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Nutrición y Metabolismo

Contenidos:

Diversidad metabolica en microorganismos de uso industrial Rol del oxigeno Fermentaciones

Requerimientos bacterianos para el crecimiento
Requerimientos bacterianos para el
crecimiento
pH optimo
pH optimo
Requerimientos bacterianos para el crecimiento pH optimo • oxigeno (o su ausencia) • energia • nutrientes

oxigeno (o su ausencia) energia nutrientes Temperatura optima

Requerimientos bacterianos para el crecimiento pH optimo • oxigeno (o su ausencia) • energia • nutrientes
Temperatura óptima de crecimiento
Temperatura óptima de
crecimiento

Mayoría de organismos estudiados y explotados son Mesofilos (25 o C- 35 o C )

Temperatura del cuerpo humano * patogenos * oportunistas sicrófilos

– Temperatura del cuerpo humano * patogenos * oportunistas • sicrófilos – Cercanos a congelacion •

Cercanos a congelacion

– Temperatura del cuerpo humano * patogenos * oportunistas • sicrófilos – Cercanos a congelacion •
– Temperatura del cuerpo humano * patogenos * oportunistas • sicrófilos – Cercanos a congelacion •

termófilos

– Temperatura del cuerpo humano * patogenos * oportunistas • sicrófilos – Cercanos a congelacion •

Cercanos a ebullicion

Ejemplos de organismos y procesos industriales?

Temperatura óptima de crecimiento • Mayoría de organismos estudiados y explotados son Mesofilos (25 C- 35
Temperatura óptima de crecimiento • Mayoría de organismos estudiados y explotados son Mesofilos (25 C- 35

pH

La mayoría crece mejor a pH cercanos al neutro

Algunos pueden sobrevivir/crecer

  • - ácido

  • - alcalino

Ejemplos de

organismos y procesos industriales?

Aerobios Obligados
Aerobios Obligados
• requieren oxigeno como aceptor obligado • no fermentan • conservacion de E por Fosforilacion oxidativa
• requieren oxigeno como aceptor obligado
• no fermentan
• conservacion de E por Fosforilacion oxidativa
(PMF)

Ejemplos? Procesos industriales?

Anaerobios Obligados
Anaerobios Obligados

Fermentacion Conservacion de E por Fosforilacion a nivel de sustrato (en general) Toxicidad de oxigeno (XQ?)

Carencia de ciertas enzimas

superoxido dismutasa

O 2 - +2H + catalasa

Anaerobios Obligados • Fermentacion • Conservacion de E por Fosforilacion a nivel de sustrato (en general)

H 2 O 2

H 2 O 2 peroxidasa

Anaerobios Obligados • Fermentacion • Conservacion de E por Fosforilacion a nivel de sustrato (en general)

H 2 0 +

O 2

H 2 O 2

H 2 0 / NADH

Anaerobios Obligados • Fermentacion • Conservacion de E por Fosforilacion a nivel de sustrato (en general)
Anaerobios Obligados • Fermentacion • Conservacion de E por Fosforilacion a nivel de sustrato (en general)

NAD

Ejemplos? Procesos Industriales?

Categorias Intermedias
Categorias Intermedias

Efecto del O2

Grupo

Aerobios facultativos

No requieren, pero crecen mejor en

su presencia.

Hacen fermentacion o respiracion aerobica

Requieren O2 pero a < presion que atm

No requieren y no crecen mejor en su

presencia-

Respiracion anaerobica con aceptores organicos o inorganicos

Microaerofilia

Aerotolerantes

anaerobico -0.3 CO2 ACETATO bact acetogenicas –anaerobios obligados -0.27 S SH- Aerobios facultativos y anaerobios obligados
anaerobico
-0.3
CO2
ACETATO
bact acetogenicas –anaerobios obligados
-0.27
S
SH-
Aerobios facultativos y anaerobios obligados
SO4
SH-
Reduccion de sulfatos- anaerobios obligados
-0.25
CO2
CH4
Bact. Metanogenicas - anaerobios obligados
Fumarato
Succinato
Aerobios facultativos
0
NO3
NO2, N2
aerobios facultativos
+0.4
Fe3
Fe 2
aerobios facultativos y anaerobios obligados
+0.75
+0.82
O2
H2O
aerobios obligados y facultativos
aerobico

Vias catabolicas de Hidratos de

carbono

• Glicolisis • Via de las pentosas (hexose monophosphate shunt) • Via de Entner Doudoroff algunas
• Glicolisis
• Via de las pentosas (hexose
monophosphate shunt)
• Via de Entner Doudoroff
algunas especies bacterianas
Vias catabolicas de Hidratos de carbono • Glicolisis • Via de las pentosas (hexose monophosphate shunt)

