Tema 2: Los microorganismos en la escala biológica

CARACTERÍSTICAS QUE DEFINEN A LOS MICROORGANISMOS

 Talla microscópica, inferior a la de células organizadas en tejidos.
o Los microorganismos disponen de una amplia superficie (membrana plasmática) para un
pequeño volumen.
 Existencia autónoma como seres unicelulares
o Toda la superficie del individuo está en contacto directo con el medio.
Ambas características otorgan a los microorganismos (procariotas) importantes ventajas en comparación
con las células de organismos superiores.
LEY DE RUBENS
Cuanto menor es el radio de una esfera, mayor es su relación Superficie/Volumen. La relación S/V en
microorganismos es hasta 10 veces mayor de células tisulares.

TALLA BACTERIANA
Ultramicrobacterias < Bacterias extremófilas < Eubacterias mesófilas < Cianobacterias (fotoxigénicas) <
Bacterias rojas del azufre (gigantes)
 Ultramicrobacterias: viven en agua de mar y en los suelos. Son oligotróficas (necesitan un ambiente
mínimo para sobrevivir) son parásitos de otras bacterias y microorganismos eucariotas. No son
cultivables. Su genoma es mínimo. Talla cercana al virus de 0.1μm
 Arqueas extremófilas: viven en ambientes extremos. Talla de 0.22-0.5 μm
 Eubacterias mesófilas: Bacterias verdaderas. Viven en condiciones medias entre 30-40ºC. Nos
atacan a nosotros. De 2 μm
 Cianobacterias (fotoxigénicas): 5 a 15 μm. Talla similar a microorganismos eucariotas.
 Bacterias rojas del azufre (fotoanoxigénicas): de 20-50 μm talla similar a organismos eucariotas.

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TASA METABÓLICA
Al tener mayor relación Superficie/Volumen, tienen mayor intercambio con el medio externo, por lo que
tienen mayor tasa metabólica, y también mayor tasa de crecimiento. También significa tener mayor
flexibilidad biológica (capacidad de reacción ante cambios del medio). Detectan fácilmente cambios
ambientales. Responden a ellos rápidamente, gracias a eficaces mecanismos de regulación de síntesis de
enzimas.
Por otro lado, las células organizadas en tejidos, son más rígidas en su equipamiento enzimático
(especialización metabólica) y apenas reaccionan ante cambios del medio externo (adaptadas a ambientes
poco cambiantes).
TASA DE CRECIMIENTO
Tener mayor tasa de crecimiento les da mayor capacidad evolutiva. Esto es debido a la frecuencia de
mutación espontánea. Igual a la de células tisulares, pero al dividirse más rápido tienen mayor número de
mutaciones. Los microorganismos tienen alta capacidad de colonización y por eso son ubicuos.
OTRAS CARACTERÍSTICAS
Dominan en densidad, diversidad y actividad sobre el resto de organismos.
 Pueden usar diferentes fuentes de energía
 Amplia variedad de estrategias metabólicas
 Mecanismos únicos de intercambio de genes que optimizan su adaptación evolutiva.
Consecuencia: los microorganismos tienen una alta capacidad de colonización.
FORMAS DE VIDA DE LAS BACTERIAS ATENDIENDO A SU NUTRICIÓN

Tipos de fotoautotrofía
 Fotosíntesis oxigénica: se produce oxígeno (O2) característica de las cianobacterias.
 Fotosíntesis anoxigénica: No genera O2 y se da en las bacterias rojas, verdes y heliobacterias.
BACTERIAS GIGANTES
Como por ejemplo Epulopiscium fishelsonii (hiperplegamiento de la membrana plasmática) o Thiomargarita
namibiens (Obtiene energía de compuestos azufrados), la vacuola central comprime el citoplasma contra la
membrana plasmática.

