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BIOQUMICA

UNIDAD 1
PROTENAS y NUCLETIDOS
Estructura y Funcin

Prof. Lilliam Svoli R.

Ctedra de Bioqumica
Facultad de Ciencias Veterinarias
Universidad Central de
Venezuela

Objetivo 2. Describir las caractersticas estructurales


y funcionales de los pptidos.

1. Formacin y caractersticas del enlace peptdico.

2.
Concepto
de
pptidos,
nomenclatura,
representacin, ejemplos e importancia.

Dos talleres prcticos


Semana 3 y Semana 4

Evaluacin Terica
Semana 5

Aminocid
os
Compuestos orgnicos formados por
un grupo amino primario (NH2) y un
grupo carboxilo (COOH), unidos a un
mismo tomo de carbono.
Algunos aminocidos se encuentran libres
como neurotransmisores, otros se unen
entre
s
formando
pptidos
como
hormonas, o formando protenas con
mltiples funciones.
7

Estructura General

COO
H3N

C H
R
8

Formas de los
Aminocidos
COOH
H2N

C H
R

COO
+

H3N

C H
R

on hbrido
zwitterin
Predomina a pH
fisiolgico

COO
+

H3 N

R
A pH fisiolgico, el grupo Carboxilato se
encuentra en su forma de base conjugada
,

COO

H
N
3
y el grupo amino en su forma de cido conjugado
De este modo cada aminocido puede
comportarse como un cido o como una base. El
trmino ANFTERO describe esta propiedad.

10

Isomerismo de los Aminocidos


(excepto la glicina)

H3N

COO

COO

CH3
L- Alanina

H
Carbono
asimtrico

NH3

CH3
D- Alanina

Imgenes quirales (no superponibles)


Enantimeros o ismeros especulares
Poseen
ptica:

actividad rotan el plano de la luz polarizada


hacia la derecha (dextrgiros) o
hacia la izquierda (levgiros).
11

Clasificacin de los
aminocidos
1) Componentes o no de las
protenas
Aminocidos proteicos:
glicina,
alanina,
valina,
leucina,
isoleucina, prolina, serina, treonina,
cistena, metionina, tirosina, triptfano,
fenilalanina,
glutamato,
glutamina,
aspartato, asparagina, histidina, lisina, y
Aminocidos no proteicos:
arginina.
ornitina,
citrulina,
cido
gammaaminobutrico (GABA), etc.
12

2)
Segn
su
capacidad
interaccionar con el agua:

de

Apolares
Alifticos:glicina, alanina, valina, leucina,
isoleucina y prolina.
Aromticos:
fenilalanina, tirosina y triptfano.
Polares
Neutro
s:

serina, treonina, cistena,


glutamina y asparagina

aspartato.
cidosglutamato,
:
histidina, lisina y arginina.
Bsicos:
13

Aminocidos Apolares Alifticos:

Glicina, Gly, GAlanina, Ala, A

Metionina, Met, M

Prolina, Pro, P

Leucina, Leu, L

Valina, Val, V

Isoleucina, Ile, I
14

Prolina, Pro, P
Difiere de los otros aminocidos en que su grupo amino es
secundario, formado por un cierre en anillo entre el grupo R y el
nitrgeno amino.
La Prolina confiere rigidez a la cadena peptdica debido a que no es
posible la rotacin alrededor del carbono .

Implicaciones en la estructura y funcin de Protenas con alto


contenido de Prolina.
15

Las molculas NEUTRAS que llevan un numero igual de

cargas positivas y negativas de forma simultnea se


denominan ZWITTERIONES.

El grupo R proporciona a cada aminocido sus


propiedades singulares

16

Aminocidos Apolares Aromticos:

Fenilalanina, Phe, F
Triptofano, Trp, W
17

Aminocidos Polares Neutros:

Serina, Ser, S
Treonina, Thr, T

Tirosina, Tyr, Y

Glutamina, Gln, Q

Cistena, Cys, C

Asparagina, Asn, N
18

Aminocidos Polares cidos:

Aspartato, Asp, D
Glutamato, Glu, E
19

Aminocidos Polares Bsicos:

Histidina, His, H
Lisina, Lys, K
Arginina, Arg, R
20

3) Esencialidad
nutricional

Nutricionalmente esenciales:
no sintetizados por el organismo (valina,
leucina, isoleucina, treonina, metionina, lisina,
fenilalanina y triptfano).

Nutricionalmente no esenciales:

pueden ser sintetizados por el organismo


(glicina, alanina, prolina, serina, glutamato,
glutamina, aspartato, asparagina).

Nutricionalmente semiesenciales:
a) Sintetizados
a
partir
de
aminocidos
esenciales (cistena, a partir de metionina y
tirosina,
a partir
fenilalanina).
b)Se
sintetizan
ende
cantidades
adecuadas para
el estado adulto pero no para el estado de
crecimiento o la preez (arginina e histidina).

