rbol filogentico Introduccin terica en Filogenia

Diagrama dibujado por Charles Darwin en El origen de las especies. Un rbol filogentico es un rbol que muestra las relaciones evolutivas entre varias especies u otras entidades que se cree que tienen una ascendencia comn. Un rbol filogentico es una forma de cladograma. Contenido [ocultar] 1 rboles filogenticos en biologa 1.1 Tipos de rboles filogenticos 1.2 Cladstica y caracteres 2 rbol filogentico en lingstica 2.1 rboles cladsticos como modelos de cambio 2.2 rboles filogenticamente perfectos 2.3 Redes filogenticas 3 Vase tambin 4 Referencias 4.1 Imgenes 4.2 General [editar]rboles filogenticos en biologa

En biologa se utilizan rboles parecidos a los genealgicos para representar cmo se encuentran emparentados los organismos vivos, se les conoce como rboles filogenticos. A diferencia de los rboles genealgicos, en los que se utiliza informacin proporcionada por los familiares, para los rboles filogenticos se usa informacin proveniente de fsiles, as como aqulla generada por la

comparacin estructural y molecular de los organismos. Tanto los rboles genealgicos como los filogenticos tienen un tronco y ramas, pero en los ltimos se muestran las relaciones entre especies y no entre individuos. Los rboles filogenticos se construyen tomando en cuenta la teora de la evolucin, que nos indica que todos los organismos son descendientes de un ancestro comn: la protoclula. As, todos los organismos, ya sean vivos o extintos, se encuentran emparentados en algn grado. [editar]Tipos de rboles filogenticos

Fig. 1: rbol filogentico enraizado para genes rRNA.

Fig. 2: Otra representacin del rbol filogentico incluyendo las transferencias horizontales

Fig. 3: rbol sin raz de la familia Miosina1 Un rbol filogentico enraizado es un rbol directo, con un nico ndulo que corresponde al ancestro comn ms reciente de todas las entidades de las hojas del rbol. La Figura 1 muestra un rbol filogentico enraizado coloreado de acuerdo con el "sistema de tres dominios".2 El mtodo ms comn para enraizar los rboles es el uso de un grupo externo no controvertido y lo suficientemente cercano para permitir la inferencia de los datos de secuencia o rasgos, pero lo suficientemente lejano para ser un grupo externo evidente. Los rboles genticos sin raz ilustran la relacin de los ndulos de las hojas sin hacer asunciones sobre ascendencia. Mientras que los rboles sin raz siempre pueden ser generados a partir de rboles enraizados omitiendo la raz, una raz no puede ser inferida a partir de un rbol sin raz sin algunos medios para identificar la ascendencia. Esto suele hacerse incluyendo un grupo externo en los datos entrantes o introduciendo asunciones adicionales sobre las tasas relativas de evolucin en cada rama, como una aplicacin de la hiptesis del reloj molecular. La Figura 2 muestra un rbol filogentico sin raz3 para la

miosina, una familia gentica de protenas. Un dendrograma es un trmino genrico para la representacin diagrmatica de un rbol filogentico. Un cladograma es un rbol formado usando mtodos cladsticos. Este tipo de rbol slo representa un patrn de ramificacin, es decir, que la longitud de sus ramas no representan el tiempo. Un filograma es un rbol filogentico que representa explcitamente un nmero de cambios de rasgos de carcter a lo largo de la longitud de sus ramas; es el resultado de la aplicacin de los principios de la sistemtica evolutiva. Un fenograma es un dendrograma no enraizado en que se establecen las relaciones de parentesco fentico de los organismos estudiados; surgen de la aplicacin de los mtodos de la taxonoma numrica. Un cronograma es un rbol filogentico que representa explcitamente el tiempo evolutivo proporcionalmente a la longitud de sus ramas. [editar]Cladstica y caracteres Artculo principal: Cladstica La mejora de los mtodos computacionales para el tratamiento de la informacin ha introducido un nmero interesante de algortmicos cladsticos para la clasificacin mediante rboles filogenticos. Muchos de esos rboles consideran un conjunto de especies representadas por un conjunto de caracteres. Un carcter es cualquier caractersticas bien definida de la especie que permita dividir el conjunto de especies en grupos, segn el valor que toma el carcter para cada especie. As un subconjunto de las especies formar un grupo respecto a dicho carcter si comparten una misma forma o valor de dicho carcter. Cada carcter permite construir un rbol filogentico cladstico que satisface ciertas propiedades razonables. Los algoritmos usuales pueden construir para un conjunto de especies numerosos rboles filogenticos, y extraer de entre ellos alguno que sea ptimo en algn sentido. Si las condiciones de optimidad estn bin escogidas esos algoritmos permiten encontrar el verdadero rbol filogentico para un grupo de especies relacionables. [editar]rbol filogentico en lingstica

