Curso: Biologa Celular y Molecular

Oscar Nolasco Crdenas MSc.

oscarnol@hotmail.com
Noviembre 2017
 Contenido

tRNA

Ribosomas

Traduccin en Procariotes

Traduccin en eucariotes

Mutaciones en las protenas

 tRNA
tRNA estructura primaria
Secuencia lineal de 60 a 95
nucletidos de longitud
( Comnmente 76).
tRNA estructura secundaria
La estructura de hoja de trbol
muestra los brazos y los bucles
o loops.
tRNA estructura terciaria
Nueve enlaces de hidrogeno
entre las bases en los bucles de
simple cadena y el plegamiento
de la estructura secundaria en
una estructura en forma de L
con el anticodon y el brazo
aceptor del aminocido en los
extremos opuestos de la
Caracteristicas
molcula. del tRNA
1. Brazo o tallo aceptor 7-bp apareadas del 5'-terminal con 3'-terminal. Puede contener
apareamientos no tipo Watson-Crick.
2. CCA cola Secuencia 3' terminal. En procariotes el CCA es transcrita, y en eucariotes
CCA es adicionada post transcripcional.
3. El brazo D tallo de 4 bp que termina en un bucle o loop que contiene dihidrouridina.
4. El Brazo del anticodon tallo de 5 bp apareadas y contiene el loop del anticodon.
5. El Brazo TC tallo de 5 bp apareadas que contiene la secuencia TC donde es una
pseudouridina.
6. Un brazo variable, tRNAs de clase 1 contiene 3 a 5 bases y tRNA de clase 2 contiene
13 a 21 bases formando un tallo de 5 bases apareadas
7. Las bases que han sido modificadas por metilacin se encuentran fuera del anticodon.
 RIBOSOMAS

El mRNA es decodificado en los ribosomas

rRNA es el principal componente de los ribosomas
El inicio de la traduccion involucra el apareamiento del mRNA y el
rRNA.
Shine-Delgarno (SD) es una secuencia que se presenta en muchos
transcriptos de procariotes que consta de 3-9 bases del mRNA los
que se complementan con el 3terminal del 16S rRNA
En transcriptos mRNA de eucariotes la secuencia que facilita la
union inicial del mRNA a la subunidad pequea ribosomal es la
secuencia Kozak ACCATGG o (GCC)RCCATGG

lac I P O lac Z lac Y lac A

AUG AUG AUG AUG

5
SD AUG AUG SD AUG
Codon interno de Met
Codon de inicio antecedido Codon de inicio antecedido
sin sitio
del sitio Shine-Dalgarno del sitio Shine-Dalgarno
Shine-Dalgarno

mRNA de eucariote
5 cap AUG AUG

El codon de inicio AUG es unico

posterior al 5 cap
 Traduccin Procariotes

La subunidad menor inicia la bsqueda del sitio

de iniciacin:
En Procariotes
IF1 previene el enlace prematuro del aatRNA al
sitio A
IF2 facilita la unin del formilmetionina a la
posicin P de la subunidad menor ribosomal
IF3 previene el enlace prematuro de la
subunidad mayor
Traduccin Eucariotes
Activacin del aminoacil-
tRNA
Terminacin
Variaciones del cdigo estndar
 Inhibidores de Sntesis de Protenas
Actuando slo en bacterias
Tetraciclina. Bloquea la unin del aminoacil-ARNt al sitio A del ribosoma
Estreptomicina impide iniciacin de la traduccin elongacin de la cadena y causa error de codificacin
Cloranfenicol, bloquea la reaccin peptidil transferasa en los ribosomas
Eritromicina se une al canal de salida de los ribosomas e inhibe la elongacin de la cadena peptdica
Rifampicina Se une a ARN polimerasa (impide la sntesis de ARN)
Actuando sobre las bacterias y eucariotas
Puromicina provoca la liberacin prematura de cadenas de polipptidos nacientes por su adicin al extremo
de la cadena en crecimiento
Actinomicina D se une al ADN impide el movimiento de la ARN polimerasa (impide la sntesis de ARN)
Actuando en los eucariotas, pero no las bacterias
Cicloheximida bloquea la reaccin de translocacin en los ribosomas
Anisomicina bloquea la reaccin peptidil transferasa en los ribosomas
a-Amanitina bloquea la sntesis de mRNA mediante la unin preferentemente a la ARN polimerasa II
 Referencia:
Alberts B, Johnson A, Lewis J, et al. Molecular
Biology of the Cell. 5th edition. New York:
Garland Science; 2008.
Chapter 6. From RNA to protein
Regulacin de
la Expresin
gentica

Curso: Biologa Celular y

Molecular
Oscar Nolasco Crdenas MSc.
oscarnol@hotmail.com
2017
 Contenido

Diferencias en la expresin

Etapas en la expresin controladas en eucariotes

Protenas regulatorias

Regulacin de la expresin en procariotes: OPERONES

Regulacin en genes eucariotes

 Diferencias en la expresin

expresin linfocitosd eprotenasde

neuronas

expresin de protenas de neuronas

expresin linfocitosd eprotenasde

neuronas

expresin de protenas de linfocito

Una clula puede
cambiar la expresin de
sus genes en respuesta
a un estimulo externo

