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Metabolismo de Lpidos

Los lpidos
Grupo heterogneo de sustancias que comparten la propiedad
comn de ser solubles en solventes no polares (metanol,
cloroformo) y relativamente insolubles en agua.
Los lpidos en procariotas se encuentran mayormente en las
estructuras de superficie (m.citoplasmtica, m. externa de gram
(-), pared celular de micobacterias, pared celular de gram (+)).
Tanto en procariotas como en eucariotas los lpidos ms
abundantes de las membranas son los fosfolpidos. Los cidos
grasos monoinsaturados y conteniendo anillos contribuyen a la
flexibilidad y fluidez que posibilitan las modificaciones de forma
que acompaan el crecimiento. Los cidos grasos saturados
muestran cambios de acuerdo a las condiciones del medio.
Tambin se observan hopanoides de funcin similar a los
esteroles.
En bacterias anaerbicas se encuentran los plasmalgenos.
Los plasmalgenos
Los plasmalgenos son fosfoglicridos en los que el
glicerol fosfato tiene en el C1 un alcohol de cadena larga
unido con enlace ter. Se presentan en bacterias
anaerbicas junto o en lugar de los fosfolpidos comunes
Se les encuentra en: Bacteroides, Clostridium,
Desulfovibrio, Propionibacterium, Ruminococcus,
Selenomonas
Se especula que cumplen un rol en la generacin de
mediadores lipdicos que estn involucrados en la
transduccin de seales. As tambin se les atribuye una
funcin antioxidante.
Ciclopropano

Los cidos grasos ciclopropano se forman a partir de los c. grasos no


saturados presentes en los fosfolpidos.

La posicin no saturada es convertida en anillo mediante la transferencia de


un grupo metil de la adenosil metionina, catalizada por la ciclopropano sintasa.
Esta enzima se enlaza a los fosfolpidos que contienen ac. grasos no
saturados y forma ciclopropano en ambas caras de la bicapa.

Esta modificacin es frecuente al inicio de la fase estacionaria del crecimiento.


La razn de este cambio puede estar explicada como una proteccin contra la
oxidacin o degradacin qumica frecuente en esta etapa.

La sintasa de ciclopropano es inducida mediante la limitacin de oxgeno


abrupta y por la adicin de nitrato o tiosulfato al medio. Aunque el rol preciso
de los ciclopropano no est bien entendido, existe una considerable evidencia
que sugiere un rol de stos en la patogenicidad de M. tuberculosis y
Helicobacter pylori.
HOPANOIDES
DIPLOTENO, un hopanoide
(Zymomonas, Frankia,
Streptomyces..)

COLESTEROL , un esterol
Catabolismo de los lpidos

Accin de las lipasas

Degradacin de cidos grasos


Microorganismos productores de lipasas

Bacterias Hongos
Achromobacter Aspergillus niger
Alcaligenes Candida cylindraceae
Arthrobacter Mucor miehei
Pseudomonas Rhizopus arrhizus
Staphylococcus Rhizopus delemar
Chromobacterium Rhizopus japonicum
Rhizopus oryzae
Saccharomyces lipolytica
Humicola lanuginosa
Mucor pusillus
Lipasas microbianas de aplicacin industrial
Propiedades de las lipasas

Varan ampliamente en pH ptimo,


termoestabilidad, especificidad y selectividad de
acuerdo a la longitud de las cadenas de cidos
grasos que hidrolizan o que utilizan para
esterificacin.
Catalizan las reacciones:
Hidrlisis/sntesis de enlace ster
Transesterificacin
Aminlisis
1) Hidrlisis/sntesis de enlace ster
R- COOR + H2O R-COOH + R-OH
R-COOH + R-OH R-COOR + H2O

2) Transterificacin
Por acidlisis:
Ra-COOR + Rb-COOH Rb-COOR + Ra-COOH
Por alcohlisis:
Ra-COOR + Rb-OH Rb-COOR + Ra-OH
Por intercambio ster
Ra-COORa + Rb-COORb Ra-COORb + Rb-COORa

