CIDOS NUCLEICOS

Meischer (1869), descubri los cidos nucleicos, trabajando con

leucocitos y espermatozoides de salmn. Obtuvo una sustancia
rica en carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno y un porcentaje
elevado de fsforo. A esta sustancia se le llam en un principio
nucleina, por encontrarse en el ncleo.
Aos ms tarde, se fragment esta nucleina, y se separ un
componente proteico y un grupo prosttico, este ltimo, por ser
cido, se le llam cido nucleico.
En los aos 30, Kossel comprob que tenan una estructura
bastante compleja.

En 1953, James Watson y Francis Crick, basados en

estudios previos de algunas caractersticas fsicas y
qumicas del ADN, proponen la estructura
tridimensional de este.

Una de las caractersticas ms llamativas

del ADN es que es capaz de codificar una
cantidad enorme de informacin biolgica.
.

Una clula fetal de mamfero no

diferenciada contiene solamente unos
cuantos picogramos (10-12 g) de ADN.

la sntesis de un nmero
enorme de protenas
que determinan la forma y
comportamiento bioqumico de
una gran variedad de tejidos
diferenciados en el animal
adulto

El ADN (Acido Desoxi ribo Nucleico) contiene

informacin almacenada en una larga cadena,
cuya secuencia determina la naturaleza del
organismo as sea una ameba, un tomate o
una vaca. La informacin gentica de cada
uno de nosotros es como una huella digital,
ya que es nica y personificada. Los genes
son secciones particulares de esta cadena de
ADN, que determina las caractersticas de
nuestro cuerpo. Por ejemplo, los genes
responsables de la melanina harn que en el
individuo se manifieste el rasgo "cabello
oscuro" o "cabello claro". Los defectos de los
genes pueden causar disfunciones en el
metabolismo de las clulas, y es el origen de
muchas
enfermedades
genticas.
Por
ejemplo, el albinismo es un defecto de la
melanina. La diabetes por su parte, puede ser
causada por una mutacin en el gen de la
insulina. La hemofilia es un defecto en los
factores de coagulacin de la sangre.

Composicin de los Ac. Nucleicos

Los cidos nucleicos estn formados por largas cadenas de nucletidos,
enlazados entre s por el grupo fosfato. Pueden alcanzar tamaos
gigantes, siendo las molculas ms grandes que se conocen, constituidas
por millones de nucletidos

Los nucletidos estn formados por:

Una

pentosa: que
desoxirribosa)

puede

(ribosa

Una base nitrogenada: que puede ser:

Prica: Guanina (G) o Adenina (A), o
Pirimidnica: Timina (T), Citosina ( C) y
Uracilo (U)
Un cido fosfrico: que en la cadena de
cido nucleico une dos pentosas a
travs de un enlace fosfodiester.

nnuclesido

nucletido

Una hebra de ADN

Tipos de cidos Nucleicos

Existen dos tipos de cidos nucleicos, ADN y ARN, que se diferencian

por el azcar (pentosa) que llevan: desoxirribosa y ribosa,
respectivamente.
Adems se diferencian por las bases nitrogenadas que contienen: El
ADN est formado por: adenina, guanina, citosina y timina; y el ARN
por: adenina, guanina, citosina y uracilo.

Citosyne

thymine

Uracil
ARN

Pyrimidines

Purines
Adenines

Guanine

azucares

Bases Nitrogenadas

4
3

3
2

5
6

8
9

Azcar

cido desoxirribonucleico (ADN): El ADN est formado por la unin de

muchos desoxirribonucletidos, unidos entre s mediante las bases
nitrogenadas, por medio de puentes de hidrgeno.

La adenina enlaza
con la timina,
mediante
dos
puentes
de
hidrgeno,
mientras que la
citosina
enlaza
con la guanina,
mediante
tres
puentes
de
hidrgeno.