21

22

Comportamiento cido Base


cido= Sustancia capaz de ceder protones
Base= Sustancia capaz de aceptar protones

cido

Base conjugada

R-COOH

R-COO + H+

R-NH3+

R-NH2

+ H+

Los aminocidos son molculas anfteras


ya que pueden actuar como cidos o como bases
23

La titulacin de un aminocido explica el efecto


del pH sobre la estructura del aminocido
La titulacin tambin es una herramienta til para
determinar la reactividad de las cadenas laterales
del aminocido

24

Las fuerzas relativas de los cidos dbiles


se expresan en trminos de la constante
de disociacin del cido (KA) o de su pKA
pH= - log H+

pKA = - log KA

pKA = Valor del pH en el cual el aminocido


se encuentra 50% disociado y 50%
no disociado.

Presenta mximo poder amortiguador


25

Formas inicas de los Aminocidos en


Debido a que los disolucin
aminocidos poseen al menos
dos grupos ionizables en su estructura (el COOH
y el +NH3) , la forma inica predominante de estas
molculas en disolucin depende del pH.

COOH
H3N+ C H
CH3

COO
H3N+ C H
CH3

COO
H 2N C H
CH3

Medio cido
pH bajo

Medio neutro
pH fisiolgico

Medio bsico
pH alto

Carga neta = +1

Carga neta = 0

Carga neta = -1

26

Estados de disociacin de los grupos


ionizables del L- -aminocido
Histidina

pH cido

pH Bsico

pKA -COOH
Carga neta= +2

pKA Imidazol

Carga neta= +1

pKA -+NH3

Carga neta=
0

pKA Imidazol+pKA -+NH3


pI=
2

Carga neta= 1

27

Curva de valoracin de la histidina


pKA -+NH3

pKA Imidazol

pKA -COOH

Equivalentes de OH

28

Propiedades qumicas de los


aminocidos

1. Formacin de sales
cido + base

sal + agua

2. Formacin de steres
cido + alcohol

ster + agua

3. Formacin de enlace peptdico


Amino + carboxilo pptido + agua
29

Aminocidos precursores de
H
compuestos especializados

cido -aminobutrico (GABA)


Neurotransmisor,
considerado un mediador de
la sinapsis de tipo inhibidor

CH2
COOH

H3 N C H
CH2
H
CN
+

Histamina

CH
HC N

H3 N C H
CH2
+

Mediador local potente en las


reacciones
alrgicas,
interviene en el control de la
secrecin de HCl por el
30
estmago

L-Dopa

COO

Derivado de L-Tirosina
precursor de la dopamina

es

H3 N C H
CH2
+

H
H3 N C H
CH2 Dopamina
+

HO

OH

HO

OH

Derivado de L-Tirosina es un
neurotransmisor
relacionado
con las funciones motrices,
emociones y sentimientos de
placer
31

Adrenalina o epinefrina

H3 N C H
H C OH
+

HO

OH

Derivado de L-Tirosina es una hormona


que acta sobre diversos rganos
facilitando la transmisin del impulso
nervioso, incrementa el ritmo cardaco,
disminuye el flujo sanguneo en los
intestinos y lo aumenta
en los
msculos esquelticos, aumenta
H la
glicemia y es broncodilatador

CH3- NH C H

Noradrenalina o norepinefrina
Derivado de L-Tirosina, interviene en la
relajacin intestinal, vasoconstriccin y
dilatacin de las pupilas, incrementa la
frecuencia y contractilidad cardaca, la
vasodilatacin, la broncodilatacin y la
liplisis

H C OH

HO

OH
32

Triyodotironina (T3)
Derivado de L-Tirosina es una
hormona
tiroidea
que
estimula
el
metabolismo
basal, su efecto es 80%
COO
superior
al de la T4.
+

H3 N

I
O

OH

H3 N

CH2
I

I
O

Tiroxina (T4)

CH2
I

COO

OH

Derivado de L-Tirosina es una


prohormona que estimula el
metabolismo basal.

I
33

Melanina

Es un pigmento de color negro a pardo negruzco


derivado de la Tirosina, el cual se encuentra en la piel
que se encuentra en la piel, cabello y recubrimiento
de la retina de los vertebrados, medula adrenal, zona
reticular de la glndula adrenal, odo interno,
sustancia negra del cerebro, locus coeroleus

Porfirinas
Producto de la condensacin de LGlicina y Succinil~CoA, hasta formar
un anillo tetra-pirrolico, dentro del
cual se encuentra un tomo
metlico.
34

Serotonina
Derivado del Triptfano, regula el
apetito, deseo sexual, temperatura
corporal, las actividades motoras y
las
funciones
perceptivas
y
cognitivas, provoca la contraccin
del msculo liso

35

36

Pptido
s
Compuestos nitrogenados formados
por
2

ms
residuos
de
aminocidos, unidos por uno ms
enlaces peptdicos.
Enlace peptdico: Es un enlace
amida que se forma cuando el par
de e sin compartir del grupo amino de un aminocido ataca al
carbono
-carboxilo
de
otro
aminocido.
37

