Clases Bioquimica

Química y Biomoléculas
Aminoácidos,
péptidos y proteínas
Aminoácidos
Estructura Básica
Aminoácidos
Funciones
Aminoácidos proteinogénicos
Alifáticos
Aromáticos
Hidroxiaminoácidos
Tioaminoácidos
Amina secundaria (iminoácidos)
Carbono α
Aminoácidos dicarboxílicos y amidas

Aminoácidos dibásicos
Aminoácidos no proteogénicos
Estos surgen
A. Durante las reacciones metabólicas
B. Como resultado de modificaciones enzimáticas de residuos de

aminoácidos en péptidos o proteínas.
C. Las "aminas biogénicas” se sintetizan a partir α- aminoácidos por

descarboxilación.
Aminas biogenas
Enlace peptídico
Enlace peptídico
Algunos péptidos de importancia biológica
Péptidos modificados
Deficiencia enzimática y fenilcetoenuria
Deficiencia enzimática y
fenilcetoenuria
Organización de las proteínas
Estructura primaria
Estructura Secundaria
Estructura Terciaria
Estructura Cuaternaria
Estructura Primaria
Es la secuencia lineal de los aminoácidos que forman una proteína
La secuencia primaria es una característica específica de cada

proteína y determina los demás niveles de su estructura y, por
tanto, su forma espacial, que condiciona su función biológica.
La variación de la estructura primaria, por pequeña que sea,

puede alterar o destruir la forma espacial habitual de la proteína y,
por consiguiente, su función.
Estructura Primaria
Normal
Normalhemoglobin
hemoglobin Sickle-cell
Sickle-cell
hemoglobin
hemoglobin
Primary
Primary ValVal HisHis Leu
Leu ThrThr ProPro GluGlu GluGlu Primary
Primary ValVal HisHis Leu
Leu ThrThr ProPro ValVal GluGlu
structure
structure 11 22 33 44 55 66 77 structure
structure 11 22 33 44 55 66 77
Exposed
Exposed
Secondary
Secondary Secondary
Secondary hydrophobic
hydrophobic
and
andtertiary
tertiary subunit
subunit and
andtertiary
tertiary region
region subunit
subunit
structures
structures structures
structures
!!!! ! !
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QuaternaryNormal
Quaternary Normal Quaternary
Quaternary Sickle-cell
Sickle-cell
structure hemoglobin
structure hemoglobin structure
structure hemoglobin
hemoglobin ! !
(top
(top
view)
view) !!!!
!!!! ! !
Function Molecules
Function Molecules dodo Function
Function Molecules
Molecules
not
not
associate
associate interact
interact
with
with
with
with
one
one oneoneanother
anothertoto
another;
another;each
each crystallize
crystallize
into
into
carries
carries
oxygen.
oxygen. a fiber;
a fiber;
capacity
capacity
totocarry
carry
oxygen
oxygen
is is
greatly
greatly
reduced.
reduced.
Se refiere a ciertos patrones de plegamiento del eje de la molécula que se

repiten en algunas zonas de muchas proteínas.
Estas estructuras son consecuencia de la formación de puentes de

hidrógeno entre los átomos que participan en los enlaces peptídicos, sin
que intervengan los grupos laterales de los aminoácidos.
Por esta razón, muchas proteínas diferentes pueden formar estas

estructuras. Hay dos tipos principales de estructuras secundarias:
La hélice α
La lámina u hoja β plegada

La hélice α
La lámina u hoja β plegada
β pleated sheet
Amino acid
subunits
α helix
Abdominal glands The spiral strands

of the spider (capture strands) are
secrete silk elastic, stretching in
fibers that form response to wind,
the web. rain, and the touch
of insects.
The radiating
strands, made
of dry silk fibers,
maintain the
shape of the web.
Spider silk: a structural protein

Containing β pleated sheets
• Se refiere al aspecto tridimensional global de la macromolécula.
• Es consecuencia de las interacciones entre aminoácidos que pueden quedar muy

alejados en la estructura primaria y de los dobleces que introduce algún
aminoácido, como la prolina, por su rigidez, en el eje de la molécula.
• Por regla general, los grupos laterales polares de los aminoácidos tienden a
colocarse en la superficie de la molécula formando puentes de hidrógeno con el
agua, mientras que los aminoácidos no polares permanecen en el interior.
• Las interacciones tienen lugar entre los grupos laterales de los aminoácidos y
pueden ser de varios tipos
a) Atracciones o repulsiones entre los aminoácidos con grupos laterales polares, que
se manifiestan en la formación de puentes de hidrógeno.
b) Atracciones o repulsiones entre los aminoácidos con grupos laterales iónicos

(ácidos y base), que forman enlaces iónicos, llamados a veces puentes salinos.
c) Repulsiones entre los grupos laterales apolares y el agua, que se manifiestan en las
interacciones hidrofóbicas y en las fuerzas de Van der Waals.
d) Los grupos laterales que contienen el grupo -SH del aminoácido cisteína pueden
formar enlaces covalentes entre sí, cuando se oxidan, dando lugar a un enlace
covalente (-S-S-): es el llamado puente disulfuro.

-SH + SH- → -S-S- +H2

Hydrophobic
interactions and
van der Waals
interactions
Polypeptide
backbone
Hydrogen
bond
Disulfide bridge
Ionic bond
Hydrophobic
interactions and
van der Waals
interactions
Polypeptide
backbone
Hydrogen
bond
Disulfide bridge
Ionic bond
• Está presente en proteínas formadas por más de una cadena polipeptídica.
• Cada una de las cadenas se llama subunidad de la proteína o protómero.
• Las subunidades pueden ser iguales o distintas.
• La estructura cuaternaria se refiere a la estructura espacial global de toda la

proteína, consecuencia de las interacciones y organización en el espacio de las
diferentes subunidades
• El tipo de interacciones que se producen son análogas a las descritas en la

estructura terciaria.
Desnaturalización
• Es cuando rompen los enlaces débiles que mantienen las estructuras de orden
superior a la primaria.
• Pierden su función.
• Variaciones de temperatura, el pH o la cantidad de sales disueltas en el agua,

producen desnaturalización, al dificultarse la formación de los puentes de
hidrógeno y de los puentes salinos.
• Para algunas proteínas de pequeño tamaño este proceso es reversible, y cuando

se recuperan las condiciones ambientales iniciales la proteína se vuelve a
plegar espontáneamente a su forma original; decimos entonces que se
renaturaliza.
Denaturation
Normal protein Denatured protein
Renaturation
Lectura:
Ferrier D., (2014) Bioquímica, España: Editorial
Lippincott Williams & Wilkins. Capítulo 5
Química y biomoléculas
Catalizadores
Enzimas biológicos
LAS ENZIMAS. CONCEPTO
❖ No alteran los equilibrios de la reacción química que catalizan.

❖ No se alteran al catalizar una reacción.
❖ Selectivas en relación con la reacción que catalizan.
❖ Sólo pueden reconocer, unirse y modificar a moléculas
determinadas.
La enzima disminuye la energía de activación
Sin enzima
Con enzima
• La Ea de la hidrólisis de la urea baja de 30 a 11 kcal/
mol con la acción de las enzimas, acelerando la
reacción 1014
E+S
• El aumento de temperatura necesario para producir

la reacción no catalizada seria de 529ºC
E+P
Tiempo de la reacción
La enzima disminuye la energía de activación
Enzima - Catalizador
• Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una

reacción química.
• Una enzima puede transformar 1000 moléculas de sustrato/ segundo
• Las enzimas tienen 3 propiedades que los catalizadores NO tienen:
– Especificidad por el sustrato
– Se inactivan por desnaturalización
– Pueden ser reguladas
Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a:
• Fijación estereoquímicamente complementaria del substrato

• Transformación catalítica del mismo
En ambas funciones participan:
• Cadenas laterales de los aminoácidos

• Grupos o moléculas no proteicas:
• Grupos prostéticos: Holoenzima
• Cofactores: Cu 2+, K + ,Mg2+
• Coenzimas
Algunos iones inorgánicos que
actúan como cofactores enzimáticos
Algunas coenzimas que actúan como portadores
de átomos o grupos funcionales específicos.
La unión del sustrato es muy específica
• Complementariedad geométrica
• Complementariedad de cargas,
uniones iónicas
• Modelos:
• Encaje inducido
• Llave – cerradura.
• Estado de transición
Teorías de la acción enzimática, 1
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)
Substrato y enzima se acoplan de forma estereospecífica, de la misma manera que

una llave se ajusta a su cerradura.
Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se considera insuficiente al no explicar

algunos fenómenos de la inhibición enzimática.
Teorías de la acción enzimática, 2
Modelo de Encaje inducido (Koshland)
Tanto la enzima como el substrato sufren una alteración en su estructura por

el hecho físico de la unión.
Está mucho más de acuerdo con todos los datos experimentales conocidos
hasta el momento.
Clasificación y
nomenclatura de enzimas
Clasificación y nomenclatura
Clasificación de enzimas por Grupos
EC 1.x Oxidorreductasas
EC 2.x Transferasas
EC 3.x Hidrolasas
EC 4.x Liasas
EC 5.x Isomerasas
EC 6.x Ligasas
Clasificación de enzimas por Grupos
Clase Tipo de reacción Subclases
1. Oxidorreductasas Deshidrogenasas
Transferencia de e- de un dador Oxidasas, peroxidasas
(agente reductor) a un aceptor Reductadas
(agente oxidante) Monooxigenasas.
Dioxigenasas
2. Transferasas C1-transferasas
Transferencia de un grupo Glicosiltransferasas
funcional (ej. amino, fosfato) Aminotransferasas
entre moléculas. Fosfotransferasas
3. Isomerasas Epimerasa
Reordenamiento/isomerización cis trans Isomerasa
molecular Transferasa intramolecular
4. Liasas (sintasas) C-C

