Clasificacin de las bacterias

La clasificacin,nomeclatura e identificacion son tres areas separadas, pero interrelacionadas de la taxonomia . La clasificacion se puede definir como el ordenamiento de microorganismos en grupos taxonmicos (taxa) con base en semejanzas o interrelaciones. La clasificacin de los microorganismos procariotas, como son las bacterias, requiere de un conocimiento obtenido por tcnicas experimentales as como de la observacin, ya que a menudo es necesario determinar las propiedades bioqumicas, fisiolgicas genticas y morfolgicas para lograr una descripcin adecuada de un taxn. La nomenclatura consiste en dar nombre a un microorganismo con base en reglas internacionales de acuerdo con sus caractersticas. La identificacin se refiere al uso prctico de un esquema de clasificacin: 1) para aislar e identificar microorganismos de inters de aquellos que no lo tienen; 2) para verificar la autenticidad o propiedades especiales de un cultivo; o 3) en una situacin clnica, para aislar e identificar al agente causal de una enfermedad. Esto ltimo permite la seleccin de un tratamiento farmacolgico dirigido de modo especfico a su erradicacin

CRITERIOS PARA LA CLASIFICACIN DE LAS BACTERIAS

Los procedimientos de tincin (como la tincin de Gram) pueden proporcionar una estimacin confiable de la naturaleza de las superficies celulares. Algunas bacterias producen pigmentos caractersticos y otras se pueden identificar con base en su complemento de enzimas extracelulares; la actividad de estas protenas frecuentemente se puede observar como zonas transparentes que rodean a las colonias que proliferan en presencia de sustratos insolubles (por ejemplo, zonas de hemolisis en medio de agar con eritrocitos) Las reacciones inmunitarias cruzadas pueden proporcionar un indicio rpido de similitud en las estructuras superficiales de bacterias aisladas por separado. Es factible utilizar pruebas del tipo de la oxidasa, que emplea un aceptor artificial o electrn para distinguir microorganismos mediante la presencia de una enzima respiratoria, el citocromo c. Pruebas bioqumicas simples pueden confirmar la existencia de funciones metablicas caractersticas.

 la inestabilidad gentica puede originar que ciertos caracteres sean muy variables dentro de un grupo biolgico o aun dentro de una misma lnea celular. Por ejemplo, los genes de resistencia a los antibiticos o los genes que codifican para enzimas (utilizacin de lactosa, etc.) pueden transportarse en plasmidos elementos genticos extracromosmicos que pueden transferirse entre bacterias no relacionadas o pueden perderse en un subconjunto de cepas bacterianas idnticas en todos sus dems aspectos. La mayor parte de los criterios de "clasificacin dependen del crecimiento del microorganismo en el laboratorio. A veces, microorganismos del tipo de los treponemas patgenos no proliferan en el laboratorio, y en estos casos pueden tener un valor particular las tcnicas que revelan la similitud mediante la medicin de la hibridacin del cido nucleico o el anlisis de la secuencia del DNA.

SISTEMAS DE IDENTIFICACIN Y CLASIFICACIN

Claves Las claves organizan las caractersticas bacterianas de tal manera que permiten una identificacin eficiente de los microorganismos. El sistema ideal de identificacin debe contener una cantidad mnima de caractersticas necesarias para un diagnstico correcto. Los grupos se separan en subgrupos menores con base en la presencia (+) o ausencia (-) de una caracterstica diagnstica. La continuacin del proceso con diferentes caracteres gua al investigador hasta el subgrupo definido ms pequeo que contiene al microorganismo analizado. En las etapas tempranas de este proceso, los microorganismos pueden ser asignados a subgrupos con base en caractersticas que no reflejan una cercana gentica.

Taxonoma numrica
La taxonoma numrica (llamada tambin taxonoma fenlica o taxometra) se us ampliamente en el decenio de 1960. Los esquemas de clasificacin numrica emplean un nmero grande (frecuentemente 100 o ms) de caractersticas taxonmicamente tiles a las que se les ha dado el mismo valor. La computadora agrupa a las distintas cepas en niveles seleccionados de semejanza global (habitualmente ms de 80% en el nivel de especie) con base en la frecuencia con la cual comparten dichas caractersticas. Adems, la clasificacin numrica proporciona un porcentaje de frecuencias de los caracteres positivos para todas las cepas dentro de cada grupo. Estos datos proporcionan una base para la construccin de una matriz de frecuencia para identificar las cepas desconocidas contra la taxa definida.

