Introducción al curso de

BIOQUÍMICA
 ETIMOLOGÍA-DEFINICIÓN

 La palabra bioquímica significa etimológicamente

«química de la vida».
 Ciencia que se ocupa de las bases moleculares de la
vida; por lo tanto, aborda el estudio de la composición
química de la materia viva, la relación estructura-función
de las moléculas características de los seres vivos, así
como las transformaciones químicas que ocurren en ellos
y además, los mecanismos moleculares que intervienen
en la regulación de tales transformaciones.
 PREGUNTAS
4. ¿De que manera
almacena y transmite
PREGUNTAS
la información que
OBJETIVO necesita para crecer y
1. ¿Cuales son las
reproducirse de forma
estructuras
exacta?
Describir la químicas de los
estructura, la componentes de la
5. ¿Qué cambios
materia viva?
organización y las acompañan a la
funciones de la reproducción,
1. ¿De que forma
envejecimiento y a la
materia viva en interactúan estos
muerte celular?
términos componentes?

moleculares 1. ¿ Como extrae

energía de su
entorno?
 HISTORIA DE LA BIOQUÍMICA
Antigüedad clásica - Edad Media

Elementos de Los humores

Empédocles: de Galeno Los Temperamentos

Agua Flema Flemático

Aire Bilis Colérico
Fuego Sangre Sanguíneo
Tierra Bilis Negra Melancólico

La enfermedad es diskrasia (discrasia), esto es:

una mezcla inadecuada de los humores
 Historia de la Bioquímica. continuación
El Renacimiento

Paracelso: Van Helmont:

Unión de Medicina y Alquimia la Yatroquímica
Historia de la Bioquímica. continuación

La Ilustración

- Scheele: los Productos Naturales: ácido

úrico, ácido cítrico, ácido málico, etc.

- Lavoisier: Equivalencia entre respiración

y combustión

- Spallanzani: La digestión como proceso

químico
Historia de la Bioquímica. continuación
El siglo XIX

- Teoría atómica (Dalton)

- Catálisis (Berzelius)

- Las Fermentaciones:
Liebig, Schwann, Pasteur
Historia de la Bioquímica. continuación

Siglo XX, 1900-1950

- Büchner y la fermentación acelular

- Harden y los sistemas acelulares

- Enzimología: Northrop, Künitz, Sumner

- Metabolismo: Embden, Meyerhof, Krebs,

Warburg, Lipmann
 Historia de la Bioquímica. continuación

El siglo XX, 1950-2010

La Biología Molecular:

- Estructura tridimensional del DNA

- Estructura tridimensional de las proteínas

- Genómica
- Proteómica
- Bioinformática
-ERA POST GENÓMICA…..
EL FUTURO INMEDIATO
 Áreas principales de la bioquímica

Bioquímica estructural Metabolismo Genética molecular

1 2 3

• Componentes de la
materia viva Totalidad de la Procesos y sustancias
• Relación de la reacciones químicas que almacenan y
función biológica con que se producen en transmiten
la estructura química la materia viva información biológica
 BIOQUIMICA
CIENCIA INTERDISCIPLINAR

Se relacionan

Genética
Química
Investigación
orgánica
Medica

Biofísica
Microbiología
Biología
Nutrición
Molecular
Raíces de la bioquímica
 ELEMENTOS QUÍMICOS DE LA MATERIA
 Abundantes elementos como C, H, O, N y P.
 Universo primitivo: H y He
 Elementos que se encuentran
en el organismo
 Importancia del agua: abundancia
de H y O.
 El cuerpo humano está formado
en un 70% por agua.
 1° nivel: C, H, O, N tienen fuerte
tendencia a formar enlaces
covalentes.
 Versatilidad del C: estabilidad de
los enlaces C-C y posible
formación de enlaces sencillos,
dobles y triples.
 2° nivel: S y P (enlaces
covalentes); iones Na+, K+ ,Mg+2,
Ca+2, y Cl-.
 3° y 4° nivel: > metales
colaboradores en la catálisis de
las reacciones químicas.
 BIOELEMENTOS SECUNDARIOS
Se encuentra en dos aminoácidos (cisteína y metionina) , presentes en todas las
Azufre
proteínas. También en algunas sustancias como el Coenzima A
Forma parte de los nucleótidos, compuestos que forman los ácidos nucléicos. Forman
parte de coenzimas y otras moléculas como fosfolípidos, sustancias fundamentales de las
Fósforo
membranas celulares. También forma parte de los fosfatos, sales minerales abundantes
en los seres vivos.
Forma parte de la molécula de clorofila, y en forma iónica actúa como catalizador, junto
Magnesio
con las enzimas , en muchas reacciones químicas del organismo.
Forma parte de los carbonatos de calcio de estructuras esqueléticas. En forma iónica
Calcio interviene en la contracción muscular, coagulación sanguínea y transmisión del impulso
nervioso.
Catión abundante en el medio extracelular; necesario para la conducción nerviosa y la
Sodio
contracción muscular
Catión más abundante en el interior de las células; necesario para la conducción nerviosa
Potasio
y la contracción muscular
Anión más frecuente; necesario para mantener el balance de agua en la sangre y fluído
Cloro
intersticial
 OLIGOELEMENTOS