Radical Fosfato

Base nitrogenada

Azcar

Nuclesido

Nuclesido

Radical fosfato

Nucletido
Nucletido

Nucletido

Nucletido

Nucletido

... = AN

ADN

Desoxirribosa
Adenina, guanina, citosina, timina
Radical fosfato

ARN

Ribosa
Adenina, guanina, citosina, uracilo
Radical fosfato

En el ARNt ya se confirma la existencia de ribotimilato

En el DNA fagos hay uracilo

La estructura de un determinado ADN est definida por la "secuencia" de las

bases nitrogenadas en la cadena de nucletidos, residiendo precisamente en
esta secuencia de bases la informacin gentica del ADN. El orden en el
que aparecen las cuatro bases a lo largo de una cadena en el ADN es, por
tanto, crtico para la clula, ya que este orden es el que constituye las
instrucciones del programa gentico de los organismos.
Conocer esta secuencia de bases, es decir, secuenciar un ADN equivale a
descifrar su mensaje gentico.

Propiedades de las bases nitrogenadas

a) Tautomera: Reacciones
intramoleculares que determinan un
equilibrio entre ismeros con
diferencias en sus enlaces. Los
tautmeros preferentes determinan
el apareamiento de bases que se
observa en el DNA.
Son dos las formas: lactama y
lactima. Bajo las condiciones de pH
y temperatura el equilibrio est casi
totalmente desplazado a lactama,
amino, amida interna o forma
ceto, en lugar de lactima, imino,
imida interna o forma enol.

C4 de la C
NH2 y no NH
Los tomos de N

C6 de la A

amino

imino

C6 de la G
Los tomos de O

C=O y no C-OH
C4 de la T

ceto

enol

b) Rotacin en torno al
enlace glucosdico
En nucletidos las dos
conformaciones se
interconvierten. La
rotacin entorno al
enlace glucosdico (entre
la pentosa y la base)
determina dos
corformaciones:
-Sin (la base sobre la
pentosa)
-Anti (la base hacia
fuera). Ambos se
interconvierten en
nucletidos de purina. La
forma anti predomina en
nucletidos de pirimidina
y en los cidos nucleicos.

c) Absorcin de luz: lo que sirve para cuantificar cidos nucleicos

espectrofotomtricamente

Estructura del ADN: Primaria

En un monucletido, el grupo fosfato es

un ster fosfrico primario, lo que
quiere decir que posee un solo enlace
ster. En el dinucletiso se forma el
enlace fosfodister, es decir el fosfato
est unido a dos grupos.

secuencia

esqueleto

El dinucletido
formado es 3 5
fosfodister. Se
pueden seguir
aadiendo ms
nucletidos,
establecindose
un esqueleto:
azcar fosfato
azcar, con una
base unida a cada
azcar en su
posicin 1.
La informacin
codificada radica
en la secuencia de
las BN

pApA

ApAp

OH

El grupo ortofosfato puede esterificarse en 5 3 o en 3 5

 El grupo fosfato es vulnerable a la ruptura qumica o enzimtica

Por qu desorribosa y no ribosa?

La presencia de un grupo OH
en posicin 2 de la ribosa, la
hace que el polinuceltido sea
menos estable: el OH se
encuentra adecuadamente
situado para atacar el P en
presencia de iones OH - ,
causando la rotura de la unin
fosfodister. Al formar un
enlace cclico 2, 3

Fosfonucletido 5

Fosfonucletido 3

Estructura Secundaria
Modelo propuesto por Watson y Crick en
1953.
Son dos hebras antiparalelas, en forma
de hlice, que se mantienen unidas por el
apareamiento complementario de las
bases:
A T y C- G
2

Presencia de grupos cetnicos y amnicos:

lo que ofrece la oportunidad para formar
enlaces H
Cetnico: T, U
Amnico: A

Forman un puente

Amnico Cetnico: G

Forma dos puentes

Espectro de difraccin de
rayos X: Wilkins y Atsbury

James Watson y Francis Crick

Regla de la Equivalencia
El modelo secundario descrito requiere cantidades equivalentes de A y T
y de C y G. Demostrado por Chargaff mediante cromatografa antes que
Watson y Crick propusieron el modelo:
A/T y C/G

