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GENOMA HUMANO

GENOMA :

Es el conjunto completo de informacin


almacenada en el ADN, en particular en cada
una de sus clulas .
FUNCIONES: ALMACENAR / DUPLICAR / EXPRESAR INF.
Informacin para:
Protenas involucradas en el
transporte de protenas
Protenas involucradas en
los procesos bioqumicos
Plegamiento de Protenas
Protenas inmunolgicas
Protenas estructural

30 ,000

mRNA rRNA tRNA


Genes
multicopia

MiniMicrosatlite satlite

LINES SINES DNA


satlite

GENOMA NUCLEAR
ADN : 3x109 pb

41% de CG en eucromatina
GENES : 30000

CROMOSOMAS: 22 + X+Y
Crom
osom
a

Cantida
Crom
d de
osom
DNA
a
(Mb)

Cantida
d de
DNA
(Mb)

279

13

118

251

14

107

221

15

100

197

16

104

198

17

88

176

18

86

163

19

72

148

20

66

140

21

45

10

143

22

48

11

1448

163

12

142

51

4Mb
180
genes
HLA

Heterocromatina constitutiva: 13,14,15,21,22


1,9,16,Y

FILOGENIA

1,2%

3%

De mono

al

hombre

Fusin del cromosoma 2p y 2q reduce de 24 a 23 pares de Cromosomas


C1
Inv. pericentrica

C2
Fusin

C18
Inv. pericentrica

CX
Bandas
telmericas

CY
Brazo largo del
cromosoma Y

DIFERENCIAS ENTRE LAS ESPECIES


1. Inversiones pericentricas: cromosomas 1 y 18
2. Inversiones paracentricas: 4,5,9,12,15 y 16 del hombre y el chimpancs
3. Inversiones peri y paracentricas: cromosoma 16 del hombre y del
gorila
4. Heterocromatina constitutiva
a. Variaciones en la cantidad centromrica en la cuatro especies,
cromosomas 1,9,16,13,15,21,22
b. Diferencias en el tamao del Y
c. Presencia de otras bandas
5. Presencia banda telmericas terminales en cromosoma X
6. Localizacin de los organizadores nucleolares
a. Humano: 13,14,15,21,22
b. Chimpancs: 13,14,18,21,22
c. Gorila: 13, 21,22
d. Orangutn: 2p, 3p, 7q, 13,14,15 y 22

SECUENCIAS DE GENOMA NUCLEAR


SEGN SU FUNCION

RNA
antisentido

rR
NA

m
iR
NA

RIBOSOMICOS
rRNA
TRANSFERENCIA
tRNA
NUCLEAR PEQUEO snRNA
NUCLEOLAR PEQUEO snoRNA
OTROS: MICRO-RNA miRNA

sn
RN
A

sno
RNA

1. SECUENCIAS CODIFICANTES o
GENES RNA

tRNA

Unidad transcripcional de 45 S (18, 5.8 y28 S)


Grupos: 30 40 repeticiones tndem
Localizado en: C 13, 14,15, 21, 22

Unidad 5S: 200 300 genes1p41-42


Genes rRNA 16 S y Genes RNA 23 S: ribosoma
mitocondrial

497 GENES -- 49 familias


61 codones - 49 tRNA
Codones:

AU(U/C)
UA(U/C
AA (U/C)

Loci: todos cromosomas


(excepto 22 y Y)

- C6

residen 280 (4Mb)

- C1 residen genes tRNA Asn y Glu


-

C7

18 /30 tRNA Cys (0.5 Mb)

SnRNA ricos en uridina : U3


RNA espliceosmico
- 44 genes snRNA U6
- 16 genessnRNA U1 locus RNU1 en 1p36.1
- Genes snRNA U2 locus de 6.1kb RNU2 17q21-22 (6 /+
30
repeticiones)

GENES snoRNA
Localizacin: en intrones
De copia nicas / Esparcidos
15q snoRNA presentes en la unididad
transcripcional SNURF SNRPN (impronta paterna)
Guan modificaciones de bases en rRNA y snRNA U6
Sub familias:
SnoRNA caja C/D : gua metilacin 2`o-ribosa,
SnoRNA H/ACA : guia la pseudouridilacin - forma
seudouridina

Micro-RNA miRNA ( 22nt)


300 genes miRNA (>dentro de intrones), 7 en C13

se transcriben por ARNpol II

pri-miRNA --RN-asa III (DROSHA)--- pre miRNA --- RN-asaIII (DICER)--- miRNA
(ncleo)

(Bicatenario) 70 nt

FUNCIN
Reguladores antisentido
Se enlazan al 3 UTR del ARMm
Inhiben la traduccin

Reprimen la sntesis

protenas del gen blanco


Degrada el mRNA

(citoplasma)

22nt

OTROS GENES RNA

1. Tamao del gen: variable


2. T. del exn (<200pb) independiente al tamao del gen
3. Tamao del intrn es proporcional al tamao del gen
4. La fraccin del DNA codificante es inversa al tamao del gen
5. Correlacin entre tamao de gen tamao del producto, (excep.)

