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PROTEÍNAS:

NIVELES DE ORGANIZACIÓN,
PROPIEDADES Y CLASES
Prof. Cruz Briceño M.
Departamento de Morfología Humana- UNT
PROTEINAS
• Las proteínas son sustancias orgánicas
nitrogenadas complejas, polímeros aminoácidos,
que se pliegan en una notable diversidad de
formas tridimensionales, que les proporciona una
correspondiente variedad de funciones
ESTRUCTURA FUNCION
Absorción
Nutrición
Secreción
Reproducción
Respiración
Conductividad
Excreción :
Contractilidad
Irritabilidad
Movimiento
Transporte

PROTEINAS
PROTEINAS: ESTRUCTURA
• UNIDADES MONOMERICAS: Aminoácidos
Propiedades F/Q:
- Pta C asimétrico
(no Gly)
- Anfóteros
- RX químicas
Grupo C y N

Tipos según:
- Polaridad de R
L - Naturaleza
química de R
- Valor nutritivo
D
Isómeros
TIPOS: 20 AMINOÁCIDOS MAS COMUNES QUE CONSTITUYEN LAS PROTEÍNAS
No polares

SEGÚN
LA
POLARIDAD
DE R

Polares sin carga

Polares con carga


grupo imidazolica
(38/ Hb)
Otros Aminoácidos :
Codificados: selenocisteína  eucariotas/procariotas y arqueas
Pirrolisina  sólo en arquea
Modificados: Hidroxiprolina/ hidroxilisina
SEGÚN SU VALOR NUTRITIVO
NIVELES DE ORGANIZACIÓN
La función deriva de la
estructura tridimencional
supersecundaria
y ésta estructura está
establecida por:
- Enlaces no covalentes
débiles
- Distribución de
aminoácidos.
- Chaperonas
ESTRUCTURA PRIMARIA
Determinada por los de aminoácidos y enlaces peptidicos de la
cadena.

POLIPEPTIDO

a) Esqueleto proteico

b) Cadenas laterales
POLIMERIZACIÓN DE AMINOÁCIDOS PUEDE
SER:
•Peptidos (dipeptidos, tripeptidos, etc)
 Oligopeptidos
Cadena corta de aminoácidos 30-50 aa

 Polipeptidos
Cadenas largas de aminoácidos
•Proteína

Tamaño
•Da / KDa
Péptidos de importancia biológica:
•Glutatión: (3 aa)  mantiene las condiciones reductoras del
citoplasma

•Vasopresina (9aa) regula: reabsorcion de agua.

•Oxitocina (9 aa) estímula contracciones uterinas

•Hormona melano estimulante(MSH): (14aa) .

•Insulina (51 aa)  regula niveles de glucosa

•Glucagon (29 aa) regula los niveles de glucosa

•Corticotropina (39 aa) estímula la corteza adrenal


ESTRUCTURA SECUNDARIA
•CONSTITUYE EL PLEGAMIENTO TRIDIMENCIONAL LOCAL
CONDICIONADO POR: - Enlaces no covalentes
- Distribución de aa polares / no polares

*
PATRONES DE PLEGAMIENTO :
Resultan de la unión de N-H y C=O del esqueleto polipeptídico

1. Estructura secundaria ordenada repetitiva


a) Hélice  : Puentes de hidrogeno intracatenarios

3,6 residuos
por vuelta
de hélice
HELICES 
Hélice  cortas Superhélice Ejm:  -queratinas

Ejm. Proteínas de membrana:


•Receptores
•Transportadores
b) LAMINA β Puentes de hidrogeno intercatenarios

Antiparalela

Paralela
Los enlaces de hidrogeno se forman entre grupos NH y C=O
del enlace peptidico de una cadena o de la cadena contigua.
La hoja β se encuentra plegada por que los enlaces C-C son
tetrahédricos y no pueden existir en conformaciones planas
2. Estructura secundaria ordenada no repetitiva
Giros β: δ, ɣ, β, α y π según invierta el sentido 2,
3, 4, 5 o 6 aminoácidos
Buclesβ

