ENZIMAS 6.1 Introduceién a los enzimas 191 6.2. 4Cémo funcionan los enzimas? 193 6:3 La cinética enzimética como método para comprender el mecanismo 202 6.4 Ejemplos de reacciones enziméticas 213 6.5 Eneimas reguladores 225 Esta condiciGn podria cumplirse si, cuando las motéculas ‘se combinaran con un enzima, se encontraran @ una Sistancia un poco mayor (que aquella a la que se encuentran cuando estén unidas covalentemente), pero ‘mis cerca que ou distancia de equilbrio euande se ‘encuentran libres... Usando el simil de Fisher de la llave la cerradura, la lave na encaja perfectamente en la eerradura sino que ejerce una cierta tensién sobre ella. J.B. S, Haldane, Enzymes, 1930 La catélisis de puede descstir formaimente come fa estabilizacién del estado de transicién mediante la unién fuerte del catalizador. —Witiam P Jencks, articule en Advances in Eneymolagy, 1975 ‘xisven dos condiciones fundamentales para la vida. ina, i entidad viva ha de poder autorreplicarse Cun tem consi- derado en la Parte Il de este tito); ros, el organismo ha de poder catallzar reacciones quimicas eficiente 9 selectiva- ment. La importancia contra de la catdiss puede sorprender A algunos estidiantes principlantes en et estudio de la biogui lea, pero es fei de hustear. Como se ha desert en el Capi- tullo 1, los sistemas vivos utiizan la energia de su entorno, Muchos de nasotros, por ejemplo, curmuaniinos. cantidades sustanciales de sacarosa —articar de mesa comin como in tipo de combustible, ya sea en forma de aliments y bebidas ddulees 0 como aziear propiamente dicho. La corwersin de Ea 190 Capitulo sacarvss en GOy y yV en presencia de oxigend e5 un proceso sltamente exergénico, que lera enengia libre que podenos utilizar para pensar, mevernos, saborear y ver, Sin embargo, se puede almacenar na bolsa de sacar durante ais sin que s- fra ninguna trinsformacién obvia a COs HO. Siendo este Proceso quimico termodindmicamente favorable, es, se ern- hargo, guy lento? Aun as, cuando un ser human (o cai cual- ‘aur are organisms) catekaiee sacar ke energla quien 9¢ iberaen seguncios. La diferencia ests ela cats. Sin cat sig, as Yeapciones quimieas que, como a de bs oxida de la s1carosa, son nersearias para muatener Ia vida, no podrian arse en una escala de tiempo eanveniente En este capitnio dirigimos nuestra teneiin hacia los ca- tallzadores de las reacciones en los sistemas boldgleos: los errimas, hs peoteinas mas extraordnariae y de mayor eapeein- lizacion. Los encamas tienen un gran poder cataitien, a meno Imuy 5uperioral de los catalizasones sintétios 0 inorgaco Posen un elevado grado de especificidad respecto x sus sus: trates, aceleran espectaculrmente las reacciones quimicas es pesifcas y furcionan en soluciones acuosas en conuciones riuy saves de temperstura y pH. Hay poces catalizadones n0 bioldgicos que tengan todas estas propiedades. Los enzimas estan en el centro de todos las proceso biogul: rilkos, Actuando en secuencias organizalas colin cientos do reaceiones consecuiivas en las que se degradan moléculas de nutrientes, se conserva y transforin la energsquimica y se fabnean las macromoléeulasbiokigieas a partir de peecursores sencilo. A través de in ace de fos enalmas regulators los sistemus enn dticas se enontinan de un modo my efi per ‘iterdo ua integra arrnoniosa dela multitud de set ‘des metabelica diferentes que son necesaras para la ven. “estudio de ls enzimas también tiene uaa importancta bictca inmensa, Bn alguras enfermeddes, especialmente en Jas que son gentticamente heredables, puede baber una de lencia, 0 ineiuso una ausencia total, de-uno o més enzimas. ‘También se pueden producir situaciones anormales por la ac- Alvided excesiva de un enna especifiea, La meticion de la actividad enzimdtica en ol plasma sanguineo, eritrecitos @ muvestras de tejiclo son importantes en el diagnostic de enfer- medades. Muchos firmacos ejercen sun efectos bloligicos atewvea