Formacin de un enlace
peptdico

Glicina

Alanina

Enlace
peptdi
co

Agua

Glicilalanina, Gli-Ala, GA
38

Formacin de un
dipptido
-

COO

COO
+ C
+ C
H
N
H
H
+
H3N
3
CH3
H
Glicina, Gly

Alanina, Ala

HOH
O
C

H3N +

COO -

N C H
H CH
C H
3
H

Glicil-alanina, Gly-Ala

39

Caractersticas del enlace


peptdico
La unidad peptdica es rgida y
plana

Los tomos
involucrados en el
enlace peptdico son
coplanares.
Trans: El hidrgeno
del grupo amino
sustituido, est casi
siempre ubicado
opuesto al oxgeno
del grupo carbonilo.
Es un hbrido de
resonancia con
electrones
deslocalizados a lo
largo de los enlaces
(C N) y (C O).
Presenta un
carcter parcial de
doble enlace.
40

Nomenclatura de los pptidos


Los pptidos se nombran comenzando por el
extremo N y se les da el sufijo il a los aminocidos
excepto al ltimo, es decir, se nombran como
derivados del aminocido del extremo carboxilo
Por ejemplo:

anil-seril-cisteinil-lisil-fenilalanil-histidil-treoni
Abreviaturas o smbolos separados por guiones, y
colocando entre parntesis los aminocidos
dudosos:

Ala-Ser-(Cis-Lis-Fen)-His-Tre
AS(CKF)HT

41

Representacin de los
pptidos

1.En zig-zag, con extremo amino a la izquierda.


2.Abreviaturas separadas por guiones,
colocando
entre
parntesis
los
aminocidos dudosos:
Ala-Ser-(Cis-Lis-Fen)-His-Tre
AS(CKF)HT
3.Derivados del aminocido del extremo
carboxilo.

nil-seril-(cisteinil-lisil-fenilalanil)-histidil-treon
42

Representacin de un tripptido
ltimo aa

OH

primer aa

Amino terminal,
Grupo N terminal

H3N+

CH2

Carboxilo terminal,
Grupo C terminal

CH2
N
H

C
O

CH2

OH

COO
Asp-Tir-Ser

DYS

Aspartil-tirosil-serina
43

AC. ASPARTICO ALANINA SERINA


ASPARTILALANILSERINA
44

La formacin de PPTIDOS a partir de


aminocidos a pH 7.4 Se acompaa de una
prdida neta de una carga positiva y una
negativa, por cada enlace peptdico formado.
No obstante, a pH fisiolgico los pptidos en
ocasiones son molculas con carga debido a
sus grupos R cidos o bsicos.

45

No obstante, a pH fisiolgico los pptidos en


ocasiones son molculas con carga debido a
sus grupos R cidos o bsicos.

Glutamato (aa cido) a pH


fisiolgico carga (-)

Lisina (aa bsico) a pH


fisiolgico carga (+)
46

Clasificacin de los pptidos


1. Segn el nmero de los residuos de aminocidos
(1 sola cadena):
Dipptido (2 residuos de aminocidos),
Tripptido (3 residuos de aminocidos)
Oligopptido (4 a 10 residuos de aminocidos)
Polipptido (mas de 10 residuos de aminocidos).
2. Segn el nmero de cadenas:
Monmero (1 cadena):
vasopresina
Dmero (2 cadenas):
insulina
47

Pptidos de importancia fisiolgica


Tripptido (gamma glutamil-cisteinil-glicina).
Glutatin:
SH
O CH2
H
C
C
C
N
CH2
H
CH2
O
H 3N + C H
COO

H
N
H

O
C O
H

Funciones:
Descomposicin del H2O2.
Metabolismo de sustancias txicas.
Antioxidante intracelular.
Transporte de aminocidos
48

Hormonas
pancreticas
Insulina:
Conformada por 2 cadenas, con
un total de 51 aminocidos,
responsable de la entrada de
glucosa en las clulas del tejido
muscular y adiposo.
Glucagn:
Es
una
cadena
de
29
aminocidos,
aumenta
los
niveles de glucosa en sangre,
y la movilizacin de cidos
grasos del tejido adiposo.

49

Hormonas
hipotalmicas

Hormona liberadora de tirotropina (tripptido).

Estimula la secrecin de TSH (del tiroides) y


Prolactina .
La TSH estimula la sntesis de las hormonas
tiroideas, y la Prolactina estimula la produccin de
leche en las glndulas mamarias de las hembras y
participa en la regulacin del sistema reproductor
Hormona
liberadora de gonadotropina (decapptido).
del macho
Estimula la secrecin de LH (luteinizante) y FSH
(hormona estimulante de los folculos).
La LH estimula el desarrollo celular y la sntesis de
hormonas sexuales en ovarios y testculos.
La FSH promueve la ovulacin y la sntesis
estrgenos en ovarios y desarrollo de
50
espermatozoides en los testculos.