Embden Meyerhof Parnas Pathway

VIAS CATABOLICAS DE HIDRATOS DE CARBONO

1- las 3 vias convierten glucosa a PGALD por rutas diferentes

VIAS CATABOLICAS DE HIDRATOS DE CARBONO 1- las 3 vias convierten glucosa a PGALD por rutas

2- el pasaje de PGALD a pyr es identico en los 3 casos 3- la oxidacion de pyr a

AcCoA depende de la

posibilidad de respiracion

VIAS CATABOLICAS DE HIDRATOS DE CARBONO 1- las 3 vias convierten glucosa a PGALD por rutas
VIAS CATABOLICAS DE HIDRATOS DE CARBONO 1- las 3 vias convierten glucosa a PGALD por rutas
VIAS CATABOLICAS DE HIDRATOS DE CARBONO 1- las 3 vias convierten glucosa a PGALD por rutas

Reoxidacion de

cofactores

VIAS CATABOLICAS DE HIDRATOS DE CARBONO 1- las 3 vias convierten glucosa a PGALD por rutas

El balance energetico y de intermediarios de reduccion para cada via es (desde glucosa hasta piruvato):

EMP PPP ED
EMP
PPP
ED

2 ATP + 2 NADH

2 NADPH + 1 NADH + 1 ATP

1 NADH + 1 NADPH + 1 ATP

La re-oxidacion de los cofactores depende de que el organismo respire o fermente.

Si respira, la re-oxidacion se hace por transporte de electrones, formacion de un gradiente de H+ (p) y se sintetiza ATP. Si fermenta, la re-oxidacion se hace mediante un aceptor organico y puede o no sintetizarse ATP Acoplado a fosforilacion oxidativa (ej, acetilfosfato, succinil CoA) No acoplado a fosforilacion oxidativa o gradiente (solo se forma el acido/ol correspondiente)

-

+

Azotobacter chrococcum

EMP

Arthrobacter sp.

+

Bacteria
Bacteria
-
-
ED
ED

Thiobacillus sp

  • - +

Bacillus sp

+

-

E.coli y otras enterobacterias

+

+

Pseudomonas sp.

  • - +

Rhizobium sp.

Alcaligenenes euthropus

  • - +

Xanthomonas sp.

  • - +

  • - +

- + Azotobacter chrococcum EMP Arthrobacter sp. + Bacteria - ED Thiobacillus sp - + Bacillus
- + Azotobacter chrococcum EMP Arthrobacter sp. + Bacteria - ED Thiobacillus sp - + Bacillus
- + Azotobacter chrococcum EMP Arthrobacter sp. + Bacteria - ED Thiobacillus sp - + Bacillus
Fermentacion Sustrato organico
Fermentacion
Sustrato organico

ADP

ADP
 

ATP

celulas

Productos: Acidos, alcoholes, CO2, H2, NH3

NADH Pyruvato
NADH
Pyruvato
(C3)
(C3)
NAD
NAD

Alcoholes de cadena corta,

Acidos grasos
Acidos grasos
(C2-C4)
(C2-C4)

En procariontes la fermentacion constituye un modo regular de existencia En eucariontes ocurre de modo excepcional.

Fumarato reductasa + 4 H+ - 2 H+ bloqueado
Fumarato
reductasa
+ 4 H+
- 2 H+
bloqueado

La fermentacion mas importante es la de los hidratos de carbono.

De acuerdo a los productos formados, se clasifica en:

LACTICA

ETANOLICA

BUTIRICA

PROPIONICA

ACIDO-MIXTA

HOMOACETICA.

TIPO

REACCION

ORGANISMOS

  • acido lactico

Hexosas

Fermentacion homolactica

  • etanol + CO2

Hexosas

Fermentacion alcoholica

Acido mixta

Etanol+ acetato + CO2

Acido – mixta Etanol+ acetato + CO2 Homoacetica Etanol Etanol CO2 Acetato propionato Lactato Fermetacion propionica
Acido – mixta Etanol+ acetato + CO2 Homoacetica Etanol Etanol CO2 Acetato propionato Lactato Fermetacion propionica
Acido – mixta Etanol+ acetato + CO2 Homoacetica Etanol Etanol CO2 Acetato propionato Lactato Fermetacion propionica
Acido – mixta Etanol+ acetato + CO2 Homoacetica Etanol Etanol CO2 Acetato propionato Lactato Fermetacion propionica
Acido – mixta Etanol+ acetato + CO2 Homoacetica Etanol Etanol CO2 Acetato propionato Lactato Fermetacion propionica
Acido – mixta Etanol+ acetato + CO2 Homoacetica Etanol Etanol CO2 Acetato propionato Lactato Fermetacion propionica