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ULTRAMICROBACTERIAS
Son oligotróficas o parásitos de otras bacterias y microorganismos eucariotas. No son cultivables y su
genoma es mínimo.
Pelagibacter ubique es el microbio más abundante del planeta. Se identificó como resultado de análisis
metagenómicos empleando técnicas de secuenciación masiva para estudiar la diversidad microbiana de los
océanos.
Se caracterizan por capacidad para pasar físicamente a través de filtros con un tamaño de poro <0,45 μm.
Son omnipresentes en la biosfera y están presentes en gran abundancia en una amplia gama de hábitats,
incluidos océanos, ríos, suelos y lechos rocosos subterráneos. Por su pequeño tamaño:
 Exhiben una reducción significativa de su genoma para ejecutar sólo funciones esenciales
 No contienen genes duplicados, ni genes virales ni ADN basura.
 El pequeño tamaño del genoma implica un menor trabajo para realizar la copia cuando el
microorganismo se replica.
 Son microorganismos oligótrofos adaptados a medio ambientes donde la concentración de
nutrientes esenciales es muy baja (los océanos). Es muy ventajoso ya que no compiten con especies
copiótrofas: Aquellas que crecen bien en ambientes ricos en nutrientes; la gran mayoría de bacterias
y arqueas
 Mantienen relaciones sintróficas con otros microbios.
 Los requisitos inusuales de nutrientes causados por la reducción de su genoma y/o dependencia
metabólica con otras especies hace que sean muy difíciles de aislar y cultivar
METAGENÓMICA
Es el estudio del material genético recuperado directamente de muestras ambientales o clínicas
mediante métodos de secuenciación de ADN
Proyectos pioneros de metagenómica: exploran el metagenoma microbiano del océano. 2700 científicos de
más de 80 países reúnen resultados de 540 expediciones. Evaluaron la diversidad genética de las
comunidades microbianas marinas y su papel en procesos fundamentales del ecosistema marino en nuestras
más de 1200 localizaciones. Reúne una base de datos de 18 millones de secuencia de ADN de
microorganismos marinos. Sólo el 1% de la microbiota marina es cultivable.
SINTROFÍA
Cooperación microbiana inter-especie simbiótica en la que el crecimiento de un organismo depende, o se ve
mejorado, de productos metabólicos proporcionados por otro organismo. La asociación sintrófica entre los
microbios consumidores de H2 y los fermentadores permite la degradación continua de los compuestos
orgánicos y el crecimiento de ambos socios.

SIMBIOSIS
Relación de estrecha convivencia entre seres vivos de distinta especie (los cuales pasan a llamarse
simbiontes), con el fin de obtener algún beneficio de esta interacción. Las asociaciones simbióticas se
clasifican de acuerdo a los efectos de la interacción de los organismos implicados:
 Parasitismo: Uno del os organismos se ve beneficiado causando daño al otro.

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  Comensalismo: No existe efecto negativo ni beneficio sobre el otro.
 Mutualismo: ambos organismos se benefician.
DOMINIO BACTERIA
La forma es constante para cada especie. Las bacterias se clasifican en cinco grupos según su forma básica:
esféricas (cocos), bastones (bacilos), coma (vibrios), espirales (espirilla), y sacacorchos (espiroquetas).

Agrupación bacteriana: algunos géneros bacterianos se agrupan de una manera característica por la
tendencia de las células hijas a permanecer parcialmente adheridas después de la división celular.
 Cocos
o Pares: diplococos
o Cadena: estreptococos
o Cuatro células esféricas: tétrada
o En forma de racimo o irregular: Estafilococos
o En paquetes cúbicos: sarcinas
o Ejemplos de cocos Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Streptococcus
pneumoniae etc.