Adición o remoción de átomos C-O
C-N
C-S
5. Ligasas (sintetasas) C-C
C-O
C-N
C-S
6. Hidrolasas Esterasas
Glicosidasas
Peptidasas
Amidasas
Clasificación y nomenclatura
Cinética
Enzimática
Cinética Enzimática
• La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de cada

uno de los factores que intervienen en la actividad enzimática, que
se evalúa a través de la velocidad de la reacción catalizada.
• Las variables más importantes son:
• Concentración de enzima, sustratos y productos (incluyendo
inhibidores y/o activadores)
• pH
• Temperatura
Baja
concentración
de sustrato
ALTA
concentración
de sustrato
SATURACION
Una cinética hiperbólica implica un proceso saturante:
Hay un número limitado de sitios en la enzima para fijar substrato;

una vez que están ocupados todos, por mucho que aumente la
concentración de substrato, la velocidad permanecerá constante
tendiendo a un valor asintótico
k+1 k+2
E+S ES E+P
k-1
Hipótesis de Michaelis - Menten
k+1 k+2
E+S ES E+P
k-1
- La primera parte del mecanismo,
k+1
E+S ES
k-1
Tiene lugar mucho más rápidamente que la segunda:
k+2
ES E+P
. . .
Efecto de la concentración de substrato
.
v
.
.
.
.
[s]
Relación entre Km y Vmax
Michaelis y Menten
Vmax
Velocidad de la reacción (v) Vmax/2
Km Concentración de Sustrato [S]
La Km es la concentración de sustrato
donde se obtiene la mitad de la Vmax
Vmax
Velocidad de la reacción (v)

Vmax/2
Km Concentración de Sustrato [S]
A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato

A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato
Significado de la constante Km
1. Constante de equilibrio de disociación del complejo ES
2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato
3. Mide la función de fijación
4. Concentración de sustrato para la que la velocidad se hace

igual a la mitad de la máxima (s0.5)
5. Se define para una pareja enzima-substrato
6. Se mide en unidades de concentración

Significado de la constante Vmax
1. Velocidad asintótica para s
2. Directamente proporcional a la concentración de

enzima
3. Mide función de transformación catalítica
4. Se expresa en unidades de velocidad

Representación directa
v
100
Vmax
80
60
Vmx s
v=
40 Km + s
20
s
0
0 20 40 60 80 100
Km
Representación recíproca doble
(Lineweaver - Burk)
Representación Lineweaver-Burke
0.04
1/v
0.03
1/Vmax
0.02
1 Km 1 1
-1/Km = ⋅ +
0.01
v Vmx s Vmx
0.00
-0.4 -0.2 0.0 0.2 0.4 0.6
1/s
Factores que afectan
la actividad Enzimática
Efecto del pH en la ENZIMA
Cada enzima tiene un pH óptimo para su actividad

El pH afecta las interacciones iónicas
Efecto de la temperatura en la ENZIMA
Aumento de la Desnaturación
velocidad por calor
15º 40º 75º

Temperatura
Cada enzima tiene una temperatura óptima.

Coenzimas
• Las coenzimas son pequeñas moléculas

orgánicas, que se unen a la enzima.
• Las coenzimas colaboran en la reacción
enzimática recibiendo transitoriamente algún
grupo químico: H+ , OH, CH3 .
• La enzima sin la coenzima recibe el nombre de
APOENZIMA
El NAD es una coenzima aceptora de H
Sustrato
oxidado
(A) Tetrámero de lactato deshidrogenasa. (B) Sitio activo
Algunas enzimas requieren metales para mejorar su actividad
Inhibición enzimática
Inhibidor
Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de
interacciones con el centro activo u otros centros específicos
(alostéricos).
Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a la

enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática.
De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:
I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo
II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula,

causando un cambio conformacional con repercusión negativa en
la actividad enzimática.
Inhibición enzimática isostérica
Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos:
1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,

con el complejo enzima-substrato o con ambos:
E+I EI
ES + I ESI
2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima:

E+I E’
Inhibición reversible
El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre,
impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva
El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo

haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la
fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción
catalítica: Inhibición No Competitiva
El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato

una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se
conoce como Inhibición Acompetitiva
Inhibición Competitiva
Inhibidores Competitivos
• Compiten con el sustrato por el sitio activo de
la enzima
• Se une solo a la enzima libre
• V máx no se altera y K M cambia
Inhibición competitiva
Al aumentar la cantidad
d e S U S T R ATO e l
inhibidor competitivo es
desplazado y se forma
producto
Por tanto, en la inhibición competitiva,
El efecto cinético del inhibidor es el aumento Km
La Vmax no aparece modificada; para concentraciones muy altas

del substrato, v = Vmax, igual que en ausencia de inhibidor
Cuanto más pequeño sea el valor de Ki mayor será la potencia del

inhibidor competitivor
Sin inhibidor
Con inhibidor
El inhibidor competitivo
aumenta la Km
Km Km
Sin con
inhibidor inhibidor
Inhibición competitiva - Representación dobles recíprocos
0.07
1/v
0.06
0.05
0.04
1/Vmax
0.03
0.02
-1/Km
0.01
1/s
0.00
-0.3 -0.2 -0.1 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6
-1/(K’m)
[ES] [EI]
El inhibidor no El sustrato no
puede unirse al puede unirse al
complejo [ES] complejo [EI]
Ejemplos de inhibidores competitivos y sus enzimas blanco
Malonato Succinato deshidrogenasa

Sulfanilamida Dihidropteroato sintetasa
Metotrexato Dihidrofolato reductasa
Captopril Enzima convertidor de angiotensina
Alopurinol (bajas conc) Xantina oxidasa
Metotrexato y Dihidrofolato
• El ácido fólico en sus formas de dihidro y
tetrahidrofolato es coenzima de la reacción
catalizada por la dihidrofolato reductasa.
• Esta reacción es parte del metabolismo de los
nucleótidos para la síntesis de DNA.
• Metotrexato se usa en la terapia de algunos
cánceres, inhibiendo la síntesis de DNA.
CH3
Inhibición No Competitiva
Inhibidor No Competitivo
• Se une a un lugar diferente del sitio activo la
enzima
• Se une a la enzima libre y también al complejo
enzima-sustrato
• Por acción del inhibidor disminuye la Vm pero
el valor de Km no se altera, cuando el inhibidor
se une por igual a la enzima libre y al [ES].
Inhibición NO competitiva
El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un sitio
diferente del sitio activo
Inhibición No competitiva
El inhibidor se une a la enzima

libre y al complejo [ES]
Inhibición No competitiva
Efecto de un inhibidor no competitivo sobre la cinética enzimática

Inhibición Acompetitiva o
Incompetitiva
Inhibidor Incompetitivo
En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro activo
pero solo después de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto,
inhibidor y sustrato no compiten. De esta manera, aunque todo el
sustrato esté saturando la enzima y toda la enzima esté como
complejo ES, el inhibidor puede enlazarse produciendo un
complejo inactivo ESI.
Como I solo se une a ES estimula la formación de ES y, por tanto,

incrementa la unión del sustrato a la enzima, disminuyendo Km .
Sin embargo, el complejo ESI no conduce a productos y Vm
disminuye.
Inhibidor acompetitivo
• Se une a un lugar diferente del sitio activo

de la enzima
• Se une sólo al complejo enzima-sustrato
• Los efectos que tiene: disminuye el valor

de Km y también el de Vmáx
S
E ES E+P
I
Inhibición
Anticompetitiva
ESI
El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES;

el complejo ESI no es productivo
Inhibición acompetitiva
Inhibición competitiva versus no competitiva
Competitiva No competitiva Acompetitiva