Hormonas
hipotalmicas

Hormona liberadora de corticotropina

(41 amino-cidos).
Estimula
la
secrecin
de
ACTH
(adrenocorticotropa), la cual estimula la
sntesis de esteroides en la corteza
suprarrenal

Hormona liberadora de la hormona de


crecimiento

(44 aminocidos).
Estimula
la secrecin GH (hormona de
crecimiento), la cual promueve efectos
anablicos generales en muchos tejidos.
51

Hormonas hipofisiarias
Vasopresina ADH :
nonapptido,
promueve
la
resorcin de agua desde los
tbulos renales distales para el
mantenimiento del equilibrio
hdrico del organismo. Regula la
presin sangunea

Oxitocina:

nonapptido,
promueve
la
expulsin de leche de las
glndulas
mamarias
y
la
contraccin del msculo liso
uterino.
52

Protenas
Cadenas polipeptdicas de mas de 100
aminocidos,
con
estructuras
primaria, secundaria y terciaria por lo
menos (algunas tambin cuaternaria).
Compuesto
orgnico
nitrogenado
formado por
aminocidos, que
cumple mltiples funciones en los
seres vivos.
53

Funciones de las Protenas


Catlisis enzimtica
Transporte y almacenamiento
Proteccin inmune
Generacin y transmisin del impulso nervioso
Control del crecimiento y diferenciacin
Movimiento coordinado y soporte mecnico

54

Protenas: diversas formas y tamao

55

Clasificacin de las protenas


1)Segn su forma
a) Globulares:
Relacin longitud/ancho <
10
Solubles
en soluciones salinas acuosas.
Ejemplos: Enzimas, mioglobina, hemoglobina

b) Fibrosas:
Relacin longitud/ancho > 10
Insolubles en soluciones salinas acuosas.
Ejemplos: Colgeno, queratina.
56

2) Segn su funcin
a) Cataltica (enzimas)
b) Transportadoras (hemoglobina, lipoprotenas)
c) Almacenadoras (ovoalbmina, casena)
d) Protectoras o de defensa (queratina,
fibringeno y trombina , inmunoglobulinas)
e) Estructurales (colgeno, fibrona, elastina)
f) Reguladoras (hormonas insulina y glucagon))

g) Contrctiles o de movimiento (actina, miosina, tubulina

57

3) Segn su composicin
a) Simples: formadas solamente por residuos de
aminocidos.
Ejemplo: Albmina
b) Complejas: Contienen residuos de aminocidos
y otro (s) componente
(s)
Grupo prosttico:
parte no proteica

Apoprotena: protena sin su grupo prosttico


Holoprotena: protena combinada con su grupo prosttic
Ejemplos:

glucoprotena (glcido)
lipoprotena (lpido)
metaloprotena (metal)
fosfoprotena (grupos
fosfatos

58

4) Segn el nmero de cadenas


a) Monomricas: 1 sola cadena polipeptdica.
Ejemplo:

Mioglobina

b) Oligomrica:
polipeptdica
Ejemplo:

ms

de

cadena

Hemoglobina (tetramrica)
59

5) Segn su solubilidad
a) Solubles en soluciones salinas acuosas:
Protenas globulares (albmina, globulinas)
b) Insolubles en soluciones salinas acuosas:
Protenas fibrosas (colgeno, queratina)

60

Niveles
estructurales:
Estructura Primaria:
Secuencia de

aminocidos
unidos por enlaces peptdicos

Estructura Secundaria: Ordenamiento espacial de los


residuos
de
aminocidos
cercanos entre s

Estructura Terciaria:

Se refiere a la conformacin
tridimensional resultante del
plegamiento de una cadena
polipeptdica

Estructura Cuaternaria: Asociacin de dos

o ms
cadenas polipeptdicas (varias
subunidades o monmeros)
61

Estructura
primaria
Ly
s
Ly
s
Gl
y
Gl
y
Le
u
Val

Niveles
Estructura
estructurales:
secundaria

Estructura
terciaria

Estructura
cuaternaria

Al
a
His

62

Cada polipptido tiene una secuencia de aa especfica.


Ly
s
Ly
s
Gl
y
Gl
y
Le
u
Val

Las interacciones entre los residuos de aa determinan


la estructura tridimensional de una proten, su papel
funcional y sus relaciones con otras protenas.
Las comparaciones de secuencias de polipeptidos han
sido empleadas para trazar las relaciones genticas de
las distintas especies.

Al
a
His

63

Debido a que los enlaces peptdicos son rgidos, los carbonos


Son puntos de giro para la cadena polipeptdica .
Varias propiedades de los grupos R (tamao, carga) unidos al
carbono influyen sobre los ngulos.
Determinados aminocidos estimulan o inhiben patrones
especficos de estructura secundaria .
Muchas protenas fibrosas estn formadas casi en su totalidad
por patrones estructurales secundarios.