 Bacilos
o Aislados: Cocobacilos, bacilos
o Adheridos por sus extremos: Diplobacilo
o Formando cadenas: Estreptobacilo
o Adosados: Empaladiza
o Ejemplos bacilos: Lactobacillus casei,
Streptobacillus moniliformis, Bacillus anthracis

 Espirilos y espiroquetas
o Generalmente no forman grupos.
o Ejemplos: Helicobacter pylori, Borrelia burgdorferi

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DOMINIO ARQUEA
Pueden vivir tanto en ambientes no extremos como el acuático y el terrestre: existen de manera similar a las
Bacterias. Abundan Bacilos y espirilos.
Las arqueobacterias también pueden ser extremófilas: pueden vivir en ambientes hipersalinos, ácidos,
húmedos… Algunas arqueobacterias son: Hallobacterium salinarun,

Existen diferentes formas que

pueden tomar

ORIGEN EVOLUTIVO DE LOS MICROORGANISMOS

La Sistemática es una ciencia que estudia las relaciones de parentesco entre los organismos y su historia
evolutiva (filogenia + taxonomía). Sus objetivos principales son:
 Explorar la biósfera para descubrir y describir su biodiversidad
 Proponer hipótesis sobre las relaciones de parentesco entre especies y grupos de especies, de
acuerdo al conocimiento que se dispone de ellos (morfológicos, moleculares, ecológicos,
biogeográficos, etc.)
 Sistematizar la biodiversidad descubierta en clasificaciones jerárquicas según las hipótesis de
parentesco, para lo cual se vale de la Taxonomía
Taxonomía (Linneo): comprende la descripción de los organismos y la organización de esta diversidad
en la base a un conjunto de leyes y reglas.
Filogenia: es la historia o crónica evolutiva de las especies. Su misión es conocer las relaciones evolutivas
entre los grupos de especies.
Tradicionalmente la historia evolutiva y la taxonomía de los seres vivos se estudió principalmente con las
herramientas de la paleontología, mediante el examen de fósiles, y las de la biología comparada, comparando
los rasgos de los organismos vivos. Estos enfoques permitieron progresar mucho en la comprensión de la
evolución de las plantas y los animales.
El primer intento de representar la historia evolutiva de los microorganismos fue publicado por Ernst
Haeckel (1866), quien sugirió, correctamente, que los organismos unicelulares (Monera) eran antepasados
de otras formas de vida. Propone un tercer reino denominado Protista donde incluye a los organismos
unicelulares
Whittaker (1969), propone un esquema de clasificación en 5 reinos basada en criterios anatómicos y
fisiológicos como la organización celular, el tipo de nutrición, si presentan verdaderos tejidos, pared celular,
tipo de nutrición, reproducción, y movilidad
 Plantae
 Animalia
 Fungi
 Protista: Eucariotas que no son animales, plantas u hongos
 Monera: procariotas.
Seguía siendo del todo imposible resolver las relaciones evolutivas entre la mayoría de los microorganismos.
La filogenia micobiana había progresado poco desde Haeckel.

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CARACTERÍSTICAS QUE DIFERENCIAN LOS SERES VIVOS ORGANIZADOS EN LOS 5
REINOS DE WITHAKER

1953: Watson y Crick publican el modelo (estructura tridimensional) de la doble hélice del ADN. Ayudado
por el trabajo de Maurice Wilkins y Rosalind Franklin.
Aplicación de un haz de rayos X a una estructura y luego imprimir una placa fotográfica con todos los rayos
que la han atravesado y que han sufrido una difracción por el objeto interpuesto.

Imagen de ADN por difracción de rayos x:

El desarrollo de la biología molecular a mediados del siglo XX, condujo a plantearse la utilización directa
del ADN como marcador complementario en taxonomía
TAXONOMÍA MOLECULAR BASADA EN EL ADN
Todas las células contienen ADN como material genético y éste pasa de padres a hijos. Las mutaciones
hereditarias se acumulan en las secuencias de ADN de manera natural. Por tanto, la diferencia en secuencias
nucleotídicas entre dos organismos será función del número de mutaciones acumuladas desde que
compartieron un antepasado común. Las diferencias en las secuencias de ADN se pueden utilizar para inferir
relaciones evolutivas (grado de similitud): Filogenética
La acumulación de mutaciones en el ADN a lo largo del tiempo es la
causa de que las secuencias de un mismo gen en dos especies distintas no
sean idénticas. Cuanto más tiempo pase desde el último antecesor común
más diferentes serán las secuencias.