Interac con enrimas. Los eniras sehan con ‘vertdo en herramentas prctcas importantes, no so en me- dicta sino tmbiea en a industria quimica, en el tratamiento diel aliments y on a agiculturn capitulo empieza con la descripesn ale la propicdades de los enzimas los peincipios fundamentales de poder co- talc. Sigue uns intact enetiea ena, diel- phina que proporciona gran parte tot mareo necesario para Crunlquie dseusion sobre fos eeazuas. Se ean seuidamente algznos efemplas de meeanismas erzimitiens que iste kos prinehins introdueidas preciatnents en el capitulo, Acabaros con ura discus, solire los entinas reguladores, 6.1 Introduccién a los enzimas Gean parte de la historia de la bloqulimica es la historia de la lvestigactén sole os enim. Las eatalizacores binkigicos se reconotieron y fueron descritos por primera vex a finales det sig xv, en estutios sobre la digestiin de la carne por ae ereciones del estomayg: lt irvestigzaclon continuo a prineiping del siglo xis examinando la conversion ce sbmidin en aevicar por la sally diversos extractos vegotales, Hacka 1880 Louis ‘Pasteur tego a er tonciuston de que latermeriacion det acar ‘alcotol por be tevadhira estaba catalizada poc “fermentos” Pesta que tales ferment son inseparahies re Ta estructura de las e@luias cle levarura vivas; este punto de visea, derma radio vitalismo, se mantuve durante décadas. BI deseubr- rmiento de Eehuard Buchner en 1807 de que los extracton le Jevadura pueden fermentar el azsicar a alcohol demostro que Jas moléewla que intervienen sn ta farmentactén pusden con timuar funcionando cuando se separan ile fa estructura de bas cedllas vivas. Fredevick W. Kine denomind estas moléeulas ‘enzimias, Al rechazarse las nociones vitalistaa de Ia vida, Aislaniento de risevos eruimas y lainvestigactén de sus pro- iiedades permiti6 el avance de la eiencia bloqutmica. 1 absiamiento y cristalizacion de la ureasa por James ‘Sumner en 1826 proporeions un gran impuiso a los primeros estiadios sobre los engimae. Sumner haillé que los eristales de urease consiatian exelusivanente en proteina y pastulé que tortor loss enaimas son proteinas, A falta ce otros ejemplos esta idea fue discutida durante aigin tiempo. La conclusion de Sumner silo se acepio ampliamente exmilo ma tarde, en Ba icacia ce 1990, Joh North op y Moses Kunitz cristaezaron in pepsina, ln tipsy utes eran dgeivesy ell mt que tarnbidn ena protelnas. Durante este pe rao, J. i 8. Haktane eseribis un tratacl de- nnominado “Enzimas"- Aunque atin-no estaba lara la naturaieza molecular de tos enzimas, este libro eortenia ix notable sugerencia de .qUé as Interacciones por endices bile entre el ercima y su sustrato podrian ser utlizadas ‘para-catalizar ia reaecién. Esta briante idea (stiem el centro de miestro eonecimiento ac tual sobre la cataisis enasmitca uae Hache, toe0-1917 GL Inwoduecivina tos anzimas 198 La investignelsin sobre les enimas ha sido muy intern desde la tia parte del siglo xx. Bsto ha comcucido ala pus riffeacidn de millares de enaimas, a Ia elueidaciin de Ia. ex- tructura y mecanismo quimico de muchos de elles y a un cconocimiento general sobre su mado de accién, La mayoria de enzimas son proteinas Can ta exnepeton ds un pequenio prupo de moléenlas de RNA catalitico (Capitulo 26), todo los enizimas son proteins. Si actividad catalitica cepencie dela integriad ale su confor ‘6m proteica nativa, Sise desnaturala o dsuéla un enaima en, sus subunidades, se suele perder la actividad catalitica. Si se descompone: un enzima en sus aminodcidas eonstatuyentes, sslempre se destruye su actividad cataitica. Af, la estructuras primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria de hue protetinas ‘enzimiticas son esenciales para su nctivided cataitien Los enzimias, al igual que oteas proteinas, tienen masas rmolerulares relativas que van descle unos. 12.000 hasta mas de 1 milton. Algunos entdimas no requieren para su actividad mis