Ejemplo de rbo filogentico para las lenguas afroasiticas (Ehret, 1995). En lingstica histrica tambin ha sido comn el uso de rboles filogenticos para clasificar las lenguas descendientes de una lengua madre comn o protolengua. Su uso empez en el siglo XIX cuando el uso extensivo de varias metforas biolgicas aplicadas a la evolucin y diversificacin de las lenguas humanas y la aparicin del mtodo comparativo llev al intento de dibujar rboles genealgicos para las familias de lenguas. Modernamente la construccin de rboles filogenticos se basa en el anlisis cladstico aplicado, bien al lxico (considerando que dos lenguas comparten alguna caracterstica cuando mantienen ambas cierta forma lxica concreta), o bien a caractersticas fonolgicas o gramaticales. Sin embargo, la representacin de las familias de lenguas mediante rboles filogenticos tiene limitaciones cuando se aplica a ciertas familias, ya que las lenguas, a diferencia de los individuos biolgicos, no tienen caractersticas permanentes por la influencia mutua, el sprachbund o convergencia comn por factores sociales. La construccin de rboles filogenticos resulta ms sencilla para unas familias lingsticas que para otras, por ejemplo, para las lenguas austronesias, cuya expansin por el pacfico se produjo saltando de isla en isla, la construccin de rboles resulta ms sencilla que para las lenguas urlicas o altaicas en las que las influencias de unas lenguas en otras y la presencia de prstamo gramatical dificulta enormemente la elaboracin de rboles filogenticos. [editar]rboles cladsticos como modelos de cambio [editar]rboles filogenticamente perfectos Una condicin importante en los rboles empleados en lingstica es la condicin de filogenia perfecta. Los rboles que satisfacen dicha condicin son los rboles filogentciamente perfectos, que satisfacen la siguiente definicin: Un rbol para un conjunto de lenguas tiene filogenia perfecta si para un conjunto de caracteres , si es posible etiquetar los nodos del rbol de tal manera que los caracteres evolucionen a lo largo del rbol sin retromutaciones o evolucin paralela en . En este caso se dice que es compatible con los valores observados en las "hojas" (nodos extremos) para todos los caracteres. Cuando un nodo o proto-lengua B que no posee una caracterstica que s posee algn otro nodo o proto-lengua A de la que deriva, experimenta un cambio o mutacin dando lugar a una proto-lengua C que vuelve a poseer la caracterstica presente en la proto-lengua A y ausente en la proto-lengua B. [editar]Redes filogenticas

Red filogentica para las lenguas indoeuropeas, las lneas rojas son lneas de contacto que permiten definir subrboles especiales para los caracteres heredados. Es bien conocido, que los rboles filogenticos no pueden representar adecuadamente situaciones de evolucin lingstica si hay un contacto lingstico importante entre las ramas del rbol. En la medida que el prstamo lingstico entre ramas puede ser claramente identificado, pueden ignorarse las caractersticas prestadas y seguir usandose rboles. Sin embargo, en los casos en que la historia pasada no es bien conocida y los rasgos heradados no puden ser separados de los rasgos prestados pueden introducirse las llamadas redes filogenticas, que en esencia son una generalizacin de los rboles filogenticos (de hecho un rbol filogentico es un tipo muy particular de red filogentica).4 Una red filogentica es un objeto topolgico etiquietado cuya topologa no es estrictamente un rbol, sino un rbol al que se aaden lneas adicionales entre nodos de ramificacin para representar situaciones de contacto o prstamo lingstico. Estas lneas adicionales hacen que una red filogentica usa grafos que topolgicamente pueden contener ciclos y, por tanto, no necesariamente son rboles topolgicos. En una red filogentica se consideran todos los subrboles posibles, siendo filogenticamente adecuados si la evolucin temporal de cualquier carcter puede ser representado por un un rbol filogentico contenido en la red.