Pendiente
(KM/Vmáx) ↑ ↑ -
Intercepto en Y
(1/Vmáx) - ↑ ↑
Intercepto en X
(-1/KM) ↑ - ↑
Inhibición Irreversible
• Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo químico
de la enzima, modificándola covalentemente
• Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki,

sino por una constante de velocidad ki:
E+I E’
• A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los
inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación del
inhibidor.
• Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente

tóxicos.
Inhibidores Irreversibles
• Producen inactivación permanente de la
actividad enzimática
• Se interfiere con el normal desarrollo de una
reacción o vía metabólica
• Ejemplos: p-cloromercuribenzoato,
yodoacetato, diisopropilfluorfosfato
Inhibición irreversible
Enzima blanco y reacción
Inhibidor Efecto del inhibidor/Uso
catalizada
Plomo (Pb) Ácido aminolevulínico (ALA)
deshidratasa, ferroquelatasa
El plomo bloquea la producción de heme
Reacción:
Ácido aminolevulínico → heme
Organofosfatos Acetilcolinoesterasa
Suben los niveles de acetilcolina en el espacio
(gas nervioso, Reacción: sináptico.
insecticida) Acetilcolina→ colina + acetato
Cianuro (CN-) y Citocromo oxidasa (complejo
sulfuro (S2-) IV) Inhibe la cadena transportadora de e-, y por
Reacción: tanto, la fosforilación oxidativa.
Transferencia de e- de citocromo-
c a O2
Ácido Ciclooxigenasa (COX)
Inhibe la síntesis de eicosanoides tales como las
acetilsalicílico
Reacción: prostaglandinas, prostaciclinas y tromboxanos
Ácido araquidónico → para aliviar el dolor y la inflamación.
prostaglandina H2
Inhibición enzimática alosterica
Enzimas Alostéricas
• Son enzimas cuya estructura proteica está formada de
varias subunidades
• No se rigen por la cinética de M - M
• Además del sitio o centro activo tienen sitios alostéricos o
de regulación
• Sitio activo/sustratos;
• Sitio alostérico/moduladores o reguladores
• La relación entre la velocidad de reacción y la
concentración de sustrato sigue cinética sigmoídea
Enzimas alostéricas
• Las enzimas alostéricas

presentan estructura
cuaternaria.
• Tienen diferentes sitios activos,
unen mas de una molécula de
sustrato
• La unión del sustrato es
cooperativa
• la curva de velocidad presenta
una forma sigmoidal
Concepto de Cooperatividad
• La unión de los sustratos al sitio activo de una
subunidad produce un cambio conformacional
que por contacto físico se transmite a las
subunidades vecinas, facilitando las interacciones
• Modelos de unión: secuencial y concertado
• Ejemplos: unión Hb-O2, enzimas alostéricas y sus
sustratos
Moduladores Alostéricos
• También reciben el nombre de efectores y
pueden ser positivos o negativos
• Se unen al sitio alostérico que puede estar en
la misma subunidad que tiene al sitio activo o
en las subunidades regulatorias
• Su unión produce un cambio conformacional
que afecta al sitio activo
Aspartato Transcarbamilasa
• Ác L-asp + Carbamil-P === Carbamil-asp + Pi .
Primera reacción en la síntesis de pirimidinas
• Efector positivo: CTP
Efector negativo: ATP
• Tiene dos subunidades catalíticas para los
sustratos y tres subunidades regulatorias para
los efectores
Efectores alostéricos positivos y negativos
Efector Enzima blanco y reacción Resultado efecto/ uso

catalítica
Piruvato carboxilasa
Un efector positivo que estimula la
(+) Acetil-CoA Reacción: gluconeogénesis.
Piruvato → oxaloacetato
(+) Fructosa 2,6- Fosfofructoquinasa-1 Efector positivo y negativo que
BP estimulan e inhiben la glucólisis,
Reacción:
Fructosa 6-P → fructosa 1,6-BP respectivamente
(-) Citrato
Hexoquinasa
Un efecto negativo que inhibe la
(-) Glucosa 6-P Reacción: glucólisis.
Glucosa → glucosa 6-P
(+) ATP Aspartato carbomoilasa
Efector positivo y negativo que
Reacción: estimulan e inhiben la síntesis de
(-) CTP
carbamoil-P + aspartato→ pirimidinas, respectivamente
carbamoil aspartato
Regulación de las enzimas
Transcripción puede o la actividad enzimática (∆Vmáx)
Km no es alterado
Vmax se modiﬁca
Metabolitos pueden o la actividad enzimática (∆Km)
Fosforilación / desfosforilación pueden modificar la afinidad de la enzima
Km es alterado
Vmax no cambia
Metabolitos pueden o la actividad enzimática (∆Km)
Enzima
Glucagón
Pi ATP
OH
(Tyr, Ser, Thr) AMPc
Insulina Fosfatasa Quinasa
H2O ADP
Enzima
O
O P O
O
RESUMEN
• Las enzimas son proteínas que catalizan las
reacciones biológicas
• Presentan especificidad por su sustrato
• Cada enzima presenta dos parámetros
importantes Vmax (saturación de la enzima) y
la Km (medida de la afinidad por el sustrato)
RESUMEN
• La actividad enzimática puede ser inhibida, por
inhibidores competitivos (similares al sustrato)
o por inhibidores no competitivos.
• La temperatura y el pH afectan a la enzima en
su actividad catalítica.
• Algunas enzimas requieren de coenzimas y/o
cofactores para su actividad.
Oxidación del piruvato y Ciclo Oxidación y

de los ácidos tricarboxílicos descarboxilación
Fuentes del Acetil-SCoA
Carbohidratos Lípidos Proteínas
Glucosa Ácidos grasos Aminoácidos
Lisina Fenilalanina Treonina Triptófano

Isoleucina
Leucina
Glicólisis
AcetilCoA Nicotinamida
Tirosina
Similar a la β-oxidación
β-oxidación
Glicina Alanina Oxoácido
anillo aromático
ció i-
na sam
Oxidación, descarboxilación
Oxidación y
n
ruptura del
n
Tra
Piruvato
Fumarato
y clivaje
Propionil Piruvato
CoA
Acetoacetato
PDC PDC
AcetilCoA
Dr. QF. Mario Avila Garrido

Oxidación del Piruvato
Regulación del Complejo Piruvato deshidrogenasa
Ciclo de Krebs
( los ácidos tricarboxílicos)

Por cada ciclo se produce:
1 Oxaloacetato, 2 CO2, 3 NADH, 1 FADH2, 1 GTP
Por tanto la oxidación de una molécula de acetil-CoA produce 12 ATPs
3 ATP
3 NADH . = 9 ATP
1 NADH
2 ATP
1 FADH2 . = 2 ATP
1 FADH2
1 ATP
1 GTP . = 1 ATP
1 GTP
SUMA = 12 ATP/acetil CoA (o 24 ATP/glucosa)

Regulación
del ciclo de
Krebs

Reacciones anapleróticas y funciones anabólicas del ciclo de TCA
Reacciones Anapleróticas reacciones que reponen intermediarios de TCA cuando alguno

de ellos a sido utilizado para la biosíntesis de otros compuestos.
1. Degradación de aminoácidos a oxaloacetato, α-cetoglutarato, succinil CoA y fumarato. Esto

ocurre por vía transaminación, desanimación u oxidación de anillos aromáticos.
2. Carboxilación del piruvato a oxaloacetato (cuando glicemia es baja).

Reacciones anapleróticas y funciones anabólicas del ciclo de TCA
Reacciones Anabólicas
1. Síntesis de glucosa, a partir de OAA, y ácidos grasos a partir de citrato.
2. Síntesis de aminoácidos a partir de oxaloacetato y α-cetoglutarato.

1. Síntesis de glucosa, a partir de OAA, y ácidos grasos a partir de citrato.

2. Síntesis de aminoácidos a partir de oxaloacetato y α-cetoglutarato.

Rol de Ciclo de Krebs en el anabolismo
Cadena transportadora de
electrones y fosforilación Formación de ATP
oxidativa.
Membranas y compartimentos
Succinato deshidrogenasa

Membranas y compartimentos

ATP sintasa
Componentes de la cadena respiratoria Dr. QF. Mario Avila Garrido

Potencial Gradiente
de de
membrana protones
Componentes de la cadena respiratoria Dr. QF. Mario Avila Garrido

FUENTE DE ELECTRONES
1. NADH.
a) El isocitrato, α-cetoglutarato, y malato deshidrogenasas del TCA
b) Piruvato deshidrogensa
c) 3-hidroxiacil CoA deshidrogenasa de la oxidación de AG.
d) Otras NAD+- deshidrogenasas
2. FADH2.
a) Succinato deshidrogenasa del TCA.
b) La FAD-deshidrogenasa de la lanzadera del α-glicerofosfato.
c) La acil-CoA deshidrogenasa de la oxidación de los AG.
d) Otras FAD- deshidrogenasas

• El complejo I, también llamado NADH: ubiquinona oxidorreductasa transporta los electrones
del NADH a la ubiquinona.
• El complejo II, es la succinato dehidrogenasa, única enzima del ciclo de Krebs unida a
membrana, que pasa los electrones del FADH2 a la ubiquinona.
• El complejo III, también llamado citocromo bc1 o complejo ubiquinona: citocromo c

oxidorreductasa, acopla la transferencia de electrones desde la ubiquinona al citocromo c.
• El complejo IV, también llamado citocromo oxidasa, es la última etapa de la cadena de

transporte electrónico de la respiración y conduce los electrones desde el citocromo c hasta el
último aceptor de los electrones, el oxígeno que se reduce a agua.