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Reloj molecular: indica que el número de cambios en las secuencias de estas moléculas es equivalente al
tiempo transcurrido desde la divergencia de dos líneas evolutivas que comparten la molécula. Un
cronómetro molecular que permita detectar las relaciones evolutivas más amplias ha de cumplir las siguientes
condiciones:
 Debe tener una distribución universal
 No debe estar sujeto a transmisión horizontal
 Ha de poseer una constancia funcional, de modo que la presión selectiva que actúe sobre la molécula
sea mínima
 La longitud de la secuencia debe ser suficiente para que las estimaciones de semejanza tengan
validez estadística
 La tasa de cambio debe ser lo suficientemente baja como para permitir la detección de las relaciones
evolutivas lejanas
 Desde el punto de vista metodológico interesa que no sea excesivamente larga para poder aplicar
técnicas de secuenciación
El cronómetro molecular por excelencia es el ADN; sin embargo, su tasa de cambio es demasiado rápida
como para que cualquier gen pueda utilizarse como indicador de procesos de especiación.
Carl Woese, 1977: Creador de la nueva taxonomía molecular basada en la comparación entre especies de
la llamada secuencia del ARN ribosomal (ARNr) 16s y 18s que comparten todos los seres vivos del planeta
ya que apenas ha sufrido cambios desde la aparición en la Tierra de las primeras formas de vida. Además:
 Están universalmente distribuidos en todos los seres vivos
 Forman parte integral de la maquinaria de síntesis proteica
básica de toda célula viva
 Se han conservado durante el transcurso de la evolución
 Presentan una variación en la longitud de la molécula
adecuada para medir cualquier distancia filogenética

Woese identificó un grupo de procariotas lo llamó Arquea como el tercer dominio de la vida, junto con
Bacteria y Eukaria. Demostró que el análisis de las secuencias de genes de ARNr se podía usar para poner
de manifiesto relaciones evolutivas, de manera que se obtenía así la primera herramienta eficaz para la
clasificación evolutiva de microorganismos.
Este sistema de análisis filogenético reveló dos hechos evolutivos importantes:
 No todos los procariotas están estrechamente relacionados desde el punto de vista evolutivo,
 El dominio Arquea presenta una relación más próxima al dominio Eukaria que al dominio Bacteria.
o El Árbol filogenético universal está determinado por análisis comparativo de secuencias
ARNr.

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 o Hay una mayor distancia evolutiva entre un procariota del dominio Archaea y otro del
dominio Bacteria (y que a “simple vista” al microscopio pueden ser idénticos), que entre un
hongo y un elefante.
No podemos olvidar que, durante unos 2.000 millones de años, los procariotas evolucionaron ellos solos en
el planeta
Los avances en la tecnología de secuenciación del ADN han convertido la genómica en una herramienta
estándar en los análisis de filogenia microbiana. La obtención de una secuencia génica a partir de un
microorganismo aislado en el laboratorio (cultivo puro) para su identificación taxonómica es relativamente
sencillo. Para ello se siguen los siguientes pasos:
1. Aislamiento de ADN
2. Amplificación secuencia (ampliación)
3. Secuenciación del amplicón
4. Identificación de secuencia (bases de datos)
5. Identificación de la especie.
6. Análisis filogenético (alineamiento de secuencia).
Alineación de secuencias
La filogenia solo se puede inferir de genes con homología, es decir, genes que han sido heredados de un
antepasado común. Los análisis filogenéticos calculan cambios evolutivos a partir del número de
diferencias de secuencia a través de un conjunto de posiciones homólogas de nucleótidos.
Algunas mutaciones introducen inserciones o delecciones de nucleótidos, que hacen que las secuencias
génicas difieran en cuanto a su longitud, de manera que se hace necesario alinear las posiciones de los
nucleótidos antes de realizar el análisis filogenético de las secuencias génicas.
Construcción de árbol filogenético
Para deducir los árboles filogenéticos a partir de datos de secuencias moleculares hay diversos métodos
disponibles. La estructura de un árbol filogenético se suele deducir aplicando algoritmos.
FILOGENIA MOLECULAR
Rama de la filogenia que analiza las diferencias moleculares hereditarias en las secuencias de ADN, ARN y
proteínas, para obtener información sobre las relaciones evolutivas de un organismo. Relación filogenética
entre dos organismos: grado de parentesco entre ellos.
Análisis filogenético: comparación de la secuencia de bases de “cronómetro molecular”.
Se emplean aquellos genes que codifican moléculas de función universal, con un número manejable de bases
y con regiones muy “conservadas” alternadas con regiones de alta variabilidad.
Reloj molecular: gen que codifica el ARNr 16S (en eucariotas 18S): Permite establecer las relaciones
filogenéticas existentes entre los microorganismos (excluyendo virus).
Árboles filogenéticos: representación del resultado de la comparación de secuencias
NOMENCLATURA
La nomenclatura para nombrar a los organismos sigue el sistema binomial diseñado por Carl Linneo (1707-
1778); nombre del género en mayúscula y el adjetivo de la especie en minúscula
 Los nombres son en latín o en derivaciones de griego latinizado; a menudo son descriptivos de
alguna propiedad fundamental del organismo y se escriben en cursiva
 La creación de nombres nuevos debe seguir las reglas descritas en el Código Internacional de
Nomenclatura de las Bacterias
 Cuando se aísla de la naturaleza un microorganismo nuevo y se piensa que es único se debe validar
formalmente la categoría taxonómica como nuevo género o especie