64

Fuerzas que estabilizan los niveles


estructurales de las protenas

nlaces covalentes (fuertes) comparticin de electrone


a. Enlace peptdico: entre el grupo alfa NH2 de un
aminocido y el grupo carboxilo de otro aminocido

b. Enlace disulfuro: entre 2 cistenas, inter o intra-cadena

Enlaces dbiles (transferencia de electrones):


a. Puentes de hidrgeno: entre el N (NH2) y el O (COOH
o del H2O), un tomo de hidrgeno es compartido
dos tomos o
diferentes
b. por
Electrostticos
salinos: entre grupos con cargas
opuestas (+NH3) y (COO)
c. Hidrfobos: Fuerzas de repulsin entre cadenas
laterales no polares y el H2O, interaccionando
entre s.
d. grupos
Van derhidrfobos
Waals: Fuerzas
de atraccin o de repulsin
dipolar a distancias cortas
65

Puentes de hidrgenos
Entre el
grupo
hidroxilo
de un
alcohol y el
agua

Entre el
grupo
carbonilo
de una
cetona y el
agua

Entre los
enlaces
peptdicos de
polipptidos

Entre bases
complementa
rias del ADN

Timina

Adenina

66

Estructura Primaria

Es la secuencia lineal de los residuos de aminocidos


Esta secuencia es la que determina la
estructura tridimensional y la funcin de
la protena
Est especificada por la informacin gentica
Las alteraciones en la estructura primaria
provocan enfermedades moleculares
Enlaces que la conforman:
Enlace peptdico
Puente disulfuro (si
lo hubiera).
67

Estructura secundaria
Plegado local, el la conformacin que se
repite de modo regular en la cadena
polipetdica.
Los tipos de estructura secundaria que
se observan con ms frecuencia son la
- Hlice y la lmina -plegada.
Ambas conformaciones se encuentran
estabilizadas por puentes de hidrgenos
entre los grupos carbonilo (C = O) y el
imino (N H) del esqueleto plipeptdico
y por interacciones de Van der Waals.
68

Alfa-hlice (-hlice)

36 residuos aa por cada


vuelta de la hlice.
Los grupos R se extienden
hacia afuera.

69

Hlice derecha
Puentes de hidrgeno
Fuerzas de Van der Waals
Longitud: entre 4 y 50
residuos (12)
3,6 residuos por vuelta
Se repite cada 18 residuos
Grupos R dirigidos hacia
afuera

70

Tipos de Hlices o espirales

Hlice 310

Hlice

Hlice

71

Lmina plegada beta

72

Cadenas plegadas en abanico.


Esqueleto peptdico extendido casi por
completo.
Implican tramos de 5 a 10 aminocidos.
Puentes de hidrgeno, Fuerzas de Van
der Waals.
Las tiras pueden ser paralelas (igual
direccin) o antiparalelas (direcciones
opuestas).
Los Grupos R alternan hacia arriba o
hacia debajo de la cadena principal.

73

Lminas -plegadas
a) Paralelas

b) Antiparalelas

Las lminas -antiparalelas son ms estables debido a que se


forman puentes de hidrgenos colineales

74

De importancia
El aa glicina donde el grupo R es tan pequeo (H) que la
cadena puede ser muy flexible
El aa Prolina (anillo rgido) que impide el giro del enlace N-C
y no tiene grupo N-H para formar enlaces de hidrgeno
intracadena que son cruciales en este tipo de plegamiento.

75

Lminas plegadas beta


antiparalelas

76

Estructuras supersecundarias
Son combinaciones de estructuras
hlices alfa y lminas beta

secundarias

de

Unidades : Estn constituidas por dos lminas -plegadas

paralelas interconectadas por un segmento de hlice


Unidades : Estn constituidas por dos -hlices sucesivas
separadas por un segmento no helicoidal.
Estn constituidos por lminas -plegadas antiparalelas interconectadas por segmentos de
aminocidos polares y glicina que producen un
cambio brusco de la direccin de la cadena
polipeptdica
Se produce cuando varias configuraciones de
Barril :
lminas -plegadas se repliegan sobre ellas
mismas.
Llave Griega: Se producen cuando una lmina -plegada antiparalela se dobla sobre s misma.

Meandros:

77

Estructuras supersecundarias
Unidades :

Barril :

Unidades :

Meandros:

Llave Griega:

78

Estructura terciaria
Es la configuracin tridimensional nica que
asume una protena globular al plegarse sobre s
misma.
Caractersticas:
1. Aproximacin de las cadenas laterales de aminocidos
distantes en la estructura primaria.
2. Empaquetamiento
3. polipeptdica.
Presencia
de

compacto

de

la

cadena

segmentos
estructuralmente
independientes con funciones especficas.

Estabilizada por:
1. Interacciones hidrfobas
2. Interacciones electrostticas o puentes salinos
3. Puentes de hidrgenos
4. Enlaces covalentes (Puentes disulfuro)
79

Interacciones que mantienen


la estructura terciaria
Puente salino

Interaccio
nes
hidrofbic
as

Puente
disulfur
o

Puente de hidrgeno
80

structuras tipo de las protenas globulare


Predominio Hlices

Mezcla de Hlices
y Lminas

Predominio Lminas

81

Estructura Cuaternaria
Es el ensamble de dos o ms cadenas
polipeptdicas separadas que se unen por medio de
interacciones
no
covalentes
y
por
entrecruzamientos covalentes.
Fuerzas que la estabilizan:
1. Interacciones hidrfobas
2. Interacciones electrostticas o puentes salinos
3. Puentes de hidrgenos
4. Enlaces covalentes (Puentes disulfuro, entrecruzamientos
de desmosina y de lisinonorleucina)
82

Estructuras Cuaternarias

Hemoglobina

Inmunoglobulina

83

Niveles estructurales de la hemoglobina


Ly
s
Ly
s
Gl
y
Gl
y
Le
u
Val
Al
a
His
Estructu
ra
primari
a

Estructu
ra
secunda
ria

Estructu
ra
terciaria

Estructu
ra
cuaterna
ria

84

Desnaturalizacin de las protenas


Prdida de la estructura tridimensional de la protena
(estructuras secundaria, terciaria y cuaternaria) por
exposicin a agentes fsicos y/o qumicos.
Dependiendo del grado de desnaturalizacin, la
molcula puede perder parcial o totalmente su actividad
biolgica.

