Lgica Molecular de los Seres Vivos

Caractersticas que identifican a la Materia Viva

1. El atributo ms sobresaliente de los seres vivos es su complejidad y alto grado de organizacin, sin importar su tamao. 2. Cada componente tiene un propsito o funcin especfica (a nivel micro y macromolecular, incluso las concentraciones de iones). 3. Extraen, transforman y utilizan energa de su entorno, con un 100% de eficiencia (para edificar y mantener sus estructuras). 4. Se auto replican con precisin, generando una copia exacta. Esto viene dado por el ADN y los mecanismos de replicacin.

Bioqumica del Estado Vital

La meta bsica actual de la bioqumica es determinar de qu modo el conjunto de molculas inanimadas que constituyen los seres vivos se influyen mutuamente para constituir, mantener y perpetuar el estado de vida. El reconocimiento de los sistemas enzimticos como unidades catalticas en las rutas metablicas principales y el desarrollo de una hiptesis unitaria para la transferencia de energa en las clulas vivas, permitieron que la bioqumica surgiera como ciencia. Los seres vivos son una coleccin de molculas que llevan a cabo un programa con la finalidad de reproducirse y que cumplan con el mismo programa. Las molculas inanimadas que componen los seres vivos cumplen con leyes fsicas y qumicas, pero no solo se rigen por ellos, sino que adems, ejercen acciones mutuas de acuerdo con otro conjunto de principios denominados Lgica Molecular de la Vida. Tambin puede definirse como la estrategia de los seres vivos para lograr sus 4 caractersticas que los distinguen.

La Unidad Qumica de los diversos Organismos sustenta la Diversidad Biolgica

Las biomolculas son las molculas halladas en la materia viva, variados y complejos. La mayor parte de la materia orgnica en las clulas vivas est constituida por macromolculas, compuestos carbonados que son: las protenas, los cidos nucleicos, las grasas y los polisacridos. Cada clase de macromolculas est formada por muchas molculas sencillas, denominadas sub unidades, sillares estructurales o monmeros (aminocidos, nucletidos y monosacridos). Estas sub unidades son idnticas y nicas, y forman todas las macromolculas de los seres vivos, sin importar la especie. Esto genera 2 consecuencias: una economa celular, porque cada una de ellas desempea ms de una funcin, y que toda la materia viva proviene del mismo origen. La identidad de cada organismo est preservada por la posesin de un juego distintivo de cidos nucleicos y protenas (por la secuencia de bases). Es por esta razn, que aunque todos los seres

1 Constanza Trujillo 2006

vivos tengamos la misma clase de micromolculas, nos diferenciamos debido a la secuencia de las mismas.

Produccin y consumo de energa en el metabolismo

Los seres vivos cumplen con la 2 ley de la termodinmica (entropa o desorden a su alrededor) y con la 1 (la energa no se crea ni se destruye, slo se transforma), debido a que absorben de su entorno una forma de energa til y devuelven al ambiente una cantidad equivalente en otra forma menos utilizable. Entonces, los organismos vivos nunca estn en equilibrio con su ambiente. El metabolismo es regulado para alcanzar balance y economa. El metabolismo es un proceso catablico y endergnico. De acuerdo a la evolucin, las membranas han debido de ser las primeras en surgir, debido a que engloban las molculas solubles en agua de la clula permitiendo que se acumulen en concentraciones altas, difiriendo de concentracin del ambiente. La composicin molecular de los seres vivos refleja, un estado estacionario dinmico, ya que las concentraciones constantes no son reflejo de una inercia qumica, sino el resultado de este estado, en el que existe un flujo constante de masa y energa a travs del sistema. Se puede reconocer como un sistema homeosttico. Un ejemplo puede ser el mantenimiento del nmero de eritrocitos en la sangre, pues no es que siempre sean las mismas clulas, sino que se reponen para mantener constante el nmero de las mismas. Otro ejemplo es la hemoglobina y la concentracin de glucosa en la sangre. Las transformaciones de energa son un flujo de electrones. El ser humano obtiene energa de sus alimentos, que se destruye hasta obtener las micromolculas que le permiten al organismo fabricar sus macromolculas necesarias.

Trabajo

Ruta: que no ocurre en una sola reaccin.

Qumico: sntesis continua de componentes celulares. Osmtico: acumulacin y retencin de sales y varios compuestos. Mecnico: movimiento (contraccin muscular).
e
-

smosis Energa Movimiento Reacciones Qumicas

e-

Entonces, los seres vivos: toman energa de su ambiente o absorben energa solar. La forma til de energa que las clulas toman se denomina energa libre de Gibbs, tambin puede definirse como el tipo de energa capaz de realizar trabajo a temperatura y presin constantes. Los organismos son sistemas abiertos, porque intercambian materia y energa con su entorno y, al hacerlo, lo transforman. Las reacciones qumicas que ocurren se acoplan; as, reacciones espontneas aportan la energa necesaria para otra que la requiere. Estas reacciones pueden ser exergnicas

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cuando liberan energa (G > 0 son espontneas-) o endergnicas, cuando absorben energa (G < 0 no espontnea-).