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  Para ello se debe publicar una descripción detallada de las características y los rasgos distintivos del
organismo, junto con el nombre propuesto y, se ha de depositar cultivos viables del organismo en al
menos dos colecciones de cultivos internacionales
 El manuscrito con la descripción y el nombre de un nuevo taxón es sometido a la revisión de
expertos. Publicación, por ejemplo, en: Internation Journal of Systematic and Evolutionary Biology
(IJSEM)
EL ORIGEN DE LOS MICROORGANISMOS EN LA VIDA DE LA TIERRA

Estromatolitos: Fósiles microbianos más antiguos conocidos (3.700 millones de años). Comunidades
microbianas se fosilizan capa por capa formando estromatolitos.
Astrobiología: La vida es un sistema químico autosostenible capaz de experimentar evolución.
QUÍMICA PRBIÓTICA: BÚSQUEDA DE LAS RAÍCES QUÍMICAS DE LA VIDA
Teoría de Oparin-Haldane (1920): Las moléculas orgánicas podrían haberse formado a partir de compuestos
químicos inorgánicos por medio de una fuente de energía externa (por ejemplo, radiación ultravioleta). La
atmósfera tenía un fuerte carácter reductor, carecía de O2 y estaba formada por H2, CH4, NH3, CO2, y H2O.
Estos elementos gaseosos reaccionaron entre sí por procesos físico-químicos mediados por energía externa
(radiación solar, actividad eléctrica de la atmósfera) originando la síntesis prebiológica de compuestos
orgánicos en ambientes acuáticos o “caldo primitivo o sopa primordial”.
Evolución Pre-biológica: Los compuestos orgánicos sencillos (monómeros) generaron compuestos de
mayor complejidad (polímeros), que se encapsularon para originar sistemas pre-celulares.
Millones de años después se inició la evolución biológica con la aparición de las primeras células primitivas
(eubiontes) que posiblemente se parecían a las bacterias que conocemos actualmente.
1953: Miller y Urey demostraron experimentalmente la teoría de la sopa primordial en el origen de la vida
de Oparin y Haldane.
El experimento consistió, básicamente, en someter una mezcla de metano, amoníaco, hidrógeno, dióxido de
carbono, nitrógeno y vapor de agua a descargas eléctricas de 60.000 voltios, calor y luz ultravioleta. Como
resultado, se observó la formación de una serie de moléculas orgánicas, entre la que destacan ácido acético,
y los aminoácidos glicina, alanina, ácido glutámico, y ácido aspártico. Un análisis posterior (2008) identificó
20 aminoácidos y componentes de ácidos nucleicos.
HIPÓTESIS DEL MUNDO ARN
Francis Crick y Leslie Orgel: La vida en la Tierra pudo comenzar por moléculas de ARN simple capaces
de copiarse a sí mismas.
El ARN es un catalizador eficiente implicado en la síntesis de las proteínas en el ribosoma, y al igual
que el ADN posee la capacidad de almacenar información. En 2008 se demostró que los nucleótidos de ARN
podrían elaborarse a partir de moléculas muy simples que probablemente estuviesen presentes en condiciones
prebióticas.

