CUESTIONARIO TEMA DEL EXAMEN DE LA UNIDAD II

Vzquez Glvez Karla Majoggani Ing. Bioqumica Sntesis de pirimidinas 11-abril-2011

1. Cules son los ribonucletidos de las pirimidinas, descrbalos e indique cual es el nombre tcnico (nomenclatura correcta)? Los ribonucleotidos formados en la sntesis de pirimidinas son el UTP y el CTP El UTP (uridina 5 monofosfato) El ctp (citidina 5-TRIFOSFATO) 2. Describe la ruta de la sntesis de novo del CTP y UTP. La sntesis de las pirimidinas es menos compleja que la de las purinas, puesto que la base es mucho ms simple. La primera base terminada se deriva a partir de una mol de glutamina, una mol de ATP y una mol de CO2(que forman carbamoil fosfato) y una mol de aspartato. Una mol adicional de glutamina y ATP son requeridas en la conversin de UTP a CTP. La va de la biosntesis de pirimidina esta diagramada abajo. El carbamoil fosfato usado para la sntesis del nucletido de pirimidina se deriva de la glutamina y del bicarbonato, dentro del citosol, contrariamente al carbamoil fosfato del ciclo de la urea que se deriva del amonaco y del bicarbonato en la mitocondria. La reaccin del ciclo de la urea es catalizada por la carbamoil fosfato sintetasa I (CPS-I) mientras que el precursor del nucletido de pirimidina es sintetizado por la CPS-II. El carbamoil fosfato es entonces condensado con el aspartato en una reaccin catalizada por la enzima limitante de la biosntesis del nucletido de pirimidina, la aspartato transcarbamoilasa (ATCasa).

Sntesis de fosfato por carbamoil CPS II

Enzima nombres: 1. aspartato transcarbamoylase, ATCase 2. carbamoil aspartato deshidratasis

3. dihidroorotato deshidrogenasa 4. orotato phosphoribosyltransferase 5. orotidine-5'-fosfato carboxilasa Sntesis de la UMP de carbamoil fosfato. Carbamoyl de fosfato en utilizan pirimidina sntesis de nucletidos difiere de la que sintetiza en el ciclo de la urea, es sintetizados a partir de glutamina en lugar de amoniaco y se sintetiza en el citosol. La reaccin es catalizada por carbamoil fosfato sintetasa II (CPS-II). Posteriormente carbamoil fosfato se incorpora en la pirimidina va de la biosntesis de nucletidos a travs de la accin de la aspartato transcarbamoylase, ATCase (enzima # 1) que es la limitacin de velocidad en el paso pirimidina biosntesis. Tras la finalizacin de la UMP de sntesis se puede fosforilados a la UTP y utilizado como un sustrato para la CTP sintasa de la sntesis de la CTP. Uridina nucletidos son tambin los precursores de de novo de sntesis la timina nucletidos. La sntesis de pirimidina difiere de dos maneras significativas de la sntesis de purinas. Primero, la estructura de anillo est configurada como una base libre, que no se construye encima de PRPP. El PRPP es agregado a la primera base completamente formada de pirimidina (cido ortico), formando el orotato monofosfato (OMP), que es posteriormente decarboxilado a UMP. Segundo, no hay ramificacin en la va de la sntesis de pirimidina. El UMP es fosforilado dos veces para producir UTP (el ATP es el donante de fosfato). La primera fosforilacin es catalizada por la uridilato cinasa y el segundo por la nuclesido difosfato cinasa que ubicuita. Finalmente el UTP es aminado por la accin de la CTP sintasa, generando CTP. Los nucletidos de timina son a su vez derivados por la sntesis de novodesde dUMP o mediante vas de salvamento a partir de la deoxiuridina o deoxitinidina.

3.-Qu importancia tiene la enzima aspartato transcarbamilasa en la sntesis del UTP y CTP? La importancia de la aspartato La unin de la parte a amina del asparatato y el carbomil fosfato La formacin del anillo de las pirimidinas Tiene tres sitios activos

4.-Explique en que consiste la regulacin por retroinhibicion en la biosntesis de la pirimidinas en UTP y CTP. La regulacin de la sntesis de pirimidina ocurre principalmente en el primer paso que es catalizado por la aspartato transcarbamoilasa, ATCasa. Inhibido por el CTP y activado por el ATP, la ATCasa es una protena multifuncional en las clulas de mamferos. Es capaz de catalizar la formacin de carbamoil fosfato, carbamoil aspartato, y dihidroorotato. La actividad de la carbamoil sintetasa de este complejo es llamada carbamoil fosfato sintetasa II (CPS-II) contrariamente a la CPS-I, que est involucrada en el ciclo de la urea. La ATCasa, y por lo tanto la actividad de la CPS-II, es localizada en el citoplasma y prefiere glutamina como substrato. La CPS-I del ciclo de la urea se localiza en la mitocondria y utiliza el amonaco. El dominio CPS-II es activado por el ATP e inhibido por UDP, UTP, dUTP, y CTP.