= 1

A/G

C/T

= 1

En contraste con la universalidad de la complementariedad, la proporcin

A + T/ G+C vara enormemente de una especie a otra:
AT
AT
CG
TA

TA
4/4 = 1
4/2 = 2

2/2 = 1
2/4 = 0,5

GC
GC
C- G

AT

CG

G-C

G-C

1/1 = 1
1/5 = 0,2

5/5 = 1
5/1 = 5

Orientacin de las
hebras

Una hebra se
orienta en
sentido 5 3 y
la otra en
sentido 3 5, es
decir son
antiparalelas

Resumen de las caractersticas del modelo

Las dos hebras son helicoidales
La doble hlice tiene un dimetro de
20 A
La doble hlice da un giro completo
cada 34 A hacia la derecha: dextrgira
La distancia entre dos nucletidos
sucesivos es de 3,4 A, es dcir en una
vuelta hay 10 nucletidos.
Las dos hebras son antiparalelas
Las dos hebras giran en hlice, una
alrededor de la otra, enlazndose
mediante puentes H en la parte central
Hay un apilamiento de bases
estabilizan la estructura helicoidal,
puede ser mucho ms fuerte que la
establece los puentes H entre las
cadenas

que
que
que
dos

Consecuencias de la doble hlice

Estructura de doble hlice: estabilidad

Inexistencia de restricciones respecto a la secuencia de bases de su
estructura primaria: til como molcula informativa
Un gen = 1000 pb promedio

4 1000 nmero inimaginable de

combinaciones

Estructura doble: replicacin exacta

Complementariedad: replicacin, transcripcin y traduccin.
Los cambios ocasionales de unas bases por otras: mutaciones
Intercambio de segmentos entre cromtidas hermanas: recombinacin

Tipos de ADN
TIPO DE ADN

GIRO DE HELICE

nm por Vuelta

Plano entre bases

Dextrgiro

2.8

inclinado

n de nucleotidos por
vuelta
11

Dextrgiro

3.4

perpendicular

10

Levgiro

4.5

zig-zag

12

Estructura Terciaria

Se refiere a como se almacena el ADN en

un volumen reducido. Vara segn se
trate de organismos procariotes o
eucariotes:
a) En procariontes se pliega como una
super-hlice en forma, generalmente,
circular y asociada a una pequea
cantidad de protenas, no histonas. Lo
mismo ocurre en la mitocondrias y en
los plastos.
b) En los eucariotas est unido a
protenas del tipo histonas,
constituyendo la cromatina

Propiedades del ADN

1. Tamao y peso molecular: Se utilizan unidades moleculares:
nanmetros y amstrong
Para el PM se utiliza el dalton:
1 d = masa de 1 tomo de H = 1,66 x 10
1 vuelta 34 A
10000

24

10 pb
X

X = 2491 pb = 3000 = 2 x 106d

As, se se determina el PM se puede calcular indirectamente la longitud
y su contenido gentico
Genoma ms pequeo: 1,7 u SV40 ( 5 a 10 genes)
Hombre: 1,6 a 8,2 cm: 48 a 240 megabases

2. Propiedades Fsicas y Qumicas

a) Absorvancia: Mide la concentracin del ADN en funcin de la
cantidad de luz de una determinada longitud de onda que es
absorbida por las molculas en la solucin.
La
molcula duplexa presenta menor absorbancia. Se puede
calcular
la pureza de la solucin con la proporcin 260/280.
La
absorbancia de un mol de ADN es de un 35 a 40% al valor
calculado de la absorbancia de las bases que la componen:
efecto
hipocrmico

Bases nitrogenadas
Protenas

DNA

A260
= 1,8
A280

Absorcin mxima 260 nm

Absorcin mxima 280 nm

RNA

A260
= 2,0
A280

b) Interacciones Inicas: Debido a la presencia del gran nmero de

fosfatos hacia su superficie, el ADN se comporta como un fuerte
polianin: polianin, que le permite reaccionar con molculas positivas
c) Viscosidad: Es directamente proporcional a la resistencia de sus
componentes a flotar:
- ADN duplexo: fuertemente viscoso

d) Sedimentacin en centrifugacin: Se usa para separar cidos

nucleicos. Hay dos tcnicas:
En gradiente de densidad preformada: La posicin del ADN en el
tubo depende del tiempo de exposicin y del tamao de la molcula

e) Desnaturalizacin desnaturalizacin: Marmur y Dotty demostraron

que incrementando lentamente la T, el ADN pierde su naturaleza
duplexa.
Tambin demostraron que existe un Tm. La dinmica de la desnaturacin
se midi a travs de la absorbancia: efecto hipercrmico