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 Hipótesis del mundo
ARN

TEORÍA DEL MUNDO HIERRO-AZUFRE

Hipótesis acerca del origen de la vida (1992) Günter Wächtershäuser: La química primitiva de la vida ocurrió
en la superficie de minerales como la pirita (FeS2) localizadas en fuentes hidrotermales a altas presiones y
temperaturas (>100 °C).
Los depósitos minerales de sulfuro de hierro cerca de respiraderos hidrotermales de aguas profundas podrían
reaccionarían con ácido sulfhídrico para formar pirita H2S + FeS → FeS2+ H2. Los electrones liberados
en la reacción permiten que los compuestos orgánicos reaccionen unos con otros y aumenten su complejidad,
de forma que es el mineral el que proporciona la energía.

Proceso:
1. Organización espontánea de compuestos orgánicos sobre pirita: aminoácidos, ác. grasos, bases …
2. Polimerización en películas orgánicas de crecimiento quimioautótrofo (energía procedente del
mineral).
3. Desprendimiento de esferas (protocélulas).
TEORÍA DE LA PANSPERMIA MOLECULAR
Origen cósmico de la vida en la tierra: Los compuestos
orgánicos prebióticos de la vida se originaron en el espacio, y
fueron distribuidos al planeta donde luego emergió la vida. Se
conoce que el polvo interestelar consta de moléculas orgánicas.
En meteoritos se han detectado componentes de ácidos
nucleicos, y otros compuestos químicos orgánicos.

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DIVERSIFICACIÓN METABÓLICA
Litótrofos: Pueden ser: organótrofos anaerobios, metanógenos, fotótrofos anoxigénicos → oxigénicos.
Quimiolitótrofos: Utilizan la energía liberada en la oxidación de
compuestos inorgánicos (H2 inicialmente) para fijar CO2.
Organótrofos anaerobios: Emplean compuestos orgánicos como fuente
de electrones, y el aceptor final de electrones es otra sustancia distinta al
O2.
Metanogénesis: reducción del CO2 a metano
Metabolismo fotótrofo anoxigénico y oxigénico: basado en pigmentos
que permiten convertir la energía lumínica en energía química
empleando sulfuro de hidrógeno o agua como poder reductor,
respectivamente, para fijar carbono. El metabolismo fotótrofo
oxigénico es más evolucionado.

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EL ORIGEN DE LA CÉLULA EUCARIOTA
Las cianobacterias causaron la gran oxidación
El O2 fue la fuerza impulsora del origen de la célula eucariota hace unos 2.000 millones de años
La Teoría endosimbiótica seriada (1967. Lynn Margulis): Explica la aparición de la célula eucariota por
asimilación simbiótica de procariotas con habilidades diferenciadas. Según la hipótesis las mitocondrias y
los cloroplastos eucariotas se originaron a partir de procariotas (a-proteobacteria y una cianobacteria,
respectivamente) que se internalizaron en la futura célula eucariota.
Las evidencias experimentales apoyan la hipótesis endosimbiótica: tanto las mitocondrias como los
cloroplastos tienen ribosomas de tamaño procariótico (70S) y ARNr 16S.

