El MIOCENO SUPERIOR esta caracterizada por importantes
transgresiones marinas , por el levantamiento de Piedemonte Pacifico, el funcionamiento del arco volcnico, el desarrollo de cuencas intramontaosas asociadas a una actividad volcnica, la formacin de una cuenca de antepais al este, y finalmente por las deformaciones compresivas. En la cuenca de antearco de Pisco se depositar la Formacin Pisco (Mioceno Superior) dividido en dos por una discontinuidad cuya responsable seria la crisis tectnica Quechua III (17 M.a.). En la regin de Puno y Cusco se desarrollan cuencas imtramontaosas del tipo Pull-Apart. La apertura en transcurrencia siniestral de estas cuencas estara ligada a la crisis tectnica Quechua II (11 M.a.).
En el Mioceno Superior (entre 11 y 6 M.a.) la deformacin se
desplaz bruscamente hacia el Este, estructurndose la zona subandina y la cuenca Oriental de antepas. PLIO-CUATERNARIO Durante el cuaternario se depositan en el territorio peruano sedimentos de origen volcnico, glaciares, aluviales, lacustres, marinos y elicos. La evolucin tectono-sedimentaria Pliocuaternaria de la regin del Cusco est dada primero por el relleno de series fluvio-torrenciales de la Formacin Chincheros (Plioceno) y por la Formacin San Sebastin (Plioceno inferior), caracterizada por los depsitos fluvio-lacustres.