GRADO EN QUMICA

2015-16

Tema 7

cidos
nucleicos

Funciones de los nucletidos

1- Constituyentes de los cidos nucleicos: DNA (cido
desoxirribonucleico) y RNAs (cidos ribonucleicos).
2- Unidad de intercambio de energa en los procesos
metbolicos: ATP y GTP.
3- Intermediarios en las seales iniciadas por hormonas y
otros estmulos extracelulares: GTP, AMPcclico y
GMPcclico.
4- Base estructural de cofactores enzimticos e
intermediarios metablicos: Coenzima-A, NADH,
NADPH, FAD, Aceti-CoA, etc

Estructura de los nucletidos

Fosfato

Base nitrogenada:
Purina o pirimidina

Azcar:
Pentosa

Estructura de los nucletidos

Azcar

Ribosa

Aldehdo
Pentosa

-Furanosa

Desoxirribosa

Estructura de los nucletidos

Bases nitrogenadas
Bases pirimidnicas

Pirimidina

Citosina

Timina
(DNA)

Uracilo
(RNA)

Estructura de los nucletidos

Bases nitrogenadas
Bases purnicas

Purina

Adenina

Guanina

Estructura de los nucletidos

OTRAS BASES
en DNA

Estas bases modificadas parecen

intervenir en procesos de regulacin
de la expresin o proteccin de la
informacin gentica.
en tRNA

NUCLESIDO
Enlace N--glucosdico

Estructura de los nucletidos

Nucletido: Adenilato (adenosina

5-monofosfato)

Guanilato (Guanosina
5-monofosfato)

Smbolos:
Nuclesido:

Adenosina

Ribonucletidos

Guanosina

Estructura de los nucletidos

Nucletido:

Uridilato (uridina 5monofosfato)

Citidilato (Citidina 5monofosfato)

Smbolos:
Nuclesido:

Uridina

Ribonucletidos

Citidina

Estructura de los nucletidos

Nucletido: Desoxiadenilato

(desoxiadenosina
5-monofosfato)

Desoxiguanilato
(desoxiguanosina
5-monofosfato)

Desoxiadenosina

Desoxiguanosina

Smbolos:
Nuclesido:

Desoxiribonucletidos

Estructura de los nucletidos

Nucletido:

Desoxitimidilato
(desoxitimidina 5monofosfato)

Desoxicitidilato
(desoxicitidina 5monofosfato)

Smbolos:
Nuclesido:

Timidina o Desoxitimidina

Desoxicitidina

Desoxiribonucletidos

Estructura de los nucletidos

Abreviaturas de los
ribonucleosidos 5-fosfato

Adenina
Guanina
Citosina
Uracilo
Abreviaturas de los
desoxiribonucleosidos 5-fosfato

En forma de NTP se incorporan a

los cidos nucleicos DNA y RNAs

Adenina
Guanina
Citosin
a
Timina

Coeficiente de extincin molar,

Espectros de absorcin de los

nucletidos
Coeficiente de
extincin molar a 260
nm, (M-1cm-1)

Longitud de onda (nm)

Funcin de los nucletidos

Constituyentes de los cidos
nucleicos DNA y RNAs.
DNA: Almacena la informacin gentica

Especifica todos los RNAs y las protenas de un organismo as

como, cundo y dnde se va a expresar esa informacin gentica.
Define la individualidad de un organismo vivo.
Garantiza la transferencia de la informacin
gentica de una generacin a otra.

RNAs: Intervienen en la expresin de

la informacin gentica.
su transformacin en molculas funcionales
para las clulas, las protenas.
el control y regulacin de esa expresin.

Otras funciones de los nucletidos

Intercambio de energa
ster 14 kJ/mol

Adenina

Anhdrido
30 kJ/mol

Anhdrido
30 kJ/mol

ATP
Todos los nucletidos son equivalentes energticamente aunque el
ATP es la forma mayoritaria de intercambio de energa en las clulas.