Comba β

Compuesto por 3-4 residuos de aminoácidos


Se estabiliza por enlaces de H
Son frecuentes: Glicina de cadena lateral pequeña
Prolinacurvatura permite plegarse en
forma de U a la cadena principal
ESTRUCTURA SUPERSECUNDARIA: MOTIVOS
Motivos con Motivos con lamina β Motivos hélice α
hélice α y lamina β
Hélice–lazo-hélice

Horquillaβ
Dedo de Zinc: α- β –α

Hélice- giro -Hélice


NAD

Cremallera de leucina
Barril β Plegamiento Rossman
β-α- β –α - β
Hélice-bucle-Hélice
Alteraciones del plegamiento:
Hélice : Prion Humano
mutación (gen C20)
Lámina β (Proteína infecciosa)
Proteína insoluble
Resistente a las proteasas
Tiende a precipitar en neuronas

Aisla y destruye las neuronas


Cavidades en cerebro

Encefalopatias espongiforme o enfermedad prionica


Perdida de la conducta motora
Demensia progresiva
Muerte
ESTRUCTURA TERCIARIA
La conformación tridimensional, plegada y biológicamente
activa de una proteína es propia de la estructura terciaria
Disposición tridimensional de los residuos de aminoácidos
Estabilizada por interacciones: a)
- Covalentes, No covalentes entre otros
- Puentes de H entre:
grupos peptídicos
grupos R
- Interacciones Hidrofóbicas
- Iónicas
- Fuerzas de van der Waals
- Puentes disulfuro
- Cation π (interacción entre nube electrónica de cadena
aromática - (+)aminoácido catiónico)
• b) DISTRIBUCION DE LOS AMINOACIDOS POLARES Y NO POLARES
DOMINIO PROTEICO
Estructura compacta y estable de 40 – 350 aa
Unidades estructurales y funcionales de las proteínas
Número varia por proteína : Mioglobina

- Un dominio: mioglobina, ribonucleasa


- Mas de un dominio
Dominio F. Dominio F.
reguladora catalítica
Proteína quinasa
Src
MODELO DE DOMINIO PROTEICO
Según la particularidad estructural
Hélice α Hélice α y lámina β Lámina β

Citocromo-b Lactato deshidrogenasa Ig. Cadena Ligera


Cu,Zn superoxido dismutasa
Lisozima
Dominios de serina proteasas
Dominios estructurales
Dominio acídico
Dominio rico en prolina
Dominio conservados SH3

Dominio Funcionales
Dominio cinasa
Dominio serina proteasa
Dominio de unión a la membrana
Dominio de unión al DNA
Dominios de unión al DNA: homeodominios

Proteína α de
levadura

Proteína agrelada
Drosophila
Familias de proteínas determinadas por similitud de los dominios

Barajado de dominios en serina proteasas


semejanzas
. Sec aminoácidos Dominio
- Conformación tridimensional FCE

Diferencias: actividad Dominio serina


protesas

d. de unión al calcio

d. Kringle
(3 S-S)
MODULOS PROTEICOS
Son dominios que participan en la formación de una gran
número de proteínas (40-200 aa)
Estructura:

• C y N terminal en
polos opuestos
• Núcleo de lámina
β

Módulos (duplicados) en
línea
Rígidos, Presentes en
SH2
- Fibronectina
- Proteínas receptoras
Dominios relacionados evolutivamente
1000 dominios en IG
500 dominios en proteína quinasas
250 homeodominios de unión al DNA
300 dominios SH3
120 Dominios SH2

Las proteínas presentan


2 ó mas dominios
distribuidos en la misma
forma (5%)
PROTEÍNAS HOMÓLOGAS
• Ortólogas
• Moléculas homologas
que derivan de un Presentes en especies distintas,
antecesor común con función identica o similares
• Secuencia de Hemoglobina en vertebrados
aminoácidos es • Parólogas
semejantes Presentes en la misma especie.
Se diferencia en sus funciones
bioquimicas detalladas
Ejm mioglobina y hemoglobina
Proteínas Homólogas
Gen ancestral Gen ancestral

Especiación Duplicación génica

Gen a Gen b Gen a Gen b

Genes ortólogos Genes parólogos


Globinas
DETECCIÓN DE HOMOLOGÍA

Dominios Evolución Nuevos Dominios

Sec . aa Relación Sec . aa nueva


estructural
Proteína de supone Descubrir la
función homología entre la
conocida Relación secuencia de aa
funcional

