SP-6: 18/09/23

SP-6
En las secuencias de los operones ribosomales de E. coli y de la bacteria seleccionada:
a) Determinar el número y la organización de los genes.
b) Detectar los ARN de transferencia (tRNA).
c) Determinar la región de los promotores y terminadores.

Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655

NC_000913.3

1. Registrar el número de operones ribosomales y la banda de DNA que los codifica

2. Elegir un operón ribosomal codificado en la banda positiva y otro en la banda negativa y

determinar el orden secuencial de los genes del operón ribosomal
3. Seleccionar un operón ribosomal codificado en la banda positiva:
Delimitar la posición de la región de la unidad transcripcional policistrónica
Determinar la posición de la región de los promotores y terminadores
Detectar los promotores (P1 y P2)
https://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html
Detectar los terminadores (T1 y T2)
http://rssf.i2bc.paris-saclay.fr/toolbox/arnold/
Identificar los RNA de transferencia, el anticodón y confirmar su estructura característica.
http://trna.ucsc.edu/tRNAscan-SE/

Tarea para estudiantes

Bacterias asignadas
Acinetobacter baumannii Strain VB2486 NZ_CP050403.1
Aeromonas hydrophila Strain KAM330 NZ_AP023398.1

1. Registrar el número de operones ribosomales y la banda de DNA que los codifica

"16S ribosomal RNA"
2. Elegir un operón ribosomal codificado en la banda positiva y otro en la banda negativa y
determinar el orden secuencial de los genes del operón ribosomal
3. Seleccionar un operón ribosomal codificado en la banda positiva o negativa:
Delimitar la posición de la región de la unidad transcripcional policistrónica
Determinar la posición de la región de los promotores y terminadores
Identificar los RNA de transferencia y el anticodón