Cuando el ADN se enfra vuelve a recuperar su estructura duplexa, si

se lee a 260 nm baja la absorbancia: efecto hipocrmico
la velocidad de renaturalizacin del ADN de un organismo est
relacionada con su complejidad. La complejidad se define como la suma
del nmero de nucletidos que tiene cada tipo de secuencia sin tener
en cuenta el nmero de veces que est
repetida. El ADN de los virus y las
bacterias en su mayora slo tiene
secuencias que estn una sola vez en el
genoma (secuencias nicas). Sin
embargo, los organismo ms complejos,
como los eucariontes, presentan distintos
tipos de secuencias en su genoma. Los
eucariontes tienen secuencias nicas
(SU), secuencias de bajo nmero de
copias (SBNC, 2-10 copias), secuencias
repetidas (SR, alrededor de 102 copias) y
altamente repetidas (SAR, 103 a 106
copias).

f) Energa libre: (

G) Su relacin seala el grado de estabilidad de

la doble hebra. Es una constante termodinmica que indica la cantidad
de energa consumida (+) o liberada (-) en una reaccin. Se mide
Kcal/mol
Globalmente cuando se va a formar una estructura de bases
emparejadas, se libera energa y su estabilidad est en esa capacidad
para liberarla.
Se libera energa en cada par de bases que se forman

LE 5-25
DNA

Synthesis of
mRNA in the nucleus
mRNA

NUCLEUS
CYTOPLASM

mRNA
Movement of
mRNA into cytoplasm
via nuclear pore

Ribosome

Synthesis
of protein

Polypeptide

Amino
acids

REPLICACIN DEL ADN

La capacidad de las clulas de mantener un

elevado grado de orden dentro de un
universo catico, depende de la informacin
gentica que se expresa, se mantiene y a
veces mejora, mediante los procesos
genticos bsicos la sntesis de protenas y
del RNA, la reparacin
del DNA, la
replicacion del DNA y la recombinaci6n
gentica.

Replicacin
La reproduccin requiere la transmisin fiel de la
informacin gentica de padres a hijos
Esto hace necesario una replicacin exacta del
ADN genmico completo
Se necesita una compleja maquinaria para copiar
las grandes molculas de ADN que forman los
cromosomas en procariotas y eucariotas
Los virus utilizan esta maquinaria para replicar su
ADN, alterando al ADN de la clula que infect

REPLICACIN COMO PROCESO SEMICONSERVATIVO

La
replicacin
semiconservadora.

del

ADN

es

Si cada cadena de ADN actu de molde

para la sntesis de una nueva cadena, se
producirn dos molculas de ADN nuevas,
cada una con una cadena nueva y vieja
este proceso de denomina replicacin
semiconservadora

REPLICACIN DE ADN

LA Replicacin empieza en un punto de origen y normalmente transcurre en

forma bidireccional.
la replicacin es un proceso altamente coordinado en el que las cadenas se
desenllorran y replican simultneamente
La replicacin inicia en sitios en forma lazos conocidos como horquillas de
replicacin.

Dos requisitos centrales para la sintesis de

ADN
1.- ADN polimerasa requiere de un molde,
segn la reglas de apareamiento de Watson y
Crick en donde hay una G en el molde se aede
una C a la nueva cadena asi sucesivamente.
2.- se requiere un cebador. Un cebador es un
segmento de cadena nueva (complementario al
molde) con grupo 3hidroxilo al que se le aade
nuclotido.

