Está en la página 1de 14

GARP para torpes

Algunos trucos no documentados de


GARP, necesarios para no sucumbir a la
frustracin

Truquitos aportados por Elisa Liras, en


la rplica del IV taller de modelizacin
de nichos ecolgicos GBIF (2730/05/08)

1. GARP necesita agrupar las variables ambientales (VEs) en conjuntos llamados


Dataset (de igual manera que DIVA necesita agruparlas en Stacks)
Load Layers > from ASCII raster grid

2. Buscamos la carpeta donde previamente hemos guardado las VEs y la mscara


(mask.asc, que puede ser una copia renombrada de cualquier VE) que indica el
mbito geogrfico de anlisis. Estos ficheros los hemos podido generar con DIVAGIS (donde importamos los archivos .bil de WORLDCLIM y los convertimos
despus a .asc)

4. GARP carga todos los ficheros .asc de ese directorio e identifica a la mscara
como tal.
5. Es necesario dar un nombre de identificador y un ttulo, pues si no GARP nos
dar problemas (este es el truco tonto no documentado nmero 1)
6. Graba el dataset con File > Save (genera un fichero .dxl)

7. Cargar los puntos de presencia (upload data points). Si no quieres


problemas, constryete un fichero excel con estos puntos (tres columnas:
nombre de la especie, latitud y longitud)

8. Cargar el conjunto de variables (dataset, fichero formato .dxl que se cre


con el Desktop Manager)
Dataset > Scan Directory y luego localizar el archivo en Environmental layers >
Dataset

9. Configura las especificaciones sobre cmo construir y evaluar los modelos


(ojo con los runs, que requieren tiempo; para empezar es mejor probar con
pocos)

2
3

11. Truco tonto no documentado nmero 2: el directorio de salida.


-- Por una deficiencia de programacin no se puede especificar una ruta a una
carpeta vaca, sino a un archivo dentro de una carpeta (crea un archivo,
localzalo con este cuadro de dilogo y borra despus el nombre del archivo).
-- Importante: despus borra todo el contenido de esa carpeta.

12. No esperes ms para hacer el


modelo: Model > run (ahora tienes
tiempo para un caf)
13. En la carpeta de resultados aparece:
-- un fichero .xls con la descripcin de
cada modelo (el manual es necesario
para interpretar los ndices)
-- ficheros .bmp con las imgenes de los
resultados de los modelos
-- ficheros .asc con los valores de cada
modelo para cada celdilla (valores entre
0 y 1, donde 1 es la mxima adecuacin
o probabilidad de presencia)

14. Las predicciones finales se deben obtener como suma de las predicciones
de los modelos por separado (las que se representan en los ficheros .bmp y
se encuentran en los .asc). Para ello podemos sumar los ficheros de tipo
raster (.asc) con cualquier programa de SIG. Con DIVA se hace as:
Data > Import to Gridfile > Multiple Files

15. Construye un stack en DIVA que agrupe los ficheros recin importados:
Stack > Make stack

16. y bautzalo:

17. Suma los valores predichos para las celdas por todos los modelos
Stack > Calculate

17. Suma los valores predichos para las celdas por todos los modelos
Stack > Calculate

18. Las reas coloreadas de rojo son aquellas que ms modelos


concordaban en dar como adecuadas (la mxima puntuacin en
este ejemplo es 3 porque slo se corrieron tres bloques de
iteraciones runs--).

19. Fase de toma de decisiones y redaccin de artculo

Para esto no hay cristiano


que lo entienda
haz clic aqu

Para me ha gustado
el resultado
haz clic aqu