Configuracin nativa

Protena desnaturalizada
85

Principales condiciones desnaturalizantes:

1. cidos y bases fuertes:


Alteran los patrones de los
puentes de hidrgeno e interacciones electrostticas

. Solventes orgnicos (como el etanol):


Rompen interacciones
hidrfobas
Rompen las interacciones hidrfobas
3. Detergentes:

4. Agentes Caotrpicos:
-mercaptoetanol, reduce
puentes disulfuros.
Urea, rompe puentes de hidrgenos e interacciones
Afectan las interacciones electrostticas
5. Concentracin
hidrfobas. salina:

Iones metlicos pesados (como el Pb2+ y el Hg2+)


Afectan las interacciones electrostticas

7. Cambios de temperatura:
Rompen todas las interacciones dbiles

Rompen todas las interacciones dbiles


8. Agresin mecnica:
86

Protenas Fibrosas
Protenas
alargadas,
de
estrechamente entrelazadas.

varias

cadenas

Contienen proporciones elevadas de estructuras


secundarias regulares como hlices y laminas plegadas.
Tienen funciones estructurales.
Ejemplos:
Queratinas
Colgeno
Elastina
Fibrona
87

Queratinas
-QUERATINA:
protena fibrosa estructural.
Ubicacin: pelo, lana, piel, cuernos y uas.
Estructura primaria: abundante en alanina, leucina y cistena
(puentes disulfuro).
Estructura secundaria: alfa-hlice derecha estabilizada por
enlaces de hidrgeno, puentes disulfuro y fuerzas de
Van der Waals.
Estructura terciaria: dmero (2 cadenas enrrolladas). 2 dmeros
enrrollados helicoidalmente de forma antiparalela
forman un protofilamento superenrollado (4 cadenas).
8 protofilamentos enrrollados a derecha forman un
filamento o microfibrilla (16 dmeros o 32 cadenas).
Cientos de filamentos forman una macrofibrilla.
-QUERATINA:Lminas beta. Se encuentran en plumas, escamas
(aves y reptiles).
88

-Queratina
Hlice

Dmero enrollado

Protofilamento superenrollado:

89

Colgeno
Funcin: Glucoprotena fibrosa estructural del tejido
conjuntivo.

Ubicacin: piel, tendones, huesos, dientes, crnea y vasos sanguneos.


Estructura primaria: Principalmente glicina (cada 3
residuos), prolina, hidroxiprolina e hidroxilisina
(glicosilada y no glicosilada).
Estructura secundaria: hlices 310 izquierdas, estabilizadas
por puentes de hidrgeno.
Estructura
terciaria:
Triple
hlice
(tropocolgeno),
estabilizada
por
enlaces
de
hidrgeno
(hidroxilisina).
Enlaces cruzados entre varias molculas de
tropocolgeno formando la fibra de colgeno,
mediante unin de 2 molculas de alisina,
aumentando la dureza y disminuyendo la
elasticidad. Aumentan con la edad.

90

91

Sntesis de Colgeno

Fibrona (seda de gusanos,


araas)
Lminas
plegadas beta
antiparalelas
Interacciones
de Van der
Waals
Abundante en
glicina, (uno de
cada dos
residuos es
glicina)

92

Protenas Globulares
1. Forma esfrica
2. Interior hidrfobo y exterior hidrfilo
3. Solubles en agua (polares)
4. Mltiples funciones
(catlisis,
transporte,
regulacin,
proteccin), excepto
la funcin
estructural
93

Mioglobina

Hemoglobina

(monomrica)

(multimrica)
94

Mioglobina
Hemoprotena globular monomrica
Funcin: Almacena oxgeno en las mitocondrias
del msculo esqueltico y cardaco.
Estructura primaria:
153 aminocidos
Estructura secundaria:el 75% corresponde a hlices (A,B,C,D,E,F,G,H).
Estructura terciaria:Superficie polar e interior no
polar, excepto las 2 histidinas
cercanas al Hemo. Un grupo
hemo en el centro de la
molcula.
95

Estructura de la
Mioglobina
Grupo hemo

Carboxilo terminal
Amino terminal
96

Hemoglobina
Hemoprotena polimrica de los eritrocitos
Funcin: Transporte del oxgeno desde los pulmones hacia los tejidos y
del CO2 y protones desde los tejidos hacia los pulmones para
ser excretados.
Ubicacin:Eritrocitos.
Estructura primaria:
rica en todos los aminocidos
Estructura secundaria:8 alfa hlices (75%).
Estructura terciaria: globular, superficie polar e interior no polar,
excepto las 2 histidinas cercanas al grupo hemo.
Un grupo hemo en el centro de cada monmero.
Estructura cuaternaria:tetrmero, 2 cadenas alfa (141 aa) y dos
cadenas beta (146 aa) Fija 4 molculas de
oxgeno (una por cada Hemo).
Efecto cooperativo: La

oxigenacin de 1 cadena altera la


conformacin
de
la
segunda
cadena
97
favoreciendo
su
oxigenacin
y
as
sucesivamente.