Cadena transportadora
de electrones

Resumen del flujo de electrones y protones a través de los cuatro
complejos de la cadena respiratoria

Flujo de electrones

Agentes que intervienen en la cadena transportadora de electrones

Agentes que intervienen en la cadena transportadora de electrones

La cadena respiratoria crea un gradiente de protones
La fosforilación oxidativa avanza en dos pasos:
1. Se bombean protones fuera de la matriz mitocondrial. La bomba de protones está dirigida

por las reacciones de oxidorreducción de la cadena respiratoria.
2. Los protones vuelven a entrar en la mitocondria a través de un canal de protones. Este

proceso favorecido entrópicamente dirige la síntesis de ATP.

Formación del ATP

Cadena de transporte de electrones en asociación con el bombeo de protones (H+). Se bombean diez
protones (H+) por cada nicotinamida adenina dinucleótido (NADH) que se oxida.

Regulación
• O2: la fosforilación oxidativa no ocurre en ausencia de O2.
• Relación ATP:ADP
[ATP] Inhibición Incremento Disminución ↓velocidad de ↓velocidad de

↑ [ADP] ATP sintasa gradiente [H+] - transporte de e- ciclo de Krebs glucólisis
- Bombeo de H+
↓ [ATP]
↑ [ATP]
Incremento
[ATP] Activación Disminución - transporte de e- ↑ velocidad de ↑ velocidad de
↓ [ADP] ATP sintasa gradiente [H+] - Bombeo de H+ ciclo de Krebs glucólisis

Agentes que intervienen en la fosforilación oxidativa

Dos desacoplantes
químicos de la
fosforilación
oxidativa.

Desacoplantes generan calor e inhiben a la ATP sintetasa

Dos desacoplantes químicos
de la fosforilación oxidativa.

Sistemas de transporte mitocondrial
Lanzadera de malato-aspartato y glicerofosfato

Antiport intercambio Fosfato/OH- y fosfato/malato
Antiport intercambio de ATP/ADP

Lanzadera de malato-aspartato y glicerofosfato
corazón,
hígado y riñón

Lanzadera de glicerofosfato
Músculo esquelético y
cerebro

Nucleótido de
Adenina y
fosfato
translocasas

Antiport intercambio Fosfato/OH- y fosfato/malato
Antiport intercambio de ATP/ADP

Glucólisis y catabolismo Degradación y formación

de hexosas de la glucosa
Principales vías de utilización de la glucosa
Matriz
extracelular Glucógeno
Síntesis de
polímeros Almacenamiento
estructurales
Glucosa
Oxidación por vía

Oxidación por vía
de las pentosas
glucolítica
fosfato
Ribosa-5-fosfato Piruvato
(1) Dr. QF. Mario Avila

Garrido
PRINCIPALES TRANSPORTADORES DE GLUCOSA
Transportador Expresado en Función
Mayoría de los tejidos, eritrocitos, barrera
GLUT 1 Captación basal de glucosa.
hematoencefálica, placenta, tejidos fetales.
GLUT 2 Hígado, intestino, células β pancreáticas Alta capacidad de captación de glucosa.
GLUT 3 Neuronas, placenta, riñón Captación neuronal de glucosa.
GLUT 4 Músculo esquelético, tejido adiposo y corazón Captación de glucosa insulino-dependiente.
GLUT 5 Intestino delgado, testículos Transportador de fructosa.
Dependientes de iones sodio. Transportador

SGLT-1 Intestino delgado y riñón
unidireccional y activo

Fuentes de carbono y energía en la glucólisis
• Almidón, lactosa y fructosa

• Glucosa
• Glucógeno
Etapas de la glucólisis
• Conversión de hexosa a triosa fosfato.

• Conversión de triosa fosfato a piruvato


! Glucosa a glucosa-6-fosfato
• Enzima: hexoquinasa/glucoquinasa
• La reacción es irreversible
• La enzima es alostérica fuertemente inhibida por el producto, G6P.
• Isoenzimas de la hexoquinasa presentan diferentes Km para glucosa y
diferentes especificidades para las hexosas.
(a) la mayoría de las hexoquinasa tienen bajo Km para la glucosa

(b) el hígado es el único donde la principal enzima para fosforilar es una glucoquinasa,
tiene un alto Km. Es inducible.
• Producto, G6P es un intermediario que participa como precursor en

otras vías metabólicas.


Característica Hexokinasa Glucokinasa
Tejido Todos Hígado y células β pancreáticas
Bajo (alta afinidad por el

Km Alto (baja afinidad por el sustrato)
sustrato
Vmáx Bajo Alto
Inhibición por
Sí No
glucosa-6-fosfato
Inducible por insulina No Sí
Sustrato Glucosa, fructosa y galactosa Solo glucosa
Provee a las células de Permite la acumulación

niveles basales de glucosa-6- intracelular de glucosa para la
Rol fisiológico fosfato necesarios para la conversión a glucógeno o
producción de energía triacilglicéridos
! F6P a fructosa1,-6-bifosfato
• Enzima: fosfofructoquinasa (PFK-1) enzima limitante de la glucólisis.
• La reacción es irreversible.
• Activadores de la PFK-1
(1) F6P, su aparición induce la actividad de la enzima
(2) AMP
(3) fructosa 2,6-bifosfato, se forma a partir de F6P cuando hay altos niveles
presentes (solo en hígado).
• Inhibidores de la PFK
(1) ATP, disminuye la afinidad de la PFK por la F6P, interfiere en la
activación de la PFK por el AMPc.
(2) Citrato, evita la activación hepática de la enzima.

! F6P a fructosa1,-6-bifosfato

! PEP a piruvato.
Enzima, piruvato quinasa (PK), es una enzima alostérica.
(1) Activador. La isoenzima PK hepática es activada por F1,6BP.
a) Es inducida por la ingesta de carbohidratos y altos niveles de insulina.
b) Es regulada por modificación covalente.
i) Es fosforilada por una quinasa AMPc-dependiente, inactivándose
(2) Inhibidores. ATP, alanina, AG y acetil-SCoA.

Garrido

! PEP a piruvato.
Regulación de la glucólisis

Presente en todas las células,
excepto en el hígado.
Regulación de la glucólisis:
Hexoquinasa (HK)/glucoquinasa (GK).

Fosfofructoquinasa-1.
Piruvatoquinasa (PK)
Modulada por fluctuaciones en las concentraciones de moléculas:
ATP, AMP
Glucosa, insulina y glucagón
En general en la glucólisis:
• Estimulada después de una comida, cuando la glicemia y los niveles de insulina
son altos, pero los niveles de glucagón son bajos.
• Inhibida durante los periodos de ayuno, cuando la glicemia y los niveles de insulina
son bajos, pero glucagón alto.
• Estimulada por señales de "baja energía" , tales como, niveles de AMP elevados.
• Inhibida por señales de "alta energía" , tales como, niveles de ATP

elevados.

Garrido

Hexoquinasa (HK)/glucoquinasa (GK) " isoenzimas

- Hexoquinasa, en todos los tejidos.
- Glucoquinasa, en hepatocito y células beta pancreáticas.
Regulación hormonal de la Glucoquinasa.

# Insulina Síntesis de GK
# Glucagón Síntesis de GK

Hexoquinasa (HK)/glucoquinasa (GK) " isoenzimas

Mismo sustrato PERO:
Diferente afinidad.
Distinta sensibilidad a los cambios en los niveles de los intermediarios
glicolíticos.
Km (mM) Inhibidor Actividad
Alta a bajos niveles

Hexokinasa 0,1 Glucosa-6-fosfato
de glucosa
8
Casi nada, Fru-6-P, Alta a altos niveles
Glucokinasa (no tiene cinética
indirectamente de glucosa
de M-M)
Cinética enzimática de hexoquinasa y glucoquinasa

Inactivación de la glucoquinasa vía translocación
nuclear en el hepatocito
Glucosa
ATP
GK-RP GK
GK ADP
Glucosa 6-P
Núcleo
Citoplasma Fructosa 6-P

2. Fosfofructoquinasa-1 $ Enzima limitante
- (+) por AMP y 2,6-fructosa bifosfato (2,6-fru-biP).
- (-) por ATP y citrato.

2. Fosfofructoquinasa-1 $ Enzima limitante
El 2,6-Fru-biP es formado por una enzima bifuncional la fosfofructoquinasa-2/fructosa-

bifosfatasa-2 (PFK-2/FBPasa-2)
Regulación hormonal de la PFK-1.
# Insulina PFK-1
# Glucagón PFK-1
Cuando la % actividad de la PFK-1, la glicólisis es inhibida pero la gluconeogénesis

es favorecida

[Insulina] [Insulina]
[Glucagón] [Glucagón]
[cAMP]
Proteín fosfatasas Proteín quinasa A
PFK-2/FBPasa-2
Fructosa 2,6-BP Fructosa 6-P
PFK-2/FBPasa-2
ATP
ADP Regulación hormonal
PFK-1 de la PFK-1.
Fructosa 1,6-BP
3. Piruvato Kinasa (PK)
- (+) 1,6-fructosa bifosfato (1,6-fru-biP).
- (-) [ATP], alanina, ácidos grasos de cadena larga.
Regulación hormonal de la PK.

Insulina PK
Glucagón PK

[Insulina] [Insulina]
[Glucagón] [Glucagón]
[cAMP]
Proteín fosfatasas Proteín quinasa A
Regulación hormonal de la
PK
Fosfoenol- PK en el hepatocito.
Piruvato
piruvato
ADP ATP

3. Piruvato Kinasa (PK)

Destinos del Piruvato
Piruvato a lactato.
Piruvato a acetil CoA. Es irreversible ocurre en la mitocondria

• Piruvato a lactato.