Homoacetica

Etanol

Etanol

CO2

Acetato

  • propionato

Lactato

Fermetacion propionica

CO2

Hexosas

Hexosoas

  • lactico

Fermentacion heterolactica

butirato

succinato

Etanol

Acetona

Acetato

Hexosas

  • butanol

Butanol

H2 + CO2

Acetato

Caproato + butirato + H2

Hexosas-

Acido butirico

H2 + CO2

formato

acetato

lactato

H2 + CO2

2,3 butanodiol

Acetato

CO2

Formato +

Oxalato + H+

Oxalato

CO2

  • propionato+

Succinato

Succinato

Caproato

  • CH4 +CO2

Metanogenica

acetato

H2 + CO2

acido lactico Hexosas Fermentacion homolactica etanol + CO2 Hexosas Fermentacion alcoholica Acido – mixta Etanol+
acido lactico Hexosas Fermentacion homolactica etanol + CO2 Hexosas Fermentacion alcoholica Acido – mixta Etanol+

Yeast

Zimomonas

Streptococcus

Algunos Lactobacillus

Leuconostoc

Algunos Lactobacillus

Propionibacterium

Clostridium propionicum

Enterobacterias

E.coli

Salmonella

Shigella

Klebsiella

Clostridium butiricum

Clostridium butiricum

  • C. kluyveri

  • C. aceticum

Acetobacterium

Methanotrix

Methanosarcina

Propionigenium

Oxalobacter

PRODUCTOS, REACCIONES Y GRUPOS MICROBIANOS RESPONSABLES DE LOS PROCESOS FERMENTATIVOS MAS IMPORTANTES

enterobacterias
enterobacterias

Lactico+ etanol+ CO2

Lactobacilos.

Streptococcus

Leuconostoc

Clostridium propionicum y Propioniobacteriu

m

Zimomonas

levaduras

Clostridium

butiricum

Los grupos que mas interesan desde el punto de vista alimentario son: enterobacterias y clostridium

(Sanitario) y

bacterias lacticas , propionibacterias y levaduras (Productivo)

FERMENTACION LACTICA

Las bacterias lacticas son un grupo heterogeneo de microrganismos anaerobios pero aerotolerantes que fermentan glucosa a acido lactico como unico o mayor producto.

Incluyen los generos: Lactobacillus, Streptococcus, Leuconostoc, Pediococcus, Sporolactobacillus y Bifidobacterium. Son de distribucion abundante en la naturaleza Tienen gran importancia economica y en algunos casos medica. Derivan ATP de la fosforilacion a nivel de sustrato.

1- HOMOFERMENTATIVA: Usa la via de EMP y produce fundamentalmente acido lactico. Se generan 2 ATP por mol de glucosa.

ALDOLASA

Glucosa

1- HOMOFERMENTATIVA : Usa la via de EMP y produce fundamentalmente acido lactico. Se generan 2

PEP-PGAD

1- HOMOFERMENTATIVA : Usa la via de EMP y produce fundamentalmente acido lactico. Se generan 2

piruvato

1- HOMOFERMENTATIVA : Usa la via de EMP y produce fundamentalmente acido lactico. Se generan 2
1- HOMOFERMENTATIVA : Usa la via de EMP y produce fundamentalmente acido lactico. Se generan 2
1- HOMOFERMENTATIVA : Usa la via de EMP y produce fundamentalmente acido lactico. Se generan 2

2 ATP

2 NADH

lactato

2- HETEROFERMENTATIVA: Emplea la via de las pentosas en las etapas de decarboxilacion e isomerizacion.

Via de pentosas fosfoketolasa
Via de pentosas
fosfoketolasa

El balance global de la fermentacion heterofermentativa es:

Glucosa + ADP + Pi La ganancia neta es de 1 ATP.

El balance global de la fermentacion heterofermentativa es: Glucosa + ADP + Pi La ganancia neta
El balance global de la fermentacion heterofermentativa es: Glucosa + ADP + Pi La ganancia neta

etanol +

lactato +CO2 + ATP

Existen algunas variaciones en el perfil fermentativo observado en distintos generos microbianos.

  • 1. Ej. Bifidobacterium

2 Glucosa + 5 ADP + 5 Pi 3 Acetato + 2 lactato + 5 ATP
2 Glucosa
+ 5 ADP + 5 Pi
3 Acetato + 2 lactato + 5 ATP

Se

genera mas ATP

Se emplea la via de pentosas pero en combinaciones distintas se forman otros productos (ej acetato)

  • 2 Glucosa

2 Glucosa 2 fructosa ATP acetil-P acetato eritrosa-P (C3 + C7) 2 (C5) 2 PGAD +

2 fructosa

2 Glucosa 2 fructosa ATP acetil-P acetato eritrosa-P (C3 + C7) 2 (C5) 2 PGAD +

ATP

2 Glucosa 2 fructosa ATP acetil-P acetato eritrosa-P (C3 + C7) 2 (C5) 2 PGAD +
acetil-P acetato
acetil-P
acetato

eritrosa-P

(C3 + C7)