Otras funciones de los nucletidos

Cofactores enzimticos

-mercaptoetilamina

Acido pantotnico

Coenzima A

3-fosfoadenosina difosfato
(3-P-ADP)

Otras funciones de los nucletidos

Cofactores enzimticos

Nicotinamida
(Vitamina B3)

Nicotinamida adenina dinucletido (NAD+)

Riboflavina
(Vitamina B2)

Flavin adenina dinucletido

(FAD)

Otras funciones de los nucletidos

Sealizadores y reguladores celulares
HormonaReceptor

Adenina

ATP

cAMP

Citoplasma

Adenosina 3,5-monofosfato cclica

(AMP cclico, AMPc)

Guanosina 3,5-monofosfato cclica

(GMP cclico, GMPc)

Estructura de los cidos nucleicos

DNA

Extremo

Extremo

RNA

Enlace
fosfodister
Las cadenas muestran
direccionalidad: 5
3

Extremo

Extremo

Estructura tridimensional del DNA

Antecedentes: qu se saba?
El DNA de distintos tejidos de un organismo
tiene la misma composicin de bases.
La composicin de bases cambia de una especie
a otra.
La composicin de bases no se modifica con la
edad, nutricin, entorno, etc.
A=T y G=C A+G=T+C
(Principio de Chargaff)
Molcula helicoidal: Imagen de
difraccin de Rayos X
(R. Franklin y M.Wilkins)

Estructura tridimensional del DNA

La doble hlice de Watson y Crick
El DNA es una doble hlice.
Cada hebra se enrolla a lo largo de un eje
central en sentido dextrgiro.

El esqueleto de azcar-fosfato se sita en el

exterior (polar).

Las bases, hidrofbicas, se localizan en el interior

Las hebras son antiparalelas (5
3 y 3
5)
A=T y G=C
Doble surco
Cadenas complementarias, no iguales.

Estructura del DNA

La doble hlice
Top view

Surco
menor
Surco
mayor

(10,5
bases)

Estructura del DNA

La doble hlice

2 puentes de
hidrgeno

Timina
Adenina

3 puentes de
hidrgeno

Citosina
Guanina

Las bases complementarias se unen mediante

puentes de hidrgeno.

Estructuras tridimensionales del DNA

Resultan de las distintas conformaciones posibles del azcar y
de la libertad de giro de los enlaces N-glucosdico y fosfoazcar

Levgira
Dextrgiras

Z form

Estabilizacin de la estructura del DNA

- Enlaces covalentes: enlace fosfodister
- Enlaces dbiles:
Puentes de hidrgeno
Interacciones hidrofbicas
Fuerzas de Van der Waals
Interacciones inicas con cationes: Mg2+

Replicacin del DNA

El modelo de doble hlice
permiti
comprender
el
fundamento de la replicacin
del DNA y la transmisin de la
informacin gentica.

Nueva

Hebra
molde

Nueva

Hebras
hijas

Hebra
molde

Estructura del DNA

PROCARIOTAS

MITOCONDRIAS

Una sola molcula de DNA circular que adopta

una estructura tridimensional superenrollada.
DNA E.coli

DNAmit: forma
relajada

DNAmit: forma
superenrrollada

Estructura del DNA

Cromosoma

Pares de
bases

Ncleo

EUCARIOTAS

Cromtida Cromtida
Telmero

Centrmero

Clula

Telmero

Nucleosomas

Histonas
Doble
hlice

Sucesivos niveles de compactacin:

La doble hlice se organiza en torno a las
histonas, formando los NUCLEOSOMAS.
Los nucleosomas se enrollan y compactan
formando un CROMOSOMA.

Propiedades qumicas
de los cidos nucleicos

Las dos hebras de la doble hlice se

pueden separar de forma reversible:
- In vitro por la temperatura (fusin) y pH
- In vivo por Helicasas
Hipocromismo
DNA parcialmente
desnaturalizado
(flechas)

Hipocromismo de
la doble hlice.

T de
fusin

Doble hlice
Desnaturalizacin

DNA
parcialmente
desnaturalizado

Proceso rpido si las hebras no

estn completamente separadas.
Templado o
hibridacin
(annealing)

Asociacin de las
hebras por
apareamiento de
las bases

Separacin de las
hebras

Hebras separadas (ovillo aleatorio)

Si las hebras estn completamente
separadas: la hibridacin ocurre en 2
etapas: 1) encuentro al azar de las dos
hebras e hibridacin en una pequea
regin, proceso lento y 2) rpida
hibridacin de las bases restantes.
Hibridacin de hebras de
DNA de diferentes orgenes.

