Examen Departamental Biologia Molecular Semestre Febrero-Junio 2008 ENCIERRA EN UN CIRCULO LA LETRA QUE REPRESENTE LA RESPUESTA CORRECTA (solo una) 1. Los nuclestidos son la unidad de los acidos nucléicos. Cada nucledtido esta compuesto por: (2) Una pentosa, un fosfato y una base nitrogenada (b) DNA, RNA y proteinas (©) Adenina, guanina, citosina y timina (d) Acidos grasos, proteinas y azicares (@) El aminoacido, el codén y el anticodén 2, Son regiones del genoma que estén permanentemente en una condicién altamente condensada y que no se expresan genéticamente (a) heterocromatina (b) eucromatina (©) cromatina homéloga (A) interbandas 3. Sefiala la aseveracion que es falsa (@) Durante la replicacién del DNA hay errores que tienen que ser reparados por un mecanismo molecular (6) Las mutaciones son mecanismos que permiten la variacién genética {c) Mientras mas mutaciones presente un individuo, mejor va a estar adaptado (d) Existe mas de un mecanismo de reparacion del DNA Sein unidad de expresion genética y requlacion en bactetias, incuye genes estucturales y elementos de control en el DNA que son reconocidos por proteinas regulatorias: (a) operador (©) cistrén (0) intrén (d) trans-regulador (©) operén §, Es una molécula pequeria que al unirse a una proteina regulatoria provoca un efecto negativo a la transcripcién: (a) co-represor (b) complemento (0) cofactor (d) coenzima (@) atenuador 6. Es la enzima encargada de transcribir el RNA mensajero en eucariotes (e) RNA polimerasa |(f). RNA potimerasa II (9) RNA polimerasa Ill (h) RNA polimerasa IV (i) RNA polimerasa V 7. Son secuencias de DNA localizadas antes del sitio de iniciacién de la transeripoién que sirven para anclar el complejo de iniciacién de la transcripci6n: (a) TBP (b) TAFs (0) TATA box (d) Anticodén del tRNA (©) Codén UAA 8. Es un intermediario en el splicing del mRNA en el cual una estructura circular gon una extensién en el extremo 3" es producida por la formacion de un enlace 5-2: (a) Lider (b) Fragmento nuclear (©) Lariat o de lazo (@) Estructura cruciforme 9. Durante este proceso, un s6lo gen da origen a mas de una secuencia de mRNA: (2) splicing polar (b) splicing alternativo (0) rearreglo genémico (d) entrecruzamiento (e) transcripcién alternativa 10. Una region de este rRNA se aparea con la secuencia Shine-Dalgamo (a) 5S (b) 168 (0) 238 (4) 50S (e) 5S 11.Cada cromosoma, para ser funcional, requiere de al menos estos tres componentes en su secuencia: a) centriolo, nucleolo, histona b) origen de replicaci6n, centrémero, telémero ©) anafase, metafase, telofase d) genes, intrones, exones12, Watson y Crick usaron toda la siguiente informacion para deducir la estructura del DNA excepto: a) La determinacién del ‘principio transformante” por Avery, McLeod y McCarty b) Los estudios de difraccién de rayos X hechos por Franklin ©) Las reglas de Chargaff de la composicion de las bases del DNA 4) Las micrografias electrénicas del DNA de Linus Pauling ©) La determinacién de que el tautémero predominante en las bases es el ceto 13. El splicing nuclear se produce por dos reacciones de transesterificacion en las que un extremo libre OH ataca a una unién fosfodiéster. Puede decir cual es el orden en que ocurren estas reacciones? Puede dibujar los productos pH Ex6n1-0-P-0.cU— ~——--AG-O-P-0-Exén2 14. ¢Cual es la funci6n de la DNA polimerasa | en la replicacion? éPor qué su funcién no puede ser acometida por otra polimerasa (como la Il o fa my? £6, Sefiala si las siguientes aseveraciones son falsas (F) 0 verdaderas (V) Durante la replicacion del DNA: (__ ) la cadena lider (“leading strand”) se sintetiza de manera discontinua (__ ) la cadena lider ("leading strand") se sintetiza de manera continua ("la cadena lider ("leading strand’) se sintetiza en la direccion de la orquilla de replicacién (|__ ) la cadena de retraso ("lagging strand") se sintetiza de manera discontinua ("J la cadena de retraso ("lagging strand’) se sintetiza de manera continua 16. Sefala cual de las siguientes enzimas participa en la sintesis del DNA de células procariontes (P) 0 eucariontes (E). ¢ ) pol & ( ) Primasa () pot tt (pol &/primasa17, Relaciona las columnas al sefialar la funcién de cada enzima durante la replicacién de! DNA. a. Topoisomerasa b. Helicasa c. Ligasa d. Primasa @. Proteinas de unién a una cadena sencilla de DNA (___ ) Desdoblamiento de las cadenas del DNA. (_) Mantener y estabilizar al DNA en la forma de cadena sencilla (_) Rompimiento y unién reversible de las cadenas del DNA (_ ) Formacién de enlaces covalentes 5°-3°. (__) Sintesis de! RNA iniciador, 16. Indica el orden (del 1 al 5) en el que ocurren los siguientes eventos enla maduracién del mRNA. inicio de la transcripcion adicion de la cola de poli-A splicing transporte al citoplasma en asociacién con mRNPs adicion del cap 5° 19. Para iniciar la replicacién del DNA se utiliza un primer de: a. DNA b. proteina c. RNA d. fosforibosa @. nucleoproteina 20. En E.coli, la cadena de DNA parental se puede distinguir de la cadena de DNA recién sintetizada porque: a. La cadena parental est metitada y la nueva no lo esta, b. La cadena parental no esta metilada y la nueva si lo est, ¢. La cadena parental presenta mutaciones puntuales que resultan en deleciones en la cadena nueva. 4d. La cadena parental esta acetilada y la nueva no lo esta, 21.El porcentaje de pares de base GC en la molécula de DNA esté relacionado con la Tm de esa molécula porque: a. la estabilidad de los pares de bases GC y AT son intrinsecamente diferentes b. los pares de bases AT requieren una mayor temperatura para desnaturalizarse ¢. los puentes de H triples de los pares de bases GC son menos estables que los puentes de H dobles de los pares de bases AT 4d. el contenido de GC es igual al contenido de AT22. .Qué ocurre cuando la maquinaria de traduccién eucariética se encuentra con un codén UAG? a. 1 complejo de preiniciacion ya unido detiene su escaneo, y posiciona el t2NA iniciador en este sitio. b. los factores de terminacion reconocen este codén y finalizan la traduccién & este codon es reconocido por el correspondiente anticodén de una molécula de RNA vacia, que no lleva ningiin aminoacido 4. este codén no es reconocido por ningun factor, lo que causa que la maquinaria de traduccion se pare. 23.Un enhancer @. puede estar localizado rio arriba (upstream) del promotor b. puede estar localizado rio abajo (downstream) del promotor ©. puede estar localizado a distancias variables del promotor d. puede ser especifico para un tipo celular en particular e. todas las anteriores f. ninguna de las anteriores. 24.¢Cual elemento de los siguientes NO se encuentra en proteinas de unién al DNA? a. homeodominios b. dedos de Zn ©. zippers de Leu d. islas CpG 25. Cul es el primer factor que se une al promotor de genes que codifican para proteinas en eucariotes? a. RNA polimerasa b. TFIA c. TFIIB d. TFIID e. TBP. 26.Es el tipo de recombinacion que ocurre durante la meiosis en eucariotes: a) homéloga b) heterdioga ©) sitio especifica 4) por eleccién de copia €) disyuntiva 27.- El core 0 cuerpo de la RNA polimerasa de procatiotes esté constituido por las siguientes subunidades: (2) oBys (b) y8o2 (c) app! (a) anBplo28.