Elementos necesarios para la

replicacin

Enzima Principal:
DNA Polimerasa
Desoxirribonuclesidos 5-trifosfatos
(dNTPs)
Protenas adicionales:
Primasa
De enganche deslizantes y de carga (PCNA y RFC)
Helicasa
De unin al ADN monocatenario (RFA)
Topoisomerasas

Secuencias de ADN para iniciar la replicacin

Protenas que reconocen esa secuencia (ORC)

ADN polimerasas
Enzimas con la capacidad de copiar exactamente una
hebra molde de ADN
En procariotas se han identificado 3 variedades:
ADN polimerasa I (con actividad de exonucleasa,
elimina iniciadores)
ADN polimerasa II (no se conoce bien su actividad)
ADN polimerasa III (es la que coloca los nucletidos)

ADN polimerasas
En eucariotas se han identificado otros tipos de
ADN polimerasas:
y : son activas en las clulas en divisin
(ADN polimerasa III)
funciona como reparadora de ADN daado
(ADN polimerasa I)
: se localiza en la mitocondria

ADN mitocondrial

Caractersticas de las
ADN polimerasas
Todas las ADN polimerasas sintetizan ADN solo en
direccin 5 3 aadiendo a la cadena en crecimiento
un dNTP al grupo 3OH
No son capaces de iniciar la sntesis del ADN de novo
sino que necesitan de un cebador o iniciador
preformado, esto solo pueden hacerlo las ARN
polimerasas

ADN polimerasas
Desoxirribonuclesido
tri-fosfato entrante

trifosfato

Hebra
recin
sintetizada

Desoxirribonucle
sido tri-fosfato
entrante

Hebra
patrn

Hebra
patrn

pirofosfato
5a 3direccin
de crecimiento
de la cadena

Hebra
recin
sintetizada

Enzimas que participan en la

duplicacin del ADN

Topoisomerasas: catalizan
la rotura reversible y la
unin de las hebras de
ADN, ruptura de puentes
fosfodiester.
Topoisomerasa I: reduce el
nmero de enrollamientos
negativos.
Topoisomerasa II: ( DNA
girasa) corta las dos
cadenas y luego lo pasa
por el lazo que ha formado.

Enzimas que participan en la

duplicacin del ADN
Helicasa: Catalizan el
desenrrollamiento de
la doble cadena,
rompiendo los puentes
de hidrgeno, separa
la doble cadena

Enzimas que participan en la

duplicacin del ADN
Primasa: coloca
fragmentos cortos de
ARN en los fragmentos
de Okasaki de la
hebra rezagada
Ligasa: se encarga de
unir los fragmentos de
Okasaki

ADN EUCARIOTA
DNA polimerasas
Enzimas con la capacidad de copiar exactamente
una hebra molde de ADN
Alfa:

participa conjuntamente con la Primasa

en la sntesis de los fragmentos de okazaki
Beta: reparacin del ADN daado
Delta: ensambla la hebra lder y la rezagada
(polimerasa III)
Gamma: replicacin del ADN mitocondrial
Epsilon: no esta definida su funcin

REPLICACION DEL ADN

1. El ADN es desenrollado
por las topoisomerasas
2. Luego se separan las 2
cadenas por medio de la
helicasa

Horquilla de replicacin
El antiparalelismo
del ADN representa
el problema de
sntesis 5 3
Este es un modelo
incorrecto de
replicacin, ya que la
ADN polimerasa solo
aade nucletidos
den direccin 5 3

Se
El primer
separanpaso
las 2escadenas
la colocacin
por medio
de unde
la
pequeo
helicasafragmento de ARN por la
Se
enzima
unen PRIMASA,
a cada cadena
este fragmento
simple las
protenas
despus es
SSB
removido
que estabilizan
por unalas
cadenas
polimerasa
y evitan
con actividad
el enrollamiento
exonucleasa.
Proteinas SSB

HELICASA

REPLICACION DEL ADN

La polimerasa III coloca los nuclotidos complementarios en
direccin 5 - 3 en ambas cadenas.
5
3

Fragmentos de Okasaki

La enzima primasa sintetiza segmentos de ARN 83-10

nucletidos, llamados iniciadores, cebadores o primers
(en eucariotas actan la primasa y la ADN polimerasa )

