuerpos cetónicos se crean a niveles moderados en el organismo mientras dormimos y
cuando no hay carbohidratos disponibles. Sin embargo, cuando el aporte en hidratos de carbono
es menor a unos 80 g/día, se dice que el cuerpo está en un estado de cetosis. Se desconoce si la
cetosis tiene o no efectos a largo plazo.
Si los niveles de los cuerpos cetónicos son demasiado altos, el pH de la sangre cae, resultando
en cetoacidosis. Esto es muy raro y, en general, ocurre solamente en la diabetes tipo I sin tratar,
y en alcohólicos tras beber y no comer.
Ciclo de la urea
El ciclo de la urea es un proceso metabólico en el cual se procesan los derivados proteicos y se
genera urea como producto final.
Si no se reutilizan para la síntesis de nuevos aminoácidos u otros productos nitrogenados, los
grupos amino se canalizan a un único producto final de excreción. La mayoría de especies
acuáticas, como por ejemplo los peces óseos, excretan el nitrógeno amínico en forma de
amoníaco por lo que se les llama animales amonotélicos; la mayoría de animales terrestres son
ureotélicos, excretan el nitrógeno amínico en forma de urea; las aves y también los reptiles son
uricotélicos, excretan el nitrógeno amínico en forma de ácido úrico.
Esta ruta fue descubierta en 1932 por Hans Krebs (que más tarde también descubriría el ciclo
del ácido cítrico) y un estudiante médico asociado, Kurt Henseleit. La producción de urea tiene
lugar casi exclusivamente en el hígado y representa el destino de la mayor parte del amoníaco
allí canalizado. La urea pasa al torrente sanguíneo y de ahí a los riñones y se excreta en la orina.
Dando asi urea como producto final
Producción de urea a partir de amoníaco
en cinco pasos enzimáticos
El ciclo de la urea empieza en el interior de las mitocondrias del hígado, si bien tres de los pasos
siguientes tienen lugar en el citosol; por tanto, el ciclo abarca dos compartimientos celulares. El
primer grupo amino que entra en el ciclo de la urea proviene del amoníaco de la matriz
mitocondrial, como resultado de las múltiples rutas descritas. Parte del amoníaco también llega
al hígado vía vena porta a partir del intestino, en donde se produce por oxidación bacteriana de
aminoácidos. Cualquiera que sea su origen, el NH4 generado en las mitocondrias hepáticas se
utiliza inmediatamente junto con el CO2 (en forma de HCO3-) producido por la respiración
mitocondrial, generando carbamoil fosfato en la matriz. Esta reacción dependiente de ATP es
catalizada por la carbamoil fosfato sintetasa I, la enzima reguladora. La forma mitocondrial de la
enzima es distinta de la forma citosólica (II), que tiene una función diferente en la síntesis de
pirimidinas.
El carbamoil fosfato, que puede ser considerado como un donador activado del grupo carbamilo, entra ahora en el ciclo de la
urea, que consta de cuatro pasos enzimáticos. En primer lugar, el carbamoil fosfato cede su grupo carbamilo a la ornitina para
formar citrulina y libera Pi y tiene lugar a través de un intermedio citrulil-AMP'. La ornitina desempeña pues un papel similar al
del oxalacetato en el ciclo del ácido cítrico, aceptando material en cada vuelta del ciclo. La reacción está catalizada por la ornitina
transcarbamilasa, y la citrulina formada pasa de la mitocondria al citosol.
El segundo grupo amino se introduce a partir del aspartato (generado en la mitocondria por transaminación y transportado al
citosol) mediante una reacción de condensación entre el grupo amino del aspartato y el grupo ureido (carbonilo) de la citrulina,
que forma argininosuccinato. Esta reacción citosólica, catalizada por la argininosuccinato sintetasa, requiere ATP. A continuación,
se corta reversiblemente el argininosuccinato por la argininosuccinato liasa, para formar arginina libre y fumarato, que entra en la
mitocondria y se une a la reserva de intermedios del ciclo del ácido cítrico. En la última reacción del ciclo de la urea, la enzima
citosólica arginasa corta la arginina dando urea y ornitina. La ornitina es transportada a la mitocondria para iniciar otra vuelta del
ciclo de la urea.
Las enzimas de muchas rutas metabólicas están agrupados. El producto de una enzima se canaliza directamente al siguiente
enzima de la vía. En el ciclo de la urea, los enzimas mitocondriales y citosólicos parecen estar agrupados de esta forma. La
citrulina transportada al exterior de la mitocondria no se diluye en la reserva general de metabolitos del citosol sino que pasa
directamente al centro activo de la argininosuccinato sintetasa. Esta canalización entre enzimas continúa para el
argininosuccinato, arginina y ornitina. Sólo se libera la urea a la reserva general de metabolitos del citosol.