grupos: quimlens que sus resituos aminodeidas. Otros requie Fen wh companente quimico adicional Usmado eofaetor. El Cofactor puede ser uno o varias iones inorganieos tales eon Beh Mg! Me™ o Zac* (Tabb 8-1) o unm molécula onginica cut Citacromo avidiasa Fat? oFe®* —Citocmmo anda, catalasa, parodia « Plavate quioasa Ne ‘Heanquinasa, giucosa 6-fosfatasa, Dirwato quinasa a Arginasa, bonucletida reductasa No Dintsogenasa ner Ureasa Se, Glutation peroidasa zn ‘Garpdnion annigrasa, ateonat deshidrogenasa, caoripeptidasas Aye Bimes Sure, 887-1953, 1B 5. Haldane, 992-198192 Caniio Enemas TABLA 6-2 Algunos coenzimas que actian coma oortador res transitorios de dtomos o grupos funcionales Coenzima Gjemplos de gripos quimicos transteridos Precursor en la dicta para las mamiferos Biocitina co, Biotina Coenzima A Grupos acllo ‘Acido pantoténico y otras moldculas 5/-Desoxiadenasilcobalamina ‘toma de H y grupos aiquilo Vitamin 8, (coensima By2) Flavina adenina dinuciedtida Flecamnes ibotlavina (itarina 8) Upoato Eectrones y grupos acilo. ‘No se requiere en la deta Nicotinamida adenina dinucledtida fon hdrura (H™) ‘Acido nicatnion(niacina) Piridoralfosfato Grupes amino Firidoxina (vtamina 8) Tewahidofotato Grupos monocarbonados Folate Tismina piratostato Aldehidos Tiemina (vitamina By) some ode en deters esrb Pa ee ‘ometaloorginéea complejs denominaela eoamzima (Tibia 6-2), Algunos enzinas requieren tayo un ener eomne ua om jones metaicos para su actividad, Un eoeraima o jon metalico ‘unido covalentemente 0 de manera muy fuerte 2 la progesna cenrimética se denomins grupo prostétieo. {in erima cote pleto catalfticamente active junto con su coerzima yia jones ‘metalions se derartins Moloemzima. La parte proteica de tal ‘encima se denomiina apaenzima apoproteina. Los cnerz- ‘mas achlan como transpartadores transitorias de grupos fun ionales especifices. La mayuria de ellos son iterivandos de las vilarunas, nalsientes orginiens requeridos en pequefias cant dares en la diets, Los eoorimas se considerarin més detalis. damente a medida que se encuentren en la discusién de ls tas iets en ls Purl Hale ete Mono. Finalmente aig "nog enzimas son modificados covalentemente por fosforaciin, slucosilzeién y otros procesas, Gran patte de estas alteraciones intervienen en la regulacion dela actividad enzimnstica Los enzimas se clasifican segin las reacciones que catalizan ‘Muchos evcimas se han bautizado aftaciendo el ufijo “asa” al ‘hombre de su sustrato 2 wna palabra o frase que describe su actividad. sf ta useasa catalina Sa hrs dela urea y Ia DNA, polimerssa cataliza la polimerizacién de nucle6tidos en la sin TABLA 6-3 Clasificacién internacional de los enzimas, tesis del DNA. Otros ensimas reeibieron nombres may genera: Jes, antes de que se supiera cusl era 0 reacelén especifica. Por ejemplo, un enzima que aetasba en Indigestion de la eo tmida se Ham6 pepsina, sel grlego pepe, “digestion”, ye lsc ima recibié su nombte par su eapsciclad de lisar hue parades ‘celulares bacterianas, Otros recibieron el namie en virtud de 5 origen 0 €l modo como se obtuvieron: la teipsina, que Teck ‘big su nombre del griego tryen, “desgastar”, se obtuvo fra- tando telido paneredtico con glicerina, A veces el mistvo ‘eizina tiene ds o mas nombres, o dos enzimas diferentes tie- nen el mismo nombre: Debido a tales ambiguedades y al m= ‘mero constantemente ereciente de enzimas descubiertos, s¢ ha adoptado por acuerdo internacional un sistema de nomen clarura y clasifcacion de los enamas, tste sistema cistribuye {os enzimas en seis claves principales, cada una de ellas con di ferentes subclases, segin ol tipo de reacciin catalizadn (Tabla 6-3). A cada enaima se le asigna un ndimero clasificatorio de ‘cuatro apartados y un nombe sistemético que identifica la Accién catalizada. Por ejemplo, el nombre sistomatico formal del en2ima que eataliza In reacelon, ATP + nygiuensa —+ ADP: + n-glucosis 6-fosfato sla