• Piruvato a lactato.

• Piruvato a etanol " en levaduras

Gluconeogénesis

1 Glucosa 1 Glucosa
Vías opuestas glicólisis y
gluconeogénesis
hexoquinasa/
Bypass glucosa 6-fosfatasa
glucoquinasa
fosfofructoquinasa-1 Bypass fructosa1,6-bifosfatasa
Gluconeogénesis
Glicólisis
Bypass PEP carboxiquinasa
piruvato quinasa piruvato carboxilasa
2 Piruvato 2 Piruvato

Problema crítico en la reversión de la glucólisis es la irreversibilidad de las tres reacciones

quinasas:
Hexoquinasa IV (GK)
Fosfofructoquinasa (PKF-1)
Piruvatoquinasa (PK)
Para solventar el problema el hígado utiliza 4 enzimas distintas:
Para evitar la PK "

Piruvato carboxilasa (PC) mitocondrial,
Fosfoenolpiruvato carboxiquinasa citoplasmática (PEPCK)
Para no utilizar la PKF " Fructosa-1,6-bifosfatasa (fru-1,6-BPasa)
Para evitar a la GK "Glucosa-6-fosfatasa (Glc-6-Pasa)

La estructura carbonada es suministrada por tres fuentes principales:
Lactato
Glicerol
Aminoácidos " alanina
A partir de lactato
(1)PEPCK
(1) (1)PCm
(1)
(1)
A partir de glicerol
A partir de aminoácidos
(1)PEPCK
(1)PCm
(1)
(1)
(1)
Vía de las Pentosas
Funciones
1. Provee de NADPH para biosíntesis reductivas.

2. Provee de ribosa 5-fosfato para la síntesis de ácidos nucleicos.
3. Provee de una ruta para el uso de pentosas y su conversión F6P y G3P.
Ubicación
1. Hígado, glándulas mamarias, tejido adiposo y corteza adrenal.

2. Las enzimas son citoplasmáticas.

1. Glucosa 6-P (G6P) a 6-fosfogluconolactona.
a) NADP+ es reducido a NADPH, en GR el NADPH se requiere para

mantener el glutatión reducido.
b) Enzima. Glucosa 6-fosfatodeshidrogenasa, su deficiencia causa anemia
hemolítica.
2. 6-fosfogluconolactona a 6-fosfogluconato
a) Catalizado por una lactonasa (gluconato hidrolasa)
3. 6-fosfogluconato a ribulosa 5-fosfato y CO2

a) NADP+ es reducido a NADPH.
b) Enzima. 6-fosfogluconatodeshidrogensa.

Química y Biomoleculas
Metabolismo del Degradación y
Glucógeno formación de glucógeno

Metabolismo del glucógeno.
• Importancia y función del glucógeno.
• Degradación del glucógeno: Glucógeno fosforilasa, enzima desramificante.
• Biosíntesis del glucógeno: Glucógeno sintasa, enzima ramificante.
• Regulación hormonal y alostérica.
• Regulación diferencial en tejido muscular y hepático.
• Control coordinado de la síntesis y degradación del glucógeno.

Importancia y función del glucógeno
• Forma de almacenamiento de glucosa fácilmente movilizable.
• El exceso de glucosa de la dieta se almacena como glucógeno. Se moviliza cuando
surge una necesidad: actividad muscular, entre comidas (reserva energética (12 24 h).
• Se encuentra en el citosol: gránulos de 10-40 nm. Contiene las enzimas para su
degradación y biosíntesis y las enzimas reguladoras.
• Lugares principales de almacenamiento: hígado y músculo esquelético.
• Funciones diferentes: regular el nivel de glucosa en sangre (hígado) y suministrar
glucosa para la actividad muscular vigorosa (músculo).
-

El contenido de GLUCÓGENO del hígado varía a lo largo del día
Gránulos de glucógeno
Funciones del glucógeno en hígado y músculo
Comparación de las funciones del glucógeno
hepático y muscular
Glucógeno Hepático Glucógeno Muscular
Función Mantención de la concentración de Combustible de reserva para la contracción

principal glucosa sanguínea muscular
Otras Utilizado como combustible para Ninguna, el músculo carece de glucosa-6-

Funciones cualquier tejido: el hígado contiene fosfatasa y la glucosa-6-P, no sale.
glucosa-6-fosfatasa que desfosforila a la
glucosa-6-fosfato y permite que salga a
la sangre.
Depósitos Aprox. 10% del peso del hígado. Sólo Aprox. 1-2% del peso del músculo (pero
duran 12-24 hrs durante el ayuno. tenemos mucha más masa muscular, por lo
que hay el doble de glucógeno que en el
hígado)
Control El glucagón y la adrenalina estimulan la La adrenalina estimula la glucogenolisis.

hormonal glucogenolisis. La insulina estimula la síntesis.
La insulina estimula la síntesis.
Estructura del glucógeno
(α1!4)
(α1!6)
Residuo de glucosa con unión α1!4. Extremo reductor adherido a la

glucogenina
Residuo de glucosa con unión α1!6. Extremos no reductores.
Hidrólisis y fosforólisis
HIDRÓLISIS: digestión de polisacáridos y disacáridos.
FOSFOROLISIS: movilización del glucógeno intracelular.
Se emplea fosfato en vez de H2O para romper el enlace.

Ventaja: la glucosa se libera ya fosforilada y la célula no gasta energía en fosforilarla.

Degradación y biosíntesis del glucógeno
Glucogenolisis Glucogenogénesis
Glucogenogénesis
Glucogenogénesis
Glucogenogénesis
Enzima ramificante
7 residuos de Glu
Enzima
ramiﬁcante
Glucogenogénesis
Glucogenolisis
Glucogenolisis
Glucogenolisis
REGULACIÓN DEL METABOLISMO DEL
GLUCÓGENO
Regulación recíproca de glucogénesis y glucogenolisis
Control hormonal de la glucógeno sintasa
Control hormonal de la glucógeno fosforilasa
INSULINA, GLUCAGÓN Y ADRENALINA en el metabolismo glucídico
Lípidos de Combustible metabólico y

importancia siológica precursores para biosíntesis
fi
Lípidos
Funciones
1. Energética: combustible de alto valor calórico (10 kcal/g) y de uso diferido. Sólo
admiten degradación aeróbica (respiración)
2. Estructural: Forman las membranas plasmáticas de todo tipo de seres vivos
3. Informativa: señales químicas como esteroides, prostaglandinas, retinoides,

leucotrienos, calciferoles, etc.
Lípidos
Funciones
Lípidos
- Característica fundamental es la insolubilidad en agua y la solubilidad

en solventes orgánicos
- Químicamente, los lípidos son:
• Derivados por esterificación y otras modificaciones de ácidos

orgánicos monocarboxílicos, llamados ácidos grasos
• Derivados por aposición y posteriores modificaciones de

unidades isoprenoides

Ácidos grasos
❖ saturados
❖ insaturados
❖ Isomerización cis-trans
Ácidos grasos
❖ Saturados C Acétic Etanoic

C Butíric Butanoic
C Caproic Hexanoic
C Caprílic Octanoic
C1 Cápric Decanoic
C1 Láuric Dodecanoic
C1 Mirístic Tetradecanoic
C1 Palmític Hexadecanoic
C1 Esteáric Octadecanoic
C2 Araquídic Eicosanoic
C2 Behénic Docoeicosanoic
C2 Lignocéric Tetraeicosanoico
2
4
6
8
0
2
4
6
8
0
2
4
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
o
Ácidos grasos
❖ Saturados
C2 - C4 ácidos grasos de cadena corta y C6 - C12 ácidos grasos de cadena intermedia
• Se absorben directamente desde el intestino delgado hacia la vena porta

• Pueden difundir libremente, sin esteri cación con carnitina para ingresar a la
matriz mitocondrial.
C14 > ácidos grasos de cadena larga
• Se encuentran en los TG y lípidos estructurales

• Requieren de carnitina para hacia el interior de la matriz mitocondrial.
fi
.
Ácidos grasos
❖ Saturados
Ácido palmítico, C16 CH3 (CH2)14 COOH
COOH
Ácidos grasos
❖ Insaturados, contienen una o mas insaturaciones
C16: Palmitoleic 9-cis hexadecenoic

C18: Oleic 9-cis octadecenoic
C18: Linoleic 9,12 todo cis octadecadienoic
C18: Linolénic 9,12,15 todo cis octadecatrienoic
C20: Araquidónic 5,8,11,14 todo cis eicosatetraenoico
1
1
2
3
4
o
o
o
o
o
o
Estructura de los ácidos grasos insaturados
ω6
Araquidónico
ω3
COOH
ω6
COOH
Linolénico
COOH
Linoleico
ω9
COOH
Oleico
Ác.linoleico
Ác.oleico
Ác.linolénico
Ác.araquidónico
Nomenclatura de ácido grasos
1
ω
β
COOH
CH3 α
Ácido palmítico (hexadecanoico)
1
ω 16
15 13 11 9 7 5 3
COOH
CH3 14 12 10 8 6 4 2
Ácido palmitoleico (cis ∆9 hexadecenoico ω7)

