28 Fundamentos de la Bioquimica

Los millares de reacciones quimicas catalizadas por

Los enzimas facilitan secuencias de reacciones quimicas
enzimas en el interior de las celulas, se encuentran
Todas las macromoleculas biologieas son mucho menos
organizadas en muchas secuencias de reacciones conse-
estables termodinamicamente que sus subunidades
cutivas denorninadas rutas (o vias), en las quo el pro-
monomericas, aunque sean, no obstante, estables eine"-
ducto de una reaccion pasa a ser el reactivo de la
ticamente: su degradation no catalizada ocurre tan
siguiente. Algunas de estas rutas degradan nutrientes
lentamente (en un margen de altos y no de segundos)
organicos transformandolos en productos finales senci-
que, en la escala de tiempo aplicable a los organismos,
l l os, con el fin de extraer de ellos energfa qufmica y
estas moleculas son estables. Si practicamente todas las
convertirla en una forma Util para la celula; en conjunto,
reacciones quimicas celulares tienen lugar a una veloci-
estas reacciones degradativas productoras de energfa
dad significative es gracias a la presencia de enzimas,
l i bre reciben el nombre de catabolismo. La energfa
biocatali7adores que, al igual que el resto de catalizado-
liberada por las reacciones c.atabOlicas es usada on la
res, provocan un gran incremento en la velocidad de
sintesis del ATP. Como resultado de ello, la concentra-
reacciones quimicas especfficas sin consumirse en el
ciOn celular de ATP se halla muy por encirna de su con-
proceso.
centracion en el equilibria de modo que la AG de in
La trayectoria desde reactivo(s) a producto(s)
hidralisis del ATP es grande y negativa. De modo simi-
transcurre de manera practicarnente universal a traves
lar, el catabolismo tiene como resultado la production
de una barrera energetica, denominada barrera de aeti-
de los transportadores de electrones reducidos NADH y
vacion (Fig, 1-29), que debe ser superada para que
tenga lugar la reaccion. La rotura y formation de enla-
ces implica generalmente y de inanera previa La castor-
skin de los enlaces existentes, lo que genera un estado Nutnentes Otro tipo de
almacenados trabajo celular
de transition de mayor energfa libre que reactivos o
productos. El panto mas alto en un diagrama de coorde- Comida Biomoleculas
nadas de reaccion representa el estado de transicion y ingerida corn plejas
la diferencia de energfa entre un reactivo en su estado
Fotones Trabajo
fundamental y en su estado de transicion se denomina mecanico
solares
energia de activation, AGt. Los enzimas catalizan
reacciones al proporcionar un entorno mas confortable Trabajo
osmOtico
para el estado de transicion: una superficie complemen-
taria a su estereoquimica, polaridad y carga. La union de
un enzima al estado de transicion es exergOnica, y la
energia liberada por esa union reduce la energfa de acti-
NAD(P)*
vacion de la reacciOn e incrementa de modo muy impor-
tante su velocidad de reaccion.
Una contribution adicional a la catalisis ocurre
cuando dos o mas reactivos se unen a la superficie del Rutas de Rutas de
enzirna en lugares cercanos yen una orientaciOn este- reacciones reacciones
reospecffica que favorece la reaccion. Gracias a esta catabolicas anabolicas
(exergonicas) (endergonicas)
disposition se incrementa en varios ordenes de magni-
tud la probabilidad de que se produzcan colisiones pro-
ductivas entre los reactivos. Como resultado de estos y
otros factores que se discuten en el Capitulo 6, las
reacciones catalizadas por enzimas tienen lugar gene-
ralmente a velocidades rnayores que 10's veces las de
las reacciones no catalizadas. (Equivalente a un imiltdn
de milio-rzes de veces mas rapidas!)
Salvo algunas excepciones notables, los catalizado-
11111 01 CO2
res celulares son proteinas. (Como se discutird en los
Capftulos 26 y 27, algunas moleculas de RNA poseen NH3
actividad enzirmatica.) Tambien de modo casi universal, H2O cry
or
cada enzima cataliza una reacciOn especifica, y cada cl'os seocillos, precufs'"
reacciOn en la celula esta catalizada por un enzima ciife-
rente. Es, por tanto, evidente que en cada celula son
FIGURA 1-30 Pape" central del ATP y el NAD(P)14 en el metabo-
necesarios miles de enzimas diferentes. La multiplici- lism°. El ATP es el intermediario quimico que conecta los procesos que
dad de los enzimas, su especificidad (la capacidad de liberan enerpa con aquellos que requieren aporle de energfa. Su papel
discriminar entre diferentes reactivos) y su susceptibi- en la celula es analog° al de! dmero en las relations comerciales: se
lidad a la regulaciOn confieren a las celulas la capacidad "gana/produce" en reacciones exergonicas y se "gasta/consume en as
de disminuir selectivamente his barreras de activation. endergonicas. El NAD(P)H (dinuclealido de nicotinannida y adenina
Esta selectividad resulta crucial para la regulaciOn efec- (fosfato)) es un cofactor transportador de electrones que capta electro-
tiva de los procesos celulares. Haciendo quo las reaccio- nes en reacciones oxidat]yas para donarlos a continuatidn en una gran
nes especfficas procedan a velocidades significativas, variedad de reacciones biostntelicas reductoras. Presentes en concentra-
los enzimas determinan de que modo se canalizan la cones relativamente pequenas, estos cofactores esenciales pare las
materia y la energfa hacia las actividades celulares. reacciones anancti[ras deben ser constantemente regenerados ROC reac-
canes catabcilicas_