El origen exacto de la célula eucariota sigue siendo una de las grandes preguntas sin resolver en evolución.
La teoría endosimbiótica postula que éste se encuentra en un supuesto ancestro arquea, pero su identidad y
naturaleza siguen siendo un tema de debate.
En 2015 un grupo de investigadores de la Universidad de Uppsala, Suecia, descubrió mediante metagenómica
un nuevo linaje de arqueas extremófilas denominadas Lokiarchaeota identificadas cerca de fuentes
hidrotermales que reciben el nombre del Castillo de Loki. El análisis filogenético demostró que Loki parece
ser ser el pariente más cercano de los eucariotas en el árbol de la vida.
Se identificaron genes eucariotas implicados en la remodelación de la membrana y de tráfico vesicular
indicando un incremento de complejidad celular antes de la adquisición del endosimbionte mitocondrial.
Parece que el antepasado arquea de los eucariotas tenía un citoesqueleto de actina dinámico y capacidades
potencialmente endo y/o fagocíticas, lo que habría facilitado la invaginación del progenitor mitocondria.

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Los métodos filogenéticos moleculares por sí solos son insuficientes para resolver la relación ancestral entre
arqueas y eucariotas. El ADN ambiental aislado podría tener contaminación con material genético de otros
organismos. No se podía demostrar con total seguridad que los genes de tipo eucariota realmente
pertenecieran a las arqueas
Se requiere evidencia biológica: Hay que aislar el microorganismo y estudiarlo exhaustivamente, además
de confirmar el análisis metagenómico. Recientemente, se han descubierto otras arqueas relacionadas con
Loki, que se nombraron en honor a otros dioses nórdicos (Thor, Heimdall y Odin): Asgardarchaeota o arqueas
Asgard.
Todos ellos contienen una gran cantidad de genes 'eucarióticos’, reforzando la idea de que los eucariotas
tienen un ancestro arcaico y que estos ancestros quizás estaban "preparados" para volverse complejos Las
arqueas Asgard son reticentes al crecimiento en cultivo (extremófilos).
La primera especie cultivada se extrajo del sedimento marino en la fosa de Nankai (Japón) a 2500 metros de
profundidad y a una temperatura de dos grados. El equipo dirigido por Hiroyuki Imachi, de la Agencia de
Japón para la Ciencia y Tecnología de la Tierra Marina ha conseguido, tras 12 años de investigación, cultivar
este tipo de arqueas en el laboratorio
Logran crecer en cultivo al arquea Prometheoarchaeum syntrophicum en honor a Prometeo, quien creó a los
humanos del barro. Es un microorganismo anaeróbico de crecimiento extremadamente lento (14-25 dias),
tentaculado, maximizando la superficie de contacto con el medio externo. Crece en consorcios sintróficos
con quien intercambia H2 por aminoácidos y péptidos.
La sintrofía puede explicar el origen de la célula eucariota:
Hipótesis para la eucariogénesis
Se especula que emplearían los tentáculos para capturar las bacterias
de las que obtienen los sustratos que necesitan para sobrevivir. Esto
habría dado lugar a una simbiosis mucho más íntima entre los
microorganismos. Estas bacterias pasaron a vivir en el interior de la
propia arquea, formando las actuales mitocondrias.
EVOLUCIÓN CELULAR
Lynn Margulis: Teoría de la Evolución por Endosimbiosis
Seriada.
 Explica el origen de la célula eucariota por endosimibiosis entre arqueas y bacterias.
 Margulis sostenía que:
o Los eucariotas evolucionaron hasta originar organismos superiores por adquisición seriada de
genomas procedentes de bacterias simbiontes.
LA EVOLUCIÓN POR FUSIÓN DE GENOMAS
Gracias a la técnica de hibridación con sondas de ADN bacteriano se descubren sin cesar bacterias
endosimbiontes en células de vertebrados e invertebrados. Se localizan bacterias simbiontes en células de
embriones, larvas, en ovocitos y en núcleos de espermátidas (genes del endosimbionte pasan a la
descendencia del hospedador) Genes del simbionte bacteriano son detectados en el cromosoma X de su
hospedador.

