Eder Acevedo Rodrguez Taxonoma [del griego taxis, estructura u orden y nomos, ley, o nemein, distribuir o gobernar].
Clasificacin
Nomenclatura
Identificacin Organizacin de los organismos en grupos o taxones, en funcin de sus semejanzas o su parentesco evolutivo. Se ocupa de la asignacin de nombres a grupos taxonmicos de conformidad con normas publicadas. Es el proceso de determinar que un aislamiento en particular pertenece a un taxn reconocido. Nuestro planeta tiene una antigedad de 4600 millones de aos.
La diversidad microbiana aumento de forma considerable desde que el oxgeno se hizo abundante.
Carl Woese y sus colaboradores realizaron estudios de las secuencias de rRNA en clulas procariotas se separaron precozmente en grupos bien definidos.
Hiptesis endosimbitica.
El rbol filogentico universal se divide en 3 grupos primarios (dominios): Bacterias Archaea Eucarya
Los nombres de los grupos microbianos de cada nivel o rango tienen terminaciones (sufijos) caractersticos de ese nivel.
La especies procariotas se caracterizan por definiciones fenotpicas y genotpicas.
Cepa: una poblacin de organismos que desciende de un nico organismo o de un aislamiento en cultivo puro.
Cepa tipo: cepa de alguna especie.
Gnero: grupo definido de una o ms especies, que estn separados de otros gneros.
La clasificacin ms natural es aquella que presenta el mayor contenido informativo o valor predictivo.
1. Clasificacin fentica.
2. Taxonoma numrica.
3. Clasificacin filogentica.
Agrupa a los organismos en funcin de las semejanzas en sus caractersticas fenotpicas. Se emplean rasgos no ponderados para estimar la semejanza general. Peter H. A. Sneath y Robert Sokal, lo han definido cmo: el agrupamiento mediante mtodos numricos de unidades taxonmicas en taxones, en base al estado de sus caracteres . Deben emplearse al menos 50 caracteres (de preferencia cientos) y de diferentes tipos de datos para establecer una clasificacin precisa y fiable. Sistemas de clasificacin filogenticos: sistemas basados en relaciones evolutivas ms que en semejanzas generales. Coeficiente de asociacin: funcin que determina la concordancia de caracteres que presentan esos dos organismos.
Coeficiente de emparejamiento simple: es la proporcin de caracteres que concuerdan con independencia de que el atributo este presente o ausente.
Coeficiente de Jaccard: se ignoran todos aquellos caracteres ausentes en dichos organismos.
C. morfolgicas: Son fciles de estudiar y analizar desde eucariotas a los procariotas ms complejos. Son valiosas ya que las caractersticas estructurales dependen de la expresin de muchos genes. Indicador de parentesco filogentico.
son tiles en la identificacin rutinaria y proporcionan informacin filogentica. C. fisiolgicas y metablicas: estn directamente relacionadas con la naturaleza y la actividad de las enzimas microbianas y las protenas de transporte.
Las protenas son productos gnicos El anlisis de estas caractersticas proporciona una comparacin indirecta de los genomas microbianos.
C. ecolgicas: afectan la relacin de los microorganismos con su entorno. Incluso los organismos estrechamente relacionados pueden diferir en relacin con sus caractersticas ecolgicas.
Anlisis gentico: Estudio del intercambio de genes cromosmicos mediante procesos de transformacin y conjugacin son de utilidad para la clasificacin.
La demostracin de la transformacin entre dos cepas proporciona evidencias de una estrecha relacin.
-Los modelos de ciclo vital. -La naturaleza de las relaciones simbiticas. -La capacidad de causar enfermedad en husped especfico. -Preferencias de hbitat. -Necesidades de Temperatura, pH, oxgeno y concentracin osmtica. . Proporcionan considerable informacin acerca del parentesco verdadero.
Comparacin de protenas: Existen diversas formas de comparar protenas el enfoque ms directo consiste en determinar la secuencia de aminocidos de las protenas que presentan la misma funcin, si estas secuencias son similares los organismos probablemente estn estrechamente relacionados.
Composicin de a. nucleicos: Determinacin de la composicin de las bases de DNA, (contenido de bases pricas y pirimidnicas) mediante hidrlisis o HPLC. Contenidos de C +G confirma un esquema taxonmico desarrollado utilizando otros datos, y es de utilizar para caracterizar gneros procariotas.
Hibridacin de a. Nucleicos: Comparar semejanza entre genomas. Tcnica filtros de nitrocelulosa con cadenas DNA no radiactivo.
Secuenciacin de a. nucleicos: Gracias a los otras dos mtodos, las estructuras genmicas pueden compararse directamente mediante la secuenciacin del DNA y el RNA.
rRNA contiene secuencias variables y estables y por tanto es posible comparar microorganismos estrechamente relacionados como de parentesco muy lejano. (Secuencias que sufren poca modificaciones con el tiempo). Dominios Utilizado los estudios del rRNA para agruparse en tres dominios Archaea, Bacterias y Eucarya. Reinos Los organismos se ubican en cinco reinos en funcin de los criterios siguientes: Tipo celular Nivel de organizacin Tipo nutricional. Plantae, fungi, animalia, protistas y monera.
Primera edicin Para clasificar los procariotas se utilizan: -Forma celular. -Tincin de Gram. -Relaciones con el oxgeno. -Modo de produccin de energa. Proporciona una clasificacin principalmente fentica, y muchos taxones no son homogneos desde el punto de vista filogentico.
Segunda edicin: Las comparaciones de las secuencias de los cidos nucleicos, en especial las secuencias de rRNA 16S, constituyen la base de esta nueva clasificacin.
Nomenclatura:
Primer nombre Gnero
Segundo nombre Especie
Escherichia coli Bibliografa.
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