NADPH, que pueden donar electrones en procesos que
generan ATP o impulsar pasos reductores en vias bio-
sinteticas.
Otras rutas parten de pequenas moleculas precur-
soras y las convierten en moleculas progresivamente
mayores y mas complejas, entre las que se incluyen las
proteinas y los 6cidos nucleicos. Estas rutas sinteticas
que requieren, invariablemenie, 1111 aporte de energia
reciben el nombre colectivo de anabolism° La corn-
plcja red de rutas catalizadas per enzimas, tanto catabd-
licas como anabolicas, constituye el metabolismo
celular. El ATP (junto con los nucleosidos trifosfato
energeticamente equivalentes que son citidina trifosfa-
to (CTP), uridina trifosfato (UTP) y guanosina trifosfa-
to (GTP)) es el nexo de union entre los componentes
anabalicos y catabOlicos de esta red (lo que se muestra
esquernaticamente en la Fig. 1-30). Las rutas de reac-
clones catalizadas enzimaticamente que actdan sobre
los principales constituyentes de las celulas (proteinas,
grasas, azdeares y acidos nucleicos) son practicamente
identicas en todos los organismos vivos.
El metabolismo esta regulado para conseguir equilibrio y
economia
Las celulas vivas no solo sintetizan simultaneamente
miles de clases diferentes de moleculas de glOcidos, gra-
sas, proteinas y acidos nucleicos y sus subunidades mats
sencillas sino que ademas son capaces de hacerlo en las
proporciones precisa-s que son necesarias para la celula
en cualquier situation. Cuando, por ejemplo, se produce
un crecimiento celular rapido, deben sintetizarse gran-
des cantidades de precursores de proteinas y acidos
nucleicos, mieniras que en condiciones de no crecimien-
to la necesidad de cstos precursores se encuentra muy
reducida. Los enzimas slave de cada rota metabOlica
estan regulados de manera que eada tipo de molecula
precursora se sintetiza en la cantidad adecuada a las
necesidades de Is celula en aquel momenta.
Consideremos la rota que da lugar en E. soli a la
sintesis del aminoacido isoleucina, uno de los constitu-
yentes de las proteinas. La ruta consta de cinco reaccio-
nes catalizadas por cinco enzimas diferentes (las letras A a
F representan los intermediaries de la ruta):
Treonina Isoleucina
Si una celula empieza a producir mas isoleucina de la
necesaria para la suites's proteica, la isoleucina no utili-
zada se acumula y este incremento en la concentraciOn
inhibe la aetividad catalitica del primer enzuna de la
rota, con lo que se frena inmediatamente la producciOn
de isoleucina. Esta inhibition por retroalimentacion
mantienc el equilibrio entre producciOn y utilizaciOn de
cada interrnediario metabOli co. (A lo largo del libro usa-
remos el simbolo U para indicar inhibition de una reac-
cion enzimatica.)
A pesar de que sea Util para la organization y la
comprensiOn del metabolismo, el concepto de rotas
discretas constituye una simplification. En la celula
1.3 Fundamentos fisicos 29
existen miles de intermediarios metabOlicos, muchos de
los cuales forman parte de ma's de una rota. El metabo-
lismo se representa mejor comb una red de rutas inter-
conectadas e interdependientes donde la variaciOn en la
concentraciOn de cualquier metabolito da inicio a un
efecto en cadena que influye en el flujo de materiales a
traves de otras rotas. La comprensiOn de estas comple-
jas interacciones entre intermediarios y rutas en terrni-
nos cuantitativos es una tarea eliorme que puede pare-
cer desalentadora, pero el impulso actual en la biologia
de sistemas. que se discute en el Capitol° 15, ha
empezado a generar nuevos conocimientos sobre la
regulaciOn global del metabolismo.
Las celulas regulan tambien la sintesis de sus pro-
pios catalizadores, los enzimas, en respuesta al aumento
o disminuciOn en las necesidades de un producto meta-
bolico; este terra se trata en el Capitol° 25. La expresiOn
regulada de los genes (la traducciOn de la inforrnaciOn
del DNA en proteinas celulares aetivas) y la sintesis de
los enzimas son otros rriveles de control metabolic° en la
Todos ellos deben ser tenidos en cuenta al descri-
bir el control global del metabolismo celular.
RESUMEN 1.3 fundamentos fisicos
• Las celulas vivas son sistemas abiertos que inter-
eambian materia y energia con su entomb, extrayendo y
canalizando energia para mantenerse en un estado
estacionario dinamico distante del equilibria. La energia se
obtiene de is luz solar o de combustibles quimicos
convirtiendo la energia de un flujo electrOnico en ener-
gia de los enlaces quImicos del ATP.
111 La tendencia de una reaction quimica a llegar al
equilibrio puede expresarse como la variaciOn en su ener-
gia fibre, AG, quo tiene dos componentes: variaciOn de
entalpia, AH, y variaciOn de entropia, AS. Estas variables
se relacionan entre alias por la ecuacian AG = AH -TAS.
■ Cuando la AG de una reacciOn es negativa, la reac-
ciOn es exergartica y tiende a llegar a su fin; cuando AG
es positiva, la reacciOn es enderganica y tiende a avan-
zar en la direcciOn opuesta. Cuando dos reacciones se
suman para dar logar a una tercera reaceion, la AG de la
reacciOn global es la soma de las AG de las dos reaccio-
nes individuales.
■ Las reacciones que convierten ATP en Pi y ADP o on
AMP y Pp son altamente exergOnicas (AG negativa y de
valor elevado). Muchas reacciones celulares endergarri-
cas son posibles gracias al acoplamiento, a traves de
intennediarios comunes, con estas reacciones altamen-
te exergonicas.
■ La variaciOn de energia Libre estindar de una reac-
clan, AG', es una constante fisica relacionada con la cons-
tante de equilibria mediante la ecuaciOn AG° = -R7' In Kg.
• La mayor parte de las reacciones celulares tienen
Lugar a velocidades Utiles gracias a que existen enzimas
que las catalizan. Los enzimas acttlan en parte estabili-
zando el estado de transition, reduciendo la energia de
activaciOn, AGt, e incrementando la velocidad de reac-
ciOn en muchos Ordenes de mag,nitud. La actividad
catalitica de los enzimas en las celulas esta. regulada.
■ El metabolismo es la suma de muchas secuencias
de reacciones interconectadas en las que se intercon-
vierten metabolitos celulares. Cada secuencia esta
regulada de manera que produzca lo que la celula nece-