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MICROBIOTA SIMBIONTE
En el cuerpo humano podemos encontrar microbiota:

Las primeras bacterias, evolucionaron durante 2300 millones de años hasta originar las primeras células
eucariotas que siguieron evolucionando 800 millones de años más hasta originar organismos superiores.
ESTRUCTURAS BACTERIANAS PLURICELULARES
Los microorganismos son organismos unicelulares que se dividen por fisión binaria y con un estilo de vida
solitario. Sin embargo, en la naturaleza es muy poco probable encontrar microorganismos aislados. El
crecimiento en grupo:
 Limita su movilidad
 Les confiere una menor flotabilidad en ambientes acuosos
 Incrementa la competencia por recursos.
Se organizan en estructuras pluricelulares que NO son tejidos

Beneficios a los organismos que acceden a través del crecimiento grupal

 El incremento de tamaño confiere mayor resistencia ante depredadores
o Flectobacillus puede ante la presencia de amenazas:
 Asociarse en grupos
 Desarrollar crecimiento en racimos
 Adoptar un crecimiento filamentoso
 Cacpacidad de crecer o sobrevivir en ambientes de baja disponibilidad de nutrientes
o Myxobacteria xanthus cuando hay escasez:
 Se agrupa y desenvuelve cuerpos fructíferos
 Facilita la alimentación predatoria pues aumentan la concentración de enzimas
segregadas extracelularmente.

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BIOFILM
Biofilm: Comunidades de microorganismos que crecen embebidos en una matriz de exopolisacáridos y
adheridos a una superficie inerte o un tejido vivo. Es una estructura multicelular que genera un ecosistema
microbiano:
 Organizada en mono o multicapas (tapetes microbianos: 1000μm)
 Compleja en cuanto a sus características funcionales y estructurales
 Se adhiere a todo tipo de un sustrato: sólido o líquido, mineral, animal o vegetal
 Conviven una o varias especies (aerobias, anaerobias, litótrofas, fotótrofas y organótrofas
MATRIZ DE BIOFILM
Formado por EPS, proteínas y ADN
 Da cohesión al biofilm: mucosidad-elásticidad (difícil de disgregar)
 Atrapa arcillas y otros minerales que aumentan su consistencia.
 Con canales (originados por el “pastoreo” de animales microscópicos) que distribuyen agua-oxígeno-
nutrientes/eliminan desechos
EPS: 50-90% de la estructura
 Diferente para cada especie bacteriana (algnatos, polisacáridos, ricos en glucosa…)
Microorganismos: Comunidades “exosimbiontes” con diversas interacciones fisiológicas y metabólicas.
 Estratificadas: distribución espacial según el tipo metabólico
o Internas: anaerobias consumen metabolitos producidos por las poblaciones más externas
(aerobias y fotótrofas)
Formación de biofilm (mediado por QS)
1. Aproximación al sustrato, pérdida de flagelos y desarrollo de fimbrias, cápsulas.
2. Formación de micro-colonias productoras de EPS
3. Incorporación progresiva de arcillas y nutrientes, y de distintas especies microbianas
Disgregación del Biofilm
Factores ambientales (Ej. disminución de nutrientes) provocan síntesis de las enzimas que degradan la matriz
de EPS (proceso mediado por QS). Las células se diseminan, desarrollan flagelos y generan un nuevo biofilm
en otras zonas.
Ventajas del biofilm
 Generan microambientes independientes del ambiente externo, creando condiciones favorables en
ambientes habitualmente hostiles:
o Los tóxicos difunden con dificultad en el biofilm: las bacterias más externas los degradan
antes de que afecten al resto Patógenos: evaden antibióticos y defensas del hospedador
(fagocitosis por macrófagos)
 Mejoran el acceso-disponibilidad de nutrientes (Ej: simbiontes de plantas y animales)
 La matriz de EPS almacena reservas de nutrientes (ej. Biofilm sobre superficies inertes)
 Evita arrastres por corrientes fuertes (ej. En rocas de zonas intermareales)
 Facilitan la cooperación metabólica y los mecanismos de intercambio de genes

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