Reacciones qumicas en las clulas vivas

Las clulas pueden actuar como mquinas qumicas porque poseen enzimas, catalizadores capaces de aumentar mucho la velocidad de reacciones qumicas especficas. Estas son molculas proteicas muy especializadas, elaboradas por las clulas a partir de aminocidos sencillos. Las reacciones catalizadas enzimticamente tienen lugar con un rendimiento del 100% y no hay subproductos. Debido a la especificidad de las enzimas, los organismos vivos pueden llevar a cabo, de modo simultneo, muchas reacciones individuales diferentes al mismo tiempo. La ruta metablica es una serie de reacciones y transformaciones, catalizadas por enzimas especficas. Para ello debe haber una afinidad molecular para las interacciones.
E1 E2 E3

Las reacciones enzimticas estn determinadas por intermediarios, antes de lograr la formacin de un producto determinado. Las clulas vivas tienen la capacidad de regular la sntesis de sus propios catalizadores. As, la clula puede interrumpir la sntesis de enzimas necesarias para producir un producto determinado a partir de sus precursores cuando puede obtenerlo ya fabricado de su entorno. Las clulas vivas poseen adems, la capacidad de detener la produccin de un producto, cuando en el medio existe la cantidad necesaria del mismo, o tambin iniciar la produccin del mismo, cuando el sustrato se encuentra en la concentracin necesaria para ello. Para esto, una de las enzimas (E1, E2 o E3) acta como enzima reguladora, iniciando o deteniendo la reaccin. La estimulacin viene dada por el sustrato inicial, y la inhibicin por el producto final. Las interacciones entre S, P y la E son transitorias, y por lo tanto, dbiles (enlaces no covalentes). Cuando el P inhibe el proceso, se denomina retroalimentacin negativa.
E2 E1 E3

ATP: intermediario qumico que enlaza los procesos celulares que liberan energa con los que requieren de ella. Es decir, enlaza a los productores en reacciones exergnicas con los consumidores en reacciones endergnicas. Degradacin = Catablica = Exergnica Sntesis = Anablica = Endergnica

Transferencia de la informacin Biolgica

Algunos organismos vivos son tan complejos que la cantidad de informacin gentica que se transmite parece desproporcionada al pequeo tamao de las clulas que la deben transportar, 3 Constanza Trujillo 2006

concretamente, la clula espermtica y el huevo. Esto lleva a otro axioma de la lgica molecular; los smbolos en los que se halla codificada la informacin gentica del ADN son de dimensiones sub-moleculares. Esto se resume en que el ADN est formado por 4 sub-unidades (nucletidos), que son las purinas y pirimidinas. Otra caracterstica de la propiedad de auto replicacin de los seres vivos, consiste en la extraordinaria estabilidad de la informacin gentica almacenada en el ADN. La estructura del ADN (doble helicoidal) constituye su molde interno y permite su propia replicacin casi perfecta y su propia reparacin a travs de enzimas especficas. Los cambios en las instrucciones de herencia, son los que permiten la evolucin. Esta capacidad de las clulas para preservar su informacin gentica es el resultado de la complementariedad estructural, ya que cada hebra constituye el patrn para la rplica enzimtica de otra hebra complementaria. La informacin unidimensional del ADN se transfiere a la informacin tridimensional inherente de los componentes macromoleculares y supramoleculares de los organismos, gracias a la traslacin de la estructura del ADN a la estructura proteica, mediante la Transcripcin, en el que se replica un segmento de gen. Los 64 tripletes, alcanzan y sobran para cubrir los 20 aminocidos que funcionan como micromolculas que componen las protenas. Esto trae como consecuencia, que el cdigo gentico sea degenerado, lo que quiere decir que existen codones sinnimos, y un aminocido puede ser llamado por uno o ms tripletes. Las molculas proteicas se pliegan, pero no al azar, sino que vienen configuradas para adoptar esa forma especfica. Este plegamiento puede verse afectado por el pH o por interacciones dbiles. Los cidos nucleicos se reconocen entre s por estas interacciones (efecto hidrofbico, puentes de hidrgeno, uniones electroestticas, etc).

Resumen de la Lgica Molecular de los Seres Vivos: una clula viva es un sistema abierto isotrmico de molculas orgnicas que se ensambla, ajusta y perpetua por s mismo y opera segn el principio de mxima economa de partes y procesos; promueve muchas reacciones orgnicas ligadas consecutivamente, destinadas a la transferencia de energa y a la sntesis de sus propios componentes por medio de catalizadores orgnicos que ella misma produce.

4 Constanza Trujillo 2006