mente H, Mg o carga aunque equilibra todos los demas
elementos que intervienen en la reaccion (C, N, 0 y P, en
la anterior ecuaciOn).
Podemos escribir una reaccion que si equilibra
todos los elementos y la carga. Por ejemplo, cuando se
hidroliza el ATP a un pH superior a 8,5 en ausencia de
Me-, la reacci6n quimica se representa asf
ATP4- + H2O ADP3- + HP01- + H'
La constante de equilibrio correspondiente K'eq = culas a partir de precursores roes pequeftos, el transpor-
[ADP-][HP042-][1114ATP4-], depende solo de la tempo-
ratura, presiOn y fuerza iOnica.
Las dos formas de escribir una reacciOn metabOlica
son valiosas en bioquirnica. Las ecuaciones quirnicas son
necesarias cuando se ha de dar cuenta de todos los ato-
mos y cargas en una reaccion, como cuando considera-
mos el mecanismo de una reacciOn quimica. Se utilizan las
ecuaciones bioquimicas para determinar la direcciOn en la
que transcurrisa espontaneamente una reacciOn, dado un
pH y una [Mel determinados, o para calcular la constante
de equilibrio de tal reacciOn.
A lo largo de este libro utilizaremos ecuaciones bio-
quimicas a menos que el foco este puesto sobre un
mecanismo quimico y utilizaremos los valores de AG'° y
K' determinados a pH 7 y lout.
RESUMEN 13.2 Logica quimica y reacciones bioquimicas
comunes
■ Los sistemas vivos utilizan un gran
clones qufmicas que se pueden clasifi
generales.
IN Los grupos carbonilo juegan un papel especial en
reacciones que forman o rompen enlaces C-C. Los inter-
medios carbaniOn son frecuentes y se estabilizan
mediante grupos carbonilo adyacentes o, menus fre-
cuentemente, por iminas o cierros cofactores.
II Una redistribuciOn de electrones puede producir
reordenamientos, isomerizaciones y eliminaciones.
Tales reacciones incluyen Oxido-reducciones intramole-
culares, cambios cis-trans en el ordenamiento de an
doble enlace y trasposiciones de dobles enlaces.
III La rotura homolftiea de enlaces covalentes que
genera radicales fibres tiene lugar en algunas rutas,
tales como ciertas reacciones de isomerizaciOn, descar-
boxilaci6n, de reductasas y reordenamientos.
it Las reacciones de transferencia de fosforilo son un
tipo muy importante en la transferencia de grupo den-
tro de las celulas y se requieren para la activation de
mole' culas que ban de intervener en reacciones que, de
otro modo, serfan muy desfavorablcs.
■ Las reacciones de oxidacion-reducciOn implican la
perdida o ganancia de electrones: un reactivo gana elec-
trones reduciendose mientras que el otro los pierde y se
oxida. Las reacciones de oxidaciOn generalmente lihe-
ran energia siendo importantes en el catabolism°.
1 3.3 Transferencia de grupos fosforilo y
ATP
Una vez desarrollados algunos principios fundamentales
de los cambios de energia en los sistemas quimicos y
113 Transferencia de grupos fosforilo y ATP 507
revisadas las clases comunes de reacciones podemos
examinar ahora el ciclo de la energia en las celulas y el
papel especial del ATP como la moneda energetics que
enlaza catabolismo y anabolismo (vease la Fig. 1-30).
Las celulas heterotrOficas obtienen energia libre en una
forma quimica a traves del catabolism de moleculas
nutrientes, y utilizan esta energia para producir ATP a
partir de ADP y Pi. A continuacion el ATP cede parte de
sit energia qufrnica a procesos endergonicos tales como
la sintesis de intermediarios metabolicos y macromole-
te de sustancias a traves de membranes contra gradien-
tes de concentration, y el movimiento mecanico. Esta
cesiOn de energia a partir del ATP generalmente implica
la participation covalente del ATP en la reacciOn que ha
de ser impulsada, con el resultado final de que el ATP se
convierte en ADP y Pio, en algunas reacciones en AMP
y 2 P. Discutiremos ahora la base quimica de laa gran-
des variaciones de energia fibre que acompafian la
hidrOlisis del ATP y otros compuestos fosfato de alta
energia, y mostraremos que en la rnayoria de casos de
cesiOn de energia por el ATP interviene una transferen-
cia de grupo y no simplemente la bidrolisis del ATP.
Para ilustrar la gama de transducciones de energia en
las que el ATP proporciona la energia, consideraremos
la sintesis de macromoleculas ricas en inforrnaciOn, el
transporte de solutos a traves de membranas y el movi-
miento producido por la contraction muscular.
La variacien de energia libre en la hidroiisis del ATP es
egativa
13-11 resume la base quimica de la relativa-
me.nte grande y negativa variaciOn de energia libre
estandar de hidrOlisis del ATP. La rotura hidrolitica del
enlace anhidrido acid° fosfOrico terminal (fosfoarthfdri-
do) del ATP elimina uno de los tres fosfatos cargados
negativamente con lo que disminuye parte de la repul-
sion electrostatica del ATP; el P. osta estabiliza-
do por la formaci6n de varias formas resonantes que no
son posibles en el ATP.
La variaciOn de energia libre para la hidrOlisis del
ATP es -30,5 kJ/mol en coudiciones estandar, pero la
energia libre real de hidrOlisis (AG) del ATP en las celu-
las vivos es muy diferente: las concentraciones celulares
de ATP, ADP y Pi no son identicas y son much° menores
que las concentraciones estandar 1,0 M (Tabla 13-5).
Ademas, el Mgt' del citosol se une al ATP y al ADP (Fig.
13-12), y en la mayorfa de reacciones enzimaticas en
las que interviene el ATP como dador de grupo fosforilo,
el verdadero sustrato es MgATP2 . La AG' pertinente es,
por tanto, la de la hidrOlisis del MgATP2-. Puede calcu-
larse la AG para la hidrOlisis del ATP a partir de los datos
de la Tabla 13-5. La energia fibre de hidrolisis real del
ATP en las conditions intracelulares se la llama a
menudo potencial de fosforilacion, AGp.
Se puede calcular la variation de energia libre real de
cualquier reacciOn metabOlica tal como tiene lugar en la
celula, siempre que se conozcan las concentracio-
nes de todos los reactivos y productos asi corno otros
factores (tales como pH, temperatura yMg'i que pue-
dan afectar a la variaciOn de energia fibre real.
Para complicar awe ma's la situation, las concentra-
ciones totales de ATP, ADP, Pi (y H1 en una celula
 •