3) Aminlisis
RCOORa + Rb-NH2 R-CONH-Rb + Ra-OH
Degradacin de
cidos grasos
Sntesis de Lpidos
Sntesis de cidos grasos saturados
Sntesis de cidos grasos no saturados
Sntesis de fosfolpidos
Sntesis de isoprenoides , esteroles y
esteroides
Sntesis de lpidos de arqueobacterias
Los cidos grasos
Son molculas no polares de una longitud promedio de 16 a 18
carbonos en bacterias. El ms abundante es el cido palmtico
(C16),le sigue el esterico (C18) mirstico (C14) y lurico (C12)
Pueden ser saturados , monoinsaturados, ramificados , hidroxilados
, metilados o conteniendo ciclopropano
Las bacterias gram positivas son mas ricas en cidos grasos de
cadenas ramificadas que las gram negativas ...(?)
No ocurren de manera libre en bacterias, se encuentran
esterificados a otras molculas: a) a derivados glicerolfosfato
(fosfolpidos), b) a carbohidratos (lipido A) c) a proteinas
(lipoprotena)
Los ac.grasos no saturados y los ramificados otorgan mayor fluidez
a las membranas
El tipo de cido graso que est presente en la clula estar
influenciado por las condiciones de crecimiento del cultivo
(composicin del medio, tenor de oxgeno, temperatura, edad del
cultivo).
Distribucin de los cidos grasos
Los cultivos jvenes tienen grandes cantidades de cidos grasos C16
y C18 monoenoicos y slo pequeas cantidades de cidos grasos con
anillos ciclopropano, los mismos que aumentan en la ultima etapa del
crecimiento exponencial a expensas de los cidos grasos no
saturados.

En S. aureus cerca del 5% de los cidos grasos totales son


insaturados cuando el microorganismo crece en medio mnimo,
incrementando hasta el 30% cuando crece en medio rico. En aireacin
S.aureus tiene menos porcentaje de cidos grasos saturados.

Grandes cantidades de acidos grasos de cadenas ramificadas se


presentan en Bacillus, Staphylococcus, Corynebacterium,
Mycobacterium, Pseudomonas y Spirochaeta.

Muchos cidos grasos poco comunes, estn presentes en pequeas


cantidades. cidos grasos ramificados, hidroxilados y ciclopropanos
estn presentes en muchos microorganismos. El cido corinolico
(dihidroxi cido graso ramificado con 52 C) y el cido miclico
(dihidroxi cido graso ramificado con 87-88C) son ejemplos de cidos
grasos nicos en Corynebacterium y Mycobacterium
Sntesis de Ac. Grasos
Sntesis de Ac.
grasos
Biotin Carboxyl
Carrier Protein
(1)

(2) (3)
Condensacin

Reduccin

Deshidratacin Reduccin
16 palmitoil-ACP 16 palmitoleoil-ACP

Cis vaccenoil - ACP


Sntesis de cidos grasos no saturados
Se forman por dos vas: Va Anaerbica
Va Aerbica
Va Anaerbica: restringida a procariotas
(Clostridium, Lactobacillus, E.coli, bact. de
fotosntesis)
Va Aerbica: Bacillus, Mycobacterium,
Corynebacterium, Micrococcus y
eucariotas
Sintesis de cidos grasos no saturados
(cont..)
Va anaerobia: Una deshidrasa desatura un
hidroxiacil ACP de 10 carbonos hasta trans-, -
decenoil-ACP que es isomerizado hasta cis---
ACP. Este derivado no es sustrato de la enoil
reductasa y puede elongarse. Ejm: Ac.
palmitoleico y Ac. vaccnico
Va aerobia: Una desaturasa introduce un doble
enlace en un derivado ac. graso acil-ACP en
presencia de O2 y NADPH. Ejm: Ac. oleico.
Diagrama de la estructura molecular de distintos cidos
grasos
cidos grasos cido graso cis- cido graso trans-
saturados insaturado insaturado
Sntesis de Coenzima A
La coenzima A is sintetizada en un proceso de 5 pasos desde
pantotenato:
El pantotenato es fosforilado a 4-fosfopantotenato por la enzima
pantotenato quinasa.
Una cistena es aadida al 4'-fosfopantotenato formando 4'-fosfo-
N-pantotenoilcistena (PPC)
PPC es descarboxilada a 4'-fosfopantetena por una
fosfopantetena descarbosilasa
La 4-fosfopantetena es adenilada para formar defosfo-CoA.
Finalmente la defosfo-CoA es fosforilada utilizando ATP hasta
coenzima A.
Punto
de
control
Lista de grupos acil activados por la coenzima A
Acetil-CoA
Propionil-CoA
Acetoacetil-CoA
Cumaril-CoA (en la sntesis de flavonoides)