Existe
- Base de datos de numerosas Se determina la función de
secuencias de proteínas proteína
- Programas de búsqueda para
comparar nuevas proteínas con la Ahorra años de investigación
base de datos
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Elementos: Subunidad Proteica
Lugar de unión: superficie de interacción por
enlaces no-covalentes
Enlaces de hidrógeno Fuerzas hidrofóbicas
P. DIMERICA
Proteina represora Cro
( bacteriofago lambda)

Unión cabeza-cabeza

Cu Zn superoxidos dismutasa

Monómero de PM 16000 Da
8 Laminas B antiparalelas
(estructura en barril)
TRIMERICA TETRAMERICA
Neuroaminidasa
Motivo : Gly – X -Y

Unión
cabeza-cola

Hemoglobina
TAMAÑO Y FORMA

60 subunidades
Proteína cubierta
del virus del pollo

2120 subunidades
Proteina del virus
del tabaco

12 subunidades
FORMA:
GLOBULARES: péptidos plegados en forma compacta,
superficie irregular. Filamentos de actina

Lugar de unión
complementario
FIBROSAS:
Estructura tridimencional sencilla y alargada
Intracelulares: queratina
Extracelulares: colágeno,
elastina

• Resistente
• Mantiene unido a los tejidos
Elastina
Cadenas polipetidicas relativamente laxas y poco
estructuradas, entrecruzadas por enlaces covalentes  Red
Estabilizadas por: S- S
ESTRUCTURA SUPRAMOLECULAR
Estructuras: Ejm. Virus del tomate TBSV
• Complejos enzimáticos
• Ribosomas 180 subunidades de 386 aa + ARN 4500 nt
• Filamentos proteicos
• Virus
• Membranas
Ventajas
• Reducen la información genética
• Enlaces de energía relativamente baja
• Minimizan los errores en la síntesis y
ensamblaje
Láminas planas, tubos, anillos, esferas

Cambio en la geometría
de las subunidades
Ensamblaje Cilíndrico
Ejm. Virus del mosaico del tabaco

ARN 6395 nt
Subunidades 2130

MECANISMO DE AUTOENSAMBLAJE

TMV D. PROTEOLISIS Y
ENSAMBLAJE
PROPIEDADES: SOLUBILIDAD
• Por su elevado PM producen dispersiones coloidales en el
agua. La solubilidad se debe a los grupos R, que al ionizarse
establecen puentes de hidrogeno con el agua
• proteínas fibrilaresinsolubles
• Proteínas globulares  solubles en sistemas acuosos y
difunden fácilmente. Son proteínas con función móvil o
dinámicas
– R apolares hacia el interior
– R hidrofílicos hacia el exterior
Influyen : la salinidad del medio
pH del medio
DESNATURALIZACIÓN
Consiste en la perdida total o parcial de los niveles
estructurales superior al primario por perdida de
enlaces que mantiene a la proteína
• Cambian las propiedades físicas, químicas y
biológicas. Descenso de solubilidad
• Pérdida de la actividad biológica
• Estructura primaria intacta
DESNATURALIZACIÓN
• IRREVERSIBLE • REVERSIBLE
- Albumina cocida -Inmunoglobulinas
- Leche cortada - lisozima

FACTORES
 Ácidos y bases fuertes
 Temperatura calor
 Cambios en el pH
 Disolventes orgánicos (alcohol, acetona)
 Compuestos polares neutros (urea y guanidina)
 Reductores (mercaptoetanol)
ESPECIFICIDAD
• Las proteínas homologas
son aquellas que realizan
funciones idénticas.
En vertebrados
- hemoglobina
- Citocromo c
• Las proteínas homologas
de diferentes especies
son semejantes pero no
idénticas
CAPACIDAD AMORTIGUADORA
• Se debe a los grupos R ionizables poder
amortiguados en amplio rango de pH