508 Biaenergetica y tipos de Ruda bioquimicos

0 0 0
II r". is II FIGURA 13-11 Base quirnica de la elevada variation de energia libre

0-P-O-P-O-P-0- RiTb-1 Adenina

asociada a la hidralisis del ATP. 0
La hidrolisis, al provocar la separa-
tion de cargas, elimina la repulsion electrostatica entre las cuatro cargas
H- t ,0 0 0 ATP4-
negatiyas del ATP. 0 Et producto fosfato inorganico (P) se estabill.72 por
la formed& de un hibrido de resonancia, en el que cada uno de ios cua-
O ej, tro enlaces fosforo-oxigeno tiene el mismo grado de caracter de doble
fl hidrolisis con
0—P-1 i dismieucion de enlace rnentras clue el ion hidrogeno no esta asoclado de manera per-
la repulsion manente con ninguno de los oxigenos (En los fosfatos involucrados en
P, 0- de carga enlaces anhidrido o ester tiene lugar Lambien un aerto grado de estabili-
0 ep:arbeJsliozancazo a za6in por resorancia, pare son posibles mends formas de resonancia
que para el P,). Jn tercel. factor (no mostrado) que favorece /a hidralisis
— 45— de ATP es e, mayor grado de solvatacien (hidrataciOn) de los productos
R P, y ADP con relaci6n al ATP, lo que estabiiiea aun mas los productos

6- c_p ___j) con rolaciOn a los reactivos.

11-
O
6-
La diferencia se debe a la fuerte union de ATP, ADP y
a proteinas celulares. Por ejemplo, is [ADP] fibre en el
O 0 nuisculo en reposo se ha calculado de forma variada
R II
-!O—P —0—P Rib Adenina entre 1 y 37 p,m.I.Trilizando el valor 25 y_sm en el Ejeinplo
O 0 ADP2- practico 13-2, obtendriamos una AGI, de -64 Idirool. No
obstante, el calculo del valor exacto de ❑Gp es, quiza,
menos instructivo que la generalizaciOn que podemos

Il
ionizacion
hacer sobre los cambios de energia Libre reales: in vivo,
la energia liberada per la hidrolisis del ATP es mayor
que el valor de la variation do energia Libre estandar,
O AG'.
11
H + -P - -P -0-, Rib -I Adenina En las discusiones quo siguen utilizaremos el valor
•
O 0 ADP3- do AG' de hidnilisis del ATP, porque ello permite una
comparacion, sobre la misma base, con la energetica de
ATP4 + Hz° ADP'-+
tras reacciones celulares. Recuerde, sin embargo, que
= -30.5 ki/mol
vas la cantidad pertinente es -para la
ATP y cualquier otra reacciOn- y quo

-come las que se clan en la Tabla 13-5-- pueden ser sus- puede ser bastante diferente de AG'.

tancialmente superiores a las concentraciones libres, Aqui hemos de mencionar un punto importante

flue son los valores terrnodinamicamente pertinentes. sobre los niveles celulares de ATP. He m s visto (y lo
discutiremos aim mas) quo las propiedades quirnicas
del ATI' hacen que sea una forma adecuada de moncda

TARA 13-5 Concentraciones totales de energetica en las celulas. Pero no son solamente las
propiedades quimicas intrinsecas que le confieren esta
nucleatidos de adenina, fosfato
capacidad para impulsar reacciones met abOlicas y otros
inorganico y fosfocreatina procesos que requieren energia. Mars importante adn es
en algunas celulas que, en el transcurso do la evoluciOn ha habido una

Concentracion nnm)• fuerte presiOn selectiva hacia mecanismos reguladores

que mantienen las concentraciones celulares de ATP
MP ADP° AMP P, PCr
muy por enctima de las concenlra-ciones de equal-
flepatocito 3,38 1,32 0,29 4,8 0 brie para la reacciOn de hidnilisis. Cuando bajan las
de rata concentraciones de ATP, no solo disrninuye la cantidad
Miocito 8,05 0,93 0,04 8,05 28
de rata

Neurona 2,59 0,73 0,06 2,72 4,7 0 0 0

de rata
0-P-0-P-0 - 0 Rib -I Adenine
Eritrocito 2,25 0,25 0,02 1,65 0
0- 0 ° MgATP2-
mg?'
humano