Reacciones del ciclo de la urea
carbamoil fosfato + 2
1 2ATP + HCO3− + NH4+ CPS1 mitocondria
ADP + Pi
citrulina + aspartato + argininosuccinato +
3 AMP + PPi ASS citosol
ATP
1 L-ornitina
2 carbamil fosfato
3 L-citrulina
4 argininosuccinato
5 fumarato
6 L-arginina
7 urea
L-Asp L-aspartato
CPS-1 carbamil fosfato sintetasa I
OTC Ornitina transcarbamilasa
ASS argininosuccinato sintetasa
ASL argininosuccinato liasa
ARG1|Arginasa1
Conexiones entre los ciclos del ácido
cítrico y de la urea
Dado que el fumarato producido en la reacción de la argininosuccinato liasa es también un intermediario del ciclo
del ácido cítrico, los ciclos están, en principio, interconectados –en un proceso conocido como el “doble ciclo de
Krebs”-. Sin embargo, cada ciclo puede funcionar de manera independiente y la comunicación entre ellos depende
del transporte de intermedios clave entre la mitocondria y el citosol. Varias enzimas del ciclo del ácido cítrico,
incluyendo la fumarasa (fumarato hidratasa y la malato deshidrogenasa) también están presentes como isozimas
en el citosol. El fumarato generado en la síntesis citosólica de arginina puede, por tanto, convertirse en malato y a
continuación en oxalacetato en el citosol, y estos intermedios pueden seguir siendo metabolizados en el citosol o
ser transportados a las mitocondrias para su utilización en el ciclo del ácido cítrico.
El aspartato formado en las mitocondrias por transaminación entre oxalacetato y glutamato puede ser
transportado al citosol, en donde actúa como donador de nitrógeno en la reacción del ciclo de la urea catalizada
por la argininosuccinato sintetasa. Estas reacciones, que constituyen la desviación del aspartato-argininosuccinato,
proporcionan vínculos metabólicos entre las rutas separadas por las que se procesan los grupos amino y los
esqueletos carbonados de los aminoácidos.
La actividad del ciclo de la urea está
regulada a dos niveles
El flujo de nitrógeno a través del ciclo de la urea varía con la dieta de un organismo. Cuando la
dieta es mayoritariamente proteína, la utilización de los esqueletos carbonados de los
aminoácidos como combustible da lugar a la producción de mucha urea a partir del exceso de
grupos amino. Durante la inanición prolongada, en la que la degradación de proteína muscular
empieza a suministrar gran parte de la energía metabólica del organismo, también aumenta
sustancialmente la producción de urea.
Estos cambios en la demanda de actividad del ciclo de la urea se consiguen a largo plazo
mediante la regulación de las velocidades de síntesis de los cuatro enzimas del ciclo de la urea y
de la carbamil fosfato sintetasa I en el hígado.
Las cinco enzimas se sintetizan a velocidades más elevadas durante la inanición o en los animales
con dietas muy ricas en proteínas que en animales bien alimentados con dietas que contienen
principalmente glúcidos y grasas. Los animales con dietas carentes de proteínas producen niveles
más bajos de los enzimas del ciclo de la urea.
En una escala de tiempo más corta, la regulación alostérica de al menos una enzima clave ajusta
el flujo a través del ciclo de la urea. La primera enzima de la ruta, la carbamil fosfato sintetasa I,
está activada alostéricamente por el N-acetilglutamato, que es sintetizado a partir del acetil-CoA
y glutamato por la N-acetilglutamato sintasa. Este enzima cataliza el primer paso de la síntesis de
novo de la arginina a partir de glutamato en plantas y microorganismos. Los mamíferos, sin
embargo, tienen actividad N-acetilglutamato sintasa en el hígado, pero carecen del resto de
enzimas necesarias para convertir glutamato en arginina. Por tanto, el uso de N-acetilglutamato
para activar un paso en el ciclo de la urea resulta enigmático.
Defectos genéticos en el ciclo de la urea
pueden ser letales
Las personas con defectos genéticos en cualquiera de los enzimas que intervienen en la formación de urea no
pueden tolerar una dieta rica en proteínas. Los aminoácidos ingeridos en exceso con respecto a los
requerimientos diarios mínimos para la síntesis de proteínas se desaminan en el hígado, produciendo amoníaco
libre que no puede ser convertido en urea y exportado a la sangre, y el amoníaco es muy tóxico. Los humanos,
sin embargo, no podemos vivir de una dieta carente de proteína. Somos incapaces de sintetizar la mitad de los
20 aminoácidos estándar, y estos aminoácidos esenciales deben ser suministrados en la dieta.