1
18
17 15 13 11 9 7 5 3
COOH
H3C 16 14 12 10 8 6 4 2
Ácido esteárico (Octadecanoico) Mp=69,9ºC
1
17 15 13 11 9 7 5 3
18
16 14 12 10 8 6 4 2
COOH
H3C
Ácido oleico (cis ∆9-Octadecenoico ω9) Mp=13,4ºC
1
17 15 13 11 9 7 5 3
18
16 14 12 10 8 6 4 2
COOH
H3C
Ácido linoleico (cis ∆9,12-Octadecadienoico ω6) Mp=-5,0ºC
1
17 15 13 11 9 7 5 3
18
16 14 12 10 8 6 4 2
COOH
H3C
Ácido linolénico (cis ∆9,12,15-Octadecatrienoico ω3) Mp=-10,0ºC
Lípidos
A) Derivados de ácidos grasos
Ácido graso Glicérido Lípidos de membran Otro

- Triacilglicérid - Glicerofosfolípido - Eicosanoides
- Diacilglicérid - Es ngolípido
- Monoacilglicérido - Glicolípidos
Acetil CoA
Isopentenil pirofosfat B) Lípidos isoprenoides

(isopreno activo)
Esteroide Vitaminas liposoluble Otro
- Colestero - A, D, E, K - Coenzima Q
- Hormonas esteroidale
- Ácidos biliares
fi
s
A) Derivados de ácidos grasos

Triglicéridos
Lípidos de membrana
Glicerolípidos
Es ngolípidos
fi
Glucosa(
Galactosa(
N*ace,lgalactosamina(
Fucosa(
Eicosanoides: ácido araquidónico
Glucocorticoides
Fosfolipasa A2
-
Salicilatos
- Ácido araquidónico (C20:4)
Cicloxigenasa Lipoxigenasa
PGG2 5-HPETE
PGH2
LTA4
PGI2 PGE2 + TXA2

PGF2α
TXB2
LTC4
Algunas estimulan contracción Producidos por plaquetas Poderosos constrictores de

de musculatura uterina. y actúan en la formación musculatura lisa de
Afectan el flujo sanguíneo de de los coágulos. bronquios.
determinados órganos.
El ciclo sueño vigilia.
Respuesta de algunas
hormonas, ej. Insulina y
glucagón
Involucradas la generación de
fiebre, inflamación y dolor.
Lípidos
Acetil CoA Isopentenil pirofosfat B) Lípidos isoprenoides

(isopreno activo)
Esteroide
- Colestero
- Ácidos biliare
Vitaminas liposoluble
- A, D, E,
Otro
- Coenzima Q
s
B) Lípidos isoprenoides
Esteroide
- Colestero
- Ácidos biliare
Vitaminas liposoluble
- A, D, E,
Otro
- Coenzima Q
s
Lípidos insaponificables
C
C C
n C C
CH2OH
Retinol
Colesterol
HO
Colesterol
Ácidos biliares
Hormonas esteroidales
Vitaminas liposolubles: Vitamina D
Vitamina D
Vitamina A
Catabolismo de los ácidos Lipólisis y degradación
grasos de ácidos grasos

Glucosa
Ácidos grasos
Piruvato
Acetil-CoA
Vias Vias
anabólicas catabólicas
Derivados de ácidos grasos Ciclo de

Krebs
Derivados de isoprenos
Cuerpos cetónicos

Movilización de los
triglicéridos almacenados en
el adipocito

monoacil-
Glicerol lipasa
diacil-
glicerolipasa
Lipasas que catalizan la

lipasa hidrólisis de acilgliceroles
hormono-sensible
monoacil-
Glicerol lipasa
liproteín
lipasa
Lipasas que catalizan la

lipasa
hormono-sensible hidrólisis de acilgliceroles
Ingreso de glicerol
a la vía glicolítica

Tipos de ácidos grasos
Clasificación por Número de Lugar de Transporte de

tamaño carbonos catabolismo membrana
Cadena corta 2-4 Mitocondria Difusión
Cadena media 4-12 Mitocondria Difusión
Ciclo de la
Cadena larga 12-20 Mitocondria
carnitina
Cadena muy
> 20 Peroxisoma Desconocido
larga

Conversión de ácido grasos a lipoacil-SCoA
Lado citosólico de la
membrana externa
mitocondrial

Fase I: transporte de ácidos grasos de cadena larga
hacia el interior mitocondrial vía lanzadera de
la carnitina.
Fase II: -oxidación de ácidos grasos.

𝝱
Transporte de ácidos grasos de cadena larga (13-20 C) hacia el
interior de la matriz mitocondrial.
AMP + PPi
CoA ATP Deficiencia de Deficiencia de Deficiencia de
CPT I CACT CPT II
Ácido Lipo acil
graso 1
lipoacil-CoA CoA Citosol
sintetasa Memb. mitocondrial externa
CPT I
Lipo acil (etapa lim.) Memb. mitocondrial int.
Lipo acil- Lipo acil-
-
CoA 2 CPT II Matriz
Malonil CoA carnitina carnitina 4 Lipo acil
CoA
CoA CACT CoA
3
Carnitina Carnitina
1. Acil-CoA sintetasa
2. Carnitin palmitoil transferasa I
3. Carnitin-acilcarnitina translocasa
4. Carnitin palmitoil transferasa II
APLICACIÓN CLINICA
Deficiencia de la carnitina aciltransferasa I: se presenta en prematuros. Por inmadurez

metabólica o en recién nacidos de término por antecedentes genéticos.
No se puede realizar la metabolización de ácidos grasos de cadena larga. Déficit energético

principalmente a nivel muscular (esquelético y cardíaco).
Tratamiento: dieta rica en ácidos grasos de cadena corta en el caso de prematuros hasta alcanzar
madurez metabólica.
La condición genética es grave y conduce a la muerte.
En adultos puede conducir a delgadez extrema.

PACIENTE DEFICITARIA GENETICA EN ACIL CARNITINA TRANSFERASA I

Carnitina
• deriva de la lisina.
• dieta es la principal fuente.
• se sintetizan pequeñas cantidades en el riñón (70%) e hígado (30%).
• Activamente utilizada por el músculo esquelético y cardíaco.

Fase II: β-oxidación de ácidos grasos.
SE PRODUCE PRINCIPALMENTE EN EL TEJIDO MUSCULAR ESQUELETICO Y CARDIACO, Y EN

EL HIGADO
LOS ACIDOS GRASOS DE CADENA CORTA (C8) Y MENORES NO NECESITAN DE CARNITINA

PARA SER BETA OXIDADOS EN LA MITOCONDRIA. IMPORTANTE EN LA LACTANCIA. LA LECHE
HUMANA CONTIENE TRIGLICERIDOS DE CADENA CORTA

β-oxidación de
ácidos grasos
2 ATP
3 ATP

Vías alternativas de oxidación de los ácidos grasos

β-oxidación de un AG Degradación de ácido grasos impar
H H H O
H H H O
C C C C S(CoA) Lipoacil-CoA Lipoacil-CoA
⍺ (n= par de carbonos) C C C C S(CoA) (n= impar de carbonos)
⍺
H H H
H H H
FAD
acil CoA A CoQ de la cadena respiratoria
deshidrogenasa 1 β-oxidación
(2 ATP)
Se repite hasta degradarse completamente a acetil-CoA FADH2
Acetil CoA
H H O
H H O
C C C C S(CoA) Trans lipo enoil-CoA
⍺
H C C C
⍺ S(CoA) Propionil-CoA
H H (n= 3 carbonos)
H2O H H
enoil CoA
hidratasa 2
CO2
propionil CoA
H OH H O carboxilasa ATP
(req. biotina)
C C C C S(CoA) β-hidroxiacil-CoA ADP + Pi

⍺
H H O
H H H
NAD+ H C C C
⍺ S(CoA) Metilmalonil-CoA
3-hidroxiacil CoA A complejo I de la cadena respiratoria
deshidrogenasa 3 (3 ATP) H COO-
NADH metilmalonil CoA
mutasa
(req. vit. B12)
H O H O
H H O
C C C C S(CoA) β-cetoacil-CoA
⍺
H H H C C C
⍺ S(CoA) Succinil-CoA Ciclo TCA
CoA -OOC H
acetil CoA
aciltransferasa 4
(β-ceto tiolasa)
A ciclo de
Acetil CoA TCA
H O (12 ATP)
C C S(CoA Lipoacil-CoA
(n-2 carbonos) Dr. QF. Mario Avila Garrido
H
𝝱
𝝱
𝝱
𝝱
𝝱
𝝱
𝝱
𝝱

Comparación de la
β-oxidación en
mitocondrias y en
peroxisomas

β-oxidación de AG de cadena muy larga ocurre en los peroxisomas

Regulación de la β-oxidación.
1 Ácido graso
- AMP-PK
Lipo acil-CoA
músculo, hígado
-
ATP 2 Malonil-CoA Acetil-CoA
Acetil-CoA
ADP - Lipo acil carnitina carboxilasa
3 + Insulina (hígado)
Cadena NADH
transportadora FAD (2H) - β-oxidación
de electrones
Acetil-CoA
CUERPOS CETÓNICOS
Excesiva β-oxidación

Los cuerpos cetónicos
Son solubles en agua.