En un organismo
multicelular, las
clulas se diferencian
por el tipo de protenas
que sintetizan a pesar
de contener el mismo
DNA
 Etapas en la expresin controladas en eucariotes

La expresin de los genes puede ser regulada en muchos pasos en la va :

DNA a RNA a Protenas
Protenas regulatorias
El inicio de la transcripcin es el punto principal de
regulacin que es modulado por:
REPRESORES
ACTIVADORES

El activador puede ejercer una

activacin alosterica de la RNA
polimerasa
Protenas que curvan el DNA
pueden facilitar la interaccin
entre distantes protenas
reguladoras que se unen al
DNA
 Secuencias
cortas en el
ADN son
componentes
fundamentales
en el switch
gentico
 Durante los pasos de regulacin de la transcripcin los patrones de enlaces
de hidrogeno y grupos aceptores son las caractersticas mas importante en
el reconocimiento de genes por las protenas regulatorias adems de la
secuencia de nucletidos y la geometra de la doble hlice.

Las protenas regulatorias, contienen un motivo estructural que puede leer las
secuencias de DNA:
El motivo hlice torsin hlice es uno de los motivos mas comunes que se
encuentran en protenas que se unen al DNA como son las protenas
homeoticas de Drosophila, represor lambda, represor triptfano y CAP

El motivo Dedos de Zinc es un motivo que utiliza una o mas molculas de Zinc
El motivo Cierre de leucina
Motivos de hoja B tambin pueden reconocer DNA
 Regulacin de la expresin
gentica: Transcripcin del gen
Regulacin negativa La Regulacin positiva La unin
unin de un represor inhibe de un activador facilita la
la transcripcin transcripcin
 Regulacin de la expresin en procariotes: OPERONES

Un opern es un grupo (cluster) de genes funcionalmente

relacionados que se encuentran coordinadamente regulados

Contiene:
Genes Estructurales: codifican a enzimas
Genes Regulatorios: codifican represores o
activadores de la expresin
Sitios de regulacin: Promotores, operadores
El operon trp es regulado en parte
por un apo-represor
El operon trp es tambin regulado por atenuacin
La actividad del ribosoma
determina la estructura
secundaria del RNA lider

Alta concentracin
de triptfano,
provoca la
terminacin de la
transcripcin

Baja
concentracin de
triptfano,
mantiene la
transcripcin
Control positivo: Protena activadora de
catabolitos (CAP) o protena receptora de
cAMP (CRP)
En presencia de glucosa, [cAMP] es cerca de
10-7 M
En ausencia de glucosa, [cAMP] se
incrementa cerca de 10-4 M
Es un dimero que se une a cAMP
 Las bacterias
suelen
intercambiar
sus
subunidades
de la RNA
polimerasa
para regular su
expresin
 Regulacin de la expresin en eucariotes

I. Nucleosomas y sus modificadores

II. Mas reguladores y regiones reguladoras mas extensas:

Exacerbadores (Enhancers) Los enhancer se
presentan en una variedad de posiciones respecto a los genes

Elementos aislantes o limtantes (Insulator)

ACTIVACION TRANSCRIPCIONAL
Los activadores actan indirectamente reclutando
complejos modificadores de la cromatina y las HAT
que ayudan a la maquinaria transcripcional unirse al
promotor o iniciar la transcripcin
 Los activadores actuan directamente con los
mediadores y factores de la maquinaria
transcripcional
En S. cerevisiae se presenta
un orden de eventos para el
inicio de transcripcin, sin
embargo este orden difiere
en algunos genes donde la
modificacin de histonas
ocurre primero, seguida del
reclutamiento de la
polimerasa y luego la
remodelacin de la
cromatina
 REPRESIN TRANSCRIPCIONAL:
 El 8 % de la
capacidad
codante del
genoma de
mamferos esta
dedicada a los
reguladores de la
transcripcin de
genes.
Cada gen es
regulado por un
conjunto de
genes
reguladores, cada
protena es
regulada por otro
set de protenas
Existen diversas
vas de regulacin
de molculas
proteicas
 Estrategias de
memoria
celular
 Circuitos
transcripcionales
permiten a la
clula mantener
un orden lgico
 La importancia de la
combinacin del control
gentico en el desarrollo
de un organismo
Mecanismo de silenciamiento
 La metilacin en el DNA esta asociada al
silenciamiento en genes de clulas animales fenmeno
llamado imprinting
Mecanismos epigeneticos aseguran que los patrones de
expresin pueden ser transmitidos a las clulas hijas
 Las alteraciones
en la estructura
de la cromatina
pueden ser
heredadas
 Control Post trancripcional
 Referencia:
Alberts B, Johnson A, Lewis J, et al. Molecular
Biology of the Cell. 5th edition. New York:
Garland Science; 2008.
Chapter 7. Control of gene expression