A los pacientes con defectos en el ciclo de la urea se les aplican diversos tratamientos. La administración
cuidadosa de los ácidos aromáticos benzenoato o fenilacetato en la dieta puede ayudar a reducir los niveles de
amoníaco en la sangre. El benzenoato se convierte en benzenoil-CoA, que se combina con la glicina formando
hipurato. La glicina utilizada en esta reacción debe ser regenerada, y así el amoníaco se utiliza en la reacción de
la glicina sintasa. El fenilacetato se combina con glutamina para formar fenilacetilglutamina, y la subsiguiente
síntesis de glutamina sintasa ayuda a eliminar amoníaco. Tanto el hipurato como la fenilacetilglutamina son
compuestos no tóxicos que se excretan en la orina.
Otras terapias son más específicas de una determinada
deficiencia enzimática. La deficiencia de N-acetilglutamato
sintetasa tiene como resultado la ausencia del activador normal
de la carbamil fosfato sintetasa I. Este estado puede tratarse
administrando carbamil glutamato, un análogo del N-
acetilglutamato que es efectivo como activador de la carbamil
fosfato sintetasa I. Para las deficiencias en ornitina
transcarbamilasa, argininosuccinato sintetasa y argininosuccinato
liasa, es útil sumplementar la dieta con arginina. Muchos de estos
tratamientos deben ir acompañados de un control estricto de la
dieta y de suplementos de los aminoácidos esenciales. En los
pocos casos de deficiencia de arginasa, la arginina, el sustrato del
enzima defectivo, debe excluirse en la dieta.
El hábitat natural determina la ruta de
excreción del nitrógeno
La síntesis de urea no es la única ruta, ni siquiera la más común, para excretar el amoníaco. La base para las
diferentes formas moleculares en que se excretan los grupos amino se encuentra en la anatomía y en la fisiología
de los organismos en relación con su hábitat natural. Las bacterias y los protozoos simplemente liberan el amoníaco
en su entorno acuoso, en el que se diluye, con lo que se convierte en una forma inocua. En los peces óseos
(animales amonotélicos), el hígado es el lugar principal del catabolismo de los aminoácidos. El amonio producido
por transdesaminación se libera simplemente del hígado a la sangre para su transporte a las branquias, y es
rápidamente eliminado de la sangre a medida que el agua pasa a través de las branquias. Así pues, los peces óseos
no requieren un complejo sistema urinario.
En las aves y reptiles, la disponibilidad de agua para el proceso excretor constituye una consideración especialmente
importante. La excreción de urea en la orina requiere la excreción simultánea de una cantidad relativamente grande
de agua; el peso constituiría un impedimento para las aves en vuelo, mientras que los reptiles que viven en
ambientes áridos no pueden tener agua sobrante. Estos animales convierten el nitrógeno amínico en purinas, las
cuales se catabolizan a ácido úrico, un compuesto bastante insoluble que se excreta en las heces en forma de masa
semisólida de cristales de ácido úrico. Para tener la ventaja de excretar el nitrógeno amínico en esta forma, las aves y
reptiles llevan a cabo un trabajo metabólico considerable; la ruta desde los grupos amino de los aminoácidos a las
purinas y al ácido úrico es un proceso complejo y que requiere energía.
Aminoacidos
Un aminoácido es una molécula orgánica con un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH).1 Los aminoácidos más
frecuentes y de mayor interés son aquellos que forman parte de las proteínas. Dos aminoácidos se combinan en una
reacción de condensación entre el grupo amino de uno y el carboxilo del otro, liberándose una molécula de agua y
formando un enlace amida que se denomina enlace peptídico; estos dos "residuos" de aminoácido forman un dipéptido.
Si se une un tercer aminoácido se forma un tripéptido y así, sucesivamente, hasta formar un polipéptido. Esta reacción
tiene lugar de manera natural dentro de las células, en los ribosomas.
Todos los aminoácidos componentes de las proteínas son L-alfa-aminoácidos. Esto significa que el grupo amino está unido
al carbono contiguo al grupo carboxilo (carbono alfa) o, dicho de otro modo, que tanto el carboxilo como el amino están
unidos al mismo carbono; además, a este carbono alfa se unen un hidrógeno y una cadena (habitualmente denominada
cadena lateral o radical R) de estructura variable, que determina la identidad y las propiedades de cada uno de los
diferentes aminoácidos. Existen cientos de radicales por lo que se conocen cientos de aminoácidos diferentes, pero sólo 22
(los dos últimos fueron descubiertos en los años 1986 -selenocisteína- y 2002 -pirrolisina-)2 forman parte de las proteínas y
tienen codones específicos en el código genético.
La unión de varios aminoácidos da lugar a cadenas llamadas péptidos o polipéptidos, que se denominan proteínas cuando
la cadena polipeptídica supera una cierta longitud (entre 50 y 100 residuos aminoácidos, dependiendo de los autores) o la
masa molecular total supera las 5000 uma y, especialmente, cuando tienen una estructura tridimensional estable definida.