Clasificaciones filogenticas: hacia la comprensin de las interrelaciones evolutivas entre las bacterias
las clasificaciones filogenticas son medidas de la divergencia gentica de distintos filos(divisiones biolgicas). El vnculo filogentico "cercano de dos microorganismos significa que comparten un ancestro reciente y los registros de fsiles han permitido que estas inferencias sean fciles de hacer para la mayor parte de los representantes de los vegetales y animales. Las propiedades genticas de las bacterias pueden permitir que algunos genes se intercambien entre microorganismos que tengan un parentesco lejano. Adems, la multipiicacion de las bacterias es casi por entero vegetativa y sus mecanismos de intercambio gentico rara vez incluyen la recombinacion entre porciones grandes de sus genomas

 Por tanto, el concepto de especie unidad fundamental de las filogenias eucariotas de las filogenias eucariotas tiene un significado enteramente distinto cuando se aplica a las bacterias. Una especie eucariota es un grupo biolgico que tiene la capacidad de inter- procrear para producir una descendencia'" viable. La especie bacteriana se define como un grupo particular de microorganismos que tienen ciertas caractersticas que los distinguen y presentan generalmente una semejanza cercana entre s en los aspectos ms esenciales de organizacin. La decisin de circunscribir a los grupos de microorganismos dentro de una especie bacteriana la toma el taxnomo, quien puede elegir subdividir al grupo en biotipos y agrupar especies en gneros. Pueden tambin proponerse grupos ms amplios, como las familias.

 Los ribosomas desempean una funcin esencial en la sntesis de las protenas. Los genes que codifican RNA ribosmico y protenas ribosmicas se han conservado a lo largo de la evolucin y se han separado ms lentamente que otros genes cromosmicos. La comparacin de la secuencia de los nucletidos del RNA 16S ribosmico de diversas fuentes biolgicas revel relaciones evolutivas entre organismos muy divergentes y ha permitido dilucidar a un nuevo reino, las Arqueobacterias.

 hay dos grupos distintos de microorganismos procariotas: las eubacterias y las arqueobacterias. Las eubacterias comprenden a las bacterias ms comunes, es decir aqullas con las cuales la mayora. deJas-personas est, familiarizada. Las arqueobacterias no producen peptidogiucano, lo que constituye una diferencia importante entre ellas y las eubacterias clsicas. Tambin difieren de las eubacterias por habitar en ambientes extremosos (por ejemplo, temperatura _ gran salinidad, o pH bajo) y efectuar reacciones metablicas poco comunes, como la formacin de metano.

DESCRIPCIN DE LAS PRINCIPALES CATEGORAS Y GRUPOS DE BACTERIAS

Eubacterias gramnegativas que tienen paredes celulares

Es un grupo heterogneo de bacterias que tienen envoltura celular compleja (tipo gramnegativa) consntituida por una membrana externa, una capa delgada e interna de peptidoglucano (que contiene cido murmico y est presente en todos los microorganismos excepto en los que han perdido esta porcin de envoltura celular) y una membrana citoplsmica. la forma celular puede ser esfrica, oval, :omo bacilos rectos o curvos, helicoidal o filamen- : Dsa; algunas de estas formas pueden estar envueltas en vainas o encapsuladas. La reproduccin se realiza ror fisin binaria, pero algunos grupos se reprodu- :en por gemacin. Las mixobacterias pueden formar cuerpos fructferos o esporas. La movilidad, cuando existe, se realiza por medio de flagelos o por deslizamiento. Los miembros de esta categora pueden ser bacterias fototrficas o no fototrficas, e incluyen especies aerobias, anaerobias, anaerobias facultativas y microaerfilas; algunos miembros son parsitos

las formas celulares que ocurren en las bacterias verdaderas unicelulares A.Cocos
B.Bacilos.C.Espirales