 Modificacin
bases

de

Compuestos que
promueven
la
deaminacin de
las bases.

Figure 6-23 Essential Cell Biology ( Garland Science 2010)

sus consecuencias

Figure 6-25 Essential Cell Biology ( Garland Science 2010)

 Accin de la radiacin UV
sus consecuencias

 Accin de compuestos alquilantes

Compuestos
que promueven
la alquilacin
de las bases.
Gas mostaza

Dao oxidativo en DNA: generado por especies reactivas de oxgeno

(ROS) inducidas por procesos externos como la irradiacin o resultantes del
propio metabolismo aerbico (CT/FOX).

Bases metiladas de forma natural en DNA

Funcin todava poco conocida, podran intervenir en
mecanismos de reconocimiento de DNA propio y
reparacin (E. Coli) o en eucariotas controlando la
migracin de elementos genticos mviles o
interviniendo en el control de la expresin de genes.

SAM:
Compuesto
metilante fisiolgico.

Tipos de RNAs

Table 7-1 Essential Cell Biology ( Garland Science 2010)

Estructura general de los RNAs

Cadena sencilla que pueden plegarse por apareamiento de pares
convencional (A) y no convencionales (B) adquiriendo complejas y
variadas estructuras tridimensionales (C).

Figure 7-5 Essential Cell Biology ( Garland Science 2010)

Uniones
A-G

Estructura de una molcula

de un
RNA real que
interviene en el corte y
empalme (splicing) del RNA

RNA mensajero
Intermediarios en la sntesis de protenas
Se encuentra en el ncleo y en el citoplasma.
Sus niveles aumentan cuando aumenta la sntesis de protenas.

Gen
Gen
(a) Monocistrnico
Gen 1
(b) Policistrnico

Una sola protena

Gen 2

Gen 3
Varias protenas

RNA mensajero
Cadena sencilla
Tiende a adoptar conformacin helicoidal
dextrgira por las interacciones de
apilamiento de bases.
Estructura tridimensional de
un mRNA de Tetrahymena
termphila.

RNA mensajero
Las regiones complementarias del RNA pueden aparearse.
Son frecuentes estructuras en forma de horquilla.
Las regiones apareadas adoptan frecuentemente una
estructura de una doble hlice dextrgira tipo A.
Horquilla

Hebras
sencillas
Protuberancia

Lazo
interno

Doble hlice en la horquilla

RNA de transferencia
Su funcin es la de incorporar aminocidos a las cadenas
crecientes de protenas que se sintetizan en los ribosomas.
Su longitud vara entre 73 y 93 nucletidos.
Contiene regiones complementarias que dan lugar a su estructura.
Brazo del
aminocido

Brazo del
aminocido: Lugar
de unin de los
aminocidos
(secuencia CCA)
Puentes de hidrgeno
entre bases apareadas

Anticodon: 3 bases que se

unen al RNAmensajero

Brazo del anticodn:

7 bases no
apareadas.

RNA ribosomal:
Forman parte de los ribosomas,
interviniendo en la sntesis de protenas.
Diversos tipos y tamaos entre
especies. Tambin ejercen diferentes
funciones dentro del ribosoma; algunos
de ellos presentan actividad cataltica
peptidil-transferasa (ribozima).
Secuencias
de
nucletidos
muy
diversas entre especies pero con
estructuras tridimensionales complejas
muy conservadas.
A) Estructura
secundaria
de la subunidad 16S.
B) Estructura terciaria de la
subunidad 16S.

RIBOZIMAS:

Subunidad de RNA en la
RNAnucleasa P de E. coli

RNAs con actividad cataltica:

transesterificacin e hidrlisis del
enlace fosfodister.
Su sustrato mayoritario, aunque no
solo, son molculas de RNA del
propio ribozima (autocatlisis) o
externas.
Presentan
estructuras
tridimensionales complejas con algunos
apareamientos no convencionales
(ej. G-U).
Intervienen en el procesamiento y
maduracin de diversos RNAs (tRNA,
rRNA y mRNA) y en la formacin del
enlace peptdico en los ribosomas.