Estructura del grupo hemo

Consta de un anillo
de porfirina, formado
por cuatro pirroles,
con un tomo de Fe+2
en el centro.

98

Imagen ampliada del


bolsillo del grupo hemo

Coordinacin octadrica
del tomo de hierro

99

EFECTO BOHR DE LA HEMOGLOBINA

La cada del pH en los capilares sanguneos reduce la


afinidad de la hemoglobina por el oxgeno
(protonacin de la histidina)

100

Protenas Plasmticas
Albmina
Globulinas (alfa, beta y gamma)
Fibringeno

Fibringeno

Patrn de electroforesis de las protenas


plasmticas

101

Albmina
Protena simple globular monomrica de 585 aa.
Ubicacin:
plasma sanguneo (la ms abundante, 4 mg/dL).
Lugar de sntesis:
hgado.
Funciones:
a) Ayuda a mantener la presin osmtica de la sangre.
b) Transporta cidos grasos libres, algunas hormonas
esteroideas por la sangre, bilirrubina y una porcin
del triptfano plasmtico y una gran variedad de
frmacos (aspirina, penicilina G, sulfonamidas, etc).
c) Fija el calcio (50%) en la sangre y
alrededor del 10% de cobre.

102

Globulinas
Protenas plasmticas globulares complejas.
Lugar de sntesis:hgado.
Clasificacin:
Alfa-1: lipoprotena de alta densidad (HDL:transporta colesterol)
Alfa-2: Haptoglobulina, ceruloplasmina (transporte
plasmtico de cobre).
Pre-beta: lipoprotena de muy
(VLDL:transporte de triglicridos).

baja

densidad

Beta-1: Transferrina(transporte plasmtico de hierro),


lipoprotena de baja densidad (LDL: transporte de
colesterol).
Gamma:
anticuerpos
103

Inmunoglobulinas plasmticas
(gamma globulinas)

Glucoprotenas de por lo menos 4 cadenas.


Ubicacin:
plasma sanguneo.
Lugar de sntesis:linfocitos B.
Funcin:
anticuerpos (proteccin contra agentes extraos).
Estructura secundaria:predominantemente
beta antiparalelas.
Estructura terciaria: por 2 cadenas
pesadas
(L2P2)
enlaces disulfuro.

lminas

ligeras y 2
unidas
por
104

Fraccin amino
terminal

Fraccin amino
terminal

Dominio
variable
Dominio
constant
e

105

Tipos de Inmunoglobulinas

El tipo de cadena H determina la clase de la inmunoglobulina


IgG: 1 tetrmero (anticuerpos plasmticos mas abundantes)
IgA: 2 tetrmeros (secreciones corporales)
IgE: 1 tetrmeros (respuestas alrgicas)
IgM: 5 tetrmeros (respuesta inicial al microorganismo invasor)
IgD: 1 tetrmero

106

Tipos de Inmunoglobulinas
Monmeros IgD, IgE, IgG

Dmero IgA

Pentmero IgM

107

Inmunoglobulin
2 cadenas
a Gligeras y 2 cadenas
pesadas

108

Inmunoglobulina M
(pentamrica)

109

Fibringeno
Glucoprotena alargada plasmtica, soluble en
agua.
Lugar de sntesis:
hgado
Composicin:
por 6 cadenas (tres pares), unidas
por puentes disulfuro.

(A)2; (B)2; (Gamma)2


Funcin:al transformarse en fibrina, se polimeriza
formando un cogulo insoluble y evitando
110
la hemorragia.

Estructura del Fibringeno


A 66 KD
B 52 KD
46 KD

Cadena polipeptdica
Fibrinopptido A
Fibrinopptido B
Puente disulfuro
Lugar de corte de la Trombina
111

Actina
Polmero de doble hlice (actina F) de una protena
globular (actina G)
Ubicacin: tejido muscular, forma parte de
filamentos delgados de la miofibrilla.

los

Sitios de unin:
1. Con el ATP por un monmero de actina G,
conduciendo a la polimerizacin, hidrolizndose
el ATP.
2. Con la miosina en cada subunidad.
Funcin:contraccin muscular.
112

Modelo del Filamento


de Actina F

Estructura del
monmero de
Actina G

Los monmeros de Actina G


se
indican
en
colores
diferentes
Los residuos verdes son los
puntos de unin con la
miosina113

Miosina
Protena muscular, conforma el filamento grueso
de la miofibrilla muscular.
por
6
cadenas
Composicin: Formada
polipeptdicas (2 pesadas y 4
livianas).
Estructura terciaria:2 grandes subunidades: 1
cabeza globular y 1 cola
fibrosa.
Funcin:
contraccin muscular.

