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Ncleo de Gentica Mdica - Belo Horizonte, Brasil

 Aplicacin de las
Redes Bayesianas en
Determinacin de
Paternidad
 O GENE Ncleo de Gentica Mdica est
ofreciendo un servicio de consultora
estadstica en casos complejos de
determinacin de paternidad mediante la
utilizacin de Redes Bayesianas.

Ello permite que laboratorios que no son

especializados en gentica formal puedan
emitir dictmenes en casos de difcil anlisis,
contando con la seguridad de un tratamiento
estadstico de alta confiabilidad.
 El objetivo de esta breve
presentacin es ofrecer una
explicacin sencilla de la
poderosa metodologa de las
Redes Bayesianas y de los
servicios que GENE est
ofreciendo.
 Casos complejos en
determinacin de paternidad

Frecuentemente surgen cuestiones

relacionadas a la paternidad tras la muerte
del posible padre.
Estos casos son muy importantes y a veces
grandes herencias pueden estar
involucradas.
La metodologa bsica utilizada es hacer la
reconstitucin del perfil gentico del posible
padre, ya fallecido, mediante los familiares
vivos.
 Algunos casos de determinacin de
paternidad post mortem del posible padre
permiten una resolucin directa.

Por ejemplo: casos en los que hay uno o ms

hijos reconocidos del hombre fallecido y
estn disponibles para pruebas genticas se
pueden solucionar algebraicamente mediante
la aplicacin directa de principios de
probabilidad y de gentica mendeliana,
especialmente si tambin se pueden estudiar
las madres.
 Viuda

Madre del Hijos del

Posible hijo Posible padre fallecido
posible padre fallecido

Posible hijo

ste es un caso sencillo y que permite una buena y fcil

reconstitucin del perfil gentico del posible padre
? fallecido.
El clculo del ndice de paternidad se puede hacer
mediante la aplicacin directa de principios mendelianos.
Casos en los que uno o ms hermanos
del padre fallecido estn disponibles
para pruebas genticas se pueden
igualmente solucionar algebraicamente
mediante la aplicacin de principios de
probabilidad y de gentica mendeliana.
 Hermanos del Padres del
posible padre fallecido posible padre fallecido

Madre del
posible hijo

Posible padre fallecido

ste es un caso un poco ms
complicado, ya que no permite la Posible hijo
reconstitucin directa del perfil gentico
del posible padre fallecido, pero s la del
perfil gentico de sus padres. ?
Sin embargo, el clculo del ndice de
paternidad puede seguir hacindose
mediante aplicacin directa de principios
mendelianos.
 Por otra parte, en casos en los que hay uno o
ms hijos de la persona fallecida y a la vez, uno
o ms hermanos disponibles para pruebas
genticas, surge el problema de cmo combinar
las dos ramas de informacin. No se puede
aplicar la regla de multiplicacin porque las dos
evidencias no son independientes.

ste es uno de los tipos de casos en los que es

necesario analizar las verosimilitudes del
heredograma en su totalidad, lo que slo se puede
hacer mediante las redes bayesianas.

Veamos un heredograma ...

 ?

Observen que en este caso se hicieron pruebas de los hermanos y de una hija
del hombre fallecido. Aunque podamos calcular ndices de paternidad separados
para cada una de estas categoras, el clculo de un ndice de paternidad
combinado final es muy fastidioso. En estos casos, las redes bayesianas nos
permiten combinar la informacin de una manera eficiente y a prueba de errores.
Veamos el ejemplo concreto de tipaje en un locus especfico...
 SS SX

UV WT

Frecuencias
ggggg
alelicas
S = 0,272
T = 0,071
U = 0,043
V = 0,090
W = 0,144 ST XT
X = 0,380
El alelo paterno obligatorio es T

Genotipos en un locus de microsatlites

 Si hacemos clculos algebraicos y
consideramos solamente el hijo reconocido del
posible padre fallecido, el ndice de paternidad
es L = 7,542.
Si hacemos clculos algebraicos y
consideramos solamente los hermanos del
posible padre fallecido, el ndice de paternidad
es L = 3,521.
Cul ser el ndice de paternidad combinado?
No podemos utilizar la regla de la multiplicacin
porque los eventos no son independientes.
Contestaremos a esa pregunta con la ayuda de
las redes bayesianas.
 Leyenda (de arriba abajo)
gfpg G-father pat. gene
gfmg G-father mat. gene
gmpg G-mother pat. gene
gmmg G-mother mat. gene
pfpg P. father pat. gene
pfmg P. father mat. gene
u1pg Uncle 1 pat. gene
u1mg Uncle 1 mat. gene
u1gtype Uncle 1 genotype
m2pg Mother 2 pat. gene
m2mg Mother 2 mat. gene
m1pg Mother 1 pat. gene
m1mg Mother 1 mat. gene
m2gtype Mother 2 genotype
m1gtype Mother 1 genotype
tf=pf? True father =
possible father?
sta es la red bayesiana correspondiente al c2pg Child 2 pat. gene
c2mg Child 2 mat. gene
heredograma mostrado en la diapositiva anterior. c1pg Child 1 pat. gene
c1mg Child 1 mat. gene
Los iconos representan gametos y estn c2gtype Child 2 genotype
conectados por relaciones mendelianas. c1gtype Child 1 genotype
 Para ilustrar, indicamos en la
prxima diapositiva cmo los
individuos (obviamente siendo cada
uno el producto de la unin de dos
gametos) estn dispuestos en esta
red bayesiana.