2 Glucosa 2 fructosa ATP acetil-P acetato eritrosa-P (C3 + C7) 2 (C5) 2 PGAD +

2 (C5)

2 PGAD + 2 Acetil-P

2 Glucosa 2 fructosa ATP acetil-P acetato eritrosa-P (C3 + C7) 2 (C5) 2 PGAD +

2ATP

2 lactato

2 Glucosa 2 fructosa ATP acetil-P acetato eritrosa-P (C3 + C7) 2 (C5) 2 PGAD +

2AT

2 acetato

Parte del piruvato puede ser reducido a lactato, pero tambien puede

derivarse

a

la

Ejemplos:

formacion de acetil-P como enlace

de alta energia.

Lactobacillus plantarum y L. delbruckii forman los sig. productos:

Pyr

+ Pi

+ FAD

acetil-P (piruvato oxidasa)

+ Pi + FAD acetil-P (piruvato oxidasa)

+ CO2 + FADH2

Pyr

+ FADH2

lactato + FAD (lactato oxidasa)

+ FADH2 lactato + FAD (lactato oxidasa)

Streptococcus emplea piruvato decarboxilasa y genera acetato como en las bacterias aerobicas.

FERMENTACION PROPIONICA

Existen 2 vias para obtener propionato, que son empleadas por distintos generos microbianos.

1- Via del acrilato.

Empleada por microorganismos del genero Clostridium. Pueden fermentar H de C, aminoacidos, etc.

Ej .tipo: Clostridium propionicum

3 Lactato 2 propionato + acetato + CO2 + 1 ATP
3 Lactato
2 propionato + acetato + CO2 + 1 ATP

La via permite conservar solo 1 ATP por tres moles de lactato

(rendimiento bajo)

2- Via del succinato-propionato.

Microorganismo tipo: Propionibacterium (bacteria del rumen presente en los productos lacteos) · Fermenta hexosas o lactato produciendo propionato, acetato y CO2. Se usa en la produccion de queso Gruyere. Se pueden generar aminoacidos y tetrapirroles a traves de succinilCoA.

La respiracion de fumarato permite conservar energia a traves de la fumarato reductasa que esta en la membrana

Los [H] pueden provenir del lactato, del NADH, H2, formato, glicerol-P

Tiene mayor rendimiento energetico que la via del acrilato.

FERMENTACION ACETOGENICA

Se forma AcH por reduccion de CO2 empleando la via de acetilCoA.

Ej. 1 Clostridium thermoaceticum: sintetiza 3 moles de AcH a partir de 1 mol de glucosa (2 moles de Pyr + 1 mol por reduccion de CO2)

Ej. 2- Reductores de sulfatos (creciendo en ausencia de sulfatos y en presencia de piruvato)

Ej. 2- Reductores de sulfatos (creciendo en ausencia de sulfatos y en presencia de piruvato)

FERMENTACION ACIDO-MIXTA

En enterobacterias (anaerobias facultativas) la adaptacion desde un ambiente aerobio al crecimiento en anaerobiosis se acompaña con:

Las oxidasas terminales son reemplazadas por reductasas

El

ciclo del acido citrico se transforma en reductivo (aparece

fumarato reductasa) Se oxida Pyr a acetilCoA + formato Enzimas de la fermentacion mixta c/s formacion de butanodiol. Serratia, Erwinia y Enterobacter forman 2,3 butanodiol, acetoina, CO2, H2 y etanol.

Escherichia, Salmonella y Shigella producen acidos (succinato, acetato, lactato), CO2, H2 y etanol. Shigella y Erwinia no pueden descomponer formato a CO2 por lo cual no producen gas.

La produccion de 2,3 butanodiol se ve favorecida en el medio ligeramente acido pues de este modo se evita la excesiva formacion de acidos organicos.

FERMENTACION BUTIRICA

FERMENTACION BUTIRICA Microorganismos del genero Clostridium (que fermentan H de C). Se producen: acido butirico, H2,

Microorganismos del genero Clostridium (que fermentan H de C). Se producen: acido butirico, H2, CO2 y pequeñas cantidades de acetato.

La secuencia incluye: 1- formacion de Pyr (por EMP); 2- Decarboxilacion a AcCoA, CO2 e H2; 3- condensacion de AcCoA y reduccion, con consumo de los NADH generados previamente.

Algunos Clostridium realizan esta fermentacion en sus primeras etapas pero luego, cuando se acumula acido y el pH desciende, cambian para producir butanol y acetona (empleando el acido formado como sustrato).

El proceso consta de dos fases:

acidogenica solventogenica