ATP:glucosa fosfotransforasa, Jo que inelea que entaliea latransferencia de-un grupo fosfato del ATP aa gueoes, Enh ‘mero de clasficarion de este eraima (rulmero E.C., por Braye No Base Tipo de reaccién atalizeda 1 Gridoreductasas _Tansferencia de elecrones (ions hidrura 0 Stomos de H) 2 Wansterssas ‘Rescciones de wanslorencia de grupos 3 Hicrolasas ‘Reaceiones de hidroisis (ransferencia dle guupes funcionales al agua) 4 asas ‘Aii6n de grupos a dobies enlatas, 0 formacién de dobles eflaces por eliinacidn de gupos 5 Isomerasas “Tansferencia de grupos deni de motéculas dando formas isomércas 6 Ugasas FFormaci6n de enlaces C—C, CS, C—O y CN mediante resceiones de condensacién _acopladas a la rotura de ATP ea: rer ris cat ee de cs, mo 0 ue sa. 1 tcp ni dick y nse ein fe ems ante, wp Se ass stan 19 pure reat‘Conunission) es 2.7.1.1. Bl primer digo (23 denota of nome dle la elase (Iransferasa); el segundo digit. (7), a subelase (fosfotransterasa); el tercer digita (E), wna fosfotransferasa Com un grupa hidroxilo-camo aceptor; el custo digito (1, 0 shieosa come aceptor del geune foetao. Ba maichos casos se thliza un nombre seneillo ce uso mas eormin (en este ¢as0 hexoqilnasa), La hate y a descripesin completa de log mules de erisinas coneidos s¢ naitenen acta por el Comite de Nomenclatara ce ta International Union of Biochemistry and Maleciay Biology (www: elem. acsukubmbyensy/e) Bate capitulo se dedica mayotitariamente a los prineipios y ‘eopiedasies comues toxios is enzimas RESUMEN 6.1 introduccidn a los enzimas La vida depende de In existencia de catalizadores ppadercsus y espectieos: log erimas. Prictiesmente ‘nas las reacciones hioquimnicas son catalizadas por ‘un enima. 1m Coma excepeidn de tin procas mols ele RNA ‘cataiftco, todos fos enzias conocido son protetnas. Muchas necesitan comnrimas no proteieas ofactones para desempefar su accién calalitica ‘8 Los enadimas se clasifiean de-aeuerdo con el tino de reascién que catalizan. Thos los engirnas tienen, ‘ndmeras y nombres formales col sistema B.C. la mayoria tienen tambiert nombres sencills: 6.2 Como funcionan los enzimas? La cate eruimética de las reactiones es esenedal para los sistemas vives. Hn condiciones biologicas, les reacciones no catalandas tiawlen a ser lentas. La mayeris de moléeulas bio- \igicas san muy estables al pid newira, la temperatura suave y el ambient acuoso presente ene) interior de las celta Auden, tuchas eeauciones bloguinicas comunes implica procesas quimieas que son tlesfavorables a poco probabies en el ambiente colular, tales eomo la formacién teansitoria de Intermediarios eargados inestables.o la colisiém de clot 0 mas moléculay con la orientacién precisa requerida para la reac: ‘ifn. Las reacclones necesaras pura digentr los alimentos, er= var geftalee nerviosas 0 cnntraer el musculo no se dan a una vyolocidiad dit sin ental ‘Un emma soluciona estos problemas al proporclonar un umblente espectfico dentro del cual una resceifn etermnada puede transcurrir a mayor velocidad, El msgo distintivo de tuna renecidn eatatizuda enzimaticamente es quo tiene lugar dentro de los confines de una bolsa del enaina denominada si- tio activo (Pig. 6-1). La motécula Maca en el sitio active y sobre ba que setts #] enmina se dencraina ewstrata, La super. dHcie Wet suite acuvo del enmama esta revestusta. Con residuos sninoscidos cuyos grupas sustituyentes se unen al sustralo y ‘atalizan la transformacion quires, A menudo, stia neti ccubre al sustrate y lo secuestra completamente de la slucién, Bi comple erainna-sustrato, cuya existenia fue propuesta FIGURA 6-1 Fjacldn de un sustate al sto activa de ene. Se ruesraelenzina quiresripsina unio a un sustate a roja (PDB 1D 7GCH). Algunos aminoscidos clave del shi activo se rueran Com tuna mane rojs en lx supercede! enzins, por primera yea por Charles- Adolphe Wartz-en 1880, es de in Dortancia central en la accidn de los ensittas. Bs tambien el ‘unto de pavtida cle Hos teatanniontee materitieas que deinen el comporramlerita cinético de la resectones catallzadiss por ‘enzimas, ast como se las descripeiones Ledricas de los meca: neo enscimstions Los enimas alteran las velocidades de reaccién pero no los equilibrios Se pute escribir uns reneeiinenaimdtien sencilla coma B+S== B= EP E+P seduce By P avpreonian el etal, el stelgal y ol pr ducto, respectivamnente. ES y EP son complejos transitorios del envitna con el sustratay eon el producto -respectivamente Para entencler la.catalisis, hemos de apreciar ex primer uggir la importante distineién entre equilbrias de reaccidn y velocidades cle reaccian, Lat funeidn cde un catalizador es am- ientar la vafocisiad de una reaecién, Los eatalizudares 110 redlfican los equifidvias de resceidn, Cualquier rexceién, Bor elemplo 8 = P, se puede describir mediante un diagram de Ja cootdenada de renceidn (Pig. 6-2), una deseripcion de Jos ‘cambios enengetieos durante la reaceiGn, Tal carne se he expli- eado on el Capitulo 1, fa enorgia do log sistemas binligieos se eseribe en funcin de la energia libre, @. in el dingrarna de la coordenada, 5¢ representa la energia ibre del sistema frente al progreso de la reaceion (courdenacla de la reaecidn). El punto de parti tata para ia reaction hacia la derestia comma hacia Jn fzquierda se denominst estado basal, que esta contribucien ‘ala eneryta bre del sisterva do una moléeula promedio ($.0 1B) bajo un eonjtanta ele condiciones dads. Para deseribir las ‘variacianes de energia libre de ls racrianes, los quimicas dei-398 Capitulo 6 Enzimas FIGURA 6-2. Diagrama de la eoordenada de reaeciém de una reoc- iin quitnica, Se represnta Ta ener ibe del sistema frente al pro- [)ei0 dela reaccidn S + P. Un dlagrarna de este tipo constituye wna ‘escripcién de fos eamblos energéticos durante Ia reaccin y el eje horizantal (coordenada ee reaccin)refleja tox cambios quimicos progresivs ip. e, rotura 0 formacin de enlaces) 2 mecila ue § co ‘comer en PS ncican fas ene de acta, AG", para as aes clones § + Py P+ S. AG’ es la variacién ee eneypia ibe es dar slobal ce ls dieceién $= P, hen Un conjunta estindar de condiciones {Lemperatura 208 K, presiGn parcial de cada gus 1 atm o 101 3 kPa; concentracion de toda los aolutos igual & 1 6) y expresan la variacion de ‘energia libre de este sistema reaceionante com AG", la-varin- eign de energia libre esténdar. Dato que en los sistemas bioquiticos participa normalmemte el H” en coreenteaciones ‘muy lejamus de Em, los bioguimioos definen la varineién de la energia libre esténdard bioquimiea, AG", como la varia ‘ion de energia libre estindar « pl 7,G; etmplesremos esta se finicin aa large cle teen elite, Fol Capitulo 13 se dara a ddefinicién mas cormpleta de AG, Fl equilbrio entre $ y P reflea la diferencia en ener ti bbe dle sss estaclos basales, En el ejemplo que se musssra er ka igura 8-2, la energfa libre del estado basal de P es inferior a Ja del de 8, por lo que la AG" de la reaccin es negativa y el ‘euilibrio favoreee a P. La posiciin y la direceiin de este equi likrio mo se-ven aféctadas por ningin catalizadlor Un equilibrio favorable no inciea que la corwersiin $+ P ‘su rapida. La velocidad de reaccién es dependicnte de un pa- ametto Cotalmonte diferente. Existe una barrera energétlea entre S y P que representa la onergia requerida para el alt eamiento de los grupos reactives, La formacion de ergs Inestables transitorias, ls reordenamientos de enlaces y otras {ransformaciones que se requieren para que la reaccion tenga ugar en cualquiera de las dos direcciones. Esto viene repre: venlado por la “colina” energética de las Figuras 6-2 y 6, Para que hays reacclia las moléculas han de superar esta barrera, pporlo que se deben levar a un nivel energético supesior: En la cumbre de la colina enengética existe un punto ene! que la ea- da hacia el estado $0 P es igualmente probable (en cualquier ano, el