Estructura general de un aminoácido
La estructura general de un alfa-aminoácido se establece por la presencia de un carbono central
(alfa) unido a un grupo carboxilo (rojo en la figura), un grupo amino (verde), un hidrógeno (en
negro) y la cadena lateral (azul):
“R” representa la “cadena lateral”, específica para cada
aminoácido. Tanto el carboxilo como el amino son grupos
funcionales susceptibles de ionización dependiendo de los
cambios de pH, por eso ningún aminoácido en disolución se
encuentra realmente en la forma representada en la figura,
sino que se encuentra ionizado.
Dependiendo de las sustancias que actúen en las cadenas laterales, los aminoácidos se comportaran de distintas maneras, de
manera general a pH bajo (ácido), los aminoácidos se encuentran mayoritariamente en su forma catiónica (con carga positiva),
mientras que a pH alto (básico) se encuentran en su forma aniónica (con carga negativa).
Cuando el pH es igual al punto isoeléctrico (PI) observamos que el grupo carboxilo es desprotonado formándose el anión
carboxilo, en el caso inverso el grupo amino se protona formándose el catión amonio, a esta configuración en disolución acuosa
(que es la forma más común de encontrarlos) se le conoce como zwitterión, donde se encuentra en una forma dipolar (neutra
con carga dipolar + y -, con una carga global de 0).
La mayoría de los alfa-aminoácidos son aminas primarias, siendo 19 los que comparten esta característica, esto debido a que solo
difieren en la cadena lateral. Solo la prolina es una amina secundaria, pues los átomos de N y del carbono alfa se encuentran
dentro de un anillo.
Clasificación
Existen muchas formas de clasificar los aminoácidos; las tres que se presentan a continuación son las más comunes.
Neutros polares, polares o hidrófilos: serina (Ser, S), treonina (Thr, T), glutamina (Gln, Q), asparagina (Asn, N), tirosina (Tyr, Y),
cisteína (Cys, C).
Neutros no polares, apolares o hidrófobos: alanina (Ala, A), valina (Val, V), leucina (Leu, L), isoleucina (Ile, I), metionina (Met,
M), prolina (Pro, P), fenilalanina (Phe, F), triptófano (Trp, W) y glicina (Gly, G).
Con carga negativa o ácidos: ácido aspártico (Asp, D) y ácido glutámico (Glu, E).
Con carga positiva o básicos: lisina (Lys, K), arginina (Arg, R) e histidina (His, H).
Aromáticos: fenilalanina (Phe, F), tirosina (Tyr, Y), triptófano (Trp, W) y prolina (Pro, P) (ya incluidos en los grupos neutros
polares y neutros no polares).
Según su obtención
A los aminoácidos que deben ser captados como parte de A los aminoácidos que pueden sintetizarse en el propio
los alimentos y no pueden ser sintetizados por el organismo organismo se los conoce como no esenciales y son:
se los llama esenciales. La carencia de estos aminoácidos •Alanina (Ala, A)
en la dieta limita el desarrollo del organismo, ya que no es •Prolina (Pro, P)
posible reponer las células de los tejidos que mueren o •Glicina (Gly, G)
crear tejidos nuevos, en el caso del crecimiento. Para el ser •Serina (Ser, S)
humano, los aminoácidos esenciales son: •Cisteína (Cys, C) **
•Valina (Val, V) •Asparagina (Asn, N)
•Leucina (Leu, L) •Glutamina (Gln, Q)
•Treonina (Thr, T) •Tirosina (Tyr, Y) **
•Lisina (Lys, K) •Ácido aspártico (Asp, D)
•Triptófano (Trp, W) •Ácido glutámico (Glu, E)
•Histidina (His, H) * •Selenocisteína (Sec, U)
•Fenilalanina (Phe, F) •Pirrolisina (Pyl, O)
•Isoleucina (Ile, I)
•Arginina (Arg, R) *
•Metionina (Met, M)
Estas clasificaciones sobre aminoácidos esenciales varían según la especie. Se han aislado cepas de bacterias con requerimientos
diferentes de cada tipo de aminoácido. Para algunos aminoácidos hay dudas sobre si son esenciales en algunas especies, según
diferentes autores.
Según la ubicación del grupo amino
•Alfa-aminoácidos: El grupo amino está ubicado en el carbono n.º 2 de la cadena, es
decir el primer carbono a continuación del grupo carboxilo (históricamente este
carbono se denomina carbono alfa). La mayoría de las proteínas están compuestas
por residuos de alfa-aminoácidos enlazados mediante enlaces amida (enlaces
peptídicos).
•Beta-aminoácidos: El grupo amino está ubicado en el carbono n.º 3 de la cadena, es
decir en el segundo carbono a continuación del grupo carboxilo.
•Gamma-aminoácidos: El grupo amino está ubicado en el carbono n.º 4 de la cadena,
es decir en el tercer carbono a continuación del grupo carboxilo.
