BIO-COMPUTACIN

rea de la Bio-Informtica, que incluye el desarrollo y utilizacin de sistemas computacionales

basados en modelos y materiales biolgicos (biochips, biosensores, computacin basada en ADN,
entre otros). Las computadoras basadas en DNA (computadores ADN) se estn empleando para la
secuenciacin masiva y la deteccin de diversas enfermedades, a partir de la explotacin del
procesamiento paralelo implcito.
Dentro de la Bio-Computacin en la Bio-Informtica se encuentran 2 reas:
El desarrollo e implementacin de herramientas que permitan el acceso, uso y manejo de varios
tipos de informacin.
La creacin de nuevos algoritmos (frmulas matemticas) y estadsticos con los que se pueden
relacionar partes de un conjunto enorme de datos como, por ejemplo, mtodos para localizar un
gen dentro de una secuencia, predecir la estructura o funcin de distintas protenas y agrupar
secuencias de protenas en familias relacionadas.

COMPUTACIN CELULAR
La computacin con ADN naci en 1994 cuando Leonard M. Aldeman, cientfico de
computadores de la Universidad de California manipul ADN para resolver un problema
matemtico. Se avanz en este campo en 2001 por parte de Ehud Shapiro del Instituto
Weizmann de Israel, cuando fue capaz de utilizar molculas de ADN como nanocomputadores
biomoleculares de manera rudimentaria, para diagnosticar cnceres.

APLICACINES FUTURAS
En los niveles tecnolgicos de manipulacin de ADN, la computacin ADN no proporciona ventajas sobre
los computadores electrnicos, por ejemplo, cuando codificamos tareas con molculas de ADN para el
problema HPP de Adleman, si n es igual a 100, la cantidad de ADN necesaria seria mayor que el peso de
la tierra. No hay suficiente espacio para mejorar el algoritmo para hacer que el nmero de molculas de
ADN sea prcticamente pequeo. En esta etapa, algunas personas han comenzado a preocuparse sobre
las direcciones del estudio de la computacin ADN. Sin embargo, en otros subcampos de la computacin
ADN se han hecho grandes progresos.
Modelos de relojes de pulsera ms evolucionados tendrn la capacidad de contacto inalmbrico con
servicios de emergencia si un individuo est en serio peligro mdico. Adems, el historial medico
completo del individuo puede ser grabado y mantenido en el reloj para acceder los hospitales y mdicos,
desterrando para siempre los historiales mdicos inexactos e incompletos.
Tipos de manipulaciones moleculares bsicas para computacin ADN
Hay dos tipos principales:
-

Hibridacin simple: Es la forma bsica de la actividad del ADN. Fusin de dos

clulas de distinta estirpe para dar lugar a otra de caractersticas mixtas
Tratamiento enzimtico: Es la manera de operar con diferentes formas de ADN.

UN EVALUADOR LGICO UNIVERSAL (QUE OPERA EN CELULAS DE MAMIFEROS)

Un autmata molecular es un sistema molecular manipulado unido a un entorno (bio) molecular por el
flujo de mensajes de entrada y las acciones de los mensajes de salida, donde los mensajes de entrada
son procesados por un conjunto de elementos intermedio, esto es, un computador.
Para construir un evaluador que se ajuste a la primera
aproximacin, hay que construir un circuito biolgico que
se componga de dos o ms especies de mRNA que
codifiquen la misma protena, pero que tengan diferentes
regiones sin codificar. Esta protena es la salida del
sistema. Una salida activa biolgica puede funcionar con
un actuador. Si al menos una especie de mRNA es
traducida, la salida resultante representar un valor True
lgico, implementando una operacin OR (Figura 1a). Los
niveles de especies de mRNA y la salida son
determinados por la presencia o ausencia de las entradas
moleculares endgenas con la ayuda de mediadores
moleculares.

ARQUITECTURA DE LAS FPGAs

La arquitectura bsica de una FPGA consiste en una matriz de bloques lgicos programables (del ingls
Configurable Logic Block o CLB) y canales de interconexin entre ellos.
Por un lado, los bloques lgicos estn compuestos tpicamente por una tabla de bsqueda de cuatro
entradas (que es capaz de representar cualquier funcin lgica combinacional de cuatro entradas) y un
flip-flop. Como se observa en la figura, el bloque lgico tiene cinco entradas en total (4 que van a parar
a la tabla de bsqueda ms una seal de reloj) y una nica salida, que se obtiene o bien de la salida de
la tabla de bsqueda sin registrar (sin pasar por el flip-flop) o bien de la salida de la tabla de bsqueda
una vez registrada.
Por otro lado, los canales de interconexin estn compuestos por un gran nmero de segmentos de
cable en paralelo de tal modo que cada entrada o salida (tanto de los bloques lgicos como de la FPGA
en s) puede conectarse a cualquiera de dichos segmentos del canal de interconexin.

COMPUTADORA
INFORMACION

MOLECULAR (ADN)

CUANTICA

FOTONICA

Lloyd Smith

Paul Benioff

Mark Wade

CREADOR:

La computadora

La computadora molecular, es
un modelo de computadora
alternativo al silicio, basado
DEFINICIN:

en el uso de molculas de
ADN como unidades de
procesamiento.

cuntica es un

Se pueden registrar los

paradigma de

resultados del clculo y

computacin distinto al

no trivialmente: Se

de la computacin

mide el nmero de

clsica. Se basa en el

fotones de salida en lo

uso de qubits en lugar

que es el rendimiento

de bits, y da lugar a

de la red , explica

nuevas puertas lgicas Philip Walther de la

que hacen posibles

Facultad de Fsica

nuevos algoritmos.
Uno de los obstculos
La estructura de molculas de principales para la

PROBLEMAS:

ADN para almacenar la

computacin cuntica

informacin de partida y se

es el problema de la

estudi las molculas

decoherencia cuntica,

resultantes de las reacciones

los tiempos de

qumicas para obtener la

decoherencia para los

solucin.

sistemas y las tasas de

errores.

-Las aplicaciones
potenciales de la
fotonica son
virtualmente ilimitadas.
- limitando su
aplicacin comercial.

UNIDAD DE MEDIDA:
La medida es el nanmetro, es decir milmillonsima parte de un metro.
Recalcando que las reas ms importantes que se vislumbran de la nanotecnologa son la informtica y la
medicina.
VENTAJA:
Las computadoras moleculares presentan las siguientes ventajas frente a las computadoras tradicionales, en:
menor tamao, rapidez (eficiencia).
OBJETIVOS:
AUMENTO EN LA CAPACIDAD DE MEMORIA: Una pequea porcin de volumen contiene unas grandes
cantidades de molculas. Ejemplo. Una solucin acuosa contiene unos 108 tera-bytes.
PROCESAMIENTO PARALELO: Agilizar la ejecucin de programa mediante la divisin en fragmentos que
pueden ser ejecutados simultneamente.
COMPLEJIDAD DE PROBLEMAS QUE PUEDE RESOLVER:
Problemas de tiempo Polinmicos: Clase P.
Problemas de tiempo Exponencial: Clase EXP.
Problemas Intratables.

CONCLUSIN
La computadora molecular, es un modelo de computadora alternativo al silicio, basado en el uso de
molculas de ADN como unidades de procesamiento.
La bio-informtica est en paales, es decir, es un campo que es muy actual y que est en actual
expansin.
Aunque las expectativas del desarrollo de este tipo de tecnologa son impresionantes, las opiniones sobre
la consecucin o no de las mismas son tambin variadas.
A nivel de Per, el desarrollo de empresas relacionadas con la bio-informtica es todava escaso.