El principal responsable de esta propiedad a pH


7, es la HISTIDINA
EFECTO OSMÓTICO
• Las proteínas tienden a Las proteínas retienen
captar agua de un medio iones difusibles como
hipotónico del que estén - Bicarbonato
separada por una - Cloruro
membrana
semipermeable. - Sodio
• El efecto osmótico - Potasio
- es proporcional al Aumentan el efecto
número de partículas osmótico
disueltas. Responsable de la presión
coloidosmotica
CLASIFICACIÓN
SU CONFORMACION FISICA
CLASIFICACION: DE ACUERDO A SU COMPOSICION
P Proteína Características Ejemplos
R S ALBUMINAS Solubles agua, pueden precipitadas por el agregado de Ovoalbúmina
O I sales a alta concentración. Son ricas en S. Lactoalbúmina
T M
E P GLOBULINAS Iinsolubles agua, disuelven en soluciones salinas diluidas. Ovoglobulina
I L Precipitan más fácilmente que albúminas por adición de Lactoglobulina
N E sales.
A S HISTONAS Solubles soluciones salinas, fuertemente básicas, gran H1, H2A, H2B,
S proporción de lisina y arginina. Están unidas al DNA. H3, H4

ESCLERO- Insolubles. Moléculas largas y fibrosas. Están tejidos de Colágeno


PROTEINAS sostén y estructuras resistencia física Elastina
Queratinas
P C
R O PROTEINA GRUPO PROSTETICO EJEMPLOS
O M
NUCLEOPROTEINAS RNA Ribosomas
T J
U LIPOPROTEINAS Fosfolípidos, colesterol, lípidos neutros - Lipoproteinas
E
I G GLUCOPROTEINAS Hexosamina, galactosa, manosa, ác. siálico  -Globulinas
N A FOSFOPROTEINAS Fosfato esterificado a restos de serina Caseína, Vitelina
A D
FLAVOPROTEINAS Flavín nucelótido Succinato Dhasa
S A
S METALOPROTEINAS Fe (OH)3 D-aminoácido oxidasa
Fe y Cu Citocromo oxidasa
Zn Alcohol deshidrogenasa
DE ACUERDO CON SU FUNCION BIOLÓGICA
Tipos y ejemplos Localización y función
Enzimas
Hexocinasa Fosforila a la glucosa
Lactato Deshidrogenasa Deshidrogena al lactato
Ribonucleasa Cataliza la hidrólisis del ác. ribonucleico
Tripsina Hidroliza algunos péptidos
Hormonas
Horm. adrenocorticotropa Regula la síntesis de corticosteroides
Hormona del crecimiento Estimula el crecimiento de huesos
Insulina Regula el metabolismo de la glucosa
Proteínas reguladoras
Calmodulina Modulador intracelular fijador de calcio
Troponina C Fijador de calcio que regula la contracción en el
Proteínas de reserva músculo
Caseína Proteína de la leche
Ferritina Almacenamiento de hierro en bazo
Ovoalbúmina Proteína de la clara de huevo
Tipos y ejemplos Localización y función
Proteínas transportadoras
Albúmina sérica Transporta ácidos grasos en la sangre
Beta-lipoproteína Transporte de lípidos en sangre
Hemoglobina Transporte de O2 en la sangre.
Mioglobina Transporte de O2 en músculo
Proteínas contráctiles
Actina Filamentos móviles de las miofibrillas
Dineína Cilios y flagelos
Miosina Filamentos estáticos de las miofibrillas
Proteínas relacionadas con la inmunidad y la defensa
Anticuerpos Forman complejos con las proteínas extrañas
Fibrinógeno Precursor de la fibrina en la coagulac. sanguínea
Trombina Componente del mecanismo de coagulación
Proteínas estructurales
Colágeno Tj. conectivo fibroso (tendones, hueso y
Elastina cartílago)
Tejido conectivo elástico (ligamentos)
- Queratina Piel, plumas, uñas y pezuñas
Tipos y ejemplos Localización y función
Proteínas cromosomicas
Histonas Favorecen el empaquetamiento del ADN
No histonas

Proteínas receptores
Receptor a FGE y otros Receptores de hormonas y factores troficos para
Receptor de insulina, etc recibir transducir señales, desde el exterior al
Interior de la célula
Proteínas factores troficos
FC Relacionados con la señalización en el desarrollo
tejidos

Proteínas Factores de transcripción


Controlan la expresión génica
"No hay que confundir nunca el
conocimiento con la sabiduría. El primero
nos sirve para ganarnos la vida; la
sabiduría nos ayuda a vivir." Sorcha Carey