Celula 7,90 1,04 0,82 7,9 0

O 0
dc E. coli
II
0-P -- - - P - O - Rib Adenina
'En el caso de los eritrocitos as concentraciones son as del citosol
(los eritrocitos humans carecen de nude° y rnitocondrias) En los ,0 MgADP
otros tipos de celuias los datos corresponden a los contenidos tvt8"21.
totales de la celula, aunque el citosol y la mitocondna tienen
concentraciones muy diterentes de ADP PCr es fosfocreatina que
se describe en la p. 516. FIGURA 13-12 Mgt' y ATP. La formaclOn de los complejos con me
Este valor relleje Ia concentration total; el verdadero valor para el apantalfa parclafmente as cargas negatives e influye sobre Is conforme-
ADO Libre puede ser mucho manor. d& de los grupos fosfato de nucledtidos tales como el ATP y a# ADP
1070 Metabolism° de las proteinas

en que lugar de la celula se sintetizaban las proteinas. El tercer descubriniiento importante tuvo lugar
Inyectaron aminoacidos radiactivos a ratas y se extraje- cuando Francis Crick se pregunt6 de que modo la infor-
ron los higados, se homogenizaron y fraccionaron por macifin genetica contenida en el lenguaje de 4 tetras de
centrifugation a diferentes los aridos nucleicos podia traducirse al lenguaje de 20
intervalos despues de la inyec- Tetras de las proteinas. Crick propuso que un pequetio
ei6n. Seguidarnente, se anali- acido nucleico (tal vez RNA) podria desempefiar el
zaron las proteinas radiactivas papel de adaptador; ulna parte de la molecula de adap-
en las fracciones subcelulares. tador se uniria a un aminoacido especifico mientras que
a•-•
Cuando se dejaban pasar floras otra parte del adaptador reconoceria la secuencia
o Bias despues de la inyecciOn nucleotidica que codificara dicho aminoacido en el
de los aminoacidos marcados infiNA (Fig. 27-2). Esta idea pronto fue confirmada. El
todas las fracciones subcclula- tRNA adaptador "traduce" la secuencia nucleotidica de
res contenian proteinas mar- un mRNA a la secuencia de aminoacidos de un polipep-
460 cadas. No obstante, cuando tido. El proceso global de sintesis de proteinas guiada
habian transcurrido escasa- por 1T1RNA muy a menudo se denomina simplemente
Paul Zamecnik, 1917-2009
mente arms rninutos solo se traduccion.
[Fuente Archives and Special
encontraba proteina marcada Estos tres avances pronto condujeron a la identifi-
Collections, Massachusetts
en la fraction que c.ontenfa caciOn de las principales fases de la sintesis de proteinas
General Hospital.]
particulas pequefias de ribo- y fmalmente a la elucidation del cedigo genetico que
nucieoproteina. Estas particulas, visibles en los tejidos especifica cada one de los aminoacidos.
animales por microscopia electranica, se identificaron,
por tanto, come el sitio de la sintesis proteica a partir de
El cOdigo genetico fue descifrado mediante moldes
aminoacidos y mas tarde se las llama ribosomas
demRNA a rtificiales
(Fig. 27-1).
El segundo descubrimiento clave fue realizado por En la decada de 1960 estaba claro que se requerian al
Mahlon Hoagland y Zamecnik, que encontraron que los menos tres residues nucleOticos del DNA para codificar
aminoacidos eran "activados" cuando se incubaban con cada aminoacido. El eedigo de cuatro letras del DNA (A,
T, G y C) en grupos de dos solo puetle dar 42 = 16 corn-
ATP y la fraction cites6lica del higado. Los aminoacidos
se unian a una forma especial de RNA soluble y ter- binaciones diferentes, que, no son suficientes para codi-
ficar los 20 aminoacidos. No obstante, cuatro bases en
moestable, caracterizada per Robert Holley, Hamada
mas tarde RNA de transferencia (tRNA),r feimando upos de tres pueden dar = 64 combinaciones
andirioacil-tRNA. Los enzimas que cataliza r,
gt.ih -g de las caracteristicas esenciales del codigo
eeso son las ananoacii-tRNA sintetasas.
genetico fueron rapidamente establecidas mediante
experimentos geneticos (Figs. 27-3, 27-4). Un eoclOn
es un triplete de nucleOtidos que codifica un aminoaci-
do especifico. La traducciOn tiene lugar de manera que
los tripletes son leidos sucesivamente y sin solaparnien-
to, lin primer codOn especifico en la secuencia determi-
na el marco de lectura, en el que un nuevo coden

N
R
Aminoacido
H3N—C—H

5itio de union
del aminoacido

Ada ptador

` s ueJ

C1-:..)1ATUij G.' I ATE1-U111411 G1 U GtG

FIGURA 27-1 Ribosomas y reticulo endoplasmatico. La rn crografra
electrOnica y el dibuo esquernatico de una porciOn de celuia pancreatica
rruestran ribosomas unidos a la cara externa (citosalica) del reficulo
endoplasmAtico (RE)_ ribosomas son los numerosos pequenos pun-
Los en el horde de las capas de membranas paralelas. (Fuente: Joseph F.
Gennaro Jr/ Fuente cientifica)
mRNA
Triplete de nucleifThdos
clue codifica un am Inoacido
FIGURA 27-2 Hipotesis del adaptador de Crick. Actuamente sahe•
mos que el aminoacido esta undo covalentemente a extremo 3' de la
molecula de tRNA y que un triplete de rucleOtidos especifico en otra
parte de la molecula de tRNA interacciona con un triplete especifico en
el mRNA mediarte puentes de hidrogeno entre bases complementarias
 27.1E1 codigo genetico 1071

mRNA - -LG UA1GCC !it) A C G A ;RI ---- 3'

Codigo sin AUA CGA GUC
solapamiento 1 2 3
(+)
COdigo con AUA CGA GUC
solapamiento 1 loser-6On --ICU Al GCC [u C Al C G G fa Li -
(-)
2