Estos iniciadores se extienden con la ADN polimerasa (III en

procariotas y ADN polimerasa en eucariotas)

Los iniciadores de ARN deben eliminarse y ser

reemplazados por ADN
en E. coli acta una ARNasa H y la ADN polimerasa I
En eucariotas actan otras exonucleasas y la ADN
polimerasa

Los fragmentos de Okasaki son unidos por ligasas

Origen de fragmentos de
Okasaki

Virus ARN
Poseen una transcriptasa inversa
Sintetiza una hebra de ADN a partir del ARN
Luego, a partir de este ADN fabrica ms copias
de ARN

Enzimas que participan en la duplicacin del ADN

en clulas procariotas

Topoisomerasas: desenrollan y enrollan el ADN

Helicasa: rompe los puentes de hidrgeno, separa la doble cadena
Polimerasa III: coloca los nucletidos de ADN, reconocimiento y
correccin de ensamblaje.
Primasa: coloca fragmentos cortos de ARN en los fragmentos de
Okasaki de la hebra rezagada
Ligasa: se encarga de unir los fragmentos de Okasaki
Polimerasa I: funcin exonucleasa, retira los fragmentos cortos de
ARN y los reemplaza por ADN
Polimerasa II: rellena brechas y facilita la sntesis de DNA dirigida
por plantillas daadas.

ADN Bacteriano

ADN mitocondrial
Replicacin igual a ADN procariota
variacin cada 20,000 mil aos
Informacin gentica solo por lnea
materna

TRANSCRIPCIN
DEL

ADN

DEFINICION :

Es la sntesis de molculas de ARN.

Producida por la unin de los nucletidos
ADENINA ,GUANINA , CITOCINA ,
URACILO que
se alinean con el
ordenamiento
marcado
por
los
nucletidos complementarios presentes
en el ADN, esta complementariedad
determina que las bases A,U,C y G del
ARN se apareen respectivamente con las
bases T,A,G y C del ADN

LAS MOLECULAS DE ARN SE SINTETIZAN

POR EL AGREGADO DE UN NUCLEOTIDO
POR VEZ

Se construye el ARN:
1)- separacin de las cadenas de ADN
2)- los ribo nucletidos se aparean con su
complementaria del ADN
3)- se separa la unin de ribo nucletidos
del ADN y ARN liberndose as la cadena
de ARN sintetizado
4)- finalmente las dos cadenas de ADN se
volverian a unir

TRADUCCIN
Una vez que el
ARNm ha madurado,
se produce la
sntesis de protenas
a partir de la
lectura de este
ARNm. Este proceso
ocurre en los
ribosomas presentes
en el citoplasma.

El ARNm se
desplaza a
travs del
ribosoma, en el
cual ocurre la
lectura de
cada uno de los
codones del
ARNm.

TRADUCCIN
Cada vez que un codn es ledo, se
aade un nuevo aminocido a la
protena que se est sintetizando.
Comienza con la lectura del primer
codn en el ARNm: AUG ( secuencia
complementaria al sitio de inicio de la
transcripcin: TAC ). Este codn codifica
para el aminocido metionina. Por lo
tanto, este aminocido se encuentra en
el extremo inicial de todas las protenas.

La traduccin
termina cuando en
el ribosoma se
leen algunos de
los codones de
trmino: UAA, UGA
o UAG secuencias
complementarias
de los tripletes de
ADN: ATT, ACT y
ATC
respectivamente

TIPOS DE ARN
ARN mensajero: se sintetiza en el
ncleo, a partir del ADN y viaja al
citoplasma.
ARN ribosomal: junto a un grupo de
protenas, forma parte de los
ribosomas.

ARN de tranferencia:
traduce el mensaje para la
sntesis de protenas. Se
unen a un codn a travs de
una de sus regiones,
llamada anticodn, por
complementariedad de
bases.
Para cada codn en el
ARNm existen molculas de
ARNt que contienen un
anticodn complementario.
Existen tambin 64
molculas de ARNt.