Acil derivados de los cidos dicarboxlicos


Malonil-CoA
Succinil-CoA
Hidroximetilglutaril-CoA (en la sntesis de isoprenoides)
Pimelil-CoA (en la sntesis de biotina)
Butyryl CoA
Inhibidores de la sntesis de cidos
grasos
Cerulenina: Producto fngico que
ocasiona la inhibicin irreversible de la
sintasa I y II de beta ketoacil-ACP
Tiolactomicina: Inhibe sintasa I,II y III de
beta ketoacil-ACP por modificacin
covalente del sitio de unin del malonil-
CoA. Tambin puede inhibir la sntesis
de cido miclico.
Triclosan ((2,4,4' tricloro-2'-hidroxdifenil
eter) : Inhibe la enoil-ACP reductasa.
Inhibidores de la sntesis de ac. grasos
FabA
:Hydroxydecanoyl
ACP deshidrasa
FabB: Ketoacyl-ACP
sintasa I
FabD Malonyl-
CoA:ACP
transacylase
FabE Acetyl-CoA
carboxylase
FabF Ketoacyl-ACP
sintasa II
FabG Ketoacyl-ACP
reductase
FabH Ketoacyl-ACP
sintasa III
FabI trans-2-enoyl-
ACP reductasa
FabK Enoyl-ACP
reductasa
Fosfolpidos de membrana
PS Fosfatidilserina
PE Fosfatidiletanolamina
PC Fosfatidilcolina (= lecitina)
PG Fosfatidilglicerol
PI Fosfatidilinositol
DPG Difosfatidilglicerol (=Cardiolipina)
Sntesis de
Fosfolpidos

1.- G3P deshidrogenasa


2.- G3P aciltransferasa
3.- CDP diglicrido sintasa
4.- Fosfatidilserina sintasa
5.-Fosfatidilserina
descarboxilasa
6.-PGP sintasa
7.- PGP fosfatasa
8.- CL sintasa
Acilacin del glicerol 3-P para formar el fosfoglicrido
Transferencia de grupos acil en la membrana

La protena perifrica PlsX cataliza la formacin de un (Acil-P) desde un acil-


ACP, y PlsY usa este intermediario para acilar el glicerol-3-P hasta 1-acil-glicerol-
3-P (tambin conocido como acido lisofosfatdico (LPA)). PlsB acila glicerol-3-P
utilizando ya sea donadores acil-ACP o acil-CoA . PlsC transfiere un cido graso
a la posisin 2 del LPA para formar cido fosfatdico (PA) el intermediario clave en
la sntesis de todos los fosfolpidos de membrana.
Tipos de cidos grasos de los fosfolpidos
de membrana
Los cidos grasos saturados de cadena recta (SFA) como el
ac.palmtico (16:0), son lineales y empacan juntos eficientemente
produciendo una bicapa que tiene propiedades de baja
permeabilidad.
Los cis-UFA introducen una pronunciada curvatura en la cadena lo
cual interrumpe el orden de la bicapa y resulta en una alta
permeabilidad.
La composicin de los cidos grasos de cadena ramificada afecta la
fluidez de la membrana debido al efecto disturbador que ocasiona
el grupo metil en el empaque de la cadena acilada. Los cidos
grasos anteiso promueven una mayor fluidez que los cidos grasos
iso debido a que la ramificacin con el metil se encuentra ms al
interior de la cadena.
Las bacterias que producen este tipo de cidos grasos modifican su
tasa iso:anteiso en respuesta al estrs de temperatura y pH.
Precursores de la sntesis de cidos grasos
ramificados

3
Cambios en la composicin lipdica en la
membrana bacteriana
Cada grupo bacteriano responde al estrs
de diferentes formas pero siempre
actuando sobre la composicin de los
cidos grasos de membrana.
Se han propuesto mecanismos tales como
desaturacin, ramificacin, isomerizacin
cis-trans, elongacin de la cadena de
cidos grasos y formacin de ciclo
propano.
Sntesis de fosfolpidos en E. coli

Unin del
pirofosfato

Phosphatidate
Requiere un componente activador
Fosfatidato+CTP CDPdiaciglicerol+PPi
CDP-diacilglicerol puede ser convertido en:
a) Fosfatidilserina (PS) y subsecuentemente a PE
b) Fosfatidilglicerol-3-fosfato (PG)
Sntesis de fosfatidilserina (PS) & fosfatidil-
etanolamina (PE)