3 Deiebon [AC GIIG A ul---

FIGURA 27-3 Un codigo con solapamiento frente a un codigo sin ( -)
solapamiento. En un codigo sin solapamiento los codones (numerados
de forma consecutive) no comparten nuc'eOtdos. En un codigo con
insertion - U Al IG G u-
y deletion
solapamiento, algunos nucleOtidos del mRNA son compartidos por Marco de lectura
codones diferentes. En un codigo de tripletes con solapamiento maxima, recta urado
muchos nucleotides come el tercet rucle6Udo (A) de is izquierda, son
compartidos por tres codones Observese que en un codigo con solapa- FIGURA 27-4 Cdcligo de tripletes no solapados. Los d:atos sobre Is
miento, ha secuencia del primer coder limita las posibles secuencias del naturaleza del codigo genetico se obtuvieron a partir de muchos tipos de

segundo radon. Un codigo sin solapamiento da macho man flextilidad experimentos. entre epos experimentos geneticos sabre los efectos de

en la secuencia de tripletes de los codones vecinos y, por tanto, an las mutac'ones por deleciOn e inserci6r. La insertion o delecidn de un par

posibles sec,iencias de aminoacidos especiiicadas por el codigo. El de bases (mostrada aqui en el transcrito de mRNA) altera Is secuencia

codigo genetico utilized': en todos los sistemas vivos es sin solapa- de tripletes en un codigo sin solapamiento, todos los aminoacidos coditi-

mierto, cados par el mRNA despues del cambia quedan afectados. E a comblna-
clan de mutaciones por insertion y delebein afecta algunos aminoacidos,
pero tinalrnente puede restaurar 4 secuencia corrects de aminoacidos.
empieza cada tres nucleatidos. No hay puntuaciOn entre
La adiciOn o sustraccion de tres nucleotidos (no =strode) deia intactos
los codones de sucesivos aminoacidos. La secuencia de box restantes tripletes, la que demuestra que un cod& tiene tres nucleO-
aminoacidos de una protelna esta definida, por tanto, tidos, y no cuatro o cinco. Los codones de tripletes sombreaoos en gris
par una secuencia lineal de tripletes contiguos. En prin- son los transcritos a partir del gen original; los codones sombreados en
cipio, cualquier secuencia de DNA de cadena sencilla o azul son codones nuevos resultantes de mutaciones por insertion o
de mRNA tiene tres posibles marcos de lectura. Cada deleclOn.
marco de lectura da una secuencia diferente de codones
(Fig. 27-5), pero solo una es probable que codifique
na), mientras que el poliadenilato, poli(A), codifies la
una proteina determinada. Thdavia quedaba una
polilisina. El poliguanilato no generO ningun polipeptido
gunta fundamental por responder, e
orma espontaneamente tetraplexos (vease la
14i r
palabras de tres tetras pare cada amin
En 1961 Marshall Niren- Ind) que no pueden unirse a los ribosomas.
berg y Heinrich Matthaei rea- Los polinucleOtidos sintkicos utilizados en estos
lizaron el primer avance signi- experimentos se obtuvieron con la polinucleotido fosfo-
f i cativo. Incubaron poliuridila- rilasa, que cataliza la formation de polimeros de RNA a
to sintetico, poli(U), con un partir de ADP, UDP, CDP y GDP. Este enzima, descu-
extracto de E coli, GTP, ATP bierto per Severn Ochoa, no requiere molde y fabrica
y una mezcla de los 20 ami- polfrneros con aria composicitin de bases que refleja
noacidos en 20 tubas diferen- directamente la concentration relativa de los precurso-
tes, cada tuba con un amino6.- res nucleOsido 5'-difosfato del medic. Si a la polinucle&
cido diferente marcado con tido fosforilasa se le suministra solo UDP, fabrica
poli(U). Si se le sinninistra una mezcla de cinco partes
radioactividad. Puesto que el
de ADP y una de CDP, fabricara un polimero con cinco
mRNA poli(U) esta formado
Marshall Nirenberg, 1927-2010 sextos de adenilato y un sexto de citidilato. Un polimero
por muchos tripletes UUU
TFuente: AP photo.] al azar de este tipo es probable que contenga muchos
sucesivos, deberfa promover
tripletes con la secuencia AAA, un flamer() menor de
la sintesis de un polipeptido que contuviera solamente AAC, ACA y CAA, relativamente pocos ACC, CCA y
el aminoacido codificado por el triplete UUU. En efecto, CAC y muy pocos tripletes CCC (Tabla 27-1). Con la
se form() un polipeptido radiactivo solo en uno de los 20 utilization de diferentes mRNA artificiaies producidos
tubas, el que contenia fenilalanina radiactiva. Nirenberg por la polinucleatido fosforilasa a partir de mezclas de
y Matthaei concluyeron, par tanto, que el triplete ULM partida diferentes de ADP, GDP, UDP y CDP, los grupos
codiflca la fenilalanina. El ruismo metodo demostr6 que de Nirenberg y Ochoa pronto identificaron la composi-
el polinucleOtido sintetico policitidilato o poli(C) codifi-
tion de bases de los tripletes que codifican la casi tota-
ca un polipeptido que solo contiene prolina (poliproli-

Marco de lectura 1 5' -- U Ciru C G A CJ C U GlIG A U UIIC A CI1A G U1--- 3'

Marco de lecture 2 - - - U FLFE U1 1 C G A C C fU G G ijA G A IU U C: A C A }G U —

Marco de ectura 3 - -U WIC U Cr —G G A FC IG G AI G A ULU C A IC A 111---

FIGURA 27-5 Marcos de lectura en el codigo genetico. En un codigo de tripletes sin solapamiento,
todos los mRNA tienen tres pautas de lectura potenc:eles, mostradas en diferentes colotes Observese que
los tripietes y, por tanto, los aminoacidos espectficados, son diferentes or coda marco de lecture.
1072 Metabolism° de as proteinas

TABLA 27-1 Incorporation de aminoacidos en polipeptidos en respuestA

a polimeros aleatorios de RNA
Asignacion tentative Frecuencia
Frecuenda de to composition de incorporation esperada
de incorporation observada de nucleotides eel (Mon basada en la asignadon
Aniinoacido (Lys=100) correspondiente lLys=100)