El complejo actina-miosina (actomiosina)


aumenta la actividad intrnseca de
ATPasa.
114

Molcula de Miosina
2 grandes subunidades
6
cadenas
polipeptdicas
(2
pesadas y 4 ligeras,
unidas
por
interacciones debiles)

Cabeza
globular

Cola
fibrosa
115

116

Nucletidos
Compuestos
nitrogenados
orgnicos, formados por una base
heterocclica
aromtica,
un
monosacrido y por lo menos un
cido fosfrico.
Cumplen funciones importantes
en la transferencia de energa, en
la regulacin metablica y/o como
sillares
estructurales
de
los
cidos nucleicos.
117

Estructura de un nucletido
Adenina
(Base aromtica nitrogenada)

Ribosa

(Azcar C5)

Grupos fosfatos
118

Anillos de Purina y pirimidina

Purina

Pirimidina

119

Bases Nitrogenadas
Pricas
NH2
N

Adenina
N

HN

Guanina
N

CH
HC

CH

H2N

N
H

Pirimidnicas:

NH 2

HN
N

C
CH

C
CH

C
CH

N
Uracilo

N
Citosina

HN

C
C
CH

CH3

N
Timina

120

Bases
nitrogenadas
O
CH3

H3C

N
CH

C
O

Caf

Cafena (1, 3, 7- trimetil-xantina)


O

CH3

H3C

HN

CH3
C

N
CH3

N
H

N
CH

C
O

CH

Teofilina (1, 7- dimetil-xantina)

Cacao
Teobromina (3, 7- dimeti-xantina)

CH3
121

ases nitrogenadas poco comune


NH 2

NH 2
CH3

CH2OH

H
H3 C

O
5-metil-citosina

H
5-hidroximetil-citosina

CH3
N

O
C

N
HN

CH
HC

N
H

Dimeti-Adenina

CH3
C

N
CH

H2 N

7-metil-guanina

122

Conformaciones syn y anti

syn-Adenosina

anti-Adenosina

123

Frmula de la Base
nitrogenada

Nombre de la Base
nitrogenada

Nombre del
nuclesido

Nombre del
nucletido

NH2

CH
HC

Adenina

Adenosina

Adenosina 5
monofosfato AMP

Guanina

Guanosina

Guanosina 5
monofosfato GMP

Uracilo

Uridina

Uridina 5
monofosfato UMP

Citosina

Citidina

Citidina 5
monofosfato CMP

Timina

Timidina

Timidina 5
monofosfato TMP

N
H

O
HN

N
CH

H2N

N
H

124

1. Nuclesidos:

2. Nucletidos:

Adenosina

Adenosina 5 monofosfato
AMP

Guanosina

Guanosina 5 monofosfato
GMP
125

Adenosina
Adenosina 5 monofosfato
AMP

Funciones:
Principal transductor
energtico.
Precursor de coenzimas.
Adenosina 5
trifosfato
ATP

El AMP es componente de
los cidos nucleicos.

126

Hidrlisis del ATP para producir


energa
Principal
transductor
de energa

Producto y
Sustrato en la
fosforilacin
oxidativa

127

Derivados del
Coenzima
AMP

S-Adonosilmetionina

Metionina*

Adenilatos de
aminocidos

Aminocido

Sulfato activo

SO3-2

PO3-2

3 5 AMPcclico

PO3-2

NAD+

NADP+

PO3-2

FAD+

CoA~SH

PO3-2

* Reemplaza al grupo fosfato


R es un derivado de la vitamina B
128

Guanosina

Guanosina 5
Trifosfato GTP

Guanosina 5 monofosfato
GMP

Funciones:
Succinil CoA
Succinato (ciclo
Krebs)
Regulador y fuente de energa
para la sntesis de protenas.
El GMP es componente de los
cidos nucleicos.
129

Segundos mensajeros

AMPc

GMPc

130

Funciones:
Interviene en la
sntesis de
fosfoglicridos.

Citidina 5
Trifosfato CTP

El CMP es
componente de los
cidos nucleicos.
131

Uridina 5
Trifosfato UTP

Funciones:
Intervienen en el
metabolismo de los glcidos.
Interviene en reacciones de
conjugacin del cido
glucurnico.
El UMP es componente del
ARN.
132

Timidina 5
Trifosfato TTP

Timidina
Funcin:

El TMP es componente del


ADN.
133

ACIDOS NUCLEICOS
Polmeros de nucletidos monofosfatos pricos y
pirimidnicos, unidos por enlaces fosfodiester.

ribosa

ARN
cido
ribonucleico

Desoxirribosa

ADN
cido
desoxirribonucleico

134

Comparacin entre el ADN y el ARN

135

ACIDO

DESOXIRRIBONUCLEICO
(DNA)

ADN circular

136

Apareamiento de bases en
el ADN

137