1) Reaccin Fosfatidilserina sintasa


PSsintasa CMP
CDPdiacilglicerol+serina Fosfatidilserina

2) Reaccin Fosfatidilserina descarboxilasa


PSdescarboxilasa CO2
Fosfatidilserina Fosfatidiletanolamina

H+
Sintesis de
fosfatidilglicerol (PG)
1) Fosfatidilglicerol 3-fosfato sintasa
PG3Psintasa CMP
CDPdiacilglicerol+glycerol3P Fosfatidilglicerol3P
2) Fosfatidilglicerol 3-P fosfatasa

PG3Pfosfatasa Pi
Fosfatidilglicerol3P Fosfatidilglicerol
H2O
Sintesis de cardiolipina
Reaccin Cardiolipina sintasa
(procariotas vs. eucariotas)
BACTERIA

2 PGs glicerol + cardiolipina


EUCARIOTAS

CDP-diaciglicerol + PG*
CMP + cardiolipina

* Fosfatidilglicerol se forma igual


como en bacterias
Sintesis de fosfatidilinositol (PI)
(eucariota)

EUCARIOTAS
CDP-diacilglicerol + inositol PIkinase
CMP + fosfatidilinositol

Los derivados de PI y PI fosforilado


juegan un importante rol en la
transduccin de seales
Sntesis de PS en Eucariotas
PS

A
En
levaduras

PE
En levaduras la fosfatidilserina (PS) es sintetizada como en
bacterias a partir del CDP-diacilglicerol
En mamferos la PS no es derivada del CDP-diacilglicerol
sino del PE via un desplazamiento de grupos funcionales
(Serina - etanolamina)
Sintesis de PE Mamferos vs. Bacteria
MAMIFEROS
ATP ADP
1)Etanolamina Fosforiletanolamina

CTP PPi
2)Fosforiletanolamina CDPetanolamina
DiacilglicerolCMP
3)CDPetanolamina Fosfatidiletanolamina

LEVADURAS&BACTERIA
PSdescarboxilasa CO2
Fosfatidilserina Fosfatidiletanolamina
CH2-O-CH=CH-(CH2)n-CH3
Plasmalgenos
CH-O-CO-(CH2)n-CH3
() (+)
CH2-O-PO3-CH2-CH2-N(CH3) 3

Lipido (Eter)
Eter: R1-O-R2
Alkeno con enlace ter :CH2-O-CH=CH-(CH2)n-CH3
Producido en bacterias anaerbicas y en
eucariotas principalmente en los peroxisomas
Sntesis de Plasmalgenos

Reacciones en resumen
Esqueleto = DHAP
Acilacin de C1 en el DHAP mediante residuos
acil CoA o acil ACP
Intercambio del alcohol por un grupo carboxlico
en el C1
Reduccin mediante NADPH
Acilacin mediante un segundo acil CoA en C2
Grupo funcional unido al fosfato del C3
Oxidacin a alkeno via oxidasa de funcin mixta
Sntesis de
Plasmalgenos
Sintesis de isoprenoides
Estn compuestos de unidades repetidas de isopentenil
difosfato (IPP)
IPP es un intermediario en la sntesis de esteroles y de los
lpidos de arqueobacterias
Isoprenoides de importancia en microorganismos:
Undecaprenol , Bactoprenol, Ubiquinona,Clorofila
Menaquinona, Plastoquinona, Carotenos, y
Esteroles
Los esteroles estn presentes en hongos y son raros en
bacterias, las excepciones son los micoplasmas,
Streptococcus pneumoniae y los microorganismos
metanotrficos.
Sntesis del intermediario IPP

Ruta del Mevalonato Ruta del Piruvato GAP


Mycoplasma En casi todas las eubacterias
Lactobacillus La mayora de bacterias
Methanococcus gram negativas
Methanobacterium Chlamydia,
Chlamydia Aquifex,
Scenedesmus,
Pyrococcus
Mycobacterium tuberculosis
Archeoglobus
Streptomyces
Streptococcus pneumoniae
Staphylococcus aureus
Ruta del Mevalonato (levaduras)

No en bacterias
DIPLOTENO, un hopanoide
(Zymomonas, Frankia,
Streptomyces..)