El papel de la glicina en la regulacin de la ATCasa es actuar como inhibidor competitivo del sitio de enlace de la glutamina. Como en la regulacin de la sntesis de purina, los niveles de ATP tambin regulan la biosntesis de pirimidina en el nivel de formacin de la PRPP. Un incremento en el nivel de PRPP da lugar a una activacin de la sntesis de pirimidina. Hay tambin regulacin de OMP decarboxilasa: esta enzima es inhibida competitivamente por el UMP y, a un menor grado, por el CMP. Finalmente, la CTP sintasa es inhibida por el CTP y activada por el GTP. 4.- Explique como se forma timirilato Sntesis de los Nucletidos de Timina La va de la sntesis de novo de dTTP primero requiere del uso de dUMP del metabolismo de cualquier UDP o CDP. El dUMP es convertido a dTMP por la accin de la timidilato sintasa. El grupo metl (recuerda que la timina es 5-metil uracil) es donado por N5,N10-metileno-THF, similar a la donacin de los grupos metilos durante la

biosntesis de las purinas. La nica propiedad de la accin de la timidilato sintasa es que el THF es convertido a dihidrofolato (DHF), la nica reaccin que produce DHF a partir de THF. Para que la reaccin de la timidilato sintasa continue, el THF debe ser regenerado desde DHF. Esto se logra a travs de la accin de la dihidrofolato reductasa

(DHFR). El THF entonces es convertido a N5,N10-THF por la accin de la serina hidroximetil transferasa. El papel crucial de la DHFR en la biosntesis del nucletido de timidina le hace un blanco ideal para los agentes quimioteraputicos (vase abajo). 5.- Investigue qu consecuencias puede traer la ausencia de enzimas, sustratos o cofactores en la biosntesis o degradacin de los nucletidos Significado Clnico del Metabolismo de Purina Los problemas clnicos asociados al metabolismo del nucletido en humanos son predominantemente el resultado del catabolismo anormal de las purinas. Las consecuencias clnicas del metabolismo anormal de purina se extienden de desordenes medios a severos e incluso fatales. Las manifestaciones clnicas del catabolismo anormal de purina se presentan desde la insolubilidad del producto derivado de la degradacin, cido rico. La Gota es una condicin que resulta de la precipitacin del urato como cristales monosdicos de urato (MSU) o de dihidrato pirofosfato de calcio (CPPD) en el lquido sinovial de las articulaciones, conduciendo a inflamacin severa y a artritis. La respuesta inflamatoria se debe a la reaccin de los cristales con un sistema inflamatorio lo que resulta en la produccin de interleucina-1 (IL-1) y IL-18. La mayora de las formas de gota son el resultado del exceso en la produccin de purina y del catabolismo consiguiente o, a una deficiencia parcial en de la enzima de salvamento, HGPRT. La