camino #3 dle hajeda). Bs lo que se denomina estado de tranaleléa. El estan ike (oanividi tires una especte qu mia con estabilidad signifieativa, por le que no se ha de con- fundir con un intarmediatio de reacetn. Bs, simplemente, un Momento molecular fuga2 en el que-asontecimientos tales como rotura de enlaces, formacin de enlaces y desarrelo de em han lecado al inetanto prose an cl gus el elapoe ha cia sustrato o hacia producto es igualmente probable. La die Fencia entre Los niveles de energia del estado basal ¥ del fstado de transicién se denomina energia de activactén, ‘AG*. La velocidad do una reacoién tefl esta eneraia de act ‘aciin: a una energin de activaeién més elevada correspondle tuna renccion mds lenta, Las velocidaes de reaceién pueden ‘aumentarse incrementanda la temperatira, mstiante toque s» sumenta el nimero de molgculas con enengia suficiente para superar la barrera energética, De anedo aternativo,€3 po sible disminuir la energia de activacién atadiendo un catali- vidor (Pig. 63), La catdlisis axomenta las votocidades de reaceidn dismimuyendo tas energias de actinacién, Los engtimas no constatuyen una éxcepedén ala regla de aque Ins eateizadotes no modifica el equilbrio de reaccién Lae flechas bidireceiorales de la Beuacin 6-1 iustran este punto; cualqir eraima que eatalce Ia reaccién SP tam- ben catia la reaceiin P+, Su tinea mision et aeslarerla Interconversiin de y F No co gasta erzima en el process yl punto de equiibrio no queda afectada, No obstance, a rene: cin alcanza e} equiibrio de una manera mucho mis rapid cuando se halla presente el enzima adecuado ya que-se incre ment ia welcida cl a eaceton. Se pueiteistrar este principio general considerando ta reactén dein sacarosa con el oxgeno para formar did de earbono y gu: CaHlasOn: + 120) —» 1200) + 1111.0 Besta transformacién, que se realiza a través de una serie de reacelones sepasadas ine tiie AC many grande: y negative. por lo que la calidad de sacarosa presente en el equillari ex ‘despreclable, No obstanta, la sscarosa es un eompucstestable va quella barreea de activacién enersética que debe supers an- tes de reaceisnar com el oxen es muy alta, La seearosa puede almacenarse en un. reeipiente en presencia de oxigen de ma- sted de dranseton¢) Coorlendla de ronecion FICURA 6-3. Diagrama de la coonenad de reacclin donde se com: para as reacciones eaaliada por enna y sin eatalinar. fra oa dn $+ Pos intormediatias ES y EP acupsn mirc et la cara de rogreso energitico de a reaccibn catalizada enzimsticamente; Los ‘Seminos AGhaus¥ AGL Coresporden a fas enerpias de actoaciin de ls eaceiones sn ctalizary catalzada, respeetvamente La ener- la de activaciin del proceso goal es menor cuandk e! enzima eata- Fea la reaccid,‘era cast indefinida sin reacckonar. Sin ennibarg, en la cals, ln sacaroa o8 degrada & 00, y HO teaves de wa serie de reacciones catalizada por encimas. Eins enimas na 60 acele ran las reacciones sino que las omganizan y cantzolan ee tal ra era que gran parte de la energia lberada en este procead ae recuperaen otras formas asequibles ala cella para que realice sus funcionas. La ruta de reacciones mediante Iae que la sae ost (¥ otras amicares) 5e degradan es a rata petmarta de toe macion de energia para las celuas y los erizimas de esta ruta perriten que la Secuencia de reacciones Leng Iugas en uns ea ‘cal de tiempo itil para las cha ‘Cunlquier reacciGn puede consistir en varias etapas que ‘suponen la formaciin y desintegraeién de especies.qatmieas: (ransitorias denorinwdas intermediarios de reaceién.