Fundamental para la síntesis de clorofila, catalizador en reacciones químicas y formando parte de

Hierro citocromos que intervienen en la respiración celular, y en la hemoglobina que interviene en el
transporte de oxígeno.
Manganeso Interviene en la fotolisis del agua , durante el proceso de fotosíntesis en las plantas.
Iodo Necesario para la síntesis de la tiroxina, hormona que interviene en el metabolismo
Flúor Forma parte del esmalte dentario y de los huesos.
Cobalto Forma parte de la vitamina B12, necesaria para la síntesis de hemoglobina .
Silicio Proporciona resistencia al tejido conjuntivo, endurece tejidos vegetales como en las gramíneas.
Cromo Interviene junto a la insulina en la regulación de glucosa en sangre.
Zinc Actúa como catalizador en muchas reacciones del organismo.
Actúa sobre neurotransmisores y la permeabilidad celular. En dosis adecuada puede prevenir
Litio
estados de depresiones.
Forma parte de las enzimas vegetales que actúan en la reducción de los nitratos por parte de las
Molibdeno
plantas.
 BIOMOLÉCULAS
• INORGÁNICAS: H2O, O2, CO2
• ORGÁNICAS: Pr, Ac. Nucleicos, HC, L (macromol.)

ESTRUCTURA Y FUNCIÓN DE MACROMOLÉCULAS

POLISACÁRIDOS: polímero de función estructural
(celulosa) o de almacen de energía (glucógeno)
AC. NUCLEICOS: polímeros de 4 nucleótidos con función
en el almacenamiento, transmisión y expresión de la
información genética.
PROTEINAS: combinación de 20 aa. Distintas funciones
(catalítica, estructural, transporte, hormonas, anticuerpos,
receptores.
LIPIDOS: no polimeriza, se asocian. Función estructural o
funcional.
Enlace químico e interacciones no covalentes
Estructura electrónica de algunos elementos
1s 1s 2s 2p 2p 2p
H C
1s 1s 2s 2p 2p 2p
He N
1s 2s 2p 2p 2p 1s 2s 2p 2p 2p
Li O
1s 2s 2p 2p 2p 1s 2s 2p 2p 2p
Be F
1s 2s 2p 2p 2p 1s 2s 2p 2p 2p
B Ne
 Enlaces iónicos

A• + B • A+ + :B-

1. Fuertes (>50 kcal/mol)

2. Propios del estado cristalino
3. Elementos extremos en la Tabla Periódica
 Enlace iónico

Cristal de ClNa
 Enlaces covalentes

1. Compartición de electrones en
orbitales moleculares
2. Estado sólido, líquido y gas
3. Fuertes (>50 kcal/mol)
4. Tantos como orbitales con
electrones desapareados
Hibridación
de orbitales 1s 2s 2p 2p 2p
C
Sin hibridación
1s sp3 sp3 sp3 sp3
C
H3C CH3 sp3: tetraedro
1s sp2 sp2 sp2 2p

C
H2C CH2 sp2: triángulo
1s sp sp 2p 2p
C
HC CH
sp: lineal
Energía de enlaces covalentes, kcal/mol

H-H 103
H-Cl 102
HO-H 119
H2N-H 107
H3C-H 102
 Enlaces de coordinación

Orbital molecular formado por:

- Un orbital vacío
- Un par electrónico

Dador: átomos con pares electrónicos: N, O

Aceptor: orbital vacío (átomos metálicos)
 Interacciones débiles

1. Fuerzas de van der Waals

2. Enlaces de hidrógeno

3. Interacciones iónicas o salinas

 Fuerzas de van der Waals

nRT = PV (Gas perfecto)

nRT = (P + a/V2)(V- b) (Gas real)

a: Atracción intermolecular
b: Volumen de la molécula

1. Dipolos transitorios
2. Dipolos inducidos
3. Dipolos permanentes
Momento dipolar, m

H2 0
Cl2 0
HF 1.91
HCl 1.08
H2O 1.85
NH3 1.47
CH4 0
 Fuerzas de van der Waals

- Son interacciones muy débiles

- En el medio biológico tienen importancia
en ausencia de agua
- Rotas por detergentes
Compuestos hidrofóbicos