Eubacterias Grampositivas que tienen paredes celulares

Estas bacterias tienen un perfil de pared celular del tipo grampositivo; en general las clulas se tien, pero no siempre, de manera Gram positiva. Las clulas pueden ser esfricas, o en forma de bacilos o filamentoslos bacilos y los filamentos pueden no ramificarse o mostrar una ramificacin verdadera. La reproduccin se realiza generalmente por fisin binaria. Algunas bacterias en esta categora producen esporas como formas de reposo (endosporas o esporas en hifas). Estos microorganismos son generalmente hetertrofos quimiosintticos e incluyen especies aerobias, anaerobias y anaerobias facultativas. Los grupos dentro de esta categora incluyen bacterias asporgenas y esporgenas simples, as como a los actinomicetos estructuralmente complejos y a otros de esta familia.

Eubacterias que carecen de paredes celulares

Son microorganismos carentes de paredes celulares (denominados comnmente como micoplasmas y constituyen la clase Mollicutes) y que no sintetizan a los precursores del peptidoglucano. Estn recubiertas por una membrana unitaria, la membrana plasmtica (figura 3-2). Semejan a las formas L que pueden ser generadas por muchas especies de bacterias (notablemente las eubacterias grampositivas); sin embargo, a diferencia de las formas L, nunca revierten al estado en el cual tienen una pared y no hay interrelaciones antignicas entre los micoplasmas y las formas L eubacterianas

 Micrografia electronica de celulas de un miembro del grupo mycoplasma

Arqueobacterias
Estos microorganismos procariotas son, predominantemente, habitantes de ambientes terrestres y acuticos extremosos (alta salinidad, alta temperatura, anaerobiosis) algunos son simbiotes en el aparato digestivo de los animales. Las arqueobacterias estn constituidas por microorganismos aerobios, anaerobios y anaerobios facultativos que son quimiolittrofos, hetertrofos o hetertrofos facultativos Ciertas especies son mesflIas, mientras que otras tienen la capacidad de

Arqueobacterias Estos microorganismos procariotas son, predominantemente, habitantes de ambientes terrestres y acuticos extremosos (alta salinidad, alta temperatura, anaerobiosis) algunos son simbiotes en el aparato digestivo de los animales. Las arqueobacterias estn constituidas por microorganismos aerobios, anaerobios y anaerobios facultativos que son quimiolittrofos, hetertrofos o hetertrofos facultativos (captulo 5). Ciertas especies son mesfl- Ias, mientras que otras tienen la capacidad de Caracterstica

Eubacterias Arqueobacterias, Eucariotas

El factor-2 de alargamiento (EF-2) contiene al aminocido diftami- da y, por tanto, es ADP- ribosilable por la toxina diftrica No S No No S S

El iniciador metionil tRNA no est formilado Algunos genes del tRNA contienen intrones

La sntesis protenica se inhibe por anisomicina, pero no por cloramfenicol No SiLas RNA polimerasas dependientes del DNA son enzimas multicom- ponentes y son insensibles a los antibiticos rifampicina y estrepto- lidigina No S

proliferar a temperaturas superiores a 100 C. Estas arqueobacterias hipertermfilas estn singularmente adaptadas para proliferar y multiplicarse a temperaturas altas. Con pocas excepciones, las enzimas aisladas de estos microorganismos son intrnsecamente ms termoestables que su contraparte de los microorganismos mesfilos. Algunas de estas enzimas termoestables, como la DNA polimerasa del Thermus ciquaticus (Taq polimerasa) son un componente importante de los mtodos de amplificacin del DNA como la reaccin en cadena de la polimerasa (PCR). Las arqueobacterias pueden diferenciarse de las eubacterias, en parte, por la carencia de una pared celular de peptidoglucano, la posesin de diter isoprenoide o lpidos de tetrater diglicerol y por secuencias caractersticas del RNA ribosmico. Las arqueobacterias tambin comparten algunas caractersticas moleculares con los eucario- tas (cuadro 3-3). Las clulas pueden tener diversas formas que incluyen la esfrica, espiral, plana o bacilar; tambin pueden presentarse formas unicelulares y multicelulares en filamentos y agregados. La multiplicacin se realiza ya sea por fisin binaria, gemacin, constriccin, fragmentacin o por mecanismos desconocidos.