Dogma central da Biologia Molecular

DNA
Francis Crick - o fluxo de informao gentica ocorre do DNA para o RNA para as protenas

Replicao Transcrio

RNA
Traduo

Protenas

DNA
- Polmero de nucleotdeos unidos por ligaes fosfodister - hlice com duas cadeias de nucleotdeos - as duas cadeias tm orientaes opostas antiparalelas - os grupos fosfato esto orientados para o exterior da hlice e as bases para o interior - as duas cadeias so mantidas unidas por pontes de hidrognio entre adenina / timina (2) e guanina /citosina (3)

Pareamento de bases nitrogenadas

A ligao entre os nucleotdeos (ligaes fosfodister) -hidroxil (OH) ligado pentose de um nucleotdeo - fosfato do nucleotdeo seguinte ligado ao carbono 5

Modelos para a replicao do DNA

semiconservativa conservativa dispersiva

Duplicao do DNA
uma cadeia de DNA funciona como molde sobre o qual so adicionados nucleotdeos que reconstroem uma cadeia complementar segundo o princpio do emparelhamento das bases

Base azotada

Pirimidinas ou Bases Purimdicas: timina e citosina (uracilo no RNA) Purinas ou Bases Pricas: adenina e guanina

Grupo fosfato aucar

Nucleosdeos trifosfato - nucletidos

Duplicao do DNA
molde - uma cadeia que utilizada como referncia para a construo de uma nova cadeia cadeia nova - uma cadeia que cresce de 5 para 3 - novo nucleotdeo vai-se ligar ao grupo hidroxilo livre da extremidade 3 da cadeia em crescimento Quebra de dois grupos fosfato fornece a energia para o estabelecimento da nova ligao fosfodister

DNA polimerases
- catalisam a adio de nucleotdeos extremidade 3 de uma cadeia em crescimento funcionam apenas de 5 para 3 - mantm-se associadas ao DNA atravs de uma protena gancho (clamp) e movem-se ao longo deste medida que ocorre a polimerizao - no podem iniciar a replicao, necessitam da existncia de uma cadeia iniciadora primer - Capacidade de proofreading : verificao automtica do correcto
emparelhamento

Duplicao do DNA
Origens de duplicao - locais onde as duas cadeias so separadas e a duplicao comea - 1 molcula de DNA muitas origens duplicao rpida

formam-se duas forquilhas de duplicao a partir de cada origem

duplicao bidireccional a partir da origem

replicao bidireccional a partir da origem polimerizao apenas de 5 para 3

levanta um problema na forquilha de replicao uma cadeia molde 3-5 complementar ser 5-3 outra cadeia molde 5-3 complementar ser 3-5 cadeia 3 5

cadeia contnua molde para uma cadeia nova com crescimento contnuo cadeia descontnua molde para uma cadeia nova com crescimento descontnuo

cadeia 5 3

cadeia descontnua ter orientao 3 5

DNA polimerase incapaz de elongar neste sentido

vai formar pequenos fragmentos de 5 para 3 (de trs para a frente), uns a seguir aos outros, na direco 3 5

fragmentos de Okazaki

Duplicao do DNA
- processo altamente complexo e fortemente regulado de modo a evitar erros - envolve a colaborao de um nmero elevado de protenas
DNA helicases
vo abrindo a dupla hlice frente da DNA polimerase, utilizando a energia do ATP

SSBP = single stranded DNA binding protein : protenas de ligao cadeia simples
ligam-se s cadeias simples de DNA evitando o reemparelhamento

RNA primase
sintetisa um primer de RNA sobre a cadeia molde para que as DNA polimerases possam actuar

DNA polimerases
catalisam o crescimento das duas novas cadeias

DNA ligase
une os fragmentos de Okazaki da cadeia lagging

Topoisomerases
cortam e reunem a cadeia de DNA permitindo o seu desenrolamento frente da forquilha de replicao

Esquema da forquilha de duplicao

RNA
- cadeia simples -Ribose ao invs de desoxirribose -contm uracilo em vez de timina - pode assumir conformaes tridimensionais complexas: 3 tipos principais de RNA - funes de transmisso de informao, estruturais e cataltica

DNA

DNA

RNA

Tipos de RNA
mRNAs RNA mensageiro rRNAs RNA ribossomal codificam as protenas formam parte da estrutura dos ribossomas e participam na sntese proteica adaptadores entre o mRNA e os amino cidos durante a sntese proteica utilizados no splicing do mRNA, transporte de protenas para o retculo, etc.

tRNAs RNA de transferncia

pequenos RNAs

Transcrio
- abertura e desenrolamento de uma pequena poro do DNA - uma das duas cadeias funciona como molde para a sntese de RNA - Atrs do local onde ocorre a transcrio, a dupla cadeia de DNA re-estabelece-se - as molculas de RNA so muito mais curtas que as de DNA - catalisada por uma enzima

RNA polimerase

RNA polimerase
- catalisa a formao de pontes fosfodister entre nucleotdeos - move-se ao longo da cadeia de DNA desenrolando a hlice - adiciona nucleotdeos no sentido 5 3

- utiliza a energia das ligaes fosfato dos nucleosdeos trifosfato - no possui actividade de proofreading por isso pode comear a sua actividade sem necessitar um primer - re-enrola as duas cadeias de DNA deslocando a cadeia de RNA