Benceno
Colesterol

Decano
 Compuestos polares

L-Arginina
Agua

ATP
D-Glucosa
 Compuesto
anfipático

(Gangliósido GM1)
Bicapa lipídica Micela
 Enlaces de hidrógeno

- Compartición de un protón entre dos pares electrónicos

- Dador: Grupo X-H con cierto momento dipolar
- Aceptor: Grupo Y: con un par electrónico
- Débil (mucho más fuerte que int. de van der Waals)
- Rotas por urea 6M, guanidina 8M
 DNA
conformación B

Estructura
mantenida por
enlaces de H
Par Adenina-Timina

H
N N H O CH3

N N H N
R
N N
O R
Par Guanina-Citosina

H
N O H N

N N H N
R
N
N H O R
H
Proteínas: Estructura en a-hélice

Ca
O
N
C
H
Ca Ca
O
N
C
H
Ca
Proteínas:
Estructura en hoja plegada

Ca
O
N
C
H
Ca Ca
O
N
C
H
Ca
 Interacciones iónicas o salinas
(No confundir con enlace iónico)

- Entre grupos de carga opuesta en solución

- Débiles (más fuertes que int. de van der Waals)
- Los iones participantes aparecen solvatados
- Rotas por altas concentraciones salinas, extremos de pH
Solvatación de iones en solución
Nucleosoma: Asociación
DNA-histonas
El Agua
Calores de vaporización, DHvap (cal/g)

Agua 540
Metanol 263
Etanol 204
n-Propanol 164
Acetona 125
Hexano 101
Benceno 94
Cloroformo 59
Constante dieléctrica a 20ºC, D

Agua 80
Metanol 33
Etanol 24
Acetona 21.4
Benceno 2.3
Hexano 1.9
 Punto Punto
fusión, ºC ebullición, ºC
Agua 0º 100º
Metanol -98º 65º
Etanol -117º 78º
n-Propanol -127º 97º
Acetona -95º 56º
Hexano -98º 69º
Benceno 6º 80º
Cloroformo -63º 61º
 Punto Punto
fusión, ºC ebullición, ºC
HCl -114.24º -85.06º
H2O 0º 100º
H 3N -77.73º -33.34º
H 4C -182.47º -161.45º
Constante dieléctrica a 20ºC, D

HCl 4.12
H2O 80.0
H3N 18.9
H4C 1.7
 Agua

1s 2s 2p 2p 2p

1s sp3 sp3 sp3 sp3

Estructura electrónica
0.0965 nm H
del oxígeno
O 104.5º

0.0965 nm
H
Enlaces de hidrógeno en el agua

H H
O
H
O
H H H
O H O
H O H
H
Estructura del hielo
Producto iónico del agua

H 2O H+ + OH-

[H+][OH-]
Kd =
[H2O]

Kd[H2O] = [H+][OH-] = 10-14

Ácidos y Bases
Ácidos y Bases (teoría de Bronsted-Lowry)

Ácido: especie química que tiende a

ceder protones

Base: especie química que tiende a

aceptar protones

AH A - + H+
B + H+ BH+
 Base
Ácido
conjugada

Ác. Clorhídrico HCl Cl-

Ác. Fórmico H-COOH H-COO-
Ác. Acético CH3-COOH CH3-COO-
Ác. Carbónico:
Disociación 1 H2CO3 HCO3-
Disociación 2 HCO3- CO32-
Ác. Fosfórico:
Disociación 1 H3PO4 H2PO4-
Disociación 2 H2PO4- HPO42-
Disociación 3 HPO42- PO43-
Amoníaco NH4+ NH3
Metilamina CH3NH3+ CH3NH2
Ácidos y Bases (teoría de Lewis)

Bases: grupos moleculares con pares

electrónicos libres (nucleófilos)

Ácidos: grupos moleculares con afinidad

hacia pares electrónicos libres (electrófilos)
AH A- + H+ Ecuación de
[A-][H+] Henderson-
Ka =
[AH] Hasselbach
[A-]
logKa = log [H+] + log
[AH]
-log [H+] = -logKa + log [A-]
[AH]

[base]
pH = pKa + log
[ácido]
Producto iónico del agua

H 2O H+ + OH-

[H+][OH-]
Kd =
[H2O]