COLESTEROL , un esterol
Lovastatina, un hipolipidemiante de origen fngico que inhibe la
sntesis de colesterol .
Productores: Aspergillus terreus, Monascus ruber
Accin: Inhibicin competitiva de la HMG reductasa
Ruta del Piruvato GAP (va alternativa
para la produccin de IPP en bacterias)

DXP = Deoxi-D-Xilulosa fosfato


MEP = 2C-metil D-eritritol 4P
IPP = Isopentenil pirofosfato
Sintesis de IPP: Ruta del Piruvato GAP
Reactants Enzyme Product
Pyruvate and
1-Deoxy-D-xylulose 5-
glyceraldehyde 3- DOXP synthase (Dxs)
phosphate (DOXP)
phosphate

DOXP reductase (Dxr, 2-C-methylerythritol 4-


DOXP
IspC) phosphate (MEP)

4-diphosphocytidyl-2- 4-diphosphocytidyl-2-
MEP C-methyl-D-erythritol C-methylerythritol
synthase (YgbP, IspD) (CDP-ME)

4-diphosphocytidyl-2-
4-diphosphocytidyl-2-
C-methyl-D-erythritol
CDP-ME C-methyl-D-erythritol
2-phosphate (CDP-
kinase (YchB, IspE)
MEP)

2-C-methyl-D-erythritol
2-C-methyl-D-erythritol
2,4-
CDP-MEP 2,4-cyclodiphosphate
cyclopyrophosphate
synthase (YgbB, IspF)
(MEcPP)
(E)-4-Hydroxy-3-
HMB-PP synthase methyl-but-2-enyl
MEcPP
(GcpE, IspG) pyrophosphate (HMB-
PP)

HMB-PP reductase
HMB-PP IPP and DMAPP
(LytB, IspH)
Sntesis de Isoprenoides en
bacterias

Casi todas las eubacterias con excepcin


de S. aureus y otros gram positivos como
Bacillus burgdorferi utilizan solo la va del
piruvato GAP para la sntesis de
isoprenoides.
Esta ruta ha sido tambin demostrada en
Chlamydia trachomatis, Aquifex aeolicus,
Scenedesmus, M. tuberculosis,
Synecocystis
Lpidos en Arqueobacterias

Los lpidos de arqueobacterias poseen alcoholes de cadenas largas tipo


isoprenoides que se enlazan al glicerol a travs de enlaces ter.
Monocapas y
bicapas de
lpidos en
Archaeas
Estructura del lipoglucan tetrater de Thermoplasma
acidophilum . Monocapa de lpidos en vez de bicapa.
Azcares manosa y glucosa. Adems Glicoprotenas.
Lpidos en Arqueobacterias
A. Diteres con modificaciones
en la cadena y con un anillo.
Comn en Euryarchaeota
B. Tetrateres pueden contener
hasta 8 anillos ciclopentano
(caldarchaeol)
C. Lipidos de Crenarchaeotas
con anillos ciclopentano y
ciclohexano
(Thaumarchaota)
D. Derivado de Calditol, un
tetrater encontrado en
Sulfolobus
Sntesis de lpidos de Arqueobacterias

El ncleo glicerol es sintetizado a travs de


glicerol 3-P o DHAP. El alcohol es derivado del
geranil-geranil pirofosfato (GGPP)sintetizado a
partir de acetil CoA va mevalonato.

El hidroxilo del C1 del glicerol-P reacciona con


el GGPP desplazando el pirofosfato. Contina
una reduccin de los doble enlace, la unin con
un grupo polar y la formacin de lpidos tetrater
si es el caso.
Bioconversiones microbianas a partir de
esteroides
Los esteroides pueden sufrir transformaciones qumicas por
accin microbiana an cuando no sean sintetizados por stos.
Las reacciones incluyen oxidaciones, hidrlisis, reducciones,
produccin de steres.
Varios procesos comerciales con esteroides utilizan
microorganismos . Por ejemplo en la conversin de:
Progesterona en hidroxiprogesterona por Rhizopus nigricans.
Componente S en cortisol por Curvularia lunata
Cortisol en Prednisona por Arthrobacter simplex
Progesterona en dihidrotestololactona por Cylindrocarpon radicola
Diendiol en Triendiol (precursor de prednisona) por Septomyxa
affinis
Bacterias que pueden degradar esteroides

Corynebacterium, Mycobacterium,
Streptomyces,
Rhodococcus, Pseudomonas, Comamonas,
Burkholderia,
Chromobacterium , Schizophyllum, Arthrobacter,
Brevibacterium
Stigmatella aurantiaca

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