Blgo.

Csar Pacco Carrin

La informacin fluye (con la excepcin de la transcripcion reversa) del

ADN al ARN por va del proceso llamado transcripcin, y luego a la protena por el proceso de traduccin.

Transcripcin es el proceso de fabricacion ARN usando el ADN como

molde .

Traduccin es la construccin de una secuencia de aminocidos (polipptido) con la informacin proporcionada por la molcula de ARN .

El esquema de este "dogma" ha sido encontrada repetidamente y se considera una regla general (salvo en los retrovirus).

El ARN mensajero (ARNm) es el molde para la

construccin de la proteina. El ARN ribosmico

(ARNr) se encuentra en el sitio donde se

construye la protena: el ribosoma. El ARN de transferencia (tARN) es el transportador que coloca el aminocido apropiado en el sitio correspondiente.

El ARN tiene el azucar ribosa en vez de desoxirribosa. La base uracilo (U) reemplaza a la timina (T) en el ARN. El ARN tiene una sola hebra, si bin el tARN puede formar una estructura de forma de trebol debido a la complementaridad de sus pares de bases.

La ARN polimerasa abre la parte del ADN a ser transcripta. Solo una de las hebras del ADN (la hebra codificante ) se transcribe. Los nucletidos de ARN se encuentran disponibles en la regin de la cromatina (este proceso solo ocurre en la interfase) y se unen en un proceso de sntesis similar al del ADN.

La transcripcin del ADN es el primer proceso de la expresin gnica,

mediante el cul se transfiere la informacin contenida en la secuencia del ADN hacia la secuencia de protena utilizando diversos ARN como

intermediarios. Durante la transcripcin gentica, las secuencias de ADN

son copiadas a ARN mediante una enzima llamada ARN polimerasa que sintetiza un ARN mensajero que mantiene la informacin de la secuencia del ADN. De esta manera, la transcripcin del ADN tambin podra llamarse sntesis del ARN mensajero.

En el caso de las eucariotas, el proceso se realiza en el ncleo, y es similar

al de las procariotas, pero de mayor complejidad. Diferentes RNAp transcriben distintos tipos de genes. La RNApII transcribe los pre-RNAm,

mientras que la RNApI y RNApIII transcriben los RNA-ribosomales y

RNAt, respectivamente. Los RNAs transcritos son modificados posteriormente. El pre-ARNm,por ejemplo, sufre un proceso de maduracin que tras cortes y empalmes sucesivos elimina ciertos segmentos del ADN llamados los intrones para producir el ARNm final.

Durante este proceso de maduracin se puede dar lugar a diferentes

molculas de ARN, en funcin de diversos reguladores. As pues, un mismo gen o secuencia de ADN, puede dar lugar a diferentes molculas

de ARNm y por tanto, producir diferentes protenas. Otro factor de

regulacin propio de las clulas eucariotas son los conocidos potenciadores (en ingls: "enhancers"), que incrementan mucho (100 veces) la actividad de transcripcin de un gen, y no depende de la ubicacin de stos en el gen, ni la direccin de la lectura.

Clsicamente se divide el proceso de la transcripcin en 3 etapas principales (iniciacin, elongacin y terminacin), pero realmente se pueden diferenciar 5 etapas :

Preiniciacin: Al contrario de la replicacin de ADN, durante el inicio de la

transcripcin no se requiere la presencia de un cebador para sintetizar la nueva cadena, de ARN en este caso. Antes del inicio de la transcripcin se necesitan toda una serie de factores de transcripcin que ejercen los factores de iniciacin. Estos se unen a secuencias especficas de ADN para reconocer el sitio donde la transcripcin ha de comenzar y se sintetice el ARN cebador. Esta secuencia de ADN en la que se ensamblan los complejos de transcripcin se llama promotor.

Los promotores se localizan en los extremos 5'-terminales de los genes, antes del
comienzo del gen, y a ellos se unen los factores de transcripcin mediante fuerzas de Van der Waals y enlaces de hidrgeno.

Preiniciacin: Los promotores tienen secuencias reguladoras definidas, muy conservadas en

cada especie, donde las ms conocidas son la caja TATA (situada sobre la regin -10), con la
secuencia consenso TATA(A/T)A(A/T); y la caja TTGACA (situada en el punto -35). La formacin del complejo de transcripcin se realiza sobre el promotor TATA, all se forma el ncleo del complejo de iniciacin. Sobre la caja TATA se fija una protena de unin (TBP) junto con el factor

de transcripcin TFII D (TF proviene del ingls: transcription factor). Despus, a ellos se unen
otros factores de transcripcin especficos: TFII A, que estabiliza el complejo TFII D-ADN; los factores TFII B y TFII E se unen al ADN y el TFII F (una helicasa dependiente de ATP) y al final la ARN polimerasa. Todo ello forma un complejo que se llama complejo de preiniciacin cerrado. Cuando la estructura se abre por mediacin del factor de transcripcin TFII H, da comienzo la iniciacin..

