Asimilacion del nitrogeno

Asimilacion del nitrogeno

 El nitrógeno está presente en dos grandes grupos en función de su

naturaleza química:
• Nitrógeno orgánico: Está presente en moléculas orgánicas complejas
como las proteínas, chitinas y peptidoglicanos, que necesitan ser
degradadas en moléculas más pequeñas para ser asimiladas (como por
ejemplo, en forma de aminoácidos).
• Nitrógeno inorgánico: Esencialmente bajo la forma de amonio y nitrato.
Estos compuestos son directamente asimilables por los microorganismos y
por las plantas.
 La fuente de nitrógeno más fácilmente asimilable por los microorganismos
es el amonio, seguida por moléculas orgánicas como el glutamato y la
glutamina.
 Según esto, podemos ver dos mecanismos principales de asimilación y
transformación del nitrógeno: la vía directa (asimilación de pequeñas
moléculas orgánicas solubles como aminoácidos) y la vía de la
mineralización-inmobilización (MIT, que necesita de la transformación del
nitrógeno orgánico en moléculas inorgánicas asimilables como el amonio
o el nitrato).

 Tipos de enzimas extracelulares:
 Así, podemos encontrar dos grandes grupos de enzimas extracelulares que excretan al
medio para degradar la materia orgánica y así, liberar los compuestos que contienen
nitrógeno:
 – Depolimerasas extracelulares: Estas enzimas fundamentalmente se encargan de la
degradación de grandes moléculas orgánicas con nitrógeno y como ejemplos más
característicos encontramos las proteasas, las chitinasas y las peptidoglicanasas.
 – Enzimas extracelulares de mineralización: Estas enzimas se encargan de transformar los
compuestos que generan las anteriores resultando finalmente, moléculas más simples
como amonio o nitrato. Como ejemplos más característicos encontramos las ureasas y
las aminoácido oxidasas.
 Finalmente, también los microorganismos poseen otro tipo de enzimas no extracelulares
(es decir, dentro de las células) implicadas en la asimilación directa del nitrógeno como la
glutamina sintetasa, glutamato sintetasa (GS/GOGAT) y la glutamato deshidrogenasa
(GDH) para el caso del amonio y la nitrato y nitrito reductasa para el caso del nitrato.
 ¿Cómo saben los microorganismos qué enzimas utilizar (y/o excretar)?
 Que un microorganismo excrete al medio uno u otro tipo de enzimas
dependerá fundamentalmente del proceso conocido como la “regulación
por nitrógeno”. Producir las enzimas tiene un coste energético y metabólico
para el microorganismo y la decisión dependerá fundamentalmente de las
necesidades del medio, es decir, si hay abundancia de moléculas
orgánicas nitrogenadas y muy poco amonio, el microorganismo producirá
enzimas de tipo depolimerasas y viceversa. Por lo tanto, que el
microorganismos produzca y excrete este tipo de enzimas dependerá de
las necesidades de asimilación del nitrógeno y de su forma en el suelo.
 ¿Qué hace que una vía predomine sobre la otra? Parece ser que hay tres
grandes factores involucrados en esta cuestión como son la cantidad de
nitrógeno disponible (amonio o pequeñas moléculas orgánicas como
los aminoácidos), la fuente del carbono (si son moléculas orgánicas más
complejas como los carbohidratos o más sencillas como azúcares, o
aminoácidos) y la relación entre el carbono y el nitrógeno.
 El último factor es muy interesante ya que regula los otros dos. Así, valores mayores
de 40 en la relación C/N de un suelo (mucho carbono por unidad de nitrógeno) se
traduce en el fenómeno conocido como “inmobilización del nitrógeno” (es decir,
que no está directamente disponible para el microorganismo ya que
presumiblemente el nitrógeno formará parte de grandes moléculas orgánicas).
Valores menores de 20 se traducen en una “mineralización de nitrógeno” (es decir,
que hay poco carbono por unidad de nitrógeno debido a que las
moléculas orgánicas grandes que contienen el nitrógeno se están transformando en
otras mucho más pequeñas). Finalmente, valores entre 20 y 40 son los ideales para
que haya una máxima asimilación del nitrógeno (y también de carbono) por parte
de lo microorganismos presentes en un suelo.