Correlacin
entre tamao
de gen
tamao del
producto, con
excepciones

45 kb 4563 aa

2 Mb 3685 aa

Genes de Histonas: secuencia identica


86 sec. En 10 Cromosoma:

1,2,4,5,6,11,12,15,21,22

2 grupos grandes en cromosoma 6p 21.3

Genes Ubiquitinas
Localizacin en varios cromosomas
En serie de repeticiones (cotranscripcin/
policistrnicos)

En unidades monmeras pero unidos a otros


genes Unidades de transcripcin biscitrnica

Genes muy relacionados pero no son idnticos en su


secuencia
Agrupados / Consecuencia de duplicaciones
Cromosomas diferentes

Genes HOX
Familia gnica: grupo de 10 genes en cuatro cromosomas dif.
Cromosoma:
13q13-14

Xq13-22

4q11-12

5q31-33

Secuencia sin relacin fsica pero con


relacin funcional
Sus productos pueden ser:
Subunidades de la misma protena
globina 11p
Globina 16p
Ferritina cad. Pesada 11qCadena liviana 22q

Subunidades de la misma estructura

macromolecular
Componentes de la misma va metablica o
de desarrollo
(hidroxilasas)

Protenas ligando receptor


Insulina 11p
Interferon 9p

Receptor 19p
Receptor 21q

No son comunes, Son muy cercanos


Utilizan marcos de lectura
d.1. Organizacin gnica bidireccional.

Se transcriben de cadenas opuestas:


Genes de reparacin de DNA

d.2. Genes superpuestos de forma


parcial

Ejm. Genes HLA clase III

d.3. Genes dentro de genes

Localizados dentro de otros genes


snoRNA protenas ribosomales / protena nucleolares

Incluidos en intrones de genes grandes


Ejm. Gen del factor VIII de la coagulacin

Gen RB1
Gen NF1

OGMP: glucoproteina de mielina del oligodendrocito

d.4. Unidades policistrnicas

Grupos > de los Genes rRNA


Genes UBA52
Ubiquitinas
UBA80
Protena ribosmica S27 / L40

e. Familia gnicas
i. Familias gnicas comunes:
Muestran homologa de secuencia codificante

Ejm.
Genes de histonas
Genes de globinas
y

ii. Familia de genes que codifican protenas


con dominios grandes y muy conservados

Homologa notable en regiones conservadas


Homologa baja en regiones no conservadas

Ejm. Familia de factores de Transcripcin del desarrollo


sec conservada codifica un dominio de unin al DNA

iii. Familia de genes que codifican productos


con secuencias conservadas cortas
Familia gnica de Caja DEAD = asp Glu Ala Asp
Ejm. Protena que participan en el splicing
Familia gnica de Caja WD: Triptofano - aspartato (4-16 repeticiones tanden)
(44-66 aa)
Ejm. Protenas reguladoras: Divisin celular,
Transcripcin y Modificaciones de mRNA
Sealamiento transmembranoso

Gli - His

Trp - Asp

-Codifican productos relacionados desde el punto de vista


funcional en sentido general y muestran dbil homologa de
secuencia.
Ejm. - Ig, RCT, HLA
- Globinas: globinas y , Mioglobia, neuroglobina
- Receptores acoplados a protenas G

a. Familias gnicas organizadas en un


grupo nico
Organizacin gnica tnden:
Genes relacionados en secuencia y funcin
Ejm: Genes RNA: (rRNA, U2, snRNA.