Observe cmo el heredograma

gentico se encaja naturalmente en
la estructura de la red bayesiana.
 Posible abuelo (fallecido) Posible abuela (fallecida)

Posible padre (PP) Posible ta Posible to

(fallecido)

Madre del
Viuda del PP posible hijo

Hija del PP Posible hijo

 Podemos utilizar esta red bayesiana
para calcular las verosimilitudes de
todo el heredograma en los dos
estados alternativos:
1) el posible padre es el padre biolgico
2) un individuo randmico es el padre
biolgico.
As pues, podemos calcular el ndice
de paternidad combinado sin
dificultades.
El ndice de paternidad combinado calculado por la
tcnica de las redes bayesianas es
L = 7,042.

Observe qu este ndice es ms bajo que el

obtenido por el simple anlisis del hijo reconocido!

Si quiere saber ms detalles sobre las razones de

eso, haga clic aqu.

Si no, siga con la presentacin.

 Para un mejor entendimiento,
analizaremos ahora y en detalle la
estructura de una red bayesiana
diseada para anlisis de un caso
de determinacin bastante ms
sencillo, es decir, un conjunto de
hijo(a), madre y posible padre.
Es obvio que no necesitamos de
una tcnica tan sofisticada para
analizar un caso tan sencillo,
pero lo vamos a hacer como un
ejercicio de demostracin de la
estructura de la red bayesiana.
 Posible Padre

Madre

Hijo

Esta es la red bayesiana del tro

Y aqu estn los resultados del
tipaje en un locus de
microsatlites...
Posible Padre: U V

Madre: S T

Hijo: T U
El alelo paterno obligatorio es U,
con una frecuencia
poblacional de 0,124.
Es muy fcil calcular que el ndice
de paternidad en este locus es
L = 0,5 / 0,124 = 4,032.
Pero vamos a ver como podemos
calcularlo mediante una red
bayesiana...
Comenzamos atribuyendo a todos
los gametos frecuencias a priori
iguales a las de la poblacin en
general.

Tambin establecemos que la

probabilidad a priori de paternidad
es de un 0.5.
Estas tablas quedan escondidas detrs de la estructura de la red bayesiana.
 Esta tabla presenta las probabilidades condicionales de transmisin de los
alelos con base en el genotipo del individuo. Ella tambin queda escondida
detrs de la estructura de la red bayesiana.
 Esta tabla presenta las probabilidades condicionales de transmisin de los
alelos del posible padre con base en su genotipo, bajo las dos posibilidades
contrastantes: de que sea o no el padre biolgico. Ella tambin queda
escondida detrs de la estructura de la red bayesiana.

No Yes
 Posible Padre

Madre

Hijo

Evidencia

Ahora, incorporamos los resultados de los tipajes, es decir, los

genotipos de la madre, hijo(a) y posible padre.
 La red bayesiana se propaga para incorporar la evidencia, es decir, los
genotipos de la madre, hijo(a) y posible padre, a las probabilidades a priori y a
las probabilidades condicionales que ya estaban incorporadas en la red.
He aqu las probabilidades a posteriori para los varios nodos de la red bayesiana.
Ahora podemos leer directamente en el nodo rosa el resultado del ndice de
paternidad. Dividiendo 0,801282 por 0,198718, obtenemos el resultado 4,032!
Las redes bayesianas tambin
nos permiten calcular con
seguridad las probabilidades
relativas en las situaciones en
las que hay ms de un posible
padre en la misma familia, aun
cuando ambos candidatos
ya hayan fallecido.
 Adicionalmente, las redes bayesianas
nos permiten analizar con xito casos en
los que la evidencia disponible es
bastante indirecta. Por ejemplo:
recientemente GENE solucion un caso
en el que haba slo dos sobrinos vivos
disponibles del hombre fallecido, para
las pruebas genticas (en este caso,
hubo que fue estudiar 50 loci de
microsatlites).
 Se debe subrayar que inclusive
en los casos en los que es
posible el anlisis algebraico, las
redes bayesianas nos
proporcionan ms confiabilidad y
seguridad en el estudio de
cualquier caso complejo de
determinacin de paternidad.
 Los laboratorios interesados en los
servicios de consultora en redes
bayesianas de GENE pueden
contactarnos para presentar su caso
especfico y obtener una estimacin del
costo de la consultora:
GENE Ncleo de Gentica Mdica
Paternidad por Redes Bayesianas
E-mail: admin@GENE-PATER.com