Aminoácidos codificados en el genoma
Los aminoácidos proteicos, canónicos o naturales son aquellos que están codificados en el
genoma; para la mayoría de los seres vivos son 20: alanina, arginina, asparagina, aspartato,
cisteína, fenilalanina, glicina, glutamato, glutamina, histidina, isoleucina, leucina, lisina,
metionina, prolina, serina, tirosina, treonina, triptófano y valina.
Sin embargo, hay excepciones: en algunos seres vivos el código genético tiene pequeñas
modificaciones y puede codificar otros aminoácidos. El aminoácido número 21 es la
selenocisteína, que aparece tanto en eucariotas como procariotas y arqueas, y el número 22 es
la pirrolisina que aparece solo en arqueas.3 4 5
Aminoácidos modificados
Modificaciones postraduccionales de los 20 aminoácidos codificados genéticamente conducen a la formación de más de 100
derivados de los aminoácidos. Las modificaciones de los aminoácidos juegan con frecuencia un papel de gran importancia en
la específica funcionalidad de una proteína.
Son numerosos los ejemplos de modificación postraduccional de aminoácidos. La formación de puentes disulfuro, claves en la
estabilización de la estructura terciaria de las proteínas, está catalizada por una disulfuro-isomerasa. En las histonas tiene
lugar la metilación de las lisinas. En el colágeno abunda el aminoácido 4-hidroxiprolina, que es el resultado de la hidroxilación
de la prolina. La metionina inicial de todos los polipéptidos (codificada por el codón de inicio AUG) casi siempre se elimina por
proteólisis.6
Algunos aminoácidos no proteicos tienen función propia, por ejemplo como neurotransmisores o vitaminas. Por ejemplo, la
beta-alanina o el ácido gamma-aminobutírico (GABA). Existen muchos aminoácidos no proteicos que juegan papeles distintos
en la naturaleza y pueden provenir o no de aminoácidos
Ejemplos de estos aminoácidos no proteínicos son:
•Norvalina •Quinurenina
•Sarcosina •Norleucina •Nicotianina
•Etilglicina o ácido α- •Ciclopentenilglicina •Ácido 2-azetidincarboxílico
•beta-alanina •β-(4-hidroxibenzotiazol-6-il)alanina
aminobutírico (AABA)
•Ácido djencólico •Ácido gamma-aminobutírico •β-(2-metil-4-hidroxibenzotiazol-6-il)-alanina
•Hipoglicinas A y B •Ácido iboténico •Indospicina
•Mimosina •Ácido pipecólico •Nε-(indol-3-acetil)lisina
•Aliina •Ácido guanidinacético •(p-hidroximetil)fenilalanina
•Canalina •Taurina •0-etil-L-homoserina, aislada de
•Canavanina •Ácido trans-2-amino-5-cloro-4-hexenoico Corynebacterium ethanolaminophilum
•Ornitina •Ácido trans-2-amino-5-cloro-6-hidroxi-4-hexe
•5-Hidroxitriptófano
noico
•Homometionina •Ácido licopérdico, aislado de Lycoperdon
•Ácido 2-amino-4-cloro-4-pentenoico
•Homoserina perlatum
•Ácido diaminopimélico
•Homoarginina •Ácido lentínico
•Semialdehído aspártico
•Homofenilalanina •Ácido estizolobínico
•Semialdehído glutámico
•Homocisteína •Ácido estizolóbico
•Citrulina
•Homoleucina •Tiroxina
•DOPA
•Cistationina •Azoxibacilina
Reacciones de los aminoácidos
Los aminoácidos sufren en los seres vivos tres reacciones principales que se inician cuando un
aminoácido se une con el fosfato de piridoxal formando una base de Schiff o aldimina. De ahí en
adelante la transformación depende de las enzimas, que tienen en común el uso del fosfato de
piridoxal como coenzima. Las reacciones que se desencadenan pueden ser:
1.La transaminación, que necesita la participación de un α-cetoácido;
2.La descarboxilación;
3.La racemización, que es la conversión de un compuesto L en D, o viceversa. Aunque en las proteínas
los aminoácidos están presentes únicamente en la configuración L, en las bacterias podemos
encontrar algunos D-aminoácidos formando parte de péptidos pequeños.
Cadena de transporte de electrones
La cadena de transporte de electrones es una serie de mecanismos de electrones que se encuentran en la
membrana plasmática de bacterias, en la membrana interna mitocondrial o en las membranas tilacoidales, que
mediante reacciones bioquímicas producen trifosfato de adenosina (ATP), que es el compuesto energético que
utilizan los seres vivos. Solo dos fuentes de energía son utilizadas por los organismos vivos: reacciones de
reducción-oxidación y la luz solar (fotosíntesis). Los organismos que utilizan las reacciones redox para producir
ATP se les conoce con el nombre de quimioautótrofos, mientras que los que utilizan la luz solar para tal evento se
les conoce por el nombre de fotoautótrofos. Ambos tipos de organismos utilizan sus cadenas de transporte de
electrones para convertir la energía en ATP.