Disminuyen el pH.
Solo los produce el hígado
Acetoacetona β-hidroxibutirato Acetona

Cetogénesis
- Formación de cuerpos cetónicos a partir de

acetil-SCoA.
- Matriz mitocondrial del hepatocito
Cetogenolisis
• Solo en mitocondrias de tejidos extrahepáticos:

‣ Músculo
‣ Riñón
‣ Cerebro
• Acetoacetato y β-hidroxibutirato son transportados al

interior celular.
‣ Oxidación a acetil-CoA
‣ Matriz mitocondrial
‣ Usado en ciclo de Krebs
• Dos tipos de células no usan cuerpos cetónicos.

‣ Glóbulos rojos (no hay mitocondrias)
‣ Hepatocitos (carece de tioforasa)

β-Hidroxibutirato
como combustible.
Complejo I de la
cadena (3 ATP)
TCA
(Tioforasa) (1 GTP)
TCA
(2 x 12 ATP)
Formación de
cuerpos cetónicos y
exportación desde el
hígado

1 Ácido graso
Regulación de la síntesis
de cuerpos cetónicos 2 ↑CPT-I (↓Malonil CoA)
Lipo acil carnitina
- Lipo acil-CoA
FAD (2H)
3 ↑ATP β-Oxidación
NADH
5
↑Acetil-CoA Acetoacetil Cuerpos
CoA cetónicos
Oxaloacetato
4
Ciclo de Citrato
Malato Krebs

Concentración de los cuerpos cetónicos durante el ayuno
Biosíntesis y almacenamiento Formación de ácidos grasos en
de ácidos grasos el hígado y músculos

Biosíntesis de AG
(exceso ingesta carbohidratos)
Lipidos

Vías catabólicas y anabólicas de los ácidos

grasos son diferentes
• Catabolismo de ácidos grasos
– produce acetil-SCoA
– Genera poder reductor: NADH
– ubicación: mitocondria
• Anabolismo de ácidos grasos
– requiere de malonil-SCoA y acetil-SCoA
– Obtiene poder reductor desde NADPH
– ubicación: citosol en animales.

Catabolismo y Anabolismo lipídico en células

animales y vegetales

LIPOGÉNESIS
• Se localiza en el citosol
• Usa NADP + como fuente de poder reductor

SÍNTESIS DE ÁCIDOS GRASOS
Fase I: transporte del acetil-CoA al citosol.
Fase II: preparación del precursor clave: malonil-SCoA por la acetil-

SCoA carboxilasa.
Fase III: elongación de la cadena de ácidos grasos (2C) mediante la

ácido grasos sintasa

FASE I y II
SÍNTESIS DEL MALONIL-SCoA:
Acetil-SCoA carboxilasa (ACC)
Fase II
Síntesis del malonil-SCoA
O HCO₃⁻ Acetil-CoA
O O
carboxilasa
CH3-C-SCoA -O—C—CH2-C-SCoA
ATP ADP + Pi
ADP + Pi Enz CO2 Biotin
ATP
HCO₃⁻ + Enz Biotin

Fase II
Regulación de Acetil-SCoA carboxilasa
Insulina + Enz
Protein
fosfatasa
Enz P Enz
ACC(i) Protein quinasa ACC(a)

dependiente de AMPc
ADP Enz ATP
Adrenalina
Glucagón

FASE III
Elongación de la cadena de ácidos grasos:
Ácido Graso sintasa
Ácido graso sintetasa
• La proteína contiene siete actividades

enzimáticas distintas.
• Proteína portadora de acilos (ACP)
• Forma


Si consideramos la síntesis del palmitato desde acetil-
SCoA en dos partes:
1) La formación de 7 malonil-SCoA
7Acetil-SCoA +7CO2 + 7ATP ➔ 7malonil-SCoA + 7ADP
+7Pi
2) Siete ciclos de condensación y reducción

8Acetil-SCoA + 7ATP + 14NADPH +14H+ ➔
palmitato + 8CoA + 14NADP+ + 6H2O
8Acetil-SCoA + 7ATP + 14NADPH +14H+ ➔

palmitato + 8CoA + 7ADP + 7Pi + 14NADP+ + 6H2O

LIPOGÉNESIS

DIFERENCIAS ENTRE LA BETA-OXIDACION Y LA BIOSINTESIS
BETA-OXIDACION BIOSINTESIS
Lugar
Sustrato
Producto
Cofactores
Enzimas
Concepto
DIFERENCIAS ENTRE LA BETA-OXIDACION Y LA BIOSINTESIS
BETA-OXIDACION BIOSINTESIS
Lugar MITOCONDRIA CITOPLASMA
Sustrato ACIL-CoA ACETIL + MALONIL-CoA
Producto ACETIL-CoA ACIDO PALMITICO
Cofactores NAD+ y FAD NADPH
Enzimas LIBRES EN MATRIZ COMP. MULTIENZIMATICO
Concepto OXIDACION REDUCCION

Regulación de la síntesis de
ácidos grasos

-
ELONGACIÓN DE ÁCIDOS GRASOS
(de más de 16 carbonos)

Intervienen dos sistemas
• Sistema microsomal, se encuentra en el lado citosólico

de REL. Utiliza malonil Co-A y NADPH. Ácido graso
elongasa
• En las mitocondrias, utiliza acetil-CoA y NADH o

NADPH.

AG lineales: biosíntesis
• ác. linoleico en el hombre no se sintetiza (dieta)

• se usa como precursor de otros AG

ETAPA 2
Desaturación de ácidos grasos
Transferencia de electrones en la desaturación de AG.
1. Se introduce el doble enlace entre el C9 y C10
2. Los AG más comunes en mamíferos son el ácido palmitoleico (16:1:∆9) y el oleico

(18:1 :∆9).
3. Es catalizada por NADH-citocromo b5 reductasa, citocromo b5 y ∆9-desaturasa.
4. Tiene lugar en al lado interno del REL.

AG lineales: biosíntesis
• Ac. araquidónico (AA): 2º mensajero y precursor de AG cíclicos eicosanoides

Biosíntesis de Esteroles

Acetil CoA
Acetil CoA
Acetil CoA
Isopentenil pirofosfato (IPP)
Esteroides Vitaminas liposolubles Otros

(ej. Colesterol, ácidos biliares, (ej. A, D, E, K) (ej. ubiquinona, grupo hem)
hormonas esteroidales)
Lipoconjugados cíclicos: Esteroles
precursor de hormonas esteroidales, ácidos biliares, vit. D
Síntesis de membranas
constituyente membranas biológicas: moderar solidez-fluidez

Origen de los átomos de carbono del colesterol

Etapas de síntesis de colesterol
1. Conversión de acetil-CoA a isopentenil pirofosfato.
2. Conversión de isopentenil pirofosfato a colesterol.

1. Conversión de O
acetil-CoA a Acetil CoA H3C—C—S(CoA) Acetil CoA (C2)
isopentenil Acetil CoA

acetil CoA
pirofosfato. acetiltransferasa 1
O O
CoA
Acetoacetil CoA H3C—C—CH2—C—S(CoA) Acetoacetil CoA (C4)
Acetil CoA
HMG CoA
2
sintasa
CH3
CoA O
IPP partir de acetil CoA

Fase I: Generación de
HMG CoA -OOC—H2C—C—CH2—C—S(CoA) HMG CoA (C6)
HMG CoA reductasa OH

(limitante) 2 NADPH
Insulina,
tiroxina
+ 3 2 NADP+
Glucagón, -
esteroles, CoA
↑ [AMP], CH3
Vit. E, estatinas
Mevalonato -OOC—H2C—C—CH2—CH2—OH Mevalonato (C6)
3 ATP
OH
3 ADP
CO2
Isopentenil pirofosfato (IPP) O ℗℗ IPP (C5)
2. Conversión de
isopentenil
pirofosfato a Isopentenil pirofosfato (IPP) O ℗℗
IPP (C5)
colesterol.
6 IPP
NADPH
Escualestatinas
NADP+
colesterol a partir de IPP

Fase II: Generación de
Escualeno
O2
NADPH
NADP+
Lanosterol
O2
Azoles (ej.
miconazol,
NADPH
ketoconazol),
KCN, tamoxifeno,
morfolina, NADP+
triparanol
2CO2, 1 HCOOH
Colesterol

Colesterol: biosíntesis
Conversión de
escualeno en
colesterol

Destinos del
colesterol

Destino del colesterol
en los tejidos
Todos los tejidos:

- Incorporado en las membranas celulares.
Hígado:
- Utilizado para la síntesis de ácidos biliares.
Glándulas adrenales, ovarios y testículos:

- Usado para la síntesis de hormonas esteroidales.
Piel:
- Utilizado para la síntesis de vitamina D.
Inhibición competitiva de la HMGR por estatinas

Regulación de la actividad de la HMGR
vía fosforilación/desfosforilación

Lípidos: transporte

quilomicrones LDL



LCAT: lecitina-colesterol acil transferasa

Lípidos: endocitosis

Estatinas
La regulación de la
formación de colesterol
equilibra la síntesis con
la ingestión por la
dieta.
Colesterol: propiedades biológicas
• constituyente membranas biológicas: fluidez

• precursor de hormonas esteroidales, ács. biliares, vit. D

Colesterol: propiedades biológicas

“Lipoderivados”: derivados isoprenoides

Oxidación de aminoácidos
y producción de urea
Metabolismo de
proteínas y aminoácidos

Relaciones metabólicas de los aminoácidos

Circunstancias metabólicas para oxidación de aminoácidos
Aminoácidos son oxidados bajo tres circunstancias:

• Aminoácidos sobrantes, obtenidos de la síntesis y degradación normales
de proteínas.
• Aminoácidos dietarios, que exceden las necesidades del organismo para la

síntesis proteica….no se pueden almacenar.
• Cuando las proteínas celulares se usan como combustible, en las que no

hay glúcidos disponibles o estas no son utilizados adecuadamente (inanición,
diabetes mellitus).