Asparagina 24 A2C 20
Gllitantina 24 A2C 20
1-listidina 6 AC2 4
Lisina 100 AAA 100
Prolina 7 AC2, CCC 4,8
Treonina 26 A2C, AC%3 24
Nola: Aqui se presents un resumer de los datos de uno de los primeros experimentos disenados para dilucidar el
cadigo genetic° Se utilize un RNA sintetico, que solo contenia residuos A y C en la proporcior pare drgir Ea sintesis del
polipeptido Se determiraron tanto la (dentidad coma la cantidad de aminoacidos incorparados.
Raserdose en la abundancia relative de residuos A y C en el RNA sintetico y asignando al codon AAA (el tries
probable) una frecuencia de 100. deberia haber tree codones de composcion A.C. calla uno cor una frecuencia
relative de 20: fres codones oe camposicien AC,. coda uno con una frecuenc)a relaava de 4,0, y el codon CCC con una
frecuencia relative de 0,8. La asignacidn del CCC se oaso en la informacZn obtenida en estudios antenores con
poli(C). Cuando se hacen dos asignaciones tentativas de codon. se propene que ambos coddicar el r11J9M0
aminoacido.
'Estes designaciones de composiciOn de nucleOlidos no contienen nforrnacion sobre la secuencia nucleotidica
(except°, claro este, en los cases de AAA y GGC).

ildad de los aminoacidos. Aunque estos experimentos codones sin ambigtiedades.

revelaron la composition de bases de los tripletes codi- El polimero por ejem-
ifcantes, en general no pudieron desvelar su secuencia plo, tiene codones ACA y
de bases. CAC alternantes: ACACACA-
---) ,ACA.,. El polipeptido
uio: ct,(64
)) Convention dm: El contenido del capit te:fitaldogOn. este mensaje-
buena parte de los tRNA. El aminoacicio especificado ro contenia cantidades igua-
por un tRNA se indica con un superindice, tal como les de treonina y de histidina.
tRNA' y el tRNA aminoacilado con un nombre con un Dado que el codOn de la histi-
guiOn: alanil-tRNAk3 o Ala-tRNA". (( dina tiene una A y dos C
(Tabla 27-1), CAC debe codi-
En 1964 Nirenberg y Philip Leder lograron otro ficar la histidina y ACA la H. Gobind Khorana, '922-2011
avance fundamental, Encontraron que los ribosornas treonina. [Fuente. Cortesia de
aislados de E. coli fijaban un antinoacil-tRNA especffico Los resultados de muchos Archives, University of
en presencia del correspondiente polinucledtido mensa- experimentos permitieron la Wisconsin-Madison.]
jero sintetico. Por ejemplo, ribosomas incubados con asignacidn de 61 de los 64
poli(U) y fenilalanil-tRNAPhe (o Phe-tRNA ) fijan codones posibles. Los otros tres se identificaron como
ambos RNA, pero si los ribosomas se incuban con codones de terminaciOn, en parte porque destrulan los
poli(U) y algun otro aminoacil-tRNA, el aminoacil-tRNA patrones de cociificaciOn de aminoacidos cuando esta-
no se fija porque no reconoce los tripletes LILT del
poli(U) (Tabla 27-2). Incluso los trinueleotidos permi-
tian la union especifica de los tRNA apropiados, por lo
TABLA 27-2 Trinucleetidos que inducen
que estos experimentos pudieron realizarse con oligo-
union especifica de
nucleOtidos sintetizados qulenicamente. De esta forma
fue posible determinar que aminoacil-tRNA se fijaba a aminoacil-tRNA a los ribosomas
54 de los 64 codones de tripletes posibles. Con algunos Aliment° relative de aminoacil tRNA marcado
codones, o no se fijaba ningdri aminoacil-tRNA o se fija- con '4( unido al nbosome
ba mss de uno. Se necesitaba otro inetodo para comple-
Trinucleotido Pfie tRNA"" Lys-tFINV' Pro-tRNA'"
tar y confirmar el codigo genetic o en su totalidad.
Contemporaneamente, H. Gobind Khorana aport6 TUT' 4,6
un enfoque complementario, desarrollando metodos
7,7
que perrnitian sintetizar polirribonucleotidos con AAA
secuencias repetitivas de dos a cuatro bases. Los poll- CCC 0 0 3,1
peptidos producidos utilizando estos mRNA tenian uno Fuente: Information from M. Nirenberg y P. Leder, Science 145:1399,
o unos pocos aminoacidos en patrones repetitivos. 1964.

Estos patrones, combinados con la infonnaciOn obterri- *Los numeros representan of factor en que aumentaba la cantidad de "C
unido cuando as hallaba presenter el trinucledtido Mclicado, en
da a partir de los polimeros al azar utili7ados por Niren- re lation con el control at cual no se habia anadido el tnnucleando.
berg y colaboradores, permitieron la asignacion de
 27.1E1 racligo genetic!) 1073

Marco de lectura I 5'- - HG UAF,IkG ..J.,A A GILU A A G U LI A A - -- 3'

Marco de lectura 2 G ,L1 A A-IG u AjIA G UIIA A GI U A Al G U Al A - -

Marco de lectura 3 ---GUAAG'IUAAIGUA*GUAAG[UAAh---

FIGURA 27-6 Efecto de an codon de terminacitin en un tetranuclekido repeticlo. Los

codones de terminacids (en rose) se encuentran cada cuarto coddn en as tres chierertes
marcos de lecture (mostrados en dilerentes colores). Se sintelizar dipeptidos o trpeptidos
segiin el silo en donde se una inieialmente of rdposorna

