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Evolucin sistemtica y taxonoma

microbiana
Dra. Bertha Soriano Bernilla
Dpto. Microbiologa y Parasitologa
UNT
Filogenia tiene como objeto de
estudio: vnculos evolutivos entre
las formas de vida.

Todos los organismos tienen


macromolculas ribosmicas en
especial los RNAs ribosmicos, se
han usado para construir un rbol
filogentico para todas las formas
de vida procaritica y eucaritica.

CARL WOESE, el primero en


advertir el empleo del RNA
ribosmico.

14/11/2017 Dra. Bertha Soriano Bernilla-UNT


Grupos principales de organismos vivos

14/11/2017 Dra. Bertha Soriano Bernilla-UNT


14/11/2017 Dra. Bertha Soriano Bernilla-UNT
14/11/2017 Dra. Bertha Soriano Bernilla-UNT
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Las principales caractersticas que llevaron a
reconocer tres diferentes dominios fueron
los anlisis del ARN ribosomal de la
subunidad menor:
Bacteria hay una secuencia particular entre
las posiciones 500-545 del ARNr-16S,
Archaea hay una estructura nica entre las
posiciones 180-197 o 405-498 del mismo
ARNr-16S y
Eukarya el ARNr de la subunidad menor es
18S y difiere de los procariontes entre las
posiciones 585-656.
14/11/2017 Dra. Bertha Soriano Bernilla-UNT
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Taxonoma:
Ciencia de la clasificacin y est constituida por dos
subdisciplinas principales: identificacin y nomenclatura.
Taxonoma Bacteriana:
Hace referencia a cosas distintas a la filogenia bacteriana, se ha
basado tradicionalmente en anlisis fenotpicos para la
clasificacin e identificacin.
Filogenia:
Es el estudio de la evolucin y desarrollo de las especies. La
comparacin de secuencias de algunas macromolculas, es la
forma mas precisa y confiable para inferir en las relaciones
filogenticas.

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Clasificacin y el concepto de especie
Los microbilogos necesitan identificar y clasificar las
bacterias por diferentes razones prcticas.
En microbiologa, la unidad taxonmica bsica es la especie.
Especie: de manera operativa, es una coleccin de cepas
similares que difieren lo suficiente de otros grupos de cepas
para asegurar su reconocimiento como unidad taxonmica
bsica.
Cepas o clones: una poblacin de clulas genticamente
idnticas derivadas de una sola clula.

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Los grupos de especies se renen en gneros.
Los gneros se agrupan en Familias, las familias en
rdenes, los rdenes en divisiones, etc., hasta alcanzar el
nivel taxonmico ms alto, que es el dominio.

Familia es el taxn superior que se emplea de manera


rutinaria en estudios taxonmicos de procariotas.

Para identificar un organismo desconocido es esencial que


dicho organismo satisfaga todos los criterios taxonmicos de
los rangos que estn por encima de la designacin de
especie.

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Clasificacin y el concepto de especie
Dominio.............Bacteria
Divisin.............Gracilicutes
Orden.................Rhodospirillales
Familia...............Chromatiaceae
Gnero...............Chromatium
Especie...............warmingii

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Ejercicio:
Con las propiedades siguientes proceda a jerarquizar
taxonmicamente la bacteria roja del azufre Chromatium
warmingii.
1. Clulas de 3.5-4.0 um x 5-11 um; almacena azufre principalmente en
los polos de la clula
2. Bacterias Gram negativas
3. Clulas procariticas; secuencia rARN tpicas del linaje de las
bacterias rojas.
4. Bacterias rojas fototrficas
5. Bacterias rojas del azufre con forma bacilar
6. Bacterias rojas del azufre

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Clasificacin y el concepto de especie
Dominio...Bacteria.... Clulas procariticas; secuencia
rARN tpicas del linaje de las bacterias rojas.
Divisin..Gracilicutes.. Bacterias Gram negativas
Orden...Rhodospirillales... Bacterias rojas fototrficas
Familia..Chromatiaceae... Bacterias rojas del azufre
Gnero..Chromatium... Bacterias rojas del azufre con forma
bacilar
Especie....warmingii.... Clulas de 3.5-4.0 um x 5-11 um; almacena
azufre principalmente en los polos de la clula

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The International Code of Nomenclature of Bacteria
Sistema binomial de nomenclatura (Linneo)
Gnero especie
Bacillus cereus
Bacillus acidocaldarius
B. cereus
Bacillus sp.
Bacillus spp.