Formas de excreción del nitrógeno

Transaminación Enzimática
• Todas las aminotransferasas (transaminasas) ocupan como cofactor
piridoxal fosfato.
• Normalmente, α-cetoglutarato acepta grupos amino.
• L-Glutamina actúa como un almacenador temporal de nitrógeno.
• L-Glutamina puede donar los grupos amino cuando son necesarios

en la biosíntesis de aminoácidos.


Visión general del catabolismos de los aminoácidos en
los mamíferos

Transaminasa
Glutamato
deshidrogenasa
NAD+
NADH
La glutamina transporta amoniaco en el torrente

sanguíneo
• La glutamina que no se ocupa
se procesa en el intestino, riñón
e hígado

La glutamina transporta amoniaco en el torrente
sanguíneo
Remoción del exceso de amonio desde el cerebro

La glutamina transporta amoniaco en el
torrente sanguíneo
Remoción del exceso de amonio desde los músculos (ciclo glucosa-alanina)

Relación entre glutamato, glutamina y α-cetoglutarato
NH3 NH3
α-cetoglutarato glutamato glutamina
NH3 NH3
Glutamato deshidrogenasa
glutamato + NAD+ + H 2O α-cetoglutarato + NH3 + NADH
Glutamina sintetasa
ADP
ATP
glutamato + NH3
glutamina
Glutaminasa
glutamina + H 2O glutamato + NH3

Excreción del nitrógeno y ciclo de la
urea

Compartimentalización de las enzimas del ciclo de la urea
Mitocondriales:
• Carbamoil fosfato sintetasa I
• Ornitina transcarbamoilasa
Citosólicas:
• Argininosuccinato sintetasa
• Argininosuccinato liasa
• Arginasa


Estequiometría del ciclo de la urea
CO2 + NH4+ + 3ATP + aspartato + 2H2O ➔ Urea + 2ADP + 2Pi + AMP + PPi + Fumarato

Vías de degradación de
aminoácidos
Destino de los esqueletos de carbono

Aminoácidos proteogénicos: cetogénicos y glucogénicos
Aminoácidos Precursor de cuerpos

Acetil-CoA o
cetogénicos cetónicos, ácidos
Leu Lys acetoacetato grasos e isoprenoides
Phe*
Aminoácidos 2 Tyr*
Ile* Trp*
cetogénicos y 5
glucogénicos 13 Thr*
His Met Gly
Val Arg Ala Pro

Piruvato o
intermediarios
Aminoácidos Asp Ser Precursor de síntesis
Asn del ciclo TCA
glucogénicos (oxaloacetato, de glucosa vía
Gln Glu Cys ⍺-cetoglutarato, gluconeogénesis
succinil-CoA,
fumarato
Thr*
Panorama de la degradación de
Acetil CoA
aminoácidos Trp*
Gly
Cys Ala Ser

Leu
Piruvato Acetoacetato
Acetil CoA
Asn Asp Oxaloacetato

Lys
Acetoacetato
Thr*
Gln
Phe* Tyr* Fumarato His
-cetoglutarato Glu
Arg
Pro
Succinil CoA
Acetoacetato
Acetil CoA
Ile* Val Met Thr* Dr. QF. Mario Avila Garrido

𝝰

Degradación de aminoácidos ramificados.

No se degradan en el hígado
• Valina, leucina e isoleucina son convertidos a su correspondiente α-cetoácido

por la acción de tres aminotransfererasas específicas.
• Enzima común los tres α-cetoácidos son sustrato de una enzima común, la que
cataliza su descarboxilación oxidativa. Es el complejo de la α-cetoácido de
cadena ramificada deshidrogenasa.
• Cofactores TPP, FAD, NAD, lipoato y coenzima A.
• Se oxidan como combustible principalmente en el músculo, tejido adiposo,

riñón y tejido cerebral.

Degradación de
aminoácidos ramificados

Vías catabólicas para tres aminoácidos de cadena ramificada:
valina, isoleucina, y leucina. Dr. QF. Mario Avila Garrido
Algunas aminas biógenas

Thr*
Derivados de Trp: Acetil CoA

- Serotonina → Melatonina Trp* Derivados de Gly:
- Niacina →NAD(P)+ - Hem
Gly
Derivados de Ser:
- Acetilcolina
Cys Ala Ser
Leu
Piruvato Acetoacetato
Derivados de Lys:
Acetil CoA - Carnitina
Derivados de His:
Asn Asp Oxaloacetato
Lys
Acetoacetato - Histamina
Thr*
Derivados de Arg:
- Óxido nítrico (cerebro)
Gln - Urea
Phe* Tyr* Fumarato His

-cetoglutarato Glu
Arg Derivados de Glu:
Derivados de Tyr: - Ácido -aminobutírico
- Dopamina → Norepi. → Epi.
Pro
Succinil CoA
- Hormonas tiroídeas Acetoacetato
- Melanina
Derivados de diversos aminoácidos:

Acetil CoA - Glutatión (formado de Glu + Cys + Gly)
- Creatina (Arg + Gly)
Derivados de Met:
- S-adenosilmetionina (SAM) Ile* Val Met Thr* Dr. QF. Mario Avila Garrido
𝝰
𝝲



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Química y Biomoléculas

Amina secundaria (iminoácidos)

Aminoácidos dicarboxílicos y amidas

A. Durante las reacciones metabólicas

B. Como resultado de modificaciones enzimáticas de residuos de

C. Las "aminas biogénicas” se sintetizan a partir α- aminoácidos por

Es la secuencia lineal de los aminoácidos que forman una proteína

La secuencia primaria es una característica específica de cada

La variación de la estructura primaria, por pequeña que sea,

Se refiere a ciertos patrones de plegamiento del eje de la molécula que se

Estas estructuras son consecuencia de la formación de puentes de

Por esta razón, muchas proteínas diferentes pueden formar estas

La lámina u hoja β plegada

Abdominal glands The spiral strands

Spider silk: a structural protein

• Se refiere al aspecto tridimensional global de la macromolécula.

• Es consecuencia de las interacciones entre aminoácidos que pueden quedar muy

b) Atracciones o repulsiones entre los aminoácidos con grupos laterales iónicos

-SH + SH- → -S-S- +H2

• Está presente en proteínas formadas por más de una cadena polipeptídica.

• Cada una de las cadenas se llama subunidad de la proteína o protómero.

• Las subunidades pueden ser iguales o distintas.

• La estructura cuaternaria se refiere a la estructura espacial global de toda la

• El tipo de interacciones que se producen son análogas a las descritas en la

• Variaciones de temperatura, el pH o la cantidad de sales disueltas en el agua,

• Para algunas proteínas de pequeño tamaño este proceso es reversible, y cuando

Normal protein Denatured protein

❖ No alteran los equilibrios de la reacción química que catalizan.

• El aumento de temperatura necesario para producir

• Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una

• Fijación estereoquímicamente complementaria del substrato

En ambas funciones participan:

• Cadenas laterales de los aminoácidos

Substrato y enzima se acoplan de forma estereospecífica, de la misma manera que

Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se considera insuficiente al no explicar

Tanto la enzima como el substrato sufren una alteración en su estructura por

Clasificación de enzimas por Grupos

4. Liasas (sintasas) C-C

• La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de cada

Hay un número limitado de sitios en la enzima para fijar substrato;

Velocidad de la reacción (v) Vmax/2

Km Concentración de Sustrato [S]

Velocidad de la reacción (v)

Km Concentración de Sustrato [S]

A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato

2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato

3. Mide la función de fijación

4. Concentración de sustrato para la que la velocidad se hace

5. Se define para una pareja enzima-substrato

6. Se mide en unidades de concentración

1. Velocidad asintótica para s

2. Directamente proporcional a la concentración de

3. Mide función de transformación catalítica

4. Se expresa en unidades de velocidad

Cada enzima tiene un pH óptimo para su actividad

15º 40º 75º

Cada enzima tiene una temperatura óptima.

• Las coenzimas son pequeñas moléculas

Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a la

De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:

I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo

II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula,

1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,

2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima: