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VARIACIONES EN LA

ESTRUCTURA DEL DNA


MARCO ANTONIO GALARZA GONZALEZ 1741080
JONATHAN ALEXIS SILVA RANGEL 1735515
• Las variaciones de el DNA sobre la
VARIACIONES doble hebra mantienen la forma
EN LA DOBLE general de la estructura genética, pero
HEBRA tienen ciertas diferencias que las
hacen distintas.
FORMA A
• Esta forma surge a partir de la deshidratación de la
estructura de B-DNA original por debajo de un 75% de
humedad.
• No se ha encontrado bajo condiciones fisiológicas, pero
si en disoluciones deshidratantes.
• Es mas corta, mas ancha y con mas bases por vuelta
que el B-DNA
FORMA Z
• A diferencia de las estructuras A-DNA y B-DNA, la Z-DNA, gira hacia el
lado izquierdo
• Se descubrió accidentalmente en 1970, pero solo en 2018 se descubrió
que causaba la transformación, siendo el uso de la proteína
hZαADAR1.
• Se cree que tiene funciones de expression genetica y replicacion en los
seres vivos, pero esto es debatido.
• Es mas estrecha, mas larga y con mayor numero de bases por vuelta a
comparación de B-DNA.
A-DNA B-DNA Z-DNA
Sentido de giro Dextrogiro Dextrogiro Levogiro
(Derecha) (Derecha) (Izquierda)
Anti: Bases
nitrogenadas Forma y tamaño Mas ancha, mas Intermedia Mas estrecha y
orientadas corta larga
alejadas del Diámetro de hélice 2,55 nm 2,37 nm 1,64 nm
anillo de
Distancia entre 0,23 nm 0,34 nm 0,38 nm
pentosa
bases
Sin: Solo las Pares por vuelta 11 10,4 12
piramidinas Longitud de vuelta 25,3 nm 34,6 nm 4,56 nm
se alejan, las de hélice
purinas sobre
Inclinación de las 19º 1,2º 9º
la pentosa
pares de bases
Surco mayor Estrecho, profundo Ancho, Plano, sin
profundidad media profundidad
Surco menor Amplio, no Estrecho, Estrecho, profundo
profundo profundidad media
Enlace N-glicosidico Anti Anti Sin
CURVATURA DE LA DOBLE HÉLICE
• En secuencias los pares de bases no son
VARIANTES
exactamente coplanares, lo que
LOCALES DE LA ocasionaría una desviación del eje de la
ESTRUCTURA doble hélice.

SECUNDARIA • La curvatura no se origina por una


secuencia particular de nucleótidos,
DEL B-DNA sino que es forzada por la unión de una
proteína a la cadena de DNA.
SECUENCIAS PALINDRÓMICAS
• Son regiones en el DNA en donde la
secuencia de una hebra es leída de
izquierda a derecha, es igual que la de la
otra hebra, leída de derecha a izquierda.

• Son llamados palíndromos interrumpidos


donde una secuencia separa las dos
mitades del palíndromo y actúa como el
centro de simetría no puntual.
REPETICIONES DE SECUENCIA
• Repeticiones invertidas: cuando se leen en
sentidos opuestos, las dos mitades tienen
la misma secuencia.

• Repeticiones directas: cuando en el DNA


hay repetición de secuencia leída en el
mismo sentido.

• Repeticiones especulares: cuando la


secuencia se repite de forma invertida
dentro de la misma hebra.
FUNCIONALIDAD DE LOS PALINDROMOS
• Actúan como señales de
reconocimiento a las que se unen
numerosas proteínas reguladoras, con
estructuras diméricas que permiten
unirse de forma simétrica a ambas
mitades del palíndromo.
CONSECUENCIAS ESTRUCTURALES DE LOS PALÍNDROMOS
• En ácidos nucleicos de hebra sencilla: la
hebra sencilla de DNA o RNA pueden
plegarse sobre sí mismas formando una
estructura en horquilla.
• En DNA de doble hebra: las hebras del
palíndromo pueden separarse y
reasociarse de orta forma, dando lugar
a horquillas o crucuformes (dos bucles).
H-DNA: TRIPLE HÉLICE

• En condiciones normales, las secuencias se


encuentran apareadas sin alteración en la doble
hélice.

• Parte de la doble hélice se abra y la región rica en


C y T se repliegue y aparee con la otra hebra (AG)
mediante enlaces de Hoogsteen en una zona
donde aún forma doble hélice.
MOTIVOS • Un motivo es una secuencia de
ESTRUCTURALES aminoácidos como una proteína, que
RESPONSABLES
se asocia con una cierta función y que
DE LA UNIÓN DEL
esta conservado en secuencias de
DNA CON
PROTEINAS aminoácidos o DNA.
MOTIVO HÉLICE-GIRO-HÉLICE (HTH)

• Se encuentra en proteínas reguladoras de la expresión genética


en virus, procariotas y eucariotas. Regulan la transcripción en
bacterias y virus.

• Esta formado por dos segmentos de péptidos en el α-hélice


separados por una secuencia de aminoácidos flexible. Una de las
α-helices se encaja en el surco mayor del DNA y la otra α-hélice
se una al lado opuesto de le hélice de DNA de la misma manera.
Esto da una estructura en un ángulo casi perpendicular.
MOTIVO HÉLICE-BUCLE-HÉLICE

• Cuenta con dos segmentos α-hélice, sin embargo, el péptido


que los une es mas largo a diferencia de HTH, esto le da
mayor flexibilidad y mas posibilidades de orientación mutua.

• Los motivos HLH (Helix – loop – hélix), se pueden asociar


entre si, creando proteínas dimétricas.

• Un ejemplo famoso es la proteína Max del ratón.


MOTIVO HOMEODOMINIO

• Se puede considerar como una ampliación de HTH,


pero aparece repetidamente con una estructura
idéntica en distintas proteínas a diferencia de HTH.
Además de las dos α-helice similares a la de HTH,
existe una tercera hélice cuyos aminoácidos
interactúan directamente con el DNA.

• Regula el desarrollo embrionario y se ha estudiado


muy a fondo en moscas de Drosophila.
MOTIVO DEDO DE ZINC
• Se encuentra en multitud de proteínas eucarióticas que se
unen al DNA. Son importantes para el funcionamiento de
transcripción TFIIIA y el receptor de estrógenos.

• Esta formado por 30 aminoácidos, de las cuales 2 son


cisteínas y 2 son histidinas que aparecen en posiciones
constantes coordinadas tetradicamente por un ion Zn+2.
Esto permite la unión a la cadena peptídica.

• Generalmente la forma del motivo es tridimensional


alargada en forma de dedo.
MOTIVO CREMALLERA DE
LEUCINA
• Una región de la proteína cuya secuencia tiene un
residuo de leucina cada 7 aminoácidos.

• Dos cadenas peptídicas de este tipo se asocian


hidrofobicamente intercalando sus restos de
leucina similarmente a una cremallera.

• Estas estructuras son de función reguladora para


transcripción de proteínas bZIP

• Son reguladoras del desarrollo

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