Conceptos generales
La misión de la cadena transportadora de electrones es la de crear un gradiente electroquímico que se
utiliza para la síntesis de ATP. Dicho gradiente electroquímico se consigue mediante el flujo de
electrones entre diversas sustancias de esta cadena que favorecen en último caso la translocación de
protones que generan el gradiente anteriormente mencionado. De esta forma podemos deducir la
existencia de tres procesos totalmente dependientes:
•un flujo de electrones desde sustancias individuales;
•un uso de la energía desprendida de ese flujo de electrones que se utiliza para la translocación de
protones en contra de gradiente, por lo que energéticamente estamos hablando de un proceso
desfavorable;
•un uso de ese gradiente electroquímico para la formación de ATP mediante un proceso favorable
desde un punto de vista energético.
Antecedentes
Las reacciones redox son reacciones químicas en las cuales los electrones son transferidos desde
una molécula donadora hacia una molécula aceptora. La fuerza que conduce a esta clase de
reacciones es la energía libre de Gibbs de los reactivos y los productos. La energía libre de Gibbs
es la energía disponible para realizar un trabajo. Ninguna reacción que incremente la energía
libre de Gibbs total de un sistema se realizará de forma espontánea.
El transporte de electrones se realiza mediante reacciones que son termodinámicamente favorables, y han sido acopladas a
reacciones que termodinámicamente no lo son, como por ejemplo son la separación de carga, la creación de un gradiente
osmótico o el cootransporte. De esta forma, la energía libre del sistema baja y hace posible que el proceso se lleve a cabo. Las
macromoléculas biológicas que catalizan este tipo de reacciones desfavorables, termodinámicamente hablando, se han
encontrado en todas las formas de vida conocidas, y solo realizan estas funciones si y solo si están acopladas a reacciones
termodinámicas favorables y que ocurran a la vez de las que no lo son.
La cadena de transporte de electrones produce energía para la formación de un gradiente electroquímico, es decir se utiliza ese
flujo para el transporte de sustancias a través de membrana. Este gradiente se utiliza para realizar, posteriormente un trabajo
mecánico, como puede ser la rotación de un flagelo bacteriano o la síntesis de ATP, que es imprescindible para un organismo.
Esta cadena también consiste en una serie de transportadores que actúan secuencialmente, los cuales son generalmente
proteínas integrales de membrana con grupos prostéticos capaces de aceptar y/o donar 1 o 2 electrones.
El ATP también se puede obtener de otras formas, como por ejemplo en la fosforilación a nivel de sustrato. Existen organismos
que obtienen el ATP exclusivamente mediante fermentación, pero en la mayoría de los casos la generación de grandes
cantidades de ATP se realiza a través de cadenas de transportes de electrones.
Cadenas de transporte de electrones en mitocondrias[editar]
Las células de la mayoría de eucariotas contienen orgánulos intracelulares conocidos con el nombre de mitocondrias que
producen ATP. Las fuentes de energía como la glucosa son inicialmente metabolizados en el citoplasma y los productos
obtenidos son llevados al interior de la mitocondria donde se continua el catabolismo usando rutas metabólicas que
incluyen el ciclo de los ácidos tricarboxílicos, la beta oxidación de los ácidos grasos y la oxidación de los aminoácidos.
El resultado final de estas rutas es la producción de dos donadores de electrones: NADH y FADH2. Los electrones de estos
dos donadores son pasados a través de la cadena de electrones hasta el oxígeno, el cual se reduce para formar agua. Esto es
un proceso de múltiples pasos que ocurren en la membrana mitocondrial interna. Las enzimas que catalizan estas
reacciones tienen la notable capacidad de crear simultáneamente un gradiente de protones a través de la membrana,
produciendo un estado altamente energético con el potencial de generar trabajo. Mientras el transporte de electrones
ocurre con una alta eficiencia, un pequeño porcentaje de electrones son prematuramente extraídos del oxígeno, resultando
en la formación de un radical libre tóxico: el superóxido. En los últimos años se ha descubierto que los complejos de la
cadena de transporte de electrones suelen juntarse unas con otras formando estructuras proteínicas mayores que se
nombran supercomplejos respiratorios.
.
Estos supercomplejos suelen estar formados únicamente por los complejos I, III y IV en plantas, mientras que en
mamíferos se les han encontrado en conjunto con complejo II también. Se ha propuesto que la función de la formación de
los supercomplejos respiratorios es la canalización de los electrones a través de los complejos I, III y IV, con la finalidad de
agilizar el transporte de electrones, regular la formación de radicales de oxígeno o incrementar la eficiencia de producción
de ATP por medio de la exclusión de la alternativa oxidasa o de las NAD(P)H dehidrogenasas del tipo II del transporte de
electrones. De esta forma únicamente las proteínas que tienen la capacidad de transportar protones a través de la
membrana interna de las mitocondrias y que por lo mismo contribuyen a la formación del gradiente electroquímico para
la producción de ATP estarían incluidas en la estructura de los supercomplejos.