* Un Intermediatin de-reancivn rs cusiquier eepecie nmociida en eh transeurso de in reaceldn que tenga un tiempo de vida qtenieo fino (y mayor que el de una vibracién molecular, equivakente survdos). Cuando la reaceifin § = Pesta catalizada por un enzima, las complejos ES y EP pueden ser considera. dos intermersarios a pesar de que Sy P sean especies quimi- eas estables (Ee. 6-1); kos complejos ES y EP ocupan wales en el diagrama de la onordenada de reacclén (Fig, 6-8), Bn el curso de una reacekon catalizada enaimticamente sueten exis tir otros intermedarine quimicos aeicionales y menos estables [La intereonversin de dos intermediarios de reaccin secuen- ales constituye por tanto un paso de la reaccion, Cando en luna reacei6n existen vuris pasos, la velocidad global viene de- ‘eeminada por el paso Co pasos) eva energa de activsciém es Jams elevadas este paso se enomina paso limitante de ve- Jostdad. fn un caro kencillo, ek paeo imitantw de velocidad ol punto de energia ids eleva en el diagrama te intercon versiinde Sy P.1n is practica, el paso limitante de velocidad puede cambiar con las eondielones de reaeelén y en el easo de muchos emaimas puede haber varios as con ener de c= tHvacton simian, lo que significa que todes els son narile ‘ment lnitanes de la velocidad, Las energias de activacién son barreras energéticas para Jas reacciones quimicas. Estas barreras sox eraciales para la propia vida, La velocidad a la que una moléeula 9¢ transfortoa fen una renccién qutmica lecerminada desciende al aumentar Ja barrera de activacion de esta reacein. Sin estas barreras fenengéticas las macromoléculas complejes reverlirian espan- téneamente a formas molecalares mucho mis seneillas ¥ no Dodrian existir ni las estracturas complejas y altamente or- Aenndas ni los procesos metabslicos que tienen Nagar en ins elas, Los enalimas han evolueionado pane dlr aeeti- ‘uamente las energias de activacion de las reacciones necesa- iss para la supervivencia celular. “nurse queen este caput lon termina paso @ htewmediarto so “fearon a eapseles ques que se aighan oxy una inten reseelon eh {allzada enzinaticamente. Bl conterto de las rotas metabdlicas en Di pe pute clos eiclees (Pats ce be Mra ed te Solnos se utsian de manera ago diferents, Una reaeeién enaimiten ‘complot ree x mevunio el nombre da “pagu” da wn ruta yal pro "Huet do la esecion do un ensiona (que ws sustain para e sigmcnto eta de a rota) slo suse enonay “iterreciaro" 62 eCéme funcionan tos enzimas? 195 Las velocidades de reaccisn y tos equilibrios tienen definiciones termodinémicas precisas Los equdlibrios de reaccidn estén asociadins inextricable= ‘mente a la Varlacion de enorgia libre estnular dle la reaccién, AD”, mientras que las velocidades de reaccitn estin asocia- das a a energf de activaciin, 8G". View introduceion basica a estas relaclones termodinsinicas Goustitiye ol pritakne a para saber eémo funcionan los enzimas, Un equilibrio tal como 8 == P viene descrito por una constante de equilibrie, Keg, 0 K {p, 26). En las condicio- nes estindar vlilizadas para comparar los pracesos biogult ‘cos, nina constante de equilibria se denota per Kg (0.4) eT 6-2) De laterinndindmica, puede cescriirse la rebaciin entre Ray AG" mediante la expresin AT In Rey 6-8) donde R 6st constants dels gases (8,16 Uhvol - K) y Tesla temperatura absoluta, 298 K (25). La Bouacicn 6-3 se de- sarvollara ytratara detalladamente en el Capitulo 13. Agu ot ppunto Imparianie es que la constante de equllorio es un re- feo directo de ia wariacion de energia bre estsindar gba de 1b reaceign (Tabla 6-1), Un valor negative grande de AG re- fleja wn equlliiio de reacelin favorable aunque, tal como se hha comentado antes, na signifique que la neaccién transeurra con una velocidad elevada, 1a velocidad de una reaeeiOn cualquiera viene determi. hada por la concentracién de reactive {oneactevas)y por una constante de velocidad ususlmente representada por el simbolo k. Para la reaecln unimolecular 8 — Pts velocidad dota rencehn, V, que representa la cantidad de S que ha reec- ‘ionado por unidad de empo, viene expresada por una eeus- ‘clin de la velocklad: v= eS) on en esta reaecion, 4a Velocaad solo Gepencte se la concentracion die 8, Be lo que se denomina nna reaceion de primer orden, oc Wan sea ar 8 AG = AINE