bait presentes en los polirneros de RNA sintetico final de la sintesis de un polipeptido y no codifican nin-
(Fig. 27-6). El significado de todos los tripletes (tabu- guno de los aminoacidos conocidos. Algunas excepcio-
lado en la Fig. 27-7) fue establecido ya en 1966 y ha nes a esters reglas se discuten en el Recuadro 27-1.
sido verificado de muchas formas distintas. El descifra- Como se describe en la Seccien 27.2, el inicio de la
do del codigo genetic° esta considerado coma uno de sintesis proteica en la celula as un proceso elaborado
los mayores descubrimientos cientificos del siglo XX. que requiere un cociOn de Mid° y otras senates en el
Los codones son la slave de la traduccien de la mRNA. Desde la perspectiva actual, los experimentos
information genetica, que hate posible la sintesis de de Nirenberg, Khorana y otros para identificar la fun-
proteinas especlficas. El marco de lectura se establece cidn de los codones no debieran haber funcionado en
cuando empieza la traduecion de una molecula de ausencia de codones de irticio. Afortunadamente, las
mRNA y se mantiene mientras la rnaquinaria de sintesis conditions experimentales hicieron que los requeri-
lea secuencialmente un triplete tras otro. Si el marco de mientos normales para el inicio de is sintesis proteica
lectura initial se desplaza una o dos bases o si la traduc- estuviesen relajados. Una vez Inas en la historia de la
clan pass par alto un nucleOtido en el mRNA, todos los bioquinnica, el esfuerzo combinado con la buena suerte
codones siguientes estaran fuera de registro; el resulta- produjo un avance importante.
do es una protein "sin sentido" con una secuencia de En una secuencia de nucleetidos al azar, uno de
aminoacidos alterada. cada 20 codones de cada marco de lectura, es, come
Varios codones tienen funciones especiales (Fig. promedio, un codon de terminacien. En general, un
27-7). El codon de inicio AUG es la sepal mss con marco de lectura sin un codon de terminaciOn en 50 a
del principio de las cadenas polipeptidirni en tociqq, aids codones, se denomina marco de lectura abierto
eelulas, ademas de codificar residues Alert en tnasiete t' ("OftV).,Los marcos de lectura abiertos largos normal-
internas de los polipeptidos. Los codones de termini- mente correspondent a genes que codifican proteins.
don (UAA, UAG y UGA), tambien llamados codones de En el anatisis de las secuencias presentes en los bancos
paro o codones sin sentido, norrnalmente senalan el de dates, se utilizan programas sofisticacios que buscan
marcos de lectura abiertos con el fin de encontrar genes
entre la enorme cantidad de DNA no genic°. Un gen
Primera letra del codon(extrerro 5) ininterrumpido que codificara una proteins tipica de
Segunda Petra del masa molecular 60.000 requeriria un marco de lectura
codon abierto con 500 codones o aids.
A G
Una caracteristica destacable del codigo genetic°
UUU Phe LICU Ser UAU Tyr UGU Cys
consiste en que un aminoacido determinado puede ser
UUC Phe UCC Ser LAC Tyr UGC Cys especificado per mss de un codon por lo que el codigo
U
UUA Leu UCA Ser UAA Stop UGA Stop
UUG Leu UCG Ser UAG Stop UGG Trp se califica coma degenerado. Ella no significa que el
codigo sea imperfecto: aunque un aminoacido puede
CUU Leu CCU Pro CAU His CGU Arg
CUC Leu CCC Pro CAC His CGC Arg
tenor dos o Inas codones cada cedar' especifica un
C
CUA Leu CCA Pro CAA Gln CGA Arg ilnico aminoacido. La degeneration del codigo no as
CUG Leu CCG Pro CAG Gin CGG Arg uniforme. Mientras que la metionina y el triptdfano
tienen un solo codon, tres aminoacidos (Arg, Leu, Ser)
AUU Ile ACU Thr AAU Asn AGU Ser
AUC He ACC Thr AAC Asn AGC Ser tienen sets codones, since aminoacidos tienen cuatro,
A
AUA Ile ACA Thr AAA Lys AGA Arg la isoleucina tiene tres y nueve aminoacidos tienen dos
AUG Met ACG Thr AAG Lys AGG Arg (Tabla 27-3).
El codigo genetic° es casi universal. Con la Mtn-
GUU Val GCU Ala GAU Asp GGU Gly
GUC Val GCC Ala GAC Asp GGC Gty
game exception de pequefias variaciones en las mito-
G
GUA Val GCA Ala GAA Glu GGA Gly condrias, algunas bacterias y algunos eucariotas unice-
GUG Val GCG Ala GAG Glu GGG Gly
lulares (Recuadro 27-1), los codones de los aminoaci-
dos son identicos en todas las especies exarninadas
FIGURA 27-7 "Diccionario" de las palabras del codigo de los aminoa- hasta ahora. Los seres humanos, E. soli, has plantas del
cidos en los mRNA. Los codones estan escritos en Is direcciOn 5-3'. tabaco, los anfibios y los virus comparten el mismo
La tercera base de cada codon (en negrita) juega un papel menos irnpor- codigo genetic°. Ella indica que todas las formas de
tante en la esdecificacian del aminoi6do que las dos primeras. Los tres
vida tienen un antepasado comun, cuyo codigo geneti-
codones de terminacion se indican en rojo y el coddn de iniclo AUG er
co ha sido preservado a lo largo de toda la evoluciOn
verde. Todos as aminoacidos, excepto fa metionina y ei triptotano, tie-
biologica. Incluso las variaciones refuerzan esta coin
nen mss de un coddn. En la mayoria de casos, los codones que especifi-
elusion.
can el mismo aminoacido solo difieren en IS tercera base.
1. El ATP constituye la unión química entre catabolis- mo y anabolismo. Es la moneda energética de la célula viva. La
conversión exergónica del ATP a ADP y P,, o a AMP y PP, está acoplada a muchas reacciones y procesos endergónicos.

2. La hidrólisis directa del ATP es la fuente de energía en algunos procesos impulsados por cambios de confor- mación
pero, en general, no es la hidrólisis del ATP sino la transferencia de un grupo fosforilo, pirofosforilo o adenililo del ATP al
sustrato o al enzima la que acopla la energía de rotura del ATP a transformaciones endergó- nicas de sustratos.

3. A través de estas reacciones de transferencia de grupo, el ATP proporciona la energía para las reacciones anabólicas,
incluida la sintesis de macromoléculas por- tadoras de información, y para el transporte de molécu-las e iones a través
de las membranas contra gradientes de concentración o de potencial eléctrico.

4. Para mantener su elevado potencial de transferen- cia de grupo, la concentración ATP debe mantenerse muy por
encima de la concentración de equilibrio mediante reacciones del catabolismo que producen energía.