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American Type Culture Collection (ATCC).
Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und
Zellkulturen (DSM).
Colecciones de cultivos axnicos o puros que han sido
reconocidos como gneros o especies.
La cepa depositada sirve como cepa tipo de la nueva especie, o
gnero y especie, y se conserva como patrn de comparacin de
otras cepas que se suponga pertenecen a la misma especie o
gnero.

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International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB)
Revista oficial de registro para la taxonoma y clasificacin de
los microorganismos, es decir, publica los nombres aprobados y
abre el camino para su inclusin en el Bergeys Manual, uno de
los principales tratados de taxonoma de procariotas.

Los cultivos de referencia se mantienen congelados o


liofilizados (las cepas se conservan vivas).

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Taxonoma bacteriana convencional
Caractersticas de valor taxonmico: Basada en la
caracterizacin morfolgica, fisiolgica y bioqumica.
Morfologa
Tincin de Gram
Tipo de Nutricin (fototrofa, quimioorganotrofa y
quimiolitotrofa).
Estructura qumica de la pared celular
Presencia de inclusiones celulares y productos de reserva.
Estructura qumica de la cpsula
Los pigmentos
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Los requerimientos nutritivos
La capacidad para usar compuestos de C, N y S
Los productos de fermentacin
Los requerimientos y tolerancias a gases, temperatura y de pH.
La sensibilidad a los antibiticos
La patogenicidad
Las relaciones simbiticas
Las caractersticas inmunolgicas
El hbitat

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Objetivo
El objetivo de la Taxonoma bacteriana es dar un
ordenamiento de las unidades taxonmicas bsicas
(especies).

Especie bacteriana
Es un conjunto de poblaciones clonales que
presentan un elevado grado de similitud fenotpica
entre s y que a su vez difieren de otros conjuntos de
poblaciones clonales.

Caracterizacin
Ideal: caracterizacin completa del genotipo (es decir
de su constitucin gentica). Real: caracterizacin parcial
del fenotipo (apariencia).
Adems de propiedades estructurales, se debe recurrir a las
propiedades bioqumicas y fisiolgicas para la caracterizacin
de especies; es decir que las bacterias se clasifican no solo
por su apariencia sino tambin por lo que pueden hacer.

Denominacin
Uso del sistema binomial de nomenclatura
formado por 2 palabras.
Ejemplos Bacillus subtilis
Bradyrhizobium japonicum
Manual Bergey de Bacteriologa

Volumen I Bacterias Gram (-) de importancia


mdica e industrial
Volumen II Bacterias Gram (+) de importancia
mdica e industrial
Volumen III Bacterias Gram (-) restantes
Volumen IV Actinomicetes y bacterias
relacionadas
Volumen I: Trata del dominio Archaea, en su
totalidad y de algunas bacterias Gram negativas
especiales, como las Cianobacterias. En este
volumen no hay casi ninguna bacteria de
importancia clnica.

Volumen II: Proteobacterias, bacterias Gram


negativas . Dividido en cinco secciones (alfa, beta,
delta, gamma y psilon proteobacterias), el reino
Proteobacteria agrupa a la mayor parte de las
bacterias Gram negativas de importancia clnica.
Neisseria, Brucella, Legionella, Pseudomonas, Haemophilus,
Campylobacter y Enterobacterias, pertenecen a este
reino.
Volumen III: Trata sobre los Gram positivos con bajo
contenido en G+C. Aqu aparecen gneros como
Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus,
Clostridium y Bacillus .

Volumen IV: Contiene una sola seccin que agrupa a


todos los Gram positivos con alto contenido en G+C Los
gneros ms conocidos de este volumen sern
Mycobacterium y Corynebacterium.

Volumen V: trata de otras bacterias Gram negativas,


agrupadas en ocho secciones diferentes. No tienen
ningn factor en comn. Los gneros ms importantes
desde el punto de vista clnico sern Chlamydia,
Treponema, Borrelia o Bacteroides
Taxonoma molecular
Llamada quimiotaxonoma, emplea los anlisis
moleculares de una de las diversas biomolculas
de la clula.
Entre los principales mtodos quimiotaxonmicos
estn la hibridacin DNA:
DNA
El ribotipado, mtodo que permite identificar y
clasificar bacterias en funcin de los genes del
RNA ribosomal
Anlisis de lpidos

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