Iniciacin: Primero, una Helicasa separa las hebras de ADN en estas

denominadas cajas TATA, ya que la adenina y timina poseen un doble enlace, mientras que la citocina y guanina poseen uno triple.

Posteriormente se unen los factores y las proteinas de transcripcin (TBP,

TF2D, TF2B) permitiendo, de esta manera, el acceso de la ARN polimerasa al molde de ADN de cadena simple, siendo esta la ultima en posicionarse. Aunque la bsqueda del promotor por la ARN polimerasa es muy rpida, la formacin de la burbuja de transcripcin o apertura del ADN y la sntesis del cebador es muy lenta.

Iniciacin: La burbuja de transcripcin es una apertura de ADN desnaturalizado

de 18 pares de bases, donde empieza a sintetizarse el ARN cebador a partir del

nucletido nmero 10 del ADN molde de la burbuja de transcripcin. La burbuja de transcripcin se llama complejo abierto. La ARN polimerasa es una enzima formada por 5 subunidades: 2 subunidades , 1 subunidad , 1 subunidad ' y 1 subunidad que tiene como funcin la unin de ribonucletidos trifosfato. Cuando se forma el complejo abierto, la ARN polimerasa comienza a unir ribonucletidos mediante enlaces fosfodister, y una vez que se forma el primer

enlace fosfodister, acaba la etapa de iniciacin.y comienza asi la siguiente

etapa.

Disgregacin del promotor: Una vez sintetizado el primer enlace fosfodister, se

debe deshacer el complejo del promotor para que quede limpio para volver a funcionar de nuevo. Durante esta fase hay una tendencia a desprenderse el transcrito inicial de ARN y producir transcritos truncados, dando lugar a una iniciacin abortada, comn tanto en procariontes como eucariontes. Una vez que la cadena transcrita alcanza una longitud de unos 23 nucletidos, el complejo ya no se desliza y da lugar a la siguiente fase, la elongacin.

La disgregacin del promotor coincide con una fosforilacin de la serina 5 del

dominio carboxilo terminal de la ARN polimerasa, que es fosforilado por el TFII H (que es una protena quinasa dependiente de ATP)

Elongacin: La ARN polimerasa cataliza la elongacin de cadena del ARN. Una cadena de ARN se une por apareamiento de bases a la cadena de ADN, y para que se formen correctamente los enlaces de hidrgeno que determina el siguiente nucletido del molde de ADN, el centro activo de la ARN polimerasa reconoce a los ribonucletidos trifosfato entrantes. Cuando el nucletido entrante forma los enlaces de hidrgeno idneos, entonces la ARN polimerasa cataliza la formacin del enlace fosfodister que corresponde. A esto se le llama elongacin, la segunda etapa de la transcripcin del ARN.

Terminacin: Al finalizar la sntesis de ARNm, esta molcula ya se ha separado completamente del ADN (que recupera su forma original) y tambin de la ARN polimerasa, terminando la transcripcin. La terminacin es otra etapa distinta de la transcripcin, porque justo

cuando el complejo de transcripcin se ha ensamblado activamente debe

desensamblarse una vez que la elongacin se ha completado. La terminacin est sealizada por la informacin contenida en sitios de la

secuencia del ADN que se est transcribiendo, por lo que la ARN

polimerasa se detiene al transcribir algunas secuencias especiales del ADN.

Terminacin: Estas secuencias son ricas en guanina y citosina, situadas en el extremo de los genes, seguidas de secuencias ricas en timina, formando secuencias palindrmicas, que cuando se transcriben el ARN recin sintetizado adopta una estructura en horquilla que desestabiliza el

complejo ARN-ADN, obligando a separarse de la ARN polimerasa,

renaturalizndose la burbuja de transcripcin. Algunas secuencias de ADN carecen de la secuencia de terminacin, sino que poseen otra

secuencia a la que se unen una serie de protenas reguladoras especficas

de la terminacin de la transcripcin como rho .

Las ARN-polimerasa son un conjunto de protenas con carcter

enzimtico capaces de formar los ribonucletidos para sintetizar ARN a partir de una secuencia de ADN que sirve como patrn o

molde. La ARN polimerasa ms importante es la implicada en la

sntesis del ARN mensajero o transcripcin del ADN.

La ARN polimerasa es la enzima soluble conocida de mayor

tamao puesto que mide unos 100 de dimetro y es visible en

micrografas electrnicas, donde se observa unida al promotor en el ADN.