Genes polipeptdicos: Poli-ubiquitina


Grupo cerrado: no en tnden, pueden estar
Agrupados de manera estrecha y regulados por
regin de control de locus nico (globinas)
Individuales e idnticos en secuencia y funcin
Grupo compuesto: relacin fsica, pero no

en secuencia, ni en funcin
Ejm. HLA - Fact. Complemento srico - Hidrolasas
esteroides

v.b. Familia de genes organizadas en


mltiples grupos gnicos
Relacionados muy de cerca o distribuidos
en (uno), dos o mas sitios cromosmicos
Similitud alta o baja entre genes de
diferentes grupos
Ejm
Receptores olfatorios (900 unid) : 25 grupos
en C20
HOX (38 copias) 2p, 7, 12, 17

vi. Familia de gnicas


dispersas
Dispersos y difieren en secuencia (salvo dup)
Los miembros de la familia se origina por:
Genomas diferentes:
isoformas de protenas mitocondriales y
nucleares
Duplicaciones del gen/genoma
Presentan homologa secuencial en dominios
Familia PAX
Retrotranscripcin
En los genes funcionales pueden tener intro y
copia procesada funcional
cDNA natural

Pseudogenes no procesado en un grupo


gnico
Pueden originarse por:
Duplicaciones: alteran regiones codificantes o
reguladores
No funcional
Inserciones de secuencia de ADN complementario

Transcripto

(sin sec. Promotoras)

transcriptasa inversa

ADNc
Inserciones de codones terminales

Ejemplo:
- globinas

Genes truncados y fragmento de genes


internos en un grupo gnico
Contiene : pseudogenes no procesados
Copias de genes truncados
Copias de fragmentos gnicos
Origen: Duplicaciones / entrecruzamiento desigual
Ejm. ARNm de HLA I
6p21.3

mRNA HLA I

Genes de
Cadena pesada
HLA I 6p21.3
- 6 genes
- 4 seudogenes
- Copias gnicas
parciales

Pseudogenes no procesados
Duplicacin segmentaria.

Ej. NF1 (pericentromrico C 1 7q11.2)


PKD (enf poliqustica del rin) (subtelomerico
C 16p)

Pseudogenes procesados: Son mas frecuentes


Caracteriza por :
Truncados 5 Y Extremo 3` con poli A (ARNm)
No tiene intrones
Carecen de promotor (no se expresa)
Ejemplos: genes B tubulina, Inmunoglobulina
Mecanismo
de origen:

II. SECUENCIAS DE NO CODIFICANTES


Repetidas en Tanden y dispersas
1. DE REPETICIN EN TANDEN
Tipos DNA: Satelite, minisatelite y microsatelites
a. DNA SATLITE: Sec. cientos Kb repetidas en tndem

a.

Repeticiones: simple(1-10 nt) / Complejas (>10


nt)

10 al 15% de secuencias repetidas del genoma.

Mayormente se localiza en regin pericentromrica, tiene


funcin estructural, carece de orgenes de replicacin

La menor parte de DNA Sat. est disperso por todo el


genoma, tiene funcin amortiguadora de las mutaciones.

. DNA Sat. alfoide: : centrmeros


Unidades de 171 pb longitud mll de pb
Motivo: CTTCGTTGGAAACGGGA
Fija protenas centromricas CENP-B:
Es especfico para cada cromosoma

. DNA : 68 pb
Cromosomas: 13-15, 21,22,9,1, Y
ADN Sat -1: 42 pb pericentromrico
ADN Sat-2: 5 pb (>cromosomas) conservado

b. ADN MINISATLITE : 102 - 103


VNRT : repeticin en tnden de nmero variables
Muy polimrficos,
i. DNA minisatelite hipervariable:
- Presente en proximidades del telmero (otros lugares)
-Secuencias cortas: 9-64pb repetidas en tnden
- Secuencia comn GGGCAGGAXG, constituye una
secuencia seal para la recombinacin.
identificacin de individuos (fingerprint)
- No transcriben, excepto MUC1 en 1p codifica
protena polimrfica

ii. DNA minisatlite telomrico 104


- Porcin terminal de telmeros:10-15 Kb
- Secuencia repetida:
5 TTAGGG 3 repetida 2000 a 10000 veces seguidas
- Su longitud vara con la edad de la clula
Espermatozoide tiene 15 Kb
Clula somtica
1,2 Kb
Linfocitos en cultivo:
normales
47 7.7 pb menos por ao
S. Down
133 5.5 pb menos por ao

c. DNA MICROSATELITE: 104


Muy polimorfico. Localizados x todo el genoma (60Mb)
Unidades repetitivas: de 2,3 4 (<10) nt
Comunes: (CA)n/(TG)n una x 36kb) AT/TA (una x 50kb) AG/CT (una x 125kb)
Raras : CG/GC (una x 10Mb)

Origen: deslizamiento de replicacin


Raro aparecen en secuencias codificantes, excepto
trinucleotidos en ciertas alteraciones hereditarias
CTG exon 1 de FMR1 S. X frgil
CTG extremo 3 de gen de la distrofia miotnica
CAG en gen Huntingtin S. Corea de Huntington (informa una sec.
poliglutamina)