El parecido entre las mitocondrias intracelulares y las bacterias de vida libre es altísimo. El conocimiento de la estructura,
la funcionalidad y las similitudes en el ADN entre mitocondrias y las bacterias prueban fuertemente el origen
endosimbiótico de las mitocondrias. Es decir, hay fuertes pruebas que indican que las células eucarióticas primitivas
incorporaron bacterias, que debido a las fuerzas selectivas de la evolución se han trasformado en un orgánulo de estas
Transportadores redox mitocondriales
Se han identificado cuatro complejos enzimáticos unidos a membrana interna mitocondrial. Tres
de ellos son complejos transmembrana, que están embebidos en la membrana interna, mientras
que el otro está asociado a membrana. Los tres complejos transmembrana tienen la capacidad
de actuar como bombas de protones. El flujo de electrones global se esquematiza de la siguiente
forma:
NADH → Complejo I → Q → Complejo III → Citocromo c → Complejo IV → H2O
↑
Complejo II
Complejo I
El complejo I o NADH deshidrogenasa o NADH:ubiquinona oxidoreductasa (EC 1.6.5.3) capta dos electrones del NADH y los
transfiere a un transportador liposoluble denominado ubiquinona (Q). El producto reducido, que se conoce con el nombre de
ubiquinol (QH2) puede difundir libremente por la membrana. Al mismo tiempo, el Complejo I transloca cuatro protones a través
de membrana y produce un gradiente de protones.
El NADH es oxidado a NAD+, y reduce al FMN a FMNH2 en un único paso que implica a dos electrones. El siguiente
transportador de electrones es un centro Fe-S que solo puede aceptar un electrón y trasferirlo a la ubiquinona generando una
forma reducida, denominada semiquinona. Esta semiquinona vuelve a reducirse con el otro electrón que quedaba, generando
el ubiquinol, QH2. Durante este proceso, cuatro protones se translocan a través de la membrana interna mitocondrial, desde la
matriz hacia el espacio intermembrana.
Complejo II
El Complejo II o succinato deshidrogenasa; [1] EC 1.3.5.1 no es una bomba de protones. Además es la única enzima del ciclo
de Krebs asociado a membrana. Antes de que este complejo actúe, el FADH2 se forma durante la conversión de succinato en
fumarato en el ciclo del ácido cítrico. A continuación los electrones son transferidos por medio de una serie de centros FeS
hacia Q. EL glicerol-3-fosfato y el acetil-CoA también transfieren electrones a Q mediante vías diferentes en que participan
flavoproteínas.
Complejo III
El complejo III o complejo citocromo bc1; EC 1.10.2.2, obtiene dos
electrones desde QH2 y los transfiere a dos moléculas de citocromo c,
que es un transportador de electrones hidrosoluble que se encuentra
en el espacio intermembrana de la mitocondria. Al mismo tiempo,
transloca cuatro protones a través de la membrana por los dos
electrones transportados desde el ubiquinol.
Complejo IV
El complejo IV o citocromo c oxidasa; EC 1.9.3.1 capta cuatro electrones
de las cuatro moléculas de citocromo c y se transfieren al oxígeno (O2),
para producir dos moléculas de agua (H2O). Al mismo tiempo, se
translocan cuatro protones al espacio intermembrana, por los cuatro
electrones. Además "desaparecen" de la matriz 2 protones que forman
parte del H2O
Acoplamiento con la fosforilación
oxidativa
La hipótesis del acoplamiento quimiosmótico, lo que el valió el Premio Nobel de Química a Peter D. Mitchell, explica que la
cadena de transporte de electrones y la fosforilación oxidativa están acopladas por el gradiente de protones. El flujo de
protones crea un gradiente de pH y un gradiente electroquímico. Este gradiente de protones es usado por la ATP sintasa para
formar ATP vía la fosforilación oxidativa. La ATP sintasa actúa como un canal de iones que "devuelve" los protones a la matriz
mitocondrial. Durante esta vuelta, la energía libre de Gibbs producida durante la generación de las formas oxidadas de los
transportadores de electrones es liberada. Esta energía es utilizada por la síntesis de ATP, catalizada por el componente F1 del
complejo FOF1 ATP sintasa.
El acoplamiento con la fosforilación oxidativa es un paso clave en la producción de ATP. Sin embargo, en ciertas ocasiones
desacoplarlo puede tener usos biológicos. En la membrana interna mitocondrial de los tejidos adiposos marrones existe una
gran cantidad de termogenina, que es una proteína desacopladora, que actúa como una vía alternativa para el regreso de los
protones a la matriz. Esto resulta en consumo de la energía en termogénesis en vez de utilizarse para la producción de ATP. Esto
puede ser útil para generar calor cuando sea necesario, por ejemplo en invierno o durante la hibernación de ciertos animales.