La reaccin qumica que cataliza la ARN polimerasa consiste

en la unin de ribonucletidos trifosfato, adenosn trifosfato (ATP), uridn trifosfato (UTP), guanosin trifosfato (GTP) y citidn trifosfato (CTP), liberndose los grupos fosfato.

Adems de la polimerizacin de los ribonucletidos trifosfato, la ARN polimerasa

tiene otras funciones como:

Reconocer y unirse a localizaciones especficas o promotores de la molcula de ARN.

Desenrollar parcialmente la molcula del molde de ADN, gracias a su actividad helicasa intrnseca.

Sintetizar un ARN cebador para la elongacin posterior. Terminacin de la cadena.

La ARN polimerasa cataliza consecutivamente la elongacin de la cadena de

ARN, al mismo tiempo que enrolla y desenrolla la doble cadena de ADN, y termina la transcripcin despus de copiar el gen.

Esta complejidad de funciones se manifiesta en su estructura cuaternaria, ya que al igual que la ADN polimerasa, esta formada por varias subunidades que conforman la holoenzima, que en union con protenas accesorias forman una mquina proteica o

complejo de transcripcin que llevan a cabo la sntesis del ARN.

Algunas subunidades aisladas de la ARN polimerasa son catalticamente funcionales, mientras que otras slo pueden

detectarse cuando el complejo de transcripcin se encuentra

totalmente ensamblado.

Los complejos de transcripcin de distintos organismos presentan una composicin variable, pero esencialmente todos catalizan el mismo tipo de reacciones. Debido a esta coincidencia, en el estudio del proceso de transcripcin se toma como modelo la reacciones catalizadas por el

complejo de transcripcin de la bacteria Escherichia coli, que aunque se

diferencia en el ensamblamiento de la clulas eucariticas, actan de forma anloga.

La ARN polimerasa fue descubierta al mismo tiempo que el ARN

mensajero en 1960 por los investigadores Samuel Weiss y Jerard Hurwits de laboratorios diferentes.

En procariotas, la misma enzima cataliza la sntesis de todos los tipos de ARN: ARNm, ARNr y ARNt.

La ARN polimerasa en procariotas en una gran molcula. Est formada por cinco
subunidades de aproximadamente 410 kilodaltons 2', con dos unidades idnticas, que se une al ADN de forma inespecfica para catalizar la sntesis de ARN. Para unirse a regiones promotoras especficas, la holoenzima requiere un factor con el que se reduce enormemente la afinidad con regiones de ADN inespecficas, aumentando la especificidad por regiones promotoras para formar la holoenzima de cinco subunidades 2' (~480 kDa). La estructura de la

ARN polimerasa presenta una ranura de 55 de longitud y una anchura 25 . Esta

ranura permite el paso de la doble hlice de ADN que mide 20 . La longitud de 55 puede aceptar la secuencia de 18 nucletidos.

Todas

las

unidades

que

forman

la

enzima

funcionan

conjuntamente para llevar a cabo las reacciones de transcripcin. La subunidad ' participa en la unin del ADN, la subunidad contiene parte del centro activo y la subunidad est implicada principalmente en la iniciacin de la transcripcin, disocindose del resto de la enzima una vez iniciada la transcripcin.

Las ARN polimerasas de los organismos procariontes funcionan de forma anloga, aunque alguna subunidad de la protena difiera en su composicin.

Las clulas eucariotas existen tres tipos de ARN polimerasa, cada uno

especializado en sntesis de ARN determinados:

ARN polimerasa I: sintesis, reparacin, revisin y retiro de cebadores (primers), Sintetiza precursores de ARN ribosmico.

ARN polimerasa II: reparacin, Sintetiza precursores de ARN mensajero, microARNs y otros tipos de cido ribonucleico.[1] Esta polimerasa es el tipo ms estudiado, y se requieren factores de transcripcin para que se una a los promotores del ADN. Su estructura tridimensional ha sido dilucidada por Roger

Kornberg de la Universidad de Stanford, que recibi el Premio Nobel de Qumica

en 2006 por sus trabajos. Se da la circunstancia que este investigador es hijo de otro Premio Nobel, Arthur Kornberg, que recibi el galardn en 1959 por el descubrimiento de un enzima anlogo, la ADN polimerasa.

ARN polimerasa III: sintetiza ARN de transferencia, ARN ribosmico de 5S y otros pequeos ARN (ARNpequeos) encontrados en el ncleo celular (ARNp nucleares) y en el citoplasma (ARNp citoplasmticos). polimerasa IV y V: reparacin en condiciones nicas. Otros tipos de ARN polimerasa se encuentran en la mitocondria y en cloroplasto y en el ncleo del ribosoma.