- Tres tipos de RNA con diferentes actividades son responsables de la ‘sintesis de proteinas, estos son: (a) premRNA,hnRNA,snRNA (b) MRNASRNALRNA (0) tRNA,Met-tRNA,peptidil-tRNA (d)_-hnRNA,RNA,tRNA (€)_aminoacil-tRNA,peptidil-tRNA, Met-tRNA 29.- Los tolomeros se requieren en células eucariotes y no en procatiotes, Porque: (2) Las células eucariotes tienen més de un cromosoma (b) Las células eucariotes tienen cromosomas lineales (c) Las células eucariotes tienen mas formas de la DNA polimerasa, (0) Las células eucariotes tienen cromosomas circulares. 30.- Una proteina de fusion que consiste en el dominio de unién a DNA de un activador de ta transcripcién, fusionado al dominio supresor de un supresor de la transcripcion, resulta en: (2) Una proteina no funcional porque tiene secuencias de proteinas diferentes. (b) Una proteina que actiia como represor. (©) Una proteina que actia como activador. (d) Una proteina que acta como activador y represor. 31.- A los fragmentos de 1000 a 2000 bases, producidos durante la replicacion discontinua de! DNA, que son posteriormente unidos por enlaces covalentes formando una hebra intacta se les llama: (@) TATA box (b) Fragmentos Pribnow (©) Fragmentos de restriccién (d) Fragmentos de Okasaki (e) Promotor 32. ¢Por qué cuando un gene es translocado por rearreglos genéticos a un ‘extremo del cromosoma, este es silenciado? 33. Cual es el papel de RecA en el sistema SOS?74, Después de que se publicé la estructura del DNA y se sugirié su posible Tecanismo de replicacién, surgieron problemas de tipo “topolégico” para explicar realmente cémo se llevaba a cabo esta replicacion. Se propusieron tree [podelos: el de la replicacién conservativa, el de la replicacién dispersiva y el de la ‘replicacién semiconservativa. Meselson y Stahl llevaron a cabo. un experimento con el que se pudo definir cual de estos tres modelos era el bueno El experimento se esquematiza a continuacién. Esquematiza y explica cual ore el resultado que esperaban para cada uno de los tres diferentes modelos de replicacién y cual fue el que obtuvieron. (4 puntos) W0The epionnt (ne ce Suen Too ct one35. Se describié recientemente un gene humano que codifica para una proteina Que tiene el potencial de funcionar como agente anticéncer. Esta proteina es un Polipéptido pequefio que consta de solo 15 aminodicidos. Los investigadores que {a describieron hicieron accesible solo la secuencia de la proteina y por ningun motivo quieren compartir el plasmido que construyeron que porta este gene. En cl laboratorio en el que trabajas estan interesados en las propiedades de Polipéptidos con actividades similares y seria importante comparar la actividad de la proteina recién reportada con las de tu laboratorio. Describe brevemente, en 5 pasos, que harias para lograr expresar y obtener la mayor cantidad posible de este polipéptido. 3 puntos.36. Mapas de restriccién del genoma lineal de 2. Lambda (2) ° 10,000 20,000 30,000 40,000 48,502 EcoRE Sites 21226 26104 31747 30,168 44972 Bam Sites 5505 22346 arsTe 34.499 at 732 19329 23901 27.868 44.238 Sihaces una digestion del genoma de 2. con cada una de las enzimas arriba mencionadas y corres el gel, como se veria ese gel (marca con una linea donde correrian los fragmentos en cada carril) (dos puntos) Marcador de Peso Molecular EcoRI Bamtit Neo! (0,000) 60,000) (20,000) (15,000) (10,000) 5,000) 2,500) (1,000)En la siguiente tabla escribe el tamafio de los fragmentos que te resultarian con la doble digestion: (un punto) EcoRI + BamHT