mayora de las formas de gota pueden ser tratadas administrando el antimetabolito: alopurinol. Este compuesto es un anlogo estructural de la hipoxantina que inhibe fuertemente la xantina oxidasa. Dos desrdenes severos, ambos absolutamente bien descritos, estn asociados con defectos en el metabolismo de purina: El Sndrome de Lesch-Nyhan y la enfermedad de inmunodeficiencia severa combinada(SCID). El sndrome de Lesch-Nyhan resulta de la prdida del gen HGPRT funcional. El desorden es heredado como rasgo ligado al sexo, con el gen HGPRT en el cromosoma X (Xq26q27.2). Los pacientes con este defecto exhiben no slo sntomas severos de gota sino tambin un severo malfuncionamiento del sistema nervioso. En los casos ms severos, los pacientes recurren a la auto mutilacin. La muerte generalmente ocurre antes que los pacientes alcancen su vigsimo ao. La SCID es ms frecuentemente causada (90%) por una deficiencia en la enzima adenosin deaminasa (ADA). sta es la enzima responsable de convertir la adenosina a la inosina en el catabolismo de las purinas. Esta deficiencia conduce selectivamente a una destruccin de los linfocitos B y T, las clulas que sientan las bases de las respuestas inmunes. En ausencia de ADA, la deoxiadenosina es fosforilada para producir niveles de dATP que son 50 veces ms altos que lo normal. Los niveles son especialmente altos en los linfocitos, que tienen cantidades abundantes de enzimas de salvamento, incluyendo nucleosidocinasas. Las altas concentraciones de dATP inhiben la ribonucletido reductasa (vase abajo), de tal modo que evita que otros dNTPs sean producidos. El efecto neto es de inhibir la sntesis de DNA. Puesto que los linfocitos pueden ser capaces de proliferarse dramticamente en respuesta al reto antignico, la inhabilidad para sintetizar DNA deteriora seriamente las respuestas inmunes, y la enfermedad es generalmente fatal en la infancia a menos que se tomen especiales medidas protectoras. Una inmunodeficiencia menos severa resulta cuando hay una carencia de purina nucletido fosforilasa (PNP), otra enzima degradante de purina. Una de las muchas enfermedades de almacenamiento de glicgeno la enfermedad de von Gierke tambin conduce a la produccin excesiva de cido rico. Este desorden resulta de una deficiencia en la actividad de la glucosa 6-fosfatasa. El incremento en la disponibilidad de glucosa-6-fosfato aumenta el rango del fluido a travs de la va de la pentosa fosfato, produciendo una elevacin en el nivel de ribosa-5-fosfato y por lo tanto de PRPP. Los incrementos en PRPP entonces resultan en exceso de la biosntesis de purina. Trastornos del Metabolismo de Purina Desorden Defecto Naturaleza defecto del Comentarios

Gota

Tres defectos enzimticos diferentes pueden llevar a la Gota: actividad

hiperuricemia

PRPP sintetasa incrementada a HGPRT deficiencia Glucosa-6 fosfatasa deficiencia Sndrome de LeschHGPRT Nyhan SCID ADAb Ausencia de la vea arriba enzima Ausencia de la vea arriba enzima Ausencia de la vea arriba enzima Ausencia de la 2,8-dihidroxiadenina, enzima litiasis renal Ausencia de la hypouricemia xantina y enzima litiasis renal deficiencia de la vea arriba enzima

Inmunodeficiencia

PNPc

Litiasis renal

APRTd

Xantinuria

Xantina oxidasa

Enfermedad de von Glucosa-6-fosfatasa Gierke

a b

hipoxantina-guanina fosforibosiltransferasa adenosina deaminasa c purina nucletido fosforilasa d adenosina fosforibosiltransferasa

Significado Clnico del Metabolismo de Pirimidina Porque los productos del catabolismo de pirimidina son solubles, pocos desrdenes resultan del exceso en los niveles de sntesis o catabolismo. Dos desrdenes heredados que afectan la biosntesis de pirimidina son el resultado de deficiencias en la enzima bifuncional que cataliza los dos ltimos pasos de la sntesis de UMP, orotato fosforibosil transferasa y OMP decarboxilasa. Estas deficiencias resultan en aciduria ortica que causa retardo en el crecimiento, y anemia severa causada por eritrocitos hipocrmicos y la mdula megaloblstica. La leucopenia es tambin comn en acidurias orticas. Los desrdenes pueden ser tratados con uridina y/o citidina, que conducen al incremento en la produccin de UMP por medio de la accin de las nucleosido cinasas. El UMP entonces inhibe la CPS-II, atenuando as la produccin de cido ortico.

Desrdenes del Metabolismo de Pirimidina Desorden Aciduria tipo I Aciduria tipo II Enzima defectuosa Comentarios

Ortica, Orotato fosforibosil transferasa vea arriba y OMP decarboxilasa Ortica, OMP decarboxilasa vea arriba

Ortico aciduria debido a El incremento de la carbamoil la enzima del ciclo de la urea, ladeficiencia de OTC fosfato mitocondrial sale y aumenta ornitina transcarbamoilasa, es (moderada, sin la biosntesis de pirimidina; deficiente componente encefalopata heptica hematolgico) transaminasa, afecta la funcin Aciduria - del ciclo de la urea durante la benigno, frecuente en Orientales aminoisobutirica deaminacin de -amino cidos a -cetocidos el tratamiento con allopurinol y 6azauridina causan aciduria ortica sin componente hematolgico; sus subproductos catablicos inhiben la OMP decarboxilasa

aciduria ortica OMP decarboxilasa inducida por drogas