RNA polimerase
tem de reconhecer o local onde comea o gene, onde deve ligar-se e comear a transcrio promotor
sequncia de nucleotdeos que indica onde se encontra o local de iniciao assimtrico, RNA polimerase liga-se a este numa nica orientao que faz com que s uma e determinada cadeia de DNA seja transcrita

pra a transcrio quando encontra uma sequncia que constitui um sinal de terminao

Transcrio de um gene bacteriano

RNA procarionte sintetisado no citoplasma, as molculas

de mRNA ligam-se imediatamente aos ribossomas e comea a sntese proteica

RNA eucarionte sintetisado no ncleo = transcrito primrio

(pre-mRNA), sofre processamento antes de passar para o citoplasma atravs dos poros

Splicing remoo dos intres = regies no codificantes RNA capping adio extremidade 5 de um nucleotdeo atpico guanosina fosfato com um grupo metilo Poliadenilao corte da extremidade 3 e adio de vrios nucletidos de adenina = cauda poli A (vrias centenas de A)

Processamento do RNA eucarionte

5 capping e adenilao exciso dos intres (splicing) e ligao dos exes

pequenas partculas nucleares de ribonucleoprotenas snRNPs (small nuclear ribonucleoprotein particles) (pronuncia-se snurps)

polyA tail

mRNAs procariticos podem conter as instrues para vrias protenas diferentes mRNA policistrnico = transcrio de um opero

RNA
TRADUO

Protenas

cdigo de tripletos = codes

cdigo gentico
- cdigo degenerado vrios codes diferentes podem codificar o mesmo aminocido - 1 codo de iniciao AUG = metionina - 3 codes de terminao no codificam amino cidos, terminam a traduo

Trs grelhas de leitura possveis

- na realidade s uma grelha de leitura possvel determinada pelo codo de iniciao

palavras com 3 letras 43 = 64 codes

Traduo
os codes no so reconhecidos directamento pelo aminocido que codificam

dependente de uma molcula adaptadora que reconhece um codo e se liga a este, tendo noutra extremidade o aminocido

tRNA

tRNA
- cerca de 80 nucleotdeos - tem uma conformao tridimensional caracterstica devido ao emparelhamento de bases entre diferentes regies da molcula

4 segmentos formam duplas hlices produzindo uma molcula em forma de trevo 1 extremidade forma o anticodo sequncia de trs nucleotdeos que emparelham com o codo complementar do mRNA na outra extremidade (3) existe o local de ligao ao aminocido

associao do tRNA ao amino cido correcto

aminoacil-tRNA sintetases
estabelecem uma ligao covalente entre cada amino cido e as molculas de tRNA apropriadas uma enzima diferente para cada amino cido = 20 reconhece o tRNA adequado pela sequncia do anticodo e sequncias especficas do brao aceitador do tRNA actividade dependente da hidrlise de ATP formao de uma ligao energtica tRNA/aa cuja energia depois utilizada para a formao da ligao peptdica

traduo requer uma estrutura de suporte que se desloque ao longo da cadeia de mRNA e capture o tRNA

Ribossomas
- formados por mais de 50 protenas diferentes e vrias molculas de RNA - rRNA - vrios milhes presentes no citoplasma - constitudos por duas sub-unidades (grande e pequena) que so construdas no ncleo e exportadas para o citoplasma

Ribossomas
sub-unidade pequena - emparelha o tRNA com o codo do mRNA sub-unidade grande - catalisa a formao das ligaes peptdicas

as duas sub-unidades associam-se ao mRNA prximo da sua extremidade 5 o ribossoma move-se ao longo do mRNA traduzindo a sequncia de nucleotdeos numa sequncia de amino cidos, utilizando os tRNA adaptadores

Ribossomas
com 4 locais de ligao para molculas de RNA

- 1 local para o mRNA - 3 locais para tRNA

local A, local P e local E A aminoacil-tRNA P peptidil-tRNA E exit (sada)

Ribossomas

no modelo esto representadas 3 molculas de tRNA a ocupar os 3 locais mas, durante a sntese proteica, nunca esto ocupados mais de 2 ao mesmo tempo

Traduo de uma molcula de mRNA

- ocorre de 5 para 3 - a cadeia polipeptdica tem incio na extremidade amina - comea num codo AUG codo de iniciao ao qual se liga um tRNA especial tRNA iniciador ligado ao amino cido metionina (esta metionina posteriormente removida por uma protease) - o fim da traduo indicado pela presena dos codes stop UAA, UAG ou UGA

Incio da traduo
- ligao do tRNA iniciador extremidade
5 do mRNA com a ajuda de protenas facores de iniciao

Fim da traduo
- ligao de um factor de libertao a um codo stop

DNA
3 5

mRNA
codes

Anti-codes

N-terminal (NH2-) Terminal amino

C-terminal (COOH) Terminal carboxilo

- normalmente ocorre iniciao mltipla de sntese proteica em cada molcula de mRNA a sofrer traduo mal um ribossoma avana na molcula liga-se outro extremidade 5

- cada molcula de mRNA a sofrer traduo aparece ligada a uma srie de ribossomas permitindo a sntese simultnea de vrias molculas de protena a partir de uma nica molcula de mRNA

Polirribossomas

Polirribossomas

Mos obra