También se conocen desacoplantes sintéticos como el caso del 2,4-dinitrofenol, que se ha usado como pesticida, debido a su
alta toxicidad.
Resumen
La cadena de transporte de electrones mitocondrial utiliza electrones desde un donador ya sea
NADH o FADH 2 y los pasa a un aceptor de electrones final, como el O2, mediante una serie de
reacciones redox. Estas reacciones están acopladas a la creación de un gradiente de protones
generado por los complejos I, III y IV. Dicho gradiente es utilizado para generar ATP mediante la
ATP sintasa.
Las reacciones catalizadas por los complejos I y III están en equilibrio. Las concentraciones de
reactivos y productos son aproximadamente los mismos. Esto significa que estas reacciones son
reversibles al incrementar la concentración de producto.
Cadena transportadora de electrones en
bacterias
En eucariotas, el NADH es el donador de electrones más importante. En procariotas, es decir bacterias y arqueas la
situación es algo más complicada, debido a que hay un gran número de donante de electrones y un gran número
de aceptores. Si generalizamos el transporte en bacterias este podría quedar de la siguiente forma:
Donador Donador Donador
↓ ↓
Aceptor Aceptor
Es posible que los electrones entren a la cadena en tres niveles: un nivel en donde participa una deshidrogenasa,
otro en la que actúa un reservorio de quinonas, o en un nivel en el que actúa un transportador móvil como es el
citocromo. Estos niveles corresponden a sucesivos potenciales redox más positivos o sucesivas bajadas de las
diferencias en el potencial relativo en los aceptores de electrones. En otras palabras, corresponden a cambios cada
vez menores en la energía libre de Gibbs.
Las bacterias pueden usar múltiples cadenas de transporte de electrones, e incluso
simultáneamente. Las bacterias pueden usar varios donadores diferentes de electrones. Por
ejemplo, Escherichia coli, cuando crece en condiciones aeróbicas usando glucosa como
fuente de energía, usa dos NADH deshidrogenasas diferentes y dos quinol oxidasas
diferentes, un total de cuatro cadenas de transporte que funcionan simultáneamente.
Las bacterias también generan un gradiente de protones, para ello utilizan al menos tres
bombas de protones, al igual que las mitocondrias, aunque se han descrito casos en los que
solo existen dos o incluso una. Evidentemente siempre tiene que existir al menos una bomba
de protones para poder generar el gradiente electroquímico, que es esencial para la
generación de ATP
Donadores de electrones
En la biosfera actual, los donadores de electrones más comunes son las moléculas orgánicas. Los
organismos que usan moléculas orgánicas como fuente de energía son conocidos como
organotrofos. Sin embargo, existen procariotas que son capaces de utilizar fuentes inorgánicas
como fuente de energía y se les conoce por ello con el nombre de litotrofos. Estos donadores
inorgánicos incluyen al hidrógeno, al monóxido de carbono, el amonio, el nitrito, sulfuro, y el ion
ferroso. Los litotrofos se han observado creciendo en formaciones de rocas a centenares de
metros bajo la superficie de la Tierra.
Las bacterias anaeróbicas no pueden utilizar el oxígeno como aceptor final de los electrones, por
lo que requieren reductasas especializadas para cada una de los aceptores. Escherichia coli
puede usar, por ejemplo, una fumarato reductasa, la nitrato reductasa, la nitrito reductasa o la
DMSO reductasa dependiendo de si existen esos aceptores en el medio en el que estás
creciendo.
Aceptores de electrones
Al igual que existen un gran número de donadores de electrones, también existen un gran
número de aceptores que pueden ser de ambos tipos, es decir de origen orgánico o inorgánico.
Si el oxígeno está disponible, se usará como aceptor, ya que genera mayor producción
energética. En los ambientes anaeróbicos, se puede utilizar NO3-, NO2-, Fe3+, SO42-, CO2 y
pequeñas moléculas orgánicas como por ejemplo el fumarato.
Resumen
En general, las cadenas de transporte de electrones bacterianas son inducibles. Según el medio
en el que estén creciendo, las bacterias sintetizarán distintos complejos transmembranas que
producirán diferentes transportes en sus membranas.
Cadena de transporte de electrones
fotosintética
En la fosforilación oxidativa, los electrones se transfieren desde un donador de electrones de
alta energía hasta un aceptor a través de una cadena de transporte de electrones. En la
fotofosforilación, se usa la energía de la luz solar para crear un donador de electrones altamente
energético y un aceptor de esos electrones. Los electrones se transfieren desde el donador
hasta el aceptor a través de una cadena de transporte totalmente diferente a la que se observa
en las mitocondrias.