Kd[H2O] = [H+][OH-] = 10-14

Concepto de pH

- Logaritmo cambiado de signo de

la concentración de hidrogeniones

- Dado el producto iónico del agua,

[H+][OH-] = 10-14
la neutralidad ácido-base tiene lugar cuando
[H+] = [OH-] = 10-7 ; pH = 7

- Medio ácido: pH < 7 Medio básico: pH > 7

 Concepto de pKa
- Logaritmo cambiado de signo de la constante de equilibrio de
disociación de un ácido de Bronsted

- Es propio de un grupo, no de una molécula

- Cuando pH = pKa, [ácido] = [base]

- La capacidad tampón es máxima en las proximidades del pKa

- Un ácido es tanto más fuerte cuanto más bajo es su pKa; una

base es tanto más fuerte cuanto más alto es su pKa.
pKa de algunos sistemas ácido-base

Ác. Fórmico 3.75

Ác. Acético 4.76
Ác. Fosfórico:
Disociación 1 2.14
Disociación 2 7.20
Disociación 3 12.40
Amoníaco 9.25
Metilamina 10.60
 Titulación de ácido acético
CH3 COOH CH3 COO- + H+
9

CH3 COO-
7

6
pH

5
pKa
4

2 CH3 COOH

1
0 1

Base añadida
 Titulación de un aminoácido

16

14 R CH COO-
12 NH2
10
pKN
8
pH

6
R CH COO-

4
NH3+

2
R CH COOH pKC
0
NH3+
0 1 2

Base añadida
 Titulación de ácido acético
Comportamiento tampón
9

6
pH

1
0 1

Base añadida
Sistema carbónico-bicarbonato

CO2 + H2O H2CO3 HCO3- + H+

- pKa relativamente alejado del pH

fisiológico
- Ácido: [CO2] Base: [HCO3-]
- [CO2]: regulado por la respiración
- [HCO3-]: regulado por excreción renal
 Sistema de los fosfatos

- -- ---
H3PO4 H2PO4 HPO4 PO4

- La segunda disociación tiene un pKa adecuado

al tamponamiento fisiológico, pero su concentración
es relativamente baja.
Sistema de las proteínas

- Las proteínas tienen una gran cantidad de grupos

disociables que contribuyen a su capacidad tampón.
- Es un sistema de gran capacidad
- Son particularmente eficientes como tampones las
proteínas ricas en el aminoácido histidina
H O H O
N C N C
CH CH
CH2 CH2 + H+

NH N
HN HN
 SOLUCIONES TAMPÓN O AMORTIGUADORAS
Mantienen el pH fisiológico

Están formados por ácidos débiles y sus bases conjugadas

Tampón bicarbonato: mantiene el pH de los

líquidos intercelulares en valores próximos a 7,4

ión bicarbonato ácido carbónico

OTROS TAMPONES FISIOLÓGICOS

H2PO4-/HPO42- (pKa = 6,86) Mantiene el pH intracelular
Proteínas (pKa próximo a 7)
NH4+/NH3 Tampona la orina
 CASO CLINICO
 Una mujer de 36 años de edad había padecido anorexia
nerviosa durante 10 años. Fue ingresada en el Hospital
para su estudio y tratamiento. La paciente tenía una
estatura de 165 cm y pesaba 32,9kg, lo cual supone
aproximadamente un 40% menos del peso ideal para esa
estatura. Llevaba una vida sedentaria y se mostraba
deprimida. Su valor de hemoglobina era de 9 g/dl, lo cual
indica que estaba anémica.
 CASO CLINICO
 Fue sometida a alimentación por sonda nasogástrica con
3l/d de una solución nutriente que proporcionaba 1000 cal
y contenía proteínas en forma de homogenizado, grasa
en forma de triglicéridos y carbohidratos en forma de una
mezcla de almidón y sacarosa. La solución contenía una
mezcla de vitaminas y minerales, suplementados además
con 0,16mmol/l de hierro,1mg de riboflavina y 1mg de
niacina.
 CASO CLINICO
 El tratamiento no dio lugar a complicaciones y, sobre la
base de un balance nitrogenado positivo,se llegó a la
conclusión de que los nutrientes aportados estaban
siendo utilizados para la síntesis tisular. Al cabo de 21
días la paciente había ganado 9,7kg de peso
 PREGUNTAS

 ¿A qué se debe la ganancia de peso de la paciente?

 PREGUNTAS

 ¿Podría utilizarse la misma solución nutritiva si fuera

necesario tratar a esta paciente con nutrición parenteral
(hiperalimentación)?
 PREGUNTAS

 ¿Por qué se añadió un suplemento de hierro a la solución

nutritiva?