Ejemplo: SNP (polimorfismo de un solo nucletido)


Ejemplos Una repeticion de 2 pb :
GTGTGTGTGT
Una repeticion de 3 pb :
CAGCAGCAGCAGCAG
.
...TCCAGACAAGGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTCCAGTGAGATTTA

2. DNA NO CODIFICANTE REPETIDO DISPERSO


Retroposones y transposones

A. RETROPOSONES o SECUENCIAS INTERCALARES:10-102

LINES: Long interspersed nuclear elements : 1- a 5-kb


L1 o L1H 6.4 Kb
Localizados en bandas G , 20,000 a 40,000 Copias
Origen: ARN transcriptasa inversa ADN integra al genoma
a.

6.1kb

Existen 3 familias: LINE-1, LINE-2, LINE-3


Implicado en: mutaciones, recombinacin anormales tanto
intra como intercromosmicos
L1 C 22 transloca X gen Factor VIII Coagulacin
Hemofilia

b. SINES: Short interspersed nuclear elements


Alu 150 Mb (5% del genoma humano)
Sitio de restriccin 5AGCT 3 para enzima Alu I
(Artrhrobacter lacteus)

Existen 500000 copias de secuencias de 300 pb


Localizados en las banda R
Estas secuencias se originaron por retrotranscripcin

ARN 7SL Transcriptasa inversaADN se integra al genoma


ARN: partcula seal ( participa en la sntesis de protenas)

c. Elementos parecidos a retrovirus con


repeticiones terminales largas (RTL):
Transposones RTL
Pueden ser autnomos o, no autnomos con RTL
Autnomos: secuencias retrovirales endgenas(SRE)
Contiene genes gap y pol

proteasa, transcriptasa inversa, RNAasa, integrasa

Tipos: SER H (SER humana) 4.6% del genoma , > defectuosos


SER H-K
conserva genes retrovirales intactos
SERH-K10
sufre de transposicin

No autnomos: MaLR
3.8% del genoma
Carecen de gen pol y a veces del gap

Elementos repetitivos encontrados en Gen de la enzima del hgado,


la oxidasa homogentistica HGO (alcaptonuria)

Modific de B. Granadino, D. Beltrn-Valero de Bernab, J. M. Fernndez-Can, M. A. Pealva, y S. Rodrguez de Crdoba,

B. TRANSPOSONES: 10 102
Mviles, representan 3% del genomas
Codifican una transposasa
Sec. como retrovirus.
Tienen repeticiones terminales invertidas
Ejm. THE humano
MER1
MER2

GENOMA MITOCONDRIAL
Bicatenario circular: 16569 pb (0,5% genoma). cien mil copia
Asa D triple helice
Dos cadenas de pb diferentes: Cadena pesada H: rica en G
Cadena ligera L: rica en C
Posee poco ADN repetitivo, no intrones (93% codificante)
Expuesto a radicales libres (por Fosforilacin oxidativa) y
sistemas de reparacin son menos eficientes
> frecuencia de Mutaciones
Cdigo gentico: 60 codones de sentido (61 en ncleo)
4 codones de termino (3 en ncleo)
UAA, AUG, AGA , AGG

GENES MITOCONDRIALES:
37 genes: 28 en la cadena H
9 en la cadena L
24 codifican ARN: 2 ARNr,
22 ARNt
13 polipeptidos:
7 subunidades del complejo I: ND1- NAD6
1 subunidad del citocromo b
3 subbunidades citocromo oxidasa COI-COIII
2 subunidades de ATPasa: 6 y 8
Genes parcialmente
solapados

8x 4
14 x 2

60 codones

MODIFICACIONES DEL CODIGO GENETICO


Significado
comn

Significado
alternativo

Organelo u organismo

Arg

Alto

Algunas mitocondrias animales

AUA

Ile

Met

Mitocondria

CGG

Arg

Trp

Mitocondria de plantas

CUA

Leu

Tre

Mitocondria de levaduras

AUU

Ile

GUG

Val

Inicio

Algunos procariotas

UUG

Leu
Alto

Glu

Algunos protozoarios

Alto

Trp

Mitocondria, micoplasma

Codn
AGA
AGG

UAA
UAG
UGA

GENETICA MITOCONDRIAL: Herencia materna


Segregacin mittica

Mutacin elevada

20%

< 1%

Strachan
Solari
Guizar

La alegra de ver y entender es el ms perfecto don de la naturaleza


Albert Einstein
50

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